Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8pbo_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 1.A N SER 6.A OG GLY 1.A H3 3.285 2.574 ASN 3.A N SER 6.A OG ASN 3.A H 3.406 2.505 SER 6.A N ASN 3.A OD1 SER 6.A H 2.912 2.016 ALA 7.A N ASN 3.A O ALA 7.A H 2.819 1.996 ASP 8.A N PRO 4.A O ASP 8.A H 3.082 2.264 LEU 9.A N GLU 5.A O LEU 9.A H 3.031 2.180 ARG 10.A N SER 6.A O ARG 10.A H 2.929 2.098 ARG 10.A NH1 GLN 208.A OE1 ARG 10.A HH12 2.742 1.938 ARG 10.A NH2 GLN 208.A OE1 ARG 10.A HH21 3.072 2.398 ALA 11.A N ALA 7.A O ALA 11.A H 2.951 2.070 LEU 12.A N ASP 8.A O LEU 12.A H 2.951 2.098 ALA 13.A N LEU 9.A O ALA 13.A H 2.967 2.084 LYS 14.A N ARG 10.A O LYS 14.A H 2.932 2.113 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 2.873 1.988 HIS 15.A NE2 SER 90.A O HIS 15.A HE2 2.834 1.965 LEU 16.A N LEU 12.A O LEU 16.A H 3.041 2.139 TYR 17.A N ALA 13.A O TYR 17.A H 2.963 2.098 ASP 18.A N LYS 14.A O ASP 18.A H 2.949 2.048 SER 19.A N HIS 15.A O SER 19.A H 2.984 2.108 SER 19.A OG.B HIS 15.A O SER 19.A HG.B 3.330 2.573 TYR 20.A N LEU 16.A O TYR 20.A H 2.809 1.940 TYR 20.A OH ASP 169.A OD1 TYR 20.A HH 2.562 1.757 ILE 21.A N TYR 17.A O ILE 21.A H 2.880 1.984 LYS 22.A N ASP 18.A O LYS 22.A H 3.125 2.288 LYS 22.A NZ ASP 18.A OD2 LYS 22.A HZ2 2.689 1.878 SER 23.A N TYR 20.A O SER 23.A H 2.988 2.228 SER 23.A OG SER 19.A O SER 23.A HG 2.677 1.871 PHE 24.A N TYR 20.A O PHE 24.A H 2.935 2.123 LYS 28.A N ASP 169.A OD1 LYS 28.A H 2.880 2.047 LYS 28.A NZ LEU 167.A O LYS 28.A HZ1 2.693 1.800 ALA 29.A N ASP 169.A OD2 ALA 29.A H 3.010 2.187 LYS 30.A N THR 27.A OG1 LYS 30.A H 3.093 2.201 ALA 31.A N THR 27.A O ALA 31.A H 2.899 1.996 ARG 32.A N LYS 28.A O ARG 32.A H 2.856 1.962 ALA 33.A N ALA 29.A O ALA 33.A H 3.066 2.265 ILE 34.A N LYS 30.A O ILE 34.A H 2.906 2.023 LEU 35.A N ALA 31.A O LEU 35.A H 2.798 1.920 THR 36.A N ARG 32.A O THR 36.A H 2.880 2.059 THR 36.A OG1 ARG 32.A O THR 36.A HG1 2.717 1.895 GLY 37.A N ILE 34.A O GLY 37.A H 3.387 2.487 LYS 38.A N ALA 33.A O LYS 38.A H 2.978 2.248 ASP 41.A N LYS 38.A O ASP 41.A H 3.221 2.340 PHE 45.A N GLN 133.A O PHE 45.A H 2.943 2.062 ILE 47.A N PHE 135.A O ILE 47.A H 2.807 1.906 ASP 49.A N SER 52.A OG ASP 49.A H 3.035 2.331 SER 52.A N ASP 49.A OD1 SER 52.A H 2.685 1.801 LEU 53.A N ASP 49.A O LEU 53.A H 2.787 1.943 MET 54.A N MET 50.A O MET 