Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8w98_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N GLU 239.A OE2 MET 1.A H 3.198 2.465 ASP 4.A N GLY 268.A O ASP 4.A H 2.904 1.999 VAL 7.A N ASP 4.A OD2 VAL 7.A H 2.859 1.992 GLU 8.A N ASP 4.A O GLU 8.A H 2.888 2.003 GLN 9.A N PRO 5.A O GLN 9.A H 3.141 2.245 PHE 10.A N ARG 6.A O PHE 10.A H 2.943 2.052 LEU 11.A N VAL 7.A O LEU 11.A H 2.846 1.947 ALA 12.A N GLU 8.A O ALA 12.A H 2.864 2.021 GLN 13.A N GLN 9.A O GLN 13.A H 2.942 2.107 MET 14.A N LEU 11.A O MET 14.A H 3.319 2.459 SER 16.A N GLU 19.A OE1 SER 16.A H 3.167 2.282 ALA 20.A N SER 16.A O ALA 20.A H 2.920 2.056 ARG 21.A N LEU 17.A O ARG 21.A H 2.935 2.076 ARG 21.A NE VAL 79.A O ARG 21.A HE 2.966 2.115 ARG 21.A NH1 GLU 111.A OE2 ARG 21.A HH12 2.713 1.846 ARG 21.A NH2 VAL 79.A O ARG 21.A HH22 3.401 2.762 ARG 21.A NH2 ALA 109.A O ARG 21.A HH22 2.998 2.355 ARG 21.A NH2 GLU 111.A OE1 ARG 21.A HH21 2.719 1.897 GLN 22.A N ALA 18.A O GLN 22.A H 3.092 2.249 GLN 23.A N GLU 19.A O GLN 23.A H 2.878 2.042 PHE 24.A N ALA 20.A O PHE 24.A H 3.118 2.263 LYS 25.A N ARG 21.A O LYS 25.A H 3.135 2.269 GLN 26.A N GLN 22.A O GLN 26.A H 2.780 1.956 GLY 27.A N GLN 23.A O GLY 27.A H 3.023 2.154 ALA 28.A N PHE 24.A O ALA 28.A H 3.143 2.287 LEU 29.A N LYS 25.A O LEU 29.A H 3.027 2.180 LEU 30.A N GLN 26.A O LEU 30.A H 3.034 2.178 LEU 31.A N GLY 27.A O LEU 31.A H 3.243 2.391 ASP 32.A N ALA 28.A O ASP 32.A H 3.033 2.144 GLN 33.A N LEU 29.A O GLN 33.A H 2.940 2.100 MET 34.A N LEU 30.A O MET 34.A H 3.048 2.207 VAL 35.A N LEU 31.A O VAL 35.A H 2.883 2.031 GLU 43.A N ARG 58.A O GLU 43.A H 2.948 2.093 GLY 45.A N ILE 56.A O GLY 45.A H 2.900 2.026 VAL 47.A N VAL 54.A O VAL 47.A H 2.758 1.847 THR 49.A N GLY 52.A O THR 49.A H 2.814 1.982 THR 49.A OG1 GLY 52.A O THR 49.A HG1 2.503 1.653 THR 50.A N ASP 123.A OD2 THR 50.A H 2.878 1.994 THR 50.A OG1 ASP 123.A OD2 THR 50.A HG1 2.585 1.759 HIS 51.A N THR 49.A OG1 HIS 51.A H 3.110 2.299 GLY 52.A N THR 49.A O GLY 52.A H 3.101 2.217 VAL 54.A N VAL 47.A O VAL 54.A H 2.738 1.861 ILE 56.A N GLY 45.A O ILE 56.A H 2.838 1.934 ARG 57.A N SER 103.A O ARG 57.A H 2.954 2.075 ARG 57.A NE ASP 44.A OD1 ARG 57.A HE 2.841 2.041 ARG 57.A NH1 TYR 59.A OH ARG 57.A HH11 3.440 2.593 ARG 57.A NH1 ASP 84.A OD1 ARG 57.A HH12 3.405 2.715 ARG 57.A NH2 ASP 84.A OD1 ARG 57.A HH21 2.839 1.969 ARG 58.A N GLU 43.A O ARG 58.A H 2.881 1.976 ARG 58.A NH2 GLU 43.A OE1 ARG 58.A HH22 3.296 2.283 TYR 59.A N VAL 101.A O TYR 59.A H 2.700 1.792 ILE 60.A N ASP 41.A O ILE 60.A H 2.954 2.055 ASP 62.A N GLN 95.A OE1 ASP 62.A H 2.988 2.085 ARG 65.A N GLY 98.A O ARG 65.A H 