Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8b8u_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 4.A NZ PHE 2.A O LYS 4.A HZ1 3.046 2.268 ILE 5.A N VAL 80.A O ILE 5.A H 2.980 2.155 GLU 8.A N GLU 8.A OE1 GLU 8.A H 2.392 1.611 ASP 9.A N ARG 6.A O ASP 9.A H 2.859 2.078 LEU 10.A N ASN 7.A O LEU 10.A H 3.127 2.273 ILE 11.A N VAL 28.A O ILE 11.A H 2.908 2.074 ASN 13.A N LYS 26.A O ASN 13.A H 2.825 2.013 GLU 14.A N GLU 14.A OE1 GLU 14.A H 2.900 2.101 LEU 16.A N ILE 24.A O LEU 16.A H.A 2.723 1.883 GLY 19.A N THR 22.A O GLY 19.A H 3.093 2.406 GLY 19.A N THR 22.A OG1 GLY 19.A H 3.030 2.416 THR 22.A N GLY 19.A O THR 22.A H 3.297 2.449 LYS 23.A N VAL 47.A O LYS 23.A H 2.936 2.113 LYS 23.A NZ ASP 49.A OD1 LYS 23.A HZ2 3.547 2.670 ILE 24.A N GLY 17.A O ILE 24.A H 2.890 2.041 PHE 25.A N LEU 45.A O PHE 25.A H 2.864 2.035 LYS 26.A N GLU 14.A O LYS 26.A H 2.905 2.119 LYS 26.A NZ GLU 42.A OE2 LYS 26.A HZ1 2.934 2.099 GLY 27.A N VAL 43.A O GLY 27.A H 2.943 2.217 VAL 28.A N ILE 11.A O VAL 28.A H.A 2.936 2.147 ARG 29.A N THR 41.A O ARG 29.A H 2.760 1.942 ARG 30.A N ASP 9.A O ARG 30.A H 2.829 2.038 GLU 31.A N HIS 39.A O GLU 31.A H 2.974 2.169 GLY 33.A N GLN 37.A O GLY 33.A H 2.763 1.904 GLY 36.A N GLY 33.A O GLY 36.A H 2.968 2.226 GLN 37.A N ASP 34.A O GLN 37.A H 3.167 2.321 HIS 39.A N GLU 31.A O HIS 39.A H 2.918 2.083 THR 41.A N ARG 29.A O THR 41.A H 2.797 1.943 THR 41.A OG1 GLU 31.A OE2 THR 41.A HG1 2.654 1.847 VAL 43.A N GLY 27.A O VAL 43.A H 2.942 2.112 LEU 44.A N GLN 91.A O LEU 44.A H 2.846 1.988 LEU 45.A N PHE 25.A O LEU 45.A H 2.843 1.987 LYS 46.A N LEU 89.A O LYS 46.A H 2.976 2.154 LYS 46.A NZ GLN 91.A OE1.A LYS 46.A HZ3 2.947 2.141 LYS 46.A NZ GLN 91.A OE1.B LYS 46.A HZ3 2.539 1.795 LYS 46.A NZ ASP 164.A OD2 LYS 46.A HZ1 2.286 1.523 VAL 47.A N LYS 23.A O VAL 47.A H 2.834 1.989 LEU 48.A N ASN 87.A O LEU 48.A H 2.976 2.136 ASP 49.A N PHE 21.A O ASP 49.A H 2.860 2.000 HIS 52.A N ASP 49.A O HIS 52.A H 3.020 2.182 ARG 53.A NH2 ASP 85.A O ARG 53.A HH21 3.564 2.745 TYR 55.A N HIS 52.A O TYR 55.A H 2.946 2.087 SER 56.A N ARG 53.A O SER 56.A H 3.038 2.220 PHE 59.A N TYR 55.A O PHE 59.A H 2.928 2.095 PHE 60.A N SER 56.A O PHE 60.A H 2.942 2.121 GLU 61.A N GLU 57.A O GLU 61.A H 2.839 2.005 ALA 62.A N SER 58.A O ALA 62.A H 3.041 2.253 ALA 63.A N PHE 60.A O