Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8fyr_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 1.A N TYR 25.A O ALA 1.A H1 2.688 1.885 ALA 1.A N TYR 277.A OH ALA 1.A H2 3.289 2.547 GLN 3.A N TYR 23.A O GLN 3.A H 2.895 2.058 GLN 3.A NE2 THR 81.A O GLN 3.A HE21 2.742 1.989 ALA 6.A N SER 21.A O ALA 6.A H 2.809 2.062 TRP 8.A NE1 THR 206.A O TRP 8.A HE1 2.876 2.168 TRP 8.A NE1 ASP 207.A O TRP 8.A HE1 3.025 2.377 ALA 11.A N PRO 7.A O ALA 11.A H 3.173 2.338 ARG 12.A N TRP 8.A O ARG 12.A H 2.778 2.019 ARG 12.A NE ASP 187.A OD1 ARG 12.A HE 3.423 2.725 ARG 12.A NE ASP 187.A OD2 ARG 12.A HE 2.785 1.958 ARG 12.A NH1 ARG 12.A O ARG 12.A HH11 2.894 2.263 ARG 12.A NH1 SER 15.A O ARG 12.A HH12 2.770 2.091 ARG 12.A NH2 THR 16.A O ARG 12.A HH22 3.519 2.810 ARG 12.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 12.A HH21 2.967 2.150 ARG 12.A NH2 ASP 260.A OD1 ARG 12.A HH22 3.209 2.584 ILE 13.A N GLY 9.A O ILE 13.A H 3.058 2.261 SER 14.A N ALA 11.A O SER 14.A H 3.251 2.498 SER 14.A OG LEU 10.A O SER 14.A HG 3.453 2.674 SER 14.A OG ALA 11.A O SER 14.A HG 3.257 2.707 SER 15.A N ARG 12.A O SER 15.A H 3.174 2.357 SER 15.A OG SER 17.A O SER 15.A HG 2.996 2.585 SER 17.A N SER 15.A OG SER 17.A H 3.377 2.526 THR 20.A OG1 ALA 11.A O THR 20.A HG1 3.428 2.964 TYR 23.A N GLN 3.A O TYR 23.A H 2.891 2.064 TYR 24.A N SER 14.A OG TYR 24.A H 2.982 2.194 TYR 25.A N ALA 1.A O TYR 25.A H 3.068 2.251 ASP 26.A N TYR 236.A OH ASP 26.A H 2.769 1.940 SER 28.A N ASP 26.A OD2 SER 28.A H 2.811 1.966 ALA 29.A N ASP 26.A O ALA 29.A H 2.955 2.302 GLN 31.A N SER 28.A O GLN 31.A H 2.855 2.011 SER 33.A N GLY 30.A O SER 33.A H 3.097 2.257 SER 33.A OG GLY 30.A O SER 33.A HG 2.619 1.849 CYS 34.A N GLY 126.A O CYS 34.A H 3.058 2.296 CYS 34.A SG ASN 122.A O no hydrogen 3.862 N/A VAL 35.A N GLN 89.A O VAL 35.A H 2.815 1.987 TYR 36.A N VAL 128.A O TYR 36.A H 2.709 1.896 TYR 36.A OH ASP 117.A OD1 TYR 36.A HH 2.633 1.823 VAL 37.A N PHE 91.A O VAL 37.A H 2.749 1.932 ILE 38.A N SER 130.A O ILE 38.A H 3.124 2.302 ASP 39.A N VAL 93.A O ASP 39.A H 2.940 2.141 THR 40.A N ASP 39.A OD2 THR 40.A H 2.589 1.835 GLU 43.A N THR 71.A OG1 GLU 43.A H 2.904 2.104 HIS 46.A N GLU 43.A O HIS 46.A H 2.899 2.042 HIS 46.A NE2 SER 216.A O HIS 46.A HE2 2.682 1.849 PHE 49.A N HIS 46.A O PHE 49.A H 2.996 2.157 GLU 50.A N PRO 47.A O GLU 50.A H 3.078 2.339 ARG 52.A N PHE 49.A O ARG 52.A H 2.802 1.952 ARG 52.A NE GLU 50.A OE1 ARG 52.A HE 3.366 2.610 ARG 52.A NH1 GLY 78.A O ARG 52.A HH12 2.770 2.014 ARG 52.A NH1 THR 88.A O ARG 52.A HH11 2.850 2.045 ARG 52.A NH2 GLU 50.A OE1 ARG 52.A