Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8dod_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 5.A N SER 2.A OG GLN 5.A H 3.409 2.588 GLN 6.A N SER 2.A O GLN 6.A H 3.033 2.330 LYS 7.A N ALA 3.A O LYS 7.A H 3.030 2.247 LEU 8.A N VAL 4.A O LEU 8.A H 2.823 1.999 ALA 9.A N GLN 5.A O ALA 9.A H 2.838 2.016 ALA 10.A N GLN 6.A O ALA 10.A H 3.132 2.308 LEU 11.A N LYS 7.A O LEU 11.A H 2.898 2.047 GLU 12.A N LEU 8.A O GLU 12.A H 2.853 2.025 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.821 1.982 SER 14.A N ALA 10.A O SER 14.A H 2.847 2.010 SER 14.A OG ALA 10.A O no hydrogen 2.792 N/A SER 15.A N GLU 12.A O SER 15.A H 3.002 2.240 SER 15.A OG GLU 12.A O no hydrogen 2.639 N/A GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 3.402 2.594 GLY 17.A N SER 15.A OG GLY 17.A H 2.989 2.157 ARG 18.A N THR 238.A O ARG 18.A H 2.747 1.918 ARG 18.A NH1 GLU 38.A OE1 ARG 18.A HH12 2.897 2.188 ARG 18.A NH1 ARG 39.A O ARG 18.A HH11 3.009 2.277 ARG 18.A NH2 ARG 39.A O ARG 18.A HH22 2.897 2.125 LEU 19.A N GLU 12.A OE2 LEU 19.A H 2.793 1.937 GLY 20.A N TYR 236.A O GLY 20.A H 2.732 1.890 VAL 21.A N TYR 34.A O VAL 21.A H 2.873 2.057 ALA 22.A N VAL 234.A O ALA 22.A H 2.984 2.197 LEU 23.A N VAL 32.A O LEU 23.A H 2.803 1.961 ILE 24.A N VAL 232.A O ILE 24.A H 2.752 1.939 ASP 25.A N THR 30.A O ASP 25.A H 2.891 2.099 THR 26.A N PRO 230.A O THR 26.A H 3.178 2.350 THR 26.A OG1 PRO 230.A O no hydrogen 2.246 N/A ALA 27.A N ASP 25.A OD1 ALA 27.A H 2.983 2.341 THR 30.A N ASP 28.A OD1 THR 30.A H 2.999 2.203 THR 30.A OG1 ASP 28.A OD1 no hydrogen 2.255 N/A VAL 32.A N LEU 23.A O VAL 32.A H 3.134 2.355 TYR 34.A N VAL 21.A O TYR 34.A H 2.885 2.057 TYR 34.A OH GLU 12.A OE1 no hydrogen 2.183 N/A ARG 35.A NE GLU 12.A OE1 ARG 35.A HE 3.408 2.685 ARG 35.A NE GLU 12.A OE2 ARG 35.A HE 2.640 1.836 ARG 35.A NH1 GLU 38.A OE2 ARG 35.A HH11 2.804 1.985 ARG 35.A NH2 GLU 12.A OE1 ARG 35.A HH22 3.006 2.176 GLU 38.A N ARG 35.A O GLU 38.A H 3.076 2.225 ARG 39.A NH1 THR 133.A O ARG 39.A HH12 3.075 2.317 ARG 39.A NH1 THR 154.A OG1 ARG 39.A HH11 2.799 2.053 ARG 39.A NH2 THR 133.A O ARG 39.A HH21 3.041 2.271 PHE 40.A N THR 155.A O PHE 40.A H 2.965 2.138 MET 42.A N ASP 153.A O MET 42.A H 3.046 2.202 THR 45.A N MET 42.A O THR 45.A H 3.179 2.389 THR 45.A OG1 MET 42.A O no hydrogen 2.796 N/A THR 45.A OG1 TYR 236.A OH no hydrogen 3.078 