Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8rp3_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 5.A N LEU 29.A O LEU 5.A H 2.903 2.018 SER 6.A N GLY 3.A O SER 6.A H 3.208 2.345 LEU 8.A N LEU 5.A O LEU 8.A H 2.876 1.986 ARG 9.A N ASP 73.A OD2 ARG 9.A H 3.056 2.321 VAL 10.A N ASP 32.A O VAL 10.A H 2.920 2.050 VAL 11.A N VAL 74.A O VAL 11.A H 2.771 1.867 GLU 12.A N VAL 34.A O GLU 12.A H 2.921 2.024 LEU 13.A N ILE 76.A O LEU 13.A H 2.789 1.899 ALA 14.A N ILE 36.A O ALA 14.A H 3.232 2.436 HIS 21.A N GLY 17.A O HIS 21.A H 3.280 2.531 HIS 21.A N PRO 18.A O HIS 21.A H 2.779 2.094 ALA 22.A N PRO 18.A O ALA 22.A H 3.086 2.204 ALA 23.A N GLY 19.A O ALA 23.A H 3.017 2.113 MET 24.A N PRO 20.A O MET 24.A H 2.843 2.035 ILE 25.A N HIS 21.A O ILE 25.A H 3.235 2.416 LEU 26.A N ALA 22.A O LEU 26.A H 3.148 2.238 GLY 27.A N ALA 23.A O GLY 27.A H 2.927 2.015 ASP 28.A N MET 24.A O ASP 28.A H 2.806 1.894 LEU 29.A N LEU 26.A O LEU 29.A H 2.869 2.079 GLY 30.A N GLY 27.A O GLY 30.A H 2.837 1.962 ALA 31.A N LEU 26.A O ALA 31.A H 3.143 2.247 ASP 32.A N LEU 8.A O ASP 32.A H 2.904 2.002 VAL 34.A N VAL 10.A O VAL 34.A H 2.788 1.969 ARG 35.A N ARG 50.A O ARG 35.A H 2.915 2.009 ARG 35.A NE ASP 37.A OD2 ARG 35.A HE 3.358 2.597 ARG 35.A NH1 GLU 12.A OE2 ARG 35.A HH11 3.025 2.238 ARG 35.A NH2 ASP 37.A OD2 ARG 35.A HH21 3.315 2.538 ILE 36.A N GLU 12.A O ILE 36.A H 2.989 2.081 ASP 37.A N VAL 52.A O ASP 37.A H 2.817 1.918 ASP 43.A N SER 41.A OG ASP 43.A H 2.885 2.029 MET 45.A N ASP 43.A OD1 MET 45.A H 2.668 1.825 LEU 46.A N ASP 43.A O LEU 46.A H 3.429 2.620 ARG 47.A N ALA 44.A O ARG 47.A H 2.906 2.138 ARG 47.A NE ASP 28.A OD1 ARG 47.A HE 2.903 2.151 ARG 47.A NH1 PRO 323.A O ARG 47.A HH12 2.774 1.984 ARG 47.A NH2 ASP 28.A OD2 ARG 47.A HH21 2.820 1.940 ARG 47.A NH2 PRO 323.A O ARG 47.A HH22 2.969 2.236 ASN 48.A N ARG 338.A O ASN 48.A H 3.064 2.178 ASN 48.A ND2 ASP 28.A OD1 ASN 48.A HD22 3.083 2.218 ARG 49.A NE GLU 12.A OE1 ARG 49.A HE 2.802 1.963 ARG 49.A NH1 MET 45.A O ARG 49.A HH12 2.669 1.974 ARG 49.A NH1 ARG 47.A O ARG 49.A HH11 2.835 2.086 ARG 49.A NH2 GLU 12.A OE1 ARG 49.A HH21 3.396 2.736 ARG 50.A N VAL 33.A O ARG 50.A H 3.023 2.143 ARG 50.A NH1 ASP 352.A OD2 ARG 50.A HH12 3.021 2.324 ARG 50.A NH2 ASP 32.A OD1 ARG 50.A HH21 3.162 2.371 ARG 50.A NH2 ASP 32.A OD2 ARG 50.A HH21 3.106 2.512 ARG 50.A NH2 ASP 352.A OD2 ARG 50.A HH22 2.852 2.178 VAL 52.A N ARG 35.A O VAL 52.A H 2.660 1.757 ALA 54.A N ASP 37.A O ALA 54.A H 3.241 2.328 LYS 57.A N ASP 55.A OD1 LYS 57.A H 2.864 2.079 SER 58.A N ASP 55.A O SER 58.A H 2.923 2.114 LEU 62.A N SER 58.A O LEU 62.A H 2.968 