Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8udt_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 8.A NZ ASP 6.A OD1 LYS 8.A HZ3 3.086 2.194 TRP 9.A N ASP 6.A O TRP 9.A H 2.924 1.950 GLU 10.A N ASP 6.A O GLU 10.A H 2.980 2.219 GLU 10.A N PRO 7.A O GLU 10.A H 3.251 2.463 LEU 11.A N ALA 88.A O LEU 11.A H 2.932 1.961 ARG 13.A NE GLN 91.A O ARG 13.A HE 2.864 1.906 ARG 13.A NH1 PRO 94.A O ARG 13.A HH12 2.987 2.145 ARG 13.A NH2 GLN 91.A O ARG 13.A HH21 3.164 2.348 ARG 13.A NH2 PRO 94.A O ARG 13.A HH22 2.892 2.018 ARG 15.A N SER 12.A O ARG 15.A H 3.051 2.154 ARG 15.A NH1 ILE 36.A O ARG 15.A HH11 2.760 1.784 LEU 16.A N ARG 13.A O LEU 16.A H 3.051 2.079 THR 17.A N GLU 34.A O THR 17.A H 2.979 2.043 GLY 19.A N MET 32.A O GLY 19.A H 2.647 1.783 LEU 22.A N VAL 30.A O LEU 22.A H 3.052 2.090 CYS 26.A SG GLY 25.A O CYS 26.A HG 2.907 2.011 GLN 29.A N CYS 26.A O GLN 29.A H 3.524 2.576 VAL 31.A N VAL 51.A O VAL 31.A H 2.903 1.925 MET 32.A N LYS 20.A O MET 32.A H 2.933 1.928 ALA 33.A N VAL 49.A O ALA 33.A H 2.865 1.943 GLU 34.A N THR 17.A O GLU 34.A H 2.948 2.001 ALA 35.A N VAL 47.A O ALA 35.A H 2.855 1.874 ILE 36.A N ARG 15.A O ILE 36.A H 3.014 2.104 LYS 40.A NZ ASP 41.A OD2 LYS 40.A HZ2 3.501 2.604 ASP 41.A N ASP 39.A OD1 ASP 41.A H 3.145 2.211 ARG 42.A NH2 ASP 39.A OD2 ARG 42.A HH21 2.786 1.829 LYS 45.A N ARG 42.A O LYS 45.A H 3.315 2.478 VAL 47.A N ALA 35.A O VAL 47.A H 2.836 1.824 VAL 49.A N ALA 33.A O VAL 49.A H 2.807 1.826 ALA 50.A N VAL 99.A O ALA 50.A H 2.992 1.984 VAL 51.A N VAL 31.A O VAL 51.A H 2.790 1.780 LYS 52.A N VAL 97.A O LYS 52.A H 2.928 1.947 MET 53.A N GLN 29.A O MET 53.A H 2.821 1.898 THR 59.A N ASP 62.A OD2 THR 59.A H 3.084 2.083 LYS 61.A NZ ASP 65.A OD2 LYS 61.A HZ3 2.817 1.995 ASP 62.A N THR 59.A OG1 ASP 62.A H 3.167 2.210 LEU 63.A N THR 59.A O LEU 63.A H 3.240 2.332 SER 64.A N ASP 60.A O SER 64.A H 2.958 1.966 SER 64.A OG LYS 61.A O SER 64.A HG 2.960 1.976 ASP 65.A N LYS 61.A O ASP 65.A H 2.799 1.827 LEU 66.A N ASP 62.A O LEU 66.A H 3.217 2.277 VAL 67.A N LEU 63.A O VAL 67.A H 2.984 2.015 SER 68.A N SER 64.A O SER 68.A H 2.840 1.850 SER 68.A OG SER 64.A O SER 68.A HG 2.889 2.092 GLU 69.A N ASP 65.A O GLU 69.A H 2.990 2.044 MET 70.A N LEU 66.A O MET 70.A H 3.066 2.078 GLU 71.A N VAL 67.A O GLU 71.A H 2.837 1.888 MET 72.A N SER 