Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8pbs_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 3.A N VAL 284.A O VAL 3.A H 3.016 2.176 LEU 5.A N VAL 282.A O LEU 5.A H 2.680 1.822 ILE 9.A N LEU 264.A O ILE 9.A H 2.878 2.058 ASP 10.A N MET 35.A O ASP 10.A H 2.944 2.114 HIS 12.A N ASP 10.A OD1 HIS 12.A H 3.413 2.593 HIS 12.A ND1 GLU 172.A OE2 HIS 12.A HD1 2.721 1.954 VAL 13.A N CYS 37.A O VAL 13.A H 3.194 2.403 HIS 14.A N HIS 222.A O HIS 14.A H 2.800 1.954 HIS 14.A ND1 ASN 41.A OD1 HIS 14.A HD1 2.615 2.001 GLU 17.A N GLU 19.A O GLU 17.A H 3.174 2.342 ASP 20.A N SER 23.A OG ASP 20.A H 3.108 2.274 ALA 22.A N ASP 20.A OD1 ALA 22.A H 2.529 1.855 SER 23.A N ASP 20.A OD1 SER 23.A H 3.089 2.328 GLY 24.A N ASP 20.A O GLY 24.A H 2.746 1.916 THR 25.A N PHE 21.A O THR 25.A H 2.960 2.112 ALA 26.A N ALA 22.A O ALA 26.A H 3.158 2.402 ALA 27.A N SER 23.A O ALA 27.A H 3.217 2.386 ALA 28.A N GLY 24.A O ALA 28.A H 2.975 2.194 LEU 29.A N THR 25.A O LEU 29.A H 3.005 2.173 ALA 30.A N ALA 26.A O ALA 30.A H 2.957 2.112 GLY 31.A N ALA 27.A O GLY 31.A H 2.926 2.262 GLY 31.A N ALA 28.A O GLY 31.A H 2.936 2.277 GLY 32.A N LEU 29.A O GLY 32.A H 2.960 2.111 ILE 33.A N ALA 28.A O ILE 33.A H 2.798 1.950 THR 34.A N LEU 8.A O THR 34.A H 2.937 2.144 THR 34.A OG1 GLN 277.A OE1 THR 34.A HG1 2.815 2.262 VAL 36.A N ASP 66.A O VAL 36.A H 3.077 2.305 CYS 37.A N ASP 10.A O CYS 37.A H 3.018 2.285 ALA 38.A N ALA 68.A O ALA 38.A H 2.982 2.211 MET 39.A N VAL 13.A O MET 39.A H 2.884 2.099 THR 42.A N PRO 40.A O THR 42.A H 2.820 2.084 THR 42.A OG1 PRO 44.A O THR 42.A HG1 2.689 1.857 ILE 46.A N PRO 40.A O ILE 46.A H 3.073 2.230 ALA 51.A N ASP 48.A OD1 ALA 51.A H 2.536 1.695 LEU 52.A N ASP 48.A O LEU 52.A H 2.996 2.178 ALA 53.A N ALA 49.A O ALA 53.A H 2.896 2.059 LEU 54.A N PRO 50.A O LEU 54.A H 3.078 2.238 ALA 55.A N ALA 51.A O ALA 55.A H 2.971 2.116 GLN 56.A N LEU 52.A O GLN 56.A H 2.824 2.009 GLN 56.A NE2 SER 87.A OG.A GLN 56.A HE21 3.234 2.415 LYS 57.A N ALA 53.A O LYS 57.A H 3.192 2.435 LYS 57.A N LEU 54.A O LYS 57.A H 3.086 2.473 LEU 58.A N LEU 54.A O LEU 58.A H 2.941 2.098 ALA 59.A N ALA 55.A O ALA 59.A H 2.883 2.057 GLU 60.A N GLN 56.A O GLU 60.A H 3.029 2.199 ALA 61.A N LYS 57.A O ALA 61.A H 3.081 2.455 ALA 61.A N LEU 58.A O ALA 61.A H 3.262 2.557 GLY 62.A N LEU 58.A O GLY 62.A H 2.985 2.382 GLY 62.A N ALA 