Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 9pd1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N VAL 33.A O no hydrogen 2.825 N/A ASN 4.A ND2 TRP 7.A O ASN 4.A HD21 2.949 2.093 TRP 7.A N ASN 4.A O TRP 7.A H 2.969 2.161 GLU 20.A N GLU 20.A OE1 GLU 20.A H 2.406 1.626 ASP 23.A N LYS 19.A O ASP 23.A H 2.948 2.104 ILE 24.A N GLU 20.A O ILE 24.A H 2.908 2.053 PHE 25.A N PHE 21.A O PHE 25.A H 2.876 2.041 ARG 26.A N SER 22.A O ARG 26.A H 2.909 2.059 ARG 27.A N ASP 23.A O ARG 27.A H 2.976 2.190 ARG 27.A NH1 LYS 177.A O ARG 27.A HH12 2.721 2.153 ALA 28.A N ILE 24.A O ALA 28.A H 2.843 2.182 ALA 28.A N PHE 25.A O ALA 28.A H 3.260 2.596 PHE 29.A N PHE 25.A O PHE 29.A H 2.684 1.976 ALA 30.A N ALA 28.A O ALA 30.A H 3.235 2.595 GLU 37.A N GLU 37.A OE1 GLU 37.A H 2.544 1.727 GLU 40.A N PRO 36.A O GLU 40.A H 2.907 2.083 GLU 40.A N GLU 40.A OE1 GLU 40.A H 3.110 2.409 GLN 41.A N GLU 37.A O GLN 41.A H 3.074 2.252 MET 42.A N ILE 38.A O MET 42.A H 2.842 2.087 GLY 43.A N VAL 39.A O GLY 43.A H 2.886 2.235 GLY 43.A N GLU 40.A O GLY 43.A H 3.047 2.388 LYS 45.A NZ ASN 150.A OD1 LYS 45.A HZ3 2.618 1.795 ILE 50.A N VAL 154.A O ILE 50.A H 2.869 2.176 LEU 51.A N VAL 176.A O LEU 51.A H 2.872 2.049 LEU 52.A N GLY 156.A O LEU 52.A H 2.935 2.145 LYS 60.A NZ THR 158.A O LYS 60.A HZ3 3.034 2.203 ALA 64.A N LYS 60.A O ALA 64.A H 3.039 2.225 ARG 65.A N THR 61.A O ARG 65.A H 2.892 2.069 GLN 66.A N LEU 62.A O GLN 66.A H 2.929 2.096 ILE 67.A N LEU 63.A O ILE 67.A H 2.932 2.088 GLY 68.A N ALA 64.A O GLY 68.A H 2.892 2.056 LYS 69.A N ARG 65.A O LYS 69.A H 2.905 2.077 MET 70.A N GLN 66.A O MET 70.A H 2.932 2.129 LEU 71.A N ILE 67.A O LEU 71.A H 3.151 2.435 ASN 72.A N LYS 69.A O ASN 72.A H 3.299 2.455 ASN 80.A N GLU 83.A OE2 ASN 80.A H 2.463 1.655 GLY 81.A N ASN 80.A OD1 GLY 81.A H 3.109 2.445 ILE 84.A N GLY 81.A O ILE 84.A H 3.251 2.513 VAL 89.A N LYS 87.A O VAL 89.A H 3.102 2.488 ASN 95.A N GLU 91.A O ASN 95.A H 3.385 2.573 ILE 96.A N SER 92.A O ILE 96.A H 2.821 2.005 ARG 97.A N GLU 93.A O ARG 97.A H 2.906 2.149 ARG 97.A NE GLU 93.A O ARG 97.A HE 3.050 2.208 LYS 98.A NZ ASN 95.A O LYS 98.A HZ2 3.550 2.745 PHE 100.A N ARG 97.A O PHE 100.A H 3.457 2.612 GLU 104.A N PHE 100.A O GLU 104.A H 2.964 2.155 GLU 105.A N ALA 101.A O GLU 105.A H 2.864 2.061 GLU 106.A N ASP 102.A O GLU 106.A H 2.903 2.027 GLN 107.A N ALA 103.A O GLN 107.A H 2.934 2.081 ARG 108.A N GLU 104.A O ARG 108.A H 2.915 2.092 ARG 109.A N GLU 105.A O ARG 109.A H 2.904 2.101 LEU 110.A N GLU 106.A O LEU 110.A H 3.016 2.209 GLY 111.A N GLN 107.A O GLY 111.A H 2.979 2.286 ASN 113.A ND2 LEU 110.A O ASN 113.A HD21 3.552 2.706 HIS 117.A N ASN 151.A O HIS 117.A H 3.160 2.356 ILE 119.A N LEU 153.A O ILE 119.A H 3.136 2.373 ALA 126.A N GLU 123.A O ALA 126.A H 2.946 2.089 ILE 127.A N ILE 124.A O ILE 127.A H 3.199 2.388 VAL 135.A N HIS 