Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 9pbv_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 4.A N PHE 1.A O MET 4.A H 3.348 2.490 GLU 12.A N GLU 12.A OE1 GLU 12.A H 2.589 1.806 PHE 13.A N ASP 10.A O PHE 13.A H 3.011 2.178 SER 14.A N ASP 10.A O SER 14.A H 3.040 2.239 SER 14.A OG LYS 11.A O SER 14.A HG 3.495 2.786 PHE 17.A N PHE 13.A O PHE 17.A H 2.901 2.076 ARG 18.A N SER 14.A O ARG 18.A H 2.927 2.081 ARG 19.A N ASP 15.A O ARG 19.A H 2.898 2.084 ARG 19.A NH1 GLU 176.A OE2 ARG 19.A HH12 3.463 2.884 ALA 20.A N ARG 18.A O ALA 20.A H 2.973 2.277 PHE 21.A N PHE 17.A O PHE 21.A H 2.969 2.270 ARG 24.A N PHE 21.A O ARG 24.A H 3.269 2.455 GLU 29.A N GLU 29.A OE1 GLU 29.A H 2.487 1.656 GLU 32.A N PRO 28.A O GLU 32.A H 2.912 2.068 GLN 33.A N GLU 29.A O GLN 33.A H 2.890 2.109 MET 34.A N ILE 30.A O MET 34.A H 2.928 2.101 GLY 35.A N VAL 31.A O GLY 35.A H 2.694 1.851 LYS 40.A NZ LEU 150.A O LYS 40.A HZ1 3.205 2.315 ILE 42.A N VAL 155.A O ILE 42.A H 3.279 2.509 LEU 43.A N VAL 177.A O LEU 43.A H 2.945 2.301 LEU 44.A N GLY 157.A O LEU 44.A H 3.281 2.496 TYR 45.A N MET 179.A O TYR 45.A H 2.972 2.179 ALA 56.A N LYS 52.A O ALA 56.A H 2.916 2.085 ARG 57.A N THR 53.A O ARG 57.A H 2.894 2.069 GLN 58.A N LEU 54.A O GLN 58.A H 2.908 2.067 ILE 59.A N LEU 55.A O ILE 59.A H 2.898 2.053 GLY 60.A N ARG 57.A O GLY 60.A H 3.086 2.378 LYS 61.A N ARG 57.A O LYS 61.A H 2.902 2.061 MET 62.A N GLN 58.A O MET 62.A H 2.916 2.176 LEU 63.A N GLY 60.A O LEU 63.A H 3.012 2.180 VAL 71.A N ILE 112.A O VAL 71.A H 3.370 2.532 GLY 73.A N ASP 114.A O GLY 73.A H 3.156 2.432 GLU 75.A N ASN 72.A OD1 GLU 75.A H 2.559 1.749 ILE 76.A N GLY 73.A O ILE 76.A H 3.040 2.240 LEU 77.A N PRO 74.A O LEU 77.A H 3.347 2.623 TYR 80.A N ASN 78.A OD1 TYR 80.A H 3.097 2.320 ASN 87.A N GLU 83.A O ASN 87.A H 2.913 2.080 ASN 87.A ND2 ILE 76.A O ASN 87.A HD22 3.542 2.733 ILE 88.A N SER 84.A O ILE 88.A H 2.914 2.080 ARG 89.A N GLU 85.A O ARG 89.A H 2.887 2.058 ARG 89.A NH1 GLN 139.A OE1 ARG 89.A HH11 2.817 2.053 LYS 90.A N ALA 86.A O LYS 90.A H 2.918 2.220 LEU 91.A N ILE 88.A O LEU 91.A H 3.365 2.513 PHE 92.A N ARG 89.A O PHE 92.A H 3.101 2.243 GLU 96.A N PHE 92.A O GLU 96.A H 3.016 2.165 GLU 97.A N ALA 93.A O GLU 97.A H 2.899 2.054 GLU 98.A N ASP 94.A O GLU 98.A H 2.913 2.065 GLN 99.A N ALA 95.A O GLN 99.A H 2.901 2.056 ARG 100.A N.A