Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8dvy_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): PHE 7.A N PRO 3.A O PHE 7.A H 2.811 1.962 GLN 8.A N ALA 4.A O GLN 8.A H 2.641 1.818 GLN 8.A NE2 ILE 171.A O GLN 8.A HE21 2.856 2.285 ARG 9.A N ARG 5.A O ARG 9.A H 2.941 2.191 ASP 10.A N GLU 6.A O ASP 10.A H 3.084 2.279 LEU 11.A N PHE 7.A O LEU 11.A H 3.080 2.293 LEU 12.A N GLN 8.A O LEU 12.A H 2.932 2.073 ASP 13.A N ARG 9.A O ASP 13.A H 3.204 2.368 PHE 15.A N LEU 11.A O PHE 15.A H 2.777 1.975 ALA 16.A N LEU 12.A O ALA 16.A H 3.093 2.247 ARG 17.A N ASP 13.A O ARG 17.A H 2.988 2.204 GLU 18.A N TRP 14.A O GLU 18.A H 2.815 2.040 ARG 19.A N PHE 15.A O ARG 19.A H 2.819 2.118 ARG 19.A NH2 GLU 182.A OE1 ARG 19.A HH21 3.502 2.751 ARG 20.A N GLU 186.A OE2 ARG 20.A H 3.145 2.318 ARG 20.A NE GLU 186.A OE2 ARG 20.A HE 3.070 2.283 ARG 20.A NH2 GLU 186.A OE1 ARG 20.A HH21 3.219 2.388 LEU 22.A N ARG 20.A O LEU 22.A H 2.983 2.338 ARG 25.A N LEU 22.A O ARG 25.A H 2.991 2.157 ARG 25.A NE GLU 182.A OE2 ARG 25.A HE 3.265 2.571 ARG 25.A NH1 ARG 20.A O ARG 25.A HH11 3.163 2.338 ARG 25.A NH1 GLU 186.A OE1 ARG 25.A HH12 3.166 2.477 ARG 25.A NH1 GLU 186.A OE2 ARG 25.A HH12 3.278 2.429 ARG 25.A NH2 GLU 186.A OE1 ARG 25.A HH22 2.760 1.936 LYS 26.A N PRO 23.A O LYS 26.A H 3.323 2.473 ASP 29.A N ASP 27.A OD1 ASP 29.A H 2.755 1.903 TYR 31.A N ASP 29.A OD1 TYR 31.A H 3.030 2.260 TYR 31.A OH PHE 59.A O TYR 31.A HH 2.671 1.834 VAL 33.A N ASP 29.A O VAL 33.A H 3.019 2.165 TRP 34.A N PRO 30.A O TRP 34.A H 2.784 1.967 VAL 35.A N TYR 31.A O VAL 35.A H 2.916 2.084 SER 36.A N LYS 32.A O SER 36.A H 2.972 2.125 SER 36.A OG LYS 32.A O SER 36.A HG 3.394 2.810 SER 36.A OG VAL 33.A O SER 36.A HG 2.862 2.141 GLU 37.A N VAL 33.A O GLU 37.A H 2.825 1.992 VAL 38.A N TRP 34.A O VAL 38.A H 3.086 2.270 MET 39.A N VAL 35.A O MET 39.A H 2.927 2.083 LEU 40.A N SER 36.A O LEU 40.A H 2.943 2.204 GLN 41.A N VAL 38.A O GLN 41.A H 3.123 2.293 THR 43.A N LEU 40.A O THR 43.A H 3.351 2.498 THR 43.A OG1 GLN 41.A O THR 43.A HG1 2.965 2.131 THR 47.A N ARG 44.A O THR 47.A H 3.108 2.499 VAL 48.A N ARG 44.A O VAL 48.A H 2.997 2.262 ILE 49.A N VAL 45.A O ILE 49.A H 3.012 2.251 TYR 51.A OH GLU 78.A O TYR 51.A HH 2.953 2.150 PHE 52.A N VAL 48.A O PHE 52.A H 2.904 2.068 GLU 53.A N ILE 49.A O GLU 53.A H 3.300 2.482 GLN 54.A N PRO 50.A O GLN 54.A H 3.100 