Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8vnx_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TYR 5.A N VAL 16.A O TYR 5.A H 3.027 2.232 TYR 5.A OH TYR 20.A O TYR 5.A HH 2.584 1.745 VAL 7.A N PHE 14.A O VAL 7.A H 2.962 2.163 VAL 9.A N SER 12.A O VAL 9.A H 2.974 2.277 SER 12.A N VAL 9.A O SER 12.A H 2.847 2.130 THR 13.A OG1 GLU 8.A OE1 THR 13.A HG1 2.459 1.812 PHE 14.A N VAL 7.A O PHE 14.A H 2.850 2.000 THR 15.A N TYR 99.A OH THR 15.A H 3.002 2.142 VAL 16.A N TYR 5.A O VAL 16.A H 2.960 2.196 LYS 18.A N GLN 3.A O LYS 18.A H 2.996 2.266 LYS 18.A NZ ASN 2.A O LYS 18.A HZ1 2.335 1.637 ARG 19.A NE ASP 39.A OD1 ARG 19.A HE 3.006 2.199 ARG 19.A NH2 ASP 39.A OD1 ARG 19.A HH21 3.312 2.612 ARG 19.A NH2 ASP 39.A OD2 ARG 19.A HH21 2.817 2.053 TYR 20.A N LEU 17.A O TYR 20.A H 3.096 2.249 GLN 21.A N TYR 38.A O GLN 21.A H 2.870 2.055 GLN 21.A NE2 LYS 18.A O GLN 21.A HE21 2.795 1.981 LYS 24.A N ALA 36.A O LYS 24.A H 3.034 2.229 LYS 24.A NZ LEU 23.A O LYS 24.A HZ3 2.696 2.040 ILE 26.A N VAL 34.A O ILE 26.A H 3.395 2.610 GLN 31.A NE2 HIS 60.A O GLN 31.A HE22 2.971 2.163 VAL 34.A N GLY 27.A O VAL 34.A H 3.100 2.346 CYS 35.A N ILE 48.A O CYS 35.A H 2.835 2.039 ALA 36.A N LYS 24.A O ALA 36.A H 2.725 1.939 ALA 37.A N VAL 46.A O ALA 37.A H 2.923 2.197 TYR 38.A N GLN 21.A O TYR 38.A H 2.877 2.032 TYR 38.A OH ASP 43.A OD1 TYR 38.A HH 2.571 1.735 ASP 39.A N ARG 44.A O ASP 39.A H 2.803 1.949 ALA 40.A N ARG 19.A O ALA 40.A H 2.823 1.976 VAL 41.A N ASP 39.A OD1 VAL 41.A H 2.912 2.135 LEU 42.A N ASP 39.A OD1 LEU 42.A H 3.268 2.458 ASP 43.A N ASP 39.A O ASP 43.A H 2.634 1.990 VAL 46.A N ALA 37.A O VAL 46.A H 2.764 1.945 ALA 47.A N MET 102.A O ALA 47.A H 2.730 1.907 ILE 48.A N CYS 35.A O ILE 48.A H 2.740 1.925 LYS 49.A N LEU 100.A O LYS 49.A H 2.798 1.969 LYS 50.A N ILE 33.A O LYS 50.A H 2.999 2.159 LYS 50.A NZ THR 13.A O LYS 50.A HZ3 2.602 1.729 LEU 51.A N VAL 98.A O LEU 51.A H 2.706 1.853 ARG 53.A NE GLN 96.A OE1 ARG 53.A HE 2.523 1.906 ARG 53.A NH2 GLN 96.A OE1 ARG 53.A HH21 2.810 2.256 GLN 56.A N ARG 53.A O GLN 56.A H 3.165 2.345 HIS 60.A N ASN 57.A OD1 HIS 60.A H 2.979 2.126 ALA 61.A N ASN 57.A O ALA 61.A H 2.903 2.113 LYS 62.A N GLN 58.A O LYS 62.A H 2.876 2.016 ARG 63.A N THR 59.A O ARG 63.A H 3.390 2.541 ARG 63.A NH1 GLY 165.A O ARG 63.A HH12 3.075 2.395 ARG 63.A NH2 GLY 165.A O ARG 63.A HH22 3.224 2.584 ALA 64.A N HIS 60.A O ALA 64.A H 2.977 