Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8byg_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N GLY 1.A O GLY 4.A H 2.980 2.138 MET 6.A N MET 3.A O MET 6.A H 3.095 2.252 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH12 3.470 2.828 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE2 ARG 8.A HH12 2.876 2.036 ARG 8.A NH2 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH22 2.787 1.938 LEU 11.A N GLU 7.A O LEU 11.A H 2.961 2.143 ILE 12.A N ARG 8.A O ILE 12.A H 3.024 2.196 GLN 13.A N ALA 9.A O GLN 13.A H 2.928 2.106 LYS 14.A N SER 10.A O LYS 14.A H 2.848 2.020 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.846 2.018 LYS 16.A N ILE 12.A O LYS 16.A H 3.136 2.344 LEU 17.A N GLN 13.A O LEU 17.A H 3.072 2.261 ALA 18.A N LYS 14.A O ALA 18.A H 2.759 1.910 GLU 19.A N ALA 15.A O GLU 19.A H 2.946 2.139 GLN 20.A N LYS 16.A O GLN 20.A H 3.106 2.313 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 2.953 2.176 GLU 22.A N GLU 19.A O GLU 22.A H 2.991 2.157 ARG 23.A N ALA 18.A O ARG 23.A H 2.750 1.896 ARG 23.A NE ASP 26.A OD2 ARG 23.A HE 2.885 2.142 ARG 23.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 23.A HH21 2.795 2.028 MET 27.A N ARG 23.A O MET 27.A H 2.905 2.069 ALA 28.A N TYR 24.A O ALA 28.A H 2.904 2.089 ALA 29.A N GLU 25.A O ALA 29.A H 3.023 2.195 PHE 30.A N ASP 26.A O PHE 30.A H 2.885 2.066 MET 31.A N MET 27.A O MET 31.A H 2.975 2.126 LYS 32.A N ALA 28.A O LYS 32.A H 2.748 1.906 LYS 32.A NZ GLU 36.A OE2 LYS 32.A HZ1 2.701 1.975 GLY 33.A N ALA 29.A O GLY 33.A H 3.034 2.190 ALA 34.A N PHE 30.A O ALA 34.A H 2.900 2.120 VAL 35.A N MET 31.A O VAL 35.A H 2.862 2.015 GLU 36.A N LYS 32.A O GLU 36.A H 2.928 2.102 LYS 37.A N ALA 34.A O LYS 37.A H 3.110 2.332 LYS 37.A NZ MET 3.A O LYS 37.A HZ3 3.440 2.770 LYS 37.A NZ MET 6.A O LYS 37.A HZ3 2.666 2.068 GLY 38.A N VAL 35.A O GLY 38.A H 2.904 2.061 SER 42.A N GLU 45.A OE1 SER 42.A H 2.831 1.990 GLU 45.A N SER 42.A OG GLU 45.A H 3.169 2.325 ARG 46.A N SER 42.A O ARG 46.A H 2.862 2.038 ARG 46.A NH1 LEU 41.A O ARG 46.A HH11 3.025 2.427 ASN 47.A N CYS 43.A O ASN 47.A H 3.171 2.377 ASN 47.A ND2 CYS 43.A O ASN 47.A HD22 2.847 1.994 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 2.914 2.130 LEU 49.A N GLU 45.A O LEU 49.A H 2.986 2.152 SER 50.A N.A ARG 46.A O SER 50.A H.A 3.003 2.181 SER 50.A N.B ARG 46.A O SER 50.A H.B 2.989 2.158 VAL 51.A N ASN 47.A O VAL 51.A H.A 2.905 2.053 ALA 52.A N LEU 48.A O ALA 52.A H 3.092 2.266 TYR 53.A