2.105 GLU 63.A N ASP 59.A O GLU 63.A H 3.264 2.500 LEU 64.A N GLN 60.A O LEU 64.A H 3.254 2.427 ALA 65.A N GLY 61.A O ALA 65.A H 2.892 1.987 LEU 66.A N LEU 62.A O LEU 66.A H 3.286 2.386 LYS 67.A N GLU 63.A O LYS 67.A H 3.232 2.378 LEU 68.A N LEU 64.A O LEU 68.A H 3.223 2.433 ILE 69.A N ALA 65.A O ILE 69.A H 2.775 1.870 ALA 70.A N LEU 66.A O ALA 70.A H 2.829 1.961 LYS 71.A N LEU 68.A O LYS 71.A H 3.042 2.205 ALA 72.A N ILE 69.A O ALA 72.A H 3.011 2.152 ASP 73.A N ARG 9.A O ASP 73.A H 2.608 1.871 VAL 74.A N ARG 9.A O VAL 74.A H 3.081 2.305 LEU 75.A N ILE 102.A O LEU 75.A H 2.958 2.059 ILE 76.A N VAL 11.A O ILE 76.A H 2.836 1.959 GLU 77.A N ALA 104.A O GLU 77.A H 3.290 2.422 TYR 79.A N GLU 77.A OE1 TYR 79.A H 2.796 1.949 VAL 83.A N ARG 80.A O VAL 83.A H 2.977 2.104 GLU 85.A N GLU 85.A OE1 GLU 85.A H 2.976 2.227 ARG 86.A N GLY 82.A O ARG 86.A H 3.248 2.484 ARG 86.A N VAL 83.A O ARG 86.A H 3.302 2.623 LEU 87.A N VAL 83.A O LEU 87.A H 3.272 2.384 GLY 88.A N GLU 85.A O GLY 88.A H 3.024 2.277 LEU 89.A N THR 84.A O LEU 89.A H 2.841 2.119 CYS 94.A N GLY 90.A O CYS 94.A H 3.342 2.447 ALA 95.A N PRO 91.A O ALA 95.A H 3.103 2.352 LYS 96.A N GLU 92.A O LYS 96.A H 3.379 2.492 VAL 97.A N CYS 94.A O VAL 97.A H 3.251 2.468 ASN 98.A N ALA 95.A O ASN 98.A H 3.169 2.381 ASN 98.A ND2 ILE 69.A O ASN 98.A HD22 3.022 2.175 ASN 98.A ND2 ALA 72.A O ASN 98.A HD21 2.856 2.219 ARG 100.A N ASN 98.A OD1 ARG 100.A H 2.970 2.231 LEU 101.A N ASN 98.A O LEU 101.A H 3.358 2.514 ILE 102.A N ASP 73.A O ILE 102.A H 3.077 2.194 TYR 103.A N GLN 177.A O TYR 103.A H 2.921 2.028 ALA 104.A N LEU 75.A O ALA 104.A H 2.956 2.087 ARG 105.A N VAL 179.A O ARG 105.A H 2.799 1.894 ARG 105.A NE GLU 77.A OE2 ARG 105.A HE 2.586 1.723 ARG 105.A NH1 GLU 85.A OE2 ARG 105.A HH12 3.108 2.348 ARG 105.A NH2 GLU 77.A OE2 ARG 105.A HH21 3.363 2.746 ARG 105.A NH2 GLU 85.A OE1 ARG 105.A HH22 2.587 1.743 ARG 105.A NH2 GLU 85.A OE2 ARG 105.A HH22 3.447 2.698 MET 106.A N GLU 77.A O MET 106.A H 3.027 2.139 THR 107.A N ALA 181.A O THR 107.A H 3.014 2.102 GLN 111.A N ASP 180.A OD2 GLN 111.A H 3.424 2.548 SER 116.A N GLY 113.A O SER 116.A H 2.807 1.916 GLN 117.A NE2 PRO 81.A O GLN 117.A HE21 2.806 1.931 GLN 118.A N ARG 115.A O GLN 118.A H 2.727 1.819 ALA 121.A N ASN 124.A OD1 ALA 121.A H 2.863 1.966 ASN 124.A N ALA 121.A O ASN 124.A H 2.970 2.278 TYR 125.A N ALA 121.A O TYR 125.A H 3.271 2.422 ILE 126.A N ASP 122.A O ILE 126.A H 3.191 2.303 SER 127.A N ASN 124.A O SER 127.A H 3.138 2.446 ASN 129.A ND2 VAL 184.A O ASN 129.A HD22 2.891 2.115 ASN 129.A ND2 SER 187.A OG ASN 129.A HD21 2.843 2.221 ASN 129.A ND2 SER 188.A