N/A SER 46.A N CYS 43.A O SER 46.A H 3.044 2.184 SER 46.A OG CYS 43.A O no hydrogen 2.811 N/A LYS 47.A N SER 44.A O LYS 47.A H 2.935 2.093 LYS 47.A NZ SER 44.A OG LYS 47.A HZ2 2.871 2.079 LYS 47.A NZ ASN 106.A OD1 LYS 47.A HZ1 3.041 2.249 VAL 48.A N THR 45.A O VAL 48.A H 3.226 2.397 ALA 50.A N SER 46.A O ALA 50.A H 3.289 2.474 ALA 51.A N LYS 47.A O ALA 51.A H 2.872 2.015 ALA 52.A N VAL 48.A O ALA 52.A H 2.831 1.985 ALA 53.A N MET 49.A O ALA 53.A H 2.871 2.094 VAL 54.A N ALA 50.A O VAL 54.A H 3.142 2.346 LEU 55.A N ALA 51.A O LEU 55.A H 2.940 2.094 LYS 56.A N ALA 52.A O LYS 56.A H 2.880 2.088 LYS 56.A NZ GLU 59.A OE2 LYS 56.A HZ2 3.157 2.542 GLN 57.A N ALA 53.A O GLN 57.A H 3.117 2.322 GLN 57.A NE2 GLN 115.A O GLN 57.A HE21 3.501 2.651 SER 58.A N VAL 54.A O SER 58.A H 3.005 2.277 SER 58.A OG LEU 55.A O no hydrogen 2.329 N/A GLU 59.A N LYS 56.A O GLU 59.A H 3.102 2.333 THR 60.A N GLN 57.A O THR 60.A H 3.242 2.606 THR 60.A OG1 GLN 57.A O no hydrogen 3.202 N/A GLN 61.A N GLN 57.A O GLN 61.A H 2.934 2.075 LYS 62.A NZ GLU 59.A O LYS 62.A HZ3 2.925 2.284 LEU 64.A N GLN 61.A O LEU 64.A H 3.212 2.371 ASN 66.A N GLN 63.A O ASN 66.A H 2.862 2.105 GLN 67.A N LEU 64.A O GLN 67.A H 2.959 2.106 VAL 69.A N MET 91.A O VAL 69.A H 2.686 1.916 ILE 71.A N GLY 89.A O ILE 71.A H 3.045 2.193 LYS 72.A N ASP 75.A OD2 LYS 72.A H 2.935 2.078 ASP 75.A N LYS 72.A O ASP 75.A H 2.869 2.047 LEU 76.A N PRO 73.A O LEU 76.A H 3.154 2.307 VAL 77.A N ASN 80.A OD1 VAL 77.A H 3.162 2.413 VAL 77.A N THR 107.A OG1 VAL 77.A H 3.376 2.621 ASN 78.A N ASN 78.A OD1 ASN 78.A H 2.695 2.074 ASN 80.A ND2 VAL 77.A O ASN 80.A HD22 2.796 1.967 ILE 82.A N ASP 105.A OD2 ILE 82.A H 2.858 2.103 ALA 83.A N ASP 105.A OD2 ALA 83.A H 2.809 1.972 GLU 84.A N ASN 80.A O GLU 84.A H 2.942 2.105 LYS 85.A N ILE 82.A O LYS 85.A H 3.126 2.307 HIS 86.A N ALA 83.A O no hydrogen 2.910 N/A ASN 88.A N ILE 71.A O ASN 88.A H 2.661 1.913 GLY 89.A N HIS 86.A O GLY 89.A H 2.795 2.043 MET 91.A N VAL 69.A O MET 91.A H 2.888 2.059 THR 92.A N GLU 95.A OE2 THR 92.A H 2.971 2.135 LEU 93.A N GLN 67.A O LEU 93.A H 3.215 2.583 ALA 94.A N LEU 65.A O ALA 94.A H 2.879 2.071 GLU 95.A N THR 92.A OG1 GLU 95.A H 2.998 2.142 LEU 96.A N THR 92.A O LEU 96.A H 2.720 1.897 SER 97.A N LEU 93.A O SER 97.A H 2.893 2.099 SER 97.A OG LEU 93.A O no hydrogen 2.798 N/A ALA 98.A N ALA 94.A O