Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8q28_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A OG ASP 224.A OD1 SER 1.A HG 2.514 1.900 LEU 2.A N ASP 224.A OD2 LEU 2.A H 2.936 2.034 ASN 4.A ND2 SER 1.A OG ASN 4.A HD22 2.716 1.907 PHE 5.A N ILE 222.A O PHE 5.A H 2.958 2.067 ASP 7.A N ILE 220.A O ASP 7.A H 2.848 2.020 PHE 9.A N ASP 7.A OD1 PHE 9.A H 2.918 2.064 ASN 15.A N VAL 44.A O ASN 15.A H 2.811 1.905 GLN 16.A N GLY 13.A O GLN 16.A H 3.189 2.349 GLN 16.A NE2 VAL 14.A O GLN 16.A HE21 3.138 2.361 GLN 17.A NE2 TRP 21.A O GLN 17.A HE21 2.924 2.173 SER 19.A N THR 12.A OG1 SER 19.A H 2.861 1.958 TRP 21.A N PRO 18.A O TRP 21.A H 3.234 2.337 TRP 21.A NE1 ASP 7.A OD2 TRP 21.A HE1 2.800 1.959 GLY 22.A N VAL 68.A O GLY 22.A H 2.900 2.127 ASN 23.A N ASN 30.A OD1 ASN 23.A H 3.013 2.135 ASN 23.A ND2 GLN 17.A OE1 ASN 23.A HD21 2.897 2.023 ASN 23.A ND2 ASN 31.A O ASN 23.A HD22 3.076 2.237 PHE 24.A N GLN 66.A O PHE 24.A H 2.976 2.099 VAL 25.A N GLN 28.A O VAL 25.A H 3.068 2.190 GLY 26.A N PRO 64.A O GLY 26.A H 2.852 1.961 GLN 28.A N VAL 25.A O GLN 28.A H 3.221 2.351 ASN 30.A N ASN 23.A O ASN 30.A H 2.870 1.961 ASN 31.A N ASN 23.A OD1 ASN 31.A H 2.967 2.284 ASN 31.A ND2 VAL 25.A O ASN 31.A HD21 2.933 2.049 ASN 33.A N ASN 31.A OD1 ASN 33.A H 2.798 1.929 ASN 34.A ND2 GLN 17.A OE1 ASN 34.A HD21 2.841 1.966 ASN 34.A ND2 ALA 42.A O ASN 34.A HD22 2.883 2.026 GLY 37.A N ASN 35.A OD1 GLY 37.A H 2.960 2.207 GLN 38.A N ASN 35.A O GLN 38.A H 3.076 2.212 TYR 41.A N LYS 59.A O TYR 41.A H 2.887 2.034 ALA 42.A N ASN 34.A OD1 ALA 42.A H 2.884 1.980 LEU 43.A N HIS 57.A O LEU 43.A H 3.007 2.105 VAL 44.A N GLN 16.A O VAL 44.A H 2.938 2.026 ASP 45.A N SER 55.A O ASP 45.A H 2.773 1.877 THR 47.A N ASP 45.A OD1 THR 47.A H 2.920 2.152 THR 47.A OG1 ASP 45.A OD1 THR 47.A HG1 2.660 1.818 THR 47.A OG1 ASP 45.A OD2 THR 47.A HG1 3.356 2.636 PHE 50.A N ASP 218.A OD2 PHE 50.A H 2.859 2.092 THR 51.A N ASP 218.A OD2 THR 51.A H 2.939 2.028 ASN 53.A N GLU 10.A OE1 ASN 53.A H 2.983 2.104 ASN 54.A N GLU 10.A OE2 ASN 54.A H 2.883 2.011 ASN 54.A ND2 PHE 9.A O ASN 54.A HD21 3.030 2.160 SER 55.A N ASP 45.A O SER 55.A H 2.902 2.011 HIS 57.A N LEU 43.A O HIS 57.A H 2.720 1.817 HIS 57.A NE2 ASP 215.A OD1 HIS 57.A HE2 2.722 1.888 PHE 58.A N VAL 216.A O PHE 58.A H 2.712 1.799 LYS 59.A N TYR 41.A O LYS 59.A H 2.812 1.909 LYS 59.A NZ ASP 215.A OD1 LYS 59.A HZ2 3.022 2.153 GLY 60.A N ALA 214.A O GLY 60.A H 3.212 2.311 GLY 61.A N ALA 63.A O GLY 61.A H 2.881 1.982 ALA 65.A N TRP 206.A O ALA 65.A H 3.013 2.116 ILE 67.A N PHE 204.A O ILE 67.A H 2.908 2.084 VAL 68.A N GLY 22.A O VAL 68.A