2.848 1.967 ARG 65.A NH1 THR 96.A O ARG 65.A HH12 3.237 2.383 ARG 65.A NH2 GLN 95.A O ARG 65.A HH21 3.250 2.536 PHE 66.A N GLY 98.A O PHE 66.A H 3.058 2.382 HIS 68.A ND1 SER 140.A O HIS 68.A HD1 2.776 1.988 HIS 68.A NE2 ASP 297.A OD1 HIS 68.A HE2 2.795 1.921 LEU 70.A N THR 100.A O LEU 70.A H 2.923 2.015 VAL 71.A N VAL 142.A O VAL 71.A H 2.717 1.824 PHE 72.A N ILE 102.A O PHE 72.A H 2.779 1.867 TYR 73.A N ALA 144.A O TYR 73.A H 2.818 1.921 TYR 73.A OH CYS 121.A O TYR 73.A HH 2.867 2.191 HIS 74.A ND1 GLY 75.A O HIS 74.A HD1 2.830 1.958 GLY 75.A N ASP 146.A OD1 GLY 75.A H 2.931 2.278 VAL 79.A N GLY 76.A O VAL 79.A H 3.225 2.361 PHE 80.A N GLY 76.A O PHE 80.A H 2.817 1.951 ILE 83.A N ASP 105.A OD1 ILE 83.A H 3.219 2.519 THR 85.A N ASP 82.A OD1 THR 85.A H 2.881 2.051 THR 85.A OG1 ASP 82.A O THR 85.A HG1 3.083 2.319 HIS 86.A ND1 THR 85.A OG1 HIS 86.A HD1 2.765 1.945 HIS 86.A NE2 ASP 146.A OD2 HIS 86.A HE2 2.907 2.097 HIS 87.A N ASP 84.A O HIS 87.A H 3.112 2.224 HIS 87.A ND1 TYR 59.A OH HIS 87.A HD1 2.623 1.783 VAL 90.A N HIS 86.A O VAL 90.A H 3.010 2.117 ALA 91.A N HIS 87.A O ALA 91.A H 2.841 1.945 ARG 92.A NE GLU 283.A OE1 ARG 92.A HE 3.024 2.226 ARG 92.A NH1 GLY 88.A O ARG 92.A HH11 2.856 2.009 ARG 92.A NH2 VAL 35.A O ARG 92.A HH21 3.285 2.459 LEU 93.A N LEU 89.A O LEU 93.A H 2.847 1.945 CYS 94.A N VAL 90.A O CYS 94.A H 2.787 1.900 GLN 95.A N ALA 91.A O GLN 95.A H 2.944 2.089 GLN 95.A NE2 PRO 39.A O GLN 95.A HE21 2.909 2.060 GLN 95.A NE2 ASP 62.A OD1 GLN 95.A HE22 3.139 2.259 THR 96.A N ARG 92.A O THR 96.A H 2.708 1.823 VAL 97.A N LEU 93.A O VAL 97.A H 3.015 2.156 ALA 99.A N CYS 94.A O ALA 99.A H 3.177 2.318 VAL 101.A N TYR 59.A O VAL 101.A H 3.112 2.235 ILE 102.A N LEU 70.A O ILE 102.A H 2.756 1.850 SER 103.A N ARG 57.A O SER 103.A H 2.850 1.959 VAL 104.A N PHE 72.A O VAL 104.A H 2.967 2.206 ASP 105.A N ARG 55.A O ASP 105.A H 2.889 2.026 SER 107.A N GLU 120.A OE1 SER 107.A H 2.809 1.901 SER 107.A OG GLU 120.A OE1 SER 107.A HG 3.336 2.620 SER 107.A OG GLU 120.A OE2 SER 107.A HG 2.475 1.673 ALA 109.A N PHE 78.A O ALA 109.A H 2.799 1.888 GLU 111.A N GLU 111.A OE1 GLU 111.A H 2.772 1.928 ALA 112.A N LEU 108.A O ALA 112.A H 2.944 2.050 LYS 113.A NZ GLN 206.A O LYS 113.A HZ1 3.305 2.449 LYS 113.A NZ LEU 208.A O LYS 113.A HZ2 2.791 2.064 PHE 114.A N TYR 207.A O PHE 114.A H 2.889 2.060 VAL 116.A N LYS 113.A O VAL 116.A H 2.797 1.906 VAL 118.A N PRO 115.A O VAL 118.A H 3.027 2.359 ALA 119.A N PRO 115.A O ALA 119.A H 3.263 2.394 GLU 120.A N VAL 116.A O GLU 120.A H 3.070 2.176 CYS 121.A N PRO 117.A O CYS 121.A H 2.990 2.127 ILE 122.A N VAL 118.A O ILE 122.A H 2.992 