Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8vgr_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 13.A N SER 11.A O SER 13.A H 2.555 1.813 ALA 15.A N LEU 12.A O ALA 15.A H 3.227 2.546 ASN 19.A N PHE 179.A O ASN 19.A H 3.409 2.562 TRP 24.A N ASP 22.A OD1 TRP 24.A H 2.458 1.715 VAL 25.A N ASP 22.A O VAL 25.A H 2.906 2.084 TYR 26.A OH PHE 177.A O TYR 26.A HH 2.594 1.928 THR 30.A N SER 171.A O THR 30.A H 3.076 2.311 THR 30.A OG1 GLU 31.A O THR 30.A HG1 3.502 2.667 VAL 32.A N LEU 169.A O VAL 32.A H 2.971 2.125 GLY 35.A N VAL 32.A O GLY 35.A H 2.821 1.983 THR 36.A N GLY 34.A O THR 36.A H 2.906 2.228 PHE 37.A N ILE 167.A O PHE 37.A H 3.126 2.341 VAL 39.A N ILE 165.A O VAL 39.A H 2.906 2.119 THR 43.A N SER 40.A O THR 43.A H 3.040 2.238 LEU 49.A N VAL 150.A O LEU 49.A H 2.843 2.003 LEU 52.A N LEU 148.A O LEU 52.A H 2.932 2.121 LEU 60.A N THR 30.A OG1 LEU 60.A H 3.087 2.260 TYR 61.A N ASN 59.A OD1 TYR 61.A H 2.682 1.902 THR 62.A OG1 PRO 56.A O THR 62.A HG1 2.392 1.604 SER 63.A N ASN 59.A O SER 63.A H 2.683 1.853 SER 63.A OG ASN 59.A O SER 63.A HG 2.709 2.124 SER 63.A OG LEU 60.A O SER 63.A HG 2.826 2.197 HIS 64.A N TYR 61.A O HIS 64.A H 3.349 2.593 LEU 65.A N TYR 61.A O LEU 65.A H 2.946 2.090 PHE 66.A N THR 62.A O PHE 66.A H 2.882 2.058 ARG 67.A N HIS 64.A O ARG 67.A H 3.349 2.572 ARG 67.A NH2 GLN 187.A O ARG 67.A HH22 3.404 2.886 MET 68.A N LEU 65.A O MET 68.A H 2.742 2.007 TYR 69.A N PHE 66.A O TYR 69.A H 2.927 2.118 ALA 70.A N MET 181.A O ALA 70.A H 3.067 2.328 SER 73.A N LYS 178.A O SER 73.A H 2.898 2.240 PHE 76.A N ALA 130.A O PHE 76.A H 3.107 2.278 SER 77.A N ALA 172.A O SER 77.A H 2.980 2.188 LEU 78.A N ILE 128.A O LEU 78.A H 3.092 2.239 LYS 79.A N THR 170.A O LYS 79.A H 2.775 1.924 LEU 80.A N MET 126.A O LEU 80.A H 3.085 2.260 LEU 81.A N LYS 168.A O LEU 81.A H 3.146 2.353 ALA 83.A N GLU 166.A O ALA 83.A H 2.874 2.056 ASN 85.A N SER 88.A OG ASN 85.A H 2.928 2.139 SER 88.A N ASN 85.A O SER 88.A H 2.914 2.239 LEU 92.A N LEU 118.A O LEU 92.A H 2.623 1.766 ILE 93.A N MET 151.A O ILE 93.A H 2.978 2.201 ALA 94.A N GLU 116.A O ALA 94.A H 2.870 2.051 ALA 95.A N VAL 149.A O ALA 95.A H 2.997 2.195 ILE 96.A N PRO 114.A O ILE 96.A H 2.876 2.064 ILE 97.A N LYS 147.A O ILE 97.A H 2.902 2.067 LEU 109.A N SER 106.A O LEU 109.A H 2.833 2.191 LEU 110.A N SER 106.A O LEU 110.A H 2.961 2.193 THR 111.A N ALA 107.A O THR 111.A H 2.964 2.245 THR 111.A OG1 ALA 107.A O THR 111.A HG1 3.562 2.784 THR 111.A OG1 TYR 108.A O THR 111.A HG1 2.466 1.960 GLY 112.A N LEU 109.A O GLY 112.A H 3.207 2.374 PHE 113.A N LEU 110.A O PHE 113.A H 2.853 2.089 HIS 115.A ND1 PHE 113.A O HIS 115.A HD1 