OG ASN 129.A HD22 3.286 2.525 ILE 131.A N ASN 129.A OD1 ILE 131.A H 3.370 2.515 LEU 132.A N ILE 126.A O LEU 132.A H 2.968 2.068 ALA 134.A N ILE 131.A O ALA 134.A H 2.963 2.154 ILE 135.A N LEU 132.A O ILE 135.A H 3.162 2.260 ARG 137.A NH1 ASP 220.A OD1 ARG 137.A HH12 3.057 2.417 ARG 137.A NH2 ASP 220.A OD1 ARG 137.A HH22 2.788 1.961 VAL 143.A N ILE 135.A O VAL 143.A H 3.106 2.214 ASN 147.A ND2 ASP 151.A OD2 ASN 147.A HD22 2.993 2.147 LEU 148.A N PRO 145.A O LEU 148.A H 3.114 2.237 GLY 150.A N ASP 122.A OD2 GLY 150.A H 2.466 1.743 ASP 151.A N ASP 122.A OD2 ASP 151.A H 2.772 1.936 GLY 153.A N LEU 148.A O GLY 153.A H 2.933 2.068 GLY 154.A N VAL 149.A O GLY 154.A H 2.729 1.950 GLY 155.A N PHE 152.A O GLY 155.A H 2.960 2.099 SER 156.A N ASP 151.A O SER 156.A H 2.838 1.987 MET 157.A N PHE 152.A O MET 157.A H 2.993 2.084 LEU 159.A N GLY 155.A O LEU 159.A H 2.941 2.060 LEU 160.A N SER 156.A O LEU 160.A H 2.806 1.931 VAL 161.A N MET 157.A O VAL 161.A H 2.987 2.075 GLY 162.A N PHE 158.A O GLY 162.A H 2.850 1.968 ILE 163.A N LEU 159.A O ILE 163.A H 2.737 1.839 LEU 164.A N LEU 160.A O LEU 164.A H 2.823 1.954 ALA 165.A N VAL 161.A O ALA 165.A H 2.937 2.052 ALA 166.A N GLY 162.A O ALA 166.A H 3.023 2.195 LEU 167.A N ILE 163.A O LEU 167.A H 3.118 2.387 LEU 167.A N LEU 164.A O LEU 167.A H 3.221 2.573 TRP 168.A N LEU 164.A O TRP 168.A H 3.044 2.133 GLU 169.A N ALA 165.A O GLU 169.A H 3.048 2.149 ARG 170.A N ALA 166.A O ARG 170.A H 2.983 2.188 ARG 170.A NH1 ASP 73.A OD1 ARG 170.A HH12 3.202 2.431 ARG 170.A NH1 ARG 100.A O ARG 170.A HH11 2.862 2.008 ARG 170.A NH2 ASP 73.A OD1 ARG 170.A HH22 3.150 2.416 GLN 171.A N LEU 167.A O GLN 171.A H 3.206 2.560 GLN 171.A N TRP 168.A O GLN 171.A H 3.168 2.381 SER 172.A N GLU 169.A O SER 172.A H 3.253 2.360 SER 173.A N GLU 169.A O SER 173.A H 2.988 2.090 GLY 174.A N ARG 170.A O GLY 174.A H 2.586 1.859 LYS 175.A N SER 173.A OG LYS 175.A H 3.016 2.160 GLY 176.A N ASP 99.A O GLY 176.A H 3.022 2.109 VAL 179.A N TYR 103.A O VAL 179.A H 2.972 2.159 ALA 181.A N ARG 105.A O ALA 181.A H 2.954 2.158 MET 183.A N THR 107.A O MET 183.A H 2.892 2.006 VAL 184.A N GLY 108.A O VAL 184.A H 2.976 2.146 ASP 185.A N ALA 182.A O ASP 185.A H 2.855 2.124 GLY 186.A N ALA 182.A O GLY 186.A H 2.814 1.906 SER 187.A N MET 183.A O SER 187.A H 2.891 1.993 VAL 189.A N ASP 185.A O VAL 189.A H 3.087 2.199 LEU 190.A N GLY 186.A O LEU 190.A H 3.005 2.256 ILE 191.A N SER 187.A O ILE 191.A H 2.916 2.140 ILE 191.A N SER 188.A O ILE 191.A H 3.121 2.469 GLN 192.A N VAL 189.A O GLN 192.A H 3.312 2.454 MET 194.A N ILE 191.A O MET 194.A H 2.916 2.182 ALA 196.A N GLN 