Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 9gud_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 5.A N SER 2.A O TRP 5.A H 2.975 2.147 GLN 6.A N GLN 3.A O GLN 6.A H 3.029 2.238 VAL 9.A N VAL 194.A O VAL 9.A H 2.839 2.040 MET 11.A N ALA 192.A O MET 11.A H 2.910 2.164 TYR 15.A N PRO 12.A O TYR 15.A H 3.003 2.316 LYS 16.A NZ ASN 13.A OD1 LYS 16.A HZ2 2.811 1.938 MET 17.A N LEU 14.A O MET 17.A H 3.246 2.482 GLN 18.A N TYR 15.A O GLN 18.A H 3.441 2.589 GLN 18.A NE2 LEU 14.A O GLN 18.A HE21 2.817 1.978 ARG 19.A NH1.A GLN 18.A O ARG 19.A HH11.A 2.995 2.230 MET 20.A N ASN 227.A OD1 MET 20.A H.B 3.095 2.236 CYS 25.A N GLU 173.A OE2 CYS 25.A H 2.841 2.015 ASP 26.A N ASN 233.A OD1 ASP 26.A H 2.641 1.815 ASN 29.A ND2 ILE 237.A O ASN 29.A HD21 2.665 2.011 TYR 30.A N LEU 27.A O TYR 30.A H 3.227 2.394 ASP 32.A N ASN 29.A O ASP 32.A H 3.180 2.373 ILE 40.A N PRO 37.A O ILE 40.A H 3.078 2.285 ALA 45.A N MET 41.A O ALA 45.A H 3.125 2.273 LYS 46.A N MET 42.A O LYS 46.A H 2.690 1.877 LYS 46.A NZ GLU 203.A OE1 LYS 46.A HZ3 2.779 1.898 LYS 46.A NZ GLU 203.A OE2 LYS 46.A HZ3 3.258 2.579 TYR 47.A N ASN 43.A O TYR 47.A H 2.945 2.085 THR 48.A N VAL 44.A O THR 48.A H 2.880 2.068 THR 48.A OG1 VAL 44.A O THR 48.A HG1 2.675 1.922 GLN 49.A N ALA 45.A O GLN 49.A H 3.121 2.290 GLN 49.A NE2 SER 240.A O GLN 49.A HE22 3.370 2.543 GLN 49.A NE2 SER 243.A OG GLN 49.A HE21 3.050 2.252 LEU 50.A N LYS 46.A O LEU 50.A H 2.970 2.143 CYS 51.A N TYR 47.A O CYS 51.A H 2.918 2.087 GLN 52.A N THR 48.A O GLN 52.A H 2.872 2.060 GLN 52.A NE2 SER 243.A O GLN 52.A HE22 2.883 2.036 TYR 53.A N GLN 49.A O TYR 53.A H 2.979 2.161 LEU 54.A N LEU 50.A O LEU 54.A H 2.914 2.088 ASN 55.A N CYS 51.A O ASN 55.A H 2.959 2.278 ASN 55.A N GLN 52.A O ASN 55.A H 3.299 2.626 ASN 55.A ND2 PHE 250.A O ASN 55.A HD21 2.834 2.022 THR 56.A N TYR 53.A O THR 56.A H 2.900 2.063 THR 56.A OG1 TYR 53.A O THR 56.A HG1 2.680 1.840 LEU 57.A N LEU 54.A O LEU 57.A H 3.213 2.360 THR 58.A OG1 ASN 210.A OD1 THR 58.A HG1 2.782 2.110 ARG 66.A N ASP 125.A OD2 ARG 66.A H 2.962 2.182 ARG 66.A NH1 LYS 123.A O ARG 66.A HH11 3.171 2.339 VAL 67.A N LEU 94.A O VAL 67.A H 2.872 2.052 ILE 68.A N LEU 126.A O ILE 68.A H 3.125 2.320 HIS 69.A N VAL 96.A O HIS 69.A H 2.721 2.058 HIS 69.A ND1 THR 82.A OG1 HIS 69.A HD1 2.847 2.102 HIS 69.A NE2 TYR 47.A OH no hydrogen 2.673 N/A PHE 70.A N ILE 128.A O PHE 70.A H 2.708 1.922 ALA 72.A N SER 98.A O ALA 72.A H 2.899 2.066 GLY 73.A N ASP 99.A OD2 GLY 73.A H 2.643 1.869 SER 74.A N VAL 78.A O SER 74.A H 3.020 2.199 SER 74.A OG VAL 78.A O