Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 9c5l_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 1.A N SER 4.A OG no hydrogen 2.981 N/A ARG 1.A NE MET 27.A O ARG 1.A HE 3.126 2.328 ARG 1.A NH1 TYR 53.A O ARG 1.A HH12 3.537 2.954 ARG 1.A NH2 ALA 26.A O ARG 1.A HH21 2.896 2.324 ARG 1.A NH2 MET 27.A O ARG 1.A HH21 3.279 2.535 ARG 1.A NH2 TYR 53.A O ARG 1.A HH22 2.787 2.005 LEU 3.A N ALA 28.A O LEU 3.A H 2.745 1.903 SER 4.A N ARG 1.A O SER 4.A H 2.947 2.095 ARG 6.A N LEU 3.A O ARG 6.A H 2.989 2.138 ARG 6.A NH1 GLU 85.A OE2 ARG 6.A HH11 2.939 2.134 VAL 7.A N GLU 85.A OE1 VAL 7.A H 2.964 2.196 ALA 8.A N ASP 31.A O ALA 8.A H 2.821 1.996 VAL 9.A N ILE 86.A O VAL 9.A H 2.872 2.059 VAL 10.A N VAL 33.A O VAL 10.A H 3.116 2.266 THR 11.A N VAL 88.A O THR 11.A H 3.068 2.232 GLY 12.A N ASN 35.A OD1 GLY 12.A H 2.977 2.132 SER 13.A N ASN 35.A O SER 13.A H 2.790 2.039 SER 13.A OG VAL 10.A O SER 13.A HG 2.687 2.015 LEU 19.A N SER 15.A O LEU 19.A H 3.189 2.346 GLY 20.A N GLY 16.A O GLY 20.A H 3.021 2.188 ILE 21.A N ILE 17.A O ILE 21.A H 2.868 2.045 ALA 22.A N GLY 18.A O ALA 22.A H 2.930 2.088 MET 23.A N.A LEU 19.A O MET 23.A H.A 2.884 2.042 MET 23.A N.B LEU 19.A O MET 23.A H.B 2.903 2.069 ARG 24.A N GLY 20.A O ARG 24.A H.B 2.991 2.174 ARG 24.A NE ASP 234.A OD1 ARG 24.A HE 2.841 2.009 ARG 24.A NH2 ASP 234.A OD1 ARG 24.A HH21 3.217 2.519 ARG 24.A NH2 ASP 234.A OD2 ARG 24.A HH21 3.486 2.823 LEU 25.A N ILE 21.A O LEU 25.A H 2.853 2.001 ALA 26.A N ALA 22.A O ALA 26.A H 2.945 2.109 MET 27.A N MET 23.A O.A MET 27.A H 2.860 2.039 MET 27.A N MET 23.A O.B MET 27.A H 2.874 2.055 ALA 28.A N ARG 24.A O ALA 28.A H 2.984 2.221 GLY 29.A N ALA 26.A O GLY 29.A H 2.894 2.058 ALA 30.A N LEU 25.A O ALA 30.A H 3.015 2.184 ASP 31.A N ARG 6.A O ASP 31.A H 2.880 2.170 VAL 32.A N ARG 56.A O VAL 32.A H 2.943 2.143 VAL 33.A N ALA 8.A O VAL 33.A H 2.825 2.003 LEU 34.A N ARG 58.A O LEU 34.A H 2.834 1.979 ASN 35.A N SER 13.A OG ASN 35.A H 2.953 2.201 ASN 35.A ND2 PHE 60.A O ASN 35.A HD22 3.021 2.211 ASN 35.A ND2 ALA 62.A O ASN 35.A HD21 3.171 2.317 ARG 37.A NH1 ARG 37.A O ARG 37.A HH11 3.255 2.412 SER 40.A N ASP 43.A OD2 SER 40.A H 2.895 2.060 SER 40.A OG ASP 43.A OD1 SER 40.A HG 2.869 2.033 GLU 42.A N SER 40.A OG GLU 42.A H 3.247 2.517 ASP 43.A N SER 40.A O ASP 43.A H 3.285 2.459 ILE 46.A N GLU 42.A O ILE 46.A H 3.134 2.322 VAL 47.A N ASP 43.A O VAL 47.A H 2.965 2.127 GLU 48.A N SER 44.A O GLU 48.A H 2.920 2.111 LYS 49.A