Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8vyo_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 4.A N ARG 26.A O VAL 4.A H 3.016 2.193 LYS 6.A N GLY 24.A O LYS 6.A H 2.848 2.012 PHE 8.A N PHE 22.A O PHE 8.A H 2.970 2.124 CYS 14.A N LYS 19.A O CYS 14.A H 2.714 1.877 CYS 17.A N CYS 14.A O CYS 17.A H 2.922 2.147 ARG 18.A N CYS 14.A O ARG 18.A H 2.449 1.677 ARG 18.A NH1 GLU 273.A O ARG 18.A HH12 2.879 2.206 ARG 18.A NH2 GLU 273.A O ARG 18.A HH22 2.641 1.854 LEU 21.A N ALA 12.A O LEU 21.A H 3.094 2.244 GLY 24.A N LYS 6.A O GLY 24.A H 3.162 2.386 ARG 26.A N VAL 4.A O ARG 26.A H 2.961 2.149 CYS 27.A N TYR 32.A O CYS 27.A H 2.687 1.950 CYS 27.A SG ASN 2.A O CYS 27.A HG 3.342 2.447 GLN 28.A N ASN 2.A O GLN 28.A H 2.614 1.850 GLN 28.A NE2 SER 301.A O GLN 28.A HE22 3.179 2.396 THR 29.A OG1 ASN 2.A OD1 THR 29.A HG1 2.998 2.194 CYS 30.A N CYS 27.A O CYS 30.A H 2.942 2.123 GLY 31.A N CYS 27.A O GLY 31.A H 2.566 1.730 LYS 33.A NZ PHE 13.A O LYS 33.A HZ1 3.106 2.231 LYS 33.A NZ ASP 15.A OD1 LYS 33.A HZ3 2.341 1.569 GLN 36.A N PHE 34.A O GLN 36.A H 2.887 2.176 ILE 48.A N VAL 56.A O ILE 48.A H 2.756 1.962 SER 52.A OG ASP 179.A OD1 SER 52.A HG 3.097 2.377 SER 52.A OG ASP 179.A OD2 SER 52.A HG 3.042 2.242 THR 55.A N ASN 71.A OD1 THR 55.A H 2.816 2.223 THR 55.A OG1 ASN 71.A OD1 THR 55.A HG1 2.794 1.960 VAL 56.A N GLY 49.A O VAL 56.A H 2.602 1.765 TYR 57.A N VAL 67.A O TYR 57.A H 2.549 1.748 LYS 58.A N GLN 46.A O LYS 58.A H 2.767 1.976 VAL 67.A N TYR 57.A O VAL 67.A H 2.906 2.059 LYS 68.A NZ ASP 179.A OD1 LYS 68.A HZ2 2.976 2.256 MET 69.A N THR 55.A O MET 69.A H 2.736 1.958 LEU 70.A N LEU 110.A O LEU 70.A H 3.006 2.202 ASN 71.A ND2 SER 50.A O ASN 71.A HD22 3.247 2.403 THR 76.A OG1 GLN 79.A OE1 THR 76.A HG1 2.524 1.692 GLN 79.A N THR 76.A OG1 GLN 79.A H 3.257 2.403 LEU 80.A N THR 76.A O LEU 80.A H 2.599 1.747 GLN 81.A N PRO 77.A O GLN 81.A H 2.782 1.962 ALA 82.A N GLN 78.A O ALA 82.A H 2.941 2.125 PHE 83.A N GLN 79.A O PHE 83.A H 2.722 1.878 LYS 84.A N LEU 80.A O LYS 84.A H 2.817 1.968 ASN 85.A N GLN 81.A O ASN 85.A H 2.840 2.090 GLU 86.A N ALA 82.A O GLU 86.A H 2.799 1.966 VAL 87.A N PHE 83.A O VAL 87.A H 2.677 1.822 GLY 88.A N LYS 84.A O GLY 88.A H 2.772 2.014 VAL 89.A N GLU 86.A O VAL 89.A H 2.881 2.101 LEU 90.A N GLU 86.A O LEU 90.A H 2.894 2.061 ARG 91.A N VAL 87.A O ARG 91.A H 2.792 1.948 ARG 91.A NE MET 102.A O ARG 91.A HE 2.844 2.143 ARG 91.A NH1 ARG 91.A O ARG 91.A HH11 2.858 2.009 LYS 92.A N VAL 89.A O LYS 92.A H 2.777 1.986 THR 93.A N VAL 89.A O THR 93.A H 3.068 2.273 THR 93.A OG1 LEU 90.A O THR 93.A HG1 3.249 2.675 ASN 97.A N