132.A O VAL 135.A H 2.958 2.136 VAL 136.A N ASP 133.A O VAL 136.A H 2.900 2.236 GLN 138.A N THR 134.A O GLN 138.A H 3.320 2.535 LEU 140.A N VAL 136.A O LEU 140.A H 3.189 2.377 SER 141.A N ASN 137.A O SER 141.A H 3.061 2.257 SER 141.A OG ASN 137.A O SER 141.A HG 3.317 2.483 LYS 142.A N LEU 139.A O LYS 142.A H 2.947 2.157 ILE 143.A N LEU 139.A O ILE 143.A H 3.182 2.428 ILE 143.A N LEU 140.A O ILE 143.A H 2.926 2.335 ASP 144.A N LEU 140.A O ASP 144.A H 3.110 2.362 ASN 151.A ND2 ALA 103.A O ASN 151.A HD21 3.325 2.478 ASN 151.A ND2 SER 114.A OG ASN 151.A HD22 3.286 2.656 ILE 155.A N ILE 119.A O ILE 155.A H 3.172 2.359 GLY 156.A N ILE 50.A O GLY 156.A H 2.924 2.102 THR 158.A N LEU 52.A O THR 158.A H 3.225 2.621 ASP 162.A N ARG 160.A O ASP 162.A H 2.437 1.807 LEU 169.A N GLU 166.A O LEU 169.A H 3.229 2.583 GLY 172.A N GLU 175.A OE1 GLY 172.A H 3.199 2.453 ARG 173.A N ARG 170.A O ARG 173.A H 3.052 2.257 ARG 173.A NE ASP 144.A OD2 ARG 173.A HE 3.232 2.627 ARG 173.A NH2 ASP 144.A OD2 ARG 173.A HH21 3.383 2.811 ILE 180.A N TYR 53.A O ILE 180.A H 2.935 2.155 GLY 187.A N ASP 184.A OD1 GLY 187.A H 3.151 2.308 ARG 188.A N ASP 184.A O ARG 188.A H 2.863 2.018 ARG 188.A NE ALA 215.A O ARG 188.A HE 3.310 2.482 ARG 188.A NH2 GLU 185.A OE1 ARG 188.A HH21 3.458 2.808 LEU 189.A N GLU 185.A O LEU 189.A H 2.921 2.086 GLN 190.A N LYS 186.A O GLN 190.A H 2.908 2.060 ILE 191.A N GLY 187.A O ILE 191.A H 2.904 2.062 LEU 192.A N ARG 188.A O LEU 192.A H 2.919 2.074 HIS 193.A N LEU 189.A O HIS 193.A H 2.933 2.087 ILE 194.A N GLN 190.A O ILE 194.A H 2.921 2.108 HIS 195.A N ILE 191.A O HIS 195.A H 2.916 2.073 HIS 195.A ND1 ILE 191.A O no hydrogen 2.998 N/A THR 196.A N HIS 193.A O THR 196.A H 3.200 2.409 THR 196.A OG1 LEU 192.A O THR 196.A HG1 2.682 1.921 THR 196.A OG1 HIS 193.A O THR 196.A HG1 3.172 2.652 ALA 197.A N ILE 194.A O ALA 197.A H 3.331 2.501 ARG 200.A NH2 THR 196.A OG1 ARG 200.A HH22 3.265 2.450 GLY 201.A N ALA 197.A O GLY 201.A H 2.966 2.253 GLY 201.A N ARG 198.A O GLY 201.A H 3.176 2.532 HIS 202.A N MET 199.A O HIS 202.A H 3.191 2.558 ASP 208.A N SER 206.A OG ASP 208.A H 3.179 2.327 ALA 215.A N ILE 211.A O ALA 215.A H 2.689 1.897 VAL 216.A N LYS 212.A O VAL 216.A H 2.914 2.153 VAL 216.A N GLU 213.A O VAL 216.A H 3.169 2.570 GLU 217.A N GLU 213.A O GLU 217.A H 2.912 2.121 THR 218.A N LEU 214.A O THR 218.A H 3.215 2.378 THR 218.A OG1 LEU 214.A O THR 218.A HG1 3.025 2.187 ASN 220.A ND2 PHE 277.A O ASN 220.A HD21 2.745 2.209 GLU 225.A N SER 222.A O GLU 225.A H 3.183 2.582 LEU 226.A N SER 222.A O LEU 226.A H 3.351 2.568 GLY 228.A N ALA 224.A O GLY 228.A H 2.934 2.096 LEU 229.A N GLU 225.A O LEU 229.A H 2.853 2.024 VAL 230.A N LEU 226.A O VAL 230.A H 2.904 2.080 ARG 231.A N GLU 227.A O ARG 231.A H 2.964 2.123 ALA 232.A N GLY 228.A O ALA 232.A H 2.876 2.058 ALA 233.A N LEU 229.A O