Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8yx5_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 4.A NH1 ASN 49.A OD1 no hydrogen 3.122 N/A ARG 4.A NH2 ASN 49.A OD1 no hydrogen 2.727 N/A ILE 6.A N VAL 22.A O no hydrogen 3.161 N/A LYS 7.A N GLU 52.A OE2 no hydrogen 3.201 N/A VAL 8.A N GLN 20.A O VAL 8.A H 2.991 2.176 PHE 9.A N LYS 54.A O PHE 9.A H 2.970 2.118 THR 10.A N HIS 18.A O THR 10.A H 2.847 2.014 THR 11.A N PHE 56.A O THR 11.A H 2.992 2.375 THR 11.A OG1 ASN 16.A O THR 11.A HG1 2.777 2.356 ASP 13.A N THR 11.A OG1 ASP 13.A H 3.202 2.467 ASN 14.A N THR 11.A OG1 ASN 14.A H 2.832 2.090 ILE 15.A N ASP 13.A OD1 ILE 15.A H 2.766 1.928 ASN 16.A N ASP 13.A OD1 ASN 16.A H 2.810 1.978 ASN 16.A ND2 ASP 13.A OD2 ASN 16.A HD21 2.827 1.999 HIS 18.A N THR 10.A O HIS 18.A H 2.819 2.040 HIS 18.A NE2 GLU 68.A OE1 HIS 18.A HE2 2.822 1.973 GLN 20.A N VAL 8.A O GLN 20.A H 2.772 1.918 GLN 20.A NE2 THR 10.A OG1 GLN 20.A HE21 3.019 2.239 GLN 20.A NE2 HIS 18.A O GLN 20.A HE21 3.544 3.005 VAL 22.A N ILE 6.A O no hydrogen 2.884 N/A ASP 23.A N GLN 31.A OE1 no hydrogen 2.799 N/A MET 24.A N ARG 4.A O no hydrogen 2.820 N/A SER 25.A N ASP 23.A OD1 no hydrogen 2.811 N/A SER 25.A OG ASP 23.A OD1 no hydrogen 2.687 N/A SER 25.A OG ASP 23.A OD2 no hydrogen 3.467 N/A MET 26.A N ASP 23.A O MET 26.A H 3.175 2.322 THR 27.A N GLN 30.A OE1 THR 27.A H 2.945 2.135 THR 27.A OG1 THR 43.A O THR 27.A HG1 3.435 2.742 TYR 28.A N ILE 45.A O TYR 28.A H 3.007 2.199 GLY 29.A N THR 43.A O GLY 29.A H 2.852 2.059 GLN 30.A N THR 27.A OG1 GLN 30.A H 3.119 2.314 GLN 31.A N TYR 28.A O GLN 31.A H 2.919 2.139 GLN 31.A NE2 ASP 23.A O GLN 31.A HE22 2.943 2.308 GLN 31.A NE2 MET 26.A O GLN 31.A HE21 3.224 2.748 GLN 31.A NE2 THR 27.A O GLN 31.A HE21 3.284 2.463 PHE 32.A N TYR 28.A O PHE 32.A H 2.673 1.880 GLY 33.A N GLY 29.A O GLY 33.A H 2.954 2.164 THR 35.A N THR 43.A OG1 THR 35.A H 3.027 2.217 TYR 36.A N TYR 57.A O TYR 36.A H 2.860 2.085 LEU 37.A N ALA 40.A O LEU 37.A H 2.799 1.997 ALA 40.A N LEU 37.A O ALA 40.A H 2.900 2.113 VAL 42.A N THR 35.A O VAL 42.A H 2.881 2.075 THR 43.A N ASP 41.A OD1 THR 43.A H 3.009 2.153 ILE 45.A N VAL 42.A O ILE 45.A H 3.092 2.247 HIS 48.A N HIS 51.A ND1 HIS 48.A H 3.108 2.257 HIS 48.A ND1 SER 50.A OG HIS 48.A HD1 2.708 1.893 HIS 51.A N HIS 48.A O HIS 51.A H 2.947 2.104 HIS 51.A ND1 TYR 28.A OH no hydrogen 2.710 N/A GLU 52.A N ASN 49.A O GLU 52.A H 3.281 2.432 GLY 53.A N LYS 7.A O GLY 53.A H 2.813 1.970 LYS 54.A N HIS 51.A O LYS 54.A H 3.013 2.163 LYS 54.A NZ SER 50.A O LYS 54.A HZ3 3.496 2.780 PHE 56.A N PHE 9.A O PHE 56.A H 2.799 1.979 TYR 57.A N TYR 36.A O TYR 57.A H 