HH21 3.135 2.334 ARG 52.A NH2 GLY 78.A O ARG 52.A HH22 2.807 2.064 GLN 54.A N LEU 90.A O GLN 54.A H 2.998 2.249 VAL 56.A N GLY 92.A O VAL 56.A H 2.888 2.039 THR 58.A OG1 SER 62.A O THR 58.A HG1 2.659 1.845 TYR 59.A N LYS 94.A O TYR 59.A H 2.988 2.162 TYR 60.A N THR 58.A OG1 TYR 60.A H 3.306 2.517 ARG 64.A N SER 62.A OG ARG 64.A H 3.262 2.405 GLY 66.A N ASP 98.A OD1 GLY 66.A H 2.833 2.081 ASN 67.A N ASP 65.A OD1 ASN 67.A H 2.980 2.162 ASN 67.A ND2 ASP 98.A O ASN 67.A HD21 2.867 2.026 GLY 68.A N ASP 65.A OD1 GLY 68.A H 2.852 1.999 GLY 68.A N ASP 65.A OD2 GLY 68.A H 3.257 2.612 HIS 69.A N ASN 67.A OD1 HIS 69.A H 3.153 2.362 HIS 69.A ND1 ASP 39.A OD1 HIS 69.A HD1 2.839 2.238 HIS 69.A ND1 ASP 39.A OD2 HIS 69.A HD1 2.819 1.967 GLY 70.A N THR 40.A OG1 GLY 70.A H 2.901 2.066 THR 71.A N ASP 65.A OD2 THR 71.A H 2.960 2.194 HIS 72.A N GLY 68.A O HIS 72.A H 2.784 1.973 HIS 72.A NE2 ARG 218.A O HIS 72.A HE2 2.916 2.257 CYS 73.A N HIS 69.A O CYS 73.A H 2.918 2.084 CYS 73.A SG HIS 69.A O CYS 73.A HG 3.389 2.393 ALA 74.A N GLY 70.A O ALA 74.A H 2.826 1.972 GLY 75.A N THR 71.A O GLY 75.A H 2.918 2.126 THR 76.A N HIS 72.A O THR 76.A H 3.088 2.312 THR 76.A OG1 HIS 72.A O THR 76.A HG1 3.488 2.684 VAL 77.A N CYS 73.A O VAL 77.A H 3.054 2.292 GLY 78.A N ALA 74.A O GLY 78.A H 2.987 2.168 SER 79.A N GLY 75.A O SER 79.A H 2.907 2.070 ARG 80.A N GLU 48.A O ARG 80.A H 2.809 1.972 ARG 80.A NE THR 81.A OG1 ARG 80.A HE 3.053 2.278 ARG 80.A NH2 THR 81.A OG1 ARG 80.A HH21 3.011 2.243 THR 81.A N GLU 48.A OE1 THR 81.A H 2.586 1.731 TYR 82.A N SER 79.A OG TYR 82.A H 3.128 2.418 GLY 83.A N SER 79.A O GLY 83.A H 2.950 2.297 VAL 84.A N THR 76.A O VAL 84.A H 2.893 2.141 ALA 85.A N VAL 77.A O ALA 85.A H 2.787 1.932 LYS 86.A NZ GLN 3.A OE1 LYS 86.A HZ2 2.977 2.181 LYS 86.A NZ ARG 80.A O LYS 86.A HZ1 2.663 1.797 LYS 86.A NZ GLY 83.A O LYS 86.A HZ3 2.931 2.059 LYS 87.A N ALA 29.A O LYS 87.A H 2.742 1.918 THR 88.A N ALA 85.A O THR 88.A H 3.254 2.396 GLN 89.A N SER 33.A O GLN 89.A H 3.109 2.254 LEU 90.A N ARG 52.A O LEU 90.A H 2.819 1.966 PHE 91.A N VAL 35.A O PHE 91.A H 2.964 2.127 GLY 92.A N GLN 54.A O GLY 92.A H 2.841 2.020 VAL 93.A N VAL 37.A O VAL 93.A H 3.034 2.178 LYS 94.A N LYS 57.A O LYS 94.A H 2.830 2.000 LYS 94.A NZ THR 40.A O LYS 94.A HZ3 2.880 2.147 LYS 94.A NZ LEU 96.A O LYS 94.A HZ1 2.831 1.969 LYS 94.A NZ ASP 98.A OD1 LYS 94.A HZ2 2.884 2.218 LEU 96.A N ASP 39.A O LEU 96.A H 3.021 2.184 ASP 97.A N SER 101.A O ASP 97.A H 2.618 1.784 ASN 99.A N ASP 97.A OD1 ASN 99.A H 2.850 2.130 GLY 100.A N ASP 97.A O GLY 100.A H 2.904 2.060 SER 101.A N ASP 97.A