SER 74.A HG 3.078 2.291 LYS 76.A N SER 74.A OG LYS 76.A H 3.021 2.256 GLY 77.A N SER 74.A O GLY 77.A H 3.200 2.345 THR 82.A OG1 ASP 97.A OD2 THR 82.A HG1 3.003 2.171 ALA 83.A N ALA 79.A O ALA 83.A H 3.156 2.357 VAL 84.A N PRO 80.A O VAL 84.A H 3.148 2.368 LEU 85.A N GLY 81.A O LEU 85.A H 2.935 2.093 ARG 86.A N THR 82.A O ARG 86.A H 2.927 2.088 ARG 86.A NH1 ASP 108.A OD1 ARG 86.A HH12 3.275 2.629 ARG 86.A NH1 ASP 108.A OD2 ARG 86.A HH12 3.161 2.314 ARG 86.A NH2 ASP 108.A OD1 ARG 86.A HH22 2.818 2.036 GLN 87.A N ALA 83.A O GLN 87.A H 3.064 2.237 TRP 88.A N VAL 84.A O TRP 88.A H 2.741 1.942 TRP 88.A NE1 ASN 55.A OD1 TRP 88.A HE1 2.834 1.981 LEU 89.A N LEU 85.A O LEU 89.A H 2.686 1.842 THR 93.A N PRO 90.A O THR 93.A H 3.052 2.223 THR 93.A OG1 PRO 90.A O THR 93.A HG1 2.713 1.979 LEU 94.A N MET 65.A O LEU 94.A H 2.932 2.202 LEU 95.A N ASP 108.A OD2 LEU 95.A H 2.813 2.001 VAL 96.A N VAL 67.A O VAL 96.A H 2.951 2.121 ASP 97.A N SER 109.A O ASP 97.A H 3.114 2.309 SER 98.A N HIS 69.A O SER 98.A H 2.926 2.279 SER 98.A OG LEU 111.A O SER 98.A HG 2.822 2.077 ASP 99.A N LEU 111.A O ASP 99.A H 3.265 2.518 LEU 100.A N ASP 99.A OD1 LEU 100.A H 2.501 1.815 VAL 104.A N GLY 77.A O VAL 104.A H 2.891 2.059 SER 105.A OG ASP 97.A OD2 SER 105.A HG 2.491 1.802 ALA 107.A N SER 105.A OG ALA 107.A H 2.841 1.982 ASP 108.A N LEU 95.A O ASP 108.A H 2.781 2.142 THR 110.A OG1 ASP 97.A OD1 THR 110.A HG1 2.644 1.825 LEU 111.A N ASP 97.A O LEU 111.A H 3.032 2.224 GLY 113.A N ASP 99.A O GLY 113.A H 2.838 2.022 ALA 116.A N ASP 114.A OD2 ALA 116.A H 2.952 2.122 THR 117.A N ASP 114.A O THR 117.A H 2.811 1.979 THR 117.A OG1 ASP 114.A O THR 117.A HG1 2.619 1.781 VAL 118.A N CYS 115.A O VAL 118.A H 3.076 2.227 HIS 119.A N SER 291.A O HIS 119.A H 2.983 2.141 HIS 119.A NE2 ASP 293.A OD2 HIS 119.A HE2 2.748 2.118 ALA 121.A N VAL 289.A O ALA 121.A H 2.987 2.161 ASN 122.A ND2 LYS 123.A O ASN 122.A HD21 3.127 2.271 TRP 124.A N LYS 160.A O.A TRP 124.A H 2.842 2.152 TRP 124.A N LYS 160.A O.B TRP 124.A H 2.844 2.154 ASP 125.A N ARG 66.A O ASP 125.A H 2.899 2.111 ILE 127.A N SER 166.A O ILE 127.A H 3.050 2.258 ILE 128.A N ILE 68.A O ILE 128.A H 2.944 2.098 SER 129.A N ALA 168.A O SER 129.A H 2.992 2.164 ASP 130.A N PHE 70.A O ASP 130.A H 2.996 2.167 LYS 135.A N ASP 133.A OD1 LYS 135.A H 3.019 2.170 THR 136.A N ASP 133.A O THR 136.A H 3.019 2.182 THR 136.A OG1 ASP 133.A O THR 136.A HG1 2.904 2.104 LYS 137.A N PRO 134.A O LYS 137.A H 3.174 2.319 THR 140.A N ASN 138.A OD1 THR 140.A H 2.899 2.138 THR 140.A OG1 ASN 138.A OD1 THR 140.A HG1 2.633 