2.870 2.148 VAL 58.A N THR 11.A O VAL 58.A H 3.029 2.243 LEU 65.A N ASP 62.A OD1 LEU 65.A H 2.711 1.864 ARG 66.A N ASP 62.A O ARG 66.A H 2.916 2.119 VAL 67.A N ASP 63.A O VAL 67.A H 2.975 2.145 GLU 68.A N THR 64.A O GLU 68.A H 2.979 2.148 ALA 69.A N LEU 65.A O ALA 69.A H 2.839 2.000 PHE 70.A N ARG 66.A O PHE 70.A H 3.049 2.199 GLU 71.A N VAL 67.A O GLU 71.A H 2.952 2.103 TYR 72.A N GLU 68.A O TYR 72.A H 3.086 2.368 TYR 72.A N ALA 69.A O TYR 72.A H 3.156 2.518 TYR 73.A N ALA 69.A O TYR 73.A H 2.901 2.057 TYR 73.A OH VAL 12.A O TYR 73.A HH 2.647 2.058 HIS 74.A N PHE 70.A O HIS 74.A H 2.814 2.036 ASP 77.A N THR 75.A OG1 ASP 77.A H 3.196 2.366 SER 79.A N ASP 77.A OD1 SER 79.A H 2.970 2.155 PHE 80.A N ASP 77.A O PHE 80.A H 3.045 2.191 ARG 83.A N SER 79.A O ARG 83.A H 3.125 2.292 ARG 83.A NE SER 79.A OG ARG 83.A HE 2.950 2.098 ARG 83.A NH1 ALA 154.A O ARG 83.A HH12 2.660 1.813 ARG 83.A NH2 ASP 77.A OD2 ARG 83.A HH21 2.829 2.151 TYR 84.A N PHE 80.A O TYR 84.A H 2.821 1.988 MET 85.A N LEU 81.A O MET 85.A H 2.842 2.004 SER 86.A N GLY 82.A O SER 86.A H 2.924 2.081 SER 86.A OG GLY 82.A O SER 86.A HG 2.756 1.978 ALA 87.A N ARG 83.A O ALA 87.A H 2.968 2.123 LEU 88.A N TYR 84.A O LEU 88.A H 2.895 2.067 ASN 89.A N MET 85.A O ASN 89.A H 3.010 2.202 HIS 90.A N ALA 87.A O HIS 90.A H 2.890 2.178 THR 91.A N ALA 87.A O THR 91.A H 2.822 2.000 THR 91.A OG1 ALA 146.A O THR 91.A HG1 2.783 2.148 LYS 92.A N LEU 88.A O LYS 92.A H 2.917 2.071 LYS 92.A NZ ASP 38.A O LYS 92.A HZ3 2.940 2.388 LYS 92.A NZ ASN 89.A OD1 LYS 92.A HZ3 3.143 2.591 LYS 93.A N HIS 90.A O LYS 93.A H 2.928 2.120 TRP 94.A N THR 91.A O TRP 94.A H 3.112 2.380 TRP 94.A NE1 ASP 109.A OD2 TRP 94.A HE1 2.944 2.095 TYR 96.A OH THR 91.A O TYR 96.A HH 2.764 2.063 VAL 99.A N LEU 102.A O VAL 99.A H 2.690 1.847 LEU 102.A N VAL 99.A O LEU 102.A H 2.786 1.967 THR 103.A N GLN 122.A OE1 THR 103.A H 2.881 2.026 THR 103.A OG1 ALA 140.A O THR 103.A HG1 3.013 2.211 SER 104.A N PRO 97.A O SER 104.A H 2.856 1.996 LYS 106.A N LYS 95.A O LYS 106.A H 2.872 2.059 ALA 108.A N ASN 111.A OD1 ALA 108.A H 3.148 2.324 ASN 110.A ND2 GLY 161.A O ASN 110.A HD21 2.763 1.947 ASN 111.A N ALA 108.A O ASN 111.A H 2.959 2.310 ASN 111.A ND2 LYS 106.A O ASN 111.A HD21 3.290 2.440 LEU 114.A N ASN 111.A O LEU 114.A H 3.012 2.399 ALA 115.A N ASN 111.A O ALA 115.A H 3.047 2.214 THR 116.A N SER 112.A O THR 116.A H 2.986 2.137 ALA 117.A N TYR 113.A O ALA 117.A H 2.902 2.084 LEU 118.A N LEU 114.A O LEU 118.A H 2.752 1.911 LEU 119.A N ALA 115.A O LEU 119.A H 2.911 2.055 THR 120.A N THR 116.A O THR 120.A H 3.046 2.225 THR 120.A OG1 THR 116.A O THR 120.A HG1 2.835 