GLU 96.A O ARG 100.A H.A 2.916 2.074 ARG 100.A N.B GLU 96.A O ARG 100.A H.B 2.919 2.078 ARG 100.A NH1.B GLU 97.A OE2 ARG 100.A HH12.B 3.277 2.477 ARG 100.A NH2.B GLU 97.A OE1 ARG 100.A HH22.B 2.943 2.156 ARG 101.A N GLU 97.A O ARG 101.A H 2.895 2.075 LEU 102.A N GLU 98.A O LEU 102.A H 2.916 2.121 ASN 105.A N LEU 102.A O ASN 105.A H 3.059 2.211 ILE 112.A N LYS 69.A O ILE 112.A H 3.449 2.606 PHE 113.A N ILE 156.A O PHE 113.A H 3.188 2.336 ILE 116.A N MET 158.A O ILE 116.A H 3.203 2.348 ALA 118.A N GLU 115.A O ALA 118.A H 3.406 2.547 ILE 119.A N ILE 116.A O ILE 119.A H 3.240 2.388 SER 129.A N MET 126.A O SER 129.A H 3.244 2.409 ASN 138.A N ASP 134.A O ASN 138.A H 2.909 2.069 GLN 139.A N THR 135.A O GLN 139.A H 2.894 2.062 GLN 139.A NE2 GLN 139.A O GLN 139.A HE21 3.204 2.397 LEU 140.A N VAL 136.A O LEU 140.A H 2.918 2.072 LEU 141.A N VAL 137.A O LEU 141.A H 2.897 2.048 SER 142.A N ASN 138.A O SER 142.A H 2.918 2.074 LYS 143.A N GLN 139.A O LYS 143.A H 2.908 2.088 LYS 143.A NZ GLU 96.A OE2 LYS 143.A HZ3 2.753 1.897 ILE 144.A N LEU 140.A O ILE 144.A H 2.923 2.098 GLN 149.A N GLU 148.A OE1 GLN 149.A H 2.510 1.714 ASN 152.A ND2 ALA 95.A O ASN 152.A HD21 3.653 2.797 ASN 152.A ND2 SER 106.A OG ASN 152.A HD22 3.320 2.505 VAL 155.A N LYS 40.A O VAL 155.A H 3.418 2.593 ILE 156.A N ILE 111.A O ILE 156.A H 3.252 2.424 GLY 157.A N ILE 42.A O GLY 157.A H 3.402 2.612 ARG 161.A N THR 159.A OG1 ARG 161.A H 3.000 2.150 ARG 161.A NH1 ASP 163.A OD2 ARG 161.A HH12 2.851 2.135 ARG 161.A NH2 ASP 163.A OD2 ARG 161.A HH22 3.031 2.373 ASP 163.A N ASP 163.A OD1 ASP 163.A H 2.375 1.712 LEU 164.A N ARG 161.A O LEU 164.A H 3.443 2.600 ALA 168.A N ASP 166.A OD2 ALA 168.A H 2.943 2.227 LEU 169.A N ASP 166.A O LEU 169.A H 3.162 2.352 LEU 170.A N GLU 167.A O LEU 170.A H 3.076 2.228 ARG 174.A N ARG 171.A O ARG 174.A H 2.896 2.062 MET 179.A N LEU 43.A O MET 179.A H 2.898 2.274 ILE 181.A N TYR 45.A O ILE 181.A H 3.361 2.624 GLY 188.A N ASP 185.A OD1 GLY 188.A H 2.826 1.998 ARG 189.A N ASP 185.A O ARG 189.A H 2.975 2.144 LEU 190.A N GLU 186.A O LEU 190.A H 2.908 2.073 GLN 191.A N LYS 187.A O GLN 191.A H 2.906 2.084 ILE 192.A N GLY 188.A O ILE 192.A H 2.912 2.089 LEU 193.A N ARG 189.A O LEU 193.A H 2.903 2.068 HIS 194.A N LEU 190.A O HIS 194.A H 2.926 2.099 HIS 194.A ND1 GLN 191.A O no hydrogen 2.306 N/A ILE 195.A N GLN 