Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8byy_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N GLY 1.A O GLY 4.A H 3.032 2.199 MET 6.A N MET 3.A O MET 6.A H 3.061 2.224 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH12 3.496 2.858 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE2 ARG 8.A HH12 2.936 2.088 ARG 8.A NH2 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH22 2.795 1.944 LEU 11.A N GLU 7.A O LEU 11.A H 2.939 2.137 ILE 12.A N ARG 8.A O ILE 12.A H 3.084 2.256 GLN 13.A N ALA 9.A O GLN 13.A H 2.937 2.100 LYS 14.A N SER 10.A O LYS 14.A H 2.850 2.030 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.809 1.991 LYS 16.A N ILE 12.A O LYS 16.A H 3.138 2.333 LEU 17.A N GLN 13.A O LEU 17.A H 3.062 2.256 ALA 18.A N LYS 14.A O ALA 18.A H 2.802 1.968 GLU 19.A N ALA 15.A O GLU 19.A H 2.936 2.122 GLN 20.A N LYS 16.A O GLN 20.A H 3.094 2.277 GLN 20.A NE2 LYS 16.A O GLN 20.A HE21 3.655 2.861 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 2.982 2.209 GLU 22.A N GLU 19.A O GLU 22.A H 2.942 2.102 ARG 23.A N ALA 18.A O ARG 23.A H 2.832 1.977 ARG 23.A NE ASP 26.A OD2 ARG 23.A HE 2.970 2.228 ARG 23.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 23.A HH21 2.827 2.048 MET 27.A N ARG 23.A O MET 27.A H 2.937 2.103 ALA 28.A N TYR 24.A O ALA 28.A H 2.872 2.057 ALA 29.A N GLU 25.A O ALA 29.A H 2.990 2.167 PHE 30.A N ASP 26.A O PHE 30.A H 2.865 2.031 MET 31.A N MET 27.A O MET 31.A H 2.943 2.136 LYS 32.A N ALA 28.A O LYS 32.A H 2.815 1.971 LYS 32.A NZ GLU 36.A OE2 LYS 32.A HZ3 2.696 1.812 GLY 33.A N ALA 29.A O GLY 33.A H 3.019 2.184 ALA 34.A N PHE 30.A O ALA 34.A H 2.940 2.164 VAL 35.A N MET 31.A O VAL 35.A H 2.865 2.028 GLU 36.A N LYS 32.A O GLU 36.A H 2.947 2.134 LYS 37.A N ALA 34.A O LYS 37.A H 3.116 2.331 LYS 37.A NZ MET 3.A O LYS 37.A HZ1 3.339 2.664 LYS 37.A NZ MET 6.A O LYS 37.A HZ1 2.750 2.151 GLY 38.A N VAL 35.A O GLY 38.A H 2.949 2.104 SER 42.A N GLU 45.A OE1 SER 42.A H 2.844 2.015 GLU 45.A N SER 42.A OG GLU 45.A H 3.214 2.371 ARG 46.A N SER 42.A O ARG 46.A H 2.839 2.004 ARG 46.A NH1 LEU 41.A O ARG 46.A HH11 2.954 2.354 ASN 47.A N CYS 43.A O ASN 47.A H 3.132 2.325 ASN 47.A ND2 CYS 43.A O ASN 47.A HD22 2.925 2.076 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 2.951 2.169 LEU 49.A N GLU 45.A O LEU 49.A H 2.999 2.170 SER 50.A N ARG 46.A O SER 50.A H 2.986 2.166 SER 50.A OG ASN 47.A O SER 50.A HG 3.073 2.257 VAL 51.A N