Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8rp4_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 5.A N LEU 29.A O LEU 5.A H 2.833 1.950 SER 6.A N GLY 3.A O SER 6.A H 3.126 2.239 LEU 8.A N LEU 5.A O LEU 8.A H 2.919 2.019 ARG 9.A N ASP 73.A OD2 ARG 9.A H 2.908 2.046 ARG 9.A NH2 ASP 354.A OD1 ARG 9.A HH21 3.224 2.401 VAL 10.A N ASP 32.A O VAL 10.A H 2.905 2.023 VAL 11.A N VAL 74.A O VAL 11.A H 2.730 1.830 GLU 12.A N VAL 34.A O GLU 12.A H 2.847 1.950 LEU 13.A N ILE 76.A O LEU 13.A H 2.876 1.964 ALA 14.A N ILE 36.A O ALA 14.A H 2.938 2.052 HIS 21.A N GLY 17.A O HIS 21.A H 3.297 2.456 ALA 22.A N PRO 18.A O ALA 22.A H 2.996 2.083 ALA 23.A N GLY 19.A O ALA 23.A H 3.029 2.125 MET 24.A N PRO 20.A O MET 24.A H 2.912 2.062 ILE 25.A N HIS 21.A O ILE 25.A H 3.069 2.235 LEU 26.A N ALA 22.A O LEU 26.A H 3.050 2.164 GLY 27.A N ALA 23.A O GLY 27.A H 2.940 2.035 ASP 28.A N MET 24.A O ASP 28.A H 2.732 1.863 LEU 29.A N ILE 25.A O LEU 29.A H 3.155 2.400 LEU 29.A N LEU 26.A O LEU 29.A H 3.191 2.473 GLY 30.A N GLY 27.A O GLY 30.A H 3.020 2.171 ALA 31.A N LEU 26.A O ALA 31.A H 2.985 2.153 ASP 32.A N LEU 8.A O ASP 32.A H 2.902 2.009 VAL 34.A N VAL 10.A O VAL 34.A H 2.854 1.959 ARG 35.A N ARG 50.A O ARG 35.A H 2.774 1.871 ARG 35.A NH1 GLU 12.A OE2 ARG 35.A HH12 2.807 2.024 ARG 35.A NH1 GLY 15.A O ARG 35.A HH11 3.452 2.597 ILE 36.A N GLU 12.A O ILE 36.A H 2.817 1.952 ASP 37.A N VAL 52.A O ASP 37.A H 2.943 2.033 ARG 38.A N ASP 37.A OD1 ARG 38.A H 2.963 2.179 ASP 43.A N SER 41.A OG ASP 43.A H 2.825 2.098 MET 45.A N ASP 43.A OD1 MET 45.A H 2.738 1.906 LEU 46.A N ASP 43.A O LEU 46.A H 2.696 1.879 ARG 47.A N ALA 44.A O ARG 47.A H 3.053 2.269 ARG 47.A NE ASP 28.A OD1 ARG 47.A HE 2.834 2.028 ARG 47.A NH1 PRO 323.A O ARG 47.A HH11 2.906 2.152 ARG 47.A NH2 ASP 28.A OD2 ARG 47.A HH22 2.734 1.881 ARG 47.A NH2 PRO 323.A O ARG 47.A HH21 3.124 2.401 ASN 48.A N ARG 338.A O ASN 48.A H 2.941 2.037 ASN 48.A ND2 ASP 28.A OD1 ASN 48.A HD21 2.905 2.107 ARG 49.A NH1 GLU 12.A OE1 ARG 49.A HH12 3.181 2.360 ARG 49.A NH1 GLU 12.A OE2 ARG 49.A HH12 3.283 2.514 ARG 49.A NH1 PRO 20.A O ARG 49.A HH11 2.951 2.346 ARG 49.A NH2 MET 45.A O ARG 49.A HH21 2.586 1.834 ARG 49.A NH2 ARG 47.A O ARG 49.A HH22 2.866 2.097 ARG 50.A N VAL 33.A O ARG 50.A H 2.989 2.090 ARG 50.A NH1 ASP 352.A OD2 ARG 50.A HH11 2.752 1.988 ARG 50.A NH2 ASP 