Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 9c5k_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A NH1 MET 28.A O ARG 2.A HH11 3.117 2.290 ARG 2.A NH1 TYR 54.A O ARG 2.A HH12 3.042 2.341 ARG 2.A NH2 TYR 54.A O ARG 2.A HH22 2.979 2.263 LEU 4.A N ALA 29.A O LEU 4.A H 2.756 1.926 SER 5.A N ARG 2.A O SER 5.A H 3.040 2.184 ARG 7.A N LEU 4.A O ARG 7.A H 3.050 2.196 ARG 7.A NH1 GLU 86.A OE2 ARG 7.A HH11 2.903 2.097 VAL 8.A N GLU 86.A OE1 VAL 8.A H 2.935 2.156 ALA 9.A N ASP 32.A O ALA 9.A H 2.886 2.056 VAL 10.A N ILE 87.A O VAL 10.A H 2.882 2.081 VAL 11.A N VAL 34.A O VAL 11.A H 3.192 2.345 THR 12.A N VAL 89.A O THR 12.A H 3.079 2.248 GLY 13.A N ASN 36.A OD1 GLY 13.A H 3.016 2.177 SER 14.A N ASN 36.A O SER 14.A H 2.742 1.948 SER 14.A OG VAL 11.A O SER 14.A HG 2.611 2.026 LEU 20.A N SER 16.A O LEU 20.A H 3.201 2.358 GLY 21.A N GLY 17.A O GLY 21.A H 3.111 2.290 ILE 22.A N ILE 18.A O ILE 22.A H 2.763 1.930 ALA 23.A N GLY 19.A O ALA 23.A H 2.923 2.069 MET 24.A N LEU 20.A O MET 24.A H 2.898 2.066 ARG 25.A N GLY 21.A O ARG 25.A H 3.056 2.242 ARG 25.A NE ASP 235.A OD1 ARG 25.A HE 2.816 2.015 LEU 26.A N ILE 22.A O LEU 26.A H 2.841 1.995 ALA 27.A N ALA 23.A O ALA 27.A H 2.982 2.138 MET 28.A N MET 24.A O MET 28.A H 2.909 2.096 ALA 29.A N ARG 25.A O ALA 29.A H 3.018 2.305 ALA 29.A N LEU 26.A O ALA 29.A H 3.149 2.521 GLY 30.A N ALA 27.A O GLY 30.A H 3.010 2.184 ALA 31.A N LEU 26.A O ALA 31.A H 2.983 2.149 ASP 32.A N ARG 7.A O ASP 32.A H 2.870 2.191 VAL 33.A N ARG 57.A O VAL 33.A H 2.973 2.188 VAL 34.A N ALA 9.A O VAL 34.A H 2.930 2.121 LEU 35.A N ARG 59.A O LEU 35.A H 2.793 1.941 ASN 36.A N SER 14.A OG ASN 36.A H 2.903 2.155 ASN 36.A ND2 PHE 61.A O ASN 36.A HD22 3.045 2.246 ASN 36.A ND2 ALA 63.A O ASN 36.A HD21 3.071 2.223 ALA 46.A N ASP 44.A OD1 ALA 46.A H 3.038 2.189 LYS 50.A N ALA 46.A O LYS 50.A H 2.901 2.091 LYS 50.A NZ ASP 44.A OD2 LYS 50.A HZ3 2.763 2.026 VAL 51.A N ILE 47.A O VAL 51.A H 3.084 2.251 ALA 52.A N VAL 48.A O ALA 52.A H 2.791 1.966 GLY 55.A N ALA 52.A O GLY 55.A H 3.135 2.279 THR 56.A OG1 ALA 31.A O THR 56.A HG1 2.826 2.068 ARG 57.A N ASP 32.A OD1 ARG 57.A H 2.917 2.069 ARG 57.A NE ASP 32.A OD2 ARG 57.A HE 3.006 2.237 ARG 57.A NH2 ASP 32.A OD2 ARG 57.A HH21 2.916 2.133 ARG 57.A NH2 LEU 82.A O ARG 57.A HH22 2.962 2.203 ARG 59.A N VAL 33.A O ARG 59.A H 3.015 2.242 ARG 59.A NE