2.897 2.177 GLU 116.A N ALA 94.A O GLU 116.A H 2.726 1.965 LEU 118.A N LEU 92.A O LEU 118.A H 3.052 2.261 PHE 120.A N GLY 90.A O PHE 120.A H 3.253 2.446 THR 122.A OG1 ASP 124.A O THR 122.A HG1 3.258 2.869 ILE 128.A N LEU 78.A O ILE 128.A H 2.801 2.040 ILE 129.A N THR 2.A O ILE 129.A H 2.844 2.003 ALA 130.A N PHE 76.A O ALA 130.A H 2.779 1.941 ASP 132.A N GLY 74.A O ASP 132.A H 3.181 2.596 LYS 134.A NZ SER 73.A OG LYS 134.A HZ3 3.310 2.545 HIS 139.A N TRP 72.A O HIS 139.A H 2.899 2.188 HIS 139.A NE2 ASP 132.A OD1 HIS 139.A HE2 2.890 2.145 ARG 141.A NH1 TYR 69.A O ARG 141.A HH12 3.043 2.276 ARG 141.A NH2 PHE 66.A O ARG 141.A HH22 2.562 1.905 ARG 141.A NH2 TYR 69.A O ARG 141.A HH22 3.016 2.243 LYS 147.A N ILE 97.A O LYS 147.A H 3.100 2.307 VAL 149.A N ALA 95.A O VAL 149.A H 3.095 2.308 MET 151.A N ILE 93.A O MET 151.A H 3.154 2.385 TYR 153.A N LYS 91.A O TYR 153.A H 2.712 2.048 SER 154.A N LYS 91.A O SER 154.A H 3.109 2.388 ILE 165.A N VAL 39.A O ILE 165.A H 2.967 2.210 ILE 167.A N PHE 37.A O ILE 167.A H 2.911 2.075 LYS 168.A N LEU 81.A O LYS 168.A H 3.041 2.237 LEU 169.A N GLY 35.A O LEU 169.A H 2.906 2.077 THR 170.A N LYS 79.A O THR 170.A H 3.130 2.330 SER 171.A N THR 30.A O SER 171.A H 3.044 2.274 SER 171.A OG LEU 58.A O SER 171.A HG 2.497 2.005 ALA 172.A N SER 77.A O ALA 172.A H 3.256 2.594 LEU 174.A N GLY 75.A O LEU 174.A H 2.741 1.909 PHE 177.A N LEU 174.A O PHE 177.A H 3.198 2.520 LYS 178.A N SER 73.A O LYS 178.A H 2.872 2.083 PHE 179.A N ASN 19.A O PHE 179.A H 3.373 2.587 VAL 183.A N MET 68.A O VAL 183.A H 2.402 1.549 ILE 186.A N PRO 184.A O ILE 186.A H 2.793 2.061 GLN 187.A NE2 ARG 67.A O GLN 187.A HE21 2.888 2.034 LEU 191.A N SER 438.A O LEU 191.A H 3.243 2.397 TRP 194.A NE1 SER 434.A OG TRP 194.A HE1 2.558 1.822 SER 203.A N PRO 200.A O SER 203.A H 2.966 2.139 MET 204.A N PRO 201.A O MET 204.A H 2.928 2.124 ASN 206.A ND2 VAL 423.A O ASN 206.A HD22 3.050 2.396 ARG 208.A NH2 VAL 374.A O ARG 208.A HH22 2.909 2.378 SER 209.A N ASN 206.A O SER 209.A H 2.890 2.070 THR 212.A N SER 209.A O THR 212.A H 3.151 2.337 VAL 215.A N ARG 402.A O VAL 215.A H 2.572 1.801 LEU 217.A N ILE 482.A O LEU 217.A H 2.902 2.055 TYR 218.A N TRP 400.A O TYR 218.A H 3.176 2.458 ILE 219.A N PHE 480.A O ILE 219.A H 3.161 2.505 SER 222.A N ASN 220.A OD1 SER 222.A H 2.675 1.949 CYS 226.A N VAL 390.A O CYS 226.A H 2.957 2.151 ASN 227.A ND2 ASN 227.A O ASN 227.A HD21 2.631 1.911 ARG 232.A NH1 PRO 388.A O ARG 232.A HH12 2.833 2.086 ARG 232.A NH2 PRO 388.A O ARG 232.A HH22 2.832 2.089 THR 234.A N GLY 238.A O THR 234.A H 2.620 1.784 ILE 235.A N PRO 465.A O ILE 235.A H 2.698 1.844 ASN 242.A N GLN 229.A