1.793 ASN 143.A ND2 GLU 173.A O ASN 143.A HD21 2.973 2.157 LYS 146.A N TRP 176.A O LYS 146.A H 2.918 2.083 LYS 146.A NZ ASP 144.A O LYS 146.A HZ2 2.713 1.903 LYS 146.A NZ HIS 174.A O LYS 146.A HZ3 2.730 1.977 PHE 150.A N GLU 147.A O PHE 150.A H 2.818 2.072 THR 151.A N GLY 148.A O THR 151.A H 3.175 2.539 ILE 153.A N PHE 149.A O ILE 153.A H 2.971 2.159 CYS 154.A N PHE 150.A O CYS 154.A H 2.935 2.101 GLY 155.A N THR 151.A O GLY 155.A H 3.203 2.353 PHE 156.A N TYR 152.A O PHE 156.A H 2.740 1.900 ILE 157.A N ILE 153.A O ILE 157.A H 2.938 2.134 GLN 158.A N CYS 154.A O GLN 158.A H 3.190 2.351 GLN 159.A N GLY 155.A O GLN 159.A H 2.924 2.192 LYS 160.A N.A PHE 156.A O LYS 160.A H.A 2.747 1.969 LYS 160.A N.B PHE 156.A O LYS 160.A H.B 2.747 1.968 LYS 160.A NZ.A THR 120.A O LYS 160.A HZ2.A 2.860 2.089 LYS 160.A NZ.B THR 120.A O LYS 160.A HZ3.B 3.075 2.197 LEU 161.A N ILE 157.A O LEU 161.A H.A 3.116 2.359 ALA 162.A N TRP 124.A O ALA 162.A H 2.871 2.038 GLY 164.A N TYR 211.A O GLY 164.A H 2.671 1.831 GLY 165.A N ALA 162.A O GLY 165.A H 2.865 2.032 SER 166.A N ASP 125.A O SER 166.A H 3.167 2.384 VAL 167.A N GLY 208.A O VAL 167.A H 2.985 2.194 ALA 168.A N ILE 127.A O ALA 168.A H 2.917 2.126 ILE 169.A N LEU 206.A O.A ILE 169.A H 2.845 2.021 ILE 169.A N LEU 206.A O.B ILE 169.A H 3.090 2.271 LYS 170.A N SER 129.A O LYS 170.A H 2.871 2.083 ILE 171.A N ALA 204.A O ILE 171.A H 2.746 1.896 THR 172.A N SER 175.A O THR 172.A H 2.826 2.011 SER 175.A N THR 172.A OG1 SER 175.A H 2.885 2.070 TRP 176.A NE1 ASN 143.A OD1 TRP 176.A HE1 2.966 2.134 ASN 177.A ND2 LYS 146.A O ASN 177.A HD22 2.639 1.780 ALA 178.A N SER 145.A OG ALA 178.A H 2.965 2.141 LEU 180.A N ASN 177.A OD1 LEU 180.A H 2.839 2.105 TYR 181.A N ASN 177.A O TYR 181.A H 3.385 2.552 LYS 182.A N ALA 178.A O LYS 182.A H 2.965 2.125 LEU 183.A N ASP 179.A O LEU 183.A H 2.724 1.975 MET 184.A N LEU 180.A O MET 184.A H 3.029 2.334 MET 184.A N TYR 181.A O MET 184.A H 3.001 2.353 GLY 185.A N LYS 182.A O GLY 185.A H 3.069 2.325 HIS 186.A N LEU 183.A O HIS 186.A H 2.801 1.958 PHE 187.A N MET 184.A O PHE 187.A H 3.152 2.321 ALA 188.A N ASN 210.A O ALA 188.A H 2.898 2.081 TRP 189.A N CYS 209.A O TRP 189.A H 3.323 2.617 THR 191.A N ILE 207.A O THR 191.A H 3.052 2.302 THR 191.A OG1 MET 11.A O THR 191.A HG1 3.522 2.907 PHE 193.A N PHE 205.A O PHE 193.A H 2.986 2.140 VAL 194.A N VAL 9.A O VAL 194.A H 2.845 1.995 ASN 196.A N PRO 7.A O ASN 196.A H 3.023 2.173 ASN 196.A ND2 GLN 3.A O ASN 196.A HD21 2.970 2.220 ASN 196.A ND2 GLN 6.A O ASN 196.A HD22 2.558 1.946 VAL 197.A N GLN 