Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8fyo_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 1.A N TYR 25.A O ALA 1.A H1 2.833 2.049 GLN 3.A N TYR 23.A O GLN 3.A H 2.806 1.972 GLN 3.A NE2 THR 81.A O GLN 3.A HE21 2.879 2.035 ALA 6.A N SER 21.A O ALA 6.A H 2.798 2.035 TRP 8.A NE1 THR 206.A O TRP 8.A HE1 2.910 2.203 TRP 8.A NE1 ASP 207.A O TRP 8.A HE1 3.091 2.420 LEU 10.A N PRO 7.A O LEU 10.A H 2.993 2.393 ALA 11.A N PRO 7.A O ALA 11.A H 3.175 2.337 ARG 12.A N TRP 8.A O ARG 12.A H 2.775 2.014 ARG 12.A NE ASP 187.A OD1 ARG 12.A HE 2.860 2.003 ARG 12.A NE ASP 187.A OD2 ARG 12.A HE 3.349 2.699 ARG 12.A NH1 ARG 12.A O ARG 12.A HH11 3.029 2.295 ARG 12.A NH1 SER 15.A O ARG 12.A HH12 2.827 2.223 ARG 12.A NH2 ASP 187.A OD2 ARG 12.A HH21 2.777 1.930 ARG 12.A NH2 ASP 260.A OD2 ARG 12.A HH22 2.985 2.310 ILE 13.A N GLY 9.A O ILE 13.A H 3.053 2.239 SER 14.A N ALA 11.A O SER 14.A H 3.137 2.346 SER 15.A N ARG 12.A O SER 15.A H 3.294 2.453 SER 15.A OG SER 17.A O SER 15.A HG 2.740 2.319 SER 17.A N SER 15.A OG SER 17.A H 2.919 2.064 TYR 23.A N GLN 3.A O TYR 23.A H 2.874 2.086 TYR 25.A N ALA 1.A O TYR 25.A H 3.013 2.196 ASP 26.A N TYR 236.A OH ASP 26.A H 2.838 1.977 SER 28.A N ASP 26.A OD1 SER 28.A H 2.938 2.078 ALA 29.A N ASP 26.A O ALA 29.A H 2.994 2.257 GLN 31.A N SER 28.A O GLN 31.A H 2.820 1.964 SER 33.A N GLY 30.A O SER 33.A H 3.072 2.223 CYS 34.A N GLY 126.A O CYS 34.A H 2.960 2.176 CYS 34.A SG ASN 122.A O no hydrogen 3.970 N/A VAL 35.A N GLN 89.A O VAL 35.A H 2.813 1.974 TYR 36.A N VAL 128.A O TYR 36.A H 2.805 1.974 VAL 37.A N PHE 91.A O VAL 37.A H 2.832 2.010 ILE 38.A N SER 130.A O ILE 38.A H 3.114 2.260 ASP 39.A N VAL 93.A O ASP 39.A H 2.936 2.108 THR 40.A N ASP 39.A OD2 THR 40.A H 2.668 1.910 GLU 43.A N THR 71.A OG1 GLU 43.A H 2.858 2.048 HIS 46.A N GLU 43.A O HIS 46.A H 2.975 2.118 HIS 46.A NE2 SER 216.A O HIS 46.A HE2 2.799 1.953 PHE 49.A N HIS 46.A O PHE 49.A H 2.953 2.095 GLU 50.A N PRO 47.A O GLU 50.A H 2.991 2.222 ARG 52.A N PHE 49.A O ARG 52.A H 2.795 1.948 ARG 52.A NE GLU 50.A OE1 ARG 52.A HE 3.432 2.718 ARG 52.A NH1 GLY 78.A O ARG 52.A HH12 2.845 2.075 ARG 52.A NH1 THR 88.A O ARG 52.A HH11 2.875 2.054 ARG 52.A NH2 GLU 50.A OE1 ARG 52.A HH21 2.988 2.186 ARG 52.A NH2 GLY 78.A O ARG 52.A HH22 2.865 2.108 GLN 54.A N LEU 90.A O GLN 54.A H 2.955 2.198 GLN 54.A NE2 GLN 89.A OE1.B GLN 54.A HE22 3.339 2.721 VAL 56.A N GLY 92.A O VAL 56.A H 2.849 1.990 LYS 57.A N GLY 92.A O LYS 57.A H 3.374 2.609 THR 58.A OG1 SER 