N LEU 49.A O TYR 53.A H 3.187 2.333 LYS 54.A N SER 50.A O.A LYS 54.A H 2.815 1.988 LYS 54.A N SER 50.A O.B LYS 54.A H 2.831 2.004 LYS 54.A NZ TYR 135.A OH LYS 54.A HZ2 3.369 2.498 ASN 55.A N VAL 51.A O ASN 55.A H 3.106 2.292 ASN 55.A ND2 VAL 51.A O ASN 55.A HD22 2.924 2.080 VAL 56.A N ALA 52.A O VAL 56.A H 3.074 2.255 VAL 57.A N TYR 53.A O VAL 57.A H 2.891 2.037 GLY 58.A N LYS 54.A O GLY 58.A H 2.837 2.073 GLY 59.A N ASN 55.A O GLY 59.A H 3.137 2.303 GLN 60.A N VAL 56.A O GLN 60.A H 3.155 2.352 ARG 61.A N VAL 57.A O ARG 61.A H 2.750 1.909 ARG 61.A NE GLU 138.A OE1 ARG 61.A HE 2.912 2.083 ARG 61.A NH2 GLU 138.A OE2 ARG 61.A HH21 2.885 2.043 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 2.978 2.152 ALA 63.A N GLY 59.A O ALA 63.A H 2.991 2.158 TRP 64.A N GLN 60.A O TRP 64.A H 2.812 1.969 TRP 64.A NE1 GLU 94.A OE1 TRP 64.A HE1 2.919 2.069 ARG 65.A N ARG 61.A O ARG 65.A H 2.937 2.115 ARG 65.A NH2 GLU 138.A OE2 ARG 65.A HH21 3.333 2.754 VAL 66.A N ALA 62.A O VAL 66.A H 3.131 2.287 LEU 67.A N ALA 63.A O LEU 67.A H 2.960 2.128 SER 68.A N TRP 64.A O SER 68.A H 2.758 1.914 SER 69.A N ARG 65.A O SER 69.A H 3.015 2.205 ILE 70.A N VAL 66.A O ILE 70.A H 3.117 2.281 GLU 71.A N LEU 67.A O GLU 71.A H 2.843 2.008 GLN 72.A N SER 68.A O GLN 72.A H 2.851 2.026 LYS 73.A N SER 69.A O LYS 73.A H 2.992 2.145 SER 74.A N ILE 70.A O SER 74.A H 2.939 2.086 SER 74.A OG GLU 71.A O SER 74.A HG 2.968 2.176 ASN 75.A N GLU 71.A O ASN 75.A H 3.158 2.568 ASN 75.A N GLN 72.A O ASN 75.A H 3.070 2.331 GLU 76.A N LYS 73.A O GLU 76.A H 2.791 1.942 SER 79.A N GLU 76.A O SER 79.A H 3.373 2.563 SER 79.A OG LYS 73.A O SER 79.A HG 2.856 2.075 GLY 83.A N GLU 81.A OE1 GLY 83.A H 2.988 2.163 GLU 85.A N GLU 85.A OE1 GLU 85.A H 2.875 2.146 ARG 87.A NH1 GLU 91.A OE2 ARG 87.A HH11 3.290 2.462 GLU 88.A N PRO 84.A O GLU 88.A H 2.842 2.008 TYR 89.A N GLU 85.A O TYR 89.A H 2.955 2.140 ARG 90.A N VAL 86.A O ARG 90.A H 2.964 2.104 ARG 90.A NE GLU 71.A OE1 ARG 90.A HE 2.799 1.955 ARG 90.A NH1 GLU 94.A OE1 ARG 90.A HH11 2.862 2.133 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE1 ARG 90.A HH21 3.489 2.873 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE2 ARG 90.A HH21 2.965 2.104 GLU 91.A N ARG 87.A O GLU 91.A H 2.859 2.013 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.875 2.112 VAL 93.A N TYR 89.A O VAL 93.A H 2.978 2.141 GLU 94.A N ARG 90.A O GLU 94.A H 2.784 1.938 THR 95.A N GLU 91.A O THR 95.A H 2.836 2.022 THR 95.A OG1 GLU 91.A