H 2.928 2.138 ARG 69.A N ALA 202.A O ARG 69.A H 2.820 1.916 LEU 71.A N ASN 200.A O LEU 71.A H 2.828 1.923 LYS 77.A NZ ASP 76.A OD1 LYS 77.A HZ2 3.298 2.485 LYS 77.A NZ ASP 76.A OD2 LYS 77.A HZ2 3.073 2.421 TYR 79.A N SER 223.A O TYR 79.A H 2.810 1.952 LEU 80.A N VAL 154.A O LEU 80.A H 2.919 2.018 LYS 81.A N GLU 221.A O LYS 81.A H 2.932 2.162 LYS 81.A NZ ASP 219.A O LYS 81.A HZ1 2.928 2.042 LYS 81.A NZ GLU 221.A OE2 LYS 81.A HZ2 2.973 2.097 LYS 81.A NZ GLU 233.A OE2 LYS 81.A HZ3 2.770 1.897 ALA 82.A N VAL 152.A O ALA 82.A H 3.093 2.218 VAL 83.A N HIS 150.A O VAL 83.A H 2.870 2.041 TYR 84.A N TRP 217.A O TYR 84.A H 2.906 2.100 SER 85.A N ASP 215.A O SER 85.A H 2.931 2.099 LYS 86.A NZ LYS 87.A O LYS 86.A HZ1 2.882 2.079 LYS 86.A NZ GLU 91.A OE1 LYS 86.A HZ3 2.717 1.861 LYS 86.A NZ GLU 91.A OE2 LYS 86.A HZ3 3.343 2.723 LYS 86.A NZ GLU 97.A OE1 LYS 86.A HZ2 2.812 1.994 LYS 87.A NZ GLU 143.A OE2 LYS 87.A HZ2 3.460 2.624 LEU 88.A N ILE 144.A O LEU 88.A H 2.965 2.086 GLY 89.A N GLN 117.A OE1 GLY 89.A H 2.881 2.000 ASN 90.A ND2 GLU 143.A OE2 ASN 90.A HD21 3.113 2.246 GLU 91.A N GLY 120.A O GLU 91.A H 3.207 2.338 ASN 95.A N SER 210.A OG ASN 95.A H 2.869 2.029 ASN 95.A ND2 PHE 209.A O ASN 95.A HD21 2.926 2.092 GLU 97.A N GLN 117.A O GLU 97.A H 3.045 2.186 HIS 98.A N HIS 207.A O HIS 98.A H 2.898 2.005 ILE 99.A N PHE 115.A O ILE 99.A H 2.946 2.100 PHE 100.A N PHE 115.A O PHE 100.A H 3.177 2.266 GLY 101.A N PHE 203.A O GLY 101.A H 2.989 2.208 VAL 102.A N VAL 113.A O VAL 102.A H 3.208 2.392 ARG 103.A N TYR 201.A O ARG 103.A H 2.824 1.961 ARG 103.A NE GLU 112.A OE1 ARG 103.A HE 3.039 2.281 ARG 103.A NH1 GLN 66.A OE1 ARG 103.A HH12 2.850 2.037 ARG 103.A NH1 GLU 112.A OE1 ARG 103.A HH11 3.045 2.256 ARG 103.A NH2 GLN 66.A OE1 ARG 103.A HH21 3.197 2.475 GLY 104.A N ASN 111.A O GLY 104.A H 3.022 2.143 ALA 107.A N ASN 105.A OD1 ALA 107.A H 3.233 2.332 GLN 108.A N ASN 105.A O GLN 108.A H 3.348 2.450 VAL 113.A N VAL 102.A O VAL 113.A H 2.929 2.041 ARG 114.A N ASN 125.A O ARG 114.A H 2.859 2.106 ARG 114.A NE GLU 112.A OE2 ARG 114.A HE 2.684 1.817 ARG 114.A NH1 ASN 125.A OD1 ARG 114.A HH11 2.719 1.952 ARG 114.A NH2 ALA 109.A O ARG 114.A HH22 2.692 2.061 ARG 114.A NH2 GLU 112.A OE2 ARG 114.A HH22 3.274 2.604 PHE 115.A N PHE 100.A O PHE 115.A H 2.833 1.928 GLY 116.A N GLY 123.A O GLY 116.A H 2.948 2.047 GLN 117.A N GLU 97.A O GLN 117.A H 2.899 1.993 GLN 117.A NE2 GLU 91.A OE1 GLN 117.A HE22 2.912 2.087 GLN 117.A NE2 GLU 97.A OE1 GLN 117.A HE21 3.043 2.280 ILE 118.A N HIS 121.A O ILE 118.A H 2.832 1.954 LYS 119.A N ASN 95.A O LYS 119.A H 2.808 1.919 GLY 120.A N ASP 