2.092 ASP 123.A N ALA 119.A O ASP 123.A H 2.941 2.070 VAL 124.A N GLU 120.A O VAL 124.A H 2.961 2.081 ALA 125.A N CYS 121.A O ALA 125.A H 3.013 2.141 ARG 126.A N ILE 122.A O ARG 126.A H 2.836 1.943 ARG 126.A NH1 ASP 123.A OD1 ARG 126.A HH12 2.869 2.228 TRP 127.A N ASP 123.A O TRP 127.A H 2.875 2.000 ALA 128.A N VAL 124.A O ALA 128.A H 2.959 2.124 ALA 129.A N ALA 125.A O ALA 129.A H 2.991 2.099 HIS 130.A N ARG 126.A O HIS 130.A H 3.108 2.213 HIS 130.A ND1 GLU 131.A OE2 HIS 130.A HD1 3.152 2.332 GLU 131.A N TRP 127.A O GLU 131.A H 2.870 2.007 ALA 132.A N ALA 128.A O ALA 132.A H 2.860 2.193 TRP 135.A N ALA 132.A O TRP 135.A H 2.829 2.020 GLY 136.A N PRO 133.A O GLY 136.A H 2.978 2.141 LEU 137.A N ALA 132.A O LEU 137.A H 3.100 2.246 LYS 138.A N SER 67.A O LYS 138.A H 2.800 1.906 LYS 138.A NZ ASP 297.A OD1 LYS 138.A HZ2 3.328 2.440 ILE 141.A N PRO 166.A O ILE 141.A H 3.042 2.160 VAL 142.A N PRO 69.A O VAL 142.A H 2.935 2.024 VAL 143.A N ALA 169.A O VAL 143.A H 3.105 2.256 ALA 144.A N VAL 71.A O ALA 144.A H 2.885 2.175 GLY 145.A N LEU 171.A O GLY 145.A H 3.039 2.212 SER 147.A N PHE 173.A O SER 147.A H 2.743 1.850 GLY 149.A N ASP 146.A O GLY 149.A H 2.787 2.007 GLY 150.A N SER 147.A O GLY 150.A H 2.854 2.200 ASN 151.A N SER 147.A O ASN 151.A H 2.963 2.101 ASN 151.A ND2 ALA 176.A O ASN 151.A HD21 2.933 2.125 ASN 151.A ND2 ALA 219.A O ASN 151.A HD22 2.923 2.102 LEU 152.A N ALA 148.A O LEU 152.A H 3.147 2.290 ALA 153.A N GLY 149.A O ALA 153.A H 3.014 2.178 ALA 154.A N GLY 150.A O ALA 154.A H 2.973 2.121 VAL 155.A N ASN 151.A O VAL 155.A H 2.976 2.137 VAL 156.A N LEU 152.A O VAL 156.A H 2.922 2.034 SER 157.A N ALA 153.A O SER 157.A H 3.050 2.227 SER 157.A OG ALA 153.A O SER 157.A HG 2.729 1.918 GLN 158.A N ALA 154.A O GLN 158.A H 3.134 2.299 GLN 158.A NE2 PRO 221.A O GLN 158.A HE22 2.770 1.899 GLN 158.A NE2 TYR 250.A OH GLN 158.A HE21 2.925 2.124 ARG 159.A N VAL 155.A O ARG 159.A H 2.929 2.064 ARG 159.A NH1 GLU 163.A OE2 ARG 159.A HH11 2.642 1.813 ALA 160.A N SER 157.A O ALA 160.A H 3.284 2.404 LYS 161.A NZ THR 228.A O LYS 161.A HZ3 3.438 2.668 GLU 163.A N ARG 159.A O GLU 163.A H 3.006 2.207 GLU 163.A N ALA 160.A O GLU 163.A H 3.201 2.568 SER 164.A N LYS 161.A O SER 164.A H 2.796 1.988 LEU 165.A N ALA 160.A O LEU 165.A H 2.788 1.921 ALA 168.A N ILE 141.A O ALA 168.A H 2.653 1.779 GLN 170.A N PRO 232.A O GLN 170.A H 2.759 1.870 GLN 170.A NE2 PRO 231.A O GLN 170.A HE21 2.919 2.035 LEU 171.A N VAL 143.A O LEU 171.A H 2.810 1.941 LEU 172.A N LEU 234.A O LEU 172.A H 2.825 1.914 PHE 173.A N GLY 145.A O PHE 173.A H 2.849 1.961 TYR 174.A N ILE 236.A O TYR 174.A H 