O THR 95.A HG1 2.918 2.165 GLU 96.A N LYS 92.A O GLU 96.A H 3.074 2.256 LEU 97.A N VAL 93.A O LEU 97.A H 2.906 2.062 GLN 98.A N GLU 94.A O GLN 98.A H 2.879 2.036 GLY 99.A N THR 95.A O GLY 99.A H 2.927 2.142 VAL 100.A N GLU 96.A O VAL 100.A H 3.011 2.202 CYS 101.A N LEU 97.A O CYS 101.A H 2.954 2.116 ASP 102.A N GLN 98.A O ASP 102.A H 2.821 1.977 THR 103.A N GLY 99.A O THR 103.A H 2.958 2.157 VAL 104.A N VAL 100.A O VAL 104.A H 3.011 2.181 LEU 105.A N CYS 101.A O LEU 105.A H 2.889 2.030 GLY 106.A N ASP 102.A O GLY 106.A H 2.767 1.982 LEU 107.A N THR 103.A O LEU 107.A H 2.967 2.183 LEU 108.A N VAL 104.A O LEU 108.A H 3.018 2.195 ASP 109.A N LEU 105.A O ASP 109.A H 2.959 2.180 SER 110.A N GLY 106.A O SER 110.A H 2.882 2.272 LEU 112.A N LEU 107.A O LEU 112.A H 3.340 2.487 ILE 113.A N LEU 108.A O ILE 113.A H 2.943 2.088 GLU 115.A N HIS 111.A O GLU 115.A H 3.293 2.514 ALA 116.A N ILE 113.A O ALA 116.A H 2.968 2.130 ARG 122.A N ASP 118.A O ARG 122.A H 2.836 1.976 ARG 122.A NH1 ALA 116.A O ARG 122.A HH11 3.275 2.442 ARG 122.A NH2 GLU 158.A OE2 ARG 122.A HH21 3.164 2.323 VAL 123.A N ALA 119.A O VAL 123.A H 2.826 1.974 PHE 124.A N GLU 120.A O PHE 124.A H 3.426 2.609 TYR 125.A N SER 121.A O TYR 125.A H 2.966 2.148 LEU 126.A N ARG 122.A O LEU 126.A H 2.975 2.149 LYS 127.A N VAL 123.A O LYS 127.A H 2.856 2.009 LYS 127.A NZ ASP 131.A OD2 LYS 127.A HZ2 2.812 1.977 MET 128.A N PHE 124.A O MET 128.A H 3.068 2.224 LYS 129.A N TYR 125.A O LYS 129.A H 2.894 2.095 GLY 130.A N LEU 126.A O GLY 130.A H 2.944 2.105 ASP 131.A N LYS 127.A O ASP 131.A H 2.837 2.021 TYR 132.A N MET 128.A O TYR 132.A H 2.886 2.074 TYR 133.A N LYS 129.A O TYR 133.A H 2.985 2.130 ARG 134.A N GLY 130.A O ARG 134.A H 2.838 2.057 ARG 134.A NE TYR 156.A OH ARG 134.A HE 2.907 2.050 ARG 134.A NH2 ASP 131.A OD1 ARG 134.A HH21 3.106 2.285 ARG 134.A NH2 TYR 156.A OH ARG 134.A HH21 3.522 2.855 TYR 135.A N ASP 131.A O TYR 135.A H 2.942 2.162 LEU 136.A N TYR 132.A O LEU 136.A H 3.101 2.266 ALA 137.A N TYR 133.A O ALA 137.A H 2.776 1.987 GLU 138.A N ARG 134.A O GLU 138.A H 2.937 2.231 VAL 139.A N LEU 136.A O VAL 139.A H 3.343 2.589 ALA 140.A N ALA 137.A O ALA 140.A H 3.153 2.331 LYS 145.A N GLY 142.A O LYS 145.A H 3.213 2.355 LYS 145.A NZ ALA 137.A O LYS 145.A HZ2 3.370 2.679 ILE 148.A N ASP 144.A O ILE 148.A H 2.837 2.028 ILE 149.A N LYS 145.A O ILE 149.A H 3.068 2.228 ASP 150.A N LYS 146.A O ASP 150.A H 3.019 2.216 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 