192.A O ALA 196.A H 3.188 2.294 MET 197.A N MET 193.A O MET 197.A H 2.902 2.025 ARG 198.A N MET 194.A O ARG 198.A H 2.894 2.249 ARG 198.A NE ASP 205.A OD1 ARG 198.A HE 2.622 1.971 ARG 198.A NH1 ASP 205.A OD2 ARG 198.A HH11 3.205 2.555 THR 200.A N MET 197.A O THR 200.A H 3.316 2.422 THR 200.A OG1 MET 197.A O THR 200.A HG1 3.072 2.434 GLY 201.A N ARG 198.A O GLY 201.A H 3.326 2.462 MET 202.A N MET 197.A O MET 202.A H 2.972 2.264 THR 204.A N ASN 210.A OD1 THR 204.A H 3.058 2.298 ARG 207.A NH1 GLU 140.A O ARG 207.A HH11 2.603 1.870 ARG 207.A NH2 HIS 133.A O ARG 207.A HH21 2.953 2.123 ASN 210.A N ASP 213.A OD1 ASN 210.A H 3.130 2.267 ASN 210.A ND2 THR 204.A O ASN 210.A HD21 3.085 2.205 ASN 210.A ND2 ASP 213.A OD2 ASN 210.A HD22 2.968 2.151 GLY 215.A N ASP 213.A OD1 GLY 215.A H 2.866 2.115 TYR 219.A N ALA 216.A O TYR 219.A H 3.116 2.214 ASP 220.A N VAL 232.A O ASP 220.A H 3.128 2.285 TYR 222.A N VAL 230.A O TYR 222.A H 2.953 2.094 CYS 224.A N ARG 228.A O CYS 224.A H 2.628 1.796 ALA 225.A N HIS 277.A O ALA 225.A H 2.873 1.965 GLY 227.A N CYS 224.A O GLY 227.A H 3.066 2.212 ARG 228.A N ASP 226.A OD1 ARG 228.A H 3.269 2.411 ARG 228.A NH1 ASP 226.A OD2 ARG 228.A HH11 2.906 2.059 VAL 230.A N TYR 222.A O VAL 230.A H 3.035 2.181 ALA 231.A N THR 294.A O ALA 231.A H 2.761 1.860 VAL 232.A N ASP 220.A O VAL 232.A H 2.886 1.991 GLY 233.A N CYS 292.A O GLY 233.A H 2.779 1.877 ALA 234.A N TYR 218.A O ALA 234.A H 2.862 2.110 GLN 238.A N GLN 238.A OE1 GLN 238.A H 2.463 1.658 TYR 240.A N GLU 236.A O TYR 240.A H 2.790 1.902 ALA 241.A N PRO 237.A O ALA 241.A H 3.095 2.326 ALA 242.A N GLN 238.A O ALA 242.A H 3.177 2.272 MET 243.A N PHE 239.A O MET 243.A H 3.089 2.200 LEU 244.A N TYR 240.A O LEU 244.A H 3.023 2.155 ALA 245.A N ALA 241.A O ALA 245.A H 2.929 2.116 GLY 246.A N ALA 242.A O GLY 246.A H 3.063 2.157 LEU 247.A N MET 243.A O LEU 247.A H 3.177 2.362 GLY 248.A N ALA 245.A O GLY 248.A H 2.592 1.895 LEU 249.A N LEU 244.A O LEU 249.A H 2.810 1.904 GLU 253.A N ASP 250.A O GLU 253.A H 2.869 1.980 LEU 254.A N ALA 251.A O LEU 254.A H 2.867 1.990 GLN 257.A NE2 ILE 235.A O GLN 257.A HE21 2.650 1.842 ASP 259.A N PRO 256.A O ASP 259.A H 3.216 2.345 ARG 260.A N ASN 258.A O ARG 260.A H 2.992 2.316 ARG 260.A NH2 ALA 209.A O ARG 260.A HH22 3.101 2.290 ARG 262.A N ASP 259.A O ARG 262.A H 2.685 1.821 ARG 262.A NE GLU 265.A OE1 ARG 262.A HE 3.234 2.479 ARG 262.A NH1 ASP 259.A OD2 ARG 262.A HH11 3.427 2.832 ARG 262.A NH2 GLU 265.A OE2 ARG 262.A HH21 3.545 2.694 TRP 263.A N ARG 260.A O TRP 263.A H 3.122 2.273 TRP 263.A NE1 GLN 257.A O TRP 263.A HE1 2.799 1.949 LEU 266.A N ARG 262.A