49.A OE1 VAL 197.A H 2.980 2.189 ASN 198.A N THR 195.A O ASN 198.A H 3.269 2.572 ASN 198.A ND2 GLU 203.A OE2 ASN 198.A HD22 2.983 2.152 SER 200.A OG ASP 32.A O SER 200.A HG 2.854 2.043 SER 201.A N ASN 198.A O SER 201.A H 3.087 2.262 GLU 203.A N SER 201.A OG GLU 203.A H 2.970 2.117 ALA 204.A N ILE 171.A O ALA 204.A H 2.925 2.121 PHE 205.A N PHE 193.A O PHE 205.A H 2.803 1.972 LEU 206.A N.A ILE 169.A O LEU 206.A H.A 2.688 1.935 LEU 206.A N.B ILE 169.A O LEU 206.A H.B 2.664 1.833 ILE 207.A N THR 191.A O ILE 207.A H.A 2.875 2.024 GLY 208.A N VAL 167.A O GLY 208.A H 3.019 2.300 CYS 209.A N TRP 189.A O CYS 209.A H 2.775 1.922 CYS 209.A SG ASN 210.A OD1 CYS 209.A HG 3.406 2.266 ASN 210.A N SER 166.A OG ASN 210.A H 3.079 2.260 ASN 210.A ND2 THR 58.A O ASN 210.A HD21 2.790 1.973 ASN 210.A ND2 GLY 164.A O ASN 210.A HD22 3.281 2.425 TYR 211.A N GLY 165.A O TYR 211.A H 2.699 2.072 LEU 212.A N HIS 186.A O LEU 212.A H 2.929 2.091 ARG 216.A N GLY 185.A O ARG 216.A H 2.850 2.096 ARG 216.A NE PHE 187.A O ARG 216.A HE 3.114 2.285 GLU 217.A N GLY 185.A O GLU 217.A H 3.265 2.452 VAL 223.A N ASP 220.A OD1 VAL 223.A H 3.173 2.351 MET 224.A N ASP 220.A O MET 224.A H 2.938 2.150 HIS 225.A N GLY 221.A O HIS 225.A H 3.047 2.207 HIS 225.A NE2 GLU 173.A O HIS 225.A HE2 2.750 1.933 ALA 226.A N TYR 222.A O ALA 226.A H 3.281 2.446 ASN 227.A N VAL 223.A O ASN 227.A H 2.712 1.897 ASN 227.A ND2 LYS 16.A O ASN 227.A HD22 3.227 2.707 ASN 227.A ND2 GLN 18.A O ASN 227.A HD21 2.759 1.956 TYR 228.A N MET 224.A O TYR 228.A H 2.807 2.041 TYR 228.A OH SER 202.A O TYR 228.A HH 2.551 1.760 ILE 229.A N HIS 225.A O ILE 229.A H 2.885 2.056 PHE 230.A N ALA 226.A O PHE 230.A H 2.919 2.092 TRP 231.A N ASN 227.A O TRP 231.A H 2.980 2.138 ARG 232.A N TYR 228.A O ARG 232.A H 2.929 2.079 ARG 232.A NH1 SER 201.A O ARG 232.A HH12 2.947 2.135 ARG 232.A NH1 TYR 228.A OH ARG 232.A HH11 3.096 2.309 ARG 232.A NH2 SER 201.A O ARG 232.A HH22 3.251 2.538 ASN 233.A N ILE 229.A O ASN 233.A H 2.694 1.918 ASN 233.A ND2 LYS 24.A O ASN 233.A HD21 2.911 2.125 THR 234.A N PHE 230.A O THR 234.A H 3.052 2.354 THR 234.A N TRP 231.A O THR 234.A H 3.239 2.529 THR 234.A OG1 PHE 230.A O THR 234.A HG1 2.948 2.144 THR 234.A OG1 TRP 231.A O THR 234.A HG1 3.565 3.010 ASN 235.A ND2 TYR 15.A OH ASN 235.A HD21 2.708 1.862 ASN 235.A ND2 TRP 231.A O ASN 235.A HD22 3.141 2.330 SER 240.A N ASN 196.A O SER 240.A H 3.009 2.202 SER 240.A OG ALA 4.A O SER 240.A HG 2.438 1.662 SER 241.A OG.A THR 35.A O.A SER 241.A HG.A 2.777 1.990 SER 241.A OG.A THR 35.A O.B SER 241.A HG.A 2.700 