2.621 1.750 ALA 176.A N SER 147.A O ALA 176.A H 3.410 2.534 LEU 177.A N GLU 246.A OE2 LEU 177.A H 2.868 1.957 ASP 178.A N GLU 246.A OE2 ASP 178.A H 3.007 2.165 MET 179.A N SER 220.A OG MET 179.A H 2.928 2.034 VAL 180.A N ASP 178.A OD1 VAL 180.A H 2.910 2.074 HIS 181.A N ASP 178.A OD1 HIS 181.A H 2.995 2.103 HIS 181.A ND1 ASP 178.A OD2 HIS 181.A HD1 2.753 1.891 SER 185.A N ASP 245.A OD2 SER 185.A H 2.758 1.960 SER 185.A OG PRO 242.A O SER 185.A HG 2.658 1.872 LYS 186.A N THR 183.A OG1 LYS 186.A H 3.192 2.355 ARG 187.A N THR 183.A O ARG 187.A H 3.106 2.279 ASP 188.A N PRO 184.A O ASP 188.A H 2.779 1.894 PHE 189.A N SER 185.A O PHE 189.A H 2.897 2.045 GLY 192.A N GLU 196.A OE1 GLY 192.A H 2.804 1.947 LEU 195.A N TYR 193.A O LEU 195.A H 2.937 2.158 ALA 197.A N ALA 190.A O ALA 197.A H 2.908 2.040 MET 200.A N GLU 196.A O MET 200.A H 2.913 2.016 GLN 201.A N ALA 197.A O GLN 201.A H 2.862 1.969 GLN 201.A NE2 GLU 205.A OE2 GLN 201.A HE21 2.784 1.893 TRP 202.A N ASP 198.A O TRP 202.A H 2.955 2.061 PHE 203.A N ALA 199.A O PHE 203.A H 2.709 1.828 GLY 204.A N MET 200.A O GLY 204.A H 2.975 2.109 GLU 205.A N GLN 201.A O GLU 205.A H 3.049 2.157 GLN 206.A N TRP 202.A O GLN 206.A H 3.066 2.272 GLN 206.A NE2 TRP 202.A O GLN 206.A HE21 3.283 2.477 TYR 207.A N PHE 203.A O TYR 207.A H 3.019 2.292 TYR 207.A N GLY 204.A O TYR 207.A H 3.214 2.536 LEU 208.A N GLY 204.A O LEU 208.A H 2.841 1.945 ARG 209.A N ASP 213.A OD2 ARG 209.A H 2.776 2.000 ARG 209.A NE ASP 213.A OD2 ARG 209.A HE 3.001 2.139 ARG 209.A NH2 ASP 213.A OD1 ARG 209.A HH22 3.073 2.252 THR 210.A N ASP 213.A OD2 THR 210.A H 3.256 2.394 ASP 213.A N THR 210.A O ASP 213.A H 2.652 1.757 VAL 214.A N PRO 211.A O VAL 214.A H 3.337 2.434 SER 215.A N ASP 212.A O SER 215.A H 3.381 2.498 HIS 216.A N ASP 213.A O HIS 216.A H 2.994 2.143 ALA 219.A N HIS 216.A O ALA 219.A H 2.934 2.124 SER 220.A N HIS 216.A O SER 220.A H 2.878 1.979 SER 220.A OG VAL 214.A O SER 220.A HG 2.538 1.909 ALA 222.A N LEU 177.A O ALA 222.A H 3.015 2.132 LEU 223.A N SER 220.A O LEU 223.A H 2.963 2.059 SER 224.A N PRO 221.A O SER 224.A H 3.205 2.301 THR 228.A N ASP 226.A OD1 THR 228.A H 2.920 2.052 THR 228.A OG1 ASP 226.A OD1 THR 228.A HG1 2.636 1.836 LEU 230.A N LEU 227.A O LEU 230.A H 3.332 2.512 ALA 233.A N PRO 260.A O ALA 233.A H 2.846 1.960 LEU 234.A N GLN 170.A O LEU 234.A H 2.881 1.989 VAL 235.A N GLU 262.A O VAL 235.A H 2.726 1.817 ILE 236.A N LEU 172.A O ILE 236.A H 2.933 2.023 THR 237.A N ILE 264.A O THR 237.A H 2.904 2.012 GLU 239.A N PHE 266.A O GLU 239.A H 3.157 2.307 TYR 240.A N MET 269.A O TYR 240.A H 2.969 2.101 LEU 243.A N ASP 241.A OD1 LEU 