191.A O ILE 195.A H 2.882 2.047 HIS 196.A N ILE 192.A O HIS 196.A H 2.960 2.118 THR 197.A N LEU 193.A O THR 197.A H 2.891 2.192 THR 197.A OG1 LEU 193.A O THR 197.A HG1 2.532 1.706 ALA 198.A N ILE 195.A O ALA 198.A H 3.335 2.513 ARG 201.A N THR 197.A O ARG 201.A H 2.906 2.067 ARG 201.A NH2 THR 197.A OG1 ARG 201.A HH22 3.296 2.650 GLY 202.A N ALA 198.A O GLY 202.A H 2.877 2.042 HIS 203.A N ARG 199.A O HIS 203.A H 2.921 2.096 GLN 204.A NE2 ARG 201.A O GLN 204.A HE21 3.097 2.346 LEU 205.A N MET 200.A O LEU 205.A H 2.835 1.996 ASP 209.A N SER 207.A OG ASP 209.A H 3.083 2.244 LYS 213.A N ASP 211.A OD1 LYS 213.A H 3.137 2.445 LEU 215.A N ASP 211.A O LEU 215.A H 2.887 2.048 ALA 216.A N ILE 212.A O ALA 216.A H 2.902 2.266 VAL 217.A N GLU 214.A O VAL 217.A H 3.291 2.590 THR 219.A N ALA 216.A O THR 219.A H 3.089 2.333 LYS 220.A NZ.B VAL 217.A O LYS 220.A HZ1.B 2.591 1.833 LEU 227.A N SER 223.A O LEU 227.A H 2.741 1.991 GLU 228.A N GLY 224.A O GLU 228.A H 2.942 2.159 GLY 229.A N ALA 225.A O GLY 229.A H 2.916 2.071 LEU 230.A N GLU 226.A O LEU 230.A H 2.853 2.041 VAL 231.A N LEU 227.A O VAL 231.A H 2.939 2.107 ARG 232.A N GLU 228.A O ARG 232.A H 3.133 2.295 ALA 233.A N GLY 229.A O ALA 233.A H 2.879 2.035 ALA 234.A N LEU 230.A O ALA 234.A H 2.881 2.051 GLN 235.A N VAL 231.A O GLN 235.A H 2.941 2.114 SER 236.A N ARG 232.A O SER 236.A H 2.916 2.085 THR 237.A N ALA 233.A O THR 237.A H 2.886 2.050 ALA 238.A N ALA 234.A O ALA 238.A H 2.873 2.047 MET 239.A N GLN 235.A O MET 239.A H 2.917 2.092 ASN 240.A N SER 236.A O ASN 240.A H 2.940 2.113 ARG 241.A N THR 237.A O ARG 241.A H 2.891 2.046 ARG 241.A NE ASP 265.A OD1 ARG 241.A HE 3.191 2.455 HIS 242.A N ALA 238.A O HIS 242.A H 2.848 2.034 ILE 243.A N MET 239.A O ILE 243.A H 2.947 2.106 LYS 244.A N ASN 240.A O LYS 244.A H 2.973 2.128 ALA 245.A N ARG 241.A O ALA 245.A H 2.859 2.041 SER 246.A N HIS 242.A O SER 246.A H 2.784 1.949 SER 246.A OG HIS 242.A O SER 246.A HG 2.466 1.833 SER 246.A OG ILE 243.A O SER 246.A HG 3.387 2.715 THR 247.A N ILE 243.A O THR 247.A H 3.059 2.240 THR 247.A OG1 ILE 243.A O THR 247.A HG1 2.653 1.856 LYS 248.A N ALA 245.A O LYS 248.A H 2.742 1.939 GLU 254.A N ASP 252.A OD1 GLU 254.A H 3.353 2.528 GLU 257.A N MET 253.A O GLU 257.A H 2.791 1.991 SER 258.A N GLU 254.A O SER 258.A H 3.016 2.175 SER 258.A OG GLU 254.A O SER 258.A HG 