62.A O THR 58.A HG1 2.696 1.861 TYR 59.A N LYS 94.A O TYR 59.A H 2.945 2.173 TYR 60.A N THR 58.A OG1 TYR 60.A H 3.096 2.253 ARG 64.A N SER 62.A OG ARG 64.A H 2.957 2.101 GLY 66.A N ASP 98.A OD1 GLY 66.A H 2.882 2.106 ASN 67.A N ASP 65.A OD1 ASN 67.A H 2.954 2.124 ASN 67.A ND2 ASP 98.A O ASN 67.A HD22 2.937 2.097 GLY 68.A N ASP 65.A OD1 GLY 68.A H 2.853 2.002 GLY 68.A N ASP 65.A OD2 GLY 68.A H 3.225 2.566 HIS 69.A N ASN 67.A OD1 HIS 69.A H 3.011 2.176 HIS 69.A ND1 ASP 39.A OD2 HIS 69.A HD1 2.676 1.818 GLY 70.A N THR 40.A OG1 GLY 70.A H 2.873 2.041 THR 71.A N ASP 65.A OD2 THR 71.A H 3.057 2.304 HIS 72.A N GLY 68.A O HIS 72.A H 2.900 2.089 HIS 72.A NE2 ARG 218.A O HIS 72.A HE2 2.913 2.249 CYS 73.A N HIS 69.A O CYS 73.A H 2.972 2.135 CYS 73.A SG ASP 39.A OD1 CYS 73.A HG 3.793 2.744 ALA 74.A N GLY 70.A O ALA 74.A H 2.876 2.020 GLY 75.A N THR 71.A O GLY 75.A H 2.930 2.145 THR 76.A N HIS 72.A O THR 76.A H 3.056 2.285 VAL 77.A N CYS 73.A O VAL 77.A H 3.048 2.247 GLY 78.A N ALA 74.A O GLY 78.A H 2.953 2.135 SER 79.A N GLY 75.A O SER 79.A H 2.967 2.118 ARG 80.A N GLU 48.A O ARG 80.A H 2.856 2.009 ARG 80.A NE THR 81.A OG1 ARG 80.A HE 3.044 2.292 ARG 80.A NH2 THR 81.A OG1 ARG 80.A HH21 2.825 2.027 THR 81.A N GLU 48.A OE1 THR 81.A H 2.730 1.870 TYR 82.A N SER 79.A OG TYR 82.A H 3.010 2.268 GLY 83.A N SER 79.A O GLY 83.A H 2.996 2.346 VAL 84.A N THR 76.A O VAL 84.A H 2.918 2.112 ALA 85.A N VAL 77.A O ALA 85.A H 2.866 2.024 LYS 86.A NZ GLN 3.A OE1 LYS 86.A HZ2 2.773 1.997 LYS 86.A NZ ARG 80.A O LYS 86.A HZ1 2.663 1.780 LYS 86.A NZ GLY 83.A O LYS 86.A HZ3 2.823 1.949 LYS 87.A N ALA 29.A O LYS 87.A H 2.763 1.937 LYS 87.A NZ GLU 27.A O LYS 87.A HZ1 3.123 2.270 THR 88.A N ALA 85.A O THR 88.A H 3.232 2.368 GLN 89.A N SER 33.A O GLN 89.A H 3.132 2.280 GLN 89.A NE2.B ARG 52.A O GLN 89.A HE22.B 2.777 2.034 LEU 90.A N ARG 52.A O LEU 90.A H 2.786 1.936 PHE 91.A N VAL 35.A O PHE 91.A H 2.918 2.097 GLY 92.A N GLN 54.A O GLY 92.A H 2.803 1.983 VAL 93.A N VAL 37.A O VAL 93.A H 3.045 2.197 LYS 94.A N LYS 57.A O LYS 94.A H 2.824 1.984 LYS 94.A NZ THR 40.A O LYS 94.A HZ3 2.862 1.993 LYS 94.A NZ LEU 96.A O LYS 94.A HZ1 2.783 1.901 LYS 94.A NZ ASP 98.A OD1 LYS 94.A HZ2 2.720 1.887 VAL 95.A N ASP 39.A O VAL 95.A H 2.893 2.245 LEU 96.A N ASP 39.A O LEU 96.A H 3.058 2.237 ASP 97.A N SER 101.A O ASP 97.A H 2.694 1.838 ASN 99.A N ASP 97.A OD1 ASN 99.A H 2.794 2.059 GLY 100.A N ASP 97.A O GLY 100.A H 2.875 2.037 SER 101.A N ASP 97.A OD1 SER 101.A H 2.984 2.126 