Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8byd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N GLY 1.A O GLY 4.A H 2.969 2.141 MET 6.A N MET 3.A O MET 6.A H 3.086 2.243 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH12 3.513 2.873 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE2 ARG 8.A HH12 2.923 2.075 ARG 8.A NH2 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH22 2.809 1.958 LEU 11.A N GLU 7.A O LEU 11.A H 2.930 2.121 ILE 12.A N ARG 8.A O ILE 12.A H 3.060 2.231 GLN 13.A N ALA 9.A O GLN 13.A H 2.934 2.104 LYS 14.A N SER 10.A O LYS 14.A H 2.847 2.031 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.819 2.013 LYS 16.A N ILE 12.A O LYS 16.A H 3.140 2.329 LEU 17.A N GLN 13.A O LEU 17.A H 3.061 2.249 ALA 18.A N LYS 14.A O ALA 18.A H 2.794 1.954 GLU 19.A N ALA 15.A O GLU 19.A H 2.915 2.099 GLN 20.A N LYS 16.A O GLN 20.A H 3.106 2.295 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 2.980 2.210 GLU 22.A N GLU 19.A O GLU 22.A H 2.929 2.091 ARG 23.A N ALA 18.A O ARG 23.A H 2.832 1.977 ARG 23.A NE ASP 26.A OD2 ARG 23.A HE 2.958 2.211 ARG 23.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 23.A HH21 2.857 2.081 MET 27.A N ARG 23.A O MET 27.A H 2.932 2.096 ALA 28.A N TYR 24.A O ALA 28.A H 2.867 2.043 ALA 29.A N GLU 25.A O ALA 29.A H 2.985 2.159 PHE 30.A N ASP 26.A O PHE 30.A H 2.869 2.033 MET 31.A N MET 27.A O MET 31.A H 2.950 2.140 LYS 32.A N ALA 28.A O LYS 32.A H 2.798 1.955 LYS 32.A NZ GLU 36.A OE2 LYS 32.A HZ2 2.746 2.017 GLY 33.A N ALA 29.A O GLY 33.A H 3.012 2.173 ALA 34.A N PHE 30.A O ALA 34.A H 2.926 2.151 VAL 35.A N MET 31.A O VAL 35.A H 2.859 2.019 GLU 36.A N LYS 32.A O GLU 36.A H 2.944 2.139 LYS 37.A N ALA 34.A O LYS 37.A H 3.109 2.309 LYS 37.A NZ MET 3.A O LYS 37.A HZ1 3.362 2.699 LYS 37.A NZ MET 6.A O LYS 37.A HZ1 2.741 2.118 GLY 38.A N VAL 35.A O GLY 38.A H 2.960 2.111 SER 42.A N GLU 45.A OE1 SER 42.A H 2.841 2.010 GLU 45.A N SER 42.A OG GLU 45.A H 3.216 2.377 ARG 46.A N SER 42.A O ARG 46.A H 2.849 2.016 ARG 46.A NH1 LEU 41.A O ARG 46.A HH11 2.957 2.369 ASN 47.A N CYS 43.A O ASN 47.A H 3.122 2.305 ASN 47.A ND2 CYS 43.A O ASN 47.A HD22 2.964 2.127 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 2.901 2.090 LEU 49.A N GLU 45.A O LEU 49.A H 2.984 2.147 SER 50.A N ARG 46.A O SER 50.A H 2.968 2.144 VAL 51.A N ASN 47.A O VAL 51.A H 2.804 1.950 ALA 52.A N LEU 48.A O ALA 52.A H 3.091 2.260 TYR 53.A N LEU 49.A O TYR 53.A H 3.207 2.354 LYS 