Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8du5_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): PHE 2.A N ASP 1.A OD1 PHE 2.A H 2.765 2.073 SER 3.A OG ASP 1.A OD2 SER 3.A HG 3.118 2.386 VAL 5.A N PHE 2.A O VAL 5.A H 3.103 2.249 GLN 6.A N VAL 362.A O GLN 6.A H 2.950 2.223 LEU 8.A N SER 361.A O LEU 8.A H 3.122 2.463 THR 10.A N LYS 359.A O THR 10.A H 3.002 2.215 GLN 13.A N MET 357.A O GLN 13.A H 2.804 1.988 LEU 15.A N ILE 355.A O LEU 15.A H 3.259 2.603 SER 18.A N GLU 353.A O SER 18.A H 2.674 1.927 SER 18.A OG THR 352.A O SER 18.A HG 2.733 2.007 GLY 19.A N ASP 26.A O GLY 19.A H 2.545 1.766 GLN 21.A NE2 ASP 26.A OD2 GLN 21.A HE22 3.276 2.511 ILE 22.A N VAL 25.A O ILE 22.A H 2.740 1.916 VAL 25.A N ILE 22.A O VAL 25.A H 2.959 2.141 THR 27.A N ARG 48.A O THR 27.A H 2.841 2.106 PHE 28.A N SER 18.A OG PHE 28.A H 3.260 2.411 ARG 29.A N GLU 46.A O ARG 29.A H 3.039 2.230 ARG 29.A NH2 GLU 345.A OE1 ARG 29.A HH21 3.344 2.696 ILE 30.A N GLU 345.A OE2 ILE 30.A H 3.195 2.397 LEU 32.A N PHE 44.A O LEU 32.A H 2.839 1.979 THR 34.A N LEU 42.A O THR 34.A H 3.032 2.203 THR 36.A N THR 40.A O THR 36.A H 2.765 1.913 THR 36.A OG1 ASP 128.A OD2 THR 36.A HG1 2.914 2.193 GLY 39.A N THR 36.A O GLY 39.A H 3.364 2.514 THR 40.A N THR 36.A OG1 THR 40.A H 2.822 2.155 THR 40.A OG1 ASP 128.A OD2 THR 40.A HG1 3.382 2.720 LEU 41.A N SER 65.A O LEU 41.A H 2.898 2.042 LEU 42.A N THR 34.A O LEU 42.A H 2.993 2.133 ALA 43.A N ARG 63.A O ALA 43.A H 2.873 2.042 PHE 44.A N LEU 32.A O PHE 44.A H 2.631 1.777 ALA 45.A N ALA 61.A O ALA 45.A H 2.908 2.122 GLU 46.A N ARG 29.A O GLU 46.A H 2.960 2.143 ALA 47.A N PHE 59.A O ALA 47.A H 2.995 2.182 ARG 48.A N THR 27.A O ARG 48.A H 2.976 2.197 ARG 48.A NE GLU 46.A OE2 ARG 48.A HE 2.591 1.756 ARG 48.A NH2 GLU 46.A OE2 ARG 48.A HH21 3.016 2.344 LYS 50.A N ASP 26.A OD1 LYS 50.A H 2.625 1.810 SER 53.A OG SER 51.A O SER 53.A HG 3.148 2.358 ALA 57.A N LEU 88.A O ALA 57.A H 2.955 2.189 LYS 58.A N ALA 47.A O LYS 58.A H 3.128 2.432 LYS 58.A NZ SER 24.A O LYS 58.A HZ2 2.855 2.043 ILE 60.A N VAL 79.A O ILE 60.A H 3.141 2.317 ALA 61.A N ALA 45.A O ALA 61.A H 2.706 1.870 MET 62.A N ALA 76.A O MET 62.A H 2.769 2.031 ARG 63.A N ALA 43.A O ARG 63.A H 2.888 2.091 ARG 63.A NE SER 73.A O ARG 63.A HE 2.440 1.628 ARG 63.A NH1 LEU 15.A O ARG 63.A HH11 2.602 1.837 ARG 63.A NH2 SER 73.A O ARG 63.A HH21 2.939 2.313 ARG 64.A N SER 73.A OG ARG 64.A H 2.824 2.028 ARG 64.A NE ASP 128.A O ARG 64.A HE 2.796 2.151 SER 65.A N LEU 41.A O SER 65.A H 2.886 2.053 SER 65.A OG ASP 67.A OD1 SER 65.A HG 2.762 2.163 SER 65.A OG THR 71.A O SER 65.A HG 2.674 2.066 ASP 67.A N ASP 67.A OD1 ASP 67.A H 2.624 2.005 GLY 