54.A H 2.901 2.020 MET 55.A N ASN 51.A O MET 55.A H 2.878 1.974 GLY 56.A N SER 52.A O GLY 56.A H 2.827 2.036 GLU 57.A N LEU 53.A O GLU 57.A H 3.017 2.147 LYS 59.A N MET 55.A O LYS 59.A H 2.918 2.068 ILE 60.A N GLY 56.A O ILE 60.A H 2.579 1.686 ARG 68.A N GLU 64.A O ARG 68.A H 3.010 2.127 ARG 68.A NE GLU 57.A OE1 ARG 68.A HE 3.406 2.747 ARG 68.A NH2 LYS 63.A O ARG 68.A HH22 3.432 2.851 ILE 69.A N VAL 65.A O ILE 69.A H 3.022 2.145 PHE 70.A N ALA 66.A O PHE 70.A H 2.892 1.988 GLN 71.A N ILE 67.A O GLN 71.A H 2.897 1.997 GLY 72.A N ARG 68.A O GLY 72.A H 2.893 2.023 CYS 73.A N ILE 69.A O CYS 73.A H 3.019 2.160 GLN 74.A N PHE 70.A O GLN 74.A H 3.210 2.354 PHE 75.A N GLN 71.A O PHE 75.A H 2.890 2.013 ARG 76.A N GLY 72.A O ARG 76.A H 3.023 2.143 ARG 76.A NE GLU 79.A OE1 ARG 76.A HE 3.450 2.658 ARG 76.A NH2 GLU 79.A OE1 ARG 76.A HH22 3.538 2.775 ARG 76.A NH2 GLU 83.A OE1 ARG 76.A HH21 3.495 2.660 SER 77.A N CYS 73.A O SER 77.A H 2.887 2.034 SER 77.A OG CYS 73.A O SER 77.A HG 3.488 2.749 VAL 78.A N GLN 74.A O VAL 78.A H 2.978 2.128 GLU 79.A N PHE 75.A O GLU 79.A H 3.067 2.176 ALA 80.A N ARG 76.A O ALA 80.A H 2.859 2.003 VAL 81.A N SER 77.A O VAL 81.A H 2.859 2.012 GLN 82.A N VAL 78.A O GLN 82.A H 3.165 2.290 GLU 83.A N GLU 79.A O GLU 83.A H 3.071 2.212 ILE 84.A N ALA 80.A O ILE 84.A H 2.732 1.828 THR 85.A N VAL 81.A O THR 85.A H 2.833 1.960 GLU 86.A N GLN 82.A O GLU 86.A H 3.231 2.360 TYR 87.A N GLU 83.A O TYR 87.A H 3.006 2.131 ALA 88.A N ILE 84.A O ALA 88.A H 2.773 1.911 LYS 89.A N THR 85.A O LYS 89.A H 3.184 2.298 SER 90.A N TYR 87.A O SER 90.A H 2.903 2.170 ILE 91.A N ALA 88.A O ILE 91.A H 2.905 2.019 PHE 94.A N ILE 91.A O PHE 94.A H 2.988 2.099 ASN 96.A N GLY 93.A O ASN 96.A H 3.168 2.411 LEU 97.A N PHE 94.A O LEU 97.A H 3.088 2.208 ASN 100.A N ASP 98.A OD1 ASN 100.A H 2.943 2.107 ASN 100.A ND2 ASP 98.A OD1 ASN 100.A HD21 2.876 2.061 GLN 102.A N ASP 98.A O GLN 102.A H 2.976 2.103 GLN 102.A NE2 LEU 97.A O GLN 102.A HE21 2.822 1.977 VAL 103.A N LEU 99.A O VAL 103.A H 3.057 2.174 THR 104.A N ASN 100.A O THR 104.A H 2.988 2.098 LEU 105.A N ASP 101.A O LEU 105.A H 2.854 1.943 LEU 106.A N GLN 102.A O LEU 106.A H 3.033 2.167 LYS 107.A N VAL 103.A O LYS 107.A H 2.888 2.007 LYS 107.A NZ ILE 260.A O LYS 107.A HZ2 2.868 1.998 LYS 107.A NZ LYS 262.A O LYS 107.A HZ3 2.674 1.778 TYR 108.A N THR 