Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8byb_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N GLY 1.A O GLY 4.A H 3.038 2.216 MET 6.A N MET 3.A O MET 6.A H 3.084 2.242 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH12 3.476 2.835 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE2 ARG 8.A HH12 2.932 2.088 ARG 8.A NH2 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH22 2.800 1.954 LEU 11.A N GLU 7.A O LEU 11.A H 2.916 2.114 ILE 12.A N ARG 8.A O ILE 12.A H 3.062 2.235 GLN 13.A N ALA 9.A O GLN 13.A H 2.942 2.105 LYS 14.A N SER 10.A O LYS 14.A H 2.839 2.009 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.806 1.987 LYS 16.A N ILE 12.A O LYS 16.A H 3.127 2.318 LEU 17.A N GLN 13.A O LEU 17.A H 3.043 2.240 ALA 18.A N LYS 14.A O ALA 18.A H 2.786 1.949 GLU 19.A N ALA 15.A O GLU 19.A H 2.921 2.106 GLN 20.A N LYS 16.A O GLN 20.A H 3.084 2.275 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 2.964 2.196 GLU 22.A N GLU 19.A O GLU 22.A H 2.941 2.099 ARG 23.A N ALA 18.A O ARG 23.A H 2.830 1.973 ARG 23.A NE ASP 26.A OD2 ARG 23.A HE 2.946 2.201 ARG 23.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 23.A HH21 2.845 2.068 MET 27.A N ARG 23.A O MET 27.A H 2.923 2.087 ALA 28.A N TYR 24.A O ALA 28.A H 2.874 2.058 ALA 29.A N GLU 25.A O ALA 29.A H 2.965 2.144 PHE 30.A N ASP 26.A O PHE 30.A H 2.864 2.035 MET 31.A N MET 27.A O MET 31.A H 2.940 2.134 LYS 32.A N ALA 28.A O LYS 32.A H 2.810 1.964 LYS 32.A NZ GLU 36.A OE2 LYS 32.A HZ1 2.685 1.995 GLY 33.A N ALA 29.A O GLY 33.A H 3.010 2.177 ALA 34.A N PHE 30.A O ALA 34.A H 2.919 2.136 VAL 35.A N MET 31.A O VAL 35.A H 2.846 2.008 GLU 36.A N LYS 32.A O GLU 36.A H 2.949 2.144 LYS 37.A N ALA 34.A O LYS 37.A H 3.056 2.275 LYS 37.A NZ MET 3.A O LYS 37.A HZ3 3.365 2.707 LYS 37.A NZ MET 6.A O LYS 37.A HZ3 2.725 2.109 GLY 38.A N VAL 35.A O GLY 38.A H 2.958 2.117 SER 42.A N GLU 45.A OE1 SER 42.A H 2.832 1.996 ARG 46.A N SER 42.A O ARG 46.A H 2.837 2.007 ARG 46.A NH1 LEU 41.A O ARG 46.A HH11 2.983 2.402 ASN 47.A N CYS 43.A O ASN 47.A H 3.134 2.315 ASN 47.A ND2 CYS 43.A O ASN 47.A HD22 2.917 2.073 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 2.913 2.105 LEU 49.A N GLU 45.A O LEU 49.A H 2.975 2.143 SER 50.A N ARG 46.A O SER 50.A H 2.980 2.159 SER 50.A OG ARG 46.A O SER 50.A HG 3.527 3.003 SER 50.A OG ASN 47.A O SER 50.A HG 3.015 2.248 VAL 51.A N ASN 47.A O VAL 51.A H 2.784 1.934 ALA 52.A N LEU 48.A O ALA 52.A H 3.063 2.230 TYR 53.A N LEU 49.A O