Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8bqa_AAA.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N ASP 89.A OD2 MET 1.A H2 3.327 2.498 SER 6.A N LEU 13.A O SER 6.A H 3.188 2.361 VAL 7.A N ASN 186.A OD1 VAL 7.A H 2.928 2.049 GLN 8.A N LYS 11.A O GLN 8.A H 2.910 2.066 ASN 10.A ND2 LEU 210.A O ASN 10.A HD22 2.787 1.981 LYS 11.A N GLN 8.A O LYS 11.A H 3.114 2.230 LEU 13.A N SER 6.A O LEU 13.A H 2.805 1.940 ALA 14.A N GLN 17.A O ALA 14.A H 3.095 2.257 GLN 17.A N ALA 14.A O GLN 17.A H 3.151 2.258 GLN 17.A NE2 GLY 16.A O GLN 17.A HE22 3.385 2.820 ALA 19.A N ILE 12.A O ALA 19.A H 2.951 2.067 PHE 21.A N SER 250.A OG PHE 21.A H 2.882 2.066 GLY 23.A N ASN 251.A O GLY 23.A H 2.973 2.141 MET 24.A N LEU 55.A O MET 24.A H 3.268 2.570 SER 25.A N ASN 253.A O SER 25.A H 2.818 1.973 LEU 26.A N ARG 57.A O LEU 26.A H 2.960 2.101 SER 29.A N ALA 59.A O SER 29.A H 2.828 2.086 ASN 30.A ND2 GLU 65.A O ASN 30.A HD22 2.905 2.144 THR 31.A N GLY 66.A O THR 31.A H 2.988 2.166 THR 31.A OG1 ASP 71.A OD2 THR 31.A HG1 2.556 1.721 GLU 32.A N GLU 36.A OE2 GLU 32.A H 2.749 1.856 TRP 33.A N ASN 30.A O TRP 33.A H 3.054 2.209 TRP 33.A NE1 GLU 65.A OE1 TRP 33.A HE1 2.823 1.983 LYS 37.A NZ GLY 34.A O LYS 37.A HZ3 2.821 2.202 TYR 38.A N GLY 35.A O TYR 38.A H 3.057 2.174 TYR 38.A OH ALA 270.A O TYR 38.A HH 2.719 1.913 TYR 39.A N GLU 36.A O TYR 39.A H 3.067 2.167 TYR 39.A OH PHE 27.A O TYR 39.A HH 2.476 1.619 ASN 40.A ND2 LYS 37.A O ASN 40.A HD22 2.783 2.104 ASN 40.A ND2 ALA 272.A O ASN 40.A HD21 2.667 1.784 VAL 43.A N ASN 40.A OD1 VAL 43.A H 3.004 2.119 VAL 44.A N ASN 40.A O VAL 44.A H 3.355 2.498 SER 45.A N ALA 41.A O SER 45.A H 3.069 2.198 TRP 46.A N GLN 42.A O TRP 46.A H 2.964 2.100 LEU 47.A N VAL 43.A O LEU 47.A H 2.886 2.004 LYS 48.A N VAL 44.A O LYS 48.A H 3.103 2.232 LYS 48.A NZ ASN 88.A O LYS 48.A HZ1 3.099 2.284 SER 49.A N SER 45.A O SER 49.A H 2.871 2.007 ASP 50.A N TRP 46.A O ASP 50.A H 2.762 1.866 TRP 51.A N LEU 47.A O TRP 51.A H 3.031 2.285 ALA 53.A N LEU 47.A O ALA 53.A H 3.105 2.196 LYS 54.A N SER 22.A O LYS 54.A H 2.988 2.112 LYS 54.A NZ ASN 52.A OD1 LYS 54.A HZ3 3.419 2.761 VAL 56.A N TYR 91.A O VAL 56.A H 2.938 2.105 ARG 57.A N MET 24.A O ARG 57.A H 2.974 2.167 ARG 57.A NE GLU 128.A OE1 ARG 57.A HE 2.699 1.860 ARG 57.A NH1 SER 25.A OG ARG 57.A HH11 3.000 2.162 ARG 57.A NH2 GLU 128.A OE1 ARG 57.A HH21 3.560 2.942 ARG 57.A NH2 GLU 128.A OE2 ARG 57.A HH21 2.939 