Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8udu_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A NZ ASP 3.A OD1 LYS 5.A HZ3 2.708 1.710 TRP 6.A N ASP 3.A O TRP 6.A H 3.027 2.080 GLU 7.A N PRO 4.A O GLU 7.A H 3.201 2.300 LEU 8.A N ALA 85.A O LEU 8.A H 2.906 1.969 ARG 10.A NE GLN 88.A O ARG 10.A HE 2.795 1.788 ARG 10.A NH1 PRO 91.A O ARG 10.A HH12 2.872 2.041 ARG 10.A NH2 GLN 88.A O ARG 10.A HH21 3.411 2.657 ARG 10.A NH2 PRO 91.A O ARG 10.A HH22 2.707 1.804 ALA 11.A N SER 9.A OG ALA 11.A H 3.340 2.589 ARG 12.A N SER 9.A O ARG 12.A H 3.064 2.130 LEU 13.A N ARG 10.A O LEU 13.A H 3.005 2.009 THR 14.A N GLU 31.A O THR 14.A H 2.904 1.916 GLY 16.A N MET 29.A O GLY 16.A H 2.706 1.875 LEU 19.A N VAL 27.A O LEU 19.A H 2.923 1.919 CYS 23.A SG GLU 21.A O no hydrogen 3.818 N/A VAL 28.A N.A VAL 48.A O VAL 28.A H.A 2.905 1.956 VAL 28.A N.B VAL 48.A O VAL 28.A H.B 2.894 1.949 MET 29.A N LYS 17.A O MET 29.A H.B 3.021 2.035 ALA 30.A N VAL 46.A O ALA 30.A H 2.864 1.938 GLU 31.A N THR 14.A O GLU 31.A H 3.095 2.138 ALA 32.A N VAL 44.A O ALA 32.A H 2.847 1.839 ILE 33.A N ARG 12.A O ILE 33.A H 2.912 1.946 GLY 34.A N LYS 42.A O GLY 34.A H 3.222 2.230 LYS 37.A NZ GLY 34.A O LYS 37.A HZ2 3.324 2.378 ASP 38.A N ASP 36.A OD1 ASP 38.A H 3.033 2.084 ARG 39.A N ASP 36.A O ARG 39.A H 3.135 2.132 LYS 42.A N ARG 39.A O LYS 42.A H 3.231 2.336 LYS 42.A NZ PRO 43.A O LYS 42.A HZ2 3.204 2.264 VAL 44.A N ALA 32.A O VAL 44.A H 2.875 2.026 VAL 46.A N ALA 30.A O VAL 46.A H 2.811 1.818 ALA 47.A N VAL 96.A O ALA 47.A H 2.960 1.951 VAL 48.A N VAL 28.A O.A VAL 48.A H 2.704 1.712 VAL 48.A N VAL 28.A O.B VAL 48.A H 2.698 1.717 LYS 49.A N VAL 94.A O LYS 49.A H 2.952 1.966 LYS 49.A NZ GLU 66.A OE1 LYS 49.A HZ3 2.734 1.731 MET 50.A N GLN 26.A O MET 50.A H 3.275 2.326 ALA 55.A N LYS 52.A O ALA 55.A H 3.232 2.384 THR 56.A N ASP 59.A OD2 THR 56.A H 3.243 2.266 LEU 60.A N THR 56.A O LEU 60.A H 3.343 2.427 SER 61.A N ASP 57.A O SER 61.A H 3.109 2.116 SER 61.A OG LYS 58.A O SER 61.A HG 2.805 1.845 ASP 62.A N LYS 58.A O ASP 62.A H 2.862 1.944 LEU 63.A N ASP 59.A O LEU 63.A H 3.090 2.113 VAL 64.A N LEU 60.A O VAL 64.A H 2.890 1.908 SER 65.A N SER 61.A O SER 65.A H 2.882 1.917 SER 65.A OG SER 61.A O SER 65.A HG 2.890 2.021 GLU 66.A N ASP 62.A O GLU 66.A H 2.908 1.964 MET 67.A N LEU 63.A O MET 67.A H 2.934 1.951 GLU 68.A N VAL 64.A O GLU 68.A H 2.888 1.908 MET 69.A N SER 65.A O MET 69.A H 2.856 1.943 MET 70.A N GLU 66.A O MET 70.A H 3.012 2.099 LYS 71.A N MET 67.A O LYS 71.A H 3.055 