ALA 63.A H 3.187 2.585 SER 64.A N PHE 60.A O SER 64.A H 2.859 2.042 MET 65.A N GLU 61.A O MET 65.A H 3.003 2.152 SER 67.A N ALA 63.A O SER 67.A H 2.957 2.286 SER 67.A N SER 64.A O SER 67.A H 2.998 2.355 SER 67.A OG SER 64.A O SER 67.A HG 2.848 2.014 LEU 69.A N MET 66.A O LEU 69.A H 3.244 2.407 HIS 73.A N HIS 71.A ND1 HIS 73.A H 3.088 2.234 HIS 73.A ND1 ILE 160.A O HIS 73.A HD1 2.883 2.065 LEU 74.A N HIS 71.A O LEU 74.A H 2.975 2.142 VAL 75.A N LEU 162.A O VAL 75.A H 3.072 2.219 LEU 76.A N GLU 92.A OE1 LEU 76.A H 2.993 2.135 TYR 78.A N VAL 90.A O TYR 78.A H 2.737 1.926 GLY 79.A N VAL 90.A O GLY 79.A H 3.145 2.345 VAL 80.A N HIS 3.A O VAL 80.A H 2.957 2.175 CYS 81.A N ILE 88.A O CYS 81.A H 3.159 2.361 CYS 81.A SG ILE 5.A O no hydrogen 3.848 N/A CYS 83.A SG ASN 7.A OD1 no hydrogen 3.729 N/A GLU 86.A N CYS 83.A O GLU 86.A H 3.096 2.255 LEU 89.A N LYS 46.A O LEU 89.A H 2.904 2.097 VAL 90.A N GLY 79.A O VAL 90.A H 2.804 1.980 GLN 91.A N LEU 44.A O GLN 91.A H 2.941 2.147 GLN 91.A NE2.A SER 163.A OG GLN 91.A HE22.A 2.984 2.132 GLN 91.A NE2.B ASN 77.A OD1.A GLN 91.A HE21.B 2.392 1.695 GLN 91.A NE2.B ASP 164.A OD2 GLN 91.A HE22.B 2.829 1.986 GLU 92.A N LEU 76.A O GLU 92.A H 2.780 1.947 PHE 96.A N LEU 146.A O PHE 96.A H 2.998 2.193 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.003 2.212 SER 98.A OG LYS 142.A O SER 98.A HG 2.761 2.037 LEU 99.A N ILE 144.A O LEU 99.A H 2.736 1.968 TYR 102.A N SER 98.A O TYR 102.A H 3.127 2.311 TYR 102.A OH GLU 149.A OE2 TYR 102.A HH 2.640 1.807 LEU 103.A N LEU 99.A O LEU 103.A H 2.823 1.986 LYS 104.A N ASP 100.A O LYS 104.A H 3.314 2.496 LYS 105.A N THR 101.A O LYS 105.A H 3.063 2.231 ASN 106.A N TYR 102.A O ASN 106.A H 3.037 2.289 ASN 106.A ND2 TYR 102.A O ASN 106.A HD22 3.074 2.339 CYS 109.A N ASN 106.A O CYS 109.A H 3.138 2.389 TRP 114.A N ASN 111.A OD1 TRP 114.A H 2.894 2.057 LYS 115.A N ASN 111.A O LYS 115.A H 3.175 2.352 LYS 115.A NZ CYS 212.A O LYS 115.A HZ3 3.407 2.625 LEU 116.A N ILE 112.A O LEU 116.A H 2.746 1.911 GLU 117.A N LEU 113.A O GLU 117.A H 2.975 2.164 VAL 118.A N TRP 114.A O VAL 118.A H 3.108 2.272 ALA 119.A N LYS 115.A O ALA 119.A H 2.868 2.041 LYS 120.A N LEU 116.A O LYS 120.A H 2.882 2.050 GLN 121.A N GLU 117.A O GLN 121.A H 3.002 2.194 GLN 121.A NE2 GLU 117.A OE2 GLN 121.A HE21 2.896 2.036 GLN 