Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8bqs_AD.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N GLU 262.A OE1 GLY 3.A H 3.217 2.370 LEU 5.A N GLU 261.A OE2 LEU 5.A H 3.141 2.386 ASP 9.A N LYS 6.A O ASP 9.A H 2.984 2.140 ARG 10.A NE ASP 7.A OD1 ARG 10.A HE 3.291 2.436 ARG 10.A NH1 GLU 261.A OE1 ARG 10.A HH12 3.560 2.759 ILE 11.A N GLU 260.A OE2 ILE 11.A H 2.795 2.052 PHE 12.A N GLU 260.A OE1 PHE 12.A H 2.755 1.939 THR 13.A N ILE 11.A O THR 13.A H 2.914 2.216 ASN 14.A ND2 GLY 19.A O ASN 14.A HD22 3.691 2.943 ASN 14.A ND2 ASP 105.A OD1 ASN 14.A HD21 3.400 2.684 ASP 18.A N ASN 14.A OD1 ASP 18.A H 2.805 1.980 GLY 19.A N ASN 14.A OD1 GLY 19.A H 3.383 2.550 PHE 22.A N ASP 20.A OD2 PHE 22.A H 2.959 2.297 VAL 23.A N GLU 146.A OE1 VAL 23.A H 2.843 2.081 GLY 25.A N ASP 20.A OD2 GLY 25.A H 3.184 2.338 ALA 26.A N PHE 22.A O ALA 26.A H 2.900 2.071 LEU 27.A N VAL 23.A O LEU 27.A H 2.896 2.043 LYS 28.A N LYS 24.A O LYS 28.A H 2.922 2.124 ARG 29.A N GLY 25.A O ARG 29.A H 2.888 2.088 ARG 29.A NH1 ASP 20.A O ARG 29.A HH12 3.110 2.435 ARG 29.A NH2 ASP 20.A O ARG 29.A HH22 2.675 1.855 GLY 30.A N LEU 27.A O GLY 30.A H 3.254 2.543 ASP 31.A N ALA 26.A O ASP 31.A H 2.672 1.840 TRP 32.A N GLU 111.A OE1 TRP 32.A H 2.707 1.849 TRP 32.A NE1 HIS 107.A ND1 TRP 32.A HE1 3.250 2.460 ILE 38.A N GLN 34.A O ILE 38.A H 2.929 2.106 LEU 39.A N THR 35.A O LEU 39.A H 2.898 2.060 SER 40.A N LYS 36.A O SER 40.A H 2.885 2.062 ASN 41.A N GLU 37.A O ASN 41.A H 2.925 2.234 ASN 41.A N ILE 38.A O ASN 41.A H 3.262 2.583 GLY 42.A N LEU 39.A O GLY 42.A H 3.248 2.605 GLU 44.A N GLU 44.A OE1 GLU 44.A H 2.633 1.876 ILE 46.A N GLY 42.A O ILE 46.A H 3.208 2.395 ILE 47.A N PRO 43.A O ILE 47.A H 2.921 2.084 ASP 48.A N GLU 44.A O ASP 48.A H 2.910 2.069 GLU 49.A N TRP 45.A O GLU 49.A H 2.861 2.045 ILE 50.A N ILE 46.A O ILE 50.A H 2.937 2.103 LYS 51.A N ILE 47.A O LYS 51.A H 2.927 2.096 LYS 52.A N ASP 48.A O LYS 52.A H 2.878 2.044 SER 53.A N GLU 49.A O SER 53.A H 2.894 2.052 GLY 54.A N ILE 50.A O GLY 54.A H 2.916 2.193 GLY 54.A N LYS 51.A O GLY 54.A H 3.185 2.577 ARG 56.A NE GLY 62.A O ARG 56.A HE 2.824 1.990 ARG 56.A NH2 GLY 62.A O ARG 56.A HH21 3.168 2.460 GLY 57.A N PHE 63.A O GLY 57.A H 2.654 1.816 ARG 58.A NH2 THR 244.A O ARG 58.A HH21 3.514 2.779 SER 65.A N LEU 55.A O SER 65.A H 3.032 2.255 LYS 68.A N LEU 64.A O LYS 68.A H 2.915 2.081 LYS 68.A NZ GLU 180.A OE2 LYS 68.A HZ1 3.407 2.800 TYR 69.A N SER 