N ALA 45.A O LYS 49.A H 2.941 2.142 VAL 50.A N ILE 46.A O VAL 50.A H 3.070 2.246 ALA 51.A N VAL 47.A O ALA 51.A H 2.816 2.011 GLY 54.A N ALA 51.A O GLY 54.A H 3.085 2.228 THR 55.A OG1 ALA 30.A O THR 55.A HG1 2.811 2.061 ARG 56.A N ASP 31.A OD1 ARG 56.A H 3.001 2.154 ARG 56.A NE ASP 31.A OD2 ARG 56.A HE 2.899 2.094 ARG 56.A NH2 ASP 31.A OD2 ARG 56.A HH21 2.995 2.241 ARG 56.A NH2 LEU 81.A O ARG 56.A HH22 2.909 2.131 ARG 58.A N VAL 32.A O ARG 58.A H 2.981 2.181 ARG 58.A NE GLU 80.A OE1 ARG 58.A HE 2.932 2.099 ARG 58.A NH1 VAL 57.A O ARG 58.A HH11 2.916 2.076 PHE 60.A N LEU 34.A O PHE 60.A H 2.918 2.120 ALA 62.A N GLY 36.A O ALA 62.A H 3.004 2.191 ASN 63.A N GLN 69.A OE1 ASN 63.A H 2.834 1.981 LYS 65.A N ASN 63.A OD1 LYS 65.A H 3.007 2.172 LYS 65.A NZ GLU 109.A OE2 LYS 65.A HZ3 2.599 1.887 ASP 66.A N ASN 63.A O ASP 66.A H 2.951 2.111 ARG 67.A NH2 GLN 123.A OE1 ARG 67.A HH21 2.840 2.008 ALA 68.A N ASP 66.A OD1 ALA 68.A H 3.030 2.305 GLN 69.A N ASP 66.A O GLN 69.A H 2.852 2.241 GLN 69.A NE2 ASP 66.A OD2 GLN 69.A HE21 3.110 2.269 VAL 70.A N ASP 66.A O VAL 70.A H 3.052 2.251 GLU 71.A N ARG 67.A O GLU 71.A H 2.952 2.123 ALA 72.A N ALA 68.A O ALA 72.A H 2.909 2.118 LEU 73.A N GLN 69.A O LEU 73.A H 2.900 2.095 ILE 74.A N VAL 70.A O ILE 74.A H 3.054 2.250 LYS 75.A N GLU 71.A O LYS 75.A H 2.910 2.069 PHE 76.A N ALA 72.A O PHE 76.A H 2.856 2.035 THR 77.A N LEU 73.A O THR 77.A H 3.039 2.220 THR 77.A OG1 LEU 73.A O THR 77.A HG1 3.031 2.207 GLU 78.A N ILE 74.A O GLU 78.A H 2.948 2.121 LYS 79.A N LYS 75.A O LYS 79.A H 2.945 2.169 GLU 80.A N PHE 76.A O GLU 80.A H 2.906 2.104 LEU 81.A N THR 77.A O LEU 81.A H 2.874 2.018 GLY 82.A N THR 77.A O GLY 82.A H 3.025 2.193 GLU 85.A N VAL 7.A O GLU 85.A H 2.932 2.125 ILE 86.A N VAL 7.A O ILE 86.A H 2.976 2.150 LEU 87.A N ARG 136.A O LEU 87.A H 2.845 1.999 VAL 88.A N VAL 9.A O VAL 88.A H 2.858 2.002 ASN 89.A N ILE 138.A O ASN 89.A H 2.912 2.164 ASN 89.A ND2 THR 122.A OG1 ASN 89.A HD21 3.410 2.737 ASN 89.A ND2 ASN 139.A OD1 ASN 89.A HD22 2.895 2.048 ASN 90.A N THR 11.A OG1 ASN 90.A H 2.856 2.004 ASN 90.A ND2 THR 11.A O ASN 90.A HD21 3.205 2.418 ALA 91.A N THR 11.A OG1 ALA 91.A H 3.036 2.182 ILE 93.A N ASN 114.A OD1 ILE 93.A H 3.118 2.337 HIS 95.A N GLN 94.A OE1 HIS 95.A H 2.925 2.244 SER 97.A N ASN 151.A O SER 97.A H 2.931 2.110 GLU 100.A N GLU 100.A OE1 GLU 100.A H 2.749 1.970 PHE 102.A N VAL 99.A O PHE 102.A H 3.245 2.401 TRP 107.A N PRO 103.A O TRP 107.A H 3.015 2.170 