59.A O GLY 62.A H 3.120 2.411 ALA 63.A N ALA 59.A O ALA 63.A H 2.671 1.836 ARG 64.A NE ALA 22.A O ARG 64.A HE 2.864 2.163 ARG 64.A NH1 VAL 333.A O ARG 64.A HH11 2.848 2.245 PHE 67.A N GLN 339.A O PHE 67.A H 2.927 2.172 ALA 68.A N VAL 36.A O ALA 68.A H 2.993 2.239 PHE 70.A N ALA 38.A O PHE 70.A H 3.026 2.166 LEU 71.A N GLY 90.A O LEU 71.A H 2.898 2.067 GLY 72.A N ILE 46.A O GLY 72.A H 2.777 2.005 SER 74.A N ASN 77.A OD1 SER 74.A H 2.895 2.062 GLU 76.A N SER 74.A OG GLU 76.A H 2.999 2.146 ASN 77.A ND2 ILE 47.A O ASN 77.A HD22 2.996 2.169 ASN 77.A ND2 GLY 72.A O ASN 77.A HD21 2.831 2.038 THR 80.A N ASN 77.A O THR 80.A H 3.204 2.369 THR 80.A OG1 ASN 77.A O THR 80.A HG1 2.826 1.994 SER 87.A N VAL 84.A O SER 87.A H.B 3.030 2.298 SER 87.A OG.A VAL 84.A O SER 87.A HG.A 3.057 2.267 SER 87.A OG.B VAL 84.A O SER 87.A HG.B 3.207 2.445 ALA 88.A N ALA 85.A O ALA 88.A H 3.069 2.232 ALA 89.A N LEU 69.A O ALA 89.A H 2.788 1.986 LEU 91.A N PRO 121.A O LEU 91.A H 3.053 2.246 LEU 92.A N VAL 123.A O LEU 92.A H 2.761 1.932 LEU 94.A N HIS 125.A O LEU 94.A H 3.222 2.408 ASN 95.A ND2 THR 130.A OG1 ASN 95.A HD22 3.072 2.398 ARG 102.A N SER 99.A O ARG 102.A H 3.452 2.609 ASP 104.A N GLN 108.A OE1 ASP 104.A H 3.215 2.380 VAL 107.A N SER 105.A OG VAL 107.A H 2.852 2.029 GLN 108.A N SER 105.A O GLN 108.A H 2.927 2.259 GLN 108.A NE2 SER 75.A O GLN 108.A HE22 3.085 2.326 MET 110.A N VAL 106.A O MET 110.A H 3.011 2.189 GLU 111.A N VAL 107.A O GLU 111.A H 2.913 2.091 HIS 112.A N GLN 108.A O HIS 112.A H 3.151 2.352 HIS 112.A NE2 SER 74.A O HIS 112.A HE2 2.954 2.100 PHE 113.A N TRP 109.A O PHE 113.A H 2.881 2.056 GLU 114.A N MET 110.A O GLU 114.A H 2.797 2.067 THR 115.A N GLU 111.A O THR 115.A H 2.998 2.322 TRP 116.A N HIS 112.A O TRP 116.A H 2.897 2.054 LEU 120.A N PRO 117.A O LEU 120.A H 3.198 2.349 VAL 123.A N LEU 91.A O VAL 123.A H 2.741 1.890 ALA 124.A N HIS 146.A O ALA 124.A H 3.026 2.269 HIS 125.A N LEU 92.A O HIS 125.A H 2.863 2.053 GLN 128.A N GLU 155.A OE2 GLN 128.A H 3.015 2.186 GLN 128.A NE2 GLU 154.A OE1 GLN 128.A HE22 3.432 2.584 THR 130.A N GLU 127.A O THR 130.A H 3.015 2.243 THR 130.A OG1 GLU 127.A O THR 130.A HG1 3.081 2.403 VAL 131.A N GLN 128.A O VAL 131.A H.A 3.027 2.212 ALA 133.A N GLN 129.A O ALA 133.A H 3.119 2.308 VAL 134.A N THR 130.A O VAL 134.A H 2.981 2.154 LEU 135.A N VAL 131.A O LEU 135.A