ALA 98.A H 2.852 2.003 ALA 99.A N GLU 95.A O ALA 99.A H 2.822 2.001 ALA 100.A N LEU 96.A O ALA 100.A H 2.912 2.073 LEU 101.A N SER 97.A O LEU 101.A H 2.926 2.076 GLN 102.A N ALA 98.A O GLN 102.A H 2.758 1.920 GLN 102.A NE2 TRP 184.A O GLN 102.A HE22 2.931 2.071 TYR 103.A N ALA 99.A O TYR 103.A H 3.038 2.261 ASP 105.A N ALA 99.A O ASP 105.A H 3.160 2.321 ASN 106.A N TYR 79.A O ASN 106.A H 2.923 2.073 ASN 106.A ND2 ASN 78.A OD1 ASN 106.A HD22 2.844 1.993 THR 107.A OG1 ASP 75.A O no hydrogen 3.362 N/A THR 107.A OG1 ASN 80.A OD1 no hydrogen 2.762 N/A ALA 108.A N ASP 105.A OD1 ALA 108.A H 2.882 2.065 MET 109.A N ASP 105.A O MET 109.A H 3.160 2.345 ASN 110.A N ASN 106.A O ASN 110.A H 3.008 2.192 ASN 110.A ND2 GLU 140.A O ASN 110.A HD21 2.999 2.138 LYS 111.A N THR 107.A O LYS 111.A H 3.021 2.263 LYS 111.A NZ GLU 70.A O LYS 111.A HZ1 3.009 2.444 LEU 112.A N ALA 108.A O LEU 112.A H 3.063 2.270 ILE 113.A N MET 109.A O ILE 113.A H 2.873 2.042 ALA 114.A N ASN 110.A O ALA 114.A H 2.973 2.161 GLN 115.A N LYS 111.A O GLN 115.A H 2.995 2.181 GLN 115.A NE2 GLN 57.A OE1 GLN 115.A HE22 2.913 2.067 LEU 116.A N LEU 112.A O LEU 116.A H 3.137 2.457 LEU 116.A N ILE 113.A O LEU 116.A H 3.025 2.340 GLY 117.A N ALA 114.A O GLY 117.A H 3.084 2.247 GLY 118.A N ILE 113.A O GLY 118.A H 2.968 2.113 GLY 121.A N GLY 118.A O GLY 121.A H 2.842 2.091 VAL 122.A N PRO 119.A O VAL 122.A H 2.975 2.312 THR 123.A N PRO 119.A O THR 123.A H 3.103 2.269 THR 123.A OG1 PRO 119.A O no hydrogen 3.410 N/A THR 123.A OG1 LEU 136.A O no hydrogen 3.048 N/A ALA 124.A N GLY 120.A O ALA 124.A H 2.900 2.151 PHE 125.A N GLY 121.A O PHE 125.A H 3.373 2.629 PHE 125.A N VAL 122.A O PHE 125.A H 3.112 2.508 ALA 126.A N VAL 122.A O ALA 126.A H 3.179 2.361 ARG 127.A N THR 123.A O ARG 127.A H 2.969 2.137 ARG 127.A NH1 ASP 131.A O ARG 127.A HH11 2.756 2.027 ARG 127.A NH1 PHE 134.A O ARG 127.A HH12 2.835 2.113 ARG 127.A NH2 PHE 134.A O ARG 127.A HH21 2.838 2.116 ALA 128.A N ALA 124.A O ALA 128.A H 2.938 2.185 ILE 129.A N PHE 125.A O ILE 129.A H 3.001 2.367 ILE 129.A N ALA 126.A O ILE 129.A H 3.177 2.453 GLY 130.A N ARG 127.A O GLY 130.A H 3.202 2.362 ASP 131.A N ALA 126.A O ASP 131.A H 2.773 1.985 THR 133.A N ASP 131.A OD1 THR 133.A H 2.911 2.092 PHE 134.A N ASP 131.A OD1 PHE 134.A H 2.901 2.050 ARG 135.A N THR 154.A O ARG 135.A H 3.143 2.342 ARG 135.A NE