68.A O MET 72.A H 2.892 1.972 MET 73.A N GLU 69.A O MET 73.A H 3.046 2.143 LYS 74.A N MET 70.A O LYS 74.A H 3.215 2.341 LYS 74.A NZ ASP 6.A OD2 LYS 74.A HZ3 2.832 1.836 LYS 74.A NZ GLU 71.A OE2 LYS 74.A HZ2 2.989 2.006 MET 75.A N GLU 71.A O MET 75.A H 3.234 2.330 ILE 76.A N MET 72.A O ILE 76.A H 2.936 1.966 GLY 77.A N MET 73.A O GLY 77.A H 3.174 2.205 HIS 79.A N ASN 84.A OD1 HIS 79.A H 3.302 2.416 ASN 81.A ND2 MET 163.A O ASN 81.A HD22 3.148 2.167 ILE 82.A N HIS 79.A O ILE 82.A H 3.309 2.351 ILE 83.A N ILE 165.A O ILE 83.A H 2.883 1.889 ASN 84.A N GLU 100.A OE1 ASN 84.A H 3.027 2.125 ASN 84.A ND2 HIS 79.A O ASN 84.A HD21 2.874 1.894 ASN 84.A ND2 GLU 100.A OE1 ASN 84.A HD22 3.016 2.196 LEU 86.A N LEU 98.A O LEU 86.A H 2.862 1.856 ALA 88.A N TRP 9.A O ALA 88.A H 3.060 2.223 CYS 89.A N TYR 96.A O CYS 89.A H 2.902 1.963 CYS 89.A SG LEU 11.A O CYS 89.A HG 3.467 2.220 THR 90.A N GLU 10.A OE1 THR 90.A H 2.941 2.007 GLN 91.A N GLU 10.A OE1 GLN 91.A H 3.359 2.536 GLN 91.A NE2 LEU 3.A O GLN 91.A HE22 2.873 1.872 GLN 91.A NE2 THR 90.A OG1 GLN 91.A HE21 2.962 1.956 TYR 96.A N CYS 89.A O TYR 96.A H 3.113 2.176 VAL 97.A N LYS 52.A O VAL 97.A H 2.976 1.975 LEU 98.A N GLY 87.A O LEU 98.A H 2.857 1.857 VAL 99.A N ALA 50.A O VAL 99.A H 2.886 1.895 GLU 100.A N ASN 84.A O GLU 100.A H 3.046 2.240 LYS 104.A N VAL 157.A O LYS 104.A H 2.963 2.097 LYS 104.A NZ ASN 161.A OD1 LYS 104.A HZ2 2.952 2.136 GLY 105.A N ALA 102.A O GLY 105.A H 3.383 2.426 LEU 107.A N ALA 152.A O LEU 107.A H 3.274 2.538 LEU 107.A N VAL 155.A O LEU 107.A H 2.714 1.836 ARG 108.A NE GLU 109.A OE1 ARG 108.A HE 3.114 2.251 ARG 108.A NH2 GLU 109.A OE1 ARG 108.A HH21 3.147 2.318 GLU 109.A N ASN 106.A OD1 GLU 109.A H 2.890 1.915 PHE 110.A N ASN 106.A O PHE 110.A H 2.940 1.947 LEU 111.A N LEU 107.A O LEU 111.A H 2.934 2.002 ARG 112.A N ARG 108.A O ARG 112.A H 3.018 2.030 ARG 112.A NE GLY 219.A O ARG 112.A HE 2.870 1.896 ARG 112.A NH2 GLY 219.A O ARG 112.A HH21 3.268 2.468 ALA 113.A N GLU 109.A O ALA 113.A H 2.967 1.990 ARG 114.A N PHE 110.A O ARG 114.A H 3.380 2.539 ARG 114.A NH1 PHE 110.A O ARG 114.A HH11 3.386 2.399 ARG 115.A N ARG 112.A O ARG 115.A H 3.452 2.476 ARG 115.A NE LEU 218.A O ARG 115.A HE 2.811 2.057 ARG 115.A NH2 THR 217.A O ARG 115.A HH21 3.226 2.395 GLN 120.A N GLY 117.A O GLN 120.A H 3.458 