Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8sod_C.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 5.A N SER 1.A O GLN 5.A H 2.793 1.944 LEU 6.A N GLU 2.A O LEU 6.A H 2.991 2.251 ARG 7.A N LEU 3.A O ARG 7.A H 2.892 2.159 GLN 8.A N ASP 4.A O GLN 8.A H 2.943 2.121 GLU 9.A N GLN 5.A O GLU 9.A H 2.910 2.134 ALA 10.A N LEU 6.A O ALA 10.A H 2.918 2.084 GLU 11.A N ARG 7.A O GLU 11.A H 2.929 2.122 GLN 12.A N GLN 8.A O GLN 12.A H 2.909 2.301 GLN 12.A N GLU 9.A O GLN 12.A H 3.275 2.568 GLN 12.A NE2 GLN 8.A O GLN 12.A HE21 2.902 2.158 LEU 13.A N GLU 9.A O LEU 13.A H 2.911 2.052 LYS 14.A N ALA 10.A O LYS 14.A H 2.916 2.166 GLN 16.A N GLN 12.A O GLN 16.A H 2.902 2.135 ILE 17.A N LEU 13.A O ILE 17.A H 2.927 2.209 ILE 17.A N LYS 14.A O ILE 17.A H 3.082 2.488 ARG 18.A N LYS 14.A O ARG 18.A H 2.917 2.116 ASP 19.A N ASN 15.A O ASP 19.A H 2.915 2.140 ALA 20.A N GLN 16.A O ALA 20.A H 2.908 2.102 ARG 21.A N ILE 17.A O ARG 21.A H 2.958 2.252 ARG 21.A NE ASP 257.A OD2 ARG 21.A HE 3.218 2.385 ARG 21.A NH2 THR 220.A O ARG 21.A HH22 2.552 1.810 ARG 21.A NH2 ASP 257.A OD1 ARG 21.A HH21 3.012 2.358 ARG 21.A NH2 ASP 257.A OD2 ARG 21.A HH21 3.434 2.678 LYS 22.A N ARG 18.A O LYS 22.A H 2.875 2.020 ALA 23.A N ASP 19.A O ALA 23.A H 2.928 2.148 ALA 25.A N ARG 21.A O ALA 25.A H 3.148 2.480 ALA 25.A N LYS 22.A O ALA 25.A H 3.206 2.541 ASP 26.A N CYS 24.A O ASP 26.A H 2.640 1.977 ASP 26.A N ASP 26.A OD1 ASP 26.A H 2.564 1.928 ALA 27.A N ASP 26.A OD1 ALA 27.A H 2.719 2.058 THR 28.A N GLN 31.A OE1 THR 28.A H 3.427 2.585 GLN 31.A N THR 28.A OG1 GLN 31.A H 3.287 2.470 ILE 32.A N THR 28.A O ILE 32.A H 3.199 2.345 THR 33.A N LEU 29.A O THR 33.A H 2.874 2.107 THR 33.A OG1 LEU 299.A O THR 33.A HG1 3.121 2.329 ASN 34.A N GLN 31.A O ASN 34.A H 3.023 2.250 VAL 39.A N ASP 297.A OD2 VAL 39.A H 3.211 2.509 ARG 45.A N ASN 339.A O ARG 45.A H 3.324 2.488 ARG 47.A N ILE 337.A O ARG 47.A H 2.816 2.099 ARG 48.A N ILE 337.A O ARG 48.A H 3.319 2.507 ARG 48.A NH1 ARG 47.A O ARG 48.A HH11 3.265 2.471 LEU 50.A N LEU 335.A O LEU 50.A H 2.866 2.051 HIS 53.A NE2 SER 71.A OG no hydrogen 2.670 N/A LEU 54.A N ASP 75.A OD2 LEU 54.A H 3.126 2.276 ILE 57.A N SER 330.A O ILE 57.A H 3.241 2.425 TYR 58.A N ALA 72.A O TYR 58.A H 2.628 1.845 ALA 59.A N ALA 72.A O ALA 59.A H 3.362 2.549 