2.089 LEU 121.A N ALA 117.A O LEU 121.A H 2.810 1.992 GLN 122.A N LEU 118.A O GLN 122.A H 3.231 2.548 GLN 122.A N LEU 119.A O GLN 122.A H 3.227 2.539 GLN 122.A NE2 THR 103.A O GLN 122.A HE22 2.922 2.086 GLN 122.A NE2 LEU 118.A O GLN 122.A HE21 2.953 2.101 GLN 123.A N THR 120.A O GLN 123.A H 2.877 2.034 GLN 123.A NE2 LEU 119.A O GLN 123.A HE21 2.996 2.164 GLN 123.A NE2 HIS 268.A NE2 GLN 123.A HE22 2.766 2.013 ASN 129.A N HIS 176.A O ASN 129.A H 2.830 1.977 ALA 132.A N TYR 72.A O ALA 132.A H 2.944 2.107 LEU 133.A N PRO 130.A O LEU 133.A H 2.938 2.341 GLN 134.A N PRO 130.A O GLN 134.A H 3.016 2.176 GLN 134.A NE2 PHE 128.A O GLN 134.A HE21 2.820 1.995 ASP 135.A N PRO 131.A O ASP 135.A H 2.856 2.002 ALA 136.A N ALA 132.A O ALA 136.A H 3.060 2.217 TYR 137.A N LEU 133.A O TYR 137.A H 2.848 2.030 TYR 138.A N GLN 134.A O TYR 138.A H 3.166 2.319 ARG 139.A N ASP 135.A O ARG 139.A H 3.207 2.378 ARG 139.A NH2 GLU 144.A OE1 ARG 139.A HH22 2.643 1.882 ALA 140.A N ALA 136.A O ALA 140.A H 2.833 2.058 ARG 141.A N TYR 137.A O ARG 141.A H 2.864 2.064 ALA 142.A N ARG 139.A O ALA 142.A H 3.112 2.443 GLY 143.A N ALA 140.A O GLY 143.A H 3.018 2.194 GLU 144.A N ARG 139.A O GLU 144.A H 2.998 2.182 ASN 147.A ND2 TYR 84.A OH ASN 147.A HD21 2.619 1.906 CYS 149.A N ALA 145.A O CYS 149.A H 2.926 2.080 ALA 150.A N ALA 146.A O ALA 150.A H 2.998 2.178 LEU 151.A N ASN 147.A O LEU 151.A H 2.894 2.073 ILE 152.A N PHE 148.A O ILE 152.A H 2.926 2.099 LEU 153.A N CYS 149.A O LEU 153.A H 3.042 2.192 ALA 154.A N ALA 150.A O ALA 154.A H 2.975 2.169 TYR 155.A N LEU 151.A O TYR 155.A H 2.721 1.864 CYS 156.A N ILE 152.A O CYS 156.A H 2.934 2.106 CYS 156.A SG ILE 152.A O CYS 156.A HG 3.397 2.553 ASN 157.A N ALA 154.A O ASN 157.A H 3.230 2.402 LYS 158.A N LEU 153.A O LYS 158.A H 2.936 2.092 THR 159.A N GLU 162.A OE1 THR 159.A H 3.167 2.321 GLU 162.A N THR 159.A O GLU 162.A H 3.077 2.230 GLU 168.A N ASP 165.A OD1 GLU 168.A H 2.816 2.003 THR 169.A N ASP 165.A O THR 169.A H 2.884 2.088 THR 169.A OG1 ASP 165.A O THR 169.A HG1 2.759 2.156 MET 170.A N VAL 166.A O MET 170.A H 2.832 1.981 SER 171.A N ARG 167.A O SER 171.A H 2.915 2.087 TYR 172.A N GLU 168.A O TYR 172.A H 3.091 2.274 LEU 173.A N THR 169.A O LEU 173.A H 3.053 2.203 PHE 174.A N MET 170.A O PHE 174.A H 2.750 1.954 GLN 175.A N SER 171.A O GLN 175.A H 3.182 2.478 GLN 175.A N TYR 172.A O GLN 175.A H 3.032 2.385 HIS 176.A N LEU 173.A O HIS 176.A H 2.868 2.087 ALA 177.A N PHE 174.A O ALA 177.A H 2.988 2.150 ASN 178.A N LYS 127.A O ASN 178.A H 2.809 1.981 ASP 180.A N ASN 178.A OD1 ASP 180.A H 3.262 2.403 CYS 182.A N LEU 179.A O CYS 182.A H 2.989 2.156 LYS 