2.133 TYR 65.A N ALA 61.A O TYR 65.A H 2.895 2.036 ARG 66.A N LYS 62.A O ARG 66.A H 2.898 2.059 ARG 66.A NH1 PHE 164.A O ARG 66.A HH12 3.292 2.460 GLU 67.A N ARG 63.A O GLU 67.A H 2.907 2.069 LEU 68.A N ALA 64.A O LEU 68.A H 2.980 2.166 VAL 69.A N TYR 65.A O VAL 69.A H 2.866 2.076 LEU 70.A N ARG 66.A O LEU 70.A H 2.732 1.917 MET 71.A N GLU 67.A O MET 71.A H 3.256 2.525 LYS 72.A N VAL 69.A O LYS 72.A H 3.340 2.591 CYS 73.A N LEU 70.A O CYS 73.A H 2.881 2.090 CYS 73.A SG VAL 69.A O CYS 73.A HG 3.643 2.443 ASN 75.A N HIS 135.A NE2 ASN 75.A H 3.122 2.274 HIS 76.A NE2 GLU 318.A O HIS 76.A HE2 2.747 1.891 ASN 78.A N HIS 76.A ND1 ASN 78.A H 3.128 2.269 ASN 78.A ND2 GLN 128.A OE1 ASN 78.A HD21 3.189 2.546 ASN 78.A ND2 LEU 159.A O ASN 78.A HD22 2.952 2.100 ILE 79.A N HIS 76.A O ILE 79.A H 3.039 2.200 ILE 80.A N ILE 161.A O ILE 80.A H 2.914 2.091 LEU 83.A N VAL 101.A O LEU 83.A H 2.736 1.953 ASN 84.A ND2 TYR 20.A OH ASN 84.A HD22 3.039 2.197 PHE 86.A N TYR 99.A O PHE 86.A H 3.106 2.316 THR 87.A OG1 ASP 97.A O THR 87.A HG1 2.740 2.025 GLN 89.A N THR 87.A OG1 GLN 89.A H 3.229 2.413 LYS 90.A NZ GLU 94.A OE1 LYS 90.A HZ1 3.322 2.593 GLU 93.A N GLU 93.A OE1 GLU 93.A H 2.619 1.885 GLU 94.A N THR 91.A OG1 GLU 94.A H 3.372 2.589 PHE 95.A N LEU 92.A O PHE 95.A H 3.115 2.328 GLN 96.A N GLN 89.A OE1 GLN 96.A H 2.852 2.014 ASP 97.A N GLN 89.A OE1 ASP 97.A H 2.825 1.975 VAL 98.A N LEU 51.A O VAL 98.A H 3.030 2.211 TYR 99.A N PHE 86.A O TYR 99.A H 2.828 2.002 LEU 100.A N LYS 49.A O LEU 100.A H 2.862 2.030 VAL 101.A N ASN 84.A O VAL 101.A H 3.063 2.297 MET 102.A N ALA 47.A O MET 102.A H 2.975 2.171 LEU 104.A N ASN 45.A O LEU 104.A H 3.260 2.439 ASP 106.A N VAL 153.A O ASP 106.A H 2.917 2.101 ALA 107.A N VAL 153.A O ALA 107.A H 2.986 2.336 ASN 108.A N GLN 111.A OE1 ASN 108.A H 2.799 1.965 ASN 108.A ND2 SER 149.A O ASN 108.A HD22 2.855 1.997 LEU 109.A N ILE 151.A O LEU 109.A H 2.879 2.081 CYS 110.A N ASN 108.A OD1 CYS 110.A H 3.169 2.316 GLN 111.A N ASN 108.A O GLN 111.A H 2.927 2.285 VAL 112.A N ASN 108.A O VAL 112.A H 3.349 2.576 ILE 113.A N LEU 109.A O ILE 113.A H 2.904 2.108 GLN 114.A N GLN 111.A O GLN 114.A H 3.250 2.529 MET 115.A N VAL 112.A O MET 115.A H 2.989 2.145 ARG 121.A N ASP 118.A OD2 ARG 121.A H 3.120 2.382 ARG 121.A NH1 ASP 118.A OD1 ARG 121.A HH11 3.435 2.677 MET 122.A N.A ASP 118.A O MET 122.A H.A 3.141 2.283 MET 122.A N.B ASP 118.A O MET 122.A H.B 