ASP 137.A OD2 ARG 135.A HE 2.850 2.025 ARG 135.A NH2 ASP 137.A OD1 ARG 135.A HH22 2.925 2.099 ARG 135.A NH2 ASP 137.A OD2 ARG 135.A HH22 3.446 2.808 LEU 136.A N THR 123.A OG1 LEU 136.A H 3.024 2.176 ASP 137.A N ASP 153.A OD1 ASP 137.A H 2.712 1.852 ARG 138.A N ASP 153.A OD1 ARG 138.A H 3.099 2.304 ARG 138.A NE ASP 153.A OD2 ARG 138.A HE 2.770 2.003 ARG 138.A NH1 THR 145.A OG1 ARG 138.A HH12 2.861 2.138 ARG 138.A NH2 THR 145.A OG1 ARG 138.A HH21 3.110 2.465 ARG 138.A NH2 ASP 153.A OD2 ARG 138.A HH22 2.782 2.035 GLU 140.A N ASN 110.A OD1 GLU 140.A H 2.870 2.052 THR 142.A OG1 THR 139.A O no hydrogen 3.409 N/A LEU 143.A N THR 139.A O LEU 143.A H 3.012 2.268 ASN 144.A N PRO 141.A O ASN 144.A H 3.093 2.242 ASN 144.A ND2 GLU 140.A OE1 ASN 144.A HD21 3.443 2.609 ASN 144.A ND2 GLU 140.A OE2 ASN 144.A HD21 2.604 1.998 ASN 144.A ND2 PRO 141.A O ASN 144.A HD22 3.105 2.338 THR 145.A N THR 142.A O THR 145.A H 3.365 2.604 THR 145.A OG1 THR 142.A O no hydrogen 3.380 N/A ASP 150.A N ILE 147.A O ASP 150.A H 3.124 2.281 ARG 152.A N ASP 150.A OD1 ARG 152.A H 3.075 2.223 ARG 152.A NE ASP 150.A OD1 ARG 152.A HE 3.250 2.444 ARG 152.A NE ASP 150.A OD2 ARG 152.A HE 3.059 2.303 ARG 152.A NH2 ASP 150.A OD2 ARG 152.A HH22 2.975 2.206 ASP 153.A N ASP 137.A OD2 ASP 153.A H 2.989 2.228 THR 154.A OG1 PRO 151.A O no hydrogen 2.533 N/A THR 155.A N PHE 40.A O THR 155.A H 3.187 2.446 ARG 158.A N GLY 36.A O ARG 158.A H 2.940 2.090 ARG 158.A NE ASP 37.A OD1 ARG 158.A HE 2.500 1.650 ARG 158.A NH2 ASP 37.A OD1 ARG 158.A HH22 3.306 2.724 ARG 158.A NH2 ASP 37.A OD2 ARG 158.A HH22 2.668 1.867 ALA 159.A N THR 156.A OG1 ALA 159.A H 3.168 2.317 MET 160.A N THR 156.A O MET 160.A H 3.057 2.223 ALA 161.A N PRO 157.A O ALA 161.A H 3.058 2.236 GLN 162.A N ARG 158.A O GLN 162.A H 3.108 2.251 THR 163.A N ALA 159.A O THR 163.A H 2.938 2.105 THR 163.A OG1 ASP 131.A OD2 no hydrogen 2.650 N/A THR 163.A OG1 ALA 159.A O no hydrogen 3.198 N/A LEU 164.A N MET 160.A O LEU 164.A H 2.818 1.968 ARG 165.A N ALA 161.A O ARG 165.A H 3.002 2.150 ARG 165.A NH1 ASN 29.A OD1 ARG 165.A HH11 2.888 2.177 ARG 165.A NH2 ASN 29.A OD1 ARG 165.A HH21 2.668 1.877 GLN 166.A N GLN 162.A O GLN 166.A H 3.169 2.349 LEU 167.A N THR 163.A O LEU 167.A H 3.050 2.287 THR 168.A N LEU 164.A O THR 168.A H 2.977 2.197 THR 168.A OG1 LEU 164.A O no hydrogen 2.829 N/A LEU 169.A N