Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8by9_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N GLY 1.A O GLY 4.A H 3.079 2.256 MET 6.A N MET 3.A O MET 6.A H 3.129 2.296 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH12 3.487 2.846 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE2 ARG 8.A HH12 2.912 2.066 ARG 8.A NH2 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH22 2.800 1.950 LEU 11.A N GLU 7.A O LEU 11.A H 2.936 2.130 ILE 12.A N ARG 8.A O ILE 12.A H 3.068 2.246 GLN 13.A N ALA 9.A O GLN 13.A H 2.934 2.101 LYS 14.A N SER 10.A O LYS 14.A H 2.832 2.008 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.812 1.998 LYS 16.A N ILE 12.A O LYS 16.A H 3.117 2.321 LEU 17.A N GLN 13.A O LEU 17.A H 3.069 2.273 ALA 18.A N LYS 14.A O ALA 18.A H 2.800 1.961 GLU 19.A N ALA 15.A O GLU 19.A H 2.946 2.128 GLN 20.A N LYS 16.A O GLN 20.A H 3.088 2.270 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 2.971 2.188 GLU 22.A N GLU 19.A O GLU 22.A H 2.954 2.112 ARG 23.A N ALA 18.A O ARG 23.A H 2.820 1.967 ARG 23.A NE ASP 26.A OD2 ARG 23.A HE 2.952 2.199 ARG 23.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 23.A HH21 2.877 2.107 MET 27.A N ARG 23.A O MET 27.A H 2.933 2.097 ALA 28.A N TYR 24.A O ALA 28.A H 2.882 2.066 ALA 29.A N GLU 25.A O ALA 29.A H 2.996 2.177 PHE 30.A N ASP 26.A O PHE 30.A H 2.864 2.029 MET 31.A N MET 27.A O MET 31.A H 2.955 2.147 LYS 32.A N ALA 28.A O LYS 32.A H 2.805 1.959 LYS 32.A NZ GLU 36.A OE2 LYS 32.A HZ2 2.712 2.003 GLY 33.A N ALA 29.A O GLY 33.A H 2.984 2.139 ALA 34.A N PHE 30.A O ALA 34.A H 2.960 2.193 VAL 35.A N MET 31.A O VAL 35.A H 2.871 2.036 GLU 36.A N LYS 32.A O GLU 36.A H 2.973 2.168 LYS 37.A N ALA 34.A O LYS 37.A H 3.096 2.310 LYS 37.A NZ MET 3.A O LYS 37.A HZ1 3.324 2.646 LYS 37.A NZ MET 6.A O LYS 37.A HZ1 2.709 2.118 GLY 38.A N VAL 35.A O GLY 38.A H 2.951 2.105 SER 42.A N GLU 45.A OE1 SER 42.A H 2.848 2.011 GLU 45.A N SER 42.A OG GLU 45.A H 3.243 2.396 ARG 46.A N SER 42.A O ARG 46.A H 2.865 2.036 ARG 46.A NH1 LEU 41.A O ARG 46.A HH11 2.977 2.399 ASN 47.A N CYS 43.A O ASN 47.A H 3.142 2.328 ASN 47.A ND2 CYS 43.A O ASN 47.A HD22 2.937 2.127 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 2.923 2.133 LEU 49.A N GLU 45.A O LEU 49.A H 3.005 2.184 SER 50.A N ARG 46.A O SER 50.A H 2.985 2.158 VAL 51.A N ASN 47.A O VAL 51.A H 2.838 1.984 ALA 52.A N LEU 48.A O ALA 52.A H 3.088 2.256 TYR 53.A N LEU 49.A O TYR 53.A