3.138 2.281 SER 123.A N HIS 119.A O SER 123.A H 2.903 2.047 SER 123.A OG HIS 119.A O SER 123.A HG 2.676 1.881 SER 123.A OG GLU 120.A O SER 123.A HG 3.209 2.801 TYR 124.A N GLU 120.A O TYR 124.A H 3.128 2.373 LEU 125.A N ARG 121.A O LEU 125.A H 2.884 2.042 LEU 126.A N MET 122.A O.A LEU 126.A H 2.940 2.102 LEU 126.A N MET 122.A O.B LEU 126.A H 2.967 2.130 TYR 127.A N SER 123.A O TYR 127.A H 2.854 2.034 GLN 128.A N TYR 124.A O GLN 128.A H 3.021 2.210 GLN 128.A NE2 TYR 124.A O GLN 128.A HE21 3.243 2.441 GLN 128.A NE2 CYS 157.A O GLN 128.A HE22 2.580 1.736 MET 129.A N LEU 125.A O MET 129.A H 2.967 2.135 LEU 130.A N LEU 126.A O LEU 130.A H 2.971 2.149 CYS 131.A N TYR 127.A O CYS 131.A H 2.924 2.104 CYS 131.A SG TYR 127.A O CYS 131.A HG 3.274 2.293 GLY 132.A N GLN 128.A O GLY 132.A H 2.961 2.111 ILE 133.A N MET 129.A O ILE 133.A H 2.972 2.115 LYS 134.A N LEU 130.A O LYS 134.A H 2.827 2.000 HIS 135.A N CYS 131.A O HIS 135.A H 2.895 2.085 LEU 136.A N GLY 132.A O LEU 136.A H 2.885 2.050 HIS 137.A N ILE 133.A O HIS 137.A H 2.887 2.056 HIS 137.A NE2 ASP 196.A OD2 HIS 137.A HE2 2.717 1.858 SER 138.A N LYS 134.A O SER 138.A H 2.932 2.113 SER 138.A OG HIS 135.A O SER 138.A HG 2.669 1.880 ALA 139.A N HIS 135.A O ALA 139.A H 3.152 2.412 ALA 139.A N LEU 136.A O ALA 139.A H 3.060 2.435 GLY 140.A N HIS 137.A O GLY 140.A H 2.865 2.034 ILE 141.A N LEU 136.A O ILE 141.A H 2.809 1.980 HIS 143.A N ASP 196.A OD2 HIS 143.A H 3.118 2.312 HIS 143.A NE2 ASP 163.A O HIS 143.A HE2 2.983 2.362 HIS 143.A NE2 ASP 163.A OD1 HIS 143.A HE2 2.780 2.080 ARG 144.A N ASP 196.A OD1 ARG 144.A H 2.741 1.887 ARG 144.A NH2 ALA 167.A O ARG 144.A HH22 2.414 1.739 ASP 145.A N HIS 143.A ND1 ASP 145.A H 3.143 2.334 LYS 147.A NZ ASP 145.A OD2 LYS 147.A HZ1 2.799 1.954 LYS 147.A NZ THR 177.A O LYS 147.A HZ3 2.912 2.082 ASN 150.A N LYS 147.A O ASN 150.A H 3.223 2.403 ILE 151.A N PRO 148.A O ILE 151.A H 2.964 2.157 VAL 152.A N LYS 160.A O VAL 152.A H 3.003 2.176 VAL 153.A N ALA 107.A O VAL 153.A H 2.821 2.032 LYS 154.A N THR 158.A O LYS 154.A H 2.943 2.132 LYS 154.A NZ GLU 103.A OE2 LYS 154.A HZ2 2.768 1.896 SER 155.A N ASP 106.A OD2 SER 155.A H 2.556 1.777 CYS 157.A N LYS 154.A O CYS 157.A H 2.948 2.180 THR 158.A N ASP 156.A OD1 THR 158.A H 3.023 2.216 THR 158.A OG1 ASP 156.A OD1 THR 158.A HG1 2.557 1.744 LEU 159.A N GLN 128.A OE1 LEU 159.A H 3.071 2.463 LYS 160.A N VAL 152.A O LYS 160.A H 