183.A N GLU 231.A O LYS 183.A H 2.876 2.096 ARG 184.A N LEU 196.A O ARG 184.A H 2.978 2.162 ARG 184.A NE GLN 230.A OE1 ARG 184.A HE 2.745 1.958 ARG 184.A NH1 MET 203.A O ARG 184.A HH11 3.035 2.438 ARG 184.A NH2 GLN 230.A OE1 ARG 184.A HH21 3.157 2.494 VAL 185.A N GLN 229.A O VAL 185.A H 2.848 2.005 LEU 186.A N THR 194.A O LEU 186.A H 2.934 2.088 ASN 187.A N TYR 226.A O ASN 187.A H 3.034 2.201 ASN 187.A ND2 TYR 226.A OH ASN 187.A HD21 3.043 2.204 VAL 188.A N GLN 192.A O VAL 188.A H 2.893 2.073 VAL 189.A N THR 224.A O VAL 189.A H 2.948 2.156 GLN 192.A N VAL 188.A O GLN 192.A H 2.803 1.990 THR 194.A N LEU 186.A O THR 194.A H 3.017 2.220 LEU 196.A N ARG 184.A O LEU 196.A H 2.760 1.946 GLY 198.A N CYS 182.A O GLY 198.A H 3.254 2.494 ALA 201.A N GLY 198.A O ALA 201.A H 2.918 2.131 VAL 202.A N VAL 199.A O VAL 202.A H 3.110 2.268 TYR 204.A N MET 236.A O TYR 204.A H 3.047 2.332 GLY 206.A N SER 238.A O GLY 206.A H 2.737 1.897 TYR 210.A N TYR 298.A OH TYR 210.A H 3.423 2.626 GLN 212.A N SER 209.A OG GLN 212.A H 2.924 2.121 GLN 212.A NE2 GLN 212.A O GLN 212.A HE21 3.408 2.795 GLN 212.A NE2 GLY 216.A O GLN 212.A HE21 2.937 2.167 PHE 213.A N SER 209.A O PHE 213.A H 3.129 2.325 LYS 214.A N TYR 210.A O LYS 214.A H 2.985 2.207 LYS 214.A NZ GLU 211.A OE2 LYS 214.A HZ2 3.170 2.348 LYS 215.A N GLU 211.A O LYS 215.A H 2.916 2.165 GLY 216.A N GLN 212.A O GLY 216.A H 2.773 2.020 VAL 217.A N LYS 225.A O VAL 217.A H 2.886 2.061 ILE 219.A N ALA 223.A O ILE 219.A H 2.916 2.117 ALA 223.A N ILE 219.A O ALA 223.A H 2.894 2.067 THR 224.A N VAL 189.A O THR 224.A H 3.196 2.357 THR 224.A OG1 GLN 218.A OE1 THR 224.A HG1 2.881 2.067 LYS 225.A N VAL 217.A O LYS 225.A H 2.850 2.015 TYR 226.A N ASN 187.A O TYR 226.A H 2.915 2.097 LEU 227.A N PHE 213.A O LEU 227.A H 3.143 2.374 VAL 228.A N VAL 185.A O VAL 228.A H 2.747 1.937 GLN 229.A N VAL 185.A O GLN 229.A H 3.282 2.485 GLN 229.A NE2 SER 302.A OG GLN 229.A HE22 3.318 2.697 GLN 230.A N TYR 303.A O GLN 230.A H 2.887 2.079 GLN 230.A NE2 ALA 201.A O GLN 230.A HE22 2.861 2.008 GLN 230.A NE2 SER 232.A OG GLN 230.A HE21 2.887 2.069 GLU 231.A N LYS 183.A O GLU 231.A H 2.849 2.004 SER 232.A N ASN 301.A O SER 232.A H 3.234 2.573 SER 232.A OG PHE 234.A O SER 232.A HG 2.811 2.178 VAL 235.A N TYR 298.A O VAL 235.A H 2.887 2.110 MET 236.A N VAL 202.A O MET 236.A H 2.782 1.939 MET 237.A N VAL 296.A O MET 237.A H 2.845 1.988 SER 238.A N TYR 204.A O SER 238.A H 2.876 2.090 ALA 239.A N THR 294.A O ALA 239.A H 3.054 2.253 ALA 242.A N ILE 293.A O ALA 242.A H 3.255 2.463 TYR 244.A N GLY 291.A O TYR 244.A H 2.775 2.080 LEU 246.A N TYR 289.A O LEU 246.A H 3.049 