GLU 81.A OE1 ARG 59.A HE 3.065 2.213 ARG 59.A NH1 VAL 58.A O ARG 59.A HH11 2.824 2.001 TYR 60.A OH ARG 39.A O TYR 60.A HH 2.604 1.782 PHE 61.A N LEU 35.A O PHE 61.A H 2.913 2.094 ALA 63.A N GLY 37.A O ALA 63.A H 2.898 2.146 ASN 64.A N GLN 70.A OE1 ASN 64.A H 2.805 1.951 LYS 66.A N ASN 64.A OD1 LYS 66.A H 2.950 2.111 LYS 66.A NZ GLU 110.A OE2 LYS 66.A HZ3 2.770 1.993 ASP 67.A N ASN 64.A O ASP 67.A H 3.075 2.247 ARG 68.A NH2 GLN 124.A OE1 ARG 68.A HH21 3.160 2.305 ALA 69.A N ASP 67.A OD1 ALA 69.A H 3.041 2.321 GLN 70.A N ASP 67.A O GLN 70.A H 2.888 2.280 GLN 70.A NE2 ASP 67.A OD2 GLN 70.A HE21 2.904 2.071 VAL 71.A N ASP 67.A O VAL 71.A H 2.986 2.170 GLU 72.A N ARG 68.A O GLU 72.A H 2.943 2.123 ALA 73.A N ALA 69.A O ALA 73.A H 2.987 2.187 LEU 74.A N GLN 70.A O LEU 74.A H 2.967 2.150 ILE 75.A N VAL 71.A O ILE 75.A H 3.116 2.307 LYS 76.A N GLU 72.A O LYS 76.A H 2.858 2.023 LYS 76.A NZ GLU 79.A OE1 LYS 76.A HZ2 3.115 2.233 PHE 77.A N ALA 73.A O PHE 77.A H 2.861 2.030 THR 78.A N LEU 74.A O THR 78.A H 3.087 2.255 THR 78.A OG1 LEU 74.A O THR 78.A HG1 2.921 2.136 GLU 79.A N ILE 75.A O GLU 79.A H 2.976 2.136 LYS 80.A N LYS 76.A O LYS 80.A H 2.940 2.159 GLU 81.A N PHE 77.A O GLU 81.A H 2.873 2.062 LEU 82.A N THR 78.A O LEU 82.A H 2.852 2.021 GLY 83.A N THR 78.A O GLY 83.A H 2.976 2.142 GLU 86.A N VAL 8.A O GLU 86.A H 2.922 2.096 ILE 87.A N VAL 8.A O ILE 87.A H 2.979 2.155 LEU 88.A N ARG 137.A O LEU 88.A H 2.777 1.932 VAL 89.A N VAL 10.A O VAL 89.A H 2.877 2.030 ASN 90.A N ILE 139.A O ASN 90.A H 2.928 2.193 ASN 90.A ND2 ASN 140.A OD1 ASN 90.A HD22 2.903 2.064 ASN 91.A N THR 12.A OG1 ASN 91.A H 2.811 1.986 ASN 91.A ND2 THR 12.A O ASN 91.A HD22 3.185 2.387 ALA 92.A N THR 12.A OG1 ALA 92.A H 2.943 2.095 ILE 94.A N ASN 115.A OD1 ILE 94.A H 2.997 2.195 HIS 96.A N GLN 95.A OE1 HIS 96.A H 2.892 2.217 SER 98.A N ASN 152.A O SER 98.A H 2.893 2.088 SER 98.A OG PRO 99.A O SER 98.A HG 2.938 2.104 GLU 101.A N GLU 101.A OE1 GLU 101.A H 2.742 1.951 THR 102.A OG1 SER 98.A OG THR 102.A HG1 3.292 2.500 PHE 103.A N VAL 100.A O PHE 103.A H 3.174 2.320 TRP 108.A N PRO 104.A O TRP 108.A H 2.991 2.162 ASP 109.A N SER 105.A O ASP 109.A H 3.055 2.222 GLU 110.A N ASP 106.A O GLU 110.A H 2.898 2.118 ILE 111.A N LYS 107.A O ILE 111.A H 3.060 2.252 ILE 112.A N TRP 108.A O ILE 112.A H 2.987 2.135 ALA 113.A N ASP 109.A O ALA 113.A