O ASN 242.A H 2.978 2.230 ASN 242.A ND2 PRO 289.A O ASN 242.A HD22 2.645 1.797 SER 243.A N ILE 240.A O SER 243.A H 3.041 2.206 SER 243.A OG ARG 232.A O SER 243.A HG 3.068 2.455 ASN 246.A N THR 244.A OG1 ASN 246.A H 3.129 2.291 ALA 250.A N ASN 246.A O ALA 250.A H 3.281 2.545 CYS 255.A N TYR 358.A O CYS 255.A H 2.919 2.063 THR 256.A N LEU 272.A O THR 256.A H 2.786 1.974 GLU 258.A N TYR 270.A O GLU 258.A H 2.962 2.168 ARG 269.A NH2 LEU 352.A O ARG 269.A HH21 2.864 2.290 ARG 269.A NH2 GLU 353.A O ARG 269.A HH22 3.293 2.692 ALA 271.A N ILE 345.A O ALA 271.A H 2.864 2.032 LEU 272.A N THR 256.A O LEU 272.A H 2.716 1.887 ASP 274.A N THR 254.A O ASP 274.A H 2.456 1.620 THR 280.A N ASP 282.A OD1 THR 280.A H 3.434 2.599 PHE 281.A N ASN 278.A O PHE 281.A H 2.635 1.775 ARG 290.A NE SER 243.A O ARG 290.A HE 3.399 2.681 ARG 290.A NH2 GLY 241.A O ARG 290.A HH21 3.353 2.645 GLY 291.A N ASN 242.A O GLY 291.A H 2.922 2.111 TRP 295.A NE1 ARG 208.A O TRP 295.A HE1 2.833 2.037 GLN 305.A N GLY 302.A O GLN 305.A H 3.408 2.619 GLN 305.A NE2 GLY 298.A O GLN 305.A HE21 3.587 2.864 HIS 306.A N SER 366.A O HIS 306.A H 2.610 1.762 VAL 308.A N GLY 364.A O VAL 308.A H 2.790 1.941 CYS 309.A N HIS 325.A O CYS 309.A H 3.239 2.405 PHE 310.A N ILE 361.A O PHE 310.A H 2.766 1.967 THR 311.A N ASP 323.A O THR 311.A H 2.754 1.924 LYS 313.A NZ GLU 353.A OE2 LYS 313.A HZ2 2.559 1.737 LYS 314.A N GLN 357.A O LYS 314.A H 3.026 2.223 GLY 318.A N VAL 315.A O GLY 318.A H 2.657 1.885 GLN 320.A N GLY 318.A O GLN 320.A H 2.710 1.993 ASP 323.A N THR 311.A O ASP 323.A H 2.967 2.219 HIS 325.A N CYS 309.A O HIS 325.A H 3.016 2.204 TRP 327.A N LEU 307.A O TRP 327.A H 2.444 1.587 ASP 328.A N TYR 346.A O ASP 328.A H 2.958 2.334 TYR 329.A OH GLN 342.A OE1 TYR 329.A HH 2.460 1.794 ASN 332.A ND2 SER 301.A O ASN 332.A HD21 3.520 2.669 GLU 333.A N LEU 337.A O GLU 333.A H 3.321 2.524 ILE 345.A N ALA 271.A O ILE 345.A H 2.845 2.018 TYR 346.A OH ASN 332.A OD1 TYR 346.A HH 2.779 2.056 ILE 347.A N ARG 269.A O ILE 347.A H 3.138 2.366 LYS 348.A N MET 326.A O LYS 348.A H 2.705 1.853 ASP 349.A N ILE 347.A O ASP 349.A H 2.938 2.305 LEU 352.A N ASP 349.A O LEU 352.A H 3.253 2.457 LEU 359.A N GLY 312.A O LEU 359.A H 2.603 1.841 VAL 360.A N ALA 253.A O VAL 360.A H 3.152 2.353 MET 363.A N VAL 308.A O MET 363.A H 2.717 1.913 GLY 364.A N VAL 308.A O GLY 364.A H 3.130 2.398 SER 366.A N HIS 306.A O SER 366.A H 2.494 1.707 SER 366.A OG ASN 417.A O SER 366.A HG 3.535 2.938 THR 373.A N ASN 370.A O THR 373.A H 2.660 1.913 THR 373.A OG1 GLN 305.A OE1 THR 373.A HG1 3.036 2.283 GLN 375.A N ASP 371.A O GLN 375.A H 2.898 2.110 VAL 376.A N ASP 372.A O VAL 