69.A N SER 65.A OG GLY 69.A H 2.853 2.134 THR 71.A N ASP 67.A OD1 THR 71.A H 3.004 2.152 SER 73.A N ARG 64.A O SER 73.A H 2.832 2.072 ALA 76.A N MET 62.A O ALA 76.A H 3.229 2.454 ASP 80.A N ASP 80.A OD1 ASP 80.A H 2.724 2.125 LEU 88.A N ALA 57.A O LEU 88.A H 2.597 1.844 ASN 89.A N THR 107.A O ASN 89.A H 2.951 2.206 ASN 89.A ND2 GLU 55.A O ASN 89.A HD21 3.031 2.374 LEU 90.A N GLU 46.A OE1 LEU 90.A H 3.156 2.346 ALA 92.A N ILE 105.A O ALA 92.A H 3.249 2.444 VAL 94.A N PHE 103.A O VAL 94.A H 2.927 2.077 ASP 96.A N ILE 101.A O ASP 96.A H 3.085 2.231 VAL 97.A N GLN 156.A OE1 VAL 97.A H 3.295 2.472 ASP 98.A N ASP 96.A OD1 ASP 98.A H 3.016 2.347 GLY 100.A N ASP 96.A O GLY 100.A H 2.940 2.166 ILE 101.A N THR 99.A OG1 ILE 101.A H 2.870 2.045 VAL 102.A N SER 125.A O VAL 102.A H 3.142 2.308 PHE 103.A N VAL 94.A O PHE 103.A H 2.769 1.964 LEU 104.A N VAL 123.A O LEU 104.A H 2.811 1.960 ILE 105.A N ALA 92.A O ILE 105.A H 2.996 2.138 TYR 106.A N MET 121.A O TYR 106.A H 3.126 2.406 THR 107.A N ASN 89.A O THR 107.A H 3.091 2.235 THR 107.A OG1 PHE 147.A O THR 107.A HG1 3.234 2.717 LEU 108.A N SER 119.A O LEU 108.A H 3.007 2.363 LYS 112.A N CYS 109.A O LYS 112.A H 3.029 2.275 SER 119.A N LEU 108.A O SER 119.A H 2.985 2.138 SER 119.A OG LEU 108.A O SER 119.A HG 3.092 2.261 THR 120.A N SER 139.A OG THR 120.A H 2.566 1.744 MET 121.A N TYR 106.A O MET 121.A H 2.769 1.926 LEU 122.A N ARG 136.A O LEU 122.A H 3.050 2.342 VAL 123.A N LEU 104.A O VAL 123.A H 3.007 2.193 TRP 124.A N SER 133.A OG TRP 124.A H 2.843 1.992 SER 125.A N VAL 102.A O SER 125.A H 3.003 2.279 SER 125.A OG SER 131.A O SER 125.A HG 2.590 1.963 GLY 129.A N SER 125.A OG GLY 129.A H 2.955 2.180 SER 131.A N ASP 127.A OD1 SER 131.A H 2.761 1.939 SER 131.A OG ASP 127.A OD2 SER 131.A HG 2.567 1.779 SER 133.A N TRP 124.A O SER 133.A H 2.822 1.982 ARG 136.A N LEU 122.A O ARG 136.A H 2.996 2.341 ARG 136.A NH1 ALA 189.A O ARG 136.A HH12 3.118 2.413 ARG 136.A NH2 ALA 189.A O ARG 136.A HH22 2.795 1.984 LEU 138.A N THR 120.A O LEU 138.A H 2.921 2.307 SER 139.A N ASN 137.A OD1 SER 139.A H 3.127 2.449 SER 139.A OG GLY 143.A O SER 139.A HG 3.555 2.944 ASP 141.A N LEU 138.A O ASP 141.A H 2.854 2.166 ILE 142.A N LEU 138.A O ILE 142.A H 3.066 2.296 GLY 143.A N SER 139.A O GLY 143.A H 2.608 1.855 ALA 148.A N HIS 171.A O ALA 148.A H 3.299 2.450 GLY 150.A N CYS 169.A O GLY 150.A H 2.917 2.087 GLY 152.A N GLY 91.A O GLY 152.A H 3.198 2.428 GLY 154.A N VAL 93.A O GLY 154.A H 2.728 2.011 ILE 155.A N ILE 167.A O ILE 155.A H 3.149 2.431 GLN 156.A NE2 GLY 164.A O GLN 156.A HE21 3.490 2.669 LYS 157.A N ARG 165.A O LYS 157.A H 3.216 2.459 LYS 157.A NZ PRO 161.A O LYS 157.A