Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8bup_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 3.A OG THR 1.A OG1 SER 3.A HG 3.184 2.402 GLY 6.A N ILE 78.A O GLY 6.A H 2.899 2.089 ARG 8.A NH1 ASP 32.A OD2 ARG 8.A HH12 3.398 2.646 ARG 8.A NH1 GLU 77.A OE2 ARG 8.A HH11 2.619 1.970 ARG 8.A NH2 ASP 32.A OD2 ARG 8.A HH22 3.335 2.566 ARG 8.A NH2 ASP 34.A OD2 ARG 8.A HH21 3.258 2.605 VAL 10.A N THR 80.A O VAL 10.A H 2.902 2.095 LYS 12.A N CYS 9.A O LYS 12.A H 3.224 2.367 PHE 13.A N VAL 10.A O PHE 13.A H 3.069 2.220 ASP 14.A N LYS 31.A O ASP 14.A H 2.816 2.012 ILE 16.A N LYS 29.A O ILE 16.A H 2.656 1.798 GLY 17.A N LYS 29.A O GLY 17.A H 3.352 2.588 GLY 20.A N VAL 27.A O GLY 20.A H 3.054 2.200 TYR 24.A OH GLU 60.A OE1 TYR 24.A HH 2.626 1.836 VAL 27.A N GLY 20.A O VAL 27.A H 2.756 1.909 TYR 28.A N LEU 41.A O TYR 28.A H 2.841 2.004 LYS 29.A N GLY 17.A O LYS 29.A H 2.690 1.886 ALA 30.A N VAL 39.A O ALA 30.A H 2.909 2.110 LYS 31.A N ASP 14.A O LYS 31.A H 2.898 2.076 ASP 32.A N GLU 37.A O ASP 32.A H 2.717 1.865 LYS 33.A N LYS 12.A O LYS 33.A H 2.805 1.947 LYS 33.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 33.A HZ3 3.065 2.279 ASP 34.A N ASP 32.A OD1 ASP 34.A H 2.697 2.026 THR 35.A N ASP 32.A OD1 THR 35.A H 2.834 2.028 GLY 36.A N ASP 32.A O GLY 36.A H 2.822 2.079 GLU 37.A N THR 35.A OG1 GLU 37.A H 3.160 2.393 VAL 39.A N ALA 30.A O VAL 39.A H 2.583 1.737 ALA 40.A N PHE 99.A O ALA 40.A H 2.743 1.918 LEU 41.A N TYR 28.A O LEU 41.A H 2.822 2.044 LYS 42.A N LEU 97.A O LYS 42.A H 2.987 2.144 LYS 42.A NZ GLU 60.A OE2 LYS 42.A HZ3 3.546 2.721 LYS 43.A N GLN 26.A O LYS 43.A H 3.027 2.183 VAL 44.A N PHE 95.A O VAL 44.A H 2.778 1.923 GLU 49.A N ASN 48.A OD1 GLU 49.A H 2.555 1.906 ILE 58.A N PRO 54.A O ILE 58.A H 3.110 2.361 ARG 59.A N ILE 55.A O ARG 59.A H 2.761 1.953 GLU 60.A N THR 56.A O GLU 60.A H 3.298 2.508 ILE 61.A N ALA 57.A O ILE 61.A H 2.937 2.179 LYS 62.A N ILE 58.A O LYS 62.A H 2.930 2.083 ILE 63.A N ARG 59.A O ILE 63.A H 2.998 2.177 LEU 64.A N GLU 60.A O LEU 64.A H 3.121 2.306 GLN 66.A N ILE 63.A O GLN 66.A H 2.945 2.234 LEU 67.A N ILE 63.A O LEU 67.A H 3.073 2.378 ARG 70.A NH1 GLU 131.A OE1 ARG 70.A HH12 2.556 1.721 ARG 70.A NH2 GLU 131.A OE1 ARG 70.A HH22 3.385 2.807 SER 71.A N HIS 69.A ND1 SER 71.A H 3.299 2.444 SER 71.A OG GLN 128.A O SER 71.A HG 3.130 