HIS 61.A N VAL 70.A O HIS 61.A H 3.012 2.266 GLY 63.A N LEU 68.A O GLY 63.A H 2.569 1.753 THR 64.A OG1 PRO 106.A O THR 64.A HG1 2.457 1.809 SER 66.A N GLY 63.A O SER 66.A H 3.032 2.204 ARG 67.A N ASP 65.A OD1 ARG 67.A H 3.172 2.320 ARG 67.A NE ASP 82.A OD1 ARG 67.A HE 2.850 2.211 LEU 68.A N ASP 65.A OD1 LEU 68.A H 3.164 2.321 LEU 68.A N ASP 65.A OD2 LEU 68.A H 3.136 2.444 LEU 69.A N TRP 81.A O LEU 69.A H 3.069 2.299 VAL 70.A N HIS 61.A O VAL 70.A H 3.016 2.282 SER 71.A N ILE 79.A O SER 71.A H 3.147 2.408 ALA 72.A N ALA 59.A O ALA 72.A H 2.748 1.982 GLN 74.A N LYS 56.A O GLN 74.A H 2.554 1.748 ASP 75.A N SER 73.A OG ASP 75.A H 3.270 2.420 GLY 76.A N SER 73.A O GLY 76.A H 3.302 2.509 LYS 77.A N ASP 75.A OD1 LYS 77.A H 3.145 2.306 LEU 78.A N ILE 92.A O LEU 78.A H 2.525 1.684 ILE 80.A N HIS 90.A O ILE 80.A H 2.645 1.816 TRP 81.A N LEU 69.A O TRP 81.A H 2.860 2.000 TRP 81.A NE1 SER 71.A OG TRP 81.A HE1 2.557 1.892 ASP 82.A N ASN 87.A O ASP 82.A H 2.817 2.030 SER 83.A N ARG 67.A O SER 83.A H 2.719 1.888 TYR 84.A N ASP 82.A OD1 TYR 84.A H 2.982 2.319 THR 86.A N ASP 82.A O THR 86.A H 2.482 1.740 ASN 87.A N THR 85.A OG1 ASN 87.A H 3.327 2.476 HIS 90.A N ILE 80.A O HIS 90.A H 3.355 2.539 ILE 92.A N LEU 78.A O ILE 92.A H 2.819 1.992 LEU 94.A N GLY 76.A O LEU 94.A H 2.632 1.831 MET 100.A N GLY 114.A O MET 100.A H 2.657 1.805 THR 101.A N GLY 114.A O THR 101.A H 3.109 2.334 ALA 103.A N ALA 112.A O ALA 103.A H 3.029 2.330 ALA 105.A N TYR 110.A O ALA 105.A H 3.101 2.304 SER 107.A OG ASP 153.A OD2 SER 107.A HG 3.074 2.392 GLY 108.A N ALA 105.A O GLY 108.A H 3.116 2.399 ASN 109.A ND2 ASP 153.A OD1 ASN 109.A HD21 3.525 2.728 ASN 109.A ND2 ASP 153.A OD2 ASN 109.A HD21 2.513 1.816 VAL 111.A N TYR 123.A O VAL 111.A H 3.101 2.305 ALA 112.A N ALA 103.A O ALA 112.A H 3.344 2.510 CYS 113.A N SER 121.A O CYS 113.A H 3.234 2.411 GLY 114.A N THR 101.A O GLY 114.A H 3.183 2.470 LEU 116.A N TRP 98.A O LEU 116.A H 2.924 2.102 ASN 118.A N GLY 115.A O ASN 118.A H 3.301 2.461 ILE 119.A N ASP 117.A OD2 ILE 119.A H 3.328 2.624 CYS 120.A N LEU 138.A O CYS 120.A H 3.022 2.206 ILE 122.A N ARG 136.A O ILE 122.A H 2.883 2.051 TYR 123.A N VAL 111.A O TYR 123.A H 2.749 1.905 ASN 124.A N ARG 133.A O ASN 124.A H 2.820 2.002 ASN 124.A ND2 LYS 126.A O ASN 124.A HD22 2.799 