2.135 LYS 71.A NZ ASP 3.A OD2 LYS 71.A HZ3 2.705 1.694 LYS 71.A NZ GLU 68.A OE2 LYS 71.A HZ2 2.836 1.849 MET 72.A N GLU 68.A O MET 72.A H 3.022 2.076 ILE 73.A N MET 69.A O ILE 73.A H 2.908 1.921 GLY 74.A N MET 70.A O GLY 74.A H 3.391 2.427 HIS 76.A N ASN 81.A OD1 HIS 76.A H 3.111 2.177 ASN 78.A N HIS 76.A ND1 ASN 78.A H 2.944 1.932 ASN 78.A ND2 GLN 129.A OE1 ASN 78.A HD21 3.512 2.898 ASN 78.A ND2 MET 160.A O ASN 78.A HD22 3.012 2.008 ILE 79.A N HIS 76.A O ILE 79.A H 3.280 2.305 ILE 80.A N ILE 162.A O ILE 80.A H 2.914 1.953 ASN 81.A N GLU 97.A OE1 ASN 81.A H 3.028 2.076 ASN 81.A ND2 HIS 76.A O ASN 81.A HD21 2.750 1.762 ASN 81.A ND2 GLU 97.A OE1 ASN 81.A HD22 2.958 2.069 ASN 81.A ND2 GLU 97.A OE2 ASN 81.A HD22 3.448 2.525 LEU 83.A N LEU 95.A O LEU 83.A H 2.832 1.835 GLY 84.A N LEU 95.A O GLY 84.A H 3.413 2.470 ALA 85.A N TRP 6.A O ALA 85.A H 2.898 2.016 CYS 86.A N TYR 93.A O CYS 86.A H 2.888 1.956 CYS 86.A SG LEU 8.A O CYS 86.A HG 3.501 2.352 THR 87.A N GLU 7.A OE1 THR 87.A H 2.883 1.940 THR 87.A OG1 GLU 7.A OE1 THR 87.A HG1 3.494 2.670 THR 87.A OG1 GLU 7.A OE2 THR 87.A HG1 2.654 1.721 GLN 88.A N GLU 7.A OE1 GLN 88.A H 3.216 2.321 TYR 93.A N CYS 86.A O TYR 93.A H 3.032 2.072 VAL 94.A N LYS 49.A O VAL 94.A H 2.972 1.974 LEU 95.A N GLY 84.A O LEU 95.A H 2.834 1.858 VAL 96.A N ALA 47.A O VAL 96.A H 2.851 1.854 GLU 97.A N ASN 81.A O GLU 97.A H 3.032 2.175 LYS 101.A N VAL 154.A O LYS 101.A H 2.948 2.067 LYS 101.A NZ GLU 116.A OE2 LYS 101.A HZ3 3.024 2.104 LYS 101.A NZ ASN 158.A OD1 LYS 101.A HZ2 2.815 1.849 GLY 102.A N ALA 99.A O GLY 102.A H 3.352 2.354 LEU 104.A N VAL 152.A O LEU 104.A H 2.678 1.807 ARG 105.A NE.B GLU 106.A OE2 ARG 105.A HE.B 2.810 1.904 ARG 105.A NH1.B GLU 106.A OE2 ARG 105.A HH11.B 2.933 2.097 GLU 106.A N ASN 103.A OD1 GLU 106.A H.A 2.862 1.880 PHE 107.A N ASN 103.A O PHE 107.A H 2.948 1.975 LEU 108.A N LEU 104.A O LEU 108.A H 2.921 1.961 ARG 109.A N.A ARG 105.A O.A ARG 109.A H.A 3.076 2.111 ARG 109.A N.A ARG 105.A O.B ARG 109.A H.A 3.162 2.204 ARG 109.A N.B ARG 105.A O.A ARG 109.A H.B 3.076 2.090 ARG 109.A N.B ARG 105.A O.B ARG 109.A H.B 3.161 2.178 ARG 109.A NE.B GLY 212.A O ARG 109.A HE.B 2.520 1.684 ARG 109.A NH2.B GLY 212.A O ARG 109.A HH21.B 2.429 1.583 ALA 110.A N GLU 106.A O ALA 110.A H.A 3.032 2.114 ARG 111.A N LEU 108.A O ARG 111.A H 3.058 2.104 ARG 111.A NE GLU 116.A OE2 ARG 111.A HE 3.018 2.070 ARG 111.A NH1 PHE 107.A O ARG 111.A HH11 3.072 2.107 ARG 111.A NH2 GLU 116.A OE2 ARG 111.A HH21 3.232 2.384 ARG 112.A NE