54.A N SER 50.A O LYS 54.A H 2.830 2.000 ASN 55.A N VAL 51.A O ASN 55.A H 3.104 2.295 ASN 55.A ND2 VAL 51.A O ASN 55.A HD22 2.941 2.093 VAL 56.A N ALA 52.A O VAL 56.A H 3.065 2.237 VAL 57.A N TYR 53.A O VAL 57.A H 2.843 1.983 GLY 58.A N LYS 54.A O GLY 58.A H 2.800 2.029 GLY 59.A N ASN 55.A O GLY 59.A H 3.099 2.272 GLN 60.A N VAL 56.A O GLN 60.A H 3.161 2.351 GLN 60.A NE2 GLU 96.A OE2 GLN 60.A HE21 2.870 2.018 ARG 61.A N VAL 57.A O ARG 61.A H 2.791 1.959 ARG 61.A NE GLU 138.A OE1 ARG 61.A HE 2.928 2.118 ARG 61.A NH2 GLU 138.A OE2 ARG 61.A HH21 2.874 2.034 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 3.029 2.205 ALA 63.A N GLY 59.A O ALA 63.A H 3.023 2.192 TRP 64.A N GLN 60.A O TRP 64.A H 2.820 1.974 TRP 64.A NE1 GLU 94.A OE1 TRP 64.A HE1 2.873 2.030 ARG 65.A N ARG 61.A O ARG 65.A H 2.928 2.127 VAL 66.A N ALA 62.A O VAL 66.A H 3.137 2.310 LEU 67.A N ALA 63.A O LEU 67.A H 2.981 2.151 SER 68.A N TRP 64.A O SER 68.A H 2.732 1.884 SER 69.A N ARG 65.A O SER 69.A H 2.971 2.153 ILE 70.A N VAL 66.A O ILE 70.A H 3.047 2.225 GLU 71.A N LEU 67.A O GLU 71.A H 2.850 2.038 GLN 72.A N SER 68.A O GLN 72.A H 2.920 2.108 LYS 73.A N SER 69.A O LYS 73.A H 3.135 2.303 SER 74.A N ILE 70.A O SER 74.A H 2.940 2.115 SER 74.A OG GLU 71.A O SER 74.A HG 2.614 1.788 ASN 75.A N GLU 71.A O ASN 75.A H 3.209 2.621 ASN 75.A N GLN 72.A O ASN 75.A H 3.075 2.333 GLU 76.A N LYS 73.A O GLU 76.A H 3.058 2.213 SER 79.A N GLU 76.A O SER 79.A H 3.240 2.411 SER 79.A OG LYS 73.A O SER 79.A HG 2.714 2.003 GLY 83.A N GLU 81.A OE2 GLY 83.A H 2.772 2.064 GLU 85.A N GLU 85.A OE1 GLU 85.A H 2.826 2.100 ARG 87.A NH1 GLU 91.A OE1 ARG 87.A HH11 3.382 2.576 GLU 88.A N PRO 84.A O GLU 88.A H 2.866 2.035 TYR 89.A N GLU 85.A O TYR 89.A H 2.922 2.095 ARG 90.A N VAL 86.A O ARG 90.A H 2.897 2.038 ARG 90.A NE GLU 71.A OE1 ARG 90.A HE 2.722 1.872 ARG 90.A NH1 GLU 94.A OE1 ARG 90.A HH11 2.867 2.126 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE1 ARG 90.A HH21 3.463 2.854 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE2 ARG 90.A HH21 2.936 2.075 GLU 91.A N ARG 87.A O GLU 91.A H 2.829 1.986 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.890 2.115 VAL 93.A N TYR 89.A O VAL 93.A H 2.991 2.152 GLU 94.A N ARG 90.A O GLU 94.A H 2.807 1.966 THR 95.A N GLU 91.A O THR 95.A H 2.840 2.029 THR 95.A OG1 GLU 91.A O THR 95.A HG1 2.925 2.167 GLU 96.A N LYS 92.A O GLU 96.A H 3.096 2.279 LEU 97.A N VAL 93.A O LEU 97.A H 2.856 2.017 GLN 98.A N GLU 