2.391 VAL 72.A N HIS 69.A O VAL 72.A H 3.208 2.354 VAL 73.A N LEU 161.A O VAL 73.A H 2.914 2.118 ASN 74.A N GLU 100.A OE2 ASN 74.A H 2.875 2.095 LYS 76.A N VAL 98.A O LYS 76.A H 2.619 1.829 LYS 76.A NZ GLU 37.A OE1 LYS 76.A HZ3 2.863 2.180 VAL 79.A N TYR 96.A O VAL 79.A H 2.980 2.176 THR 80.A N ARG 8.A O THR 80.A H 2.973 2.175 ASP 81.A N ALA 94.A O ASP 81.A H 3.241 2.415 LYS 90.A N ASP 87.A O LYS 90.A H 3.170 2.586 LYS 92.A NZ LYS 89.A O LYS 92.A HZ3 3.211 2.439 GLY 93.A N ASP 91.A OD1 GLY 93.A H 3.056 2.208 ALA 94.A N ASP 81.A OD2 ALA 94.A H 3.042 2.233 PHE 95.A N VAL 44.A O PHE 95.A H 3.287 2.603 TYR 96.A N VAL 79.A O TYR 96.A H 2.715 1.905 TYR 96.A OH ASP 81.A OD1 TYR 96.A HH 2.621 1.865 LEU 97.A N LYS 42.A O LEU 97.A H 2.841 2.012 VAL 98.A N GLU 77.A O VAL 98.A H 2.796 1.955 PHE 99.A N ALA 40.A O PHE 99.A H 2.835 1.989 GLU 100.A N ASN 74.A O GLU 100.A H 3.357 2.585 ASP 103.A N ASN 154.A OD1 ASP 103.A H 3.025 2.240 HIS 104.A N LEU 153.A O HIS 104.A H 3.019 2.174 LEU 106.A N ILE 151.A O LEU 106.A H 2.822 1.988 MET 107.A N CYS 148.A O MET 107.A H 3.299 2.565 GLY 108.A N ASP 105.A OD2 GLY 108.A H 3.046 2.290 LEU 109.A N ASP 105.A O LEU 109.A H 2.963 2.124 LEU 110.A N LEU 106.A O LEU 110.A H 2.855 2.067 GLU 111.A N MET 107.A O GLU 111.A H 2.563 1.713 SER 112.A N GLY 108.A O SER 112.A H 3.004 2.148 SER 112.A OG GLY 108.A O SER 112.A HG 2.706 1.899 SER 112.A OG LEU 109.A O SER 112.A HG 3.451 3.044 GLY 113.A N LEU 110.A O GLY 113.A H 2.921 2.174 LEU 114.A N LEU 109.A O LEU 114.A H 3.326 2.538 SER 118.A N HIS 121.A ND1 SER 118.A H 3.369 2.520 SER 118.A OG HIS 121.A ND1 SER 118.A HG 3.259 2.543 ILE 122.A N SER 118.A O ILE 122.A H 3.125 2.303 LYS 123.A N GLU 119.A O LYS 123.A H 3.043 2.257 SER 124.A N ASP 120.A O SER 124.A H 3.011 2.180 PHE 125.A N HIS 121.A O PHE 125.A H 2.895 2.064 MET 126.A N ILE 122.A O MET 126.A H 2.927 2.068 LYS 127.A N LYS 123.A O LYS 127.A H 2.874 2.024 LYS 127.A NZ LEU 305.A O LYS 127.A HZ3 3.527 2.676 GLN 128.A N SER 124.A O GLN 128.A H 3.361 2.520 GLN 128.A NE2 SER 124.A O GLN 128.A HE21 3.617 2.991 GLN 128.A NE2 GLY 157.A O GLN 128.A HE22 2.941 2.227 LEU 129.A N PHE 125.A O LEU 129.A H 3.069 2.216 MET 130.A N MET 126.A O MET 130.A H 2.850 1.990 GLU 131.A N LYS 127.A O GLU 131.A H 2.976 2.147 GLY 132.A N GLN 128.A O GLY 132.A H 2.933 2.121 LEU 133.A N