65.A O TYR 69.A H 2.897 2.063 SER 70.A N GLY 66.A O SER 70.A H 2.900 2.084 PHE 71.A N LEU 67.A O PHE 71.A H 2.936 2.238 MET 72.A N TYR 69.A O MET 72.A H 3.156 2.303 ASN 76.A ND2 ARG 80.A O ASN 76.A HD21 2.481 1.624 GLY 79.A N ASN 76.A O GLY 79.A H 2.953 2.112 TYR 83.A N PRO 210.A O TYR 83.A H 2.911 2.112 LEU 84.A N ALA 124.A O LEU 84.A H 2.956 2.136 VAL 85.A N THR 212.A O VAL 85.A H 2.877 2.103 ILE 86.A N TYR 126.A O ILE 86.A H 2.886 2.061 ASN 87.A N THR 214.A O ASN 87.A H 2.918 2.095 SER 88.A N ILE 86.A O SER 88.A H 2.927 2.267 THR 95.A N GLU 92.A O THR 95.A H 3.358 2.548 LYS 97.A NZ ASP 98.A OD1 LYS 97.A HZ2 2.868 2.031 LYS 97.A NZ GLU 217.A OE1 LYS 97.A HZ3 2.880 2.140 ASP 98.A N GLU 90.A OE2 ASP 98.A H 2.902 2.112 ARG 99.A N GLU 90.A OE1 ARG 99.A H 3.330 2.607 GLU 100.A N LYS 97.A O GLU 100.A H 3.136 2.371 ARG 103.A NE GLU 100.A OE1 ARG 103.A HE 3.195 2.460 ARG 103.A NH2 GLU 100.A OE1 ARG 103.A HH21 2.877 2.067 ASN 104.A N ILE 101.A O ASN 104.A H 3.316 2.571 ASP 105.A N ILE 101.A O ASP 105.A H 2.893 2.127 HIS 107.A NE2 GLU 146.A OE1 HIS 107.A HE2 2.943 2.172 LYS 108.A N ASP 105.A O LYS 108.A H 3.163 2.553 VAL 110.A N PRO 106.A O VAL 110.A H 2.911 2.108 GLU 111.A N HIS 107.A O GLU 111.A H 2.877 2.040 GLY 112.A N LYS 108.A O GLY 112.A H 2.914 2.074 ALA 113.A N LEU 109.A O ALA 113.A H 2.880 2.051 LEU 114.A N VAL 110.A O LEU 114.A H 2.901 2.077 VAL 115.A N GLU 111.A O VAL 115.A H 2.918 2.093 VAL 116.A N GLY 112.A O VAL 116.A H 2.899 2.053 GLY 117.A N ALA 113.A O GLY 117.A H 2.855 2.028 PHE 118.A N LEU 114.A O PHE 118.A H 2.922 2.079 SER 119.A N VAL 115.A O SER 119.A H 2.921 2.086 MET 120.A N VAL 116.A O MET 120.A H 2.871 2.093 ARG 121.A N PHE 118.A O ARG 121.A H 3.221 2.410 ARG 121.A NH1 LYS 74.A O ARG 121.A HH11 2.701 1.942 ALA 122.A N GLY 117.A O ALA 122.A H 2.880 2.045 ARG 123.A NH1 ARG 123.A O ARG 123.A HH11 3.558 2.755 ALA 125.A N ASP 165.A O ALA 125.A H 2.900 2.072 TYR 126.A N LEU 84.A O TYR 126.A H 2.887 2.223 ILE 127.A N TYR 167.A O ILE 127.A H 2.897 2.059 TYR 128.A N ILE 86.A O TYR 128.A H 2.903 2.132 ILE 129.A N HIS 169.A O ILE 129.A H 2.914 2.087 ARG 130.A NE GLU 132.A OE1 ARG 130.A HE 3.311 2.475 ARG 130.A NH1 GLU 90.A O ARG 130.A HH11 2.364 1.686 GLU 132.A N GLU 132.A OE1 GLU 132.A H 2.320 1.665 PHE 133.A N ARG 130.A O PHE 133.A H 3.167 2.403 TRP 134.A N GLU 132.A O TRP 134.A H 2.890 2.196 GLU 136.A N GLU 136.A OE1 GLU 136.A H 2.581 1.777 ALA 137.A