ASP 108.A N SER 104.A O ASP 108.A H 2.960 2.120 GLU 109.A N ASP 105.A O GLU 109.A H 2.918 2.120 ILE 110.A N LYS 106.A O ILE 110.A H 2.954 2.121 ILE 111.A N TRP 107.A O ILE 111.A H 3.007 2.171 ALA 112.A N ASP 108.A O ALA 112.A H 2.859 2.047 LEU 113.A N GLU 109.A O LEU 113.A H 2.911 2.094 ASN 114.A N ILE 110.A O ASN 114.A H 2.873 2.041 ASN 114.A ND2 ILE 93.A O ASN 114.A HD21 2.889 2.046 LEU 115.A N ILE 111.A O LEU 115.A H 3.088 2.314 THR 116.A N ILE 111.A O THR 116.A H 3.049 2.219 SER 117.A N.A ALA 112.A O SER 117.A H.A 2.879 2.202 SER 117.A N.B ALA 112.A O SER 117.A H.B 2.878 2.201 SER 117.A OG.A LEU 113.A O SER 117.A HG.A 2.440 1.912 SER 117.A OG.B MET 64.A O SER 117.A HG.B 2.665 2.041 ALA 118.A N LEU 115.A O ALA 118.A H.B 3.138 2.531 PHE 119.A N LEU 115.A O PHE 119.A H 3.355 2.556 HIS 120.A N THR 116.A O HIS 120.A H 3.005 2.199 ALA 121.A N SER 117.A O.A ALA 121.A H 2.930 2.079 ALA 121.A N SER 117.A O.B ALA 121.A H 2.934 2.083 THR 122.A N ALA 118.A O THR 122.A H 2.896 2.050 THR 122.A OG1 ALA 118.A O THR 122.A HG1 2.738 2.014 GLN 123.A N PHE 119.A O GLN 123.A H 2.878 2.028 LEU 124.A N HIS 120.A O LEU 124.A H 2.998 2.197 CYS 125.A N ALA 121.A O CYS 125.A H 2.993 2.291 CYS 125.A N THR 122.A O CYS 125.A H 3.164 2.528 LEU 126.A N THR 122.A O LEU 126.A H 2.938 2.216 MET 129.A N CYS 125.A O MET 129.A H 3.389 2.542 ARG 130.A N LEU 126.A O ARG 130.A H 2.879 2.039 ARG 130.A NH2 GLU 172.A O ARG 130.A HH22 2.971 2.150 GLN 131.A N PRO 127.A O GLN 131.A H 2.919 2.098 ARG 132.A N SER 128.A O ARG 132.A H 2.950 2.157 GLY 133.A N MET 129.A O GLY 133.A H 2.790 2.179 GLY 133.A N ARG 130.A O GLY 133.A H 3.293 2.599 TRP 134.A N MET 129.A O TRP 134.A H 3.211 2.511 GLY 135.A N GLY 177.A O GLY 135.A H 3.152 2.386 ARG 136.A N GLU 85.A O ARG 136.A H 2.960 2.156 ARG 136.A NE LEU 239.A O ARG 136.A HE 2.828 2.116 ARG 136.A NH1 GLY 135.A O ARG 136.A HH11 3.171 2.333 ARG 136.A NH2 SER 241.A O ARG 136.A HH21 3.067 2.261 ARG 136.A NH2 ASP 245.A OD1 ARG 136.A HH22 2.786 1.986 ILE 137.A N THR 179.A O ILE 137.A H 2.904 2.065 ILE 138.A N LEU 87.A O ILE 138.A H 2.864 2.022 ASN 139.A N ASN 181.A O ASN 139.A H 2.908 2.062 ASN 139.A ND2 THR 166.A OG1 ASN 139.A HD22 2.869 2.034 ILE 140.A N ASN 89.A O ILE 140.A H 2.908 2.047 ALA 141.A N ILE 183.A O ALA 141.A H 2.843 2.140 VAL 143.A N PRO 185.A O VAL 143.A H 3.000 2.163 GLN 144.A N SER 142.A OG GLN 144.A H 2.926 2.079 GLY 145.A N SER 142.A O GLY 145.A H 2.884 2.052 LEU 146.A N VAL 