Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8bp1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 2.A N ASN 229.A OD1 ILE 2.A H 2.678 1.842 ARG 3.A N LYS 173.A O ARG 3.A H 2.772 1.938 VAL 5.A N HIS 116.A O VAL 5.A H 2.805 1.967 PHE 6.A N VAL 175.A O PHE 6.A H 2.856 2.007 PHE 7.A N GLY 118.A O PHE 7.A H 2.826 2.087 ASP 8.A N VAL 177.A O ASP 8.A H 2.888 2.032 GLY 11.A N ILE 14.A O GLY 11.A H 2.780 1.998 THR 12.A N SER 9.A O THR 12.A H 2.957 2.130 LEU 13.A N SER 9.A O LEU 13.A H 2.845 2.184 ILE 14.A N SER 9.A O ILE 14.A H.B 3.008 2.159 SER 15.A N GLU 99.A O SER 15.A H.A 2.871 2.022 SER 15.A OG.A GLU 17.A OE2 SER 15.A HG.A 3.070 2.309 VAL 16.A N TYR 101.A OH VAL 16.A H.A 3.251 2.399 GLY 18.A N SER 15.A OG.A GLY 18.A H 2.922 2.077 GLY 18.A N SER 15.A OG.B GLY 18.A H 2.717 1.954 ALA 19.A N SER 15.A O ALA 19.A H 2.939 2.127 TYR 20.A N VAL 16.A O TYR 20.A H 2.923 2.126 LYS 21.A N GLU 17.A O LYS 21.A H 3.079 2.257 VAL 22.A N GLY 18.A O VAL 22.A H 2.882 2.047 LEU 23.A N TYR 20.A O LEU 23.A H 2.822 1.994 LYS 24.A N LYS 21.A O LYS 24.A H 2.909 2.077 LYS 24.A NZ GLU 27.A OE1 LYS 24.A HZ3 3.321 2.488 ILE 25.A N VAL 22.A O ILE 25.A H 2.981 2.182 GLU 27.A N LEU 23.A O GLU 27.A H 2.865 2.042 GLU 28.A N LYS 24.A O GLU 28.A H 3.014 2.195 VAL 29.A N ILE 25.A O VAL 29.A H 2.836 1.997 LEU 30.A N MET 26.A O LEU 30.A H 2.974 2.176 GLY 31.A N GLU 27.A O GLY 31.A H 3.138 2.359 TYR 33.A N LEU 30.A O TYR 33.A H 2.944 2.093 TYR 33.A OH TYR 78.A O TYR 33.A HH 2.684 1.955 LEU 35.A N TYR 33.A O LEU 35.A H 2.723 1.980 LYS 38.A N ASN 36.A OD1 LYS 38.A H 2.989 2.170 THR 39.A N ASN 36.A O THR 39.A H 2.924 2.299 LEU 40.A N ASN 36.A O LEU 40.A H 3.102 2.281 LEU 41.A N PRO 37.A O LEU 41.A H 2.840 2.016 ASP 42.A N LYS 38.A O ASP 42.A H 2.961 2.143 GLU 43.A N THR 39.A O GLU 43.A H.A 3.087 2.259 TYR 44.A N LEU 40.A O TYR 44.A H 2.786 1.946 GLU 45.A N LEU 41.A O GLU 45.A H.B 2.877 2.064 LYS 46.A N ASP 42.A O LYS 46.A H 3.236 2.438 LYS 46.A NZ GLU 43.A OE2.B LYS 46.A HZ2 2.596 1.839 LEU 47.A N GLU 43.A O LEU 47.A H 3.134 2.285 ALA 48.A N TYR 44.A O ALA 48.A H 2.855 2.006 ARG 49.A N GLU 45.A O ARG 49.A H 3.030 2.182 GLU 50.A N LYS 46.A O GLU 50.A H.A 3.143 2.307 ALA 51.A N LEU 47.A O ALA 51.A H 2.788 1.930 PHE 52.A N ALA 48.A O PHE 52.A H 2.853 2.032 SER 53.A N ARG 49.A O SER 53.A H 2.775 1.966 SER 53.A OG GLU 50.A O SER 53.A HG 3.013 2.174 ASN 54.A N GLU 50.A O ASN 54.A H 3.185 2.412 TYR 55.A N PHE 52.A O TYR 55.A H 2.739 1.930 ALA 56.A N SER 53.A O ALA 56.A H 3.379 2.569 GLY 57.A N LYS 154.A O GLY 57.A H 3.011 2.252 LYS 58.A N TYR 55.A O LYS 58.A H 2.927 2.098 TYR 60.A N GLY 151.A O TYR 60.A H 2.882 2.054 TYR 60.A OH ASP 124.A OD1 TYR 60.A HH 2.372 1.635 ARG 61.A NH1 TYR 