OD1 SER 101.A H 2.947 2.116 TYR 104.A OH GLY 136.A O TYR 104.A HH 2.458 1.766 THR 106.A N GLN 103.A O THR 106.A H 2.961 2.352 ILE 107.A N GLN 103.A O ILE 107.A H 2.953 2.139 ILE 108.A N TYR 104.A O ILE 108.A H 2.761 1.925 ALA 109.A N SER 105.A O ALA 109.A H 3.008 2.182 GLY 110.A N THR 106.A O GLY 110.A H 2.897 2.095 MET 111.A N ILE 107.A O MET 111.A H 3.120 2.321 ASP 112.A N ILE 108.A O ASP 112.A H 2.975 2.131 PHE 113.A N ALA 109.A O PHE 113.A H 2.810 2.028 VAL 114.A N GLY 110.A O VAL 114.A H 3.084 2.269 ALA 115.A N MET 111.A O ALA 115.A H 3.082 2.254 SER 116.A N ASP 112.A O SER 116.A H 3.263 2.510 SER 116.A N PHE 113.A O SER 116.A H 3.051 2.428 ASP 117.A N PHE 113.A O ASP 117.A H 2.621 1.770 LYS 118.A N VAL 114.A O LYS 118.A H 3.029 2.209 LYS 118.A NZ ALA 115.A O LYS 118.A HZ3 2.715 2.132 LYS 118.A NZ SER 151.A O LYS 118.A HZ2 2.868 2.290 LYS 118.A NZ SER 151.A OG LYS 118.A HZ1 3.134 2.400 ASN 119.A N SER 116.A O ASN 119.A H 3.046 2.272 ASN 120.A N ASP 117.A O ASN 120.A H 2.905 2.058 ARG 121.A N LYS 118.A O ARG 121.A H 3.213 2.357 ARG 121.A NE ASP 117.A OD1 ARG 121.A HE 2.799 1.957 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD1 ARG 121.A HH21 3.394 2.743 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD2 ARG 121.A HH21 3.077 2.276 LYS 125.A N GLY 32.A O LYS 125.A H 3.031 2.176 GLY 126.A N CYS 123.A O GLY 126.A H 2.900 2.078 VAL 128.A N CYS 34.A O VAL 128.A H 2.736 1.942 ALA 129.A N MET 154.A O ALA 129.A H 2.773 1.937 SER 130.A N TYR 36.A O SER 130.A H 2.811 1.977 LEU 131.A N ALA 156.A O LEU 131.A H 2.793 1.944 SER 132.A OG SER 224.A O SER 132.A HG 2.776 2.331 GLY 135.A N SER 170.A O GLY 135.A H 2.996 2.246 VAL 141.A N SER 138.A OG VAL 141.A H 3.227 2.387 ASN 142.A N SER 138.A O ASN 142.A H 2.942 2.094 ASN 142.A ND2 SER 173.A OG ASN 142.A HD21 2.912 2.061 SER 143.A N SER 139.A O SER 143.A H 2.832 2.024 ALA 144.A N SER 140.A O ALA 144.A H 2.982 2.185 ALA 145.A N VAL 141.A O ALA 145.A H 2.992 2.155 ALA 146.A N ASN 142.A O ALA 146.A H 2.805 1.982 ARG 147.A N SER 143.A O ARG 147.A H 2.765 1.951 ARG 147.A NE ASP 112.A OD1 ARG 147.A HE 3.076 2.249 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD1 ARG 147.A HH21 3.293 2.546 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD2 ARG 147.A HH21 3.155 2.382 LEU 148.A N ALA 144.A O LEU 148.A H 2.910 2.079 GLN 149.A N ALA 145.A O GLN 149.A H 3.002 2.163 SER 150.A N ALA 146.A O SER 150.A H 2.803 1.967 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 2.833 2.104 GLY 152.A N GLN 149.A O GLY 152.A H 3.032 2.186 VAL 153.A N LEU 148.A O VAL 153.A H 3.420 