2.933 2.134 LYS 160.A NZ LYS 77.A O LYS 160.A HZ1 2.832 2.079 ILE 161.A N ASN 78.A O ILE 161.A H 2.880 2.048 LEU 162.A N ASN 150.A O LEU 162.A H 2.903 2.086 PHE 164.A N GLU 67.A OE2 PHE 164.A H 3.005 2.195 LEU 166.A N HIS 143.A O LEU 166.A H 2.957 2.152 TYR 180.A OH GLU 206.A OE1 TYR 180.A HH 2.586 1.816 ARG 181.A N ARG 178.A O ARG 181.A H 3.224 2.378 ARG 181.A NE ASP 145.A OD1 ARG 181.A HE 2.863 2.007 ARG 181.A NH1 TYR 219.A OH ARG 181.A HH11 2.880 2.073 ARG 181.A NH2 ASP 145.A OD2 ARG 181.A HH21 3.152 2.296 GLU 184.A N GLU 184.A OE1 GLU 184.A H 2.585 1.759 VAL 185.A N ALA 182.A O VAL 185.A H 2.854 2.191 ILE 186.A N ALA 182.A O ILE 186.A H 2.925 2.092 LEU 187.A N PRO 183.A O LEU 187.A H 2.821 2.023 MET 189.A N GLU 184.A O MET 189.A H 2.853 2.022 GLU 193.A N GLU 193.A OE1 GLU 193.A H 2.801 2.158 ASN 194.A ND2 PRO 295.A O ASN 194.A HD22 2.814 2.044 ASN 194.A ND2 ARG 298.A O ASN 194.A HD21 3.420 2.679 VAL 195.A N LYS 192.A O VAL 195.A H 3.009 2.154 ASP 196.A N GLU 193.A O ASP 196.A H 3.256 2.415 ILE 197.A N ASN 194.A O ILE 197.A H 3.167 2.442 SER 199.A OG TYR 180.A O SER 199.A HG 2.590 1.771 VAL 200.A N ASP 196.A O VAL 200.A H 3.234 2.418 GLY 201.A N ILE 197.A O GLY 201.A H 2.905 2.080 CYS 202.A N TRP 198.A O CYS 202.A H 2.862 2.086 ILE 203.A N SER 199.A O ILE 203.A H 2.907 2.085 MET 204.A N VAL 200.A O MET 204.A H 2.705 1.846 GLY 205.A N GLY 201.A O GLY 205.A H 2.827 1.972 GLU 206.A N CYS 202.A O GLU 206.A H 3.070 2.285 MET 207.A N ILE 203.A O MET 207.A H 2.969 2.185 VAL 208.A N MET 204.A O VAL 208.A H 3.260 2.529 VAL 208.A N GLY 205.A O VAL 208.A H 3.214 2.605 ARG 209.A N GLY 205.A O ARG 209.A H 2.833 1.997 ARG 209.A NH1 GLN 229.A OE1 ARG 209.A HH12 2.700 1.880 ARG 209.A NH2 GLN 229.A OE1 ARG 209.A HH22 3.276 2.639 ARG 209.A NH2 LEU 263.A O ARG 209.A HH21 3.076 2.227 HIS 210.A N GLU 206.A O HIS 210.A H 2.712 1.972 HIS 210.A ND1 ILE 113.A O HIS 210.A HD1 2.852 2.241 ARG 217.A N ASP 221.A OD2 ARG 217.A H 3.106 2.284 ARG 217.A NE ASP 221.A OD2 ARG 217.A HE 2.787 1.934 ARG 217.A NH2 ASP 221.A OD1 ARG 217.A HH21 3.480 2.655 ARG 217.A NH2 ASP 221.A OD2 ARG 217.A HH21 3.551 2.924 ASP 221.A N ASP 218.A OD1 ASP 221.A H 3.160 2.306 GLN 222.A N ASP 218.A O GLN 222.A H 2.942 2.089 GLN 222.A NE2 ARG 178.A O GLN 222.A HE22 2.764 1.981 TRP 223.A N TYR 219.A O TRP 223.A H 2.788 1.931 ASN 224.A N ILE 220.A O ASN 224.A H 3.255 2.437 LYS 225.A N ASP 221.A