1.921 SER 241.A OG.B THR 35.A O.A SER 241.A HG.B 3.136 2.456 SER 241.A OG.B THR 35.A O.B SER 241.A HG.B 3.010 2.327 TYR 242.A N SER 240.A OG TYR 242.A H.A 3.192 2.333 SER 243.A OG GLN 52.A OE1 SER 243.A HG 2.924 2.408 LEU 244.A N SER 241.A O.A LEU 244.A H 3.088 2.290 LEU 244.A N SER 241.A O.B LEU 244.A H 3.073 2.275 PHE 245.A N TYR 242.A O PHE 245.A H 3.172 2.313 ASP 246.A N SER 243.A O ASP 246.A H 3.435 2.605 SER 248.A N ASP 246.A OD1 SER 248.A H 3.464 2.611 SER 248.A OG ASP 246.A OD1 SER 248.A HG 2.958 2.174 LYS 249.A NZ SER 248.A OG LYS 249.A HZ3 3.177 2.476 PHE 250.A N MET 247.A O PHE 250.A H 3.174 2.354 LEU 252.A N TRP 88.A O LEU 252.A H 2.939 2.090 LYS 253.A NZ LYS 249.A O LYS 253.A HZ1 3.413 2.793 LYS 253.A NZ PRO 251.A O LYS 253.A HZ2 3.331 2.458 THR 257.A N VAL 61.A O THR 257.A H 3.210 2.473 MET 260.A N ILE 281.A O MET 260.A H 2.982 2.169 LYS 263.A N GLN 266.A OE1 LYS 263.A H 3.244 2.567 LYS 263.A NZ SER 261.A O LYS 263.A HZ2 3.535 2.660 GLN 266.A N LYS 263.A O GLN 266.A H 2.571 1.774 ILE 267.A N GLU 264.A O ILE 267.A H 3.448 2.608 ILE 271.A N ASN 268.A OD1 ILE 271.A H 2.663 1.863 LEU 272.A N ASN 268.A O LEU 272.A H 2.902 2.043 SER 273.A N ASP 269.A O SER 273.A H 2.709 1.927 LEU 274.A N MET 270.A O LEU 274.A H 3.028 2.218 LEU 275.A N ILE 271.A O LEU 275.A H 2.770 1.928 SER 276.A N.A LEU 272.A O SER 276.A H.A 2.962 2.164 SER 276.A N.B LEU 272.A O SER 276.A H.B 2.966 2.172 SER 276.A OG.A LEU 272.A O SER 276.A HG.A 3.031 2.333 SER 276.A OG.B LEU 272.A O SER 276.A HG.B 3.311 2.725 SER 276.A OG.B SER 273.A O SER 276.A HG.B 2.616 1.935 LYS 277.A N LEU 274.A O LYS 277.A H.A 3.106 2.347 LYS 277.A NZ SER 273.A OG LYS 277.A HZ2 3.242 2.440 GLY 278.A N LEU 275.A O GLY 278.A H 3.150 2.303 ARG 279.A N.A LEU 274.A O ARG 279.A H.A 3.135 2.291 ARG 279.A N.B LEU 274.A O ARG 279.A H.B 3.142 2.296 ILE 281.A N ALA 258.A O ILE 281.A H 2.933 2.105 ILE 282.A N LEU 163.A O ILE 282.A H 3.084 2.291 ARG 283.A N MET 260.A O ARG 283.A H 2.996 2.290 ARG 283.A NE ASP 125.A OD1 ARG 283.A HE 2.735 1.877 ARG 283.A NH1 GLU 284.A O ARG 283.A HH11 3.040 2.226 ARG 283.A NH1 ASN 285.A OD1 ARG 283.A HH12 3.028 2.186 ARG 283.A NH2 ASP 125.A OD1 ARG 283.A HH21 3.441 2.806 ARG 283.A NH2 ASP 125.A OD2 ARG 283.A HH21 2.931 2.127 VAL 289.A N ASN 122.A OD1 VAL 289.A H 3.136 2.487 SER 291.A N HIS 119.A O SER 291.A H 2.889 2.132 ASP 293.A N THR 117.A O ASP 293.A H 2.806 1.975 GLU 299.A N GLU 299.A OE1 GLU 299.A H 2.450 1.645 ASN 300.A N ASN 298.A OD1 ASN 300.A H 3.050 2.206 ASN 300.A ND2 ASN 298.A OD1 ASN 300.A HD22 3.021 2.184