TYR 53.A H 3.206 2.352 LYS 54.A N SER 50.A O LYS 54.A H 2.838 2.000 ASN 55.A N VAL 51.A O ASN 55.A H 3.125 2.323 ASN 55.A ND2 VAL 51.A O ASN 55.A HD21 2.969 2.116 VAL 56.A N ALA 52.A O VAL 56.A H 3.052 2.221 VAL 57.A N TYR 53.A O VAL 57.A H 2.823 1.964 GLY 58.A N LYS 54.A O GLY 58.A H 2.825 2.051 GLY 59.A N ASN 55.A O GLY 59.A H 3.128 2.299 GLN 60.A N VAL 56.A O GLN 60.A H 3.166 2.352 GLN 60.A NE2 GLU 96.A OE2 GLN 60.A HE21 2.874 2.024 ARG 61.A N VAL 57.A O ARG 61.A H 2.795 1.976 ARG 61.A NE GLU 138.A OE1 ARG 61.A HE 2.906 2.098 ARG 61.A NH2 GLU 138.A OE2 ARG 61.A HH21 2.897 2.061 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 3.005 2.179 ALA 63.A N GLY 59.A O ALA 63.A H 3.004 2.173 TRP 64.A N GLN 60.A O TRP 64.A H 2.821 1.972 TRP 64.A NE1 GLU 94.A OE1 TRP 64.A HE1 2.866 2.027 ARG 65.A N ARG 61.A O ARG 65.A H 2.932 2.129 VAL 66.A N ALA 62.A O VAL 66.A H 3.131 2.301 LEU 67.A N ALA 63.A O LEU 67.A H 2.985 2.153 SER 68.A N TRP 64.A O SER 68.A H 2.728 1.875 SER 69.A N ARG 65.A O SER 69.A H 2.965 2.138 ILE 70.A N VAL 66.A O ILE 70.A H 3.048 2.223 GLU 71.A N LEU 67.A O GLU 71.A H 2.845 2.033 GLN 72.A N SER 68.A O GLN 72.A H 2.875 2.051 LYS 73.A N SER 69.A O LYS 73.A H 3.126 2.288 SER 74.A N ILE 70.A O SER 74.A H 2.959 2.143 SER 74.A OG GLU 71.A O SER 74.A HG 2.719 1.894 ASN 75.A N GLN 72.A O ASN 75.A H 3.054 2.273 GLU 76.A N LYS 73.A O GLU 76.A H 3.150 2.296 SER 79.A N GLU 76.A O SER 79.A H 3.352 2.521 SER 79.A OG LYS 73.A O SER 79.A HG 2.739 2.029 GLY 83.A N GLU 81.A OE2 GLY 83.A H 2.717 2.004 GLU 85.A N GLU 85.A OE1 GLU 85.A H 2.808 2.083 ARG 87.A NH1 GLU 91.A OE2 ARG 87.A HH11 3.399 2.587 GLU 88.A N PRO 84.A O GLU 88.A H 2.852 2.015 TYR 89.A N GLU 85.A O TYR 89.A H 2.888 2.066 ARG 90.A N VAL 86.A O ARG 90.A H 2.875 2.017 ARG 90.A NE GLU 71.A OE1 ARG 90.A HE 2.737 1.885 ARG 90.A NH1 GLU 94.A OE1 ARG 90.A HH11 2.841 2.094 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE1 ARG 90.A HH21 3.459 2.844 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE2 ARG 90.A HH21 2.946 2.087 GLU 91.A N ARG 87.A O GLU 91.A H 2.823 1.983 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.912 2.149 VAL 93.A N TYR 89.A O VAL 93.A H 2.982 2.141 GLU 94.A N ARG 90.A O GLU 94.A H 2.816 1.977 THR 95.A N GLU 91.A O THR 95.A H 2.849 2.038 THR 95.A OG1 GLU 91.A O THR 95.A HG1 2.905 2.154 GLU 96.A N LYS 92.A O GLU 96.A H 3.085 2.267 LEU 97.A N VAL 93.A O LEU 97.A H 2.841 1.997 GLN 98.A N GLU 94.A O GLN 98.A H 2.831 1.992 GLY 