Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8apc_j.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 4.A N GLU 4.A OE1 GLU 4.A H 2.500 1.705 MET 7.A N TYR 3.A O MET 7.A H 2.900 2.137 GLN 8.A N GLU 4.A O GLN 8.A H 2.930 2.215 ASP 11.A N MET 7.A O ASP 11.A H 2.889 2.066 GLU 12.A N GLN 8.A O GLU 12.A H 2.963 2.120 TRP 13.A N TYR 9.A O TRP 13.A H 2.909 2.072 MET 14.A N PHE 10.A O MET 14.A H 2.883 2.051 ILE 15.A N ASP 11.A O ILE 15.A H 2.936 2.110 ARG 16.A N GLU 12.A O ARG 16.A H 2.915 2.119 TRP 17.A N TRP 13.A O TRP 17.A H 2.720 1.966 LYS 19.A NZ GLN 162.A OE1 LYS 19.A HZ1 3.186 2.360 PHE 20.A N TRP 17.A O PHE 20.A H 3.372 2.594 GLN 21.A N ARG 18.A O GLN 21.A H 3.065 2.303 THR 22.A OG1 ASP 25.A OD2 THR 22.A HG1 3.096 2.299 TRP 26.A N THR 22.A O TRP 26.A H 3.151 2.328 GLU 27.A N GLU 23.A O GLU 27.A H 2.904 2.087 ILE 28.A N SER 24.A O ILE 28.A H 2.902 2.100 GLU 29.A N ASP 25.A O GLU 29.A H 2.931 2.114 LYS 30.A N TRP 26.A O LYS 30.A H 2.909 2.086 GLY 31.A N GLU 27.A O GLY 31.A H 2.881 2.050 ARG 32.A N ILE 28.A O ARG 32.A H 2.914 2.111 ARG 32.A NE GLU 119.A OE1 ARG 32.A HE 3.006 2.255 ARG 32.A NH1 GLU 115.A OE2 ARG 32.A HH12 3.029 2.186 ARG 32.A NH2 GLU 119.A OE1 ARG 32.A HH21 2.812 2.015 GLN 33.A N GLU 29.A O GLN 33.A H 2.913 2.094 TRP 34.A N LYS 30.A O TRP 34.A H 2.899 2.079 TRP 35.A N GLY 31.A O TRP 35.A H 2.881 2.058 ARG 36.A N ARG 32.A O ARG 36.A H 2.898 2.088 ARG 37.A N GLN 33.A O ARG 37.A H 2.964 2.139 PHE 38.A N TRP 34.A O PHE 38.A H 2.896 2.085 ASN 39.A N TRP 35.A O ASN 39.A H 2.866 2.033 ASN 39.A ND2 GLU 115.A OE1 ASN 39.A HD22 2.703 1.894 MET 40.A N ARG 36.A O MET 40.A H 2.925 2.089 ALA 41.A N ARG 37.A O ALA 41.A H 2.914 2.107 VAL 42.A N PHE 38.A O VAL 42.A H 2.935 2.105 SER 43.A N ASN 39.A O SER 43.A H 2.913 2.064 SER 43.A OG ASN 39.A O SER 43.A HG 2.907 2.186 GLY 44.A N MET 40.A O GLY 44.A H 2.893 2.060 ALA 45.A N ALA 41.A O ALA 45.A H 2.906 2.095 LEU 46.A N VAL 42.A O LEU 46.A H 2.916 2.088 PHE 47.A N SER 43.A O PHE 47.A H 2.896 2.074 CYS 48.A N GLY 44.A O CYS 48.A H 2.887 2.053 CYS 48.A SG GLY 44.A O CYS 48.A HG 3.331 2.437 GLY 49.A N ALA 45.A O GLY 49.A H 2.910 2.079 LEU 50.A N LEU 46.A O LEU 50.A H 2.916 2.074 VAL 51.A N PHE 47.A O VAL 51.A H 2.899 2.068 LEU 52.A N CYS 48.A O LEU 52.A H 2.903 2.075 TYR 53.A N GLY 49.A O TYR 53.A H 2.899 2.081 THR 54.A N LEU 50.A O THR 54.A H 3.028 2.205 THR 54.A OG1 LEU 50.A O THR 54.A