94.A O GLN 98.A H 2.846 2.001 GLY 99.A N THR 95.A O GLY 99.A H 2.914 2.143 VAL 100.A N GLU 96.A O VAL 100.A H 3.029 2.220 CYS 101.A N LEU 97.A O CYS 101.A H 2.935 2.088 ASP 102.A N GLN 98.A O ASP 102.A H 2.838 1.995 THR 103.A N GLY 99.A O THR 103.A H 2.905 2.103 THR 103.A OG1 GLY 99.A O THR 103.A HG1 3.003 2.235 VAL 104.A N VAL 100.A O VAL 104.A H 2.972 2.144 LEU 105.A N CYS 101.A O LEU 105.A H 2.864 2.006 GLY 106.A N ASP 102.A O GLY 106.A H 2.811 2.018 LEU 107.A N THR 103.A O LEU 107.A H 3.008 2.215 LEU 108.A N VAL 104.A O LEU 108.A H 2.988 2.171 ASP 109.A N LEU 105.A O ASP 109.A H 2.913 2.141 SER 110.A N GLY 106.A O SER 110.A H 2.813 2.215 SER 110.A N LEU 107.A O SER 110.A H 3.330 2.622 LEU 112.A N LEU 107.A O LEU 112.A H 3.316 2.461 ILE 113.A N LEU 108.A O ILE 113.A H 2.935 2.075 ALA 116.A N ILE 113.A O ALA 116.A H 2.962 2.117 SER 121.A N ASP 118.A O SER 121.A H 3.178 2.559 SER 121.A OG ASP 118.A O SER 121.A HG 3.020 2.366 ARG 122.A N ASP 118.A O ARG 122.A H 2.886 2.026 ARG 122.A NE GLU 158.A OE2 ARG 122.A HE 3.434 2.706 ARG 122.A NH1 ALA 116.A O ARG 122.A HH11 3.071 2.235 ARG 122.A NH2 GLU 158.A OE2 ARG 122.A HH21 3.126 2.302 VAL 123.A N ALA 119.A O VAL 123.A H 2.840 2.003 TYR 125.A N SER 121.A O TYR 125.A H 2.923 2.089 LEU 126.A N ARG 122.A O LEU 126.A H 2.942 2.097 LYS 127.A N VAL 123.A O LYS 127.A H 2.858 2.013 LYS 127.A NZ ASP 131.A OD2 LYS 127.A HZ1 2.853 2.011 MET 128.A N PHE 124.A O MET 128.A H 3.047 2.209 LYS 129.A N TYR 125.A O LYS 129.A H 2.885 2.085 GLY 130.A N LEU 126.A O GLY 130.A H 2.942 2.108 ASP 131.A N LYS 127.A O ASP 131.A H 2.821 2.005 TYR 132.A N MET 128.A O TYR 132.A H 2.894 2.079 TYR 133.A N LYS 129.A O TYR 133.A H 3.048 2.192 ARG 134.A N GLY 130.A O ARG 134.A H 2.805 2.004 ARG 134.A NE TYR 156.A OH ARG 134.A HE 2.877 2.022 ARG 134.A NH2 ASP 131.A OD1 ARG 134.A HH21 3.121 2.296 ARG 134.A NH2 TYR 156.A OH ARG 134.A HH21 3.509 2.847 TYR 135.A N ASP 131.A O TYR 135.A H 2.904 2.134 LEU 136.A N TYR 132.A O LEU 136.A H 3.063 2.226 ALA 137.A N TYR 133.A O ALA 137.A H 2.803 2.016 GLU 138.A N ARG 134.A O GLU 138.A H 2.974 2.266 GLU 138.A N TYR 135.A O GLU 138.A H 3.240 2.624 VAL 139.A N LEU 136.A O VAL 139.A H 3.236 2.473 ALA 140.A N ALA 137.A O ALA 140.A H 3.184 2.357 LYS 145.A N GLY 142.A O LYS 145.A H 3.126 2.276 ARG 147.A NE ASP 144.A OD1 ARG 147.A HE 3.254 2.410 ILE 148.A N ASP 144.A O ILE 148.A H 2.879 2.085 ILE 149.A N LYS 145.A O ILE 149.A H 3.001 2.149 ASP 150.A N LYS 