32.A OD1 ARG 50.A HH22 2.899 2.235 ARG 50.A NH2 ASP 352.A OD2 ARG 50.A HH21 3.117 2.409 VAL 52.A N ARG 35.A O VAL 52.A H 2.846 1.938 ALA 54.A N ASP 37.A O ALA 54.A H 3.080 2.197 LYS 57.A N ASP 55.A OD1 LYS 57.A H 3.049 2.209 SER 58.A N ASP 55.A O SER 58.A H 3.134 2.259 GLY 61.A N SER 58.A OG GLY 61.A H 3.150 2.286 LEU 62.A N SER 58.A O LEU 62.A H 3.062 2.160 GLU 63.A N ASP 59.A O GLU 63.A H 3.135 2.354 LEU 64.A N GLN 60.A O LEU 64.A H 2.941 2.102 ALA 65.A N GLY 61.A O ALA 65.A H 2.832 1.964 LEU 66.A N LEU 62.A O LEU 66.A H 2.972 2.096 LYS 67.A N GLU 63.A O LYS 67.A H 3.070 2.230 LEU 68.A N LEU 64.A O LEU 68.A H 3.064 2.208 ILE 69.A N ALA 65.A O ILE 69.A H 2.771 1.908 ALA 70.A N LEU 66.A O ALA 70.A H 2.890 2.125 LYS 71.A N LEU 68.A O LYS 71.A H 3.102 2.341 LYS 71.A NZ ASP 354.A OD2 LYS 71.A HZ3 2.982 2.082 ALA 72.A N ILE 69.A O ALA 72.A H 3.129 2.239 ASP 73.A N ARG 9.A O ASP 73.A H 2.706 1.976 VAL 74.A N ARG 9.A O VAL 74.A H 2.983 2.178 LEU 75.A N ILE 102.A O LEU 75.A H 2.962 2.059 ILE 76.A N VAL 11.A O ILE 76.A H 2.822 1.930 GLU 77.A N ALA 104.A O GLU 77.A H 3.052 2.149 TYR 79.A N GLU 77.A OE1 TYR 79.A H 2.993 2.154 ARG 80.A NH1 GLN 117.A O ARG 80.A HH12 2.658 1.866 VAL 83.A N ARG 80.A O VAL 83.A H 3.167 2.286 GLU 85.A N GLU 85.A OE1 GLU 85.A H 2.815 2.064 ARG 86.A N GLY 82.A O ARG 86.A H 3.075 2.241 LEU 87.A N VAL 83.A O LEU 87.A H 3.173 2.379 GLY 88.A N GLU 85.A O GLY 88.A H 3.262 2.395 LEU 89.A N THR 84.A O LEU 89.A H 2.841 1.966 CYS 94.A N GLY 90.A O CYS 94.A H 3.012 2.122 ALA 95.A N PRO 91.A O ALA 95.A H 2.893 2.057 LYS 96.A N GLU 92.A O LYS 96.A H 3.291 2.459 LYS 96.A NZ GLU 93.A OE2 LYS 96.A HZ2 3.330 2.435 VAL 97.A N CYS 94.A O VAL 97.A H 3.034 2.341 ASN 98.A N CYS 94.A O ASN 98.A H 2.784 2.114 ASN 98.A ND2 ILE 69.A O ASN 98.A HD21 2.959 2.101 ASN 98.A ND2 ALA 72.A O ASN 98.A HD22 2.981 2.222 ARG 100.A N ASN 98.A OD1 ARG 100.A H 3.002 2.270 LEU 101.A N ASN 98.A O LEU 101.A H 3.462 2.590 ILE 102.A N ASP 73.A O ILE 102.A H 2.835 1.924 TYR 103.A N GLN 177.A O TYR 103.A H 2.982 2.082 ALA 104.A N LEU 75.A O ALA 104.A H 2.831 1.959 ARG 105.A N VAL 179.A O ARG 105.A H 2.800 1.895 ARG 105.A NE GLU 77.A OE2 ARG 105.A HE 2.709 1.848 ARG 105.A NH1 GLU 85.A OE2 ARG 105.A HH11 2.852 2.030 ARG 105.A NH2 GLU 77.A OE2 ARG 105.A HH22 3.309 2.647 ARG 105.A NH2 GLU 85.A OE1 ARG 105.A HH21 