HZ3 2.776 2.046 LYS 157.A NZ GLU 220.A OE2 LYS 157.A HZ1 2.967 2.166 LYS 157.A NZ GLY 224.A O LYS 157.A HZ2 3.093 2.389 GLN 158.A N GLU 220.A OE1 GLN 158.A H 3.201 2.380 GLN 158.A NE2 GLN 156.A OE1 GLN 158.A HE22 3.164 2.704 ARG 159.A NH1 PRO 222.A O ARG 159.A HH11 3.148 2.313 GLY 164.A N LYS 157.A O GLY 164.A H 2.974 2.126 ARG 165.A N GLY 162.A O ARG 165.A H 3.354 2.516 LEU 166.A N SER 184.A O LEU 166.A H 2.887 2.057 ILE 167.A N ILE 155.A O ILE 167.A H 2.950 2.112 VAL 168.A N LEU 182.A O VAL 168.A H 2.898 2.062 HIS 171.A N ALA 148.A O HIS 171.A H 3.145 2.525 GLY 172.A N GLY 178.A O GLY 172.A H 2.920 2.170 ARG 176.A N THR 173.A O ARG 176.A H 2.914 2.296 ARG 176.A NH1 GLU 145.A OE1 ARG 176.A HH11 3.376 2.630 VAL 179.A N VAL 197.A O VAL 179.A H 3.061 2.361 LEU 182.A N VAL 168.A O LEU 182.A H 2.637 1.818 LEU 183.A N HIS 192.A O LEU 183.A H 3.028 2.272 SER 184.A OG ASP 186.A OD1 SER 184.A HG 2.789 2.066 SER 184.A OG SER 190.A O SER 184.A HG 3.292 2.670 HIS 187.A ND1 ASP 96.A OD2 no hydrogen 2.552 N/A GLY 188.A N SER 184.A OG GLY 188.A H 2.918 2.101 ALA 189.A N ASP 186.A O ALA 189.A H 3.327 2.536 ALA 189.A N ASP 186.A OD1 ALA 189.A H 3.089 2.488 SER 190.A N ASP 186.A OD1 SER 190.A H 2.953 2.105 HIS 192.A N LEU 183.A O HIS 192.A H 2.899 2.093 THR 195.A N ASP 251.A O THR 195.A H 2.648 1.914 SER 198.A OG ASP 177.A O SER 198.A HG 3.567 2.983 GLY 199.A N ASP 177.A O GLY 199.A H 3.206 2.422 GLN 204.A N PRO 201.A O GLN 204.A H 3.210 2.475 LYS 206.A NZ GLY 199.A O LYS 206.A HZ1 3.007 2.239 HIS 207.A N ASP 210.A OD2 HIS 207.A H 2.926 2.164 HIS 209.A N ASN 234.A O HIS 209.A H 2.929 2.139 GLN 217.A N ASN 229.A O GLN 217.A H 2.940 2.141 TYR 219.A N ILE 227.A O TYR 219.A H 2.802 1.973 LEU 221.A N SER 225.A O LEU 221.A H 3.086 2.296 GLY 224.A N LEU 221.A O GLY 224.A H 3.251 2.395 SER 225.A N ASP 223.A OD1 SER 225.A H 2.640 1.838 SER 225.A OG ASP 223.A OD1 SER 225.A HG 2.692 1.896 VAL 226.A N SER 246.A O VAL 226.A H 2.792 1.942 ILE 227.A N TYR 219.A O ILE 227.A H 2.781 2.026 ILE 228.A N LEU 244.A O ILE 228.A H 2.604 1.748 ASN 229.A N GLN 217.A O ASN 229.A H 3.440 2.583 ALA 230.A N ILE 242.A O ALA 230.A H 2.877 2.074 ARG 231.A N ASP 214.A O ARG 231.A H 2.626 1.826 ARG 231.A NH1 GLU 215.A OE1 ARG 231.A HH11 2.633 1.811 ASN 232.A ND2 TYR 236.A O ASN 232.A HD21 3.042 2.486 GLN 233.A N ASN 212.A O GLN 233.A H 3.205 2.356 GLN 233.A NE2 GLN 233.A O GLN 233.A HE21 3.170 2.681 ASN 234.A N ASN 232.A OD1 ASN 234.A H 3.265 2.601 ASN 234.A ND2 HIS 207.A O ASN 234.A HD22 2.691 2.171 ASN 235.A N ASN 232.A O ASN 235.A H 3.439 2.594 TYR 236.A N ASN 232.A OD1 TYR 236.A H 2.945 2.136 CYS 238.A N TYR 236.A O CYS 238.A H 