2.618 MET 154.A N VAL 127.A O MET 154.A H 2.949 2.106 ALA 156.A N ALA 129.A O ALA 156.A H 2.843 1.991 VAL 157.A N CYS 178.A O VAL 157.A H 2.766 1.930 ALA 158.A N LEU 131.A O ALA 158.A H 3.110 2.342 ALA 159.A N VAL 180.A O ALA 159.A H 2.839 2.061 GLY 160.A N THR 223.A OG1 GLY 160.A H 3.081 2.349 ASN 162.A N ASN 194.A OD1 ASN 162.A H 3.026 2.319 ASN 163.A N PHE 192.A O ASN 163.A H 2.850 2.064 ALA 164.A N ASN 194.A OD1 ALA 164.A H 2.941 2.111 ALA 166.A N TYR 195.A O ALA 166.A H 2.698 1.863 ARG 167.A N ASP 165.A OD1 ARG 167.A H 2.956 2.122 ASN 168.A N ASP 165.A O ASN 168.A H 3.414 2.557 TYR 169.A N ALA 166.A O TYR 169.A H 3.127 2.346 SER 170.A N GLY 135.A O SER 170.A H 3.043 2.249 SER 170.A OG SER 138.A O SER 170.A HG 3.283 2.481 SER 173.A N TYR 169.A O SER 173.A H 2.812 2.122 GLU 174.A N PRO 171.A O GLU 174.A H 3.001 2.158 SER 176.A N GLU 174.A OE2 SER 176.A H 3.112 2.269 SER 176.A OG GLU 174.A OE2 SER 176.A HG 2.813 2.051 CYS 178.A N VAL 155.A O CYS 178.A H 2.876 2.046 THR 179.A N ASP 200.A OD2 THR 179.A H 2.946 2.100 THR 179.A OG1 ALA 172.A O THR 179.A HG1 2.612 2.004 VAL 180.A N VAL 157.A O VAL 180.A H 2.813 2.042 GLY 181.A N ILE 201.A O GLY 181.A H 2.828 2.026 ALA 182.A N SER 193.A OG ALA 182.A H 2.938 2.087 SER 183.A N GLY 203.A O SER 183.A H 2.875 2.106 ASP 184.A N ARG 188.A O ASP 184.A H 2.889 2.110 TYR 186.A N ASP 184.A OD2 TYR 186.A H 2.824 2.112 ASP 187.A N ASP 184.A O ASP 187.A H 2.867 2.058 ARG 188.A N ASP 184.A OD2 ARG 188.A H 2.970 2.134 ARG 188.A NE ASP 184.A OD1 ARG 188.A HE 2.742 1.896 ARG 188.A NH2 ASP 184.A OD1 ARG 188.A HH21 3.362 2.712 ARG 189.A N SER 262.A O ARG 189.A H 2.867 2.023 ARG 189.A NE ASN 263.A O ARG 189.A HE 2.720 1.912 ARG 189.A NH1 ASN 163.A OD1 ARG 189.A HH12 3.081 2.274 ARG 189.A NH1 SER 193.A O ARG 189.A HH11 2.866 2.235 ARG 189.A NH2 ASN 263.A O ARG 189.A HH21 3.491 2.902 SER 190.A N ALA 182.A O SER 190.A H 2.815 1.977 SER 193.A N SER 190.A O SER 193.A H 2.810 1.973 SER 193.A OG ASN 194.A O SER 193.A HG 2.916 2.181 ASN 194.A N GLY 160.A O ASN 194.A H 2.839 2.016 ASN 194.A ND2 ALA 159.A O ASN 194.A HD22 2.624 1.825 ASN 194.A ND2 ASN 162.A OD1 ASN 194.A HD21 3.361 2.592 TYR 195.A N ALA 164.A O TYR 195.A H 2.951 2.162 GLY 196.A N THR 268.A OG1 GLY 196.A H 2.895 2.102 LEU 199.A N GLY 196.A O LEU 199.A H 3.206 2.401 ASP 200.A N THR 179.A O ASP 200.A H 2.900 2.066 PHE 202.A N LEU 271.A O PHE 202.A H 2.815 2.039 GLY 203.A N GLY 181.A O GLY 203.A H 2.830 2.012 GLY 205.A N SER 183.A O GLY 205.A H 2.825 1.984 THR 206.A N SER 183.A O THR 206.A H 3.179 2.450 ASP 207.A N SER 221.A OG ASP 