55.A OH ARG 61.A HH11 2.664 1.949 ARG 61.A NH1 GLU 69.A OE1 ARG 61.A HH12 3.210 2.403 ARG 61.A NH2 GLU 69.A OE1 ARG 61.A HH22 3.329 2.561 LEU 63.A N ASP 124.A OD1 LEU 63.A H 3.032 2.201 ARG 64.A N ASP 124.A OD2 ARG 64.A H 3.277 2.493 ARG 64.A NE GLU 68.A OE2 ARG 64.A HE 3.089 2.251 ASP 65.A N PRO 62.A O ASP 65.A H 3.073 2.472 ILE 66.A N PRO 62.A O ILE 66.A H 3.270 2.478 LEU 67.A N LEU 63.A O LEU 67.A H 2.873 2.035 GLU 68.A N ARG 64.A O GLU 68.A H 2.903 2.070 GLU 69.A N ASP 65.A O GLU 69.A H 3.088 2.281 VAL 70.A N ILE 66.A O VAL 70.A H 3.140 2.360 MET 71.A N LEU 67.A O MET 71.A H 2.972 2.141 ARG 72.A N GLU 68.A O ARG 72.A H 2.902 2.097 LYS 73.A N GLU 69.A O LYS 73.A H 3.132 2.302 LEU 74.A N VAL 70.A O LEU 74.A H 3.008 2.223 ALA 75.A N MET 71.A O ALA 75.A H 2.823 1.980 GLU 76.A N ARG 72.A O GLU 76.A H 3.002 2.169 LYS 77.A N LYS 73.A O LYS 77.A H 2.881 2.064 TYR 78.A N LEU 74.A O TYR 78.A H 2.936 2.122 GLY 79.A N ALA 75.A O GLY 79.A H 2.839 2.040 ILE 89.A N ASN 85.A O ILE 89.A H 3.100 2.257 SER 90.A N LEU 86.A O SER 90.A H.A 2.941 2.122 SER 90.A OG.A LEU 86.A O SER 90.A HG.A 2.979 2.238 SER 90.A OG.B TRP 87.A O SER 90.A HG.B 2.608 1.862 LEU 91.A N TRP 87.A O LEU 91.A H 2.887 2.082 ARG 92.A N GLU 88.A O ARG 92.A H.A 2.989 2.158 ARG 92.A NE.A GLU 88.A OE2 ARG 92.A HE.A 3.302 2.684 ARG 92.A NH2.A GLU 88.A OE2 ARG 92.A HH21.A 3.399 2.814 MET 93.A N ILE 89.A O MET 93.A H 2.953 2.121 ALA 94.A N SER 90.A O ALA 94.A H 2.922 2.097 GLN 95.A N LEU 91.A O GLN 95.A H.A 3.019 2.196 ARG 96.A N ARG 92.A O ARG 96.A H 2.963 2.218 ARG 96.A NE TYR 97.A OH ARG 96.A HE 2.874 2.138 TYR 97.A N MET 93.A O TYR 97.A H 2.897 2.102 GLY 98.A N ALA 94.A O GLY 98.A H 2.902 2.119 TYR 101.A N LEU 13.A O TYR 101.A H 3.077 2.270 GLU 103.A N GLU 103.A OE1 GLU 103.A H 2.774 1.984 VAL 104.A N TYR 101.A O VAL 104.A H 3.203 2.350 VAL 107.A N GLU 103.A O VAL 107.A H 2.988 2.159 LEU 108.A N VAL 104.A O LEU 108.A H 2.861 2.005 LYS 109.A N VAL 105.A O LYS 109.A H 2.965 2.119 SER 110.A N GLU 106.A O SER 110.A H 2.962 2.193 SER 110.A OG VAL 107.A O SER 110.A HG 2.738 1.923 LEU 111.A N VAL 107.A O LEU 111.A H 3.169 2.451 LEU 111.A N LEU 108.A O LEU 111.A H 3.252 2.568 LYS 112.A N LEU 108.A O LYS 112.A H 3.160 2.423 LYS 112.A NZ ASP 142.A OD1 LYS 112.A HZ3 3.184 2.338 LYS 114.A N LEU 111.A O LYS 114.A H 3.114 2.285 TYR 115.A N LEU 111.A O TYR 115.A H 3.026 2.220 TYR 115.A OH ASP 226.A OD1 TYR 115.A HH 3.324 2.705 HIS 116.A N ARG 3.A O HIS 116.A H 2.923 2.102 VAL 117.A N ASP 142.A OD2 VAL 117.A H 2.790 1.943 GLY 118.A N VAL 5.A O GLY 118.A H 2.948 2.114 VAL 119.A N SER 143.A O VAL 119.A H 3.059 2.259 ILE 120.A N PHE 7.A O ILE 120.A H 2.885 2.063 LEU 121.A N THR 145.A O LEU 121.A H 2.788 1.955 ARG 