H 3.213 2.360 LYS 54.A N SER 50.A O LYS 54.A H 2.833 1.995 ASN 55.A N VAL 51.A O ASN 55.A H 3.121 2.312 ASN 55.A ND2 VAL 51.A O ASN 55.A HD22 2.933 2.091 VAL 56.A N ALA 52.A O VAL 56.A H 3.079 2.250 VAL 57.A N TYR 53.A O VAL 57.A H 2.862 2.005 GLY 58.A N LYS 54.A O GLY 58.A H 2.844 2.078 GLY 59.A N ASN 55.A O GLY 59.A H 3.099 2.276 GLN 60.A N VAL 56.A O GLN 60.A H 3.174 2.360 GLN 60.A NE2 GLU 96.A OE2 GLN 60.A HE21 2.901 2.048 ARG 61.A N VAL 57.A O ARG 61.A H 2.813 1.984 ARG 61.A NE GLU 138.A OE1 ARG 61.A HE 2.896 2.086 ARG 61.A NH2 GLU 138.A OE1 ARG 61.A HH21 3.545 2.901 ARG 61.A NH2 GLU 138.A OE2 ARG 61.A HH21 2.915 2.079 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 3.047 2.225 ALA 63.A N GLY 59.A O ALA 63.A H 3.024 2.194 TRP 64.A N GLN 60.A O TRP 64.A H 2.810 1.959 TRP 64.A NE1 GLU 94.A OE1 TRP 64.A HE1 2.883 2.039 ARG 65.A N ARG 61.A O ARG 65.A H 2.929 2.122 VAL 66.A N ALA 62.A O VAL 66.A H 3.133 2.304 LEU 67.A N ALA 63.A O LEU 67.A H 3.006 2.175 SER 68.A N TRP 64.A O SER 68.A H 2.753 1.900 SER 69.A N ARG 65.A O SER 69.A H 3.010 2.195 ILE 70.A N VAL 66.A O ILE 70.A H 3.069 2.246 GLU 71.A N LEU 67.A O GLU 71.A H 2.867 2.060 GLN 72.A N SER 68.A O GLN 72.A H 2.878 2.052 LYS 73.A N SER 69.A O LYS 73.A H 3.142 2.300 SER 74.A N ILE 70.A O SER 74.A H 2.964 2.148 SER 74.A OG GLU 71.A O SER 74.A HG 2.711 1.882 ASN 75.A N GLN 72.A O ASN 75.A H 2.923 2.142 GLU 76.A N LYS 73.A O GLU 76.A H 3.067 2.209 SER 79.A N GLU 76.A O SER 79.A H 3.291 2.466 SER 79.A OG LYS 73.A O SER 79.A HG 2.790 2.096 GLY 83.A N GLU 81.A OE2 GLY 83.A H 2.717 1.991 GLU 85.A N GLU 85.A OE1 GLU 85.A H 2.842 2.129 GLU 88.A N PRO 84.A O GLU 88.A H 2.883 2.039 TYR 89.A N GLU 85.A O TYR 89.A H 2.949 2.127 ARG 90.A N VAL 86.A O ARG 90.A H 2.918 2.059 ARG 90.A NE GLU 71.A OE1 ARG 90.A HE 2.720 1.870 ARG 90.A NH1 GLU 91.A OE2 ARG 90.A HH12 2.996 2.292 ARG 90.A NH1 GLU 94.A OE1 ARG 90.A HH11 2.869 2.131 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE1 ARG 90.A HH21 3.431 2.817 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE2 ARG 90.A HH21 2.957 2.098 GLU 91.A N ARG 87.A O GLU 91.A H 2.834 1.993 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.911 2.158 VAL 93.A N TYR 89.A O VAL 93.A H 2.989 2.153 GLU 94.A N ARG 90.A O GLU 94.A H 2.838 1.997 THR 95.A N GLU 91.A O THR 95.A H 2.862 2.043 THR 95.A OG1 GLU 91.A O THR 95.A HG1 2.933 2.177 GLU 96.A N LYS 92.A O GLU 96.A H 3.097 2.282 LEU 97.A