LEU 129.A O LEU 133.A H 2.833 2.018 GLU 134.A N MET 130.A O GLU 134.A H 2.806 1.988 TYR 135.A N GLU 131.A O TYR 135.A H 3.094 2.305 CYS 136.A N GLY 132.A O CYS 136.A H 2.960 2.128 CYS 136.A SG GLY 132.A O CYS 136.A HG 3.365 2.430 HIS 137.A N LEU 133.A O HIS 137.A H 2.663 1.814 HIS 137.A NE2 ASP 203.A OD2 HIS 137.A HE2 2.679 1.831 LYS 138.A N GLU 134.A O LYS 138.A H 2.734 1.895 LYS 139.A N TYR 135.A O LYS 139.A H 3.148 2.388 ASN 140.A N HIS 137.A O ASN 140.A H 2.854 2.037 PHE 141.A N CYS 136.A O PHE 141.A H 3.068 2.217 LEU 142.A N ARG 168.A O LEU 142.A H 2.945 2.090 HIS 143.A NE2 ASP 163.A O HIS 143.A HE2 2.842 2.067 ARG 144.A NE LEU 166.A O ARG 144.A HE 2.933 2.278 ARG 144.A NH1 TYR 198.A OH ARG 144.A HH11 2.444 1.697 ASN 150.A N LYS 147.A O ASN 150.A H 3.222 2.467 ASN 150.A ND2 ASP 145.A O ASN 150.A HD22 3.188 2.436 ILE 151.A N CYS 148.A O ILE 151.A H 3.313 2.499 LEU 152.A N LYS 160.A O LEU 152.A H 3.058 2.231 LEU 153.A N HIS 104.A O LEU 153.A H 2.725 1.882 ASN 154.A N GLN 158.A O ASN 154.A H 2.981 2.164 ASN 155.A N ASP 103.A OD2 ASN 155.A H 2.917 2.083 GLY 157.A N ASN 154.A O GLY 157.A H 2.910 2.065 GLN 158.A N SER 156.A OG GLN 158.A H 3.384 2.535 GLN 158.A NE2 ARG 70.A O GLN 158.A HE21 3.254 2.594 ILE 159.A N GLN 128.A OE1 ILE 159.A H 2.727 1.879 LYS 160.A N LEU 152.A O LYS 160.A H 2.927 2.086 LYS 160.A NZ GLU 100.A OE1 LYS 160.A HZ2 3.268 2.474 LYS 160.A NZ GLU 100.A OE2 LYS 160.A HZ2 2.956 2.171 LEU 161.A N SER 71.A O LEU 161.A H 2.807 1.980 ALA 162.A N ASN 150.A O ALA 162.A H 3.129 2.473 ARG 168.A NH1 PRO 177.A O ARG 168.A HH12 3.443 2.747 TYR 170.A N ASN 140.A O TYR 170.A H 3.065 2.295 TYR 186.A N THR 183.A O TYR 186.A H 2.758 2.078 TYR 186.A OH GLU 213.A OE1 TYR 186.A HH 2.920 2.141 TYR 186.A OH GLU 213.A OE2 TYR 186.A HH 3.267 2.671 ARG 187.A N LEU 184.A O ARG 187.A H 3.390 2.562 ARG 187.A NE ILE 182.A O ARG 187.A HE 2.995 2.208 ARG 187.A NH1 GLU 226.A OE2 ARG 187.A HH12 3.256 2.453 ARG 187.A NH2 ILE 182.A O ARG 187.A HH21 3.136 2.419 LEU 192.A N PRO 188.A O LEU 192.A H 3.291 2.506 LEU 193.A N PRO 189.A O LEU 193.A H 2.929 2.150 GLY 194.A N LEU 191.A O GLY 194.A H 3.059 2.286 GLU 195.A N GLU 190.A O GLU 195.A H 3.030 2.175 ARG 197.A N GLU 195.A OE1 ARG 197.A H 3.018 2.259 ARG 197.A NE GLU 195.A OE1 ARG 197.A HE 3.142 2.287 ARG 197.A NH2 GLU 195.A OE2 ARG 197.A HH21 