2.905 2.037 ARG 105.A NH2 GLU 85.A OE2 ARG 105.A HH21 3.493 2.826 MET 106.A N GLU 77.A O MET 106.A H 2.939 2.026 THR 107.A N ALA 181.A O THR 107.A H 2.914 2.017 GLY 110.A N THR 107.A OG1 GLY 110.A H 2.936 2.270 SER 116.A N GLY 113.A O SER 116.A H 2.998 2.110 GLN 117.A NE2 PRO 81.A O GLN 117.A HE22 2.861 1.979 GLN 118.A N ARG 115.A O GLN 118.A H 2.882 1.993 HIS 121.A N ASN 124.A OD1 HIS 121.A H 2.956 2.083 ASN 124.A N HIS 121.A O ASN 124.A H 2.826 2.150 TYR 125.A N HIS 121.A O TYR 125.A H 3.199 2.346 ILE 126.A N ASP 122.A O ILE 126.A H 3.024 2.133 SER 127.A N ILE 123.A O SER 127.A H 3.056 2.397 SER 127.A N ASN 124.A O SER 127.A H 3.246 2.584 LEU 128.A N TYR 125.A O LEU 128.A H 3.407 2.571 ASN 129.A ND2 VAL 184.A O ASN 129.A HD21 3.063 2.227 ASN 129.A ND2 SER 187.A OG ASN 129.A HD22 2.761 2.044 ASN 129.A ND2 SER 188.A OG ASN 129.A HD21 3.322 2.666 ILE 131.A N ASN 129.A OD1 ILE 131.A H 3.350 2.466 LEU 132.A N ILE 126.A O LEU 132.A H 2.987 2.079 ALA 134.A N ILE 131.A O ALA 134.A H 2.932 2.182 ILE 135.A N LEU 132.A O ILE 135.A H 3.090 2.197 ARG 137.A NH1 ASP 220.A OD1 ARG 137.A HH11 3.151 2.435 ARG 137.A NH2 ASP 220.A OD1 ARG 137.A HH21 2.971 2.161 GLU 140.A N ARG 137.A O GLU 140.A H 3.234 2.359 VAL 143.A N ILE 135.A O VAL 143.A H 3.336 2.477 LEU 148.A N PRO 145.A O LEU 148.A H 3.182 2.293 GLY 150.A N ASP 122.A OD2 GLY 150.A H 2.788 2.124 ALA 151.A N ASP 122.A OD2 ALA 151.A H 2.763 1.930 GLY 153.A N LEU 148.A O GLY 153.A H 2.808 1.930 GLY 154.A N VAL 149.A O GLY 154.A H 2.716 2.042 GLY 155.A N PHE 152.A O GLY 155.A H 3.152 2.256 SER 156.A N ALA 151.A O SER 156.A H 2.830 1.944 MET 157.A N PHE 152.A O MET 157.A H 2.996 2.111 LEU 159.A N GLY 155.A O LEU 159.A H 3.043 2.147 LEU 160.A N SER 156.A O LEU 160.A H 2.894 2.021 VAL 161.A N MET 157.A O VAL 161.A H 3.013 2.109 GLY 162.A N PHE 158.A O GLY 162.A H 2.822 1.960 ILE 163.A N LEU 159.A O ILE 163.A H 2.868 2.019 LEU 164.A N LEU 160.A O LEU 164.A H 2.903 1.998 ALA 165.A N VAL 161.A O ALA 165.A H 2.937 2.065 ALA 166.A N GLY 162.A O ALA 166.A H 2.948 2.104 LEU 167.A N ILE 163.A O LEU 167.A H 3.011 2.199 TRP 168.A N LEU 164.A O TRP 168.A H 3.125 2.234 GLU 169.A N ALA 165.A O GLU 169.A H 3.015 2.124 ARG 170.A N ALA 166.A O ARG 170.A H 2.842 2.043 ARG 170.A NH1 ASP 73.A OD1 ARG 170.A HH11 3.199 2.590 ARG 170.A NH1 ARG 100.A O ARG 170.A HH12 2.774 