3.401 2.635 LEU 259.A N ALA 256.A O LEU 259.A H 2.811 2.085 LEU 267.A N ARG 263.A O LEU 267.A H 3.212 2.370 ALA 268.A N GLY 264.A O ALA 268.A H 2.898 2.096 SER 269.A N ASP 265.A O SER 269.A H 2.926 2.083 LEU 270.A N PHE 266.A O LEU 270.A H 2.853 2.037 GLU 271.A N LEU 267.A O GLU 271.A H 3.005 2.222 ASN 272.A N SER 269.A O ASN 272.A H 3.241 2.432 TYR 288.A N ASP 284.A O TYR 288.A H 2.917 2.081 ILE 289.A N TYR 285.A O ILE 289.A H 2.454 1.704 TRP 296.A N ILE 294.A O TRP 296.A H 2.921 2.246 THR 301.A N ASP 298.A O THR 301.A H 2.705 2.054 VAL 303.A N PRO 299.A O VAL 303.A H 2.911 2.071 LEU 304.A N VAL 300.A O LEU 304.A H 2.939 2.093 ASP 305.A N THR 301.A O ASP 305.A H 2.896 2.068 ASP 306.A N ARG 302.A O ASP 306.A H 2.918 2.084 GLY 307.A N VAL 303.A O GLY 307.A H 2.915 2.084 GLU 308.A N LEU 304.A O GLU 308.A H 2.928 2.089 LEU 309.A N ASP 305.A O LEU 309.A H 2.900 2.071 LEU 310.A N ASP 306.A O LEU 310.A H 2.918 2.088 VAL 311.A N GLY 307.A O VAL 311.A H 2.934 2.103 GLN 312.A N.A GLU 308.A O GLN 312.A H.A 2.913 2.072 GLN 312.A N.B GLU 308.A O GLN 312.A H.B 2.909 2.064 GLN 313.A N LEU 309.A O GLN 313.A H 2.883 2.066 THR 314.A N LEU 310.A O THR 314.A H 2.956 2.127 LYS 315.A N.A VAL 311.A O LYS 315.A H.A 2.920 2.135 LYS 315.A N.B VAL 311.A O LYS 315.A H.B 2.919 2.141 ASN 316.A N GLN 312.A O.A ASN 316.A H 2.905 2.198 ASN 316.A N GLN 312.A O.B ASN 316.A H 2.893 2.184 LEU 326.A N THR 449.A O LEU 326.A H 3.262 2.509 LEU 327.A N GLY 430.A O LEU 327.A H 2.817 1.968 THR 336.A OG1 ASP 389.A OD1 THR 336.A HG1 3.285 2.536 ALA 339.A N LYS 335.A O ALA 339.A H 2.923 2.080 ALA 340.A N THR 336.A O ALA 340.A H 2.901 2.058 LYS 341.A N ALA 337.A O LYS 341.A H 2.906 2.088 ILE 342.A N LEU 338.A O ILE 342.A H 2.908 2.067 ALA 343.A N ALA 339.A O ALA 343.A H 2.928 2.087 GLU 344.A N ALA 340.A O GLU 344.A H 2.891 2.063 GLU 345.A N LYS 341.A O GLU 345.A H 2.911 2.070 SER 346.A N ILE 342.A O SER 346.A H 2.920 2.311 SER 346.A N ALA 343.A O SER 346.A H 3.100 2.388 SER 346.A OG ALA 343.A O SER 346.A HG 2.282 1.613 ASN 347.A N GLU 344.A O ASN 347.A H 3.368 2.607 LYS 352.A NZ ILE 353.A O LYS 352.A HZ2 3.219 2.410 MET 359.A N PRO 356.A O MET 359.A H 3.266 2.535 PHE 362.A N MET 359.A O PHE 362.A H 2.917 2.060 LYS 367.A N SER 363.A O LYS 367.A H 3.083 2.292 LYS 367.A NZ LEU 394.A O LYS 367.A HZ1 2.661 1.870 CYS 368.A N GLU 