3.002 2.232 ALA 152.A N ILE 148.A O ALA 152.A H 2.996 2.183 ARG 153.A N ILE 149.A O ARG 153.A H 2.939 2.091 ARG 153.A NE ASP 150.A OD1 ARG 153.A HE 2.875 2.033 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD1 ARG 153.A HH21 3.314 2.621 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD2 ARG 153.A HH21 3.333 2.487 SER 154.A N ASP 150.A O SER 154.A H 2.873 2.043 ALA 155.A N SER 151.A O ALA 155.A H 3.213 2.384 TYR 156.A N ALA 152.A O TYR 156.A H 2.967 2.109 TYR 156.A OH ASP 131.A OD1 TYR 156.A HH 2.536 1.718 GLN 157.A N ARG 153.A O GLN 157.A H 2.814 1.991 GLN 157.A NE2 GLN 157.A O GLN 157.A HE21 3.429 2.944 GLN 157.A NE2 ASP 161.A OD1 GLN 157.A HE21 2.927 2.143 GLU 158.A N SER 154.A O GLU 158.A H 3.041 2.198 ALA 159.A N ALA 155.A O ALA 159.A H 3.027 2.192 MET 160.A N TYR 156.A O MET 160.A H 2.793 1.980 ASP 161.A N GLN 157.A O ASP 161.A H 2.883 2.047 ILE 162.A N GLU 158.A O ILE 162.A H 3.127 2.285 SER 163.A N ALA 159.A O SER 163.A H 2.909 2.092 SER 163.A OG ALA 159.A O SER 163.A HG 3.265 2.785 SER 163.A OG MET 160.A O SER 163.A HG 2.872 2.084 LYS 164.A N MET 160.A O LYS 164.A H 2.874 2.051 LYS 165.A N ASP 161.A O LYS 165.A H 3.301 2.525 GLU 166.A N ILE 162.A O GLU 166.A H 2.845 2.142 MET 167.A N SER 163.A O MET 167.A H 2.952 2.144 THR 170.A OG1 ASP 209.A OD2 THR 170.A HG1 2.717 1.965 ASN 171.A N PRO 168.A O ASN 171.A H.A 3.037 2.182 ILE 173.A N ASN 171.A OD1 ILE 173.A H 2.785 2.123 ARG 174.A N ASN 171.A OD1 ARG 174.A H 3.220 2.426 ARG 174.A NH1 MET 167.A O ARG 174.A HH11 2.902 2.216 LEU 175.A N ASN 171.A O LEU 175.A H 2.875 2.049 GLY 176.A N PRO 172.A O GLY 176.A H 2.839 2.007 LEU 177.A N ILE 173.A O LEU 177.A H 2.885 2.040 ALA 178.A N ARG 174.A O ALA 178.A H 3.028 2.195 LEU 179.A N LEU 175.A O LEU 179.A H 2.880 2.037 ASN 180.A N GLY 176.A O ASN 180.A H 3.012 2.192 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD1 ASN 180.A HD22 3.024 2.192 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD2 ASN 180.A HD22 3.303 2.629 PHE 181.A N LEU 177.A O PHE 181.A H 2.853 2.010 SER 182.A N ALA 178.A O SER 182.A H 2.867 2.034 SER 182.A OG ALA 195.A O SER 182.A HG 2.739 2.053 VAL 183.A N LEU 179.A O VAL 183.A H 3.127 2.321 PHE 184.A N ASN 180.A O PHE 184.A H 2.813 1.995 HIS 185.A N PHE 181.A O HIS 185.A H 2.941 2.131 TYR 186.A N SER 182.A O TYR 186.A H 3.032 2.260 GLU 187.A N VAL 183.A O GLU 187.A H 2.770 1.924 ILE 188.A N PHE 184.A O ILE 188.A H 2.908 2.097 ALA 189.A N PHE 184.A O ALA 189.A H 