Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 9hdn_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 2.A N ASN 214.A OD1 GLY 2.A H 2.847 2.102 ARG 4.A N GLN 299.A OE1 ARG 4.A H 2.832 1.939 LYS 5.A NZ GLU 288.A OE1 LYS 5.A HZ3 3.412 2.529 MET 6.A N.B ARG 4.A O MET 6.A H.B 2.800 2.232 LYS 12.A NZ GLN 306.A O LYS 12.A HZ3 2.958 2.236 VAL 13.A N SER 10.A O VAL 13.A H 2.972 2.294 GLU 14.A N SER 10.A O GLU 14.A H 2.939 2.126 CYS 16.A N VAL 13.A O CYS 16.A H 2.865 1.998 MET 17.A N GLU 14.A O MET 17.A H 3.219 2.327 VAL 18.A N GLY 29.A O VAL 18.A H 2.935 2.051 GLN 19.A N GLN 69.A O GLN 19.A H 2.978 2.064 VAL 20.A N LEU 27.A O VAL 20.A H 2.866 1.961 THR 21.A N LEU 67.A O THR 21.A H 2.840 2.038 THR 21.A OG1 THR 26.A OG1 THR 21.A HG1 2.684 2.029 CYS 22.A N THR 25.A O CYS 22.A H 2.991 2.135 THR 25.A N CYS 22.A O THR 25.A H 3.004 2.162 THR 26.A OG1 THR 21.A OG1 THR 26.A HG1 2.684 1.843 LEU 27.A N VAL 20.A O LEU 27.A H 2.884 1.997 ASN 28.A N CYS 145.A O ASN 28.A H 2.986 2.107 ASN 28.A ND2 CYS 117.A O.A ASN 28.A HD22 3.026 2.401 ASN 28.A ND2 CYS 117.A O.B ASN 28.A HD22 2.885 2.266 ASN 28.A ND2 GLY 143.A O ASN 28.A HD22 3.085 2.468 ASN 28.A ND2 CYS 145.A O ASN 28.A HD21 2.964 2.190 GLY 29.A N VAL 18.A O GLY 29.A H 2.844 1.938 LEU 30.A N TYR 37.A O LEU 30.A H 2.859 1.954 TRP 31.A N CYS 16.A O TRP 31.A H 2.804 1.934 LEU 32.A N VAL 35.A O LEU 32.A H 2.946 2.042 ASP 33.A N THR 98.A OG1 ASP 33.A H 2.836 1.953 VAL 35.A N LEU 32.A O VAL 35.A H 3.080 2.193 VAL 36.A N LEU 89.A O VAL 36.A H 2.855 1.966 TYR 37.A N LEU 30.A O TYR 37.A H 2.828 1.919 CYS 38.A N LEU 87.A O CYS 38.A H 2.900 2.023 ARG 40.A N CYS 85.A O ARG 40.A H 3.087 2.219 ARG 40.A NE ASP 187.A OD2 ARG 40.A HE 2.766 1.905 ARG 40.A NH1 ASN 84.A O ARG 40.A HH12 3.319 2.620 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 40.A HH22 3.053 2.339 HIS 41.A NE2 HIS 164.A O HIS 41.A HE2 2.885 2.082 VAL 42.A N PRO 39.A O VAL 42.A H 3.235 2.339 ILE 43.A N ARG 40.A O ILE 43.A H 3.044 2.134 CYS 44.A N HIS 41.A O CYS 44.A H 3.083 2.200 THR 45.A N ASP 48.A OD2 THR 45.A H 2.870 1.959 ASP 48.A N THR 45.A O ASP 48.A H 2.981 2.326 ASP 48.A N THR 45.A OG1 ASP 48.A H 3.313 2.476 MET 49.A N SER 46.A O MET 49.A H 3.476 2.610 ASN 51.A N ASP 48.A O ASN 51.A H 3.375 2.552 ASP 56.A N ASN 53.A OD1 ASP 56.A H 3.002 2.105 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 2.760 1.874 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 2.793 1.943 ILE 59.A N GLU 55.A O