143.A O LEU 146.A H 2.838 1.995 VAL 147.A N VAL 143.A O VAL 147.A H 3.019 2.269 SER 149.A OG GLN 144.A OE1 SER 149.A HG 2.765 2.248 LYS 152.A NZ GLN 196.A OE1 LYS 152.A HZ1 2.901 2.068 CYS 156.A N LYS 152.A O CYS 156.A H 2.836 1.976 ALA 157.A N SER 153.A O ALA 157.A H 2.947 2.115 ALA 158.A N ALA 154.A O ALA 158.A H 2.879 2.061 LYS 159.A N TYR 155.A O LYS 159.A H 2.877 2.056 LYS 159.A NZ ILE 140.A O LYS 159.A HZ2 2.963 2.161 HIS 160.A N CYS 156.A O HIS 160.A H 2.929 2.071 HIS 160.A ND1 CYS 156.A O HIS 160.A HD1 2.881 2.157 GLY 161.A N ALA 157.A O GLY 161.A H 2.917 2.087 LEU 162.A N ALA 158.A O LEU 162.A H 2.864 2.104 ILE 163.A N LYS 159.A O ILE 163.A H 3.114 2.326 GLY 164.A N HIS 160.A O GLY 164.A H 3.000 2.180 PHE 165.A N GLY 161.A O PHE 165.A H 2.894 2.050 THR 166.A N LEU 162.A O THR 166.A H 2.934 2.128 THR 166.A OG1 LEU 162.A O THR 166.A HG1 2.763 1.952 LYS 167.A N ILE 163.A O LYS 167.A H 3.083 2.263 VAL 168.A N GLY 164.A O VAL 168.A H 3.177 2.371 VAL 169.A N PHE 165.A O VAL 169.A H 2.963 2.115 ALA 170.A N THR 166.A O ALA 170.A H 2.986 2.136 LEU 171.A N LYS 167.A O LEU 171.A H 2.975 2.164 GLU 172.A N VAL 168.A O GLU 172.A H 2.923 2.122 THR 173.A N VAL 169.A O THR 173.A H 3.151 2.551 THR 173.A N ALA 170.A O THR 173.A H 3.337 2.589 THR 173.A OG1 VAL 169.A O THR 173.A HG1 2.767 1.941 ALA 174.A N LEU 171.A O ALA 174.A H 3.458 2.607 THR 176.A N THR 173.A O THR 176.A H 2.909 2.065 THR 176.A OG1 THR 173.A O THR 176.A HG1 2.786 1.949 ILE 178.A N THR 176.A OG1 ILE 178.A H 2.966 2.122 THR 179.A N GLY 135.A O THR 179.A H 3.096 2.291 ASN 181.A N ILE 137.A O ASN 181.A H 3.068 2.272 ASN 181.A ND2 ILE 247.A O ASN 181.A HD21 2.898 2.054 ALA 182.A N THR 250.A O ALA 182.A H 2.907 2.060 ILE 183.A N ASN 139.A O ILE 183.A H 2.898 2.120 CYS 184.A N ILE 252.A O CYS 184.A H 2.837 1.999 GLY 186.A N VAL 254.A O GLY 186.A H 2.919 2.110 TYR 187.A N GLN 221.A OE1 TYR 187.A H 2.818 2.012 THR 190.A N VAL 188.A O THR 190.A H 2.814 2.124 VAL 193.A N THR 190.A O VAL 193.A H 3.063 2.401 GLU 194.A N THR 190.A O GLU 194.A H 2.693 1.833 GLU 195.A N PRO 191.A O GLU 195.A H 2.957 2.118 GLN 196.A NE2 LEU 192.A O GLN 196.A HE21 3.280 2.478 ILE 197.A N VAL 193.A O ILE 197.A H 2.922 2.111 LYS 198.A N GLU 194.A O LYS 198.A H 2.843 2.003 ALA 199.A N GLU 195.A O ALA 199.A H 2.965 2.142 VAL 200.A N GLN 196.A O VAL 200.A H 2.978 2.141 ALA 201.A N ILE 197.A O ALA 201.A H 2.760 1.941 GLU 202.A N LYS 198.A O GLU 202.A H 2.949 2.115 ALA 203.A