2.222 LEU 125.A N ASN 109.A O LEU 125.A H 3.100 2.271 LYS 126.A NZ ASN 109.A OD1 LYS 126.A HZ2 2.872 2.038 GLY 130.A N THR 127.A O GLY 130.A H 2.901 2.102 SER 135.A N ILE 122.A O SER 135.A H 2.765 2.098 LEU 138.A N CYS 120.A O LEU 138.A H 3.082 2.239 HIS 141.A ND1 ASP 162.A OD2 no hydrogen 2.497 N/A HIS 141.A NE2 THR 158.A OG1 HIS 141.A HE2 3.003 2.290 LEU 145.A N GLY 115.A O LEU 145.A H 2.559 1.791 SER 146.A N SER 159.A O SER 146.A H 2.810 2.017 SER 146.A OG VAL 186.A O SER 146.A HG 2.543 1.755 CYS 147.A N SER 159.A O CYS 147.A H 3.382 2.614 ARG 149.A N VAL 157.A O ARG 149.A H 2.830 2.071 ARG 149.A NH1 CYS 102.A O ARG 149.A HH12 2.961 2.427 LEU 151.A N GLN 155.A O LEU 151.A H 2.877 2.183 ASP 152.A N GLN 155.A O ASP 152.A H 3.048 2.208 ASN 154.A N ASP 152.A OD1 ASN 154.A H 2.381 1.649 GLN 155.A NE2 ASP 152.A OD2 GLN 155.A HE21 2.989 2.133 ILE 156.A N TRP 168.A O ILE 156.A H 3.238 2.427 VAL 157.A N ARG 149.A O VAL 157.A H 2.957 2.147 THR 158.A N ALA 166.A O THR 158.A H 2.983 2.140 SER 159.A N CYS 147.A O SER 159.A H 2.579 1.737 GLY 161.A N TYR 144.A O GLY 161.A H 2.819 2.153 THR 164.A N ASP 162.A OD1 THR 164.A H 2.890 2.267 CYS 165.A N PHE 179.A O CYS 165.A H 3.386 2.561 ALA 166.A N THR 158.A O ALA 166.A H 3.100 2.414 LEU 167.A N THR 177.A O LEU 167.A H 2.865 2.102 TRP 168.A N ILE 156.A O TRP 168.A H 2.902 2.099 TRP 168.A NE1 THR 158.A OG1 TRP 168.A HE1 2.791 2.094 ASP 169.A N GLN 174.A O ASP 169.A H 3.107 2.293 ILE 170.A N ASN 154.A O ILE 170.A H 2.548 1.729 GLU 171.A N ASN 154.A OD1 GLU 171.A H 2.920 2.282 GLY 173.A N ASP 169.A O GLY 173.A H 2.614 1.930 PHE 179.A N CYS 165.A O PHE 179.A H 2.980 2.136 HIS 182.A ND1 ASP 204.A OD2 HIS 182.A HD1 3.259 2.411 HIS 182.A NE2 SER 200.A OG no hydrogen 2.539 N/A MET 187.A N GLY 201.A O MET 187.A H 2.661 2.022 SER 188.A N GLY 201.A O SER 188.A H 3.310 2.524 SER 190.A N VAL 199.A O SER 190.A H 3.036 2.317 ALA 192.A N LEU 197.A O ALA 192.A H 3.170 2.317 LEU 197.A N ASP 194.A O LEU 197.A H 3.419 2.566 VAL 199.A N SER 190.A O VAL 199.A H 3.215 2.419 GLY 201.A N SER 188.A O GLY 201.A H 2.764 1.946 CYS 203.A N ASP 185.A O CYS 203.A H 2.945 2.268 ALA 207.A N PHE 221.A O ALA 207.A H 3.091 2.291 LYS 208.A N SER 200.A O LYS 208.A H 3.325 2.567 LYS 208.A NZ GLY 181.A O LYS 208.A HZ2 3.358 2.793 LEU 