2.296 LYS 247.A NZ GLU 288.A OE1 LYS 247.A HZ2 3.057 2.273 HIS 248.A NE2 LYS 272.A O HIS 248.A HE2 2.681 1.933 GLY 249.A N SER 271.A OG GLY 249.A H 2.833 1.998 THR 250.A N LYS 247.A O THR 250.A H 3.154 2.370 THR 252.A N PHE 297.A O THR 252.A H 2.910 2.079 CYS 253.A N PHE 297.A O CYS 253.A H 3.407 2.619 ALA 254.A N ILE 269.A O ALA 254.A H 2.736 2.035 SER 255.A N ASP 295.A O SER 255.A H 2.878 2.057 SER 255.A OG ASP 295.A OD2 SER 255.A HG 2.933 2.223 GLU 256.A N LYS 267.A O GLU 256.A H 2.861 2.089 TYR 257.A N PRO 292.A O TYR 257.A H 2.881 2.075 THR 258.A N HIS 265.A O THR 258.A H 3.017 2.179 THR 258.A OG1 HIS 265.A O THR 258.A HG1 3.458 2.846 CYS 263.A N ASN 260.A O CYS 263.A H 3.004 2.149 CYS 263.A SG ASN 260.A O no hydrogen 3.689 N/A CYS 263.A SG TYR 261.A O no hydrogen 3.517 N/A GLY 264.A N TYR 257.A OH GLY 264.A H 2.827 2.116 HIS 265.A N THR 258.A O HIS 265.A H 2.853 2.100 HIS 265.A NE2 ASP 279.A OD1 HIS 265.A HE2 2.830 1.999 LYS 267.A N GLU 256.A O LYS 267.A H 2.953 2.152 HIS 268.A N ILE 278.A O HIS 268.A H 2.977 2.134 ILE 269.A N ALA 254.A O ILE 269.A H 2.818 1.970 THR 270.A N TYR 276.A O THR 270.A H 2.976 2.181 THR 270.A OG1 THR 252.A O THR 270.A HG1 3.301 2.526 SER 271.A N THR 252.A O SER 271.A H 3.424 2.617 LYS 272.A N THR 274.A O LYS 272.A H 2.955 2.095 LYS 272.A NZ SER 271.A O LYS 272.A HZ3 3.015 2.313 GLU 273.A N GLU 273.A OE1 GLU 273.A H 2.888 2.107 LEU 275.A N SER 286.A O LEU 275.A H 3.107 2.354 TYR 276.A N THR 270.A O TYR 276.A H 2.826 1.972 CYS 277.A N THR 284.A O CYS 277.A H 2.791 1.936 ILE 278.A N HIS 268.A O ILE 278.A H 2.765 1.958 ASP 279.A N LEU 282.A O ASP 279.A H 2.757 1.910 LEU 282.A N ASP 279.A O LEU 282.A H 2.964 2.107 THR 284.A N CYS 277.A O THR 284.A H 3.004 2.173 LYS 285.A NZ GLU 273.A OE2 LYS 285.A HZ3 2.977 2.124 SER 286.A N LEU 275.A O SER 286.A H 3.014 2.210 SER 286.A OG GLU 288.A O SER 286.A HG 2.811 2.119 GLY 291.A N TYR 244.A O GLY 291.A H 2.921 2.129 ILE 293.A N ALA 242.A O ILE 293.A H 3.000 2.187 THR 294.A N SER 255.A O THR 294.A H 2.925 2.089 THR 294.A OG1 ALA 239.A O THR 294.A HG1 2.764 2.159 VAL 296.A N MET 237.A O VAL 296.A H 2.709 1.884 PHE 297.A N CYS 253.A O PHE 297.A H 2.788 1.928 TYR 298.A N VAL 235.A O TYR 298.A H 2.997 2.178 TYR 298.A OH LEU 208.A O TYR 298.A HH 2.687 2.034 LYS 299.A N THR 252.A OG1 LYS 299.A H 3.054 2.324 GLU 300.A N PRO 233.A O GLU 300.A H 3.005 2.212 ASN 301.A N GLU 300.A OE1 ASN 301.A H 2.795 1.999 TYR 303.A N GLN 230.A O TYR 303.A H 2.829 1.996 THR 304.A OG1 GLN 229.A OE1 THR 304.A HG1 2.355 1.859 THR 305.A N VAL 228.A O THR 305.A H 2.897 2.069 ILE 307.A N THR 305.A OG1 no hydrogen 2.986 N/A