LEU 211.A O ARG 112.A HE 2.826 1.931 ARG 112.A NH2 LEU 211.A O ARG 112.A HH21 2.910 2.064 GLN 117.A N GLY 114.A O GLN 117.A H 3.159 2.273 LEU 118.A N ARG 111.A O LEU 118.A H 3.085 2.143 THR 119.A N ASP 122.A OD2 THR 119.A H 3.064 2.061 ASP 122.A N THR 119.A OG1 ASP 122.A H 3.203 2.252 LEU 123.A N THR 119.A O LEU 123.A H 3.167 2.251 VAL 124.A N PHE 120.A O VAL 124.A H 2.987 2.059 SER 125.A N LYS 121.A O SER 125.A H 2.914 1.948 CYS 126.A N.A ASP 122.A O CYS 126.A H.A 2.953 2.005 CYS 126.A N.B ASP 122.A O CYS 126.A H.B 2.951 1.998 CYS 126.A SG.A ASP 122.A O CYS 126.A HG.A 3.411 2.307 ALA 127.A N LEU 123.A O ALA 127.A H.A 3.035 2.045 TYR 128.A N VAL 124.A O TYR 128.A H 2.865 1.879 GLN 129.A N SER 125.A O GLN 129.A H 2.974 2.017 GLN 129.A NE2 SER 125.A O GLN 129.A HE21 3.389 2.565 GLN 129.A NE2 SER 125.A OG GLN 129.A HE21 3.232 2.379 VAL 130.A N CYS 126.A O.A VAL 130.A H 3.049 2.078 VAL 130.A N CYS 126.A O.B VAL 130.A H 3.086 2.117 ALA 131.A N ALA 127.A O ALA 131.A H 2.944 1.960 ARG 132.A N TYR 128.A O ARG 132.A H 2.933 2.014 GLY 133.A N GLN 129.A O GLY 133.A H 3.023 2.054 MET 134.A N VAL 130.A O MET 134.A H 2.916 1.945 GLU 135.A N ALA 131.A O GLU 135.A H 2.753 1.792 TYR 136.A N ARG 132.A O TYR 136.A H 3.039 2.084 TYR 136.A OH ILE 73.A O TYR 136.A HH 2.654 1.858 LEU 137.A N GLY 133.A O LEU 137.A H 2.949 1.976 ALA 138.A N MET 134.A O ALA 138.A H 2.866 1.866 SER 139.A N GLU 135.A O SER 139.A H 3.018 2.065 SER 139.A OG TYR 136.A O SER 139.A HG 2.523 1.539 GLN 140.A N TYR 136.A O GLN 140.A H 3.100 2.298 GLN 140.A N LEU 137.A O GLN 140.A H 3.031 2.270 GLN 140.A NE2 SER 139.A OG GLN 140.A HE21 3.113 2.184 LYS 141.A N ALA 138.A O LYS 141.A H 2.984 2.039 CYS 142.A N LEU 137.A O CYS 142.A H 2.948 1.981 HIS 144.A N ASP 197.A OD2 HIS 144.A H 2.829 1.842 HIS 144.A NE2 ALA 163.A O HIS 144.A HE2 2.734 1.782 ARG 145.A N.A ASP 197.A OD1 ARG 145.A H.A 3.085 2.076 ARG 145.A N.B ASP 197.A OD1 ARG 145.A H.B 3.083 2.081 ASP 146.A N HIS 144.A ND1 ASP 146.A H.A 3.097 2.159 ALA 149.A N GLU 207.A OE1 ALA 149.A H 2.914 1.908 ARG 150.A NH2 ASP 146.A OD1 ARG 150.A HH21 2.859 1.998 ASN 151.A N ALA 148.A O ASN 151.A H 2.836 1.896 ASN 151.A ND2 ASP 146.A O ASN 151.A HD22 2.825 1.824 VAL 152.A N ALA 149.A O VAL 152.A H 3.125 2.141 LEU 153.A N LYS 161.A O LEU 153.A H 2.769 1.781 VAL 154.A N GLY 102.A O VAL 154.A H 2.860 1.954 THR 155.A N VAL 159.A O THR 155.A H 3.124 2.181 ASN 158.A N THR 155.A O ASN 158.A H 2.925 2.017 VAL 159.A N THR 155.A OG1 VAL 159.A H 2.993 2.004 MET 