123.A NH1 ASN 122.A O ARG 123.A HH11 2.825 2.043 THR 125.A N GLU 148.A OE1 THR 125.A H 2.796 1.944 ALA 128.A N ASP 124.A O ALA 128.A H 3.203 2.372 THR 129.A N THR 125.A O THR 129.A H 2.920 2.084 THR 129.A OG1 THR 125.A O THR 129.A HG1 2.869 2.165 ALA 130.A N GLU 126.A O ALA 130.A H 2.966 2.119 PHE 131.A N PRO 127.A O PHE 131.A H 2.927 2.155 LEU 132.A N ALA 128.A O LEU 132.A H 3.059 2.219 ASP 133.A N THR 129.A O ASP 133.A H 2.891 2.098 ALA 134.A N ALA 130.A O ALA 134.A H 2.856 2.077 LEU 135.A N PHE 131.A O LEU 135.A H 2.911 2.099 GLY 136.A N ASP 133.A O GLY 136.A H 3.064 2.310 ILE 137.A N LEU 132.A O ILE 137.A H 3.068 2.253 LEU 140.A N ILE 137.A O LEU 140.A H 3.023 2.229 PHE 141.A N LYS 138.A O PHE 141.A H 3.452 2.617 ASP 142.A N VAL 117.A O ASP 142.A H 2.651 1.913 SER 143.A N VAL 117.A O SER 143.A H 3.362 2.601 THR 145.A N VAL 119.A O THR 145.A H 2.969 2.148 THR 146.A N GLU 149.A OE1 THR 146.A H 3.299 2.555 THR 146.A OG1 THR 125.A OG1 THR 146.A HG1 2.669 1.860 SER 147.A N LEU 121.A O SER 147.A H.A 3.052 2.349 SER 147.A OG.B ASN 122.A OD1 SER 147.A HG.B 2.562 1.938 GLU 149.A N THR 146.A O GLU 149.A H 3.092 2.505 GLU 149.A N THR 146.A OG1 GLU 149.A H 3.085 2.291 ALA 150.A N THR 146.A O ALA 150.A H 2.968 2.149 GLY 151.A N SER 147.A O GLY 151.A H 2.784 1.996 PHE 153.A N LYS 58.A O PHE 153.A H 3.006 2.177 LYS 154.A N ASN 122.A OD1 LYS 154.A H 2.843 2.047 LYS 154.A NZ TYR 176.A OH LYS 154.A HZ2 3.396 2.644 LYS 154.A NZ ASP 184.A OD1 LYS 154.A HZ2 2.601 1.836 HIS 156.A N PHE 153.A O HIS 156.A H 2.927 2.097 ARG 158.A N HIS 156.A ND1 ARG 158.A H 3.068 2.216 GLU 161.A N PRO 157.A O GLU 161.A H.A 2.817 1.980 LEU 162.A N ARG 158.A O LEU 162.A H 2.950 2.134 ALA 163.A N ILE 159.A O ALA 163.A H 3.187 2.343 LEU 164.A N PHE 160.A O LEU 164.A H 2.977 2.138 LYS 165.A N GLU 161.A O LYS 165.A H 2.958 2.141 LYS 166.A N LEU 162.A O LYS 166.A H 2.968 2.145 LYS 166.A NZ ILE 144.A O LYS 166.A HZ1 2.708 2.053 LYS 166.A NZ GLU 149.A OE1 LYS 166.A HZ3 2.841 2.028 ALA 167.A N ALA 163.A O ALA 167.A H 3.160 2.374 GLY 168.A N LYS 165.A O GLY 168.A H 2.967 2.280 VAL 169.A N LEU 164.A O VAL 169.A H 3.302 2.502 GLU 172.A N GLU 172.A OE2 GLU 172.A H 2.818 2.043 LYS 173.A N LYS 170.A O LYS 173.A H 2.924 2.083 ALA 174.A N GLY 171.A O ALA 174.A H 2.877 2.079 VAL 175.A N ALA 4.A O VAL 175.A H.B 3.011 2.200 TYR 176.A N THR 194.A O TYR 176.A H 2.876 2.061 TYR 176.A OH ASP 184.A OD1 TYR 176.A HH 2.786 1.955 VAL 177.A N PHE 6.A O VAL 177.A H.A 2.900 2.077 GLY 178.A N ILE 196.A O GLY 178.A H 3.087 2.286 ASN 180.A N ASP 184.A OD2 ASN 180.A H 2.937 2.152 LYS 183.A N ASN 180.A OD1 LYS 183.A H 3.000 2.146 ASP 184.A N ASN 180.A O ASP 184.A H 2.901 2.094 ALA 185.A N ASN 180.A O ALA 185.A H 3.283 