ILE 59.A H 3.004 2.178 ARG 60.A NH1 ASP 56.A O ARG 60.A HH12 3.067 2.359 LYS 61.A N LEU 58.A O LYS 61.A H 2.960 2.098 LYS 61.A NZ ILE 43.A O LYS 61.A HZ3 3.535 2.856 SER 62.A N ASN 65.A OD1 SER 62.A H 2.863 1.953 ASN 65.A N SER 62.A O ASN 65.A H 3.095 2.288 PHE 66.A N ASN 63.A O PHE 66.A H 3.057 2.185 LEU 67.A N THR 21.A O LEU 67.A H 2.894 1.986 GLN 69.A N GLN 19.A O GLN 69.A H 2.861 1.982 ALA 70.A N VAL 73.A O ALA 70.A H 2.825 1.983 VAL 73.A N ALA 70.A O VAL 73.A H 3.002 2.194 LEU 75.A N VAL 68.A O LEU 75.A H 2.887 2.004 ARG 76.A N ASP 92.A OD1 ARG 76.A H 3.135 2.439 ILE 78.A N LYS 90.A O ILE 78.A H 2.719 1.825 HIS 80.A ND1 ASN 63.A OD1 HIS 80.A HD1 2.925 2.196 SER 81.A N LYS 88.A O SER 81.A H 2.954 2.159 GLN 83.A N VAL 86.A O GLN 83.A H 2.939 2.042 ASN 84.A ND2 GLU 178.A O ASN 84.A HD21 2.862 1.987 CYS 85.A N GLY 179.A O CYS 85.A H 2.940 2.077 VAL 86.A N GLN 83.A O VAL 86.A H 3.019 2.128 LEU 87.A N CYS 38.A O LEU 87.A H 2.845 1.973 LYS 88.A N SER 81.A O LYS 88.A H 2.877 1.968 LYS 88.A NZ GLN 83.A OE1 LYS 88.A HZ1 2.961 2.065 LEU 89.A N VAL 36.A O LEU 89.A H 2.786 1.876 LYS 90.A N GLY 79.A O LYS 90.A H 2.876 2.094 VAL 91.A N ASP 34.A O VAL 91.A H 2.865 1.984 ASN 95.A N ASP 33.A O ASN 95.A H 2.898 2.006 ASN 95.A ND2 GLY 15.A O ASN 95.A HD22 3.037 2.280 ASN 95.A ND2 TRP 31.A O ASN 95.A HD21 2.882 2.024 LYS 97.A N ASN 95.A OD1 LYS 97.A H 2.869 2.012 THR 98.A N ASN 95.A O THR 98.A H 3.167 2.341 LYS 100.A NZ ASP 155.A OD2 LYS 100.A HZ2 2.705 1.944 LYS 102.A N VAL 157.A O LYS 102.A H 2.937 2.134 VAL 104.A N PHE 159.A O VAL 104.A H 2.970 2.061 ARG 105.A NH1 ASP 176.A OD2 ARG 105.A HH12 2.742 1.962 ARG 105.A NH1 ASN 180.A O ARG 105.A HH11 3.092 2.497 ARG 105.A NH2 PHE 181.A O ARG 105.A HH21 2.849 1.978 ILE 106.A N TYR 182.A OH ILE 106.A H 3.045 2.153 GLN 107.A N GLN 110.A OE1.A GLN 107.A H 2.950 2.044 GLY 109.A N MET 130.A O.A GLY 109.A H 2.773 1.873 GLY 109.A N MET 130.A O.B GLY 109.A H 2.738 1.828 GLN 110.A N.A GLN 107.A O GLN 110.A H.A 3.141 2.265 GLN 110.A N.B GLN 107.A O GLN 110.A H.B 3.149 2.270 PHE 112.A N CYS 128.A O PHE 112.A H 3.074 2.183 SER 113.A N PHE 150.A O SER 113.A H 2.918 2.014 VAL 114.A N TYR 126.A O VAL 114.A H 2.779 1.891 LEU 115.A N VAL 148.A O LEU 115.A H 2.984 2.095 ALA 116.A N GLY 124.A O ALA 116.A H 2.844 2.056 CYS 117.A N.A SER 147.A OG CYS 117.A H.A 2.833 1.953 CYS 117.A N.B SER 147.A OG CYS 117.A H.B 2.863 2.117 TYR 118.A N SER 121.A O.A TYR 118.A H 3.166 2.261 TYR 118.A N