94.A OD2 GLY 120.A H 2.955 2.072 HIS 121.A N ILE 118.A O HIS 121.A H 2.677 1.768 HIS 121.A ND1 VAL 122.A O HIS 121.A HD1 2.749 1.892 GLY 123.A N GLY 116.A O GLY 123.A H 3.051 2.209 THR 124.A N SER 132.A O THR 124.A H 2.957 2.068 ASN 125.A N ARG 114.A O ASN 125.A H 3.042 2.147 ASN 125.A ND2 ASP 129.A OD1 ASN 125.A HD22 2.974 2.107 ASN 125.A ND2 ASP 130.A O ASN 125.A HD21 3.084 2.260 GLU 126.A N ASP 130.A O GLU 126.A H 3.020 2.122 SER 128.A N GLU 126.A OE1 SER 128.A H 2.805 2.084 ASP 129.A N GLU 126.A O ASP 129.A H 2.744 2.100 ILE 131.A N ASP 130.A OD1 ILE 131.A H 2.769 2.021 SER 132.A N THR 124.A O no hydrogen 2.792 N/A SER 132.A OG ASP 182.A O SER 132.A HG 2.716 1.903 GLN 135.A N ASN 184.A OD1 GLN 135.A H 2.663 1.907 GLN 137.A N PRO 134.A O GLN 137.A H 2.763 1.864 TRP 138.A N GLN 135.A O TRP 138.A H 2.950 2.053 TRP 138.A NE1 PRO 133.A O TRP 138.A HE1 3.032 2.180 TYR 139.A N LYS 119.A O TYR 139.A H 2.865 2.055 ILE 144.A N LEU 88.A O ILE 144.A H 2.739 1.835 HIS 150.A N VAL 83.A O HIS 150.A H 2.835 2.003 HIS 150.A NE2 ALA 145.A O HIS 150.A HE2 2.797 1.925 CYS 151.A N ASP 170.A OD1 CYS 151.A H 3.052 2.185 VAL 152.A N ALA 82.A O VAL 152.A H 2.928 2.020 VAL 153.A N TYR 168.A O VAL 153.A H 2.982 2.080 VAL 154.A N LEU 80.A O VAL 154.A H 2.817 1.912 GLU 155.A N HIS 166.A O GLU 155.A H 2.863 1.964 LEU 156.A N GLN 164.A O LEU 156.A H 2.846 1.946 GLY 157.A N ASP 76.A O GLY 157.A H 2.773 2.070 ARG 160.A N GLY 158.A O ARG 160.A H 3.076 2.343 ARG 160.A NE GLY 157.A O ARG 160.A HE 2.901 2.060 HIS 163.A N THR 192.A O HIS 163.A H 2.952 2.045 HIS 163.A NE2 GLY 158.A O HIS 163.A HE2 2.812 2.009 GLN 164.A N LEU 156.A O GLN 164.A H 2.950 2.045 LEU 165.A N ILE 177.A O LEU 165.A H 3.088 2.219 HIS 166.A N GLU 155.A O HIS 166.A H 2.843 1.954 HIS 166.A ND1 SER 176.A OG HIS 166.A HD1 2.933 2.086 HIS 166.A NE2 GLN 164.A OE1 HIS 166.A HE2 2.896 2.019 ALA 167.A N HIS 175.A O ALA 167.A H 2.860 1.953 TYR 168.A N VAL 153.A O TYR 168.A H 2.854 2.000 TYR 168.A OH GLU 155.A OE1 TYR 168.A HH 2.724 1.899 LEU 169.A N GLN 172.A O LEU 169.A H 2.839 1.949 ASP 170.A N CYS 151.A O ASP 170.A H 2.784 1.893 ASN 171.A ND2 CYS 229.A O ASN 171.A HD22 3.253 2.414 GLN 172.A N LEU 169.A O GLN 172.A H 2.902 2.021 GLN 172.A NE2 ASP 170.A O GLN 172.A HE21 3.247 2.389 ILE 174.A N ALA 167.A O ILE 174.A H 2.816 1.904 HIS 175.A NE2 THR 124.A OG1 HIS 175.A HE2 2.889 2.165 ILE 177.A N LEU 165.A O ILE 177.A H 2.798 1.897 ASP 178.A N ASP 182.A OD2 ASP 178.A H 2.839 1.948 SER 179.A N ASP 182.A OD2 SER 179.A H 3.065 2.213 SER 179.A OG SER 181.A OG SER 179.A HG 3.393 2.664 ASP 182.A N SER 179.A O ASP 