H 3.146 2.318 MET 136.A N ALA 132.A O MET 136.A H 2.987 2.192 VAL 137.A N ALA 133.A O VAL 137.A H 3.107 2.300 ALA 138.A N VAL 134.A O ALA 138.A H 2.913 2.083 GLN 139.A N LEU 135.A O GLN 139.A H 2.985 2.178 GLN 139.A NE2 LEU 135.A O GLN 139.A HE21 3.170 2.544 LEU 140.A N MET 136.A O LEU 140.A H 2.874 2.043 THR 141.A N VAL 137.A O THR 141.A H 2.993 2.220 GLN 142.A N GLN 139.A O GLN 142.A H 2.986 2.230 ARG 143.A N ALA 138.A O ARG 143.A H 3.024 2.204 ARG 143.A NE SER 144.A O ARG 143.A HE 2.937 2.083 ARG 143.A NH1 PRO 117.A O ARG 143.A HH12 3.167 2.530 ARG 143.A NH1 LEU 120.A O ARG 143.A HH12 3.250 2.608 ARG 143.A NH2 LEU 120.A O ARG 143.A HH22 2.678 1.853 VAL 145.A N PRO 168.A O VAL 145.A H 3.298 2.564 HIS 146.A N ILE 122.A O HIS 146.A H 3.108 2.303 HIS 146.A NE2 GLU 172.A OE1 HIS 146.A HE2 2.870 2.053 ILE 147.A N THR 170.A O ILE 147.A H 2.818 1.990 CYS 148.A N ALA 124.A O CYS 148.A H 2.954 2.097 HIS 149.A N GLU 172.A OE2 HIS 149.A H 3.317 2.502 HIS 149.A ND1 HIS 149.A O HIS 149.A HD1 2.794 2.135 VAL 150.A N GLU 172.A O VAL 150.A H 2.812 1.968 ALA 151.A N GLU 155.A OE1 ALA 151.A H 2.859 2.020 ARG 152.A NH1 GLU 155.A OE2 ARG 152.A HH11 2.823 1.999 LYS 153.A N ASP 204.A OD1 LYS 153.A H 2.699 1.875 ILE 156.A N ARG 152.A O ILE 156.A H 3.034 2.193 LEU 157.A N LYS 153.A O LEU 157.A H 2.975 2.128 LEU 158.A N GLU 154.A O LEU 158.A H 3.142 2.344 ILE 159.A N GLU 155.A O ILE 159.A H 2.965 2.128 LYS 160.A N ILE 156.A O LYS 160.A H 2.954 2.152 ALA 161.A N LEU 157.A O ALA 161.A H 3.038 2.226 ALA 162.A N LEU 158.A O ALA 162.A H 2.971 2.149 LYS 163.A N ILE 159.A O LYS 163.A H 2.835 2.022 LYS 163.A NZ VAL 214.A O LYS 163.A HZ3 2.784 1.981 LYS 163.A NZ ASP 216.A OD1 LYS 163.A HZ2 3.438 2.668 LYS 163.A NZ ASP 216.A OD2 LYS 163.A HZ2 2.700 1.856 ALA 164.A N LYS 160.A O ALA 164.A H 2.903 2.116 ARG 165.A N ALA 161.A O ARG 165.A H 3.244 2.525 ARG 165.A N ALA 162.A O ARG 165.A H 3.207 2.545 GLY 166.A N LYS 163.A O GLY 166.A H 2.971 2.130 LEU 167.A N ALA 162.A O LEU 167.A H 3.027 2.177 THR 170.A N VAL 145.A O THR 170.A H 3.198 2.386 THR 170.A OG1 HIS 146.A ND1 THR 170.A HG1 2.876 2.359 CYS 171.A N ASP 216.A OD2 CYS 171.A H 3.075 2.348 GLU 172.A N ILE 147.A O GLU 172.A H 3.050 2.252 VAL 173.A N CYS 217.A O VAL 173.A H 3.011 2.274 HIS 177.A N ALA 174.A O HIS 177.A H 3.191 2.390 HIS 177.A NE2 PRO 197.A O HIS 177.A