2.247 PHE 55.A N TYR 51.A O PHE 55.A H 2.874 2.047 ILE 56.A N PHE 52.A O ILE 56.A H 2.843 2.009 ASP 57.A N GLU 53.A O ASP 57.A H 2.939 2.153 ARG 58.A N GLN 54.A O ARG 58.A H 2.867 2.048 ARG 58.A NH2 GLU 72.A OE2 ARG 58.A HH21 3.221 2.387 PHE 59.A N PHE 55.A O PHE 59.A H 2.732 1.958 ALA 64.A N THR 61.A OG1 ALA 64.A H 3.290 2.459 LEU 65.A N THR 61.A O LEU 65.A H 3.244 2.411 ALA 66.A N LEU 62.A O ALA 66.A H 3.103 2.291 ASP 67.A N GLU 63.A O ASP 67.A H 2.767 1.928 ALA 68.A N LEU 65.A O ALA 68.A H 3.148 2.306 ASP 71.A N ASP 69.A OD2 ASP 71.A H 3.360 2.540 GLU 72.A N ASP 69.A O GLU 72.A H 2.937 2.342 VAL 73.A N ASP 69.A O VAL 73.A H 3.287 2.494 LEU 74.A N GLU 70.A O LEU 74.A H 3.184 2.353 LYS 75.A N ASP 71.A O LYS 75.A H 3.070 2.246 LYS 75.A NZ GLU 78.A OE1 LYS 75.A HZ2 2.955 2.271 LYS 75.A NZ GLU 78.A OE2 LYS 75.A HZ2 3.408 2.536 LYS 75.A NZ TYR 333.A O LYS 75.A HZ3 3.078 2.468 ALA 76.A N GLU 72.A O ALA 76.A H 3.247 2.471 TRP 77.A N VAL 73.A O TRP 77.A H 3.112 2.432 TRP 77.A N LEU 74.A O TRP 77.A H 3.100 2.452 TRP 77.A NE1 GLY 81.A O TRP 77.A HE1 3.126 2.373 GLU 78.A N LYS 75.A O GLU 78.A H 3.101 2.263 GLY 79.A N TYR 83.A OH GLY 79.A H 3.062 2.288 LEU 80.A N TRP 77.A O LEU 80.A H 2.964 2.109 ARG 85.A N TYR 82.A O ARG 85.A H 3.169 2.339 ARG 85.A NE TYR 82.A O ARG 85.A HE 3.063 2.221 ARG 85.A NH1 VAL 38.A O ARG 85.A HH11 2.879 2.189 ARG 85.A NH1 MET 39.A O ARG 85.A HH12 2.980 2.250 ARG 85.A NH1 THR 43.A OG1 ARG 85.A HH12 3.398 2.790 ARG 85.A NH2 GLY 81.A O ARG 85.A HH21 2.709 1.854 VAL 86.A N TYR 83.A O VAL 86.A H 3.052 2.321 ARG 87.A N TYR 83.A O ARG 87.A H 3.270 2.441 ASN 88.A N SER 84.A O ASN 88.A H 2.882 2.043 LEU 89.A N ARG 85.A O LEU 89.A H 3.019 2.212 HIS 90.A N VAL 86.A O HIS 90.A H 2.899 2.062 ALA 91.A N ARG 87.A O ALA 91.A H 3.079 2.220 ALA 92.A N ASN 88.A O ALA 92.A H 2.694 1.872 VAL 93.A N LEU 89.A O VAL 93.A H 2.684 1.853 LYS 94.A N HIS 90.A O LYS 94.A H 2.806 1.961 LYS 94.A NZ ALA 66.A O LYS 94.A HZ3 3.040 2.275 GLU 95.A N ALA 91.A O GLU 95.A H 2.876 2.048 VAL 96.A N ALA 92.A O VAL 96.A H 3.060 2.293 LYS 97.A N VAL 93.A O LYS 97.A H 3.036 2.248 LYS 97.A NZ ASP 67.A OD1 LYS 97.A HZ2 3.016 2.306 THR 98.A N LYS 94.A O THR 98.A H 2.812 1.979 ARG 99.A N GLU 95.A O ARG 99.A H 2.590 1.785 ARG 99.A NH1 TYR 100.A OH ARG 99.A HH11 3.081 2.253 TYR 100.A N VAL 96.A O TYR 100.A H 2.966 2.335 GLY 101.A