O LYS 225.A H 3.142 2.353 VAL 226.A N GLN 222.A O VAL 226.A H 3.055 2.271 ILE 227.A N TRP 223.A O ILE 227.A H 3.034 2.202 GLU 228.A N ASN 224.A O GLU 228.A H 2.922 2.082 GLN 229.A N VAL 226.A O GLN 229.A H 3.312 2.567 GLN 229.A NE2 LEU 213.A O GLN 229.A HE22 2.979 2.132 GLN 229.A NE2 LYS 225.A O GLN 229.A HE21 3.020 2.183 LEU 230.A N VAL 226.A O LEU 230.A H 2.913 2.053 GLY 231.A N ILE 227.A O GLY 231.A H 2.805 2.063 THR 232.A N TYR 255.A O THR 232.A H 3.128 2.283 PHE 237.A N CYS 234.A O PHE 237.A H 2.702 1.975 MET 238.A N CYS 234.A O MET 238.A H 3.278 2.512 LYS 239.A N PRO 235.A O LYS 239.A H 3.113 2.355 LYS 240.A N PHE 237.A O LYS 240.A H 3.073 2.329 LEU 241.A N MET 238.A O LEU 241.A H 2.832 1.991 GLN 242.A N GLN 242.A OE1 GLN 242.A H 3.219 2.385 ARG 246.A N GLN 242.A O ARG 246.A H 2.879 2.048 ARG 246.A NE GLU 250.A OE2 ARG 246.A HE 2.892 2.037 ASN 247.A N PRO 243.A O ASN 247.A H 3.332 2.550 TYR 248.A N THR 244.A O TYR 248.A H 3.274 2.454 VAL 249.A N VAL 245.A O VAL 249.A H 2.964 2.142 GLU 250.A N ARG 246.A O GLU 250.A H 2.806 1.968 ASN 251.A N ASN 247.A O ASN 251.A H 3.038 2.305 ASN 251.A ND2 ASN 247.A O ASN 251.A HD21 2.871 2.027 ARG 252.A N VAL 249.A O ARG 252.A H 3.363 2.574 ARG 252.A NH1 ASN 224.A OD1 ARG 252.A HH11 3.038 2.252 TYR 255.A N THR 232.A OG1 TYR 255.A H 3.196 2.428 LEU 258.A N GLN 229.A O LEU 258.A H 2.813 2.046 LYS 262.A N THR 259.A O LYS 262.A H 3.126 2.531 LEU 263.A N THR 259.A O LEU 263.A H 2.851 2.075 PHE 264.A N PHE 260.A O PHE 264.A H 2.812 2.046 LEU 268.A N PRO 265.A O LEU 268.A H 3.145 2.344 PHE 269.A N ASP 266.A O PHE 269.A H 3.047 2.194 ASP 272.A N ASP 272.A OD1 ASP 272.A H 2.594 1.948 SER 273.A N ASP 272.A OD1 SER 273.A H 2.581 1.885 HIS 275.A ND1 ASN 276.A OD1 HIS 275.A HD1 3.128 2.381 ASN 276.A N SER 273.A OG ASN 276.A H 3.184 2.370 ASN 276.A ND2 ASP 272.A OD1 ASN 276.A HD22 3.096 2.314 LYS 277.A N SER 273.A O LYS 277.A H 2.790 1.969 LEU 278.A N GLU 274.A O LEU 278.A H 2.991 2.160 LYS 279.A N HIS 275.A O LYS 279.A H 3.081 2.280 ALA 280.A N ASN 276.A O ALA 280.A H 2.987 2.168 SER 281.A N LYS 277.A O SER 281.A H 3.288 2.484 GLN 282.A N LEU 278.A O GLN 282.A H 3.016 2.225 ALA 283.A N LYS 279.A O ALA 283.A H 2.774 1.973 ARG 284.A N ALA 280.A O ARG 284.A H 2.997 2.152 ARG 284.A NE PHE 264.A O ARG 284.A HE 3.170 2.334 ARG 284.A NH2 PHE 264.A O ARG 284.A HH21 3.420 2.671 ASP 285.A N SER 281.A O ASP 285.A H 3.040 