HIS 95.A ND1 ASN 97.A H 3.106 2.264 ASN 97.A ND2 VAL 175.A O ASN 97.A HD21 3.025 2.212 ILE 98.A N HIS 95.A O ILE 98.A H 2.863 2.012 LEU 99.A N ILE 177.A O LEU 99.A H 2.923 2.067 MET 102.A N VAL 113.A O MET 102.A H 3.166 2.373 GLY 103.A N VAL 113.A O GLY 103.A H 3.311 2.608 SER 105.A N ALA 111.A O SER 105.A H 2.771 1.913 ILE 112.A N LYS 68.A O ILE 112.A H 2.910 2.111 VAL 113.A N GLY 103.A O VAL 113.A H 3.189 2.339 THR 114.A N ALA 66.A O THR 114.A H 3.213 2.385 THR 114.A OG1 LEU 100.A O THR 114.A HG1 2.848 2.012 GLN 115.A N LEU 100.A O GLN 115.A H 3.393 2.578 TRP 116.A N ASP 64.A O TRP 116.A H 3.236 2.388 SER 120.A OG HIS 124.A ND1 SER 120.A HG 3.031 2.298 SER 121.A OG ASN 165.A O SER 121.A HG 2.505 1.701 LEU 122.A N ILE 167.A O LEU 122.A H 2.598 1.748 TYR 123.A N SER 121.A OG TYR 123.A H 3.106 2.321 HIS 124.A N SER 121.A O HIS 124.A H 2.919 2.191 LEU 126.A N LEU 122.A O LEU 126.A H 3.153 2.327 HIS 127.A N TYR 123.A O HIS 127.A H 2.859 2.003 HIS 127.A NE2 GLU 218.A OE1 HIS 127.A HE2 3.004 2.244 ILE 128.A N HIS 124.A O ILE 128.A H 2.950 2.233 ILE 129.A N HIS 124.A O ILE 129.A H 3.143 2.485 THR 131.A N HIS 125.A O THR 131.A H 2.887 2.149 THR 131.A OG1 HIS 125.A ND1 THR 131.A HG1 3.002 2.235 LYS 137.A N GLU 134.A O LYS 137.A H 2.847 2.121 LYS 137.A NZ ASP 172.A OD2 LYS 137.A HZ2 2.721 1.843 ILE 139.A N MET 135.A O ILE 139.A H 3.071 2.274 ASP 140.A N ILE 136.A O ASP 140.A H 2.977 2.185 ILE 141.A N LYS 137.A O ILE 141.A H 2.774 1.932 ALA 142.A N LEU 138.A O ALA 142.A H 3.025 2.179 ARG 143.A N ILE 139.A O ARG 143.A H 2.689 1.917 ARG 143.A NH1 ASP 140.A OD1 ARG 143.A HH12 2.524 1.853 ARG 143.A NH2 ASP 140.A OD1 ARG 143.A HH22 2.565 1.902 GLN 144.A N ASP 140.A O GLN 144.A H 2.843 2.005 THR 145.A N ILE 141.A O THR 145.A H 2.948 2.090 THR 145.A OG1 ILE 141.A O THR 145.A HG1 2.661 1.823 ALA 146.A N ALA 142.A O ALA 146.A H 2.895 2.062 GLN 147.A N ARG 143.A O GLN 147.A H 2.623 1.806 GLY 148.A N GLN 144.A O GLY 148.A H 2.940 2.144 MET 149.A N THR 145.A O MET 149.A H 2.874 2.029 ASP 150.A N ALA 146.A O ASP 150.A H 2.712 1.899 TYR 151.A N GLN 147.A O TYR 151.A H 3.380 2.612 LEU 152.A N GLY 148.A O LEU 152.A H 3.023 2.205 HIS 153.A N MET 149.A O HIS 153.A H 2.780 1.924 HIS 153.A NE2 ASP 208.A OD2 HIS 153.A HE2 3.161 2.321 ALA 154.A N ASP 150.A O ALA 154.A H 2.594 1.803 LYS 155.A N LEU 152.A O LYS 155.A H 2.971 2.270 SER 156.A N HIS 153.A O SER 156.A H 2.948 2.106 ILE 157.A N LEU 152.A O ILE 157.A H 2.676 1.978 HIS 159.A N ASP 208.A OD2 HIS 159.A H 2.695 1.855 HIS 159.A NE2 GLY 178.A O HIS 159.A HE2 2.974 2.141 ARG 160.A NH1 ILE 158.A O ARG 160.A HH11 