160.A N GLN 129.A OE1 MET 160.A H 2.937 1.957 LYS 161.A N LEU 153.A O LYS 161.A H 2.803 1.932 LYS 161.A NZ LYS 77.A O LYS 161.A HZ3 2.813 1.840 LYS 161.A NZ GLU 97.A OE1 LYS 161.A HZ2 3.022 2.049 ILE 162.A N ASN 78.A O ILE 162.A H 2.833 1.843 ALA 163.A N ASN 151.A O ALA 163.A H 2.824 1.819 ASP 171.A N ASN 169.A OD1 ASP 171.A H 2.996 1.996 TYR 172.A N ASN 169.A O TYR 172.A H 3.132 2.118 VAL 179.A N LEU 177.A O VAL 179.A H 2.858 2.038 LYS 180.A NZ PRO 215.A O LYS 180.A HZ3 3.484 2.640 LYS 180.A NZ TYR 216.A O LYS 180.A HZ3 3.020 2.199 LYS 180.A NZ ILE 219.A O LYS 180.A HZ1 3.418 2.447 TRP 181.A N PRO 178.A O TRP 181.A H 2.931 1.937 TRP 181.A NE1 GLU 207.A OE1 TRP 181.A HE1 2.823 1.810 MET 182.A N VAL 179.A O MET 182.A H 3.258 2.255 GLU 185.A N GLU 185.A OE1 GLU 185.A H 2.800 1.853 LEU 187.A N ALA 183.A O LEU 187.A H 2.910 1.937 PHE 188.A N PRO 184.A O PHE 188.A H 2.864 1.933 ASP 189.A N GLU 185.A O ASP 189.A H 2.928 1.932 ARG 190.A N ALA 186.A O ARG 190.A H 2.724 1.838 THR 193.A N SER 196.A OG THR 193.A H 2.879 1.881 SER 196.A N THR 193.A OG1 SER 196.A H 2.836 1.904 ASP 197.A N THR 193.A O ASP 197.A H 3.065 2.129 VAL 198.A N HIS 194.A O VAL 198.A H 2.963 2.132 TRP 199.A N GLN 195.A O TRP 199.A H 3.230 2.295 SER 200.A N SER 196.A O SER 200.A H 3.087 2.103 SER 200.A OG SER 196.A O SER 200.A HG 3.275 2.340 PHE 201.A N ASP 197.A O PHE 201.A H 2.831 1.902 GLY 202.A N VAL 198.A O GLY 202.A H 3.009 2.096 VAL 203.A N TRP 199.A O VAL 203.A H 3.184 2.295 LEU 204.A N SER 200.A O LEU 204.A H 2.878 1.909 LEU 205.A N PHE 201.A O LEU 205.A H 2.775 1.863 TRP 206.A N GLY 202.A O TRP 206.A H 3.092 2.153 GLU 207.A N VAL 203.A O GLU 207.A H 2.904 1.968 ILE 208.A N LEU 204.A O ILE 208.A H 2.860 1.927 PHE 209.A N LEU 205.A O PHE 209.A H 3.001 2.020 THR 210.A N TRP 206.A O THR 210.A H 3.042 2.217 THR 210.A OG1 GLU 207.A O THR 210.A HG1 3.191 2.260 LEU 211.A N ILE 208.A O LEU 211.A H 2.981 2.019 GLY 212.A N GLU 207.A O GLY 212.A H 2.786 1.771 GLY 213.A N THR 210.A OG1 GLY 213.A H 2.901 2.013 ILE 219.A N TYR 216.A O ILE 219.A H 3.244 2.245 GLU 222.A N GLU 222.A OE1 GLU 222.A H 2.786 1.839 GLU 223.A N PRO 220.A O GLU 223.A H 2.983 2.009 LEU 224.A N VAL 221.A O LEU 224.A H 3.287 2.366 LEU 227.A N GLU 223.A O LEU 227.A H 3.141 2.148 LEU 228.A N LEU 224.A O LEU 228.A H 2.949 1.945 LYS 229.A N PHE 225.A O LYS 229.A H 2.903 1.922 GLU 230.A N LYS 226.A O GLU 230.A H 2.958 2.083 GLY 231.A N LEU 228.A O GLY 231.A H 3.074 2.108 HIS 232.A N LEU 227.A O HIS 232.A H 2.908 1.966 