HE2 2.712 2.023 LEU 178.A N PRO 175.A O LEU 178.A H 2.989 2.184 PHE 179.A N PRO 175.A O PHE 179.A H 2.956 2.249 SER 181.A N ASP 184.A OD2 SER 181.A H 3.248 2.515 ASP 184.A N SER 181.A O ASP 184.A H 3.159 2.427 LEU 185.A N HIS 182.A O LEU 185.A H 2.809 2.068 GLU 186.A N ASP 183.A O GLU 186.A H 3.365 2.540 ARG 187.A N ASP 184.A O ARG 187.A H 3.195 2.527 GLY 189.A N LEU 185.A O GLY 189.A H 2.806 1.992 SER 201.A N ASP 204.A OD2 SER 201.A H 3.120 2.309 VAL 205.A N SER 201.A O VAL 205.A H 2.983 2.157 GLU 206.A N ARG 202.A O GLU 206.A H 2.936 2.092 ALA 207.A N GLN 203.A O ALA 207.A H.A 2.947 2.176 LEU 208.A N ASP 204.A O LEU 208.A H 3.128 2.332 TRP 209.A N VAL 205.A O TRP 209.A H 3.184 2.350 TRP 209.A NE1 LEU 178.A O TRP 209.A HE1 3.000 2.162 GLU 210.A N GLU 206.A O GLU 210.A H 2.909 2.085 ASN 211.A N ALA 207.A O ASN 211.A H 3.004 2.281 ASN 211.A N LEU 208.A O ASN 211.A H 3.228 2.610 ASN 211.A ND2 ALA 207.A O ASN 211.A HD21 2.860 2.090 MET 212.A N TRP 209.A O MET 212.A H 3.337 2.622 VAL 214.A N ASN 211.A O VAL 214.A H 2.955 2.165 ILE 215.A N MET 212.A O ILE 215.A H 2.892 2.087 ASP 216.A N CYS 171.A O ASP 216.A H 3.099 2.353 CYS 217.A N CYS 171.A O CYS 217.A H 3.189 2.448 PHE 218.A N ARG 263.A O PHE 218.A H 2.901 2.076 ALA 219.A N VAL 173.A O ALA 219.A H 3.114 2.352 SER 220.A N ASP 10.A OD1 SER 220.A H 3.079 2.270 HIS 222.A N SER 220.A OG HIS 222.A H 3.146 2.405 HIS 222.A NE2 GLU 19.A OE2 HIS 222.A HE2 2.837 2.038 ALA 223.A N PHE 236.A O ALA 223.A H 2.735 1.884 HIS 225.A N ALA 223.A O HIS 225.A H 2.762 2.036 THR 226.A N GLU 229.A OE2 THR 226.A H 3.323 2.497 GLU 229.A N THR 226.A O GLU 229.A H 2.982 2.246 LYS 230.A N THR 226.A O LYS 230.A H 2.975 2.153 LYS 230.A NZ GLU 194.A O LYS 230.A HZ1 3.439 2.808 CYS 231.A N LEU 227.A O CYS 231.A H.A 2.870 2.034 GLY 235.A N GLU 194.A O GLY 235.A H 3.406 2.610 GLY 238.A N HIS 222.A ND1 GLY 238.A H 3.277 2.438 LEU 239.A N HIS 222.A ND1 LEU 239.A H 3.405 2.593 MET 242.A N GLY 238.A O MET 242.A H 3.012 2.342 LEU 245.A N THR 241.A O LEU 245.A H 3.077 2.241 LEU 246.A N MET 242.A O LEU 246.A H 2.998 2.190 LEU 247.A N LEU 243.A O LEU 247.A H 2.792 1.939 THR 248.A N PRO 244.A O THR 248.A H 3.073 2.249 THR 248.A OG1 PRO 244.A O THR 248.A HG1 2.502 1.696 ALA 249.A N LEU 245.A O ALA 249.A H 3.181 2.402 VAL 250.A N LEU 246.A O VAL 250.A H 2.917 2.152 SER 251.A N