121.A NE2 PRO 158.A O GLN 121.A HE22 2.774 1.934 LEU 122.A N VAL 118.A O LEU 122.A H 2.944 2.092 ALA 123.A N ALA 119.A O ALA 123.A H 2.885 2.064 ALA 124.A N LYS 120.A O ALA 124.A H 2.872 2.068 ALA 125.A N GLN 121.A O ALA 125.A H 3.016 2.192 MET 126.A N LEU 122.A O MET 126.A H 2.913 2.096 HIS 127.A N ALA 123.A O HIS 127.A H 2.787 1.994 PHE 128.A N ALA 124.A O PHE 128.A H 3.042 2.191 LEU 129.A N ALA 125.A O LEU 129.A H 2.972 2.154 GLU 130.A N MET 126.A O GLU 130.A H 2.812 2.012 GLU 131.A N HIS 127.A O GLU 131.A H 2.832 1.975 ASN 132.A N PHE 128.A O ASN 132.A H 3.169 2.441 ASN 132.A N LEU 129.A O ASN 132.A H 3.107 2.496 ASN 132.A ND2 PHE 128.A O ASN 132.A HD22 2.962 2.105 THR 133.A N GLU 130.A O THR 133.A H 2.753 1.912 LEU 134.A N LEU 129.A O LEU 134.A H 2.962 2.110 HIS 136.A N ASP 200.A OD2 HIS 136.A H 2.757 1.920 HIS 136.A NE2 SER 163.A O HIS 136.A HE2 2.789 1.932 GLY 137.A N ASP 200.A OD1 GLY 137.A H 2.781 1.965 ASN 138.A N HIS 136.A ND1 ASN 138.A H 3.056 2.226 ASN 138.A ND2 PRO 165.A O ASN 138.A HD22 3.117 2.281 ALA 141.A N GLU 210.A OE1 ALA 141.A H 2.789 1.950 ASN 143.A N CYS 140.A O ASN 143.A H 3.046 2.286 ASN 143.A ND2 ASN 138.A O ASN 143.A HD22 2.968 2.162 ILE 144.A N ALA 141.A O ILE 144.A H 3.170 2.356 LEU 145.A N LYS 161.A O LEU 145.A H 2.774 1.931 LEU 146.A N GLY 97.A O LEU 146.A H 2.975 2.169 ILE 147.A N PHE 159.A O ILE 147.A H 2.852 2.155 ARG 148.A NE PRO 157.A O ARG 148.A HE 3.007 2.362 ARG 148.A NH2 PRO 157.A O ARG 148.A HH21 2.690 1.973 ASP 151.A N ASN 156.A O ASP 151.A H 2.873 2.022 GLY 155.A N ARG 152.A O GLY 155.A H 3.290 2.506 ASN 156.A N ASP 151.A O ASN 156.A H 3.026 2.362 PHE 159.A N ARG 148.A O PHE 159.A H 3.167 2.382 ILE 160.A N GLN 121.A OE1 ILE 160.A H 2.895 2.102 LYS 161.A N LEU 145.A O LYS 161.A H 2.833 2.039 LYS 161.A NZ LEU 74.A O LYS 161.A HZ3 3.520 2.693 LYS 161.A NZ GLU 92.A OE1 LYS 161.A HZ2 2.810 1.939 LYS 161.A NZ GLU 92.A OE2 LYS 161.A HZ2 3.327 2.625 LEU 162.A N HIS 73.A O LEU 162.A H 2.804 1.979 SER 163.A N ASN 143.A O SER 163.A H 2.961 2.101 GLY 166.A N ASP 164.A OD1 GLY 166.A H 2.802 1.992 SER 168.A N SER 58.A OG SER 168.A H 2.925 2.067 THR 170.A N SER 168.A OG THR 170.A H 3.097 2.256 VAL 171.A N SER 168.A O VAL 171.A H 3.038 2.181 ILE 176.A N PRO 173.A O ILE 176.A H 3.020 2.372 LEU 177.A N PRO 173.A O LEU 