207.A H 3.017 2.175 ILE 208.A N ILE 220.A O ILE 208.A H 2.969 2.112 SER 210.A N ARG 218.A O SER 210.A H 3.121 2.304 SER 210.A OG HIS 72.A O SER 210.A HG 2.748 1.953 TRP 212.A N SER 216.A O TRP 212.A H 2.777 2.027 GLY 214.A N GLU 43.A OE1 GLY 214.A H 2.677 1.877 GLY 215.A N GLU 43.A OE2 GLY 215.A H 2.755 1.930 SER 216.A N TRP 212.A O SER 216.A H 3.155 2.398 ARG 218.A N SER 210.A O ARG 218.A H 3.074 2.303 ILE 220.A N ILE 208.A O ILE 220.A H 3.247 2.488 GLY 222.A N GLY 205.A O GLY 222.A H 2.830 2.027 THR 223.A N ASN 161.A OD1 THR 223.A H 2.766 1.914 THR 223.A OG1 ASN 161.A OD1 THR 223.A HG1 2.603 1.786 MET 225.A N GLY 222.A O MET 225.A H 2.934 2.142 THR 227.A N THR 223.A O THR 227.A H 2.998 2.175 THR 227.A OG1 THR 223.A O THR 227.A HG1 2.736 1.928 HIS 229.A ND1 MET 225.A O HIS 229.A HD1 2.883 2.055 VAL 230.A N ALA 226.A O VAL 230.A H 3.264 2.489 ALA 231.A N THR 227.A O ALA 231.A H 2.855 2.022 GLY 232.A N PRO 228.A O GLY 232.A H 2.750 1.897 LEU 233.A N HIS 229.A O LEU 233.A H 2.905 2.094 ALA 234.A N VAL 230.A O ALA 234.A H 2.818 1.994 ALA 235.A N ALA 231.A O ALA 235.A H 3.002 2.156 TYR 236.A N GLY 232.A O TYR 236.A H 2.797 1.967 LEU 237.A N LEU 233.A O LEU 237.A H 2.768 1.943 MET 238.A N ALA 234.A O MET 238.A H 2.761 1.938 THR 239.A N ALA 235.A O THR 239.A H 2.939 2.107 THR 239.A OG1 GLN 31.A O THR 239.A HG1 2.842 2.250 LEU 240.A N TYR 236.A O LEU 240.A H 3.177 2.386 GLY 241.A N MET 238.A O GLY 241.A H 2.936 2.125 LYS 242.A N LEU 237.A O LYS 242.A H 3.084 2.328 THR 244.A N SER 247.A OG THR 244.A H 3.284 2.439 SER 247.A N THR 244.A O SER 247.A H 3.160 2.484 TYR 251.A N SER 247.A O TYR 251.A H 2.798 1.968 ILE 252.A N ALA 248.A O ILE 252.A H 2.751 1.910 ALA 253.A N CYS 249.A O ALA 253.A H 2.928 2.094 ASP 254.A N ARG 250.A O ASP 254.A H 2.784 1.993 THR 255.A N TYR 251.A O THR 255.A H 2.894 2.151 ALA 256.A N ALA 253.A O ALA 256.A H 3.412 2.559 ASN 257.A N LEU 272.A O ASN 257.A H 2.899 2.172 ASN 257.A ND2 SER 15.A O ASN 257.A HD21 2.804 2.050 LYS 258.A NZ ASP 254.A O LYS 258.A HZ2 2.805 2.056 GLY 259.A N ASN 270.A O GLY 259.A H 2.857 2.013 LEU 261.A N ASN 270.A OD1 LEU 261.A H 2.894 2.063 SER 262.A N ASP 187.A O SER 262.A H 2.823 2.047 THR 268.A N PRO 265.A O THR 268.A H 3.026 2.191 ASN 270.A ND2 LEU 261.A O ASN 270.A HD21 2.776 2.001 LEU 272.A N ASN 257.A O LEU 272.A H 2.898 2.093 ALA 273.A N PHE 202.A O ALA 273.A H 2.875 2.032 ASN 275.A N ILE 13.A O ASN 275.A H 2.691 1.893 ASN 275.A ND2 TYR 24.A O ASN 275.A HD21 2.865 2.044 TYR 277.A N ASN 275.A OD1 TYR 277.A H 3.014 2.210 GLN 278.A NE2 ASN 276.A O GLN 278.A HE21 3.297 2.534