SER 121.A O.B TYR 118.A H 3.118 2.215 GLY 120.A N ASN 28.A OD1 GLY 120.A H 2.754 1.922 SER 121.A N.A TYR 118.A O SER 121.A H.A 2.862 1.982 SER 121.A N.B TYR 118.A O SER 121.A H.B 2.842 1.965 SER 123.A N ALA 116.A O SER 123.A H 2.856 1.950 TYR 126.A N VAL 114.A O TYR 126.A H 3.030 2.175 CYS 128.A N PHE 112.A O CYS 128.A H 2.912 2.005 ALA 129.A N GLU 290.A OE1 ALA 129.A H 2.946 2.246 MET 130.A N.A GLN 110.A O.A MET 130.A H.A 2.897 2.006 MET 130.A N.A GLN 110.A O.B MET 130.A H.A 2.906 2.012 MET 130.A N.B GLN 110.A O.A MET 130.A H.B 2.921 2.041 MET 130.A N.B GLN 110.A O.B MET 130.A H.B 2.930 2.046 ARG 131.A N THR 135.A O ARG 131.A H 2.837 1.960 ARG 131.A NE ASP 197.A OD2 ARG 131.A HE 2.927 2.088 ARG 131.A NH1 GLU 290.A OE2 ARG 131.A HH12 2.942 2.154 ARG 131.A NH2 THR 198.A O ARG 131.A HH22 3.085 2.285 ARG 131.A NH2 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH21 2.748 2.000 ASN 133.A N ASP 197.A OD1 ASN 133.A H 3.239 2.447 ASN 133.A ND2 GLY 195.A O ASN 133.A HD21 3.008 2.133 PHE 134.A N ARG 131.A O PHE 134.A H 2.804 1.998 THR 135.A N ASN 133.A OD1 THR 135.A H 3.081 2.203 THR 135.A OG1 ASN 133.A OD1 THR 135.A HG1 2.819 1.962 ILE 136.A N HIS 172.A O ILE 136.A H 2.865 1.972 LEU 141.A N TYR 118.A OH LEU 141.A H 2.843 1.973 SER 144.A N LEU 141.A O SER 144.A H 3.038 2.244 GLY 146.A N HIS 163.A O GLY 146.A H 2.829 1.927 SER 147.A N SER 144.A O SER 147.A H 2.931 2.055 GLY 149.A N TYR 161.A O GLY 149.A H 2.806 1.907 PHE 150.A N SER 113.A O PHE 150.A H 2.803 1.995 ASN 151.A N SER 158.A O ASN 151.A H 3.022 2.131 ASN 151.A ND2 THR 111.A O ASN 151.A HD22 2.927 2.065 ASP 153.A N CYS 156.A O ASP 153.A H 2.803 1.891 CYS 156.A N ASP 153.A O CYS 156.A H 2.920 2.141 VAL 157.A N LYS 100.A O VAL 157.A H 2.821 1.913 SER 158.A N ASN 151.A O SER 158.A H 2.771 1.908 PHE 159.A N LYS 102.A O PHE 159.A H 2.844 2.021 CYS 160.A N GLY 149.A O CYS 160.A H 3.030 2.118 TYR 161.A N GLY 149.A O TYR 161.A H 3.351 2.554 MET 162.A N THR 175.A O MET 162.A H 2.784 1.916 HIS 163.A N SER 147.A O HIS 163.A H 2.857 2.022 HIS 163.A ND1 TYR 161.A OH HIS 163.A HD1 2.938 2.095 HIS 164.A N ALA 173.A O HIS 164.A H 3.000 2.143 HIS 164.A ND1 MET 162.A O HIS 164.A HD1 3.304 2.444 HIS 164.A NE2 CYS 85.A O HIS 164.A HE2 3.338 2.466 MET 165.A N ALA 173.A O MET 165.A H 3.105 2.262 LEU 167.A N VAL 171.A O LEU 167.A H 2.888 2.033 GLY 170.A N LEU 167.A O GLY 170.A H 2.939 2.055 HIS 172.A N ILE 136.A O HIS 172.A H 2.875 2.117 HIS 172.A NE2 GLU 166.A OE2 