2.985 2.181 ASP 161.A N HIS 159.A O ASP 161.A H 2.587 1.855 LYS 163.A N ASN 166.A OD1 LYS 163.A H 2.452 1.609 LYS 163.A NZ ASP 161.A OD1 LYS 163.A HZ3 2.735 2.049 LYS 163.A NZ ASP 161.A OD2 LYS 163.A HZ1 2.744 2.075 LYS 163.A NZ SER 189.A O LYS 163.A HZ2 3.259 2.383 SER 164.A OG GLU 218.A OE1 SER 164.A HG 3.308 2.628 ASN 166.A N LYS 163.A O ASN 166.A H 3.209 2.481 ILE 167.A N SER 164.A O ILE 167.A H 3.341 2.508 PHE 168.A N LYS 176.A O PHE 168.A H 3.125 2.295 LEU 169.A N SER 120.A O LEU 169.A H 3.161 2.312 HIS 170.A N THR 174.A O HIS 170.A H 2.703 1.878 LEU 173.A N HIS 170.A O LEU 173.A H 2.950 2.127 THR 174.A OG1 GLN 144.A OE1 THR 174.A HG1 2.552 1.734 VAL 175.A N GLN 144.A OE1 VAL 175.A H 2.962 2.183 LYS 176.A N PHE 168.A O LYS 176.A H 2.933 2.137 ILE 177.A N ASN 97.A O ILE 177.A H 2.549 1.860 GLY 178.A N ASN 166.A O GLY 178.A H 2.947 2.106 ALA 183.A N GLU 86.A OE2 ALA 183.A H 2.973 2.260 THR 184.A N GLU 86.A OE1 THR 184.A H 2.870 2.069 THR 184.A OG1 GLU 86.A OE1 THR 184.A HG1 2.452 1.629 VAL 185.A N LEU 182.A O VAL 185.A H 3.285 2.432 LYS 186.A N ALA 183.A O LYS 186.A H 2.941 2.128 SER 187.A OG LYS 186.A O SER 187.A HG 2.482 1.693 TRP 192.A NE1 GLU 218.A OE2 TRP 192.A HE1 3.035 2.197 VAL 197.A N ALA 194.A O VAL 197.A H 2.799 2.190 ILE 198.A N ALA 194.A O ILE 198.A H 3.022 2.210 ARG 199.A N PRO 195.A O ARG 199.A H 2.774 2.044 MET 200.A N VAL 197.A O MET 200.A H 2.820 2.033 GLN 206.A N SER 204.A OG GLN 206.A H 3.017 2.199 GLN 206.A NE2 ASP 272.A O GLN 206.A HE22 2.965 2.122 GLN 206.A NE2 ARG 274.A O GLN 206.A HE21 3.044 2.264 SER 207.A N SER 204.A O SER 207.A H 2.880 2.151 SER 207.A OG PRO 202.A O SER 207.A HG 2.693 1.873 VAL 209.A N GLN 206.A O VAL 209.A H 3.119 2.472 ALA 211.A N SER 207.A O ALA 211.A H 3.215 2.373 PHE 212.A N ASP 208.A O PHE 212.A H 3.013 2.165 GLY 213.A N VAL 209.A O GLY 213.A H 2.816 2.030 ILE 214.A N TYR 210.A O ILE 214.A H 3.002 2.247 VAL 215.A N ALA 211.A O VAL 215.A H 3.159 2.366 LEU 216.A N PHE 212.A O LEU 216.A H 3.075 2.274 TYR 217.A N GLY 213.A O TYR 217.A H 3.166 2.375 TYR 217.A OH ASP 247.A O TYR 217.A HH 2.803 1.970 GLU 218.A N ILE 214.A O GLU 218.A H 3.084 2.251 LEU 219.A N VAL 215.A O LEU 219.A H 2.941 2.101 MET 220.A N LEU 216.A O MET 220.A H 2.874 2.039 THR 221.A N GLU 218.A O THR 221.A H 3.310 2.544 THR 221.A OG1 TYR 217.A O THR 221.A HG1 2.474 1.649 GLY 222.A N GLU 218.A O GLY 222.A H 2.584 1.817 GLN 223.A NE2 THR 221.A O GLN 223.A HE21 2.955 2.098 SER 227.A OG GLN 223.A OE1 SER 227.A HG 2.345 1.540 ILE 229.A N TYR 226.A O ILE 229.A H 2.945 2.091 ASN 230.A ND2 SER 227.A O ASN 230.A HD22 2.843 