177.A H 3.321 2.512 GLN 178.A N LYS 174.A O GLN 178.A H 2.971 2.142 GLU 179.A N ASP 175.A O GLU 179.A H 3.027 2.202 ARG 180.A N ILE 176.A O ARG 180.A H 3.001 2.350 ARG 180.A N LEU 177.A O ARG 180.A H 2.892 2.237 ARG 180.A NH2 THR 20.A OG1 ARG 180.A HH21 2.690 1.911 ILE 181.A N GLN 178.A O ILE 181.A H 3.041 2.198 TRP 183.A N ARG 180.A O TRP 183.A H 2.826 2.142 TRP 183.A NE1 GLU 210.A OE1 TRP 183.A HE1 2.945 2.107 VAL 184.A N ARG 180.A O VAL 184.A H 3.079 2.260 GLU 187.A N GLU 187.A OE1 GLU 187.A H 2.833 2.031 CYS 188.A N PRO 185.A O CYS 188.A H 2.975 2.235 ILE 189.A N PRO 185.A O ILE 189.A H 3.222 2.429 GLU 190.A N PRO 186.A O GLU 190.A H 3.026 2.203 ASN 191.A N GLU 187.A O ASN 191.A H 2.952 2.177 LYS 193.A N ASN 191.A OD1 LYS 193.A H 2.918 2.079 ASN 194.A N ASN 191.A O ASN 194.A H 2.860 2.007 ASN 194.A ND2 GLU 187.A O ASN 194.A HD22 2.818 1.966 LEU 195.A N PRO 192.A O LEU 195.A H 3.143 2.318 ASN 196.A N THR 199.A OG1 ASN 196.A H 3.009 2.211 ALA 198.A N ASN 196.A OD1 ALA 198.A H 2.762 1.904 THR 199.A N ASN 196.A O THR 199.A H 2.797 2.090 ASP 200.A N LEU 197.A O ASP 200.A H 3.102 2.436 LYS 201.A N ALA 198.A O LYS 201.A H 3.202 2.606 LYS 201.A NZ GLU 130.A OE2 LYS 201.A HZ2 2.747 1.861 TRP 202.A N ALA 198.A O TRP 202.A H 3.319 2.491 TRP 202.A NE1 PRO 182.A O TRP 202.A HE1 2.847 2.052 SER 203.A N THR 199.A O SER 203.A H 2.984 2.142 SER 203.A OG TRP 183.A O SER 203.A HG 2.761 1.934 PHE 204.A N ASP 200.A O PHE 204.A H 2.810 2.018 GLY 205.A N LYS 201.A O GLY 205.A H 3.187 2.400 THR 206.A N TRP 202.A O THR 206.A H 3.168 2.364 THR 206.A OG1 PRO 182.A O THR 206.A HG1 2.754 2.020 THR 207.A N SER 203.A O THR 207.A H 2.898 2.075 THR 207.A OG1 SER 203.A O THR 207.A HG1 2.944 2.144 LEU 208.A N PHE 204.A O LEU 208.A H 2.864 2.040 TRP 209.A N GLY 205.A O TRP 209.A H 2.970 2.152 TRP 209.A NE1 PRO 238.A O TRP 209.A HE1 2.761 1.970 GLU 210.A N THR 206.A O GLU 210.A H 2.998 2.184 ILE 211.A N THR 207.A O ILE 211.A H 2.899 2.084 CYS 212.A N LEU 208.A O CYS 212.A H 2.908 2.131 CYS 212.A SG LEU 208.A O CYS 212.A HG 3.368 2.505 SER 213.A N GLU 210.A O SER 213.A H 3.067 2.269 SER 213.A OG TRP 209.A O SER 213.A HG 2.792 2.056 GLY 215.A N GLU 210.A O GLY 215.A H 3.355 2.502 ASP 216.A N SER 213.A O ASP 216.A H 3.150 2.303 LYS 217.A NZ ASP 100.A OD2 LYS 217.A HZ2 2.808 1.934 SER 