2.080 ARG 57.A NH2 ASN 131.A OD1 ARG 57.A HH22 2.821 2.136 ALA 58.A N ILE 93.A O ALA 58.A H 2.837 1.974 ALA 59.A N TYR 39.A OH ALA 59.A H 2.974 2.230 MET 60.A N ASP 95.A O MET 60.A H 2.966 2.124 GLY 61.A N SER 29.A OG GLY 61.A H 3.273 2.516 GLU 63.A N GLU 63.A OE1 GLU 63.A H 2.818 2.006 GLY 67.A N ASP 64.A O GLY 67.A H 2.886 2.194 TYR 68.A N GLY 61.A O TYR 68.A H 2.904 2.002 LEU 69.A N VAL 62.A O LEU 69.A H 3.252 2.358 THR 70.A N GLY 67.A O THR 70.A H 3.160 2.415 ASP 71.A N GLY 67.A O ASP 71.A H 2.831 2.068 ALA 73.A N ASP 71.A OD1 ALA 73.A H 2.996 2.140 ASN 74.A N ASP 71.A O ASN 74.A H 3.161 2.289 ASN 74.A ND2 GLY 66.A O ASN 74.A HD21 2.800 1.929 ASN 74.A ND2 ASP 71.A O ASN 74.A HD22 2.806 1.941 LYS 75.A N PRO 72.A O LYS 75.A H 2.971 2.172 ARG 77.A N ALA 73.A O ARG 77.A H 3.188 2.371 ARG 77.A NE SER 29.A O ARG 77.A HE 2.853 2.067 ARG 77.A NH1 SER 29.A O ARG 77.A HH11 2.937 2.211 ARG 77.A NH1 THR 31.A OG1 ARG 77.A HH12 2.872 2.111 ARG 77.A NH1 ASN 74.A OD1 ARG 77.A HH11 3.200 2.541 VAL 78.A N ASN 74.A O VAL 78.A H 3.112 2.279 THR 79.A N LYS 75.A O THR 79.A H 2.879 1.972 GLN 80.A N ASP 76.A O GLN 80.A H 3.055 2.221 VAL 81.A N ARG 77.A O VAL 81.A H 3.322 2.452 VAL 82.A N VAL 78.A O VAL 82.A H 2.849 1.965 ASP 83.A N THR 79.A O ASP 83.A H 2.874 1.971 ALA 84.A N GLN 80.A O ALA 84.A H 3.004 2.144 ALA 85.A N VAL 81.A O ALA 85.A H 2.678 1.775 ILE 86.A N VAL 82.A O ILE 86.A H 2.915 2.077 ALA 87.A N ASP 83.A O ALA 87.A H 2.933 2.126 ASN 88.A N ALA 84.A O ASN 88.A H 2.953 2.213 ASN 88.A N ALA 85.A O ASN 88.A H 3.134 2.449 ASN 88.A ND2 ALA 84.A O ASN 88.A HD22 2.916 2.037 ASP 89.A N ILE 86.A O ASP 89.A H 3.255 2.370 MET 90.A N ALA 85.A O MET 90.A H 2.982 2.076 TYR 91.A N LYS 54.A O TYR 91.A H 2.903 2.087 TYR 91.A OH ALA 3.A O TYR 91.A HH 2.566 1.709 VAL 92.A N HIS 124.A O VAL 92.A H 2.912 2.029 ILE 93.A N VAL 56.A O ILE 93.A H 2.848 1.989 ILE 94.A N ILE 126.A O ILE 94.A H 2.761 1.920 ASP 95.A N ALA 58.A O ASP 95.A H 3.001 2.131 TRP 96.A N GLU 128.A O TRP 96.A H 2.857 1.971 HIS 97.A N MET 60.A O HIS 97.A H 2.816 1.950 HIS 97.A ND1 ASP 95.A OD2 HIS 97.A HD1 2.512 1.704 SER 98.A N TRP 96.A O SER 98.A H 2.846 2.153 HIS 99.A ND1 GLU 132.A O HIS 99.A HD1 2.827 1.963 ASN 100.A N SER 98.A OG ASN 100.A H 2.905 2.007 HIS 102.A ND1 TYR 130.A OH HIS 102.A HD1 2.762 2.030 GLN 103.A N ASN 100.A O GLN 103.A H 2.891 2.020 TYR 104.A N ALA 101.A O TYR 104.A H 2.873 1.986 GLN 