ARG 165.A O LEU 169.A H 2.767 1.930 GLY 170.A N ARG 165.A O GLY 170.A H 2.887 2.072 ALA 172.A N GLN 166.A O ALA 172.A H 3.275 2.478 GLY 174.A N GLU 59.A OE2 GLY 174.A H 2.760 1.920 GLN 177.A NE2 SER 58.A OG GLN 177.A HE22 3.365 2.649 ARG 178.A N GLY 174.A O ARG 178.A H 2.704 1.861 ARG 178.A NH1 GLY 170.A O ARG 178.A HH11 3.255 2.481 ALA 179.A N GLU 175.A O ALA 179.A H 2.986 2.164 GLN 180.A N THR 176.A O GLN 180.A H 3.059 2.269 LEU 181.A N GLN 177.A O LEU 181.A H 2.913 2.071 VAL 182.A N ARG 178.A O VAL 182.A H 2.910 2.076 THR 183.A N ALA 179.A O THR 183.A H 2.831 1.977 THR 183.A OG1 ALA 179.A O no hydrogen 3.293 N/A TRP 184.A N GLN 180.A O TRP 184.A H 2.820 1.975 LEU 185.A N LEU 181.A O LEU 185.A H 2.816 2.011 LYS 186.A N VAL 182.A O LYS 186.A H 2.866 2.035 GLY 187.A N THR 183.A O GLY 187.A H 3.227 2.472 GLY 187.A N TRP 184.A O GLY 187.A H 3.135 2.487 ASN 188.A N LEU 185.A O ASN 188.A H 3.241 2.393 ASN 188.A ND2 THR 190.A OG1 ASN 188.A HD21 3.076 2.337 ASN 188.A ND2 ASP 207.A OD1 ASN 188.A HD22 3.059 2.200 ASN 188.A ND2 ASP 207.A OD2 ASN 188.A HD22 3.215 2.612 THR 189.A N GLN 102.A O THR 189.A H 3.038 2.201 THR 189.A OG1 GLN 102.A O no hydrogen 2.619 N/A THR 190.A N ASN 188.A OD1 THR 190.A H 3.269 2.426 THR 190.A OG1 ASN 188.A OD1 no hydrogen 3.102 N/A THR 190.A OG1 THR 209.A OG1 no hydrogen 2.653 N/A SER 194.A N GLY 191.A O SER 194.A H 3.085 2.230 ILE 195.A N ASP 219.A OD2 ILE 195.A H 2.944 2.116 ARG 196.A NE ASP 207.A OD1 ARG 196.A HE 2.789 1.987 ARG 196.A NH1 LYS 186.A O ARG 196.A HH11 3.354 2.567 ARG 196.A NH1 ASP 207.A OD1 ARG 196.A HH12 3.048 2.350 ALA 197.A N SER 194.A O ALA 197.A H 3.024 2.295 GLY 198.A N ILE 195.A O GLY 198.A H 2.850 2.010 TRP 203.A N PRO 200.A O TRP 203.A H 3.072 2.252 THR 204.A N TRP 224.A O THR 204.A H 3.113 2.282 GLY 206.A N VAL 222.A O GLY 206.A H 2.925 2.091 ASP 207.A N LEU 185.A O ASP 207.A H 3.150 2.383 LYS 208.A N ILE 220.A O LYS 208.A H 2.915 2.128 LYS 208.A NZ SER 44.A OG LYS 208.A HZ1 2.778 2.060 LYS 208.A NZ THR 209.A O LYS 208.A HZ3 2.947 2.083 THR 209.A OG1 THR 190.A OG1 no hydrogen 2.653 N/A GLY 210.A N ASN 218.A O GLY 210.A H 2.877 2.104 GLY 212.A N THR 216.A O GLY 212.A H 2.957 2.226 ASP 213.A N ASN 144.A O ASP 213.A H 3.162 2.347 TYR 214.A N GLN 242.A O TYR 214.A H 2.815 1.987 THR 216.A N GLY 212.A O THR 216.A H 3.153 2.502 THR 216.A N ASP 