104.A O TYR 108.A H 3.098 2.216 TYR 108.A OH LEU 264.A O TYR 108.A HH 3.059 2.269 GLY 109.A N LEU 105.A O GLY 109.A H 2.890 2.212 GLY 109.A N LEU 106.A O GLY 109.A H 3.182 2.498 VAL 110.A N LEU 106.A O VAL 110.A H 3.037 2.296 ILE 113.A N GLY 109.A O ILE 113.A H 3.135 2.275 ILE 114.A N VAL 110.A O ILE 114.A H 2.807 1.937 TYR 115.A N HIS 111.A O TYR 115.A H 3.039 2.177 THR 116.A N GLU 112.A O THR 116.A H 3.067 2.230 MET 117.A N ILE 113.A O MET 117.A H 2.961 2.091 LEU 118.A N ILE 114.A O LEU 118.A H 2.768 1.922 ALA 119.A N TYR 115.A O ALA 119.A H 3.382 2.589 ALA 119.A N THR 116.A O ALA 119.A H 3.269 2.573 SER 120.A N MET 117.A O SER 120.A H 3.016 2.342 SER 120.A OG MET 117.A O SER 120.A HG 3.449 2.833 LEU 121.A N LEU 118.A O LEU 121.A H 2.893 2.123 MET 122.A N ALA 119.A O MET 122.A H 3.080 2.197 ASN 123.A N GLY 126.A O ASN 123.A H 3.054 2.173 ASP 125.A N ASN 123.A OD1 ASP 125.A H 2.840 2.058 GLY 126.A N ASN 123.A O GLY 126.A H 3.363 2.516 VAL 127.A N MET 136.A O VAL 127.A H 2.946 2.082 LEU 128.A N LEU 121.A O LEU 128.A H 2.927 2.021 ILE 129.A N GLY 134.A O ILE 129.A H 2.895 1.994 GLY 132.A N ILE 129.A O GLY 132.A H 2.847 2.148 GLN 133.A N SER 130.A O GLN 133.A H 2.967 2.072 GLY 134.A N ILE 129.A O GLY 134.A H 3.230 2.328 PHE 135.A N PHE 45.A O PHE 135.A H 2.885 2.084 MET 136.A N VAL 127.A O MET 136.A H 2.898 2.003 THR 137.A N ILE 47.A O THR 137.A H 2.990 2.117 ARG 138.A N ASP 125.A O ARG 138.A H 2.739 1.829 ARG 138.A NE GLU 153.A OE1 ARG 138.A HE 2.772 1.912 ARG 138.A NH1 LYS 124.A O ARG 138.A HH11 3.249 2.445 ARG 138.A NH2 GLU 153.A OE2 ARG 138.A HH22 2.906 2.069 PHE 140.A N THR 137.A OG1 PHE 140.A H 3.089 2.250 LEU 141.A N THR 137.A O LEU 141.A H 3.082 2.172 LYS 142.A N ARG 138.A O LYS 142.A H 2.957 2.055 LYS 142.A NZ GLU 139.A OE2 LYS 142.A HZ1 3.472 2.693 SER 143.A N PHE 140.A O SER 143.A H 3.094 2.290 LEU 144.A N LEU 141.A O LEU 144.A H 3.289 2.399 ARG 145.A NE GLU 64.A OE2 ARG 145.A HE 2.732 1.907 ARG 145.A NH1 GLU 248.A OE2 ARG 145.A HH12 2.953 2.153 ARG 145.A NH2 LYS 146.A O ARG 145.A HH22 2.966 2.179 ARG 145.A NH2 GLU 248.A OE1 ARG 145.A HH21 3.239 2.470 PHE 148.A N ARG 145.A O PHE 148.A H 2.801 1.951 GLU 153.A N ASP 150.A O GLU 153.A H 3.291 2.489 LYS 155.A N MET 152.A O LYS 155.A H 2.958 2.293 LYS 155.A NZ PHE 151.A O LYS 155.A HZ1 2.780 1.891 PHE 156.A N MET 152.A