O LEU 266.A H 2.900 2.009 ARG 267.A N TRP 263.A O ARG 267.A H 2.881 2.055 ARG 267.A NH2 GLY 215.A O ARG 267.A HH21 3.185 2.546 ALA 268.A N PRO 264.A O ALA 268.A H 2.950 2.085 LEU 269.A N GLU 265.A O LEU 269.A H 3.019 2.131 LEU 270.A N LEU 266.A O LEU 270.A H 2.967 2.097 THR 271.A N ARG 267.A O THR 271.A H 2.790 1.894 GLU 272.A N ALA 268.A O GLU 272.A H 2.976 2.087 ALA 273.A N LEU 269.A O ALA 273.A H 3.032 2.132 PHE 274.A N LEU 270.A O PHE 274.A H 2.981 2.156 ALA 275.A N THR 271.A O ALA 275.A H 2.945 2.102 SER 276.A N ALA 273.A O SER 276.A H 3.208 2.402 ARG 279.A N ASP 226.A OD1 ARG 279.A H 3.318 2.571 ARG 279.A NE ASP 280.A OD1 ARG 279.A HE 3.018 2.189 ARG 279.A NH1 VAL 296.A O ARG 279.A HH11 3.075 2.254 ARG 279.A NH1 GLU 301.A OE1 ARG 279.A HH12 2.725 1.871 ARG 279.A NH2 ASP 280.A OD1 ARG 279.A HH21 3.040 2.229 ARG 279.A NH2 GLU 301.A OE2 ARG 279.A HH22 3.112 2.270 HIS 281.A N ASP 278.A OD1.B HIS 281.A H 3.196 2.415 TRP 282.A N ARG 279.A O TRP 282.A H 2.873 2.223 TRP 282.A NE1 PHE 274.A O TRP 282.A HE1 2.940 2.177 GLY 283.A N ARG 279.A O GLY 283.A H 2.827 1.940 ALA 284.A N ASP 280.A O ALA 284.A H 3.047 2.155 VAL 285.A N HIS 281.A O VAL 285.A H 3.037 2.141 PHE 286.A N TRP 282.A O PHE 286.A H 2.847 2.055 ALA 287.A N ALA 284.A O ALA 287.A H 2.991 2.088 THR 294.A N ALA 231.A O THR 294.A H 3.098 2.237 VAL 296.A N TYR 229.A O VAL 296.A H 2.791 1.896 ALA 298.A N GLU 301.A OE1 ALA 298.A H 3.323 2.458 GLU 301.A N ALA 298.A O GLU 301.A H 2.698 1.808 VAL 302.A N PHE 299.A O VAL 302.A H 3.155 2.285 ASN 304.A N GLU 301.A O ASN 304.A H 3.479 2.615 GLU 305.A N VAL 302.A O GLU 305.A H 3.115 2.218 ILE 308.A N GLU 305.A O ILE 308.A H 2.864 2.089 ILE 309.A N GLU 305.A O ILE 309.A H 3.095 2.243 GLU 310.A N PRO 306.A O GLU 310.A H 2.934 2.072 ASN 312.A N ILE 309.A O ASN 312.A H 3.129 2.245 THR 313.A N ILE 308.A O THR 313.A H 3.460 2.565 TYR 315.A N GLN 322.A O TYR 315.A H 2.975 2.094 ALA 317.A N GLY 320.A O ALA 317.A H 2.856 1.996 GLN 322.A N TYR 315.A O GLN 322.A H 2.914 2.024 MET 324.A N THR 313.A O MET 324.A H 2.806 1.936 ARG 328.A NH1 ARG 311.A O ARG 328.A HH12 2.904 2.145 ARG 328.A NH2 ARG 311.A O ARG 328.A HH22 2.797 2.058 ARG 338.A N ASN 48.A OD1 ARG 338.A H 2.791 1.964 ALA 348.A N ASP 345.A O ALA 348.A H 3.195 2.440 VAL 349.A N ILE 346.A O VAL 349.A H 3.180 2.391 LEU 350.A N ILE 346.A O LEU 350.A H 3.245 2.338 THR 351.A N GLU 347.A O THR 351.A H 3.057 2.202 ASP 352.A N ALA 348.A O ASP 352.A H 3.089 2.201 TRP 353.A N VAL 349.A O TRP 353.A H 2.635 1.753 TRP 353.A NE1 ASP 32.A OD2 TRP 353.A HE1 2.677 1.819 ASP 354.A N ASP 352.A O ASP 354.A H 2.646 1.852