2.451 1.731 CYS 240.A N CYS 238.A O CYS 240.A H 2.622 1.884 ARG 241.A N LEU 264.A O ARG 241.A H 3.405 2.624 ARG 241.A NE ASN 229.A OD1 ARG 241.A HE 2.423 1.617 ARG 241.A NH1 ASP 266.A OD1 ARG 241.A HH11 3.336 2.524 ARG 241.A NH1 VAL 269.A O ARG 241.A HH12 2.698 2.028 ARG 241.A NH2 GLU 215.A O ARG 241.A HH22 3.379 2.703 ARG 241.A NH2 ASN 229.A O ARG 241.A HH21 3.473 2.642 ILE 242.A N ALA 230.A O ILE 242.A H 3.062 2.299 VAL 243.A N THR 259.A O VAL 243.A H 2.752 1.905 LEU 244.A N ILE 228.A O LEU 244.A H 2.690 1.873 ARG 245.A NH2 ASP 223.A OD2 ARG 245.A HH21 3.049 2.299 SER 246.A N VAL 226.A O SER 246.A H 2.939 2.188 SER 246.A OG THR 252.A O SER 246.A HG 2.722 2.083 THR 252.A N ASP 248.A OD1 THR 252.A H 3.326 2.471 THR 252.A N ASP 248.A OD2 THR 252.A H 2.560 1.942 THR 252.A OG1 ASP 248.A OD2 THR 252.A HG1 2.446 1.649 ASP 257.A N ARG 254.A O ASP 257.A H 3.117 2.449 VAL 258.A N PRO 255.A O VAL 258.A H 3.256 2.437 THR 259.A N VAL 243.A O THR 259.A H 2.909 2.077 GLU 263.A N ASP 261.A OD1 GLU 263.A H 3.174 2.539 VAL 265.A N GLU 263.A O VAL 265.A H 2.924 2.274 ASP 266.A N ARG 239.A O ASP 266.A H 3.158 2.316 VAL 269.A N ASP 266.A OD2 VAL 269.A H 3.008 2.202 GLY 272.A N SER 284.A O GLY 272.A H 3.121 2.278 LEU 274.A N PHE 282.A O LEU 274.A H 3.227 2.422 THR 276.A N ILE 280.A O THR 276.A H 2.864 2.026 SER 277.A N GLU 328.A OE2 SER 277.A H 3.092 2.274 SER 277.A OG GLU 328.A OE1 SER 277.A HG 2.596 1.922 SER 277.A OG GLU 328.A OE2 SER 277.A HG 3.569 2.767 GLY 279.A N THR 276.A O GLY 279.A H 3.400 2.577 ILE 280.A N THR 276.A OG1 ILE 280.A H 3.003 2.233 VAL 281.A N SER 300.A O VAL 281.A H 3.086 2.283 PHE 282.A N LEU 274.A O PHE 282.A H 2.978 2.149 PHE 283.A N ARG 298.A O PHE 283.A H 2.877 2.137 SER 284.A N GLY 272.A O SER 284.A H 3.021 2.172 SER 284.A OG SER 322.A OG SER 284.A HG 3.425 2.759 ASN 285.A N THR 296.A O ASN 285.A H 3.322 2.525 ASN 285.A ND2 VAL 265.A O ASN 285.A HD21 2.647 1.995 ALA 287.A N ASN 294.A O ALA 287.A H 3.032 2.186 HIS 288.A N PRO 286.A O HIS 288.A H 2.936 2.228 GLU 290.A N HIS 288.A ND1 GLU 290.A H 3.084 2.251 PHE 291.A N HIS 288.A ND1 PHE 291.A H 3.085 2.249 ARG 292.A NH2 VAL 268.A O ARG 292.A HH21 3.228 2.421 ASN 294.A N PRO 316.A O ASN 294.A H 3.278 2.549 ASN 294.A ND2 ALA 287.A O ASN 294.A HD21 3.487 2.897 LEU 295.A N SER 319.A OG LEU 295.A H 3.365 2.621 THR 296.A N ASN 285.A O THR 296.A H 2.949 2.129 THR 296.A OG1 ASN 294.A O THR 296.A HG1 2.951 2.135 LEU 297.A N VAL 312.A O LEU 297.A H 2.795 1.947 ARG 298.A N PHE 283.A O ARG 298.A H 2.863 2.050 SER 300.A N VAL 281.A O SER 300.A H 2.896 2.155 SER 300.A OG SER 306.A O SER 300.A HG 2.693 1.909 SER 302.A N SER 300.A OG SER 