ASN 47.A O VAL 51.A H 2.830 1.978 ALA 52.A N LEU 48.A O ALA 52.A H 3.054 2.221 TYR 53.A N LEU 49.A O TYR 53.A H 3.198 2.343 LYS 54.A N SER 50.A O LYS 54.A H 2.837 2.004 ASN 55.A N VAL 51.A O ASN 55.A H 3.115 2.300 VAL 56.A N ALA 52.A O VAL 56.A H 3.070 2.237 VAL 57.A N TYR 53.A O VAL 57.A H 2.835 1.977 GLY 58.A N LYS 54.A O GLY 58.A H 2.781 2.015 GLY 59.A N ASN 55.A O GLY 59.A H 3.121 2.298 GLN 60.A N VAL 56.A O GLN 60.A H 3.187 2.374 GLN 60.A NE2 GLU 96.A OE2 GLN 60.A HE21 2.867 2.018 ARG 61.A N VAL 57.A O ARG 61.A H 2.825 1.995 ARG 61.A NE GLU 138.A OE1 ARG 61.A HE 2.915 2.114 ARG 61.A NH2 GLU 138.A OE1 ARG 61.A HH21 3.562 2.919 ARG 61.A NH2 GLU 138.A OE2 ARG 61.A HH21 2.903 2.066 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 3.024 2.200 ALA 63.A N GLY 59.A O ALA 63.A H 3.022 2.191 TRP 64.A N GLN 60.A O TRP 64.A H 2.814 1.964 TRP 64.A NE1 GLU 94.A OE1 TRP 64.A HE1 2.869 2.022 ARG 65.A N ARG 61.A O ARG 65.A H 2.944 2.147 VAL 66.A N ALA 62.A O VAL 66.A H 3.148 2.318 LEU 67.A N ALA 63.A O LEU 67.A H 2.984 2.151 SER 68.A N TRP 64.A O SER 68.A H 2.761 1.909 SER 69.A N ARG 65.A O SER 69.A H 2.979 2.161 ILE 70.A N VAL 66.A O ILE 70.A H 3.054 2.233 GLU 71.A N LEU 67.A O GLU 71.A H 2.855 2.041 GLN 72.A N SER 68.A O GLN 72.A H 2.894 2.070 GLN 72.A NE2 SER 68.A O GLN 72.A HE21 3.053 2.512 GLN 72.A NE2 SER 68.A OG GLN 72.A HE21 3.305 2.523 LYS 73.A N SER 69.A O LYS 73.A H 3.114 2.286 SER 74.A N ILE 70.A O SER 74.A H 2.933 2.121 SER 74.A OG GLU 71.A O SER 74.A HG 2.678 1.850 ASN 75.A N GLN 72.A O ASN 75.A H 3.094 2.320 GLU 76.A N LYS 73.A O GLU 76.A H 3.103 2.250 SER 79.A N GLU 76.A O SER 79.A H 3.179 2.352 SER 79.A OG GLU 76.A O SER 79.A HG 2.525 1.694 GLY 83.A N GLU 81.A OE2 GLY 83.A H 2.787 2.047 GLU 85.A N GLU 85.A OE1 GLU 85.A H 2.826 2.100 GLU 88.A N PRO 84.A O GLU 88.A H 2.872 2.034 TYR 89.A N GLU 85.A O TYR 89.A H 2.923 2.101 ARG 90.A N VAL 86.A O ARG 90.A H 2.913 2.054 ARG 90.A NE GLU 71.A OE1 ARG 90.A HE 2.718 1.866 ARG 90.A NH1 GLU 91.A OE2 ARG 90.A HH12 2.810 2.129 ARG 90.A NH1 GLU 94.A OE1 ARG 90.A HH11 2.855 2.113 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE1 ARG 90.A HH21 3.433 2.817 ARG 90.A NH2 GLU 71.A OE2 ARG 90.A HH21 2.949 2.090 GLU 91.A N ARG 87.A O GLU 91.A H 2.834 1.996 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.922 2.160 VAL 93.A N TYR 89.A O VAL 93.A H 2.989 2.146 GLU 94.A N ARG 90.A O GLU 94.A H 2.802 1.963 THR 95.A N