N PHE 133.A O ALA 137.A H 2.889 2.074 ASN 138.A N TRP 134.A O ASN 138.A H 2.933 2.109 ILE 139.A N VAL 135.A O ILE 139.A H 2.908 2.088 LEU 140.A N GLU 136.A O LEU 140.A H 2.891 2.063 GLN 141.A N ALA 137.A O GLN 141.A H 2.878 2.060 GLN 142.A N ASN 138.A O GLN 142.A H 2.918 2.092 ALA 143.A N ILE 139.A O ALA 143.A H 2.912 2.096 ILE 144.A N LEU 140.A O ILE 144.A H 2.871 2.059 ASP 145.A N GLN 141.A O ASP 145.A H 2.896 2.073 GLU 146.A N GLN 142.A O GLU 146.A H 2.908 2.082 ALA 147.A N ALA 143.A O ALA 147.A H 2.889 2.074 TYR 148.A N ILE 144.A O TYR 148.A H 2.894 2.058 TYR 148.A OH VAL 166.A O TYR 148.A HH 3.123 2.288 ALA 149.A N ASP 145.A O ALA 149.A H 2.905 2.080 LYS 150.A N GLU 146.A O LYS 150.A H 2.896 2.082 GLY 151.A N TYR 148.A O GLY 151.A H 3.156 2.413 PHE 152.A N ALA 147.A O PHE 152.A H 2.980 2.308 GLY 154.A N PHE 164.A O GLY 154.A H 2.581 1.842 ALA 157.A N TYR 162.A O ALA 157.A H 3.380 2.555 CYS 158.A N GLY 151.A O CYS 158.A H 3.298 2.470 GLY 159.A N ASN 156.A O GLY 159.A H 2.859 2.032 SER 160.A N ALA 157.A O SER 160.A H 2.994 2.140 TYR 162.A OH ALA 122.A O TYR 162.A HH 2.467 1.844 PHE 164.A N GLY 154.A O PHE 164.A H 3.200 2.449 ASP 165.A N ARG 123.A O ASP 165.A H 2.932 2.103 VAL 166.A N TYR 148.A OH VAL 166.A H 2.853 2.138 TYR 167.A N ALA 125.A O TYR 167.A H 2.894 2.065 HIS 169.A N ILE 127.A O HIS 169.A H 2.889 2.038 GLY 171.A N ILE 129.A O GLY 171.A H 2.894 2.237 TYR 175.A N GLU 348.A OE1 TYR 175.A H 2.809 1.964 CYS 177.A N ALA 174.A O CYS 177.A H 3.093 2.299 CYS 177.A SG TYR 128.A OH CYS 177.A HG 3.469 2.486 GLY 178.A N TYR 175.A O GLY 178.A H 3.231 2.396 GLU 179.A N ILE 176.A O GLU 179.A H 2.997 2.164 LEU 183.A N GLU 179.A O LEU 183.A H 2.468 1.639 ILE 184.A N GLU 180.A O ILE 184.A H 2.904 2.093 GLU 185.A N THR 181.A O GLU 185.A H 2.916 2.086 SER 186.A N GLY 182.A O SER 186.A H 2.890 2.054 ILE 187.A N LEU 183.A O ILE 187.A H 2.929 2.101 GLU 188.A N ILE 184.A O GLU 188.A H 2.887 2.065 GLY 189.A N GLU 185.A O GLY 189.A H 2.915 2.220 GLY 189.A N SER 186.A O GLY 189.A H 3.133 2.504 LYS 190.A N GLU 185.A O LYS 190.A H 3.069 2.473 GLN 193.A N ALA 191.A O GLN 193.A H 2.613 1.875 LYS 197.A NZ GLU 179.A OE2 LYS 197.A HZ1 2.460 1.773 ASN 203.A N PHE 200.A O ASN 203.A H 2.578 1.731 GLY 205.A N CYS 209.A O GLY 205.A H 2.771 1.972 TYR 207.A N GLU 188.A OE2 TYR 207.A H 3.197 2.428 GLY 208.A N GLY 205.A O GLY 208.A H 3.134 2.352 CYS 209.A N LEU 206.A O CYS 209.A H 2.684 1.830 