N VAL 93.A O LEU 97.A H 2.856 2.012 GLN 98.A N GLU 94.A O GLN 98.A H 2.850 2.005 GLY 99.A N THR 95.A O GLY 99.A H 2.948 2.183 VAL 100.A N GLU 96.A O VAL 100.A H 3.037 2.236 CYS 101.A N LEU 97.A O CYS 101.A H 2.964 2.119 ASP 102.A N GLN 98.A O ASP 102.A H 2.855 2.004 THR 103.A N GLY 99.A O THR 103.A H 2.903 2.110 THR 103.A OG1 GLY 99.A O THR 103.A HG1 3.009 2.249 VAL 104.A N VAL 100.A O VAL 104.A H 2.974 2.141 LEU 105.A N CYS 101.A O LEU 105.A H 2.841 1.983 GLY 106.A N ASP 102.A O GLY 106.A H 2.811 2.009 LEU 107.A N THR 103.A O LEU 107.A H 2.985 2.183 LEU 108.A N VAL 104.A O LEU 108.A H 2.985 2.163 ASP 109.A N LEU 105.A O ASP 109.A H 2.938 2.173 SER 110.A N LEU 107.A O SER 110.A H 3.294 2.576 LEU 112.A N LEU 107.A O LEU 112.A H 3.367 2.515 ILE 113.A N LEU 108.A O ILE 113.A H 2.923 2.065 GLU 115.A N HIS 111.A O GLU 115.A H 3.344 2.575 ALA 116.A N ILE 113.A O ALA 116.A H 2.973 2.137 SER 121.A N ASP 118.A O SER 121.A H 3.177 2.564 SER 121.A OG ASP 118.A O SER 121.A HG 3.035 2.378 ARG 122.A N ASP 118.A O ARG 122.A H 2.870 2.012 ARG 122.A NH1 ALA 116.A O ARG 122.A HH11 3.043 2.210 ARG 122.A NH2 GLU 158.A OE2 ARG 122.A HH21 3.208 2.380 VAL 123.A N ALA 119.A O VAL 123.A H 2.860 2.020 TYR 125.A N SER 121.A O TYR 125.A H 2.923 2.103 LEU 126.A N ARG 122.A O LEU 126.A H 2.936 2.101 LYS 127.A N VAL 123.A O LYS 127.A H 2.869 2.022 LYS 127.A NZ ASP 131.A OD2 LYS 127.A HZ3 2.832 1.990 MET 128.A N PHE 124.A O MET 128.A H 3.105 2.277 LYS 129.A N TYR 125.A O LYS 129.A H 2.909 2.114 GLY 130.A N LEU 126.A O GLY 130.A H 2.960 2.121 ASP 131.A N LYS 127.A O ASP 131.A H 2.849 2.018 TYR 132.A N MET 128.A O TYR 132.A H 2.902 2.092 TYR 133.A N LYS 129.A O TYR 133.A H 3.049 2.200 ARG 134.A N GLY 130.A O ARG 134.A H 2.823 2.021 ARG 134.A NE TYR 156.A OH ARG 134.A HE 2.899 2.042 ARG 134.A NH2 ASP 131.A OD1 ARG 134.A HH21 3.109 2.281 ARG 134.A NH2 TYR 156.A OH ARG 134.A HH21 3.555 2.897 TYR 135.A N ASP 131.A O TYR 135.A H 2.917 2.142 LEU 136.A N TYR 132.A O LEU 136.A H 3.068 2.231 ALA 137.A N TYR 133.A O ALA 137.A H 2.798 2.009 GLU 138.A N ARG 134.A O GLU 138.A H 2.969 2.261 VAL 139.A N LEU 136.A O VAL 139.A H 3.276 2.522 ALA 140.A N ALA 137.A O ALA 140.A H 3.168 2.352 LYS 145.A N GLY 142.A O LYS 145.A H 3.107 2.254 ARG 147.A NH2 ASP 143.A O ARG 147.A HH21 3.391 2.808 ILE 148.A N ASP 144.A O ILE 148.A H 2.861 2.056 ILE 149.A N LYS 145.A O ILE 149.A H 2.975 2.123 ASP 150.A N LYS 146.A O ASP 150.A H 2.917 