GLU 91.A O THR 95.A H 2.847 2.036 GLU 96.A N LYS 92.A O GLU 96.A H 3.079 2.262 LEU 97.A N VAL 93.A O LEU 97.A H 2.871 2.029 GLN 98.A N GLU 94.A O GLN 98.A H 2.862 2.014 GLY 99.A N THR 95.A O GLY 99.A H 2.922 2.151 VAL 100.A N GLU 96.A O VAL 100.A H 3.032 2.227 CYS 101.A N LEU 97.A O CYS 101.A H 2.953 2.107 ASP 102.A N GLN 98.A O ASP 102.A H 2.846 2.000 THR 103.A N GLY 99.A O THR 103.A H 2.896 2.092 VAL 104.A N VAL 100.A O VAL 104.A H 2.978 2.150 LEU 105.A N CYS 101.A O LEU 105.A H 2.862 2.005 GLY 106.A N ASP 102.A O GLY 106.A H 2.826 2.035 LEU 107.A N THR 103.A O LEU 107.A H 2.990 2.186 LEU 108.A N VAL 104.A O LEU 108.A H 2.978 2.161 ASP 109.A N LEU 105.A O ASP 109.A H 2.940 2.168 SER 110.A N GLY 106.A O SER 110.A H 2.839 2.226 LEU 112.A N LEU 107.A O LEU 112.A H 3.341 2.487 ILE 113.A N LEU 108.A O ILE 113.A H 2.948 2.089 LYS 114.A NZ HIS 111.A ND1 LYS 114.A HZ2 2.870 1.991 ALA 116.A N ILE 113.A O ALA 116.A H 2.948 2.102 SER 121.A N ASP 118.A O SER 121.A H 3.177 2.571 SER 121.A OG ASP 118.A O SER 121.A HG 3.010 2.196 ARG 122.A N ASP 118.A O ARG 122.A H 2.887 2.027 ARG 122.A NH1 ALA 116.A O ARG 122.A HH11 3.040 2.202 ARG 122.A NH2 GLU 158.A OE2 ARG 122.A HH21 3.217 2.382 VAL 123.A N ALA 119.A O VAL 123.A H 2.850 2.007 TYR 125.A N SER 121.A O TYR 125.A H 2.941 2.113 LEU 126.A N ARG 122.A O LEU 126.A H 2.932 2.091 LYS 127.A N VAL 123.A O LYS 127.A H 2.865 2.016 LYS 127.A NZ ASP 131.A OD2 LYS 127.A HZ1 2.873 2.022 MET 128.A N PHE 124.A O MET 128.A H 3.009 2.177 LYS 129.A N TYR 125.A O LYS 129.A H 2.883 2.093 GLY 130.A N LEU 126.A O GLY 130.A H 2.959 2.127 ASP 131.A N LYS 127.A O ASP 131.A H 2.818 1.992 TYR 132.A N MET 128.A O TYR 132.A H 2.919 2.109 TYR 133.A N LYS 129.A O TYR 133.A H 3.041 2.188 ARG 134.A N GLY 130.A O ARG 134.A H 2.818 2.022 ARG 134.A NE TYR 156.A OH ARG 134.A HE 2.899 2.045 ARG 134.A NH2 ASP 131.A OD1 ARG 134.A HH21 3.127 2.305 ARG 134.A NH2 TYR 156.A OH ARG 134.A HH21 3.504 2.837 TYR 135.A N ASP 131.A O TYR 135.A H 2.914 2.138 LEU 136.A N TYR 132.A O LEU 136.A H 3.059 2.227 ALA 137.A N TYR 133.A O ALA 137.A H 2.794 2.013 GLU 138.A N ARG 134.A O GLU 138.A H 2.979 2.271 GLU 138.A N TYR 135.A O GLU 138.A H 3.228 2.610 VAL 139.A N LEU 136.A O VAL 139.A H 3.274 2.509 ALA 140.A N ALA 137.A O ALA 140.A H 3.189 2.384 LYS 145.A N GLY 142.A O LYS 145.A H 3.116 2.263 ARG 147.A NE ASP 144.A OD1 ARG 147.A HE 3.367 2.514 ILE 148.A N ASP 144.A O ILE 148.A H 2.876 