209.A N GLN 219.A O LEU 209.A H 2.983 2.162 TRP 210.A N PHE 198.A O TRP 210.A H 2.992 2.152 ASP 211.A N MET 216.A O ASP 211.A H 2.910 2.131 VAL 212.A N ARG 196.A O VAL 212.A H 2.704 1.944 ARG 218.A N LEU 209.A O ARG 218.A H 2.656 1.816 GLN 219.A NE2 LEU 254.A O GLN 219.A HE22 2.387 1.556 PHE 221.A N ALA 207.A O PHE 221.A H 3.027 2.200 HIS 224.A ND1 ASP 246.A OD2 no hydrogen 2.765 N/A HIS 224.A NE2 THR 242.A OG1 HIS 224.A HE2 2.471 1.749 GLU 225.A N ASP 246.A OD2 GLU 225.A H 3.008 2.272 ILE 228.A N ALA 202.A O ILE 228.A H 3.003 2.169 ASN 229.A N GLY 243.A O ASN 229.A H 2.410 1.718 ASN 229.A ND2 ASP 245.A OD1 ASN 229.A HD22 2.596 1.845 ASN 229.A ND2 ILE 272.A O ASN 229.A HD21 2.738 2.193 ALA 230.A N GLY 243.A O ALA 230.A H 3.142 2.342 CYS 232.A N ALA 241.A O CYS 232.A H 3.206 2.446 PHE 234.A N ALA 239.A O PHE 234.A H 2.617 1.761 ASN 238.A N ASN 236.A OD1 ASN 238.A H 2.587 1.756 PHE 240.A N PHE 252.A O PHE 240.A H 2.687 1.913 ALA 241.A N CYS 232.A O ALA 241.A H 3.162 2.396 THR 242.A N ARG 250.A O THR 242.A H 2.944 2.146 GLY 243.A N ALA 230.A O GLY 243.A H 2.498 1.651 ASP 245.A N ASP 227.A O ASP 245.A H 2.741 1.972 ASP 246.A N SER 244.A OG ASP 246.A H 3.129 2.309 THR 248.A N ASP 246.A OD1 THR 248.A H 2.929 2.125 CYS 249.A N TYR 263.A O CYS 249.A H 2.965 2.110 ARG 250.A N THR 242.A O ARG 250.A H 3.280 2.507 ARG 250.A NE HIS 224.A ND1 ARG 250.A HE 3.529 2.764 ARG 250.A NH1 GLU 259.A OE1 ARG 250.A HH11 3.028 2.317 LEU 251.A N MET 261.A O LEU 251.A H 2.986 2.151 PHE 252.A N PHE 240.A O PHE 252.A H 2.671 1.831 LEU 254.A N ASN 238.A O LEU 254.A H 2.966 2.131 ARG 255.A N ASP 253.A OD1 ARG 255.A H 2.682 2.028 ARG 255.A NH2 ASP 253.A OD2 ARG 255.A HH21 3.160 2.420 ALA 256.A N ASP 253.A OD1 ALA 256.A H 3.391 2.602 ASP 257.A N ASP 253.A O ASP 257.A H 2.905 2.283 ASP 257.A N LEU 254.A O ASP 257.A H 3.115 2.485 GLN 258.A NE2 ALA 256.A O GLN 258.A HE21 2.657 1.986 LEU 260.A N LEU 251.A O LEU 260.A H 3.048 2.211 TYR 263.A N CYS 249.A O TYR 263.A H 3.057 2.219 TYR 263.A OH ALA 298.A O TYR 263.A HH 2.372 1.541 ILE 268.A N HIS 265.A O ILE 268.A H 2.955 2.289 ILE 272.A N SER 244.A O ILE 272.A H 2.953 2.099 THR 273.A N GLY 287.A O THR 273.A H 2.836 2.035 THR 273.A OG1 VAL 314.A O THR 273.A HG1 2.337 1.554 SER 276.A N LEU 285.A O SER 276.A H 2.819 2.194 