THR 212.A N TYR 83.A O THR 212.A H 2.937 2.150 THR 214.A N VAL 85.A O THR 214.A H 2.890 2.118 GLU 217.A N ASN 215.A OD1 GLU 217.A H 2.729 1.949 VAL 219.A N ASN 215.A O VAL 219.A H 2.944 2.099 ALA 220.A N VAL 216.A O ALA 220.A H 2.876 2.039 VAL 221.A N GLU 217.A O VAL 221.A H 2.935 2.127 CYS 222.A N THR 218.A O CYS 222.A H 2.947 2.259 ILE 225.A N VAL 221.A O ILE 225.A H 3.089 2.243 MET 226.A N CYS 222.A O MET 226.A H 2.919 2.103 ARG 227.A N PRO 223.A O ARG 227.A H 2.919 2.142 ARG 227.A NE PRO 223.A O ARG 227.A HE 3.424 2.607 ARG 228.A N THR 224.A O ARG 228.A H 2.909 2.121 ARG 228.A NH1 GLN 8.A O ARG 228.A HH12 3.545 2.777 ALA 234.A N ALA 230.A O ALA 234.A H 2.908 2.076 SER 235.A N SER 231.A O SER 235.A H 2.902 2.250 SER 235.A N TRP 232.A O SER 235.A H 3.326 2.584 PHE 236.A N PHE 233.A O PHE 236.A H 3.239 2.386 ASN 240.A ND2 ASP 311.A OD2 ASN 240.A HD21 2.419 1.754 ASN 241.A N ARG 238.A O ASN 241.A H 2.963 2.190 LYS 245.A N GLU 261.A O LYS 245.A H 2.897 2.085 LEU 246.A N GLU 217.A OE2 LEU 246.A H 3.209 2.425 TYR 247.A N VAL 259.A O TYR 247.A H 2.905 2.305 CYS 248.A N ALA 323.A O CYS 248.A H 2.934 2.216 ILE 249.A N CYS 257.A O ILE 249.A H 2.925 2.075 SER 250.A N VAL 325.A O SER 250.A H 2.914 2.128 SER 250.A OG GLY 94.A O SER 250.A HG 3.419 2.845 HIS 252.A N VAL 327.A O HIS 252.A H 2.594 1.779 ASN 254.A N GLY 277.A O ASN 254.A H 2.990 2.143 ASN 254.A ND2 GLY 276.A O ASN 254.A HD21 3.237 2.422 ASN 254.A ND2 VAL 278.A O ASN 254.A HD22 2.898 2.414 ASN 255.A N CYS 275.A O ASN 255.A H 2.843 2.229 ASN 255.A ND2 ASN 255.A O ASN 255.A HD21 2.566 2.058 ASN 255.A ND2 HIS 274.A O ASN 255.A HD21 3.571 3.088 VAL 259.A N TYR 247.A O VAL 259.A H 2.895 2.118 GLU 261.A N LYS 245.A O GLU 261.A H 2.914 2.076 SER 264.A N MET 308.A O SER 264.A H 3.219 2.442 LEU 267.A N VAL 306.A O LEU 267.A H 3.140 2.290 LEU 270.A N PRO 266.A O LEU 270.A H 2.899 2.063 LEU 271.A N LEU 267.A O LEU 271.A H 2.919 2.095 GLU 272.A N ARG 268.A O GLU 272.A H 2.899 2.089 LYS 273.A N GLU 269.A O LYS 273.A H 2.901 2.088 HIS 274.A N LEU 270.A O HIS 274.A H 3.364 2.582 GLY 277.A N LEU 271.A O GLY 277.A H 2.553 1.854 TRP 282.A NE1 ASP 304.A OD1 TRP 282.A HE1 2.385 1.674 ASN 284.A N GLY 281.A O ASN 284.A H 2.757 2.158 LEU 285.A N TRP 282.A O LEU 285.A H 3.208 2.482 LEU 286.A N MET 328.A O LEU 286.A H 3.231 2.487 ALA 287.A N MET 328.A O ALA 287.A H 2.905 2.125 VAL 288.A N MET 298.A O VAL 288.A H 2.892 2.046 ILE 289.A