243.A H 2.937 2.051 ARG 244.A N ASP 241.A O ARG 244.A H 2.874 1.985 ARG 244.A NE ASP 245.A OD1 ARG 244.A HE 3.044 2.307 ARG 244.A NH1 GLU 239.A O ARG 244.A HH11 2.746 2.176 ARG 244.A NH2 ASP 245.A OD1 ARG 244.A HH22 3.299 2.506 ASP 245.A N SER 185.A OG ASP 245.A H 2.925 2.055 GLY 247.A N LEU 243.A O GLY 247.A H 3.287 2.405 GLU 248.A N ARG 244.A O GLU 248.A H 3.020 2.148 ALA 249.A N ASP 245.A O ALA 249.A H 2.829 1.933 TYR 250.A N GLU 246.A O TYR 250.A H 3.052 2.206 ALA 251.A N GLY 247.A O ALA 251.A H 3.039 2.171 GLU 252.A N GLU 248.A O GLU 252.A H 3.023 2.144 ALA 253.A N ALA 249.A O ALA 253.A H 2.894 2.017 LEU 254.A N TYR 250.A O LEU 254.A H 2.821 1.935 ARG 255.A N ALA 251.A O ARG 255.A H 2.995 2.118 ARG 255.A NH2 THR 261.A O ARG 255.A HH22 3.461 2.506 ALA 256.A N GLU 252.A O ALA 256.A H 3.075 2.192 ALA 257.A N ALA 253.A O ALA 257.A H 3.028 2.322 ALA 257.A N LEU 254.A O ALA 257.A H 3.048 2.366 GLY 258.A N ARG 255.A O GLY 258.A H 3.104 2.251 VAL 259.A N LEU 254.A O VAL 259.A H 3.079 2.236 GLU 262.A N ALA 233.A O GLU 262.A H 2.771 1.883 GLN 263.A NE2.A VAL 235.A O GLN 263.A HE21.A 3.093 2.595 GLN 263.A NE2.A THR 237.A OG1 GLN 263.A HE22.A 2.971 2.257 ILE 264.A N VAL 235.A O ILE 264.A H 2.877 1.976 ARG 265.A NE GLU 248.A OE2 ARG 265.A HE 2.909 2.048 ARG 265.A NH2 GLU 248.A OE1 ARG 265.A HH22 2.954 2.113 PHE 266.A N THR 237.A O PHE 266.A H 2.991 2.084 GLY 268.A N GLU 239.A OE1 GLY 268.A H 2.780 1.937 MET 269.A N PHE 266.A O MET 269.A H 3.408 2.618 MET 274.A N TYR 174.A OH MET 274.A H 2.995 2.202 THR 275.A N GLY 272.A O THR 275.A H 2.951 2.071 THR 275.A OG1 GLY 272.A O THR 275.A HG1 3.162 2.595 MET 276.A N PHE 273.A O MET 276.A H 3.110 2.269 PHE 279.A N MET 276.A O PHE 279.A H 2.987 2.081 GLN 281.A N GLN 281.A OE1 GLN 281.A H 2.950 2.170 GLN 281.A NE2 ASP 4.A OD1 GLN 281.A HE22 2.901 2.041 MET 282.A N PHE 279.A O MET 282.A H 3.071 2.215 ALA 284.A N PRO 280.A O ALA 284.A H 3.119 2.293 ALA 285.A N GLN 281.A O ALA 285.A H 2.911 2.052 ILE 286.A N MET 282.A O ILE 286.A H 3.061 2.213 GLU 287.A N GLU 283.A O GLU 287.A H 2.985 2.172 ALA 288.A N ALA 284.A O ALA 288.A H 2.944 2.094 VAL 289.A N ALA 285.A O VAL 289.A H 2.968 2.134 ALA 290.A N ILE 286.A O ALA 290.A H 3.125 2.274 ARG 291.A N GLU 287.A O ARG 291.A H 2.973 2.085 ARG 291.A NE GLU 287.A OE2 ARG 291.A HE 3.195 2.480 PHE 292.A N ALA 288.A O PHE 292.A H 2.859 1.969 LEU 293.A N VAL 289.A O LEU 293.A H 2.944 2.034 GLU 294.A N ALA 290.A O GLU 294.A H 3.096 2.328 ARG 295.A N PHE 292.A O ARG 295.A H 3.049 2.205 ARG 295.A NH1 GLU 262.A OE2 ARG 295.A HH12 2.606 1.749 ILE 296.A N LEU 293.A O ILE 296.A H 3.173 2.288