H 2.892 2.068 LEU 114.A N GLU 110.A O LEU 114.A H 3.006 2.172 ASN 115.A N ILE 111.A O ASN 115.A H 2.787 1.960 ASN 115.A ND2 ILE 94.A O ASN 115.A HD21 2.980 2.144 LEU 116.A N ILE 112.A O LEU 116.A H 3.099 2.321 THR 117.A N ILE 112.A O THR 117.A H 2.952 2.118 SER 118.A N.A ALA 113.A O SER 118.A H.A 2.861 2.142 SER 118.A N.B ALA 113.A O SER 118.A H.B 2.845 2.116 SER 118.A OG.A LEU 114.A O SER 118.A HG.A 2.439 1.948 SER 118.A OG.B MET 65.A O SER 118.A HG.B 2.450 1.732 ALA 119.A N LEU 116.A O ALA 119.A H.A 3.099 2.431 HIS 121.A N THR 117.A O HIS 121.A H 2.944 2.130 ALA 122.A N SER 118.A O.A ALA 122.A H 3.033 2.176 ALA 122.A N SER 118.A O.B ALA 122.A H 3.032 2.176 THR 123.A N ALA 119.A O THR 123.A H 2.966 2.125 THR 123.A OG1 ALA 119.A O THR 123.A HG1 2.749 2.190 GLN 124.A N PHE 120.A O GLN 124.A H 2.890 2.056 LEU 125.A N HIS 121.A O LEU 125.A H 3.056 2.309 CYS 126.A N ALA 122.A O CYS 126.A H 3.083 2.391 CYS 126.A N THR 123.A O CYS 126.A H 3.241 2.559 LEU 127.A N THR 123.A O LEU 127.A H 3.035 2.284 MET 130.A N CYS 126.A O MET 130.A H 3.315 2.471 ARG 131.A N LEU 127.A O ARG 131.A H 2.802 1.968 ARG 131.A NH2 GLU 173.A O ARG 131.A HH22 2.960 2.147 GLN 132.A N PRO 128.A O GLN 132.A H 2.952 2.116 ARG 133.A N SER 129.A O ARG 133.A H 2.943 2.138 GLY 134.A N ARG 131.A O GLY 134.A H 3.193 2.475 TRP 135.A N MET 130.A O TRP 135.A H 3.243 2.486 GLY 136.A N GLY 178.A O GLY 136.A H 3.155 2.378 ARG 137.A N GLU 86.A O ARG 137.A H 2.932 2.155 ARG 137.A NE LEU 240.A O ARG 137.A HE 2.845 2.104 ARG 137.A NH1 GLY 136.A O ARG 137.A HH11 3.164 2.321 ARG 137.A NH2 SER 242.A O ARG 137.A HH21 3.008 2.209 ARG 137.A NH2 ASP 246.A OD1 ARG 137.A HH22 2.786 1.985 ILE 138.A N THR 180.A O ILE 138.A H 2.967 2.147 ILE 139.A N LEU 88.A O ILE 139.A H 2.801 1.977 ASN 140.A N ASN 182.A O ASN 140.A H 2.949 2.109 ASN 140.A ND2 THR 167.A OG1 ASN 140.A HD22 2.962 2.125 ILE 141.A N ASN 90.A O ILE 141.A H 2.943 2.085 ALA 142.A N ILE 184.A O ALA 142.A H 2.795 2.033 VAL 144.A N PRO 186.A O VAL 144.A H 3.130 2.322 GLN 145.A N SER 143.A OG GLN 145.A H 2.744 1.907 GLY 146.A N SER 143.A O GLY 146.A H 2.862 2.021 LEU 147.A N VAL 144.A O LEU 147.A H 2.878 2.036 VAL 148.A N VAL 144.A O VAL 148.A H 3.068 2.306 SER 150.A OG GLN 145.A OE1 SER 150.A HG 2.743 2.096 LYS 153.A NZ GLN 197.A OE1 LYS 153.A HZ1 2.910 2.134 CYS 157.A N LYS 153.A O CYS 157.A