SER 278.A N LEU 283.A O SER 278.A H 2.833 2.064 GLY 281.A N SER 278.A OG GLY 281.A H 2.947 2.218 ARG 282.A N SER 280.A OG ARG 282.A H 3.310 2.451 LEU 284.A N TRP 296.A O LEU 284.A H 3.087 2.249 LEU 285.A N SER 276.A O LEU 285.A H 2.681 1.839 ALA 286.A N ASN 294.A O ALA 286.A H 3.249 2.391 GLY 287.A N SER 274.A O GLY 287.A H 2.686 1.888 TYR 288.A N ASN 292.A O TYR 288.A H 3.097 2.435 ASN 292.A N ASP 290.A OD1 ASN 292.A H 3.253 2.449 VAL 295.A N GLY 305.A O VAL 295.A H 2.484 1.627 TRP 296.A N LEU 284.A O TRP 296.A H 3.062 2.202 TRP 296.A NE1 TYR 288.A OH TRP 296.A HE1 2.848 2.030 ASP 297.A N ASP 302.A O ASP 297.A H 2.573 1.736 ALA 298.A N ARG 282.A O ALA 298.A H 2.656 1.802 LEU 299.A N ASP 297.A OD1 LEU 299.A H 3.192 2.404 LYS 300.A NZ THR 33.A O LYS 300.A HZ3 3.199 2.616 LYS 300.A NZ ILE 36.A O LYS 300.A HZ1 2.810 2.186 ALA 301.A N ASP 297.A O ALA 301.A H 2.599 1.871 ARG 303.A NH1 ASN 294.A OD1 ARG 303.A HH11 3.516 2.721 GLY 305.A N VAL 295.A O GLY 305.A H 3.206 2.400 LEU 307.A N CYS 293.A O LEU 307.A H 2.750 1.906 HIS 310.A ND1 ASP 332.A OD2 HIS 310.A HD1 2.785 2.060 HIS 310.A NE2 THR 328.A O no hydrogen 2.693 N/A HIS 310.A NE2 THR 328.A OG1 no hydrogen 2.950 N/A ASP 311.A N ASP 332.A OD2 ASP 311.A H 3.294 2.597 ARG 313.A N ASN 312.A OD1 ARG 313.A H 2.480 1.729 ARG 313.A NE ASP 289.A OD1 ARG 313.A HE 2.746 2.019 ARG 313.A NH2 ASP 289.A OD2 ARG 313.A HH21 3.041 2.434 VAL 314.A N TYR 288.A O VAL 314.A H 3.313 2.575 SER 315.A OG ILE 57.A O SER 315.A HG 2.825 2.090 GLY 318.A N ALA 327.A O GLY 318.A H 2.706 1.901 THR 320.A N ALA 325.A O THR 320.A H 3.009 2.179 GLY 323.A N THR 320.A O GLY 323.A H 2.842 2.004 MET 324.A N ASP 322.A OD1 MET 324.A H 3.034 2.187 VAL 326.A N TRP 338.A O VAL 326.A H 2.957 2.139 ALA 327.A N GLY 318.A O ALA 327.A H 2.973 2.295 THR 328.A N LYS 336.A O THR 328.A H 2.802 2.095 TRP 331.A N ARG 313.A O TRP 331.A H 2.676 1.874 ASP 332.A N SER 330.A OG ASP 332.A H 3.414 2.588 PHE 334.A N ASP 332.A OD1 PHE 334.A H 2.779 1.963 LYS 336.A N THR 328.A O LYS 336.A H 2.947 2.248 LYS 336.A NZ GLY 309.A O LYS 336.A HZ2 2.527 1.777 ILE 337.A N ARG 48.A O ILE 337.A H 3.078 2.375 TRP 338.A N VAL 326.A O TRP 338.A H 2.530 1.879 ASN 339.A N ARG 45.A O ASN 339.A H 3.409 2.610 ASN 339.A ND2 MET 324.A O ASN 339.A HD22 2.179 1.627