Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8cvu_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N.A THR 40.A OG1 LYS 1.A H3.A 2.938 2.068 LYS 1.A N.B THR 40.A OG1 LYS 1.A H3.B 2.894 2.059 LYS 1.A NZ.A GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ1.A 3.087 2.327 PHE 3.A N PHE 38.A O PHE 3.A H 2.929 2.112 GLY 4.A N GLU 7.A OE1 GLY 4.A H 3.099 2.265 ARG 5.A NH1 TRP 123.A O ARG 5.A HH11 2.901 2.057 ARG 5.A NH1 ARG 125.A O ARG 5.A HH12 2.954 2.134 ARG 5.A NH2 ARG 125.A O ARG 5.A HH22 3.239 2.513 LEU 8.A N GLY 4.A O LEU 8.A H 2.872 2.041 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 3.028 2.207 ALA 10.A N CYS 6.A O ALA 10.A H 3.003 2.168 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.088 2.281 MET 12.A N LEU 8.A O MET 12.A H 2.847 2.009 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.931 2.129 LYS 13.A NZ LEU 129.A OXT LYS 13.A HZ2 3.440 2.670 ARG 14.A N.A ALA 10.A O ARG 14.A H.A 2.967 2.139 ARG 14.A N.B ALA 10.A O ARG 14.A H.B 2.976 2.148 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 3.182 2.460 HIS 15.A ND1 ALA 11.A O HIS 15.A HD1 2.818 1.977 HIS 15.A NE2 THR 89.A OG1 no hydrogen 2.993 N/A GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 3.027 2.175 LEU 17.A N MET 12.A O LEU 17.A H 3.123 2.268 ASN 19.A N.A TYR 23.A O ASN 19.A H.A 2.864 2.249 ASN 19.A N.B TYR 23.A O ASN 19.A H.B 2.847 2.226 TYR 20.A N LEU 17.A O TYR 20.A H 3.099 2.238 GLY 22.A N ASN 19.A O.A GLY 22.A H 2.961 2.153 GLY 22.A N ASN 19.A O.B GLY 22.A H 2.991 2.182 TYR 23.A N TYR 20.A O TYR 23.A H 3.057 2.217 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 3.211 2.552 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.951 2.221 ASN 27.A ND2 SER 24.A O ASN 27.A HD22 3.499 2.721 TRP 28.A N LEU 25.A O TRP 28.A H 3.007 2.387 VAL 29.A N LEU 25.A O VAL 29.A H 3.160 2.344 CYS 30.A N GLY 26.A O CYS 30.A H 2.957 2.111 ALA 31.A N ASN 27.A O ALA 31.A H 2.989 2.159 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 3.070 2.241 LYS 33.A N VAL 29.A O LYS 33.A H 2.937 2.110 LYS 33.A NZ ASN 37.A OD1 LYS 33.A HZ1 2.681 1.842 PHE 34.A N CYS 30.A O PHE 34.A H 3.233 2.412 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.857 2.083 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 2.994 2.165 SER 36.A OG ALA 32.A O SER 36.A HG 3.050 2.239 ASN 37.A N LYS 33.A O ASN 37.A H 2.803 2.076 PHE 38.A N SER 36.A OG PHE 38.A H 3.206 2.617 ASN 39.A N SER 36.A O ASN 39.A H 3.180 2.392 THR 40.A N LYS 1.A O.A THR 40.A H 2.922 2.073 THR 40.A N LYS 1.A O.B THR 40.A H 2.890 2.043 THR 40.A OG1 LEU 84.A O THR 40.A HG1 3.264 2.702 GLN 41.A N ASN 39.A OD1 GLN 41.A H 2.969 2.122 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.309 2.463 ASN 44.A N ASP 52.A O ASN 44.A H 3.099 2.331 ASN 44.A ND2 GLN 57.A OE1 ASN 44.A HD22 2.874 2.015 ARG 45.A NE.A THR 51.A OG1 ARG 45.A HE.A 3.012 2.213 ARG 45.A NH1.B GLY 49.A O ARG 45.A HH11.B 3.042 2.351 ARG 45.A NH2.A THR 51.A OG1 ARG 45.A HH21.A 3.074 2.311 ASN 46.A N SER 50.A O ASN 46.A H 2.777 1.920 ASN 46.A ND2 SER 50.A OG ASN 46.A HD22 2.958 2.106 ASN 46.A ND2 ASP 52.A OD1 ASN 46.A HD21 3.123 2.276 GLY 49.A N ASN 46.A O GLY 49.A H 3.048 2.201 SER 50.A N ASP 48.A OD1 SER 50.A H 2.972 2.120 SER 50.A OG ASP 48.A OD1 SER 50.A HG 2.584 1.818 SER 50.A OG ASP 48.A OD2 SER 50.A HG 3.567 2.779 THR 51.A N SER 60.A OG THR 51.A H 3.063 2.235 ASP 52.A N ASN 44.A O ASP 52.A H 2.761 1.912 TYR 53.A N ILE 58.A O TYR 53.A H 2.925 2.204 TYR 53.A OH ASP 66.A OD2 TYR 53.A HH 2.642 1.843 GLY 54.A N ALA 42.A O GLY 54.A H 2.807 1.965 GLN 57.A N GLY 54.A O GLN 57.A H 3.025 2.243 GLN 57.A