HIS 172.A HE2 2.827 2.050 ALA 173.A N MET 165.A O ALA 173.A H 2.949 2.035 THR 175.A N MET 162.A O THR 175.A H 3.009 2.143 ASP 176.A N ASN 180.A O ASP 176.A H 3.090 2.208 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 2.949 2.094 ASN 180.A N ASP 176.A OD1 ASN 180.A H 3.021 2.187 TYR 182.A N GLY 174.A O TYR 182.A H 2.990 2.088 GLN 189.A N MET 49.A O GLN 189.A H 2.876 2.000 THR 199.A N ASN 238.A O THR 199.A H 3.046 2.154 ILE 200.A N ASP 289.A OD2 ILE 200.A H 2.886 1.976 ASN 203.A N ILE 200.A O ASN 203.A H 2.878 2.163 ASN 203.A ND2 GLY 109.A O ASN 203.A HD22 3.105 2.268 ASN 203.A ND2 ASP 289.A O ASN 203.A HD21 2.929 2.071 VAL 204.A N ILE 200.A O VAL 204.A H 3.092 2.205 LEU 205.A N THR 201.A O LEU 205.A H 3.027 2.123 ALA 206.A N VAL 202.A O ALA 206.A H 3.001 2.175 TRP 207.A N ASN 203.A O TRP 207.A H 3.016 2.158 LEU 208.A N VAL 204.A O LEU 208.A H 2.918 2.036 TYR 209.A N LEU 205.A O TYR 209.A H 2.967 2.089 ALA 210.A N ALA 206.A O ALA 210.A H 2.987 2.101 ALA 211.A N TRP 207.A O ALA 211.A H 2.919 2.073 VAL 212.A N LEU 208.A O VAL 212.A H 3.067 2.177 ILE 213.A N TYR 209.A O ILE 213.A H 2.981 2.095 ASN 214.A N ALA 210.A O ASN 214.A H 3.041 2.216 ASN 214.A ND2 ALA 210.A O ASN 214.A HD21 3.142 2.289 GLY 215.A N VAL 212.A O GLY 215.A H 2.953 2.059 ASP 216.A N ALA 211.A O ASP 216.A H 2.837 1.961 TRP 218.A NE1 THR 280.A O TRP 218.A HE1 2.932 2.089 LEU 220.A N ARG 217.A O LEU 220.A H 3.029 2.148 ASN 221.A ND2 ALA 266.A O ASN 221.A HD22 3.681 2.798 ASN 221.A ND2 GLU 270.A OE1 ASN 221.A HD21 3.558 2.786 PHE 223.A N ASN 221.A OD1 PHE 223.A H 2.990 2.125 THR 224.A OG1 THR 225.A O THR 224.A HG1 3.466 2.737 THR 225.A OG1 THR 226.A O THR 225.A HG1 2.975 2.158 ASP 229.A N THR 226.A OG1 ASP 229.A H 3.015 2.163 PHE 230.A N THR 226.A O PHE 230.A H 2.907 2.017 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 3.032 2.170 ASN 231.A ND2 LEU 242.A O ASN 231.A HD22 3.010 2.143 LEU 232.A N ASN 228.A O LEU 232.A H 3.263 2.455 ALA 234.A N PHE 230.A O ALA 234.A H 2.848 1.946 MET 235.A N ASN 231.A O MET 235.A H 2.774 1.873 LYS 236.A N VAL 233.A O LYS 236.A H 2.975 2.340 TYR 237.A N VAL 233.A O TYR 237.A H 3.248 2.494 TYR 237.A N ALA 234.A O TYR 237.A H 3.035 2.259 ASN 238.A N MET 235.A O ASN 238.A H 3.178 2.299 TYR 239.A N ALA 234.A O TYR 239.A H 3.133 2.223 GLU 240.A N THR 199.A O GLU 240.A H 2.905 1.992 LEU 242.A N ASN 231.A OD1 LEU 242.A H 2.941 2.035 GLN 244.A NE2 ASP 248.A OD1 GLN 244.A HE21 3.031 2.288 HIS 246.A N