N LYS 97.A O GLY 101.A H 3.029 2.341 GLY 102.A N VAL 96.A O GLY 102.A H 2.849 1.993 LYS 103.A N TYR 100.A O LYS 103.A H 3.395 2.538 ASP 106.A N ASP 106.A OD1 ASP 106.A H 2.674 2.010 GLU 110.A N ASP 107.A OD2 GLU 110.A H 2.765 2.071 PHE 111.A N ASP 107.A O PHE 111.A H 2.758 1.919 SER 112.A N PRO 108.A O SER 112.A H 2.812 1.951 SER 112.A OG VAL 117.A O no hydrogen 3.486 N/A ARG 113.A N GLU 110.A O ARG 113.A H 3.350 2.579 LEU 114.A N PHE 111.A O LEU 114.A H 2.831 1.973 VAL 117.A N LEU 114.A O VAL 117.A H 3.206 2.377 TYR 120.A OH GLU 37.A OE1 TYR 120.A HH 2.621 1.993 VAL 122.A N GLY 118.A O VAL 122.A H 3.063 2.211 GLY 123.A N PRO 119.A O GLY 123.A H 3.379 2.529 ALA 124.A N TYR 120.A O ALA 124.A H 2.811 1.977 VAL 125.A N THR 121.A O VAL 125.A H 2.981 2.125 LEU 126.A N VAL 122.A O LEU 126.A H 3.001 2.160 SER 127.A N GLY 123.A O SER 127.A H 2.946 2.119 SER 127.A OG GLY 123.A O SER 127.A HG 2.609 1.897 SER 127.A OG ALA 124.A O SER 127.A HG 3.502 2.872 LEU 128.A N ALA 124.A O LEU 128.A H 3.214 2.421 ALA 129.A N VAL 125.A O ALA 129.A H 2.902 2.049 TYR 130.A N LEU 126.A O TYR 130.A H 3.224 2.470 TYR 130.A OH VAL 104.A O TYR 130.A HH 2.768 2.141 VAL 132.A N LEU 126.A O VAL 132.A H 2.929 2.220 GLU 134.A N VAL 132.A O GLU 134.A H 2.909 2.188 VAL 141.A N ASP 138.A OD1 VAL 141.A H 2.714 1.868 MET 142.A N ASP 138.A O MET 142.A H 2.949 2.103 ARG 143.A N GLY 139.A O ARG 143.A H 2.983 2.204 ARG 143.A NE CYS 192.A O ARG 143.A HE 2.883 2.043 ARG 143.A NH2 GLY 188.A O ARG 143.A HH21 2.995 2.330 ARG 143.A NH2 CYS 192.A O ARG 143.A HH21 3.250 2.540 VAL 144.A N SER 140.A O VAL 144.A H 2.930 2.128 LEU 145.A N VAL 141.A O LEU 145.A H 2.755 1.907 SER 146.A N MET 142.A O SER 146.A H 2.926 2.123 SER 146.A OG ARG 143.A O SER 146.A HG 2.972 2.152 ARG 147.A N ARG 143.A O ARG 147.A H 3.313 2.591 ARG 147.A N VAL 144.A O ARG 147.A H 3.118 2.441 ARG 147.A NE ALA 216.A O ARG 147.A HE 2.971 2.395 ARG 147.A NH1 THR 193.A O ARG 147.A HH12 3.059 2.280 ARG 147.A NH2 THR 193.A O ARG 147.A HH22 3.182 2.441 ARG 147.A NH2 PRO 194.A O ARG 147.A HH22 3.120 2.521 ARG 147.A NH2 LEU 219.A O ARG 147.A HH21 3.448 2.699 LEU 148.A N VAL 144.A O LEU 148.A H 2.890 2.065 PHE 149.A N LEU 145.A O PHE 149.A H 3.087 2.248 VAL 151.A N SER 146.A O VAL 151.A H 3.013 2.400 ILE 155.A N VAL 221.A O ILE 155.A H 2.989 2.151 ALA 156.A N ASP 154.A OD1 ALA 156.A