HG1 2.861 2.060 THR 54.A OG1 VAL 51.A O THR 54.A HG1 3.240 2.802 SER 55.A N LEU 52.A O SER 55.A H 3.274 2.463 LEU 60.A N GLY 56.A O LEU 60.A H 2.853 2.033 LYS 61.A N THR 57.A O LYS 61.A H 2.906 2.083 ARG 62.A N ALA 58.A O ARG 62.A H 2.911 2.078 GLN 63.A N THR 59.A O GLN 63.A H 2.893 2.068 TYR 64.A N LEU 60.A O TYR 64.A H 2.792 1.937 GLN 77.A N GLY 73.A O GLN 77.A H 3.115 2.290 ALA 78.A N VAL 74.A O ALA 78.A H 2.904 2.058 LYS 79.A N ASP 75.A O LYS 79.A H 2.925 2.082 LYS 79.A NZ GLY 65.A O LYS 79.A HZ1 2.967 2.302 GLU 80.A N GLY 76.A O GLU 80.A H 2.892 2.044 THR 81.A N GLN 77.A O THR 81.A H 2.902 2.073 THR 81.A OG1 GLN 77.A O THR 81.A HG1 2.769 1.947 MET 82.A N ALA 78.A O MET 82.A H 2.935 2.089 LEU 83.A N LYS 79.A O LEU 83.A H 2.888 2.052 LYS 84.A N GLU 80.A O LYS 84.A H 2.896 2.046 THR 85.A N THR 81.A O THR 85.A H 2.919 2.084 THR 85.A OG1 THR 81.A O THR 85.A HG1 2.798 1.989 LEU 86.A N MET 82.A O LEU 86.A H 2.922 2.117 THR 87.A N LEU 83.A O THR 87.A H 2.892 2.075 THR 87.A OG1 LEU 83.A O THR 87.A HG1 2.675 1.877 THR 87.A OG1 LYS 84.A O THR 87.A HG1 3.513 3.037 SER 88.A N LYS 84.A O SER 88.A H 2.906 2.281 SER 88.A OG LYS 84.A O SER 88.A HG 2.443 1.634 ARG 91.A NE LEU 86.A O ARG 91.A HE 2.928 2.350 ARG 91.A NH1 TYR 53.A O ARG 91.A HH11 2.430 1.727 ARG 91.A NH1 SER 55.A O ARG 91.A HH12 2.776 1.975 ARG 91.A NH2 SER 55.A O ARG 91.A HH22 3.127 2.442 ARG 99.A NE THR 54.A OG1 ARG 99.A HE 3.140 2.296 ARG 99.A NH2 VAL 51.A O ARG 99.A HH21 3.018 2.212 VAL 100.A N GLY 96.A O VAL 100.A H 3.173 2.333 LEU 101.A N TYR 97.A O LEU 101.A H 2.889 2.051 ILE 102.A N GLY 98.A O ILE 102.A H 2.925 2.079 THR 103.A N ARG 99.A O THR 103.A H 2.886 2.047 THR 103.A OG1 ARG 99.A O THR 103.A HG1 2.700 1.903 THR 103.A OG1 VAL 100.A O THR 103.A HG1 3.093 2.649 GLY 104.A N VAL 100.A O GLY 104.A H 2.909 2.178 GLY 104.A N LEU 101.A O GLY 104.A H 3.237 2.603 VAL 105.A N LEU 101.A O VAL 105.A H 2.901 2.074 TYR 108.A N GLY 104.A O TYR 108.A H 2.734 1.888 ILE 109.A N VAL 105.A O ILE 109.A H 2.896 2.053 LEU 110.A N PRO 106.A O LEU 110.A H 2.902 2.056 PHE 111.A N THR 107.A O PHE 111.A H 2.939 2.083 VAL 112.A N TYR 108.A O VAL 112.A H 2.904 2.054 THR 113.A N ILE 109.A O THR 113.A H 2.905 2.058 THR 113.A OG1 ILE 109.A O THR 113.A HG1 2.616 1.808 LEU 114.A N LEU 110.A O LEU 114.A H 2.939 2.083 GLU 115.A N PHE 111.A O GLU 115.A H 2.927 2.089 HIS 116.A N VAL 112.A O HIS 116.A H 2.876 2.041 