ARG 233.A NE TRP 252.A O ARG 233.A HE 2.839 1.953 ARG 233.A NH1 LEU 228.A O ARG 233.A HH12 2.905 1.907 ARG 233.A NH1 HIS 232.A O ARG 233.A HH11 2.831 1.851 ARG 233.A NH2 TRP 252.A O ARG 233.A HH21 2.948 2.133 LYS 236.A NZ CYS 240.A O LYS 236.A HZ3 2.785 1.791 CYS 240.A N PRO 237.A O CYS 240.A H 3.082 2.102 CYS 240.A SG THR 241.A O CYS 240.A HG 3.569 2.248 LEU 244.A N THR 241.A OG1 LEU 244.A H 3.371 2.376 TYR 245.A N THR 241.A O TYR 245.A H 3.116 2.150 TYR 245.A OH MET 234.A O TYR 245.A HH 2.556 1.588 MET 246.A N HIS 242.A O MET 246.A H 2.920 1.997 ILE 247.A N ASP 243.A O ILE 247.A H 3.093 2.199 MET 248.A N LEU 244.A O MET 248.A H 3.070 2.101 ARG 249.A N TYR 245.A O ARG 249.A H 2.844 1.889 ARG 249.A NH1 TYR 245.A OH ARG 249.A HH11 3.050 2.116 GLU 250.A N MET 246.A O GLU 250.A H 2.884 1.967 CYS 251.A N ILE 247.A O CYS 251.A H 2.964 1.977 CYS 251.A SG ILE 247.A O CYS 251.A HG 3.444 2.376 TRP 252.A N MET 248.A O TRP 252.A H 3.073 2.281 TRP 252.A N ARG 249.A O TRP 252.A H 3.166 2.436 HIS 253.A N GLU 250.A O HIS 253.A H 3.162 2.270 ALA 255.A N HIS 253.A ND1 ALA 255.A H 2.990 2.029 GLN 258.A N ALA 255.A O GLN 258.A H 2.950 2.005 ARG 259.A N PRO 256.A O ARG 259.A H 3.210 2.224 ARG 259.A NE HIS 253.A O ARG 259.A HE 2.841 1.864 ARG 259.A NH1 GLU 185.A OE2 ARG 259.A HH12 2.764 1.822 ARG 259.A NH1 GLN 195.A O ARG 259.A HH11 3.045 2.089 ARG 259.A NH2 GLU 185.A OE1 ARG 259.A HH22 2.860 1.870 ARG 259.A NH2 HIS 253.A O ARG 259.A HH21 3.137 2.312 GLN 264.A N THR 261.A OG1 GLN 264.A H 3.104 2.125 LEU 265.A N THR 261.A O LEU 265.A H 2.925 1.984 VAL 266.A N PHE 262.A O VAL 266.A H 2.961 2.020 GLU 267.A N LYS 263.A O GLU 267.A H 3.268 2.299 ASP 268.A N GLN 264.A O ASP 268.A H 2.833 1.859 LEU 269.A N LEU 265.A O LEU 269.A H 2.873 1.885 ASP 270.A N VAL 266.A O ASP 270.A H 2.909 1.991 ARG 271.A N GLU 267.A O ARG 271.A H 2.974 2.008 ARG 271.A NH1 ASP 268.A OD1 ARG 271.A HH11 3.153 2.290 VAL 272.A N ASP 268.A O VAL 272.A H 2.955 1.987 LEU 273.A N LEU 269.A O LEU 273.A H 2.966 2.009 THR 274.A N ASP 270.A O THR 274.A H 3.175 2.242 THR 274.A OG1 ASP 270.A O THR 274.A HG1 3.267 2.290 VAL 275.A N ARG 271.A O VAL 275.A H 2.928 1.942 THR 276.A N VAL 272.A O THR 276.A H 2.831 2.026 THR 276.A N LEU 273.A O THR 276.A H 3.250 2.513 THR 276.A OG1 VAL 272.A O THR 276.A HG1 2.420 1.468 SER 277.A N LEU 273.A O SER 277.A H 3.217 2.285 HIS 278.A N VAL 275.A O HIS 278.A H 3.145 2.232 HIS 278.A ND1 THR 274.A O HIS 278.A HD1 3.290 2.290 HIS 279.A N VAL 275.A O HIS 279.A H 3.241 2.316