107.A N GLN 107.A OE1 GLN 107.A H 2.926 2.119 ALA 108.A N TYR 104.A O ALA 108.A H 2.987 2.097 ILE 109.A N GLN 105.A O ILE 109.A H 2.911 2.076 ALA 110.A N SER 106.A O ALA 110.A H 3.072 2.217 PHE 111.A N GLN 107.A O PHE 111.A H 2.984 2.084 PHE 112.A N ALA 108.A O PHE 112.A H 2.933 2.025 GLN 113.A N ILE 109.A O GLN 113.A H 2.889 2.025 GLU 114.A N ALA 110.A O GLU 114.A H 3.027 2.184 MET 115.A N PHE 111.A O MET 115.A H 2.819 1.971 ALA 116.A N PHE 112.A O ALA 116.A H 2.830 1.958 ARG 117.A N GLN 113.A O ARG 117.A H 2.985 2.097 LYS 118.A N GLU 114.A O LYS 118.A H 3.010 2.142 LYS 118.A NZ TYR 119.A OH LYS 118.A HZ3 3.084 2.294 TYR 119.A N MET 115.A O TYR 119.A H 2.794 1.934 TYR 119.A OH ASP 83.A OD1 TYR 119.A HH 2.634 1.838 GLY 120.A N ALA 116.A O GLY 120.A H 2.742 1.985 ASN 122.A N TYR 119.A O ASN 122.A H 2.975 2.094 ASN 122.A ND2 TYR 119.A O ASN 122.A HD22 3.227 2.405 ASN 123.A ND2 VAL 2.A O ASN 123.A HD22 3.093 2.249 HIS 124.A NE2 ASP 89.A OD1 HIS 124.A HE2 2.862 1.998 VAL 125.A N ASN 122.A O VAL 125.A H 3.508 2.599 ILE 126.A N VAL 92.A O ILE 126.A H 2.779 1.940 TYR 127.A N LEU 161.A O TYR 127.A H 3.050 2.168 GLU 128.A N ILE 94.A O GLU 128.A H 2.794 1.886 ILE 129.A N ILE 163.A O ILE 129.A H 3.389 2.553 ASN 131.A N TRP 96.A O ASN 131.A H 3.166 2.262 GLU 132.A N SER 98.A O GLU 132.A H 3.334 2.426 VAL 136.A N LEU 134.A O VAL 136.A H 2.938 2.251 TRP 138.A NE1 ASP 179.A O TRP 138.A HE1 2.832 2.004 ASN 140.A N SER 137.A OG ASN 140.A H 2.780 1.919 THR 141.A N SER 137.A O THR 141.A H 3.033 2.217 ILE 142.A N SER 137.A O ILE 142.A H 3.140 2.275 LYS 143.A N TRP 138.A O LYS 143.A H 2.725 1.820 LYS 143.A NZ ASP 179.A O LYS 143.A HZ1 3.177 2.290 ALA 146.A N ILE 142.A O ALA 146.A H 2.895 2.002 GLN 147.A N LYS 143.A O GLN 147.A H 2.676 1.814 ALA 148.A N PRO 144.A O ALA 148.A H 3.153 2.255 VAL 149.A N TYR 145.A O VAL 149.A H 2.971 2.089 ILE 150.A N ALA 146.A O ILE 150.A H 2.751 1.851 ALA 151.A N GLN 147.A O ALA 151.A H 2.920 2.030 ALA 152.A N ALA 148.A O ALA 152.A H 3.290 2.433 ILE 153.A N VAL 149.A O ILE 153.A H 2.989 2.107 ARG 154.A N ILE 150.A O ARG 154.A H 2.679 1.784 ARG 154.A NE GLN 185.A O ARG 154.A HE 3.324 2.623 ARG 154.A NH1 ASP 157.A O ARG 154.A HH11 2.912 2.081 ARG 154.A NH1 ASN 160.A O ARG 154.A HH12 2.845 2.065 ARG 154.A NH2 ASN 160.A O ARG 154.A HH22 2.866 2.088 ARG 154.A NH2 GLN 185.A O ARG 154.A HH21 2.943 2.137 ALA 155.A N ALA 151.A O ALA 155.A H 2.982 