364.A O CYS 368.A H 2.923 2.096 GLN 369.A N THR 365.A O GLN 369.A H 2.914 2.086 ALA 370.A N ALA 366.A O ALA 370.A H 2.899 2.072 MET 371.A N LYS 367.A O MET 371.A H 2.926 2.086 LYS 372.A N CYS 368.A O LYS 372.A H 2.920 2.078 LYS 373.A N GLN 369.A O LYS 373.A H 2.883 2.054 ILE 374.A N ALA 370.A O ILE 374.A H 2.931 2.099 PHE 375.A N MET 371.A O PHE 375.A H 2.966 2.120 ASP 376.A N LYS 372.A O ASP 376.A H 2.866 2.034 ASP 377.A N LYS 373.A O ASP 377.A H 2.921 2.083 ALA 378.A N ILE 374.A O ALA 378.A H 2.922 2.102 TYR 379.A N PHE 375.A O TYR 379.A H 2.924 2.247 TYR 379.A N ASP 376.A O TYR 379.A H 3.201 2.539 LYS 380.A N ASP 377.A O LYS 380.A H 3.232 2.431 LEU 383.A N SER 381.A OG LEU 383.A H 3.259 2.410 SER 384.A OG ALA 378.A O SER 384.A HG 2.883 2.100 VAL 386.A N LEU 427.A O VAL 386.A H 2.926 2.107 VAL 388.A N ILE 429.A O VAL 388.A H 2.863 2.166 ASP 390.A N THR 431.A OG1 ASP 390.A H 3.264 2.460 ILE 391.A N ASP 389.A O ILE 391.A H 2.699 2.061 LEU 395.A N ILE 391.A O LEU 395.A H 3.180 2.384 SER 405.A N LEU 395.A O SER 405.A H 3.206 2.414 GLN 410.A N ASN 406.A O GLN 410.A H 2.915 2.085 ALA 411.A N LEU 407.A O ALA 411.A H 2.894 2.060 LEU 412.A N VAL 408.A O LEU 412.A H 2.928 2.089 LEU 413.A N LEU 409.A O LEU 413.A H 2.903 2.067 VAL 414.A N GLN 410.A O VAL 414.A H 2.910 2.088 LEU 415.A N ALA 411.A O LEU 415.A H 2.907 2.100 LEU 416.A N LEU 412.A O LEU 416.A H 3.032 2.321 ARG 424.A N PRO 421.A O ARG 424.A H 3.266 2.419 LEU 426.A N PRO 321.A O LEU 426.A H 3.322 2.528 ILE 428.A N VAL 323.A O ILE 428.A H 3.250 2.414 ILE 429.A N VAL 386.A O ILE 429.A H 2.913 2.077 GLY 430.A N VAL 325.A O GLY 430.A H 3.067 2.222 THR 431.A N VAL 388.A O THR 431.A H 2.973 2.225 THR 432.A N LEU 327.A O THR 432.A H 3.021 2.172 THR 432.A OG1 ASP 390.A O THR 432.A HG1 3.284 2.548 SER 433.A OG GLY 329.A O SER 433.A HG 3.442 2.709 VAL 437.A N ASP 436.A OD1 VAL 437.A H 2.504 1.895 GLN 439.A N LYS 435.A O GLN 439.A H 2.899 2.058 GLU 440.A N ASP 436.A O GLU 440.A H 2.918 2.237 GLU 440.A N VAL 437.A O GLU 440.A H 2.890 2.282 MET 441.A N VAL 437.A O MET 441.A H 3.171 2.385 GLU 442.A N GLN 439.A O GLU 442.A H 3.140 2.319 MET 443.A N LEU 438.A O MET 443.A H 3.252 2.404 ALA 446.A N MET 443.A O ALA 446.A H 2.759 1.943 ILE 451.A N LEU 326.A O ILE 451.A H 3.140 2.365 VAL 453.A N GLU 328.A O VAL 453.A H 3.406 2.601 ALA 457.A N GLN 461.A