HIS 116.A ND1 GLU 4.A OE2 HIS 116.A HD1 3.030 2.179 TYR 117.A N THR 113.A O TYR 117.A H 2.969 2.124 ARG 118.A N LEU 114.A O ARG 118.A H 2.905 2.086 GLU 119.A N GLU 115.A O GLU 119.A H 2.878 2.084 ARG 120.A N HIS 116.A O ARG 120.A H 2.965 2.147 ARG 121.A N TYR 117.A O ARG 121.A H 2.893 2.091 ARG 122.A N ARG 118.A O ARG 122.A H 2.872 2.069 ARG 122.A NH1 GLU 29.A OE1 ARG 122.A HH11 2.927 2.185 ARG 122.A NH2 ASP 11.A OD2 ARG 122.A HH22 3.251 2.595 ARG 122.A NH2 GLU 119.A OE2 ARG 122.A HH21 2.432 1.727 MET 123.A N GLU 119.A O MET 123.A H 2.925 2.103 GLN 124.A N ARG 120.A O GLN 124.A H 2.948 2.119 GLN 125.A N ARG 121.A O GLN 125.A H 2.885 2.070 TYR 126.A N ARG 122.A O TYR 126.A H 2.917 2.075 TYR 126.A OH GLU 29.A OE2 TYR 126.A HH 2.551 1.722 LEU 127.A N MET 123.A O LEU 127.A H 2.913 2.124 GLN 128.A N GLN 124.A O GLN 128.A H 2.932 2.176 GLN 129.A N TYR 126.A O GLN 129.A H 3.331 2.532 THR 131.A OG1 ASP 25.A OD2 THR 131.A HG1 3.535 2.720 GLU 135.A N THR 131.A O GLU 135.A H 3.055 2.232 GLN 136.A N VAL 132.A O GLN 136.A H 2.883 2.064 GLN 136.A NE2 GLU 147.A O GLN 136.A HE22 2.481 1.754 MET 137.A N PHE 133.A O MET 137.A H 2.897 2.085 ARG 138.A N GLY 134.A O ARG 138.A H 2.919 2.087 ARG 138.A NE GLU 135.A OE1 ARG 138.A HE 3.407 2.662 ARG 138.A NH1 LEU 127.A O ARG 138.A HH11 2.703 2.016 ARG 138.A NH1 GLN 129.A O ARG 138.A HH12 2.707 1.854 ARG 138.A NH2 GLN 129.A O ARG 138.A HH22 3.521 2.913 ARG 138.A NH2 GLU 135.A OE1 ARG 138.A HH21 3.232 2.434 ARG 139.A N GLU 135.A O ARG 139.A H 2.886 2.049 ARG 139.A NE GLU 135.A OE2 ARG 139.A HE 2.798 2.112 LEU 140.A N GLN 136.A O LEU 140.A H 2.858 2.045 LEU 141.A N MET 137.A O LEU 141.A H 2.947 2.118 SER 142.A N ARG 138.A O SER 142.A H 2.896 2.213 SER 142.A N ARG 139.A O SER 142.A H 3.220 2.603 SER 142.A OG ARG 138.A O SER 142.A HG 2.657 1.839 THR 143.A N ARG 139.A O THR 143.A H 2.881 2.042 THR 143.A OG1 ARG 139.A O THR 143.A HG1 2.860 2.032 GLY 144.A N LEU 140.A O GLY 144.A H 2.716 2.014 ASN 153.A N TYR 149.A O ASN 153.A H 3.071 2.348 ILE 154.A N LEU 150.A O ILE 154.A H 2.992 2.162 LYS 155.A NZ TYR 168.A O LYS 155.A HZ1 3.523 2.900 ALA 156.A N PRO 151.A O ALA 156.A H 2.711 1.863 GLN 162.A N PRO 159.A O GLN 162.A H 2.893 2.048 GLN 163.A NE2 LEU 158.A O GLN 163.A HE21 3.550 2.839 TYR 166.A OH ALA 156.A O TYR 166.A HH 2.738 2.026 ASN 167.A N ALA 164.A O ASN 167.A H 2.916 2.099 TYR 168.A N TYR 166.A O TYR 168.A H 2.670 2.044