2.069 ILE 149.A N LYS 145.A O ILE 149.A H 3.003 2.155 ASP 150.A N LYS 146.A O ASP 150.A H 2.911 2.107 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 2.887 2.089 SER 151.A OG ARG 147.A O SER 151.A HG 3.177 2.406 ALA 152.A N ILE 148.A O ALA 152.A H 3.027 2.205 ARG 153.A N ILE 149.A O ARG 153.A H 2.945 2.095 ARG 153.A NE ASP 150.A OD1 ARG 153.A HE 2.754 1.913 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD1 ARG 153.A HH21 3.202 2.523 ARG 153.A NH2 ASP 150.A OD2 ARG 153.A HH21 3.246 2.395 SER 154.A N ASP 150.A O SER 154.A H 2.812 1.988 ALA 155.A N SER 151.A O ALA 155.A H 3.109 2.277 TYR 156.A N ALA 152.A O TYR 156.A H 2.968 2.110 TYR 156.A OH ASP 131.A OD1 TYR 156.A HH 2.578 1.764 GLN 157.A N ARG 153.A O GLN 157.A H 2.825 2.033 GLU 158.A N SER 154.A O GLU 158.A H 3.027 2.189 ALA 159.A N ALA 155.A O ALA 159.A H 3.020 2.167 MET 160.A N TYR 156.A O MET 160.A H 2.776 1.962 ASP 161.A N GLN 157.A O ASP 161.A H 2.886 2.055 ILE 162.A N GLU 158.A O ILE 162.A H 3.094 2.252 SER 163.A N ALA 159.A O SER 163.A H 2.924 2.105 SER 163.A OG MET 160.A O SER 163.A HG 2.927 2.094 LYS 164.A N MET 160.A O LYS 164.A H 2.919 2.103 LYS 165.A N ASP 161.A O LYS 165.A H 3.335 2.594 LYS 165.A N ILE 162.A O LYS 165.A H 3.151 2.532 LYS 165.A NZ GLU 166.A OE2 LYS 165.A HZ2 3.277 2.513 GLU 166.A N ILE 162.A O GLU 166.A H 2.883 2.191 MET 167.A N SER 163.A O MET 167.A H 2.991 2.189 THR 170.A OG1 ASP 209.A OD2 THR 170.A HG1 2.576 1.757 ASN 171.A N PRO 168.A O ASN 171.A H 3.035 2.180 ASN 171.A ND2 GLU 120.A OE2 ASN 171.A HD21 2.790 2.000 ILE 173.A N ASN 171.A OD1 ILE 173.A H 2.804 2.154 ARG 174.A N ASN 171.A OD1 ARG 174.A H 3.203 2.403 ARG 174.A NH1 MET 167.A O ARG 174.A HH11 2.828 2.146 LEU 175.A N ASN 171.A O LEU 175.A H 2.876 2.053 GLY 176.A N PRO 172.A O GLY 176.A H 2.891 2.064 LEU 177.A N ILE 173.A O LEU 177.A H 2.862 2.021 ALA 178.A N ARG 174.A O ALA 178.A H 3.021 2.181 LEU 179.A N LEU 175.A O LEU 179.A H 2.890 2.038 ASN 180.A N GLY 176.A O ASN 180.A H 2.988 2.169 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD1 ASN 180.A HD22 2.956 2.120 ASN 180.A ND2 ASP 131.A OD2 ASN 180.A HD22 3.339 2.674 PHE 181.A N LEU 177.A O PHE 181.A H 2.833 1.987 SER 182.A N ALA 178.A O SER 182.A H 2.860 2.021 VAL 183.A N LEU 179.A O VAL 183.A H 3.063 2.261 PHE 184.A N ASN 180.A O PHE 184.A H 2.818 1.987 HIS 185.A N PHE 181.A O HIS 185.A H 2.938 2.136 TYR 186.A N SER 182.A O TYR 186.A H 3.054 2.258 