182.A H 3.000 2.109 TRP 183.A N ILE 180.A O TRP 183.A H 3.264 2.363 ASN 184.A N ILE 131.A O ASN 184.A H 2.861 2.075 ASN 184.A ND2 ASN 185.A OD1 ASN 184.A HD21 2.775 1.917 ASN 185.A N ASP 130.A OD1 ASN 185.A H 2.862 2.058 VAL 188.A N ASP 130.A OD2 VAL 188.A H 2.694 1.790 ASN 191.A N VAL 188.A O ASN 191.A H 3.266 2.400 GLN 193.A N ASN 191.A OD1 GLN 193.A H 2.707 1.944 GLN 193.A NE2 ARG 160.A O GLN 193.A HE22 3.001 2.170 GLN 193.A NE2 THR 192.A OG1 GLN 193.A HE21 3.198 2.334 TRP 194.A NE1 HIS 163.A O TRP 194.A HE1 2.966 2.312 ASP 196.A N GLN 193.A O ASP 196.A H 2.958 2.052 LYS 198.A N LEU 195.A O LYS 198.A H 3.045 2.183 LYS 198.A NZ ASN 111.A OD1 LYS 198.A HZ2 3.059 2.211 LYS 198.A NZ GLU 126.A OE2 LYS 198.A HZ3 2.775 1.873 ASN 200.A ND2 GLY 104.A O ASN 200.A HD21 3.089 2.216 TYR 201.A N ARG 103.A O TYR 201.A H 3.021 2.231 ALA 202.A N ARG 69.A O ALA 202.A H 2.836 1.993 PHE 203.A N GLY 101.A O PHE 203.A H 2.908 2.008 PHE 204.A N ILE 67.A O PHE 204.A H 3.008 2.125 GLY 205.A N ILE 99.A O GLY 205.A H 2.982 2.160 TRP 206.A N ALA 65.A O TRP 206.A H 2.988 2.115 TRP 206.A NE1 ASN 212.A O TRP 206.A HE1 3.065 2.199 HIS 207.A N HIS 98.A O HIS 207.A H 3.196 2.502 SER 208.A N GLY 61.A O SER 208.A H 2.887 1.976 SER 208.A OG GLU 97.A OE2 SER 208.A HG 2.603 1.765 PHE 209.A N HIS 96.A O PHE 209.A H 2.794 1.982 SER 210.A N SER 208.A OG SER 210.A H 3.026 2.169 SER 210.A OG HIS 96.A O SER 210.A HG 3.444 2.741 ASN 212.A N SER 208.A OG ASN 212.A H 3.138 2.243 ASN 212.A ND2 GLU 97.A OE2 ASN 212.A HD21 2.799 1.945 ALA 214.A N GLY 60.A O ALA 214.A H 2.895 2.028 ASP 215.A N SER 85.A OG ASP 215.A H 3.067 2.176 VAL 216.A N PHE 58.A O VAL 216.A H 2.884 1.980 TRP 217.A N TYR 84.A O TRP 217.A H 2.803 1.901 TRP 217.A NE1 ASP 45.A OD2 TRP 217.A HE1 2.755 1.892 ASP 219.A N ASP 218.A OD1 ASP 219.A H 2.932 2.207 ILE 220.A N ASP 7.A O ILE 220.A H 2.905 2.157 GLU 221.A N LYS 81.A O GLU 221.A H 2.818 1.918 ILE 222.A N PHE 5.A O ILE 222.A H 3.018 2.135 SER 223.A N TYR 79.A O SER 223.A H 3.030 2.161 SER 223.A OG ASN 4.A OD1 SER 223.A HG 2.935 2.219 ASP 224.A N ILE 3.A O ASP 224.A H 3.149 2.326 GLN 225.A N SER 223.A OG GLN 225.A H 2.895 2.001 CYS 229.A N ASN 171.A OD1 CYS 229.A H 3.238 2.396 CYS 229.A SG ASN 171.A OD1 no hydrogen 3.358 N/A ASP 230.A N GLU 233.A OE1 ASP 230.A H 2.999 2.105 ARG 232.A NH1 THR 51.A OG1 ARG 232.A HH12 2.909 2.234 ARG 232.A NH2 PHE 50.A O ARG 232.A HH21 2.704 1.959 GLU 233.A N ASP 230.A OD1 GLU 233.A H 2.936 2.042 LEU 234.A N ASP 230.A O LEU 234.A H 2.964 2.158 GLU 235.A N SER 231.A O GLU 235.A H 3.227 2.501 GLU 235.A N ARG 232.A O GLU 235.A H 3.111 2.376