2.478 THR 122.A N ASP 125.A OD2 THR 122.A H 3.262 2.252 ASP 125.A N THR 122.A OG1 ASP 125.A H 3.084 2.140 LEU 126.A N THR 122.A O LEU 126.A H 3.118 2.205 VAL 127.A N PHE 123.A O VAL 127.A H 2.975 2.059 SER 128.A N LYS 124.A O SER 128.A H 2.889 1.945 CYS 129.A N ASP 125.A O CYS 129.A H 3.154 2.270 ALA 130.A N LEU 126.A O ALA 130.A H 3.312 2.338 TYR 131.A N VAL 127.A O TYR 131.A H 2.935 1.962 GLN 132.A N SER 128.A O GLN 132.A H 2.999 2.064 GLN 132.A NE2 SER 128.A O GLN 132.A HE21 3.372 2.600 GLN 132.A NE2 SER 128.A OG GLN 132.A HE21 3.041 2.154 VAL 133.A N CYS 129.A O VAL 133.A H 2.999 2.021 ALA 134.A N ALA 130.A O ALA 134.A H 2.944 1.956 ARG 135.A N TYR 131.A O ARG 135.A H 2.861 1.943 GLY 136.A N GLN 132.A O GLY 136.A H 3.017 2.036 MET 137.A N VAL 133.A O MET 137.A H 2.925 1.969 GLU 138.A N ALA 134.A O GLU 138.A H 2.839 1.890 TYR 139.A N ARG 135.A O TYR 139.A H 3.153 2.216 LEU 140.A N GLY 136.A O LEU 140.A H 3.031 2.061 ALA 141.A N MET 137.A O ALA 141.A H 2.823 1.831 SER 142.A N GLU 138.A O SER 142.A H 2.979 2.022 SER 142.A OG TYR 139.A O SER 142.A HG 2.580 1.607 GLN 143.A N TYR 139.A O GLN 143.A H 2.993 2.159 GLN 143.A N LEU 140.A O GLN 143.A H 3.145 2.436 LYS 144.A N ALA 141.A O LYS 144.A H 3.036 2.119 CYS 145.A N LEU 140.A O CYS 145.A H 2.896 2.009 HIS 147.A N ASP 204.A OD2 HIS 147.A H 2.912 2.006 HIS 147.A NE2 ALA 166.A O HIS 147.A HE2 2.814 1.984 ARG 148.A N ASP 204.A OD1 ARG 148.A H 3.125 2.146 ASP 149.A N HIS 147.A ND1 ASP 149.A H 3.301 2.395 ALA 152.A N GLU 214.A OE2 ALA 152.A H 3.008 2.013 ARG 153.A NH2 ASP 149.A OD1 ARG 153.A HH21 2.864 1.937 ASN 154.A N ALA 151.A O ASN 154.A H 2.945 2.096 ASN 154.A ND2 ASP 149.A O ASN 154.A HD22 2.718 2.115 VAL 155.A N ALA 152.A O VAL 155.A H 2.998 2.017 LEU 156.A N LYS 164.A O LEU 156.A H 2.789 1.805 VAL 157.A N GLY 105.A O VAL 157.A H 2.876 1.905 THR 158.A N VAL 162.A O THR 158.A H 3.114 2.166 ASN 161.A N THR 158.A O ASN 161.A H 2.944 1.990 VAL 162.A N THR 158.A OG1 VAL 162.A H 2.913 1.912 MET 163.A N GLN 132.A OE1 MET 163.A H 2.910 1.930 LYS 164.A N LEU 156.A O LYS 164.A H 2.847 1.934 LYS 164.A NZ LYS 80.A O LYS 164.A HZ3 2.741 1.807 LYS 164.A NZ GLU 100.A OE1 LYS 164.A HZ2 2.694 1.727 ILE 165.A N ASN 81.A O ILE 165.A H 2.971 1.995 ALA 166.A N ASN 154.A O ALA 166.A H 2.886 1.883 ARG 172.A NH1 ASP 167.A