2.024 ARG 170.A NH2 ASP 73.A OD1 ARG 170.A HH21 2.837 1.999 GLN 171.A N LEU 167.A O GLN 171.A H 3.246 2.479 GLN 171.A N TRP 168.A O GLN 171.A H 3.148 2.433 SER 172.A N GLU 169.A O SER 172.A H 3.123 2.342 SER 173.A N GLU 169.A O SER 173.A H 3.095 2.203 GLY 174.A N ARG 170.A O GLY 174.A H 2.844 2.065 LYS 175.A N SER 173.A OG LYS 175.A H 2.873 1.983 GLY 176.A N ASP 99.A O GLY 176.A H 2.966 2.099 VAL 179.A N TYR 103.A O VAL 179.A H 2.834 1.932 ALA 181.A N ARG 105.A O ALA 181.A H 2.936 2.078 MET 183.A N THR 107.A O MET 183.A H 2.888 2.011 VAL 184.A N GLY 108.A O VAL 184.A H 3.021 2.123 ASP 185.A N ALA 182.A O ASP 185.A H 2.965 2.304 GLY 186.A N ALA 182.A O GLY 186.A H 2.898 1.989 SER 187.A N MET 183.A O SER 187.A H 2.949 2.072 VAL 189.A N ASP 185.A O VAL 189.A H 3.047 2.163 LEU 190.A N GLY 186.A O LEU 190.A H 2.813 1.948 ILE 191.A N SER 187.A O ILE 191.A H 3.044 2.296 ILE 191.A N SER 188.A O ILE 191.A H 3.241 2.573 GLN 192.A N VAL 189.A O GLN 192.A H 3.051 2.230 MET 194.A N ILE 191.A O MET 194.A H 2.907 2.171 TRP 195.A N ILE 191.A O TRP 195.A H 3.319 2.443 ALA 196.A N GLN 192.A O ALA 196.A H 2.887 2.005 MET 197.A N MET 193.A O MET 197.A H 2.899 2.020 ARG 198.A N MET 194.A O ARG 198.A H 2.887 2.054 ARG 198.A NE ASP 205.A OD1 ARG 198.A HE 2.923 2.059 ARG 198.A NH1 ASP 205.A OD1 ARG 198.A HH12 3.531 2.861 ARG 198.A NH1 ASP 205.A OD2 ARG 198.A HH12 3.088 2.336 ALA 199.A N ALA 196.A O ALA 199.A H 3.194 2.517 THR 200.A N MET 197.A O THR 200.A H 3.063 2.216 THR 200.A OG1 MET 197.A O THR 200.A HG1 3.217 2.689 GLY 201.A N ARG 198.A O GLY 201.A H 3.504 2.597 MET 202.A N MET 197.A O MET 202.A H 2.914 2.121 THR 204.A N ASN 210.A OD1 THR 204.A H 2.819 1.908 THR 204.A OG1 ASN 210.A OD1 THR 204.A HG1 3.224 2.450 ARG 207.A NE GLU 140.A O ARG 207.A HE 3.421 2.744 ARG 207.A NH1 GLU 140.A O ARG 207.A HH12 3.013 2.236 ARG 207.A NH2 HIS 133.A O ARG 207.A HH22 2.955 2.100 ALA 209.A N ASP 213.A OD2 ALA 209.A H 3.167 2.530 ASN 210.A N ASP 213.A OD1 ASN 210.A H 2.917 2.071 ASN 210.A ND2 THR 204.A O ASN 210.A HD22 3.094 2.283 ASN 210.A ND2 THR 206.A O ASN 210.A HD22 3.209 2.724 ASN 210.A ND2 ASP 213.A OD2 ASN 210.A HD21 2.842 1.971 GLY 215.A N ASP 213.A OD1 GLY 215.A H 2.986 2.159 TYR 219.A N ALA 216.A O TYR 219.A H 2.977 2.108 ASP 220.A N VAL 232.A O ASP 220.A H 2.971 2.153 THR 221.A N ASP 220.A OD1 THR 221.A