2.187 ILE 156.A N ILE 153.A O ILE 156.A H 2.864 2.020 ASP 157.A N ILE 153.A O ASP 157.A H 2.636 1.736 ASP 159.A N ASP 157.A OD1 ASP 159.A H 3.262 2.363 ASN 160.A N ASP 157.A OD1 ASN 160.A H 3.222 2.315 ASN 160.A ND2 ASN 122.A O ASN 160.A HD21 2.714 2.111 ILE 162.A N ASN 186.A O ILE 162.A H 3.159 2.335 ILE 163.A N TYR 127.A O ILE 163.A H 2.789 1.908 VAL 164.A N ALA 188.A O VAL 164.A H 2.949 2.182 THR 166.A N SER 170.A OG THR 166.A H 3.219 2.351 THR 168.A N LEU 134.A O THR 168.A H 2.932 2.039 TRP 169.A N PRO 133.A O TRP 169.A H 2.793 1.984 SER 170.A N THR 166.A O SER 170.A H 2.970 2.239 SER 170.A OG ASN 131.A O SER 170.A HG 2.997 2.403 GLN 171.A N PRO 167.A O GLN 171.A H 3.097 2.371 GLN 171.A N THR 168.A O GLN 171.A H 3.132 2.396 ASP 172.A N PRO 167.A O ASP 172.A H 2.968 2.142 VAL 173.A N GLN 171.A O VAL 173.A H 2.884 2.104 ALA 176.A N ASP 172.A O ALA 176.A H 3.188 2.323 ALA 177.A N VAL 173.A O ALA 177.A H 2.898 2.040 ASN 178.A N VAL 175.A O ASN 178.A H 2.970 2.201 ASP 179.A N ALA 176.A O ASP 179.A H 2.922 2.071 ILE 181.A N TYR 189.A OH ILE 181.A H 2.817 2.017 GLN 185.A NE2 PRO 158.A O GLN 185.A HE22 3.229 2.412 ASN 186.A ND2 ASP 159.A O ASN 186.A HD22 2.926 2.074 ALA 188.A N ILE 162.A O ALA 188.A H 3.015 2.139 TYR 189.A N ALA 215.A O TYR 189.A H 2.919 2.114 THR 190.A N VAL 164.A O THR 190.A H 2.825 1.943 LEU 191.A N PHE 217.A O LEU 191.A H 3.205 2.322 HIS 192.A N SER 170.A O HIS 192.A H 3.046 2.265 HIS 192.A ND1 GLU 132.A OE2 HIS 192.A HD1 2.667 1.817 HIS 192.A NE2 THR 219.A OG1 HIS 192.A HE2 2.583 1.721 TYR 194.A OH GLU 132.A OE2 TYR 194.A HH 2.720 1.989 ALA 195.A N GLY 222.A O ALA 195.A H 2.845 1.961 GLY 196.A N VAL 224.A O GLY 196.A H 2.838 1.978 THR 197.A N TYR 194.A O THR 197.A H 2.727 1.850 HIS 198.A N TYR 194.A O HIS 198.A H 2.657 1.859 GLN 200.A NE2 ASP 204.A OD1 GLN 200.A HE22 2.898 2.210 ARG 203.A N GLY 199.A O ARG 203.A H 3.135 2.251 ARG 203.A NE GLN 200.A OE1 ARG 203.A HE 2.727 1.903 ARG 203.A NH1 GLU 236.A OE2 ARG 203.A HH12 2.653 1.889 ARG 203.A NH2 GLN 200.A OE1 ARG 203.A HH21 3.100 2.402 ARG 203.A NH2 GLU 236.A OE2 ARG 203.A HH22 2.673 1.914 ASP 204.A N GLN 200.A O ASP 204.A H 2.789 1.963 LYS 205.A N TYR 201.A O LYS 205.A H 3.351 2.524 LYS 205.A NZ ASP 172.A OD1 LYS 205.A HZ2 2.814 1.914 LYS 205.A NZ ASP 174.A OD1 LYS 205.A HZ1 2.795 1.897 ALA 206.A N LEU 202.A O ALA 206.A H 2.899 2.027 GLN 207.A N ARG 203.A O GLN 207.A H 2.768 1.900 