TYR 104.A OH GLY 136.A O TYR 104.A HH 2.533 1.773 ILE 107.A N GLN 103.A O ILE 107.A H 3.043 2.225 ILE 108.A N TYR 104.A O ILE 108.A H 2.855 1.997 ALA 109.A N SER 105.A O ALA 109.A H 3.017 2.184 GLY 110.A N THR 106.A O GLY 110.A H 2.914 2.109 MET 111.A N ILE 107.A O MET 111.A H 3.007 2.206 ASP 112.A N ILE 108.A O ASP 112.A H 2.938 2.102 PHE 113.A N ALA 109.A O PHE 113.A H 2.794 1.979 VAL 114.A N GLY 110.A O VAL 114.A H 3.113 2.291 ALA 115.A N MET 111.A O ALA 115.A H 3.161 2.322 SER 116.A N ASP 112.A O SER 116.A H 3.250 2.501 SER 116.A N PHE 113.A O SER 116.A H 3.138 2.489 ASP 117.A N PHE 113.A O ASP 117.A H 2.722 1.863 LYS 118.A N VAL 114.A O LYS 118.A H 3.078 2.263 LYS 118.A NZ SER 151.A O LYS 118.A HZ2 3.176 2.568 ASN 119.A N SER 116.A O ASN 119.A H 2.988 2.196 ASN 120.A N ASP 117.A O ASN 120.A H 2.838 1.992 ARG 121.A N LYS 118.A O ARG 121.A H 3.121 2.268 ARG 121.A NE ASP 117.A OD2 ARG 121.A HE 2.804 1.957 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD1 ARG 121.A HH21 3.026 2.246 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD2 ARG 121.A HH21 3.337 2.681 LYS 125.A N GLY 32.A O LYS 125.A H 2.935 2.076 GLY 126.A N CYS 123.A O GLY 126.A H 2.897 2.079 VAL 128.A N CYS 34.A O VAL 128.A H 2.826 2.002 ALA 129.A N MET 154.A O ALA 129.A H 2.821 1.981 SER 130.A N TYR 36.A O SER 130.A H 2.794 1.969 LEU 131.A N ALA 156.A O LEU 131.A H 2.831 1.983 SER 132.A OG SER 224.A O SER 132.A HG 2.642 2.089 GLY 135.A N SER 170.A O GLY 135.A H 2.936 2.142 TYR 137.A N ASN 168.A O TYR 137.A H 2.982 2.383 VAL 141.A N SER 138.A OG VAL 141.A H 3.008 2.188 ASN 142.A N SER 138.A O ASN 142.A H 2.984 2.134 ASN 142.A ND2 SER 173.A OG ASN 142.A HD21 2.993 2.140 SER 143.A N SER 139.A O SER 143.A H 2.860 2.043 ALA 144.A N SER 140.A O ALA 144.A H 3.027 2.195 ALA 145.A N VAL 141.A O ALA 145.A H 3.059 2.232 ALA 146.A N ASN 142.A O ALA 146.A H 2.857 2.023 ARG 147.A N SER 143.A O ARG 147.A H 2.834 2.022 ARG 147.A NE ASP 112.A OD1 ARG 147.A HE 3.112 2.307 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD1 ARG 147.A HH21 3.138 2.360 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD2 ARG 147.A HH21 3.266 2.497 LEU 148.A N ALA 144.A O LEU 148.A H 2.985 2.164 GLN 149.A N ALA 145.A O GLN 149.A H 3.029 2.206 GLN 149.A NE2 ALA 245.A O GLN 149.A HE21 3.290 2.537 SER 150.A N ALA 146.A O SER 150.A H 2.873 2.020 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 2.880 2.132 SER 151.A N LEU 148.A O SER 151.A H 3.235 2.626 GLY 152.A N GLN 149.A O