213.A O THR 216.A H 3.174 2.387 THR 216.A OG1 ASP 213.A O no hydrogen 2.552 N/A THR 216.A OG1 THR 238.A OG1 no hydrogen 2.904 N/A THR 217.A N PHE 237.A O THR 217.A H 2.804 1.990 THR 217.A OG1 GLY 215.A O no hydrogen 2.846 N/A ASN 218.A N GLY 210.A O ASN 218.A H 2.700 1.875 ASN 218.A ND2 PRO 41.A O ASN 218.A HD21 2.929 2.191 ASN 218.A ND2 MET 42.A O ASN 218.A HD22 2.929 2.210 ASP 219.A N THR 235.A O ASP 219.A H 2.922 2.159 ILE 220.A N LYS 208.A O ILE 220.A H 2.965 2.167 ALA 221.A N LEU 233.A O ALA 221.A H 2.740 1.959 VAL 222.A N GLY 206.A O VAL 222.A H 2.869 2.071 ILE 223.A N LEU 231.A O ILE 223.A H 2.773 1.948 TRP 224.A N THR 204.A O TRP 224.A H 2.854 2.000 GLN 226.A NE2 SER 202.A O GLN 226.A HE21 3.371 2.841 LEU 231.A N ILE 223.A O LEU 231.A H 2.603 1.788 VAL 232.A N ILE 24.A O VAL 232.A H 2.940 2.127 LEU 233.A N ALA 221.A O LEU 233.A H 2.887 2.052 VAL 234.A N ALA 22.A O VAL 234.A H 2.848 2.017 THR 235.A N ASP 219.A O THR 235.A H 2.826 1.971 THR 235.A OG1 ASP 219.A O no hydrogen 3.367 N/A TYR 236.A N GLY 20.A O TYR 236.A H 2.720 1.872 TYR 236.A OH THR 45.A OG1 no hydrogen 3.078 N/A PHE 237.A N ASN 218.A OD1 PHE 237.A H 3.267 2.501 THR 238.A N ARG 18.A O THR 238.A H 3.053 2.268 THR 238.A OG1 TYR 214.A O no hydrogen 3.351 N/A THR 238.A OG1 THR 216.A OG1 no hydrogen 2.904 N/A GLN 239.A N TYR 214.A O GLN 239.A H 2.838 2.120 GLN 239.A NE2 GLY 215.A O GLN 239.A HE22 2.973 2.151 GLN 239.A NE2 GLU 245.A O GLN 239.A HE21 2.757 1.980 ALA 244.A N GLN 241.A O ALA 244.A H 2.964 2.126 ARG 247.A N THR 217.A OG1 ARG 247.A H 3.007 2.166 ARG 247.A NE ASP 249.A OD1 ARG 247.A HE 2.872 2.020 ARG 247.A NH1 SER 15.A O ARG 247.A HH12 3.397 2.773 ARG 247.A NH2 ASP 249.A OD2 ARG 247.A HH22 2.869 2.018 VAL 250.A N ARG 247.A O VAL 250.A H 3.021 2.272 ALA 252.A N ARG 248.A O ALA 252.A H 3.047 2.215 SER 253.A N ASP 249.A O SER 253.A H 2.853 2.046 SER 253.A OG ASP 249.A O no hydrogen 2.889 N/A ALA 254.A N VAL 250.A O ALA 254.A H 2.739 1.907 ALA 255.A N LEU 251.A O ALA 255.A H 2.970 2.170 ARG 256.A N ALA 252.A O ARG 256.A H 2.975 2.145 ILE 257.A N SER 253.A O ILE 257.A H 3.040 2.191 ILE 258.A N ALA 254.A O ILE 258.A H 2.941 2.097 ALA 259.A N ALA 255.A O ALA 259.A H 2.739 1.916 GLU 260.A N ARG 256.A O GLU 260.A H 2.786 2.009 GLY 261.A N ILE 257.A O GLY 261.A H 3.079 2.417 LEU 262.A N ALA 259.A O LEU 262.A H 3.375 2.522