GLN 207.A NE2 GLN 207.A O GLN 207.A HE22 3.484 2.725 GLN 207.A NE2 ASN 211.A OD1 GLN 207.A HE22 2.873 2.236 THR 208.A N ASP 204.A O THR 208.A H 2.964 2.090 ALA 209.A N LYS 205.A O ALA 209.A H 3.072 2.204 LEU 210.A N ALA 206.A O LEU 210.A H 2.966 2.072 ASN 211.A N GLN 207.A O ASN 211.A H 2.829 1.967 ARG 212.A N THR 208.A O ARG 212.A H 2.943 2.205 ARG 212.A NH1 ASP 174.A O ARG 212.A HH11 3.002 2.360 GLY 213.A N LEU 210.A O GLY 213.A H 2.960 2.134 ILE 214.A N ALA 209.A O ILE 214.A H 3.277 2.368 PHE 217.A N TYR 189.A O PHE 217.A H 3.084 2.346 VAL 218.A N SER 250.A O VAL 218.A H 2.952 2.109 THR 219.A OG1 GLU 128.A OE2 THR 219.A HG1 2.654 1.888 TRP 221.A N ALA 252.A O TRP 221.A H 3.155 2.514 GLY 222.A N PHE 193.A O GLY 222.A H 3.037 2.203 ASN 225.A N ASP 229.A O ASN 225.A H 2.912 2.093 GLY 228.A N ASN 225.A O GLY 228.A H 3.050 2.154 ASP 229.A N ASN 227.A OD1 ASP 229.A H 3.123 2.307 ALA 233.A N SER 223.A O ALA 233.A H 2.674 1.770 THR 237.A N ALA 233.A O THR 237.A H 3.008 2.120 ASN 238.A N ASN 234.A O ASN 238.A H 2.933 2.082 ALA 239.A N SER 235.A O ALA 239.A H 3.022 2.172 TRP 240.A N GLU 236.A O TRP 240.A H 2.988 2.148 TRP 240.A NE1 HIS 198.A O TRP 240.A HE1 2.917 2.055 VAL 241.A N THR 237.A O VAL 241.A H 2.793 1.932 SER 242.A N ASN 238.A O SER 242.A H 3.009 2.141 PHE 243.A N ALA 239.A O PHE 243.A H 3.138 2.235 MET 244.A N TRP 240.A O MET 244.A H 2.885 2.038 LYS 245.A N VAL 241.A O LYS 245.A H 2.839 1.970 THR 246.A N SER 242.A O THR 246.A H 2.878 1.976 ASN 247.A N PHE 243.A O ASN 247.A H 3.105 2.277 ASN 247.A ND2 PHE 243.A O ASN 247.A HD22 2.912 2.037 HIS 248.A N LYS 245.A O HIS 248.A H 3.201 2.308 ILE 249.A N MET 244.A O ILE 249.A H 2.803 1.911 ASN 251.A N PHE 21.A O ASN 251.A H 2.946 2.124 ASN 251.A ND2 ILE 249.A O ASN 251.A HD22 3.108 2.307 ALA 252.A N VAL 218.A O ALA 252.A H 3.006 2.245 ASN 253.A N GLY 23.A O ASN 253.A H 3.111 2.250 TRP 254.A N TRP 221.A O TRP 254.A H 2.764 1.870 ALA 255.A N ALA 263.A O ALA 255.A H 2.873 1.915 LEU 256.A N SER 25.A O LEU 256.A H 2.746 1.843 GLU 261.A N LYS 259.A O GLU 261.A H 2.970 2.340 GLY 262.A N ASP 229.A OD1 GLY 262.A H 2.755 1.895 ALA 263.A N GLY 228.A O ALA 263.A H 2.912 2.066 SER 264.A N GLU 261.A O SER 264.A H 3.080 2.234 SER 264.A OG LYS 259.A O SER 264.A HG 2.567 1.807 ALA 265.A N ALA 255.A O ALA 265.A H 2.778 1.941 LEU 266.A N ASN 257.A O LEU 266.A H 3.058 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