2.982 2.182 SER 191.A N HIS 185.A O SER 191.A H 2.786 1.936 SER 191.A OG ALA 189.A O SER 191.A HG 3.210 2.422 ALA 195.A N SER 191.A O ALA 195.A H 3.024 2.214 ILE 196.A N PRO 192.A O ILE 196.A H 2.956 2.124 SER 197.A N GLU 193.A O SER 197.A H 2.920 2.072 LEU 198.A N GLU 194.A O LEU 198.A H 2.908 2.069 ALA 199.A N ALA 195.A O ALA 199.A H 3.123 2.299 LYS 200.A N ILE 196.A O LYS 200.A H 2.966 2.135 LYS 200.A NZ ASP 204.A OD2 LYS 200.A HZ1 2.887 2.102 THR 201.A N SER 197.A O THR 201.A H 2.947 2.088 THR 201.A OG1 SER 197.A O THR 201.A HG1 3.391 2.774 THR 202.A N LEU 198.A O THR 202.A H 2.949 2.107 THR 202.A OG1 LEU 198.A O THR 202.A HG1 2.656 1.898 PHE 203.A N ALA 199.A O PHE 203.A H 2.980 2.153 ASP 204.A N LYS 200.A O ASP 204.A H 2.930 2.091 GLU 205.A N THR 201.A O GLU 205.A H 2.984 2.141 ALA 206.A N THR 202.A O ALA 206.A H 3.048 2.242 MET 207.A N PHE 203.A O MET 207.A H 2.841 1.997 ALA 208.A N ASP 204.A O ALA 208.A H 3.181 2.383 ASP 209.A N ALA 206.A O ASP 209.A H 2.917 2.115 LEU 210.A N MET 207.A O LEU 210.A H 3.273 2.433 HIS 211.A ND1 ALA 208.A O no hydrogen 3.120 N/A THR 212.A N ASP 209.A O THR 212.A H 3.102 2.249 THR 212.A OG1 ASP 209.A O THR 212.A HG1 2.771 1.947 LEU 213.A N LEU 210.A O LEU 213.A H 3.093 2.248 TYR 218.A N SER 214.A O TYR 218.A H 2.798 1.949 LYS 219.A N GLU 215.A O LYS 219.A H 3.094 2.287 LYS 219.A NZ GLU 215.A OE1 LYS 219.A HZ2 3.534 2.824 ASP 220.A N ASP 216.A O ASP 220.A H 3.206 2.396 SER 221.A N SER 217.A O SER 221.A H 2.901 2.064 SER 221.A OG THR 170.A O SER 221.A HG 2.715 2.046 THR 222.A N TYR 218.A O THR 222.A H 2.863 2.011 THR 222.A OG1 TYR 218.A O THR 222.A HG1 2.795 1.998 THR 222.A OG1 LYS 219.A O THR 222.A HG1 3.299 2.848 LEU 223.A N LYS 219.A O LEU 223.A H 3.109 2.316 MET 225.A N SER 221.A O MET 225.A H 2.979 2.166 GLN 226.A N THR 222.A O GLN 226.A H 2.965 2.183 GLN 226.A NE2 ASP 230.A OD1 GLN 226.A HE21 2.806 1.990 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 3.049 2.231 ARG 229.A N MET 225.A O ARG 229.A H 2.910 2.099 ASP 230.A N GLN 226.A O ASP 230.A H 2.762 1.947 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 2.986 2.156 LEU 232.A N LEU 228.A O LEU 232.A H 2.974 2.126 THR 233.A N ARG 229.A O THR 233.A H 2.859 2.062 THR 233.A OG1 ARG 229.A O THR 233.A HG1 3.081 2.334 LEU 234.A N ASP 230.A O LEU 234.A H 2.939 2.163 TRP 235.A N ASN 231.A O TRP 235.A H 2.964 2.320 TRP 235.A N LEU 232.A O TRP 235.A H 3.215 2.529 THR 236.A OG1 LEU 232.A O THR 236.A HG1 2.693 1.874