H 2.819 2.083 TYR 222.A N VAL 230.A O TYR 222.A H 2.932 2.065 CYS 224.A N ARG 228.A O CYS 224.A H 2.765 1.868 ALA 225.A N HIS 277.A O ALA 225.A H 2.848 1.937 GLY 227.A N CYS 224.A O GLY 227.A H 2.931 2.048 ARG 228.A N ASP 226.A OD1 ARG 228.A H 3.307 2.450 ARG 228.A NH1 ASP 226.A OD2 ARG 228.A HH12 2.826 1.957 VAL 230.A N TYR 222.A O VAL 230.A H 3.003 2.126 ALA 231.A N THR 294.A O ALA 231.A H 2.826 1.920 VAL 232.A N ASP 220.A O VAL 232.A H 2.840 1.951 GLY 233.A N CYS 292.A O GLY 233.A H 2.871 1.993 ILE 235.A N GLY 233.A O ILE 235.A H 2.946 2.238 GLU 236.A N GLU 236.A OE1 GLU 236.A H 2.681 1.900 GLN 238.A N GLN 238.A OE1 GLN 238.A H 2.705 1.874 PHE 239.A N GLU 236.A O PHE 239.A H 2.928 2.285 TYR 240.A N GLU 236.A O TYR 240.A H 2.998 2.087 ALA 241.A N PRO 237.A O ALA 241.A H 2.929 2.053 ALA 242.A N GLN 238.A O ALA 242.A H 3.174 2.310 MET 243.A N PHE 239.A O MET 243.A H 3.008 2.130 LEU 244.A N TYR 240.A O LEU 244.A H 2.982 2.088 ALA 245.A N ALA 241.A O ALA 245.A H 3.077 2.242 GLY 246.A N ALA 242.A O GLY 246.A H 3.019 2.123 LEU 247.A N MET 243.A O LEU 247.A H 3.146 2.293 GLY 248.A N ALA 245.A O GLY 248.A H 2.898 2.070 LEU 249.A N LEU 244.A O LEU 249.A H 3.015 2.148 ALA 252.A N ASP 250.A OD1 ALA 252.A H 3.020 2.230 GLU 253.A N ASP 250.A O GLU 253.A H 2.864 2.003 LEU 254.A N ALA 251.A O LEU 254.A H 3.112 2.241 GLN 257.A NE2 ILE 235.A O GLN 257.A HE22 2.905 2.080 ASP 259.A N PRO 256.A O ASP 259.A H 3.133 2.235 ARG 260.A NH2 ALA 209.A O ARG 260.A HH21 2.947 2.220 ARG 262.A N ASP 259.A O ARG 262.A H 2.879 2.100 ARG 262.A NE GLU 265.A OE1 ARG 262.A HE 3.083 2.231 ARG 262.A NH2 GLU 265.A OE1 ARG 262.A HH22 3.440 2.705 ARG 262.A NH2 GLU 265.A OE2 ARG 262.A HH22 3.112 2.321 TRP 263.A N ARG 260.A O TRP 263.A H 2.946 2.061 TRP 263.A NE1 GLN 257.A O TRP 263.A HE1 2.872 2.021 LEU 266.A N ARG 262.A O LEU 266.A H 2.940 2.053 ARG 267.A N TRP 263.A O ARG 267.A H 2.817 1.933 ARG 267.A NH1 ASP 220.A OD2 ARG 267.A HH11 2.680 1.944 ARG 267.A NH2 GLY 214.A O ARG 267.A HH21 2.838 2.195 ALA 268.A N PRO 264.A O ALA 268.A H 2.944 2.084 LEU 269.A N GLU 265.A O LEU 269.A H 3.065 2.175 LEU 270.A N LEU 266.A O LEU 270.A H 2.889 2.005 THR 271.A N ARG 267.A O THR 271.A H 2.700 1.876 GLU 272.A N ALA 268.A O GLU 272.A H 3.027 2.154 ALA 273.A N LEU 269.A O ALA 273.A H 3.001 2.095 PHE 274.A N LEU 270.A O PHE 274.A H 2.920 