2.108 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 2.887 2.091 ALA 152.A N ILE 148.A O ALA 152.A H 2.979 2.151 ARG 153.A N ILE 149.A O ARG 153.A H 2.920 2.069 ARG 153.A NE ASP 150.A OD1 ARG 153.A HE 2.832 2.000 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD1 ARG 153.A HH21 3.179 2.477 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD2 ARG 153.A HH21 3.388 2.539 SER 154.A N ASP 150.A O SER 154.A H 2.848 2.020 ALA 155.A N SER 151.A O ALA 155.A H 3.111 2.273 TYR 156.A N ALA 152.A O TYR 156.A H 2.975 2.117 TYR 156.A OH ASP 131.A OD1 TYR 156.A HH 2.554 1.740 GLN 157.A N ARG 153.A O GLN 157.A H 2.843 2.040 GLU 158.A N SER 154.A O GLU 158.A H 3.037 2.194 ALA 159.A N ALA 155.A O ALA 159.A H 3.045 2.192 MET 160.A N TYR 156.A O MET 160.A H 2.778 1.966 ASP 161.A N GLN 157.A O ASP 161.A H 2.859 2.026 ILE 162.A N GLU 158.A O ILE 162.A H 3.104 2.263 SER 163.A N ALA 159.A O SER 163.A H 2.926 2.112 SER 163.A OG ALA 159.A O SER 163.A HG 3.372 2.854 SER 163.A OG MET 160.A O SER 163.A HG 2.999 2.228 LYS 164.A N MET 160.A O LYS 164.A H 2.941 2.117 LYS 165.A N ASP 161.A O LYS 165.A H 3.329 2.589 LYS 165.A N ILE 162.A O LYS 165.A H 3.129 2.510 GLU 166.A N ILE 162.A O GLU 166.A H 2.871 2.195 MET 167.A N SER 163.A O MET 167.A H 2.988 2.196 THR 170.A OG1 ASP 209.A OD2 THR 170.A HG1 2.682 1.919 ASN 171.A N PRO 168.A O ASN 171.A H 3.032 2.176 ASN 171.A ND2 GLU 120.A OE2 ASN 171.A HD21 2.816 2.019 ILE 173.A N ASN 171.A OD1 ILE 173.A H 2.799 2.148 ARG 174.A N ASN 171.A OD1 ARG 174.A H 3.177 2.382 ARG 174.A NH1 MET 167.A O ARG 174.A HH11 2.822 2.140 LEU 175.A N ASN 171.A O LEU 175.A H 2.865 2.033 GLY 176.A N PRO 172.A O GLY 176.A H 2.852 2.025 LEU 177.A N ILE 173.A O LEU 177.A H 2.872 2.025 ALA 178.A N ARG 174.A O ALA 178.A H 3.051 2.211 LEU 179.A N LEU 175.A O LEU 179.A H 2.896 2.047 ASN 180.A N GLY 176.A O ASN 180.A H 2.966 2.142 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD1 ASN 180.A HD22 2.961 2.121 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD2 ASN 180.A HD22 3.310 2.649 PHE 181.A N LEU 177.A O PHE 181.A H 2.832 1.995 SER 182.A N ALA 178.A O SER 182.A H 2.857 2.021 SER 182.A OG ALA 195.A O SER 182.A HG 2.769 2.118 VAL 183.A N LEU 179.A O VAL 183.A H 3.061 2.257 PHE 184.A N ASN 180.A O PHE 184.A H 2.825 1.991 HIS 185.A N PHE 181.A O HIS 185.A H 2.930 2.121 TYR 186.A N SER 182.A O TYR 186.A H 3.045 2.248 GLU 187.A N VAL 183.A O GLU 187.A H 2.777 1.932 ILE 