99.A N THR 95.A O GLY 99.A H 2.921 2.139 VAL 100.A N GLU 96.A O VAL 100.A H 3.043 2.236 CYS 101.A N LEU 97.A O CYS 101.A H 2.971 2.123 ASP 102.A N GLN 98.A O ASP 102.A H 2.836 1.991 THR 103.A N GLY 99.A O THR 103.A H 2.886 2.091 VAL 104.A N VAL 100.A O VAL 104.A H 2.945 2.114 LEU 105.A N CYS 101.A O LEU 105.A H 2.833 1.975 GLY 106.A N ASP 102.A O GLY 106.A H 2.810 2.021 LEU 107.A N THR 103.A O LEU 107.A H 2.986 2.180 LEU 108.A N VAL 104.A O LEU 108.A H 2.981 2.165 ASP 109.A N LEU 105.A O ASP 109.A H 2.923 2.146 SER 110.A N LEU 107.A O SER 110.A H 3.297 2.570 LEU 112.A N LEU 107.A O LEU 112.A H 3.348 2.493 ILE 113.A N LEU 108.A O ILE 113.A H 2.941 2.081 GLU 115.A N HIS 111.A O GLU 115.A H 3.367 2.598 ALA 116.A N ILE 113.A O ALA 116.A H 2.951 2.107 SER 121.A N ASP 118.A O SER 121.A H 3.171 2.570 SER 121.A OG ASP 118.A O SER 121.A HG 3.034 2.393 ARG 122.A N ASP 118.A O ARG 122.A H 2.853 1.993 ARG 122.A NH1 ALA 116.A O ARG 122.A HH11 3.025 2.190 ARG 122.A NH2 GLU 158.A OE2 ARG 122.A HH21 3.179 2.355 VAL 123.A N ALA 119.A O VAL 123.A H 2.850 2.007 TYR 125.A N SER 121.A O TYR 125.A H 2.930 2.102 LEU 126.A N ARG 122.A O LEU 126.A H 2.940 2.098 LYS 127.A N VAL 123.A O LYS 127.A H 2.878 2.040 LYS 127.A NZ ASP 131.A OD2 LYS 127.A HZ3 2.877 2.032 MET 128.A N PHE 124.A O MET 128.A H 3.039 2.201 LYS 129.A N TYR 125.A O LYS 129.A H 2.895 2.103 GLY 130.A N LEU 126.A O GLY 130.A H 2.947 2.111 ASP 131.A N LYS 127.A O ASP 131.A H 2.827 1.999 TYR 132.A N MET 128.A O TYR 132.A H 2.893 2.081 TYR 133.A N LYS 129.A O TYR 133.A H 3.040 2.184 ARG 134.A N GLY 130.A O ARG 134.A H 2.801 1.999 ARG 134.A NE TYR 156.A OH ARG 134.A HE 2.900 2.044 ARG 134.A NH2 ASP 131.A OD1 ARG 134.A HH21 3.134 2.309 ARG 134.A NH2 TYR 156.A OH ARG 134.A HH21 3.525 2.859 TYR 135.A N ASP 131.A O TYR 135.A H 2.907 2.125 LEU 136.A N TYR 132.A O LEU 136.A H 3.050 2.221 ALA 137.A N TYR 133.A O ALA 137.A H 2.787 1.996 GLU 138.A N ARG 134.A O GLU 138.A H 2.968 2.259 GLU 138.A N TYR 135.A O GLU 138.A H 3.231 2.611 VAL 139.A N LEU 136.A O VAL 139.A H 3.243 2.472 ALA 140.A N ALA 137.A O ALA 140.A H 3.171 2.345 LYS 145.A N GLY 142.A O LYS 145.A H 3.125 2.273 LYS 145.A NZ ALA 137.A O LYS 145.A HZ2 3.512 2.813 ARG 147.A NE ASP 144.A OD1 ARG 147.A HE 3.438 2.583 ILE 148.A N ASP 144.A O ILE 148.A H 2.861 2.062 ILE 149.A N LYS 145.A O ILE 149.A H 3.002 2.151 ASP 150.A N LYS 146.A O ASP 150.A H 2.927 2.132 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 2.884 2.094 ALA 152.A