2.006 ALA 275.A N THR 271.A O ALA 275.A H 2.888 2.050 SER 276.A N ALA 273.A O SER 276.A H 3.037 2.180 HIS 277.A N PHE 274.A O HIS 277.A H 3.438 2.551 ARG 279.A N ASP 226.A OD1 ARG 279.A H 3.147 2.275 ARG 279.A NE ASP 280.A OD1 ARG 279.A HE 2.882 2.087 ARG 279.A NH1 VAL 296.A O ARG 279.A HH12 3.094 2.256 ARG 279.A NH1 GLU 301.A OE1 ARG 279.A HH11 2.815 2.157 ARG 279.A NH2 ASP 280.A OD1 ARG 279.A HH22 3.089 2.409 ARG 279.A NH2 GLU 301.A OE2 ARG 279.A HH21 2.575 1.826 HIS 281.A N ASP 278.A OD1.B HIS 281.A H 3.017 2.186 TRP 282.A N ASP 278.A O TRP 282.A H 3.389 2.521 TRP 282.A NE1 PHE 274.A O TRP 282.A HE1 2.973 2.185 GLY 283.A N ARG 279.A O GLY 283.A H 2.815 1.915 ALA 284.A N ASP 280.A O ALA 284.A H 3.057 2.233 VAL 285.A N HIS 281.A O VAL 285.A H 2.989 2.113 PHE 286.A N TRP 282.A O PHE 286.A H 2.839 2.020 ALA 287.A N ALA 284.A O ALA 287.A H 3.350 2.447 ALA 291.A N SER 289.A OG ALA 291.A H 3.174 2.348 THR 294.A N ALA 231.A O THR 294.A H 2.989 2.098 VAL 296.A N TYR 229.A O VAL 296.A H 2.852 1.956 ALA 298.A N GLU 301.A OE1 ALA 298.A H 2.849 1.954 GLU 301.A N ALA 298.A O GLU 301.A H 2.847 1.975 VAL 302.A N PHE 299.A O VAL 302.A H 3.189 2.294 ASN 304.A N GLU 301.A O ASN 304.A H 3.185 2.393 GLU 305.A N VAL 302.A O GLU 305.A H 2.985 2.089 ILE 309.A N GLU 305.A O ILE 309.A H 2.933 2.062 GLU 310.A N PRO 306.A O GLU 310.A H 2.881 1.977 ARG 311.A N HIS 307.A O ARG 311.A H 3.268 2.441 ASN 312.A N ILE 309.A O ASN 312.A H 3.049 2.192 THR 313.A N ILE 308.A O THR 313.A H 3.465 2.564 TYR 315.A N GLN 322.A O TYR 315.A H 2.905 2.009 ALA 317.A N GLY 320.A O ALA 317.A H 2.705 1.884 GLY 320.A N ALA 317.A O GLY 320.A H 2.765 1.906 GLN 322.A N TYR 315.A O GLN 322.A H 2.932 2.026 MET 324.A N THR 313.A O MET 324.A H 2.792 1.911 ARG 328.A NH1 ARG 311.A O ARG 328.A HH11 2.878 2.113 ARG 328.A NH2 ARG 311.A O ARG 328.A HH21 2.782 2.015 ARG 338.A N ASN 48.A OD1 ARG 338.A H 2.863 1.972 ILE 344.A N ILE 51.A O ILE 344.A H 2.996 2.115 GLU 347.A N ASP 345.A OD1 GLU 347.A H 3.413 2.513 ALA 348.A N ASP 345.A O ALA 348.A H 3.097 2.388 LEU 350.A N ILE 346.A O LEU 350.A H 3.128 2.231 THR 351.A N GLU 347.A O THR 351.A H 2.862 2.015 ASP 352.A N ALA 348.A O ASP 352.A H 2.905 1.991 TRP 353.A N VAL 349.A O TRP 353.A H 2.708 1.819 TRP 353.A NE1 ASP 32.A OD2 TRP 353.A HE1 2.906 2.055 ASP 354.A N ASP 352.A O ASP 354.A H 2.452 1.708