LEU 247.A O no hydrogen 2.909 N/A SER 251.A N THR 248.A O no hydrogen 3.141 N/A SER 251.A OG.B THR 248.A O no hydrogen 3.126 N/A GLU 252.A N THR 248.A O GLU 252.A H 3.049 2.351 GLY 253.A N VAL 250.A O GLY 253.A H 3.306 2.460 ARG 254.A N ALA 249.A O ARG 254.A H 2.943 2.169 SER 256.A N ASP 259.A OD2 SER 256.A H 3.118 2.259 LEU 260.A N SER 256.A O LEU 260.A H 3.132 2.317 LEU 261.A N LEU 257.A O LEU 261.A H 2.904 2.102 GLN 262.A N ASP 258.A O GLN 262.A H 2.709 1.854 GLN 262.A NE2 ASP 258.A OD1 GLN 262.A HE22 3.334 2.480 ARG 263.A N ASP 259.A O ARG 263.A H 3.205 2.459 ARG 263.A N LEU 260.A O ARG 263.A H 3.158 2.544 ARG 263.A NE ILE 215.A O ARG 263.A HE 2.850 2.364 ARG 263.A NH1 ASP 259.A O ARG 263.A HH11 3.067 2.238 ARG 263.A NH2 MET 212.A O ARG 263.A HH21 2.904 2.143 LEU 264.A N LEU 260.A O LEU 264.A H 2.926 2.318 HIS 265.A ND1 GLY 7.A O HIS 265.A HD1 2.879 2.152 HIS 266.A N LEU 261.A O HIS 266.A H 3.271 2.468 ASN 267.A N GLN 262.A O ASN 267.A H 2.762 1.915 ASN 267.A ND2 ASP 216.A O ASN 267.A HD21 2.596 1.804 ARG 269.A N HIS 265.A O ARG 269.A H 3.168 2.370 ARG 270.A N HIS 266.A O ARG 270.A H 3.074 2.304 ARG 270.A NE ASN 267.A OD1 ARG 270.A HE 2.902 2.110 ILE 271.A N ASN 267.A O ILE 271.A H 2.887 2.083 PHE 272.A N PRO 268.A O PHE 272.A H 3.199 2.358 LEU 274.A N ARG 269.A O LEU 274.A H 3.088 2.443 GLN 277.A NE2 THR 34.A O GLN 277.A HE22 2.735 1.888 GLN 277.A NE2 ASP 66.A OD2 GLN 277.A HE21 2.944 2.104 THR 280.A OG1 GLN 277.A O THR 280.A HG1 3.369 2.921 THR 280.A OG1 GLU 278.A O THR 280.A HG1 2.861 2.047 TYR 281.A N VAL 319.A O TYR 281.A H 3.017 2.246 VAL 282.A N LEU 5.A O VAL 282.A H 2.908 2.078 GLU 283.A N ARG 317.A O GLU 283.A H 2.768 1.925 VAL 284.A N VAL 3.A O VAL 284.A H 3.077 2.264 ASP 285.A N THR 314.A O ASP 285.A H 2.879 2.053 GLU 287.A N ASP 285.A OD2 GLU 287.A H 3.388 2.552 TRP 290.A N VAL 311.A O TRP 290.A H 2.861 2.086 TRP 290.A NE1 GLY 313.A O TRP 290.A HE1 2.810 2.069 ILE 292.A N GLN 309.A O no hydrogen 2.967 N/A PHE 298.A N GLU 240.A OE2 PHE 298.A H 2.929 2.103 SER 299.A N GLU 240.A OE1 SER 299.A H 2.877 2.099 LYS 300.A N GLU 19.A OE1 LYS 300.A H 3.014 2.160 ALA 301.A N SER 299.A OG ALA 301.A H 3.319 2.466 HIS 302.A N SER 299.A O HIS 302.A H 3.366 2.547 HIS 302.A ND1 HIS 302.A O HIS 302.A HD1 2.843 2.205 TRP 303.A NE1 HIS 225.A O TRP 303.A HE1 3.042 2.320 PHE 306.A N THR 