3.222 2.526 THR 199.A OG1 GLU 190.A OE1 THR 199.A HG1 3.441 2.747 ILE 202.A N THR 199.A O ILE 202.A H 3.247 2.389 ASP 203.A N PRO 200.A O ASP 203.A H 3.407 2.609 TRP 205.A N ALA 201.A O TRP 205.A H 3.245 2.431 SER 206.A OG TYR 186.A O SER 206.A HG 2.964 2.177 CYS 207.A N ASP 203.A O CYS 207.A H 2.963 2.130 CYS 207.A SG ASP 203.A O CYS 207.A HG 3.437 2.495 GLY 208.A N VAL 204.A O GLY 208.A H 2.852 2.121 GLY 208.A N TRP 205.A O GLY 208.A H 3.086 2.485 CYS 209.A N TRP 205.A O CYS 209.A H 2.849 2.005 CYS 209.A SG TRP 205.A O CYS 209.A HG 3.248 2.284 ILE 210.A N SER 206.A O ILE 210.A H 2.926 2.143 LEU 211.A N CYS 207.A O LEU 211.A H 2.951 2.201 GLY 212.A N GLY 208.A O GLY 212.A H 2.935 2.116 GLU 213.A N CYS 209.A O GLU 213.A H 2.956 2.171 LEU 214.A N ILE 210.A O LEU 214.A H 2.778 2.003 PHE 215.A N GLY 212.A O PHE 215.A H 3.151 2.382 THR 216.A N GLU 213.A O THR 216.A H 3.235 2.503 LYS 217.A N GLU 213.A O LYS 217.A H 2.716 1.995 LYS 218.A N THR 216.A OG1 LYS 218.A H 3.178 2.341 GLN 229.A N LEU 225.A O GLN 229.A H 2.963 2.179 GLN 229.A NE2 PHE 221.A O GLN 229.A HE22 3.197 2.367 LEU 230.A N GLU 226.A O LEU 230.A H 3.138 2.314 GLU 231.A N LEU 227.A O GLU 231.A H 3.015 2.211 LEU 232.A N ALA 228.A O LEU 232.A H 3.164 2.354 ILE 233.A N GLN 229.A O ILE 233.A H 2.998 2.145 SER 234.A N LEU 230.A O SER 234.A H 2.891 2.119 SER 234.A OG LEU 230.A O SER 234.A HG 2.801 2.026 ARG 235.A N GLU 231.A O ARG 235.A H 2.871 2.082 LEU 236.A N ILE 233.A O LEU 236.A H 3.253 2.574 CYS 237.A N ILE 233.A O CYS 237.A H 2.635 1.779 GLY 238.A N SER 234.A O GLY 238.A H 2.886 2.154 SER 239.A OG LYS 261.A O SER 239.A HG 2.676 1.889 VAL 244.A N CYS 241.A O VAL 244.A H 3.073 2.275 TRP 245.A N CYS 241.A O TRP 245.A H 3.046 2.328 VAL 248.A N TRP 245.A O VAL 248.A H 2.942 2.094 ARG 250.A N ASP 247.A O ARG 250.A H 3.005 2.293 LEU 251.A N VAL 248.A O LEU 251.A H 3.148 2.325 TYR 253.A N LEU 193.A O TYR 253.A H 3.161 2.328 MET 257.A N TYR 253.A O MET 257.A H 2.751 1.927 LYS 258.A NZ PRO 259.A O LYS 258.A HZ2 3.222 2.374 LYS 260.A N GLU 231.A OE1 LYS 260.A H 2.810 1.973 TYR 263.A N SER 239.A OG TYR 263.A H 2.898 2.121 TYR 263.A OH GLU 231.A OE2 TYR 263.A HH 2.535 1.811 ARG 264.A NH1 GLU 269.A OE1 ARG 264.A HH12 3.514 2.757 ARG 264.A NH1 GLU 269.A OE2 ARG 264.A HH12 3.130 2.301 ARG 264.A NH2 GLU 269.A OE1 ARG 264.A HH22 