H 2.875 2.015 ALA 158.A N SER 154.A O ALA 158.A H 2.968 2.155 ALA 159.A N ALA 155.A O ALA 159.A H 2.825 1.985 LYS 160.A N TYR 156.A O LYS 160.A H 2.912 2.065 LYS 160.A NZ ILE 141.A O LYS 160.A HZ2 2.925 2.288 LYS 160.A NZ ALA 142.A O LYS 160.A HZ2 3.301 2.534 HIS 161.A N CYS 157.A O HIS 161.A H 2.895 2.038 HIS 161.A ND1 GLN 145.A O HIS 161.A HD1 3.021 2.424 HIS 161.A ND1 CYS 157.A O HIS 161.A HD1 2.946 2.276 GLY 162.A N ALA 158.A O GLY 162.A H 2.876 2.038 LEU 163.A N ALA 159.A O LEU 163.A H 2.795 2.058 ILE 164.A N LYS 160.A O ILE 164.A H 3.143 2.349 GLY 165.A N HIS 161.A O GLY 165.A H 3.009 2.191 PHE 166.A N GLY 162.A O PHE 166.A H 2.890 2.067 THR 167.A N LEU 163.A O THR 167.A H 2.965 2.142 THR 167.A OG1 LEU 163.A O THR 167.A HG1 2.726 1.941 LYS 168.A N ILE 164.A O LYS 168.A H 3.098 2.303 VAL 169.A N GLY 165.A O VAL 169.A H 3.187 2.388 VAL 170.A N PHE 166.A O VAL 170.A H 3.002 2.159 ALA 171.A N THR 167.A O ALA 171.A H 3.017 2.172 LEU 172.A N LYS 168.A O LEU 172.A H 2.958 2.154 GLU 173.A N VAL 169.A O GLU 173.A H 2.901 2.090 THR 174.A N VAL 170.A O THR 174.A H 3.132 2.494 THR 174.A N ALA 171.A O THR 174.A H 3.358 2.629 THR 174.A OG1 VAL 170.A O THR 174.A HG1 2.792 1.978 ALA 175.A N LEU 172.A O ALA 175.A H 3.436 2.595 THR 177.A N THR 174.A O THR 177.A H 2.942 2.122 THR 177.A OG1 THR 174.A O THR 177.A HG1 2.751 1.922 ILE 179.A N THR 177.A OG1 ILE 179.A H 2.978 2.133 THR 180.A N GLY 136.A O THR 180.A H 3.111 2.307 ASN 182.A N ILE 138.A O ASN 182.A H 3.088 2.319 ASN 182.A ND2 ILE 248.A O ASN 182.A HD21 2.960 2.113 ALA 183.A N THR 251.A O ALA 183.A H 2.868 2.019 ILE 184.A N ASN 140.A O ILE 184.A H 2.870 2.097 CYS 185.A N ILE 253.A O CYS 185.A H 2.864 2.022 GLY 187.A N VAL 255.A O GLY 187.A H 2.857 2.036 TYR 188.A N GLN 222.A OE1 TYR 188.A H 2.834 2.057 VAL 194.A N THR 191.A O VAL 194.A H 2.943 2.312 GLU 195.A N THR 191.A O GLU 195.A H 2.784 1.953 GLU 196.A N PRO 192.A O GLU 196.A H 3.014 2.171 GLN 197.A N VAL 194.A O GLN 197.A H 2.979 2.391 GLN 197.A NE2 LEU 193.A O GLN 197.A HE21 3.084 2.255 ILE 198.A N VAL 194.A O ILE 198.A H 2.981 2.171 LYS 199.A N GLU 195.A O LYS 199.A H 2.863 2.020 LYS 199.A NZ GLU 196.A OE2 LYS 199.A HZ2 3.121 2.301 ALA 200.A N GLU 196.A O ALA 200.A H 3.180 2.359 VAL 201.A N GLN 197.A O VAL 201.A H 3.067 2.237 ALA 202.A N ILE 198.A O ALA 202.A H 2.754 1.939 GLU 203.A N