146.A O ASP 150.A H 2.915 2.109 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 2.873 2.085 ALA 152.A N ILE 148.A O ALA 152.A H 3.010 2.189 ARG 153.A N ILE 149.A O ARG 153.A H 2.938 2.088 ARG 153.A NE ASP 150.A OD2 ARG 153.A HE 2.775 1.950 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD1 ARG 153.A HH21 3.139 2.300 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD2 ARG 153.A HH21 3.101 2.401 SER 154.A N ASP 150.A O SER 154.A H 2.835 2.015 ALA 155.A N SER 151.A O ALA 155.A H 3.125 2.290 TYR 156.A N ALA 152.A O TYR 156.A H 2.978 2.119 TYR 156.A OH ASP 131.A OD1 TYR 156.A HH 2.602 1.780 GLN 157.A N ARG 153.A O GLN 157.A H 2.821 2.028 GLN 157.A NE2 GLN 157.A O GLN 157.A HE21 3.395 2.918 GLN 157.A NE2 ASP 161.A OD1 GLN 157.A HE21 2.920 2.134 GLU 158.A N SER 154.A O GLU 158.A H 3.018 2.175 ALA 159.A N ALA 155.A O ALA 159.A H 3.017 2.165 MET 160.A N TYR 156.A O MET 160.A H 2.782 1.988 ASP 161.A N GLN 157.A O ASP 161.A H 2.870 2.037 ILE 162.A N GLU 158.A O ILE 162.A H 3.081 2.242 SER 163.A N ALA 159.A O SER 163.A H 2.913 2.094 SER 163.A OG ALA 159.A O SER 163.A HG 3.412 2.884 SER 163.A OG MET 160.A O SER 163.A HG 2.979 2.215 LYS 164.A N MET 160.A O LYS 164.A H 2.942 2.127 LYS 165.A N ASP 161.A O LYS 165.A H 3.335 2.595 LYS 165.A N ILE 162.A O LYS 165.A H 3.141 2.518 LYS 165.A NZ GLU 166.A OE2 LYS 165.A HZ3 3.480 2.841 GLU 166.A N ILE 162.A O GLU 166.A H 2.881 2.172 MET 167.A N SER 163.A O MET 167.A H 2.969 2.171 ASN 171.A N PRO 168.A O ASN 171.A H 3.045 2.191 ASN 171.A ND2 GLU 120.A OE2 ASN 171.A HD21 2.913 2.136 ILE 173.A N ASN 171.A OD1 ILE 173.A H 2.795 2.122 ARG 174.A N ASN 171.A OD1 ARG 174.A H 3.281 2.491 ARG 174.A NH1 MET 167.A O ARG 174.A HH11 2.795 2.118 LEU 175.A N ASN 171.A O LEU 175.A H 2.891 2.063 GLY 176.A N PRO 172.A O GLY 176.A H 2.855 2.027 LEU 177.A N ILE 173.A O LEU 177.A H 2.889 2.041 ALA 178.A N ARG 174.A O ALA 178.A H 3.007 2.177 LEU 179.A N LEU 175.A O LEU 179.A H 2.866 2.019 ASN 180.A N GLY 176.A O ASN 180.A H 3.000 2.189 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD1 ASN 180.A HD22 2.915 2.070 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD2 ASN 180.A HD22 3.352 2.698 PHE 181.A N LEU 177.A O PHE 181.A H 2.841 1.997 SER 182.A N ALA 178.A O SER 182.A H 2.876 2.041 SER 182.A OG ALA 195.A O SER 182.A HG 2.758 2.090 VAL 183.A N LEU 179.A O VAL 183.A H 3.090 2.286 PHE 184.A N ASN 180.A O PHE 184.A H 2.836 2.009 HIS 185.A N PHE 181.A O HIS 185.A H 