N ILE 148.A O ALA 152.A H 3.007 2.186 ARG 153.A N ILE 149.A O ARG 153.A H 2.934 2.088 ARG 153.A NE ASP 150.A OD1 ARG 153.A HE 2.746 1.907 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD1 ARG 153.A HH21 3.184 2.503 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD2 ARG 153.A HH21 3.255 2.406 SER 154.A N ASP 150.A O SER 154.A H 2.847 2.030 ALA 155.A N SER 151.A O ALA 155.A H 3.117 2.283 TYR 156.A N ALA 152.A O TYR 156.A H 2.964 2.106 TYR 156.A OH ASP 131.A OD1 TYR 156.A HH 2.590 1.772 GLN 157.A N ARG 153.A O GLN 157.A H 2.801 1.998 GLN 157.A NE2 GLN 157.A O GLN 157.A HE21 3.391 2.876 GLN 157.A NE2 ASP 161.A OD1 GLN 157.A HE21 2.927 2.146 GLU 158.A N SER 154.A O GLU 158.A H 2.993 2.150 ALA 159.A N ALA 155.A O ALA 159.A H 3.012 2.166 MET 160.A N TYR 156.A O MET 160.A H 2.759 1.957 ASP 161.A N GLN 157.A O ASP 161.A H 2.875 2.043 ILE 162.A N GLU 158.A O ILE 162.A H 3.095 2.253 SER 163.A N ALA 159.A O SER 163.A H 2.920 2.103 SER 163.A OG ALA 159.A O SER 163.A HG 3.384 2.837 SER 163.A OG MET 160.A O SER 163.A HG 2.960 2.205 LYS 164.A N MET 160.A O LYS 164.A H 2.939 2.121 LYS 165.A N ASP 161.A O LYS 165.A H 3.320 2.582 LYS 165.A N ILE 162.A O LYS 165.A H 3.132 2.510 GLU 166.A N ILE 162.A O GLU 166.A H 2.852 2.158 MET 167.A N SER 163.A O MET 167.A H 2.983 2.175 ASN 171.A N PRO 168.A O ASN 171.A H 3.051 2.196 ASN 171.A ND2 GLU 120.A OE2 ASN 171.A HD21 2.787 1.988 ILE 173.A N ASN 171.A OD1 ILE 173.A H 2.789 2.120 ARG 174.A N ASN 171.A OD1 ARG 174.A H 3.264 2.473 ARG 174.A NH1 MET 167.A O ARG 174.A HH11 2.839 2.154 LEU 175.A N ASN 171.A O LEU 175.A H 2.872 2.046 GLY 176.A N PRO 172.A O GLY 176.A H 2.845 2.017 LEU 177.A N ILE 173.A O LEU 177.A H 2.852 2.006 ALA 178.A N ARG 174.A O ALA 178.A H 3.024 2.192 LEU 179.A N LEU 175.A O LEU 179.A H 2.879 2.037 ASN 180.A N GLY 176.A O ASN 180.A H 2.973 2.156 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD1 ASN 180.A HD22 2.928 2.094 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD2 ASN 180.A HD22 3.323 2.661 PHE 181.A N LEU 177.A O PHE 181.A H 2.836 1.991 SER 182.A N ALA 178.A O SER 182.A H 2.856 2.015 SER 182.A OG ALA 195.A O SER 182.A HG 2.773 2.121 VAL 183.A N LEU 179.A O VAL 183.A H 3.059 2.258 PHE 184.A N ASN 180.A O PHE 184.A H 2.831 1.994 HIS 185.A N PHE 181.A O HIS 185.A H 2.918 2.113 TYR 186.A N SER 182.A O TYR 186.A H 3.044 2.243 GLU 187.A N VAL 183.A O GLU 187.A H 2.785 1.937 ILE 188.A N PHE 184.A O ILE 188.A H 2.934 2.122 ALA 189.A N PHE 184.A O