NE2 ALA 42.A O GLN 57.A HE22 3.115 2.485 GLN 57.A NE2 ASP 52.A O GLN 57.A HE22 3.650 3.125 GLN 57.A NE2 GLY 54.A O GLN 57.A HE21 2.972 2.113 ILE 58.A N TYR 53.A O ILE 58.A H 3.058 2.297 SER 60.A N THR 51.A O SER 60.A H 2.898 2.075 SER 60.A OG ASP 66.A OD2 SER 60.A HG 3.373 2.653 ARG 61.A N ASN 59.A OD1 ARG 61.A H 2.954 2.103 ARG 61.A NE ASP 48.A OD2 ARG 61.A HE 3.285 2.516 ARG 61.A NH1 PRO 70.A O ARG 61.A HH12 3.390 2.688 TRP 62.A N ASN 59.A O TRP 62.A H 3.384 2.547 TRP 63.A N ASN 59.A O TRP 63.A H 3.069 2.252 ASN 65.A N ILE 78.A O ASN 65.A H 2.978 2.141 ARG 68.A N.A ASP 66.A OD1 ARG 68.A H.A 3.105 2.255 ARG 68.A N.B ASP 66.A OD1 ARG 68.A H.B 3.118 2.265 ARG 68.A NH2.A GLY 49.A O ARG 68.A HH21.A 3.159 2.300 ARG 68.A NH2.B THR 51.A OG1 ARG 68.A HH21.B 3.076 2.225 THR 69.A OG1 ASP 66.A OD1 THR 69.A HG1 2.851 2.147 SER 72.A N THR 69.A O SER 72.A H 3.172 2.434 SER 72.A OG SER 60.A O no hydrogen 3.403 N/A SER 72.A OG THR 69.A O no hydrogen 2.646 N/A ARG 73.A N ARG 61.A O ARG 73.A H 3.105 2.275 LEU 75.A N TRP 62.A O LEU 75.A H 2.877 2.053 CYS 76.A N TRP 63.A O CYS 76.A H 2.999 2.180 ASN 77.A N.A ASN 74.A O ASN 77.A H.A 3.046 2.250 ASN 77.A N.B ASN 74.A O ASN 77.A H.B 3.054 2.271 ILE 78.A N ASN 74.A OD1 ILE 78.A H 3.091 2.310 CYS 80.A N ASN 65.A O CYS 80.A H 2.868 2.049 ALA 82.A N PRO 79.A O ALA 82.A H 3.015 2.225 LEU 83.A N CYS 80.A O LEU 83.A H 2.944 2.112 LEU 84.A N SER 81.A O LEU 84.A H 3.113 2.262 SER 85.A OG.A ASP 87.A O SER 85.A HG.A 2.529 1.836 ASP 87.A N SER 85.A OG.B ASP 87.A H 2.983 2.184 THR 89.A N ASP 87.A OD1 THR 89.A H 2.912 2.094 THR 89.A OG1 ASP 87.A OD1 THR 89.A HG1 2.616 1.927 VAL 92.A N ILE 88.A O VAL 92.A H 2.936 2.109 ASN 93.A N THR 89.A O ASN 93.A H 2.955 2.106 CYS 94.A N ALA 90.A O CYS 94.A H 3.068 2.236 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.878 2.048 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 2.930 2.145 LYS 97.A NZ LEU 75.A O LYS 97.A HZ1 2.664 1.885 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H 3.065 2.267 VAL 99.A N ALA 95.A O VAL 99.A H 2.929 2.083 SER 100.A N LYS 97.A O SER 100.A H 3.311 2.598 SER 100.A OG LYS 96.A O SER 100.A HG 2.790 2.114 ASP 101.A N ILE 98.A O ASP 101.A H 3.080 2.245 ASN 103.A N ASP 101.A OD1 ASN 103.A H 3.250 2.403 MET 105.A N TYR 23.A OH MET 105.A H 3.136 2.324 ASN 106.A N ASN 103.A O ASN 106.A H 3.194 2.456 ASN 106.A ND2 ASN 103.A O ASN 106.A HD22 3.149 2.385 TRP 108.A N MET 105.A O TRP 108.A H 3.027 2.190 TRP 108.A NE1 LEU 56.A O TRP 108.A HE1 2.770 2.047 ALA 110.A N GLU 35.A OE2 ALA 110.A H 3.249 2.454 TRP 111.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 111.A HE1 2.961 2.151 ARG 112.A N.A TRP 108.A O ARG 112.A H.A 3.029 2.198 ARG 112.A N.B TRP 108.A O ARG 112.A H.B 3.044 2.233 ARG 112.A NH1.A ASN 106.A O ARG 112.A HH12.A 2.786 1.982 ASN 113.A N VAL 109.A O.A ASN 113.A H 2.964 2.225 ASN 113.A N VAL 109.A O.B ASN 113.A H 2.978 2.241 ARG 114.A N ALA 110.A O ARG 114.A H 2.879 2.211 CYS 115.A N TRP 111.A O CYS 115.A H 2.966 2.157 LYS 116.A N TRP 111.A O LYS 116.A H 2.804 1.974 LYS 116.A NZ ASN 106.A OD1 LYS 116.A HZ1 3.033 2.144 THR 118.A N CYS 115.A O THR 118.A H 3.010 2.181 THR 118.A OG1 CYS 115.A O THR 118.A HG1 2.769 1.948 ALA 122.A N ASP 119.A O ALA 122.A H 3.213 2.381 TRP 123.A N VAL 120.A O TRP 123.A H 2.977 2.133 ILE 124.A N GLN 121.A O ILE 124.A H 3.139 2.310 ARG 125.A N ALA 122.A O ARG 125.A H 3.379 2.564 ARG 125.A NH2 ASP 119.A OD2 ARG 125.A HH22 3.559 2.700 CYS 127.A N ILE 124.A O CYS 127.A H 3.148 2.302 CYS 127.A SG ILE 124.A O no hydrogen 3.359 N/A CYS 127.A SG ARG 125.A O no hydrogen 4.030 N/A