LYS 199.A O GLU 203.A H 2.999 2.181 ALA 204.A N ALA 200.A O ALA 204.A H 2.966 2.193 LYS 205.A N VAL 201.A O LYS 205.A H 2.919 2.144 TYR 206.A N ALA 202.A O TYR 206.A H 2.965 2.157 GLY 208.A N ALA 202.A O GLY 208.A H 2.830 1.982 ASP 209.A N TYR 206.A O ASP 209.A H 2.970 2.147 ALA 212.A N ASP 209.A OD1 ALA 212.A H 3.033 2.190 ALA 213.A N ASP 209.A O ALA 213.A H 2.958 2.107 THR 214.A N MET 210.A O THR 214.A H 2.810 1.963 THR 214.A OG1 MET 210.A O THR 214.A HG1 2.758 2.032 GLN 215.A N GLU 211.A O GLN 215.A H 3.301 2.461 ALA 216.A N ALA 212.A O ALA 216.A H 3.005 2.166 PHE 217.A N ALA 213.A O PHE 217.A H 2.803 1.962 LEU 218.A N THR 214.A O LEU 218.A H 2.893 2.045 CYS 219.A N GLN 215.A O CYS 219.A H 2.850 2.010 GLU 220.A N ALA 216.A O GLU 220.A H 3.200 2.461 LYS 221.A N LEU 218.A O LYS 221.A H 3.172 2.342 GLN 222.A N LEU 218.A O GLN 222.A H 2.971 2.241 GLN 222.A NE2 TYR 188.A O GLN 222.A HE22 3.245 2.412 GLN 222.A NE2 ALA 226.A O GLN 222.A HE21 2.933 2.101 ALA 224.A N GLY 257.A O ALA 224.A H 3.023 2.360 LYS 225.A N GLN 222.A O LYS 225.A H 2.896 2.055 VAL 228.A N TYR 188.A O VAL 228.A H 2.917 2.139 THR 229.A N GLN 232.A OE1 THR 229.A H 3.006 2.185 GLN 232.A N THR 229.A OG1 GLN 232.A H 3.041 2.233 VAL 233.A N THR 229.A O VAL 233.A H 3.127 2.307 GLY 234.A N VAL 230.A O GLY 234.A H 2.948 2.106 ASP 235.A N GLU 231.A O ASP 235.A H 2.825 2.035 ALA 236.A N GLN 232.A O ALA 236.A H 3.040 2.236 ALA 237.A N VAL 233.A O ALA 237.A H 3.005 2.214 VAL 238.A N GLY 234.A O VAL 238.A H 2.964 2.140 PHE 239.A N ASP 235.A O PHE 239.A H 2.986 2.157 LEU 240.A N ALA 236.A O LEU 240.A H 2.987 2.150 ALA 241.A N ALA 237.A O ALA 241.A H 2.934 2.192 SER 242.A N PHE 239.A O SER 242.A H 3.080 2.258 SER 242.A OG VAL 238.A O SER 242.A HG 2.762 1.960 ALA 245.A N SER 242.A O ALA 245.A H 3.029 2.187 ASP 246.A N PRO 243.A O ASP 246.A H 3.081 2.242 ILE 248.A N ALA 245.A O ILE 248.A H 3.102 2.295 ARG 249.A NH1 THR 177.A O ARG 249.A HH12 3.097 2.381 ARG 249.A NH2 THR 177.A O ARG 249.A HH22 2.949 2.188 GLY 250.A N CYS 181.A O GLY 250.A H 2.915 2.105 THR 251.A N ASN 182.A OD1 THR 251.A H 2.920 2.062 ILE 253.A N ALA 183.A O ILE 253.A H 2.843 2.021 VAL 255.A N CYS 185.A O VAL 255.A H 2.960 2.136 GLY 258.A N ASP 256.A OD1 GLY 258.A H 2.954 2.160 TRP 259.A N ASP 256.A O TRP 259.A H 3.290 2.475 VAL 260.A N ASP 256.A OD2 VAL 260.A H 2.732 1.915