ALA 189.A H 3.009 2.216 SER 191.A N HIS 185.A O SER 191.A H 2.804 1.961 ALA 195.A N SER 191.A O ALA 195.A H 3.026 2.194 ILE 196.A N PRO 192.A O ILE 196.A H 2.928 2.107 SER 197.A N GLU 193.A O SER 197.A H 2.881 2.025 LEU 198.A N GLU 194.A O LEU 198.A H 2.874 2.033 ALA 199.A N ALA 195.A O ALA 199.A H 3.076 2.239 LYS 200.A N ILE 196.A O LYS 200.A H 2.942 2.101 LYS 200.A NZ ASP 204.A OD2 LYS 200.A HZ1 2.601 1.848 THR 201.A N SER 197.A O THR 201.A H 2.909 2.049 THR 201.A OG1 SER 197.A O THR 201.A HG1 3.263 2.650 THR 202.A N LEU 198.A O THR 202.A H 2.935 2.093 THR 202.A OG1 LEU 198.A O THR 202.A HG1 2.682 1.926 PHE 203.A N ALA 199.A O PHE 203.A H 2.946 2.119 ASP 204.A N LYS 200.A O ASP 204.A H 2.943 2.113 GLU 205.A N THR 201.A O GLU 205.A H 2.962 2.117 ALA 206.A N THR 202.A O ALA 206.A H 3.009 2.193 MET 207.A N PHE 203.A O MET 207.A H 2.878 2.038 ALA 208.A N ASP 204.A O ALA 208.A H 3.218 2.414 ASP 209.A N ALA 206.A O ASP 209.A H 2.861 2.038 LEU 210.A N MET 207.A O LEU 210.A H 3.338 2.499 HIS 211.A ND1 ALA 208.A O no hydrogen 3.147 N/A THR 212.A N ASP 209.A O THR 212.A H 3.154 2.301 THR 212.A OG1 ASP 209.A OD1 THR 212.A HG1 3.548 2.960 LEU 213.A N LEU 210.A O LEU 213.A H 3.069 2.221 SER 214.A OG SER 217.A OG SER 214.A HG 3.394 2.743 SER 217.A N SER 214.A OG SER 217.A H 3.167 2.316 TYR 218.A N SER 214.A O TYR 218.A H 2.792 1.946 LYS 219.A N GLU 215.A O LYS 219.A H 3.072 2.272 ASP 220.A N ASP 216.A O ASP 220.A H 3.225 2.417 SER 221.A N SER 217.A O SER 221.A H 2.956 2.119 SER 221.A OG THR 170.A O SER 221.A HG 2.619 1.928 THR 222.A N TYR 218.A O THR 222.A H 2.869 2.018 THR 222.A OG1 TYR 218.A O THR 222.A HG1 2.812 2.011 THR 222.A OG1 LYS 219.A O THR 222.A HG1 3.329 2.878 LEU 223.A N LYS 219.A O LEU 223.A H 3.122 2.328 MET 225.A N SER 221.A O MET 225.A H 2.959 2.134 GLN 226.A N THR 222.A O GLN 226.A H 2.920 2.139 GLN 226.A NE2 ASP 230.A OD1 GLN 226.A HE21 2.869 2.046 LEU 227.A N LEU 223.A O LEU 227.A H 3.328 2.568 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 3.053 2.237 ARG 229.A N MET 225.A O ARG 229.A H 2.959 2.141 ASP 230.A N GLN 226.A O ASP 230.A H 2.803 1.993 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 2.979 2.150 LEU 232.A N LEU 228.A O LEU 232.A H 2.966 2.125 THR 233.A N ARG 229.A O THR 233.A H 2.837 2.034 THR 233.A OG1 ARG 229.A O THR 233.A HG1 3.040 2.269 LEU 234.A N ASP 230.A O LEU 234.A H 2.972 2.170 TRP 235.A N ASN 231.A O TRP 235.A H 2.966 2.347 TRP 235.A N LEU 232.A O TRP 235.A H 3.224 2.512