H 2.782 1.951 LYS 157.A N ASP 154.A O LYS 157.A H 3.142 2.413 THR 160.A N LYS 157.A O THR 160.A H 3.213 2.604 THR 160.A OG1 ASP 154.A O THR 160.A HG1 2.535 1.750 ARG 161.A NE GLU 165.A OE2 ARG 161.A HE 2.587 1.737 ARG 161.A NH2 GLU 165.A OE1 ARG 161.A HH21 3.270 2.603 ARG 161.A NH2 GLU 165.A OE2 ARG 161.A HH21 3.132 2.480 LYS 162.A N PRO 158.A O LYS 162.A H 3.003 2.262 ARG 163.A N SER 159.A O ARG 163.A H 2.945 2.181 ARG 163.A NE ASP 153.A OD2 ARG 163.A HE 3.114 2.364 ARG 163.A NH2 ASP 153.A OD2 ARG 163.A HH21 2.884 2.085 PHE 164.A N THR 160.A O PHE 164.A H 3.048 2.212 GLU 165.A N ARG 161.A O GLU 165.A H 2.900 2.067 GLN 166.A N LYS 162.A O GLN 166.A H 2.973 2.165 ILE 167.A N ARG 163.A O ILE 167.A H 2.807 2.005 VAL 168.A N PHE 164.A O VAL 168.A H 2.836 2.032 ARG 169.A N GLU 165.A O ARG 169.A H 3.158 2.352 ARG 169.A NH1 GLU 134.A OE1 ARG 169.A HH12 3.136 2.529 ARG 169.A NH1 GLU 134.A OE2 ARG 169.A HH12 3.218 2.380 ARG 169.A NH2 GLU 134.A OE1 ARG 169.A HH22 2.987 2.342 GLU 170.A N GLN 166.A O GLU 170.A H 3.305 2.622 GLU 170.A N ILE 167.A O GLU 170.A H 3.045 2.347 ILE 171.A N ILE 167.A O ILE 171.A H 3.176 2.416 MET 172.A N VAL 168.A O MET 172.A H 2.820 2.161 TYR 174.A OH ARG 169.A O TYR 174.A HH 2.589 1.753 ASN 176.A N ALA 173.A O ASN 176.A H 3.200 2.571 PHE 180.A N ASN 176.A O PHE 180.A H 3.097 2.289 ASN 181.A N PRO 177.A O ASN 181.A H 2.875 2.057 ASN 181.A ND2 SER 127.A OG ASN 181.A HD22 3.317 2.565 ASN 181.A ND2 GLU 134.A O ASN 181.A HD21 2.751 2.097 GLU 182.A N GLY 178.A O GLU 182.A H 2.896 2.048 ALA 183.A N ALA 179.A O ALA 183.A H 2.904 2.118 LEU 184.A N PHE 180.A O LEU 184.A H 3.196 2.395 ILE 185.A N ASN 181.A O ILE 185.A H 3.218 2.397 GLU 186.A N GLU 182.A O GLU 186.A H 2.724 1.888 LEU 187.A N ALA 183.A O LEU 187.A H 2.647 1.828 GLY 188.A N LEU 184.A O GLY 188.A H 2.970 2.160 ALA 189.A N ILE 185.A O ALA 189.A H 2.989 2.266 LEU 190.A N GLU 186.A O LEU 190.A H 2.953 2.178 VAL 191.A N LEU 187.A O VAL 191.A H 2.951 2.113 CYS 192.A N LEU 187.A O CYS 192.A H 2.936 2.113 THR 193.A N VAL 191.A O THR 193.A H 2.891 2.225 THR 193.A OG1 ARG 195.A O THR 193.A HG1 2.738 1.986 SER 198.A N VAL 191.A O SER 198.A H 3.163 2.334 LEU 201.A N SER 198.A O LEU 201.A H 3.209 2.595 CYS 202.A N CYS 199.A O CYS 202.A H 3.049 2.235 TYR 207.A N VAL 204.A O TYR 207.A H 3.118 2.395 CYS 208.A N GLN 205.A O CYS 208.A H 3.405 