376.A H 3.095 2.250 TYR 386.A N TRP 384.A O TYR 386.A H 2.605 1.875 GLU 396.A N PRO 393.A O GLU 396.A H 2.912 2.109 VAL 399.A N MET 469.A O VAL 399.A H 2.879 2.183 TRP 400.A N TYR 218.A O TRP 400.A H 3.098 2.263 PHE 401.A N ALA 425.A O PHE 401.A H 2.942 2.110 ARG 402.A N GLU 216.A O ARG 402.A H 2.579 1.738 SER 403.A N VAL 423.A O SER 403.A H 3.274 2.582 SER 403.A OG VAL 423.A O SER 403.A HG 3.111 2.296 LEU 405.A N VAL 421.A O LEU 405.A H 2.914 2.216 THR 410.A OG1 SER 414.A OG THR 410.A HG1 2.948 2.331 VAL 419.A N VAL 365.A O VAL 419.A H 2.916 2.105 VAL 423.A N SER 403.A O VAL 423.A H 3.154 2.299 ASN 424.A N ASN 424.A OD1 ASN 424.A H 2.541 1.910 ALA 425.A N PHE 401.A O ALA 425.A H 2.978 2.201 SER 428.A OG GLY 231.A O SER 428.A HG 2.548 1.870 MET 432.A N PRO 429.A O MET 432.A H 2.884 2.259 CYS 433.A N PRO 429.A O CYS 433.A H 3.079 2.356 CYS 433.A SG ASP 430.A O no hydrogen 2.906 N/A TYR 436.A N MET 432.A O TYR 436.A H 2.916 2.136 TYR 436.A OH THR 234.A O TYR 436.A HH 2.909 2.080 SER 438.A N SER 434.A O SER 438.A H 2.927 2.128 GLY 439.A N ALA 435.A O GLY 439.A H 2.495 1.708 LYS 444.A N PRO 441.A O LYS 444.A H 3.239 2.507 VAL 445.A N VAL 494.A O VAL 445.A H 2.702 2.088 ALA 446.A N LEU 463.A O ALA 446.A H 3.077 2.220 LEU 447.A N SER 492.A O LEU 447.A H 3.079 2.341 LEU 448.A N PHE 461.A O LEU 448.A H 2.626 1.785 ASP 449.A N ARG 489.A O ASP 449.A H 2.807 2.206 TYR 450.A OH PRO 483.A O TYR 450.A HH 2.555 1.716 VAL 451.A N TYR 487.A O VAL 451.A H 2.675 1.842 SER 456.A N PHE 453.A O SER 456.A H 2.479 1.674 GLN 460.A NE2 ASP 449.A OD1 GLN 460.A HE21 3.019 2.291 PHE 461.A N LEU 448.A O PHE 461.A H 3.203 2.592 LYS 462.A N THR 470.A O LYS 462.A H 3.067 2.324 LYS 462.A NZ GLU 396.A OE1 LYS 462.A HZ1 3.372 2.715 LEU 463.A N ALA 446.A O LEU 463.A H 2.823 2.067 TYR 464.A N TYR 468.A O TYR 464.A H 3.069 2.245 GLY 467.A N TYR 464.A O GLY 467.A H 3.273 2.417 TYR 468.A OH GLU 466.A OE2 TYR 468.A HH 2.298 1.701 THR 470.A N LYS 462.A O THR 470.A H 3.214 2.505 ALA 471.A N GLN 397.A O ALA 471.A H 3.305 2.494 ASN 472.A ND2 ILE 500.A O ASN 472.A HD21 2.963 2.449 THR 474.A N VAL 504.A O THR 474.A H 3.244 2.560 PHE 480.A N ASN 477.A OD1 PHE 480.A H 3.186 2.555 ILE 482.A N LEU 217.A O ILE 482.A H 2.543 1.717 ARG 489.A N ASP 449.A O ARG 489.A H 3.086 2.322 ARG 489.A NH1 ASP 449.A OD2 ARG 489.A HH12 3.032 2.413 TRP 493.A NE1 PRO 192.A O TRP 493.A HE1 2.542 1.888 VAL 494.A N VAL 445.A O VAL 494.A H 2.942 2.104 PHE 498.A N SER 495.A O PHE 498.A H 3.148 2.343 MET 499.A N THR 38.A OG1 MET 499.A H 3.187 2.378 VAL 504.A N ASN 472.A O VAL 504.A H 2.798 2.072 LEU 506.A N THR 474.A O LEU 506.A H 3.091 2.261