2.048 GLN 234.A N ASN 231.A O GLN 234.A H 3.006 2.408 GLN 234.A N ASN 231.A OD1 GLN 234.A H 3.031 2.266 GLN 234.A NE2 GLN 234.A O GLN 234.A HE21 2.909 2.100 ILE 235.A N ASN 231.A O ILE 235.A H 2.816 2.007 ILE 236.A N ARG 232.A O ILE 236.A H 2.475 1.695 VAL 239.A N ILE 235.A O VAL 239.A H 2.659 1.815 GLY 240.A N PHE 237.A O GLY 240.A H 2.982 2.390 ARG 241.A N PHE 237.A O ARG 241.A H 2.781 2.073 TYR 243.A N MET 238.A O TYR 243.A H 3.094 2.328 SER 249.A N ASP 247.A OD1 SER 249.A H 2.880 2.067 SER 249.A OG ASP 247.A OD1 SER 249.A HG 2.576 1.746 LYS 250.A N ASP 247.A O LYS 250.A H 3.053 2.197 LYS 250.A NZ ASP 247.A OD2 LYS 250.A HZ1 3.113 2.231 ARG 252.A NH1 LEU 219.A O ARG 252.A HH12 2.805 1.998 ARG 252.A NH2 LEU 219.A O ARG 252.A HH22 3.372 2.783 CYS 255.A N ARG 252.A O CYS 255.A H 3.138 2.279 CYS 255.A SG ARG 252.A O CYS 255.A HG 3.168 2.198 MET 259.A N PRO 256.A O MET 259.A H 2.908 2.212 LYS 260.A N PRO 256.A O LYS 260.A H 3.423 2.615 ARG 261.A N LYS 257.A O ARG 261.A H 2.892 2.069 ARG 261.A NH1 ASP 15.A OD2 ARG 261.A HH12 3.323 2.522 ARG 261.A NH2 ASP 15.A OD2 ARG 261.A HH22 3.473 2.712 LEU 262.A N ALA 258.A O LEU 262.A H 2.613 1.792 MET 263.A N MET 259.A O MET 263.A H 2.955 2.101 ALA 264.A N LYS 260.A O ALA 264.A H 2.935 2.124 GLU 265.A N ARG 261.A O GLU 265.A H 2.903 2.078 CYS 266.A N LEU 262.A O CYS 266.A H 2.810 2.007 LEU 267.A N MET 263.A O LEU 267.A H 2.858 2.099 LYS 268.A N GLU 265.A O LYS 268.A H 3.169 2.338 ARG 271.A NE GLU 196.A OE1 ARG 271.A HE 3.389 2.584 ARG 271.A NE GLU 196.A OE2 ARG 271.A HE 3.075 2.444 ARG 274.A N ARG 271.A O ARG 274.A H 3.077 2.242 ARG 274.A NE GLN 206.A O ARG 274.A HE 3.433 2.606 ARG 274.A NH1 LYS 268.A O ARG 274.A HH11 2.559 1.707 ARG 274.A NH1 LYS 269.A O ARG 274.A HH12 2.506 1.782 ARG 274.A NH2 GLU 196.A OE1 ARG 274.A HH22 3.157 2.344 GLN 279.A N LEU 276.A O GLN 279.A H 3.035 2.446 GLN 279.A N GLN 279.A OE1 GLN 279.A H 2.522 1.759 GLN 279.A NE2 ARG 18.A O GLN 279.A HE21 3.179 2.328 ILE 280.A N LEU 276.A O ILE 280.A H 3.103 2.273 LEU 281.A N PHE 277.A O LEU 281.A H 2.749 1.908 ALA 282.A N PRO 278.A O ALA 282.A H 2.967 2.140 SER 283.A N GLN 279.A O SER 283.A H 2.731 1.914 ILE 284.A N ILE 280.A O ILE 284.A H 2.732 1.887 GLU 285.A N LEU 281.A O GLU 285.A H 2.652 1.832 LEU 286.A N ALA 282.A O LEU 286.A H 2.842 2.054 LEU 287.A N SER 283.A O LEU 287.A H 2.952 2.111 ALA 288.A N ILE 284.A O ALA 288.A H 2.852 2.073 SER 290.A N LEU 286.A O SER 290.A H 2.750 1.941 LEU 291.A N LEU 287.A O LEU 291.A H 2.900 2.073 LYS 293.A N ARG 289.A O LYS 293.A H 3.331 2.559 ILE 294.A N SER 290.A O ILE 294.A H 2.765 1.997