2.553 CYS 208.A SG ARG 147.A O no hydrogen 3.288 N/A GLN 209.A N LEU 148.A O GLN 209.A H 3.203 2.370 ALA 210.A N ARG 147.A O ALA 210.A H 3.083 2.303 ALA 212.A N CYS 208.A O ALA 212.A H 3.372 2.513 GLU 213.A N GLN 209.A O GLU 213.A H 3.140 2.359 GLY 214.A N ALA 210.A O GLY 214.A H 2.708 2.082 GLY 214.A N PHE 211.A O GLY 214.A H 3.032 2.393 VAL 215.A N ALA 210.A O VAL 215.A H 2.989 2.158 GLU 218.A N VAL 215.A O GLU 218.A H 2.861 2.039 LEU 219.A N ALA 216.A O LEU 219.A H 3.210 2.355 LYS 229.A NZ HIS 300.A O LYS 229.A HZ2 3.547 2.675 GLN 230.A NE2 GLU 295.A OE2 GLN 230.A HE22 3.438 2.792 GLN 230.A NE2 GLN 304.A OE1 GLN 230.A HE21 2.961 2.191 VAL 231.A N VAL 302.A O VAL 231.A H 2.921 2.068 LEU 233.A N GLN 304.A O LEU 233.A H 2.868 2.042 ALA 234.A N CYS 265.A O ALA 234.A H 2.892 2.047 VAL 235.A N THR 306.A O VAL 235.A H 2.931 2.111 ALA 236.A N PRO 263.A O ALA 236.A H 2.863 2.034 VAL 237.A N PHE 308.A O VAL 237.A H 3.247 2.448 ALA 239.A N GLY 310.A O ALA 239.A H 3.313 2.494 ASP 240.A N ARG 244.A O ASP 240.A H 3.142 2.398 GLY 243.A N ASP 240.A O GLY 243.A H 3.243 2.398 ARG 244.A N ASP 240.A OD1 ARG 244.A H 3.251 2.513 ARG 244.A NE ASP 240.A OD2 ARG 244.A HE 2.857 2.187 VAL 245.A N ALA 325.A O VAL 245.A H 2.669 1.822 LEU 246.A N LEU 238.A O LEU 246.A H 3.153 2.385 ILE 247.A N ARG 323.A O ILE 247.A H 3.269 2.420 ARG 248.A N GLU 261.A O ARG 248.A H 2.807 1.969 ARG 248.A NE GLU 261.A OE2 ARG 248.A HE 3.373 2.547 ARG 248.A NH2 SER 264.A O ARG 248.A HH22 2.517 1.852 LYS 249.A N PRO 321.A O LYS 249.A H 3.243 2.409 LYS 249.A NZ ASP 71.A OD1 LYS 249.A HZ2 3.043 2.225 ARG 250.A N LEU 259.A O ARG 250.A H 2.935 2.076 ARG 250.A NE LEU 255.A O ARG 250.A HE 3.224 2.418 ARG 250.A NH1 GLU 261.A OE1 ARG 250.A HH11 3.162 2.398 ARG 250.A NH1 GLU 261.A OE2 ARG 250.A HH11 3.074 2.411 ARG 250.A NH2 LEU 255.A O ARG 250.A HH21 3.331 2.575 ASN 258.A N ASP 251.A O ASN 258.A H 3.057 2.307 LEU 259.A N LEU 256.A O LEU 259.A H 3.328 2.484 TRP 260.A N ALA 334.A O TRP 260.A H 2.897 2.074 GLU 261.A N ARG 248.A O GLU 261.A H 2.850 2.091 PHE 262.A N HIS 339.A ND1 PHE 262.A H 3.042 2.293 CYS 265.A N ALA 234.A O CYS 265.A H 2.952 2.210 THR 267.A N PRO 232.A O THR 267.A H 3.269 2.568 LYS 274.A N ASP 270.A O LYS 274.A H 3.248 2.422 LEU 275.A N GLY 271.A O LEU 275.A H 3.044 2.258 GLU 276.A N LYS 272.A O GLU 276.A H 3.071 2.259 GLN 277.A N