302.A H 3.172 2.441 SER 302.A OG SER 306.A O SER 302.A HG 2.495 1.874 GLY 304.A N SER 300.A OG GLY 304.A H 2.995 2.195 THR 305.A N SER 302.A O THR 305.A H 3.198 2.347 SER 306.A N SER 302.A OG SER 306.A H 2.596 1.752 TRP 307.A NE1 ASP 261.A OD2 TRP 307.A HE1 2.691 2.000 GLN 308.A N TRP 299.A O GLN 308.A H 2.943 2.136 GLU 310.A N GLU 310.A OE1 GLU 310.A H 2.605 1.802 ARG 311.A NH2 GLU 263.A OE2 ARG 311.A HH21 2.918 2.077 VAL 312.A N LEU 297.A O VAL 312.A H 2.999 2.216 GLN 313.A NE2 ASN 294.A OD1 GLN 313.A HE21 2.810 2.169 TRP 315.A N LEU 295.A O TRP 315.A H 3.369 2.541 TRP 315.A NE1 GLY 347.A O TRP 315.A HE1 3.010 2.235 SER 319.A N ARG 292.A O SER 319.A H 3.143 2.330 SER 319.A OG GLY 317.A O SER 319.A HG 2.857 2.188 GLY 320.A N GLU 345.A O GLY 320.A H 2.908 2.239 TYR 321.A N GLU 345.A OE1 TYR 321.A H 2.538 1.682 TYR 321.A OH GLU 215.A OE2 TYR 321.A HH 3.106 2.339 SER 322.A OG SER 284.A O SER 322.A HG 2.961 2.449 SER 322.A OG SER 284.A OG SER 322.A HG 3.425 2.842 SER 323.A N LEU 343.A O SER 323.A H 2.890 2.098 THR 325.A N PHE 341.A O THR 325.A H 3.327 2.489 LEU 327.A N GLN 339.A O LEU 327.A H 3.199 2.373 SER 330.A N GLY 333.A O SER 330.A H 3.142 2.535 THR 331.A OG1 ARG 38.A O THR 331.A HG1 3.549 2.720 LYS 335.A N ASN 329.A OD1 LYS 335.A H 2.641 2.027 GLN 339.A N LEU 327.A O GLN 339.A H 3.323 2.468 GLN 339.A NE2 PRO 337.A O GLN 339.A HE21 3.331 2.610 LEU 340.A N ILE 360.A O LEU 340.A H 2.816 1.968 PHE 341.A N THR 325.A O PHE 341.A H 2.962 2.132 VAL 342.A N VAL 358.A O VAL 342.A H 2.842 2.041 LEU 343.A N SER 323.A O LEU 343.A H 3.165 2.328 TYR 344.A N SER 356.A O TYR 344.A H 2.991 2.177 TYR 344.A OH GLU 12.A OE2 TYR 344.A HH 2.311 1.640 GLU 345.A N TYR 321.A O GLU 345.A H 3.084 2.413 LYS 346.A N SER 354.A O LYS 346.A H 3.264 2.504 LYS 346.A NZ GLU 12.A OE2 LYS 346.A HZ2 2.836 2.104 GLY 347.A N PRO 318.A O GLY 347.A H 3.256 2.567 LEU 348.A N GLU 353.A OE1 LEU 348.A H 2.898 2.104 ASN 349.A N GLU 353.A OE2 ASN 349.A H 3.097 2.310 GLU 353.A N ARG 350.A O GLU 353.A H 3.064 2.205 SER 354.A N LYS 346.A O SER 354.A H 2.949 2.270 ILE 355.A N TRP 16.A O ILE 355.A H 3.113 2.286 SER 356.A N TYR 344.A O SER 356.A H 2.867 2.037 SER 356.A OG GLU 12.A OE2 SER 356.A HG 2.970 2.172 MET 357.A N GLN 13.A O MET 357.A H 2.603 1.745 VAL 358.A N VAL 342.A O VAL 358.A H 2.769 2.022 LYS 359.A N MET 11.A O LYS 359.A H 2.874 2.037 LYS 359.A NZ GLN 68.A OE1 LYS 359.A HZ1 2.873 2.045 ILE 360.A N LEU 340.A O ILE 360.A H 2.773 1.989 SER 361.A N LEU 8.A O SER 361.A H 2.714 2.034 SER 361.A OG THR 365.A O SER 361.A HG 2.455 1.661 VAL 362.A N PRO 338.A O VAL 362.A H 3.002 2.169 GLY 364.A N SER 361.A O GLY 364.A H 3.016 2.227