188.A N PHE 184.A O ILE 188.A H 2.918 2.104 ALA 189.A N PHE 184.A O ALA 189.A H 2.997 2.207 SER 191.A N HIS 185.A O SER 191.A H 2.817 1.972 ALA 195.A N SER 191.A O ALA 195.A H 3.027 2.198 ILE 196.A N PRO 192.A O ILE 196.A H 2.937 2.122 SER 197.A N GLU 193.A O SER 197.A H 2.922 2.069 LEU 198.A N GLU 194.A O LEU 198.A H 2.891 2.045 ALA 199.A N ALA 195.A O ALA 199.A H 3.097 2.261 LYS 200.A N ILE 196.A O LYS 200.A H 2.949 2.116 LYS 200.A NZ ASP 204.A OD2 LYS 200.A HZ2 2.533 1.793 THR 201.A N SER 197.A O THR 201.A H 2.929 2.070 THR 201.A OG1 SER 197.A O THR 201.A HG1 3.360 2.755 THR 202.A N LEU 198.A O THR 202.A H 2.943 2.098 THR 202.A OG1 LEU 198.A O THR 202.A HG1 2.673 1.920 PHE 203.A N ALA 199.A O PHE 203.A H 2.968 2.137 ASP 204.A N LYS 200.A O ASP 204.A H 2.935 2.098 GLU 205.A N THR 201.A O GLU 205.A H 2.967 2.125 ALA 206.A N THR 202.A O ALA 206.A H 3.006 2.175 MET 207.A N PHE 203.A O MET 207.A H 2.871 2.030 ALA 208.A N ASP 204.A O ALA 208.A H 3.249 2.459 ASP 209.A N ALA 206.A O ASP 209.A H 2.888 2.064 LEU 210.A N MET 207.A O LEU 210.A H 3.348 2.515 HIS 211.A ND1 ALA 208.A O no hydrogen 3.133 N/A THR 212.A N ASP 209.A O THR 212.A H 3.121 2.267 LEU 213.A N LEU 210.A O LEU 213.A H 3.094 2.245 SER 217.A N SER 214.A OG SER 217.A H 3.253 2.400 TYR 218.A N SER 214.A O TYR 218.A H 2.788 1.934 LYS 219.A N GLU 215.A O LYS 219.A H 3.085 2.302 ASP 220.A N ASP 216.A O ASP 220.A H 3.299 2.485 SER 221.A N SER 217.A O SER 221.A H 2.967 2.118 SER 221.A OG THR 170.A O SER 221.A HG 2.643 1.940 THR 222.A N TYR 218.A O THR 222.A H 2.899 2.048 LEU 223.A N LYS 219.A O LEU 223.A H 3.100 2.311 ILE 224.A N ASP 220.A O ILE 224.A H 3.412 2.610 MET 225.A N SER 221.A O MET 225.A H 2.946 2.119 GLN 226.A N THR 222.A O GLN 226.A H 2.940 2.169 GLN 226.A NE2 ASP 230.A OD1 GLN 226.A HE21 2.975 2.141 LEU 227.A N LEU 223.A O LEU 227.A H 3.357 2.609 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 3.107 2.295 ARG 229.A N MET 225.A O ARG 229.A H 2.985 2.168 ASP 230.A N GLN 226.A O ASP 230.A H 2.807 1.988 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 2.994 2.170 LEU 232.A N LEU 228.A O LEU 232.A H 2.974 2.124 THR 233.A N ARG 229.A O THR 233.A H 2.856 2.054 THR 233.A OG1 ARG 229.A O THR 233.A HG1 3.050 2.281 LEU 234.A N ASP 230.A O LEU 234.A H 2.988 2.201 TRP 235.A N ASN 231.A O TRP 235.A H 2.988 2.351 TRP 235.A N LEU 232.A O TRP 235.A H 3.266 2.563 THR 236.A OG1 LEU 232.A O THR 236.A HG1 2.521 1.706