220.A N LYS 217.A O SER 220.A H 3.248 2.470 LEU 222.A N LEU 219.A O LEU 222.A H 2.946 2.104 ARG 226.A N ASP 223.A OD1 ARG 226.A H 2.945 2.122 LYS 227.A N ASP 223.A O LYS 227.A H 2.801 1.994 LYS 227.A NZ.A ILE 181.A O LYS 227.A HZ3.A 2.993 2.162 LYS 227.A NZ.B LEU 222.A O LYS 227.A HZ1.B 2.552 1.696 LEU 228.A N SER 224.A O LEU 228.A H 3.039 2.240 GLN 229.A N GLN 225.A O GLN 229.A H 3.129 2.322 PHE 230.A N ARG 226.A O PHE 230.A H 2.891 2.082 TYR 231.A N LYS 227.A O TYR 231.A H 3.359 2.585 TYR 231.A OH VAL 184.A O TYR 231.A HH 2.606 1.769 GLU 232.A N LEU 228.A O GLU 232.A H 2.850 2.017 ASP 233.A N GLN 229.A O ASP 233.A H 2.807 1.959 ARG 234.A N TYR 231.A O ARG 234.A H 2.862 2.072 HIS 235.A N PHE 230.A O HIS 235.A H 3.024 2.174 GLN 236.A NE2 MET 253.A O GLN 236.A HE22 3.064 2.261 GLU 244.A N GLU 244.A OE1 GLU 244.A H 2.722 1.929 ALA 246.A N ALA 243.A O ALA 246.A H 3.093 2.239 ILE 249.A N LEU 245.A O ILE 249.A H 2.906 2.058 ASN 250.A N ALA 246.A O ASN 250.A H 3.020 2.193 ASN 251.A N ASN 247.A O ASN 251.A H 2.936 2.112 CYS 252.A N LEU 248.A O CYS 252.A H 2.961 2.140 CYS 252.A SG LEU 248.A O CYS 252.A HG 3.360 2.428 MET 253.A N ILE 249.A O MET 253.A H 2.919 2.097 TYR 255.A OH HIS 235.A O TYR 255.A HH 2.607 1.768 GLU 256.A N ASP 254.A OD1 GLU 256.A H 2.869 2.021 ASP 258.A N GLU 256.A OE2 ASP 258.A H 3.042 2.200 HIS 259.A N GLU 256.A O HIS 259.A H 3.058 2.236 ARG 260.A N PRO 257.A O ARG 260.A H 3.213 2.369 ARG 260.A NE ASP 254.A O ARG 260.A HE 2.722 1.942 ARG 260.A NH1 GLU 187.A OE2 ARG 260.A HH12 2.799 1.961 ARG 260.A NH1 ALA 198.A O ARG 260.A HH11 3.005 2.194 ARG 260.A NH2 GLU 187.A OE1 ARG 260.A HH22 2.844 1.993 ARG 260.A NH2 GLU 187.A OE2 ARG 260.A HH22 3.522 2.899 ARG 260.A NH2 ASP 254.A O ARG 260.A HH21 2.835 2.099 PHE 263.A N GLU 130.A OE1 PHE 263.A H 3.048 2.189 ALA 265.A N SER 262.A OG ALA 265.A H 3.017 2.171 ILE 266.A N SER 262.A O ILE 266.A H 2.869 2.069 ILE 267.A N PHE 263.A O ILE 267.A H 2.872 2.034 ARG 268.A N ARG 264.A O ARG 268.A H 3.014 2.189 ASP 269.A N ALA 265.A O ASP 269.A H 3.032 2.250 LEU 270.A N ILE 266.A O LEU 270.A H 2.901 2.060 ASN 271.A N ILE 267.A O ASN 271.A H 2.934 2.119 SER 272.A N ASP 269.A O SER 272.A H 2.950 2.165 SER 272.A OG.A ASP 269.A O SER 272.A HG.A 2.816 1.982 SER 272.A OG.B ARG 268.A O SER 272.A HG.B 2.722 1.927