N ALA 199.A O ALA 203.A H 2.930 2.147 LYS 204.A N VAL 200.A O LYS 204.A H 2.862 2.080 TYR 205.A N ALA 201.A O TYR 205.A H 2.966 2.197 GLY 207.A N ALA 201.A O GLY 207.A H 2.846 1.997 ASP 208.A N TYR 205.A O ASP 208.A H 2.916 2.071 ALA 211.A N ASP 208.A OD1 ALA 211.A H 3.077 2.244 ALA 212.A N ASP 208.A O ALA 212.A H 3.003 2.154 THR 213.A N MET 209.A O THR 213.A H 2.880 2.054 THR 213.A OG1 MET 209.A O THR 213.A HG1 2.660 1.865 GLN 214.A N GLU 210.A O GLN 214.A H 2.995 2.155 ALA 215.A N ALA 211.A O ALA 215.A H 2.976 2.134 PHE 216.A N ALA 212.A O PHE 216.A H 2.864 2.036 LEU 217.A N THR 213.A O LEU 217.A H 2.939 2.082 CYS 218.A N GLN 214.A O CYS 218.A H 2.833 1.983 GLU 219.A N ALA 215.A O GLU 219.A H 3.131 2.378 LYS 220.A N LEU 217.A O LYS 220.A H 3.082 2.297 GLN 221.A N LEU 217.A O GLN 221.A H 2.803 1.985 GLN 221.A NE2 TYR 187.A O GLN 221.A HE22 3.193 2.348 GLN 221.A NE2 ALA 225.A O GLN 221.A HE21 2.923 2.100 ALA 223.A N GLY 256.A O ALA 223.A H 2.987 2.288 LYS 224.A N GLN 221.A O LYS 224.A H 2.846 2.006 VAL 227.A N TYR 187.A O VAL 227.A H 2.936 2.172 THR 228.A N GLN 231.A OE1 THR 228.A H 2.986 2.164 GLU 230.A N GLU 230.A OE1 GLU 230.A H 2.893 2.118 GLN 231.A N THR 228.A OG1 GLN 231.A H 3.067 2.244 VAL 232.A N THR 228.A O VAL 232.A H 3.161 2.343 GLY 233.A N VAL 229.A O GLY 233.A H 2.933 2.097 ASP 234.A N GLU 230.A O ASP 234.A H 2.868 2.085 ALA 235.A N GLN 231.A O ALA 235.A H 3.054 2.255 ALA 236.A N VAL 232.A O ALA 236.A H 3.034 2.240 VAL 237.A N GLY 233.A O VAL 237.A H 2.858 2.047 PHE 238.A N ASP 234.A O PHE 238.A H 2.961 2.125 LEU 239.A N ALA 235.A O LEU 239.A H 2.975 2.143 ALA 240.A N ALA 236.A O ALA 240.A H 2.941 2.199 ALA 240.A N VAL 237.A O ALA 240.A H 3.148 2.563 SER 241.A N PHE 238.A O SER 241.A H 3.171 2.337 SER 241.A OG VAL 237.A O SER 241.A HG 2.625 1.827 ALA 244.A N SER 241.A O ALA 244.A H 3.114 2.275 ASP 245.A N PRO 242.A O ASP 245.A H 3.046 2.235 ILE 247.A N ALA 244.A O ILE 247.A H 3.064 2.254 ARG 248.A NH1 THR 176.A O ARG 248.A HH12 3.013 2.296 ARG 248.A NH2 THR 176.A O ARG 248.A HH22 2.910 2.164 GLY 249.A N CYS 180.A O GLY 249.A H 2.839 2.016 THR 250.A N ASN 181.A OD1 THR 250.A H 3.044 2.186 ILE 252.A N ALA 182.A O ILE 252.A H 2.833 2.018 VAL 254.A N CYS 184.A O VAL 254.A H 2.988 2.198 GLY 257.A N ASP 255.A OD1 GLY 257.A H 2.936 2.165 TRP 258.A N ASP 255.A O TRP 258.A H 3.208 2.386 VAL 259.A N ASP 255.A OD2 VAL 259.A H 2.834 2.008 ALA 260.A N GLY 257.A O ALA 260.A H 3.096 2.482