OE1 ALA 457.A H 3.009 2.151 GLU 460.A N GLU 460.A OE1 GLU 460.A H 2.418 1.625 GLN 461.A N THR 458.A O GLN 461.A H 3.131 2.523 LEU 462.A N THR 458.A O LEU 462.A H 3.379 2.601 LEU 463.A N GLY 459.A O LEU 463.A H 2.901 2.106 GLU 464.A N GLU 460.A O GLU 464.A H 2.886 2.071 ALA 465.A N GLN 461.A O ALA 465.A H 2.911 2.091 LEU 466.A N LEU 462.A O LEU 466.A H 2.896 2.058 GLU 467.A N LEU 463.A O GLU 467.A H 2.893 2.064 LEU 468.A N GLU 464.A O LEU 468.A H 2.906 2.080 LEU 469.A N ALA 465.A O LEU 469.A H 2.906 2.074 GLY 470.A N LEU 466.A O GLY 470.A H 2.874 2.043 LYS 473.A N GLU 476.A OE1 LYS 473.A H 3.455 2.609 ARG 477.A N LYS 473.A O ARG 477.A H 2.688 1.875 ARG 477.A NH2 PHE 472.A O ARG 477.A HH21 3.070 2.404 THR 478.A N ASP 474.A O THR 478.A H 2.895 2.055 THR 479.A N LYS 475.A O THR 479.A H 2.927 2.095 THR 479.A OG1 LYS 475.A O THR 479.A HG1 2.784 1.959 ILE 480.A N GLU 476.A O ILE 480.A H 2.890 2.037 ALA 481.A N ARG 477.A O ALA 481.A H 2.903 2.068 GLN 482.A N THR 478.A O GLN 482.A H 2.916 2.068 GLN 483.A N THR 479.A O GLN 483.A H 2.909 2.132 VAL 484.A N ILE 480.A O VAL 484.A H 2.736 1.957 LEU 496.A N GLY 492.A O LEU 496.A H 2.683 1.892 LEU 497.A N ILE 493.A O LEU 497.A H 2.876 2.065 MET 498.A N LYS 494.A O MET 498.A H 3.009 2.180 LEU 499.A N LYS 495.A O LEU 499.A H 2.861 2.029 ILE 500.A N LEU 496.A O ILE 500.A H 2.899 2.057 GLU 501.A N LEU 497.A O GLU 501.A H 2.930 2.097 MET 502.A N.A MET 498.A O MET 502.A H.A 2.918 2.086 MET 502.A N.B MET 498.A O MET 502.A H.B 2.915 2.079 SER 503.A N LEU 499.A O SER 503.A H 2.881 2.039 LEU 504.A N ILE 500.A O LEU 504.A H 2.934 2.147 GLN 505.A N MET 502.A O.A GLN 505.A H 2.996 2.209 GLN 505.A N MET 502.A O.B GLN 505.A H 2.973 2.183 MET 506.A N SER 503.A O MET 506.A H 3.169 2.313 GLU 509.A N GLU 509.A OE1 GLU 509.A H 2.629 1.815 ARG 511.A NE LEU 504.A O ARG 511.A HE 3.233 2.743 ARG 511.A NE MET 506.A O ARG 511.A HE 3.266 2.571 ARG 511.A NH2 LEU 504.A O ARG 511.A HH21 2.520 1.862 PHE 515.A N ARG 511.A O PHE 515.A H 2.931 2.090 LEU 516.A N VAL 512.A O LEU 516.A H 2.912 2.066 ALA 517.A N ARG 513.A O ALA 517.A H 2.897 2.051 LEU 518.A N LYS 514.A O LEU 518.A H 2.917 2.074 LEU 519.A N PHE 515.A O LEU 519.A H 2.900 2.060 ARG 520.A N LEU 516.A O ARG 520.A H 2.914 2.078 GLU 521.A N ALA 517.A O GLU 521.A H 2.896 2.078 GLU 522.A N LEU 518.A O GLU 522.A H 3.095 2.289