O PHE 156.A H 3.085 2.204 GLU 157.A N GLU 153.A O GLU 157.A H 2.933 2.051 PHE 158.A N PRO 154.A O PHE 158.A H 3.037 2.149 ALA 159.A N LYS 155.A O ALA 159.A H 2.878 2.005 VAL 160.A N PHE 156.A O VAL 160.A H 2.970 2.085 PHE 162.A N PHE 158.A O PHE 162.A H 2.693 1.824 ASN 163.A N ALA 159.A O ASN 163.A H 2.741 1.870 ASN 163.A ND2 ALA 119.A O ASN 163.A HD22 3.087 2.260 ALA 164.A N LYS 161.A O ALA 164.A H 3.313 2.538 LEU 165.A N PHE 162.A O LEU 165.A H 2.929 2.082 GLU 166.A N ASN 163.A O GLU 166.A H 3.038 2.225 ASP 168.A N ASP 171.A OD2 ASP 168.A H 2.998 2.099 ASP 171.A N ASP 168.A O ASP 171.A H 3.005 2.375 ASP 171.A N ASP 168.A OD1 ASP 171.A H 3.075 2.233 LEU 172.A N ASP 168.A O LEU 172.A H 2.952 2.054 ALA 173.A N ASP 169.A O ALA 173.A H 2.925 2.038 ILE 174.A N ASP 171.A O ILE 174.A H 3.097 2.448 PHE 175.A N ASP 171.A O PHE 175.A H 3.141 2.243 ILE 176.A N LEU 172.A O ILE 176.A H 2.814 1.915 ALA 177.A N ALA 173.A O ALA 177.A H 3.379 2.507 VAL 178.A N ILE 174.A O VAL 178.A H 2.908 2.018 ILE 179.A N PHE 175.A O ILE 179.A H 2.988 2.102 ILE 180.A N ILE 176.A O ILE 180.A H 3.108 2.247 LEU 181.A N ALA 177.A O LEU 181.A H 3.132 2.246 SER 182.A OG ILE 179.A O SER 182.A HG 2.529 1.720 ARG 185.A NH1 GLU 112.A OE2 ARG 185.A HH12 3.042 2.365 ARG 185.A NH2 GLU 112.A OE1 ARG 185.A HH21 2.834 2.018 LEU 189.A N ASP 101.A OD1 LEU 189.A H 2.808 1.895 ASN 190.A N ASP 101.A OD2 ASN 190.A H 2.866 1.978 LYS 192.A NZ ASP 196.A OD1 LYS 192.A HZ1 2.873 2.052 GLU 195.A N VAL 191.A O GLU 195.A H 2.971 2.078 ASP 196.A N LYS 192.A O ASP 196.A H 2.977 2.137 ILE 197.A N PRO 193.A O ILE 197.A H 3.269 2.400 GLN 198.A N ILE 194.A O GLN 198.A H 2.818 1.906 GLN 198.A NE2 VAL 178.A O GLN 198.A HE21 2.927 2.048 ASP 199.A N GLU 195.A O ASP 199.A H 2.808 1.967 ASN 200.A N ASP 196.A O ASN 200.A H 3.298 2.419 LEU 201.A N ILE 197.A O LEU 201.A H 2.940 2.040 LEU 202.A N GLN 198.A O LEU 202.A H 2.849 1.944 GLN 203.A N ASP 199.A O GLN 203.A H 2.924 2.048 ALA 204.A N ASN 200.A O ALA 204.A H 2.982 2.177 LEU 205.A N LEU 201.A O LEU 205.A H 2.807 1.915 GLU 206.A N LEU 202.A O GLU 206.A H 2.905 1.999 LEU 207.A N GLN 203.A O LEU 207.A H 3.158 2.257 GLN 208.A N ALA 204.A O GLN 208.A H 2.921 2.049 GLN 208.A NE2 ASP 171.A OD1 GLN 208.A HE21 3.093 2.281 LEU 209.A N LEU 205.A O LEU 209.A H 2.887 2.073 LYS 210.A N GLU 206.A O LYS 210.A