O ARG 172.A HH12 3.087 2.342 ARG 172.A NH2 ASP 167.A O ARG 172.A HH22 2.726 1.854 THR 183.A OG1 TYR 179.A OH THR 183.A HG1 2.866 2.031 LYS 187.A NZ PRO 222.A O LYS 187.A HZ3 2.886 2.122 LYS 187.A NZ TYR 223.A O LYS 187.A HZ3 2.697 1.929 TRP 188.A N PRO 185.A O TRP 188.A H 3.285 2.404 TRP 188.A NE1 GLU 214.A OE2 TRP 188.A HE1 2.733 1.796 MET 189.A N VAL 186.A O MET 189.A H 3.288 2.458 GLU 192.A N GLU 192.A OE1 GLU 192.A H 2.785 1.834 LEU 194.A N ALA 190.A O LEU 194.A H 2.863 1.892 PHE 195.A N PRO 191.A O PHE 195.A H 2.810 1.820 ASP 196.A N GLU 192.A O ASP 196.A H 2.933 2.044 ARG 197.A N ALA 193.A O ARG 197.A H 3.134 2.360 VAL 198.A N GLU 192.A O VAL 198.A H 3.059 2.045 THR 200.A N SER 203.A OG THR 200.A H 2.877 1.938 GLN 202.A N THR 200.A OG1 GLN 202.A H 3.327 2.623 GLN 202.A NE2 PRO 263.A O GLN 202.A HE21 3.205 2.205 GLN 202.A NE2 PRO 267.A O GLN 202.A HE22 3.371 2.443 SER 203.A N THR 200.A O SER 203.A H 3.131 2.397 SER 203.A N THR 200.A OG1 SER 203.A H 3.221 2.357 SER 203.A OG THR 200.A O SER 203.A HG 2.589 1.693 ASP 204.A N THR 200.A O ASP 204.A H 3.338 2.419 VAL 205.A N HIS 201.A O VAL 205.A H 3.210 2.410 TRP 206.A N GLN 202.A O TRP 206.A H 3.315 2.423 SER 207.A N SER 203.A O SER 207.A H 3.288 2.320 SER 207.A OG SER 203.A O SER 207.A HG 3.390 2.404 PHE 208.A N ASP 204.A O PHE 208.A H 2.828 1.972 GLY 209.A N VAL 205.A O GLY 209.A H 2.990 2.090 VAL 210.A N TRP 206.A O VAL 210.A H 3.185 2.277 LEU 211.A N SER 207.A O LEU 211.A H 2.909 1.972 LEU 212.A N PHE 208.A O LEU 212.A H 2.749 1.823 TRP 213.A N GLY 209.A O TRP 213.A H 3.088 2.139 TRP 213.A NE1 ASP 242.A O TRP 213.A HE1 3.068 2.153 GLU 214.A N VAL 210.A O GLU 214.A H 3.103 2.201 ILE 215.A N LEU 211.A O ILE 215.A H 2.985 2.079 PHE 216.A N LEU 212.A O PHE 216.A H 3.144 2.179 THR 217.A N TRP 213.A O THR 217.A H 2.982 2.137 LEU 218.A N ILE 215.A O LEU 218.A H 3.136 2.184 GLY 219.A N GLU 214.A O GLY 219.A H 2.774 1.762 GLY 220.A N THR 217.A OG1 GLY 220.A H 3.082 2.218 ILE 226.A N TYR 223.A O ILE 226.A H 3.446 2.554 LEU 231.A N PRO 227.A O LEU 231.A H 2.980 2.044 PHE 232.A N VAL 228.A O PHE 232.A H 3.178 2.252 LEU 234.A N GLU 230.A O LEU 234.A H 2.904 1.949 LEU 235.A N LEU 231.A O LEU 235.A H 3.017 2.047 LYS 236.A N PHE 232.A O LYS 236.A H 3.169 2.183 GLU 237.A N LYS 233.A O GLU 237.A H 3.075 2.203 