2.940 2.133 TYR 186.A N SER 182.A O TYR 186.A H 3.051 2.260 GLU 187.A N VAL 183.A O GLU 187.A H 2.799 1.953 ILE 188.A N PHE 184.A O ILE 188.A H 2.924 2.111 ALA 189.A N PHE 184.A O ALA 189.A H 3.010 2.210 SER 191.A N HIS 185.A O SER 191.A H 2.795 1.950 ALA 195.A N SER 191.A O ALA 195.A H 3.027 2.201 ILE 196.A N PRO 192.A O ILE 196.A H 2.922 2.108 SER 197.A N GLU 193.A O SER 197.A H 2.899 2.047 LEU 198.A N GLU 194.A O LEU 198.A H 2.888 2.047 ALA 199.A N ALA 195.A O ALA 199.A H 3.076 2.235 LYS 200.A N ILE 196.A O LYS 200.A H 2.938 2.097 LYS 200.A NZ ASP 204.A OD2 LYS 200.A HZ2 2.612 1.866 THR 201.A N SER 197.A O THR 201.A H 2.896 2.036 THR 202.A N LEU 198.A O THR 202.A H 2.942 2.099 THR 202.A OG1 LEU 198.A O THR 202.A HG1 2.691 1.943 PHE 203.A N ALA 199.A O PHE 203.A H 2.954 2.122 ASP 204.A N LYS 200.A O ASP 204.A H 2.900 2.073 GLU 205.A N THR 201.A O GLU 205.A H 2.952 2.105 ALA 206.A N THR 202.A O ALA 206.A H 2.997 2.179 MET 207.A N PHE 203.A O MET 207.A H 2.870 2.027 ALA 208.A N ASP 204.A O ALA 208.A H 3.222 2.420 ASP 209.A N ALA 206.A O ASP 209.A H 2.849 2.027 LEU 210.A N MET 207.A O LEU 210.A H 3.309 2.478 THR 212.A N ASP 209.A O THR 212.A H 3.132 2.277 THR 212.A OG1 ASP 209.A O THR 212.A HG1 2.778 1.957 LEU 213.A N LEU 210.A O LEU 213.A H 3.066 2.223 TYR 218.A N SER 214.A O TYR 218.A H 2.795 1.944 LYS 219.A N GLU 215.A O LYS 219.A H 3.083 2.281 ASP 220.A N ASP 216.A O ASP 220.A H 3.149 2.330 SER 221.A N SER 217.A O SER 221.A H 2.921 2.095 SER 221.A OG THR 170.A O SER 221.A HG 2.639 1.948 THR 222.A N TYR 218.A O THR 222.A H 2.852 2.000 THR 222.A OG1 TYR 218.A O THR 222.A HG1 2.817 2.021 THR 222.A OG1 LYS 219.A O THR 222.A HG1 3.335 2.856 LEU 223.A N LYS 219.A O LEU 223.A H 3.125 2.331 MET 225.A N SER 221.A O MET 225.A H 2.982 2.163 GLN 226.A N THR 222.A O GLN 226.A H 2.926 2.141 GLN 226.A NE2 ASP 230.A OD1 GLN 226.A HE21 2.865 2.045 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 3.063 2.248 ARG 229.A N MET 225.A O ARG 229.A H 2.948 2.130 ASP 230.A N GLN 226.A O ASP 230.A H 2.799 2.003 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 2.980 2.148 LEU 232.A N LEU 228.A O LEU 232.A H 2.973 2.123 THR 233.A N ARG 229.A O THR 233.A H 2.840 2.023 THR 233.A OG1 ARG 229.A O THR 233.A HG1 3.078 2.314 LEU 234.A N ASP 230.A O LEU 234.A H 2.981 2.196 TRP 235.A N ASN 231.A O TRP 235.A H 3.001 2.400 TRP 235.A N LEU 232.A O TRP 235.A H 3.194 2.469 THR 236.A OG1 LEU 232.A O THR 236.A HG1 2.597 1.776