H 3.181 2.322 LEU 211.A N LEU 207.A O LEU 211.A H 3.015 2.131 ASN 212.A N GLN 208.A O ASN 212.A H 2.891 2.053 ASN 212.A ND2 ASP 168.A OD2 ASN 212.A HD22 2.810 1.994 ASN 212.A ND2 ASP 171.A OD1 ASN 212.A HD21 2.966 2.089 HIS 213.A N LEU 209.A O HIS 213.A H 2.804 2.049 HIS 213.A NE2 ASP 171.A OD2 HIS 213.A HE2 2.585 1.715 SER 216.A N HIS 213.A O SER 216.A H 2.959 2.083 LYS 222.A N GLN 218.A O LYS 222.A H 2.907 2.064 LYS 222.A NZ SER 217.A O LYS 222.A HZ2 3.290 2.644 LEU 223.A N LEU 219.A O LEU 223.A H 2.795 1.907 LEU 224.A N PHE 220.A O LEU 224.A H 3.027 2.121 GLN 225.A N ALA 221.A O GLN 225.A H 2.946 2.110 LYS 226.A N LEU 223.A O LYS 226.A H 2.992 2.235 MET 227.A N LEU 224.A O MET 227.A H 2.984 2.167 THR 228.A N GLN 225.A O THR 228.A H 3.096 2.291 ASP 229.A N LYS 226.A O ASP 229.A H 3.053 2.389 LEU 230.A N LYS 226.A O LEU 230.A H 3.210 2.397 ARG 231.A N MET 227.A O ARG 231.A H 3.185 2.277 ARG 231.A NE GLU 112.A OE2 ARG 231.A HE 2.822 2.036 GLN 232.A N THR 228.A O GLN 232.A H 3.210 2.316 GLN 232.A NE2 THR 228.A O GLN 232.A HE21 3.631 3.051 ILE 233.A N ASP 229.A O ILE 233.A H 2.945 2.070 VAL 234.A N LEU 230.A O VAL 234.A H 3.086 2.187 THR 235.A N ARG 231.A O THR 235.A H 2.954 2.098 THR 235.A OG1 ARG 231.A O THR 235.A HG1 3.271 2.475 THR 235.A OG1 GLN 232.A O THR 235.A HG1 3.321 2.834 GLU 236.A N GLN 232.A O GLU 236.A H 2.996 2.117 HIS 237.A N ILE 233.A O HIS 237.A H 2.865 2.019 VAL 238.A N VAL 234.A O VAL 238.A H 2.929 2.056 GLN 239.A N THR 235.A O GLN 239.A H 3.068 2.192 LEU 240.A N GLU 236.A O LEU 240.A H 3.061 2.178 LEU 241.A N HIS 237.A O LEU 241.A H 3.049 2.161 GLN 242.A N VAL 238.A O GLN 242.A H 3.143 2.293 VAL 243.A N GLN 239.A O VAL 243.A H 3.159 2.334 ILE 244.A N LEU 240.A O ILE 244.A H 2.862 1.978 LYS 245.A N LEU 241.A O LYS 245.A H 3.063 2.191 LYS 246.A N VAL 243.A O LYS 246.A H 2.943 2.145 GLU 248.A N ILE 244.A O GLU 248.A H 2.723 1.928 ASP 250.A N ASP 250.A OD1.A ASP 250.A H 2.552 1.885 MET 251.A N GLU 248.A O MET 251.A H 3.195 2.324 GLN 258.A N HIS 254.A O GLN 258.A H 2.983 2.081 GLU 259.A N PRO 255.A O GLU 259.A H 3.015 2.111 ILE 260.A N LEU 256.A O ILE 260.A H 3.025 2.131 TYR 261.A N LEU 257.A O TYR 261.A H 2.833 1.940 LYS 262.A N GLN 258.A O LYS 262.A H 3.018 2.314 LYS 262.A N GLU 259.A O LYS 262.A H 3.191 2.470 LEU 264.A N TYR 261.A O LEU 264.A H 3.048 2.309