GLY 238.A N LEU 235.A O GLY 238.A H 3.219 2.287 HIS 239.A N LEU 234.A O HIS 239.A H 2.942 1.967 ARG 240.A NE TRP 259.A O ARG 240.A HE 2.846 1.887 ARG 240.A NH1 LEU 235.A O ARG 240.A HH12 3.343 2.409 ARG 240.A NH1 HIS 239.A O ARG 240.A HH11 3.281 2.274 ARG 240.A NH2 TRP 259.A O ARG 240.A HH21 3.104 2.273 LYS 243.A NZ CYS 247.A O LYS 243.A HZ3 2.922 2.272 CYS 247.A SG THR 248.A O CYS 247.A HG 3.514 2.198 TYR 252.A N THR 248.A O TYR 252.A H 3.105 2.156 TYR 252.A OH MET 241.A O TYR 252.A HH 2.723 1.748 MET 253.A N HIS 249.A O MET 253.A H 3.022 2.179 ILE 254.A N ASP 250.A O ILE 254.A H 3.349 2.492 MET 255.A N LEU 251.A O MET 255.A H 3.092 2.163 ARG 256.A N TYR 252.A O ARG 256.A H 2.824 1.867 GLU 257.A N MET 253.A O GLU 257.A H 2.926 2.099 CYS 258.A N ILE 254.A O CYS 258.A H 3.092 2.181 CYS 258.A SG ILE 254.A O CYS 258.A HG 3.302 2.064 TRP 259.A N MET 255.A O TRP 259.A H 3.319 2.604 TRP 259.A N ARG 256.A O TRP 259.A H 3.372 2.527 HIS 260.A N GLU 257.A O HIS 260.A H 3.420 2.506 HIS 260.A NE2 GLU 257.A OE1 HIS 260.A HE2 2.782 1.776 GLN 265.A N ALA 262.A O GLN 265.A H 3.041 2.268 ARG 266.A N PRO 263.A O ARG 266.A H 3.061 2.118 ARG 266.A NE HIS 260.A O ARG 266.A HE 2.741 1.745 ARG 266.A NH1 GLU 192.A OE2 ARG 266.A HH12 2.728 1.826 ARG 266.A NH1 GLN 202.A O ARG 266.A HH11 2.979 2.022 ARG 266.A NH2 GLU 192.A OE1 ARG 266.A HH22 2.870 1.921 ARG 266.A NH2 HIS 260.A O ARG 266.A HH21 3.256 2.486 THR 268.A N GLN 271.A OE1 THR 268.A H 2.936 1.996 GLN 271.A N THR 268.A OG1 GLN 271.A H 3.276 2.331 LEU 272.A N THR 268.A O LEU 272.A H 2.907 2.013 VAL 273.A N PHE 269.A O VAL 273.A H 2.923 1.938 GLU 274.A N LYS 270.A O GLU 274.A H 3.215 2.307 ASP 275.A N GLN 271.A O ASP 275.A H 2.850 1.912 LEU 276.A N LEU 272.A O LEU 276.A H 2.891 1.879 ASP 277.A N VAL 273.A O ASP 277.A H 2.894 2.058 ARG 278.A N GLU 274.A O ARG 278.A H 3.163 2.212 ARG 278.A NH1 ASP 275.A OD1 ARG 278.A HH12 3.279 2.491 ARG 278.A NH2 ASP 275.A OD1 ARG 278.A HH22 3.012 2.133 VAL 279.A N ASP 275.A O VAL 279.A H 3.246 2.362 LEU 280.A N LEU 276.A O LEU 280.A H 3.250 2.326 THR 281.A N ASP 277.A O THR 281.A H 3.094 2.234 THR 281.A OG1 ARG 278.A O THR 281.A HG1 2.790 1.911 VAL 282.A N ARG 278.A O VAL 282.A H 3.048 2.048 THR 283.A N VAL 279.A O THR 283.A H 3.509 2.516 SER 284.A OG VAL 282.A O SER 284.A HG 3.416 2.436