N ILE 326.A O ILE 289.A H 2.936 2.093 GLY 292.A N ALA 324.A O GLY 292.A H 2.587 1.745 MET 298.A N VAL 288.A O MET 298.A H 2.673 1.958 VAL 302.A N PRO 299.A O VAL 302.A H 3.067 2.391 CYS 303.A N PRO 299.A O CYS 303.A H 2.916 2.112 MET 308.A N ILE 265.A O MET 308.A H 3.121 2.274 ASP 309.A N LEU 307.A O ASP 309.A H 2.697 2.020 LEU 313.A N ASP 309.A O LEU 313.A H 2.894 2.041 LYS 314.A N PHE 310.A O LYS 314.A H 2.894 2.060 ALA 315.A N ASP 311.A O ALA 315.A H 2.906 2.071 VAL 316.A N ALA 312.A O VAL 316.A H 2.911 2.097 GLY 317.A N LEU 313.A O GLY 317.A H 2.887 2.145 SER 318.A N LEU 313.A O SER 318.A H 2.902 2.135 THR 322.A OG1 THR 95.A OG1 THR 322.A HG1 3.208 2.525 ALA 323.A N LEU 320.A O ALA 323.A H 3.092 2.233 VAL 325.A N CYS 248.A O VAL 325.A H 2.894 2.049 MET 328.A N ALA 287.A O MET 328.A H 2.884 2.132 THR 332.A N ASP 329.A O THR 332.A H 3.263 2.578 ILE 335.A N ASP 333.A OD1 ILE 335.A H 3.156 2.402 ALA 337.A N ASP 333.A O ALA 337.A H 2.928 2.104 ILE 338.A N PRO 334.A O ILE 338.A H 2.918 2.068 LEU 339.A N ILE 335.A O LEU 339.A H 2.868 2.069 ARG 340.A N ASP 336.A O ARG 340.A H 2.925 2.105 LEU 341.A N ALA 337.A O LEU 341.A H 2.941 2.124 SER 342.A N ILE 338.A O SER 342.A H 2.859 2.034 LYS 343.A N LEU 339.A O LYS 343.A H 2.906 2.086 LYS 343.A NZ GLU 368.A OE1 LYS 343.A HZ1 2.992 2.324 PHE 344.A N ARG 340.A O PHE 344.A H 2.899 2.081 TYR 345.A N LEU 341.A O TYR 345.A H 2.923 2.112 LYS 346.A N SER 342.A O LYS 346.A H 2.866 2.035 HIS 347.A N LYS 343.A O HIS 347.A H 2.915 2.087 GLU 348.A N PHE 344.A O GLU 348.A H 2.900 2.116 SER 349.A OG TYR 345.A O SER 349.A HG 2.477 1.758 SER 349.A OG LYS 346.A O SER 349.A HG 3.569 2.966 CYS 356.A SG SER 349.A OG no hydrogen 3.695 N/A ARG 357.A N CYS 353.A O ARG 357.A H 2.972 2.114 GLU 358.A N THR 354.A O GLU 358.A H 2.921 2.167 GLY 359.A N PRO 355.A O GLY 359.A H 2.877 2.034 THR 360.A N CYS 356.A O THR 360.A H 2.946 2.090 TRP 362.A N GLU 358.A O TRP 362.A H 2.959 2.122 ILE 363.A N GLY 359.A O ILE 363.A H 2.837 1.997 VAL 364.A N THR 360.A O VAL 364.A H 2.928 2.115 ASP 365.A N GLY 361.A O ASP 365.A H 2.945 2.106 VAL 366.A N TRP 362.A O VAL 366.A H 2.918 2.090 MET 367.A N ILE 363.A O MET 367.A H 2.862 2.016 GLU 368.A N VAL 364.A O GLU 368.A H 2.917 2.096 ARG 369.A N ASP 365.A O ARG 369.A H 2.951 2.120 ARG 369.A NH1 ASN 374.A O ARG 369.A HH11 3.249 2.593 ARG 369.A NH1 GLU 379.A OE1 ARG 369.A HH12 2.584 1.854 ARG 369.A NH1 GLU 379.A OE2 ARG 369.A