THR 243.A O HIS 246.A H 2.976 2.341 HIS 246.A N THR 243.A OG1 HIS 246.A H 3.206 2.377 VAL 247.A N THR 243.A O VAL 247.A H 3.073 2.200 ASP 248.A N GLN 244.A O ASP 248.A H 2.753 1.866 ILE 249.A N ASP 245.A O ILE 249.A H 2.927 2.104 LEU 250.A N HIS 246.A O LEU 250.A H 3.137 2.385 LEU 250.A N VAL 247.A O LEU 250.A H 3.160 2.456 GLY 251.A N ASP 248.A O GLY 251.A H 2.995 2.149 SER 254.A N LEU 250.A O SER 254.A H 2.942 2.052 ALA 255.A N GLY 251.A O ALA 255.A H 2.889 2.001 GLN 256.A N PRO 252.A O GLN 256.A H 2.881 1.990 THR 257.A N LEU 253.A O THR 257.A H 3.048 2.204 THR 257.A OG1 LEU 253.A O THR 257.A HG1 2.875 2.074 THR 257.A OG1 SER 254.A O THR 257.A HG1 3.447 2.920 GLY 258.A N SER 254.A O GLY 258.A H 2.724 2.009 MET 264.A N ALA 260.A O MET 264.A H 2.956 2.100 CYS 265.A N VAL 261.A O CYS 265.A H 2.838 1.956 ALA 266.A N LEU 262.A O ALA 266.A H 3.034 2.178 SER 267.A N ASP 263.A O SER 267.A H 3.007 2.212 LEU 268.A N MET 264.A O LEU 268.A H 2.951 2.084 LYS 269.A N CYS 265.A O LYS 269.A H 2.829 1.930 LYS 269.A NZ ASP 229.A OD2 LYS 269.A HZ2 2.841 1.959 GLU 270.A N ALA 266.A O GLU 270.A H 3.242 2.397 LEU 271.A N SER 267.A O LEU 271.A H 3.102 2.223 LEU 272.A N LEU 268.A O LEU 272.A H 2.851 2.007 GLN 273.A N LYS 269.A O GLN 273.A H 2.943 2.029 ASN 274.A N GLU 270.A O ASN 274.A H 2.775 1.953 GLY 275.A N LEU 271.A O GLY 275.A H 2.759 2.104 ARG 279.A N.A MET 276.A O ARG 279.A H.A 3.301 2.424 ARG 279.A N.B MET 276.A O ARG 279.A H.B 3.292 2.416 ARG 279.A NH2.A MET 276.A O ARG 279.A HH22.A 3.162 2.464 ILE 281.A N SER 284.A O ILE 281.A H 2.878 1.991 LEU 282.A N ASP 216.A OD2 LEU 282.A H 2.865 1.961 SER 284.A N ILE 281.A O SER 284.A H 2.863 2.049 LEU 286.A N SER 284.A OG LEU 286.A H 3.002 2.139 GLU 290.A N GLU 288.A OE2 GLU 290.A H 3.151 2.393 THR 292.A N ASP 295.A OD2 THR 292.A H 2.987 2.076 ASP 295.A N THR 292.A OG1 ASP 295.A H 2.932 2.089 VAL 296.A N THR 292.A O VAL 296.A H 3.132 2.326 VAL 296.A N PRO 293.A O VAL 296.A H 3.141 2.507 VAL 297.A N PRO 293.A O VAL 297.A H 3.214 2.315 ARG 298.A N PHE 294.A O ARG 298.A H 2.897 2.019 ARG 298.A NH2 ASP 295.A OD1 ARG 298.A HH22 3.065 2.258 GLN 299.A N ASP 295.A O GLN 299.A H 3.253 2.380 GLN 299.A NE2 ARG 4.A O GLN 299.A HE22 2.776 1.917 CYS 300.A N VAL 296.A O CYS 300.A H 2.952 2.081 SER 301.A N VAL 297.A O SER 301.A H 2.915 2.190 GLY 302.A N GLN 299.A O GLY 302.A H 3.442 2.608 VAL 303.A N ARG 298.A O VAL 303.A H 3.135 2.247 GLN 306.A N TYR 154.A O GLN 306.A H 2.989 2.089