2.499 GLY 186.A N PRO 181.A O GLY 186.A H 2.909 2.090 GLY 187.A N VAL 182.A O GLY 187.A H 3.079 2.461 SER 188.A N ASP 184.A O SER 188.A H 3.056 2.221 SER 188.A OG ASP 184.A O SER 188.A HG 2.930 2.204 SER 188.A OG ALA 185.A O SER 188.A HG 3.289 2.666 LYS 189.A N ALA 185.A O LYS 189.A H 3.066 2.215 LYS 189.A NZ MET 193.A O LYS 189.A HZ2 3.030 2.388 ASN 190.A N GLY 186.A O ASN 190.A H.A 3.315 2.627 ASN 190.A N GLY 187.A O ASN 190.A H.A 3.318 2.600 LEU 191.A N SER 188.A O LEU 191.A H 2.957 2.117 GLY 192.A N LYS 189.A O GLY 192.A H 3.020 2.166 MET 193.A N SER 188.A O MET 193.A H 3.326 2.544 THR 194.A N ALA 174.A O THR 194.A H 2.981 2.132 SER 195.A N ASP 212.A OD2 SER 195.A H 2.861 2.026 ILE 196.A N TYR 176.A O ILE 196.A H 2.863 2.010 LEU 197.A N PHE 213.A O LEU 197.A H 2.815 1.998 LEU 198.A N GLY 178.A O LEU 198.A H 2.786 1.940 ASP 199.A N VAL 215.A O ASP 199.A H 2.746 1.910 ARG 200.A NE GLY 11.A O ARG 200.A HE 3.523 2.680 ARG 200.A NH1 GLU 103.A OE2 ARG 200.A HH12 2.878 2.073 ARG 200.A NH2 THR 12.A O ARG 200.A HH21 2.714 2.007 ARG 200.A NH2 GLU 103.A OE2 ARG 200.A HH22 3.211 2.513 LYS 201.A NZ GLU 17.A OE1 LYS 201.A HZ1 3.507 2.788 GLY 202.A N ASP 199.A O GLY 202.A H 3.320 2.498 GLU 203.A N ASP 199.A OD1 GLU 203.A H 2.885 2.061 LYS 204.A N ASP 199.A OD2 LYS 204.A H 2.870 2.062 LYS 204.A NZ ASP 179.A O LYS 204.A HZ3 2.817 1.955 LYS 204.A NZ LEU 198.A O LYS 204.A HZ2 2.954 2.268 GLU 206.A N GLU 206.A OE1 GLU 206.A H 2.739 1.928 PHE 207.A N LYS 204.A O PHE 207.A H 2.789 1.942 TRP 208.A N ARG 205.A O TRP 208.A H 3.016 2.158 TRP 208.A NE1 ASP 199.A OD2 TRP 208.A HE1 2.852 2.016 LYS 210.A N PHE 207.A O LYS 210.A H 3.031 2.181 ALA 211.A N TRP 208.A O ALA 211.A H 3.258 2.422 ASP 212.A N SER 195.A O ASP 212.A H 3.007 2.333 ASP 212.A N SER 195.A OG ASP 212.A H 2.961 2.225 PHE 213.A N SER 195.A O PHE 213.A H 3.069 2.303 VAL 215.A N LEU 197.A O VAL 215.A H 2.968 2.147 SER 216.A N GLU 220.A OE2 SER 216.A H 2.921 2.090 LEU 218.A N GLU 103.A OE2 LEU 218.A H 2.900 2.043 ARG 219.A N ASP 217.A OD1 ARG 219.A H 2.820 1.974 ARG 219.A NE ASP 217.A OD1 ARG 219.A HE 2.966 2.185 ARG 219.A NH2 ASP 217.A OD2 ARG 219.A HH21 2.854 2.060 GLU 220.A N ASP 217.A O GLU 220.A H 3.078 2.245 VAL 221.A N LEU 218.A O VAL 221.A H 3.045 2.203 ILE 224.A N GLU 220.A O ILE 224.A H 3.158 2.339 VAL 225.A N VAL 221.A O VAL 225.A H 2.924 2.102 ASP 226.A N ILE 222.A O ASP 226.A H 2.789 1.948 GLU 227.A N LYS 223.A O GLU 227.A H 3.024 2.191 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 2.891 2.044 ASN 229.A N VAL 225.A O ASN 229.A H 3.065 2.379 ASN 229.A N ASP 226.A O ASN 229.A H 3.149 2.482 ASN 229.A ND2 ILE 2.A O ASN 229.A HD21 3.112 2.265 GLY 230.A N GLU 227.A O GLY 230.A H 3.017 2.164