2.256 LEU 286.A N GLN 282.A O LEU 286.A H 3.036 2.193 LEU 287.A N ALA 283.A O LEU 287.A H 2.947 2.089 SER 288.A N ARG 284.A O SER 288.A H 2.944 2.124 SER 288.A OG ASP 285.A O SER 288.A HG 2.775 1.957 LYS 289.A N LEU 286.A O LYS 289.A H 2.853 2.091 LYS 289.A NZ ASP 285.A OD1 LYS 289.A HZ3 3.407 2.542 MET 290.A N LEU 286.A O MET 290.A H 3.049 2.364 MET 290.A N LEU 287.A O MET 290.A H 3.158 2.470 LEU 291.A N LEU 287.A O LEU 291.A H 2.887 2.033 ALA 296.A N ASP 294.A OD1 ALA 296.A H 3.051 2.230 LYS 297.A N ASP 294.A O LYS 297.A H 2.938 2.151 ARG 298.A N PRO 295.A O ARG 298.A H 3.346 2.564 ARG 298.A NE VAL 292.A O ARG 298.A HE 2.882 2.050 ARG 298.A NH1 GLU 184.A OE2 ARG 298.A HH12 2.797 2.009 ARG 298.A NH1 ASN 194.A O ARG 298.A HH11 2.934 2.119 ARG 298.A NH2 GLU 184.A OE1 ARG 298.A HH22 2.984 2.140 ARG 298.A NH2 GLU 184.A OE2 ARG 298.A HH22 3.451 2.847 ARG 298.A NH2 VAL 292.A O ARG 298.A HH21 3.203 2.489 ARG 298.A NH2 ILE 293.A O ARG 298.A HH21 2.940 2.297 ILE 299.A N LYS 289.A O ILE 299.A H 3.001 2.162 ASP 303.A N SER 300.A OG ASP 303.A H 3.106 2.263 ALA 304.A N SER 300.A O ALA 304.A H 2.915 2.085 LEU 305.A N VAL 301.A O LEU 305.A H 2.968 2.193 GLN 306.A N ASP 303.A O GLN 306.A H 3.028 2.326 HIS 307.A N ALA 304.A O HIS 307.A H 3.132 2.311 HIS 307.A NE2 ASP 285.A OD2 HIS 307.A HE2 2.683 1.849 TYR 309.A N HIS 307.A ND1 TYR 309.A H 3.069 2.219 ILE 310.A N HIS 307.A O ILE 310.A H 2.866 2.068 ASN 311.A N HIS 307.A O ASN 311.A H 2.825 2.030 TRP 313.A N ILE 310.A O TRP 313.A H 3.292 2.440 TRP 313.A NE1 SER 123.A OG TRP 313.A HE1 2.995 2.137 TYR 314.A N ASN 311.A O TYR 314.A H 3.011 2.155 GLU 318.A N ASP 315.A O GLU 318.A H 3.060 2.253 GLU 320.A N PRO 316.A O GLU 320.A H 3.254 2.410 THR 332.A N GLU 335.A OE1 THR 332.A H 3.097 2.287 GLU 335.A N THR 332.A OG1 GLU 335.A H 3.221 2.412 TRP 336.A N THR 332.A O TRP 336.A H 2.972 2.119 LYS 337.A N ILE 333.A O LYS 337.A H 2.933 2.083 LYS 337.A NZ GLU 93.A O LYS 337.A HZ1 3.510 2.657 LYS 337.A NZ PHE 95.A O LYS 337.A HZ2 3.497 2.781 GLU 338.A N GLU 334.A O GLU 338.A H 3.286 2.472 LEU 339.A N GLU 335.A O LEU 339.A H 2.980 2.146 ILE 340.A N TRP 336.A O ILE 340.A H 2.839 1.991 TYR 341.A N LYS 337.A O TYR 341.A H 2.843 1.988 LYS 342.A N GLU 338.A O LYS 342.A H 2.909 2.085 GLU 343.A N LEU 339.A O GLU 343.A H 3.120 2.312 VAL 344.A N ILE 340.A O VAL 344.A H 2.804 2.015 MET 345.A N TYR 341.A O MET 345.A H 3.230 2.399