HH12 3.274 2.537 ARG 369.A NH2 GLU 379.A OE1 ARG 369.A HH22 2.712 2.031 LEU 370.A N VAL 366.A O LEU 370.A H 2.885 2.062 LEU 371.A N MET 367.A O LEU 371.A H 2.876 2.045 VAL 372.A N GLU 368.A O VAL 372.A H 2.939 2.105 GLY 373.A N ARG 369.A O GLY 373.A H 2.893 2.168 ALA 375.A N GLY 373.A O ALA 375.A H 2.924 2.252 GLU 379.A N ASP 376.A O GLU 379.A H 3.102 2.356 ILE 380.A N TYR 377.A O ILE 380.A H 3.079 2.291 MET 382.A N ALA 378.A O MET 382.A H 2.906 2.102 LEU 383.A N GLU 379.A O LEU 383.A H 2.859 2.043 GLN 384.A N ILE 380.A O GLN 384.A H 2.955 2.130 GLN 384.A NE2 GLN 388.A OE1 GLN 384.A HE21 3.121 2.368 GLN 385.A N ASP 381.A O GLN 385.A H 2.885 2.055 VAL 386.A N MET 382.A O VAL 386.A H 2.870 2.059 THR 387.A N LEU 383.A O THR 387.A H 2.913 2.080 GLN 388.A N GLN 384.A O GLN 388.A H 2.939 2.120 GLN 389.A N GLN 385.A O GLN 389.A H 2.870 2.088 ILE 390.A N VAL 386.A O ILE 390.A H 2.893 2.082 GLU 391.A N THR 387.A O GLU 391.A H 2.944 2.107 MET 392.A N ASP 400.A OD1 MET 392.A H 3.319 2.459 HIS 393.A N ILE 390.A O HIS 393.A H 3.219 2.386 HIS 393.A ND1 GLU 391.A O no hydrogen 2.991 N/A ALA 401.A N ALA 397.A O ALA 401.A H 2.929 2.114 ALA 402.A N LEU 398.A O ALA 402.A H 2.889 2.080 ALA 403.A N GLY 399.A O ALA 403.A H 2.895 2.151 TRP 404.A N ASP 400.A O TRP 404.A H 2.926 2.144 GLN 407.A N ALA 403.A O GLN 407.A H 3.065 2.231 GLN 407.A NE2 GLU 391.A OE1 GLN 407.A HE22 3.189 2.422 GLY 408.A N TRP 404.A O GLY 408.A H 2.916 2.082 LEU 409.A N PRO 405.A O LEU 409.A H 2.916 2.078 ILE 410.A N VAL 406.A O ILE 410.A H 2.893 2.063 LYS 411.A N GLN 407.A O LYS 411.A H 2.928 2.102 ASN 412.A N GLY 408.A O ASN 412.A H 2.917 2.199 PHE 413.A N LEU 409.A O PHE 413.A H 2.885 2.035 ARG 414.A NH2 ASP 381.A OD1 ARG 414.A HH22 2.858 2.188 ILE 417.A N PHE 413.A O ILE 417.A H 3.383 2.559 GLU 418.A N ARG 414.A O GLU 418.A H 2.943 2.107 ASP 419.A N GLU 415.A O ASP 419.A H 2.888 2.059 ARG 420.A N GLU 416.A O ARG 420.A H 2.951 2.112 ILE 421.A N ILE 417.A O ILE 421.A H 2.937 2.095 ASP 422.A N GLU 418.A O ASP 422.A H 2.876 2.065 SER 423.A N ASP 419.A O SER 423.A H 2.899 2.084 TYR 424.A N ARG 420.A O TYR 424.A H 2.954 2.122 HIS 425.A N ILE 421.A O HIS 425.A H 2.917 2.083 ALA 426.A N ASP 422.A O ALA 426.A H 2.841 2.042 LYS 427.A N SER 423.A O LYS 427.A H 2.944 2.128 HIS 428.A N HIS 425.A O HIS 428.A H 3.300 2.595 HIS 428.A ND1 TYR 424.A O no hydrogen 2.992 N/A GLN 430.A NE2 LYS 432.A O GLN 430.A HE21 2.562 1.752