GLU 273.A O GLN 277.A H 3.221 2.375 VAL 279.A N LEU 275.A O VAL 279.A H 3.226 2.447 VAL 279.A N GLU 276.A O VAL 279.A H 3.092 2.507 GLY 280.A N GLU 276.A O GLY 280.A H 3.325 2.500 GLU 281.A N GLN 277.A O GLU 281.A H 3.411 2.591 GLN 282.A N VAL 279.A O GLN 282.A H 3.295 2.556 LEU 287.A N GLU 276.A OE2 LEU 287.A H 2.796 1.938 THR 288.A N PRO 309.A O THR 288.A H 3.288 2.443 THR 288.A OG1 PRO 309.A O THR 288.A HG1 3.125 2.305 ILE 291.A N VAL 307.A O ILE 291.A H 3.118 2.349 SER 293.A OG LEU 305.A O SER 293.A HG 2.780 2.021 PHE 294.A N LEU 305.A O PHE 294.A H 3.192 2.452 HIS 296.A N TRP 303.A O HIS 296.A H 2.885 2.099 PHE 298.A N LEU 301.A O PHE 298.A H 2.742 1.927 VAL 302.A N LYS 229.A O VAL 302.A H 2.986 2.193 TRP 303.A N HIS 296.A O TRP 303.A H 2.782 2.000 GLN 304.A N VAL 231.A O GLN 304.A H 2.842 2.022 LEU 305.A N PHE 294.A O LEU 305.A H 2.812 1.994 THR 306.A N LEU 233.A O THR 306.A H 2.901 2.169 VAL 307.A N VAL 292.A O VAL 307.A H 3.365 2.517 PHE 308.A N VAL 235.A O PHE 308.A H 2.896 2.061 LEU 312.A N ALA 239.A O LEU 312.A H 3.072 2.319 HIS 314.A NE2 ASP 240.A OD2 HIS 314.A HE2 2.790 1.990 TYR 322.A N GLU 319.A O TYR 322.A H 2.988 2.161 ARG 323.A N ILE 247.A O ARG 323.A H 3.061 2.273 ARG 323.A NH1 TYR 333.A OH ARG 323.A HH11 3.068 2.237 ALA 325.A N VAL 245.A O ALA 325.A H 2.834 1.978 GLU 329.A N PRO 326.A O GLU 329.A H 3.008 2.202 LEU 330.A N GLU 327.A O LEU 330.A H 2.991 2.190 ALA 332.A N GLU 329.A O ALA 332.A H 2.977 2.130 TYR 333.A N LEU 330.A O TYR 333.A H 3.041 2.194 PHE 335.A N GLU 78.A OE2 PHE 335.A H 2.986 2.155 GLN 340.A N PRO 336.A O GLN 340.A H 2.977 2.188 GLN 340.A NE2 PHE 335.A O GLN 340.A HE21 3.019 2.197 ARG 341.A N VAL 337.A O ARG 341.A H 3.040 2.253 ARG 341.A N SER 338.A O ARG 341.A H 3.131 2.538 ARG 341.A NE GLU 345.A OE2 ARG 341.A HE 3.049 2.296 ARG 341.A NH2 GLU 345.A OE2 ARG 341.A HH21 2.848 2.049 VAL 342.A N SER 338.A O VAL 342.A H 3.028 2.231 TRP 343.A N HIS 339.A O TRP 343.A H 3.192 2.353 ARG 344.A N GLN 340.A O ARG 344.A H 3.063 2.232 ARG 344.A NH1 GLU 348.A OE1 ARG 344.A HH11 3.368 2.740 GLU 345.A N ARG 341.A O GLU 345.A H 2.808 1.957 TYR 346.A N VAL 342.A O TYR 346.A H 2.829 2.002 LYS 347.A N TRP 343.A O LYS 347.A H 2.738 1.914 GLU 348.A N ARG 344.A O GLU 348.A H 2.929 2.122 TRP 349.A N GLU 345.A O TRP 349.A H 2.862 2.045 ALA 350.A N TYR 346.A O ALA 350.A H 3.045 2.253