GLY 152.A H 2.997 2.150 MET 154.A N VAL 127.A O MET 154.A H 2.898 2.070 VAL 155.A N GLN 149.A OE1 VAL 155.A H 2.927 2.074 ALA 156.A N ALA 129.A O ALA 156.A H 2.881 2.028 VAL 157.A N CYS 178.A O VAL 157.A H 2.831 1.993 ALA 158.A N LEU 131.A O ALA 158.A H 3.049 2.251 ALA 159.A N VAL 180.A O ALA 159.A H 2.845 2.041 ASN 162.A N ASN 194.A OD1 ASN 162.A H 2.899 2.207 ASN 163.A N PHE 192.A O ASN 163.A H 2.917 2.119 ALA 164.A N ASN 194.A OD1 ALA 164.A H 2.908 2.106 ALA 166.A N TYR 195.A O ALA 166.A H 2.833 1.987 ARG 167.A N ASP 165.A OD1 ARG 167.A H 2.821 1.972 ASN 168.A N ASP 165.A O ASN 168.A H 3.416 2.557 TYR 169.A N ALA 166.A O TYR 169.A H 3.072 2.266 SER 170.A N GLY 135.A O SER 170.A H 2.893 2.092 SER 170.A OG SER 138.A O SER 170.A HG 3.290 2.519 SER 173.A N TYR 169.A O SER 173.A H 2.860 2.083 GLU 174.A N PRO 171.A O GLU 174.A H 2.978 2.120 SER 176.A N GLU 174.A OE2 SER 176.A H 3.013 2.161 CYS 178.A N VAL 155.A O CYS 178.A H 2.904 2.093 THR 179.A N ASP 200.A OD2 THR 179.A H 2.755 1.896 THR 179.A OG1 ALA 172.A O THR 179.A HG1 2.668 1.994 VAL 180.A N VAL 157.A O VAL 180.A H 2.840 2.039 GLY 181.A N ILE 201.A O GLY 181.A H 2.855 2.037 SER 183.A N GLY 203.A O SER 183.A H 2.920 2.122 ASP 184.A N ARG 188.A O ASP 184.A H 2.824 2.024 TYR 186.A N ASP 184.A OD1 TYR 186.A H 2.887 2.149 ASP 187.A N ASP 184.A O ASP 187.A H 2.858 2.058 ARG 188.A N ASP 184.A OD1 ARG 188.A H 3.006 2.164 ARG 188.A NE ASP 184.A OD2 ARG 188.A HE 2.818 1.979 ARG 188.A NH2 ASP 184.A OD2 ARG 188.A HH21 3.160 2.442 ARG 189.A N SER 262.A O ARG 189.A H 2.879 2.024 ARG 189.A NE ASN 263.A O ARG 189.A HE 2.804 1.979 ARG 189.A NH1 ASN 163.A OD1 ARG 189.A HH12 2.921 2.091 ARG 189.A NH1 SER 193.A O ARG 189.A HH11 2.809 2.132 ARG 189.A NH2 ASN 263.A O ARG 189.A HH21 3.514 2.888 SER 190.A N ALA 182.A O SER 190.A H 2.774 1.921 SER 193.A N SER 190.A O SER 193.A H 2.879 2.021 ASN 194.A N GLY 160.A O ASN 194.A H 2.826 1.987 ASN 194.A ND2 ALA 159.A O ASN 194.A HD22 2.776 1.977 ASN 194.A ND2 ASN 162.A OD1 ASN 194.A HD21 2.984 2.169 TYR 195.A N ALA 164.A O TYR 195.A H 2.973 2.173 GLY 196.A N THR 268.A OG1 GLY 196.A H 2.783 1.986 LEU 199.A N GLY 196.A O LEU 199.A H 3.130 2.301 ASP 200.A N THR 179.A O ASP 200.A H 2.905 2.065 PHE 202.A N LEU 271.A O PHE 202.A H 2.897 2.103 GLY 203.A N GLY 181.A O GLY 203.A H 2.908 2.085 GLY 205.A N SER 183.A O GLY 205.A H 2.793 1.933 THR 206.A N SER 183.A O THR 206.A H 3.231 2.510 ASP 207.A N SER 221.A OG ASP 207.A H 2.843 2.015 ILE 208.A N ILE 220.A