304.A OG1 PHE 306.A H 3.342 2.538 GLY 308.A N ILE 292.A O GLY 308.A H 3.133 2.286 GLN 309.A N PHE 306.A O GLN 309.A H 3.141 2.293 GLN 309.A NE2 PHE 179.A O GLN 309.A HE22 3.190 2.502 VAL 311.A N TRP 290.A O VAL 311.A H 2.811 1.958 LYS 312.A N THR 248.A OG1 LYS 312.A H 3.121 2.305 THR 314.A N ASP 285.A O THR 314.A H 2.978 2.270 ARG 316.A N GLU 283.A O ARG 316.A H 2.822 1.992 ARG 317.A N GLU 283.A O ARG 317.A H 3.194 2.466 ARG 317.A NH1 TYR 281.A OH ARG 317.A HH12 3.307 2.633 ARG 317.A NH1 GLU 283.A OE1 ARG 317.A HH11 3.369 2.532 VAL 318.A N TYR 326.A O VAL 318.A H 2.950 2.143 VAL 319.A N TYR 281.A O VAL 319.A H 2.923 2.079 LEU 320.A N GLU 323.A O LEU 320.A H 2.789 1.970 ARG 321.A N THR 280.A OG1 ARG 321.A H 3.004 2.178 ARG 321.A NE ASP 66.A OD1 ARG 321.A HE 3.292 2.596 ARG 321.A NE ASP 66.A OD2 ARG 321.A HE 2.859 2.030 ARG 321.A NH2 ASP 66.A OD1 ARG 321.A HH22 2.769 1.930 ARG 321.A NH2 TYR 337.A O ARG 321.A HH21 2.751 1.997 GLY 322.A N ASP 279.A O GLY 322.A H 2.984 2.244 GLU 323.A N LEU 320.A O GLU 323.A H 3.185 2.335 ALA 325.A N VAL 318.A O ALA 325.A H 2.651 1.853 TYR 326.A N VAL 318.A O TYR 326.A H 3.165 2.451 ILE 327.A N GLN 330.A O ILE 327.A H.B 2.903 2.089 ASP 328.A N ARG 316.A O ASP 328.A H 3.248 2.440 GLY 329.A N TYR 326.A OH GLY 329.A H 3.025 2.372 GLN 330.A N ILE 327.A O GLN 330.A H 2.896 2.222 LEU 332.A N ALA 325.A O LEU 332.A H 2.963 2.141 GLY 336.A N ALA 63.A O GLY 336.A H 2.830 2.047 TYR 337.A N PRO 334.A O TYR 337.A H 3.094 2.251 TYR 337.A OH LEU 320.A O TYR 337.A HH 2.721 1.896 GLY 338.A N ALA 63.A O GLY 338.A H 2.842 2.004 GLN 339.A N ASP 66.A OD1 GLN 339.A H 2.857 2.084 VAL 341.A N PHE 67.A O VAL 341.A H 2.886 2.067 ARG 342.A N ASP 340.A OD1 ARG 342.A H 3.191 2.367 ARG 342.A NE ALA 88.A O ARG 342.A HE 2.918 2.070 ARG 342.A NH1 PHE 272.A O ARG 342.A HH12 3.285 2.586 ARG 342.A NH1 HIS 273.A O ARG 342.A HH12 3.040 2.336 ARG 342.A NH1 GLY 347.A O ARG 342.A HH11 3.019 2.260 ARG 342.A NH2 ALA 89.A O ARG 342.A HH21 3.083 2.326 ARG 342.A NH2 PHE 272.A O ARG 342.A HH22 2.878 2.048 LYS 343.A N ASP 340.A O LYS 343.A H 3.079 2.257 LYS 343.A NZ GLU 60.A OE2 LYS 343.A HZ2 3.175 2.544 LYS 343.A NZ ASP 340.A OD2 LYS 343.A HZ1 3.244 2.416 TRP 344.A N VAL 341.A O TRP 344.A H 3.115 2.331 TRP 344.A NE1 GLN 339.A OE1 TRP 344.A HE1 2.903 2.159 GLY 347.A N TRP 344.A O GLY 347.A H 3.025 2.257