GLU 187.A N VAL 183.A O GLU 187.A H 2.795 1.946 ILE 188.A N PHE 184.A O ILE 188.A H 2.922 2.112 ALA 189.A N PHE 184.A O ALA 189.A H 3.009 2.225 SER 191.A N HIS 185.A O SER 191.A H 2.803 1.963 ALA 195.A N SER 191.A O ALA 195.A H 3.014 2.189 ILE 196.A N PRO 192.A O ILE 196.A H 2.924 2.106 SER 197.A N GLU 193.A O SER 197.A H 2.892 2.038 LEU 198.A N GLU 194.A O LEU 198.A H 2.906 2.060 ALA 199.A N ALA 195.A O ALA 199.A H 3.064 2.223 LYS 200.A N ILE 196.A O LYS 200.A H 2.944 2.103 LYS 200.A NZ ASP 204.A OD2 LYS 200.A HZ1 2.615 1.858 THR 201.A N SER 197.A O THR 201.A H 2.915 2.055 THR 201.A OG1 SER 197.A O THR 201.A HG1 3.328 2.720 THR 202.A N LEU 198.A O THR 202.A H 2.948 2.101 THR 202.A OG1 LEU 198.A O THR 202.A HG1 2.697 1.879 PHE 203.A N ALA 199.A O PHE 203.A H 2.971 2.144 ASP 204.A N LYS 200.A O ASP 204.A H 2.915 2.082 GLU 205.A N THR 201.A O GLU 205.A H 2.941 2.093 ALA 206.A N THR 202.A O ALA 206.A H 3.006 2.195 MET 207.A N PHE 203.A O MET 207.A H 2.874 2.032 ALA 208.A N ASP 204.A O ALA 208.A H 3.239 2.436 ASP 209.A N ALA 206.A O ASP 209.A H 2.875 2.048 LEU 210.A N MET 207.A O LEU 210.A H 3.334 2.499 THR 212.A N ASP 209.A O THR 212.A H 3.140 2.287 LEU 213.A N LEU 210.A O LEU 213.A H 3.104 2.259 SER 214.A OG SER 217.A OG SER 214.A HG 3.375 2.721 SER 217.A N SER 214.A OG SER 217.A H 3.161 2.309 TYR 218.A N SER 214.A O TYR 218.A H 2.795 1.949 LYS 219.A N GLU 215.A O LYS 219.A H 3.083 2.283 ASP 220.A N ASP 216.A O ASP 220.A H 3.185 2.372 SER 221.A N SER 217.A O SER 221.A H 2.959 2.130 SER 221.A OG THR 170.A O SER 221.A HG 2.622 1.802 THR 222.A N TYR 218.A O THR 222.A H 2.870 2.020 THR 222.A OG1 TYR 218.A O THR 222.A HG1 2.830 2.009 LEU 223.A N LYS 219.A O LEU 223.A H 3.116 2.318 MET 225.A N SER 221.A O MET 225.A H 2.965 2.139 GLN 226.A N THR 222.A O GLN 226.A H 2.943 2.166 GLN 226.A NE2 ASP 230.A OD1 GLN 226.A HE21 2.918 2.087 LEU 227.A N LEU 223.A O LEU 227.A H 3.378 2.618 LEU 228.A N ILE 224.A O LEU 228.A H 3.062 2.249 ARG 229.A N MET 225.A O ARG 229.A H 2.990 2.171 ASP 230.A N GLN 226.A O ASP 230.A H 2.796 1.987 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 2.990 2.163 LEU 232.A N LEU 228.A O LEU 232.A H 2.968 2.121 THR 233.A N ARG 229.A O THR 233.A H 2.844 2.044 THR 233.A OG1 ARG 229.A O THR 233.A HG1 3.034 2.230 LEU 234.A N ASP 230.A O LEU 234.A H 2.979 2.180 TRP 235.A N ASN 231.A O TRP 235.A H 2.975 2.351 TRP 235.A N LEU 232.A O TRP 235.A H 3.229 2.521