O ILE 208.A H 2.893 2.022 SER 210.A N ARG 218.A O SER 210.A H 3.041 2.207 SER 210.A OG HIS 72.A O SER 210.A HG 2.694 1.964 TRP 212.A N SER 216.A O TRP 212.A H 2.859 2.078 GLY 214.A N GLU 43.A OE1 GLY 214.A H 2.725 1.917 GLY 215.A N GLU 43.A OE2 GLY 215.A H 2.792 1.989 SER 216.A N TRP 212.A O SER 216.A H 3.136 2.409 ARG 218.A N SER 210.A O ARG 218.A H 3.016 2.236 ILE 220.A N ILE 208.A O ILE 220.A H 3.156 2.369 GLY 222.A N GLY 205.A O GLY 222.A H 2.819 1.999 THR 223.A N ASN 161.A OD1 THR 223.A H 2.776 1.913 MET 225.A N GLY 222.A O MET 225.A H 2.910 2.078 ALA 226.A N GLY 222.A O ALA 226.A H 3.370 2.629 THR 227.A N THR 223.A O THR 227.A H 3.072 2.255 HIS 229.A N ALA 226.A O HIS 229.A H 3.013 2.358 HIS 229.A ND1 MET 225.A O HIS 229.A HD1 2.852 2.072 VAL 230.A N ALA 226.A O VAL 230.A H 3.326 2.537 ALA 231.A N THR 227.A O ALA 231.A H 2.870 2.032 GLY 232.A N PRO 228.A O GLY 232.A H 2.838 1.986 LEU 233.A N HIS 229.A O LEU 233.A H 2.902 2.067 ALA 234.A N VAL 230.A O ALA 234.A H 2.818 1.999 ALA 235.A N ALA 231.A O ALA 235.A H 3.029 2.193 TYR 236.A N GLY 232.A O TYR 236.A H 2.916 2.065 LEU 237.A N LEU 233.A O LEU 237.A H 2.859 2.026 MET 238.A N ALA 234.A O MET 238.A H 2.825 1.994 THR 239.A N ALA 235.A O THR 239.A H 2.953 2.130 THR 239.A OG1 GLN 31.A O THR 239.A HG1 2.841 2.167 LEU 240.A N TYR 236.A O LEU 240.A H 3.154 2.363 GLY 241.A N MET 238.A O GLY 241.A H 2.889 2.086 LYS 242.A N LEU 237.A O LYS 242.A H 3.046 2.260 THR 244.A N SER 247.A OG THR 244.A H 3.366 2.547 SER 247.A N THR 244.A O SER 247.A H 3.111 2.374 ARG 250.A NH2.A ASP 200.A OD1 ARG 250.A HH22.A 2.826 2.066 TYR 251.A N SER 247.A O TYR 251.A H 2.841 2.007 ILE 252.A N ALA 248.A O ILE 252.A H 2.785 1.930 ALA 253.A N CYS 249.A O ALA 253.A H 2.887 2.048 ASP 254.A N ARG 250.A O ASP 254.A H 2.746 1.943 THR 255.A N TYR 251.A O THR 255.A H 2.911 2.180 ALA 256.A N ALA 253.A O ALA 256.A H 3.352 2.497 ASN 257.A N LEU 272.A O ASN 257.A H 2.931 2.175 ASN 257.A ND2 SER 15.A O ASN 257.A HD21 2.859 2.117 GLY 259.A N ASN 270.A O GLY 259.A H 2.924 2.077 LEU 261.A N ASN 270.A OD1 LEU 261.A H 2.976 2.142 SER 262.A N ASP 187.A O SER 262.A H 2.831 2.050 THR 268.A N PRO 265.A O THR 268.A H 2.997 2.169 ASN 270.A ND2 LEU 261.A O ASN 270.A HD21 2.780 2.001 LEU 272.A N ASN 257.A O LEU 272.A H 2.898 2.104 ALA 273.A N PHE 202.A O ALA 273.A H 2.946 2.094 ASN 275.A N ILE 13.A O ASN 275.A H 2.719 1.915 ASN 275.A ND2 TYR 24.A O ASN 275.A HD21 2.876 2.057 TYR 277.A N ASN 275.A OD1 TYR 277.A H 2.940 2.143