3.509 2.755 ARG 265.A NE ASP 283.A OD1 ARG 265.A HE 2.845 2.198 ARG 265.A NH1 CYS 237.A O ARG 265.A HH11 3.184 2.461 ARG 265.A NH1 LEU 286.A O ARG 265.A HH12 3.569 2.834 ARG 265.A NH2 ASP 283.A OD1 ARG 265.A HH21 2.473 1.715 ARG 265.A NH2 LEU 286.A O ARG 265.A HH22 3.263 2.442 ARG 266.A N LEU 236.A O ARG 266.A H 2.846 2.042 ARG 266.A NE GLU 269.A OE1 ARG 266.A HE 3.259 2.512 ARG 268.A NE ASP 283.A OD2 ARG 268.A HE 3.407 2.708 GLU 270.A N ARG 266.A O GLU 270.A H 3.011 2.192 PHE 271.A N LEU 267.A O PHE 271.A H 3.078 2.303 SER 272.A N GLU 269.A O SER 272.A H 3.156 2.376 ILE 274.A N PHE 271.A O ILE 274.A H 3.023 2.193 LEU 279.A N PRO 275.A O LEU 279.A H 2.658 1.837 ASP 280.A N SER 276.A O ASP 280.A H 2.869 2.012 LEU 281.A N ALA 277.A O LEU 281.A H 3.389 2.589 LEU 282.A N ALA 278.A O LEU 282.A H 2.793 1.967 ASP 283.A N LEU 279.A O ASP 283.A H 2.773 1.921 HIS 284.A N ASP 280.A O HIS 284.A H 3.070 2.258 MET 285.A N LEU 281.A O MET 285.A H 2.885 2.044 LEU 286.A N LEU 282.A O LEU 286.A H 2.903 2.109 THR 287.A N HIS 284.A O THR 287.A H 3.354 2.564 THR 287.A OG1 ASP 283.A O THR 287.A HG1 3.240 2.605 THR 287.A OG1 HIS 284.A O THR 287.A HG1 2.939 2.310 SER 291.A N ASP 289.A OD1 SER 291.A H 3.446 2.596 LYS 292.A N ASP 289.A O LYS 292.A H 3.116 2.444 LYS 292.A NZ VAL 244.A O LYS 292.A HZ2 3.085 2.240 ARG 293.A N ASP 289.A O ARG 293.A H 3.043 2.416 ARG 293.A NE THR 287.A O ARG 293.A HE 2.978 2.154 ARG 293.A NH1 GLU 190.A OE2 ARG 293.A HH12 2.747 2.142 ARG 293.A NH1 ALA 201.A O ARG 293.A HH11 2.892 2.120 ARG 293.A NH2 THR 287.A O ARG 293.A HH21 3.509 2.849 ARG 293.A NH2 LEU 288.A O ARG 293.A HH21 3.189 2.430 THR 295.A N GLN 298.A OE1 THR 295.A H 2.946 2.134 GLN 298.A N THR 295.A OG1 GLN 298.A H 3.220 2.399 THR 299.A N THR 295.A O THR 299.A H 3.187 2.408 THR 299.A OG1 ALA 296.A O THR 299.A HG1 2.530 1.714 LEU 300.A N ALA 296.A O LEU 300.A H 3.166 2.380 GLN 301.A N GLU 297.A O GLN 301.A H 3.096 2.382 GLN 301.A N GLN 298.A O GLN 301.A H 3.125 2.537 SER 302.A OG THR 299.A O SER 302.A HG 2.753 2.144 PHE 304.A N SER 302.A OG PHE 304.A H 3.266 2.630 LEU 305.A N SER 302.A OG LEU 305.A H 3.003 2.185 LYS 306.A N SER 302.A O LYS 306.A H 2.787 1.985 LYS 306.A NZ ASP 307.A OD1 LYS 306.A HZ2 2.791 1.914 LYS 306.A NZ ASP 307.A OD2 LYS 306.A HZ2 3.253 2.645 LYS 312.A N GLU 309.A O LYS 312.A H 3.166 2.465