ALA 233.A H 2.903 2.052 GLN 234.A N VAL 230.A O GLN 234.A H 2.946 2.098 SER 235.A N ARG 231.A O SER 235.A H 2.956 2.114 THR 236.A N ALA 232.A O THR 236.A H 2.887 2.057 THR 236.A OG1 ALA 232.A O THR 236.A HG1 2.809 2.029 ALA 237.A N ALA 233.A O ALA 237.A H 2.913 2.053 MET 238.A N GLN 234.A O MET 238.A H 2.969 2.120 ASN 239.A N SER 235.A O ASN 239.A H 2.885 2.044 ARG 240.A N THR 236.A O ARG 240.A H 2.901 2.064 ARG 240.A NE ASP 264.A OD2 ARG 240.A HE 3.442 2.622 HIS 241.A N ALA 237.A O HIS 241.A H 2.908 2.102 ILE 242.A N MET 238.A O ILE 242.A H 2.949 2.114 LYS 243.A N ASN 239.A O LYS 243.A H 2.940 2.096 ALA 244.A N ARG 240.A O ALA 244.A H 2.903 2.067 SER 245.A N HIS 241.A O SER 245.A H 2.905 2.071 THR 246.A N ILE 242.A O THR 246.A H 2.894 2.054 LYS 247.A N LYS 243.A O LYS 247.A H 2.904 2.082 VAL 248.A N ALA 244.A O VAL 248.A H 2.833 1.991 GLU 249.A N GLU 249.A OE1 GLU 249.A H 2.570 1.894 VAL 250.A N VAL 248.A O VAL 250.A H 2.757 2.041 ALA 255.A N ASP 251.A O ALA 255.A H 3.215 2.359 GLU 256.A N MET 252.A O GLU 256.A H 2.886 2.029 SER 257.A OG GLU 253.A O SER 257.A HG 2.881 2.076 LEU 266.A N ARG 262.A O LEU 266.A H 2.992 2.160 ALA 267.A N GLY 263.A O ALA 267.A H 2.881 2.041 SER 268.A N ASP 264.A O SER 268.A H 2.917 2.064 LEU 269.A N PHE 265.A O LEU 269.A H 2.894 2.055 GLU 270.A N LEU 266.A O GLU 270.A H 2.905 2.081 ASN 271.A N SER 268.A O ASN 271.A H 3.246 2.468 ASP 272.A N SER 268.A O ASP 272.A H 2.544 1.717 LYS 274.A NZ ASN 271.A O LYS 274.A HZ2 2.498 1.851 ASP 283.A N ASN 280.A OD1 ASP 283.A H 2.492 1.727 TYR 287.A N TYR 284.A O TYR 287.A H 2.907 2.114 ILE 288.A N TYR 284.A O ILE 288.A H 2.759 1.908 ARG 301.A N ASP 297.A O ARG 301.A H 3.197 2.356 ARG 301.A NH2 HIS 451.A O ARG 301.A HH22 3.365 2.512 VAL 302.A N PRO 298.A O VAL 302.A H 2.892 2.051 LEU 303.A N VAL 299.A O LEU 303.A H 2.949 2.109 ASP 304.A N THR 300.A O ASP 304.A H 2.881 2.033 ASP 305.A N ARG 301.A O ASP 305.A H 2.926 2.092 GLY 306.A N VAL 302.A O GLY 306.A H 2.914 2.071 GLU 307.A N LEU 303.A O GLU 307.A H 2.917 2.095 LEU 308.A N ASP 304.A O LEU 308.A H 2.899 2.075 LEU 309.A N ASP 305.A O LEU 309.A H 2.948 2.116 VAL 310.A N GLY 306.A O VAL 310.A H 2.910 2.070 GLN 311.A N GLU 307.A O GLN 311.A H 2.890 2.048 GLN 312.A N LEU 308.A O GLN 312.A H 2.928 2.093 THR 313.A N LEU 309.A O THR 313.A H 2.954 2.113 THR 313.A OG1 LEU 425.A O THR 313.A HG1 3.502 2.951 LYS 314.A N VAL 310.A O LYS 314.A H 2.929 2.123 ASN 315.A N GLN 311.A O ASN 315.A H 3.260 2.428 VAL 324.A N ILE 427.A O VAL 324.A H 3.216 2.583 LEU 326.A N GLY 429.A O LEU 326.A H 3.374 2.571 GLU 327.A N ILE 450.A O GLU 327.A H 3.280 2.479 SER 332.A N PRO 329.A O SER 332.A H 3.281 2.507 SER 332.A OG PRO 329.A O SER 332.A HG 2.391 1.650 LYS 334.A NZ GLY 328.A O LYS 334.A HZ2 2.901 2.032 ALA 338.A N LYS 334.A O ALA 338.A H 3.192 2.353 ALA 339.A N THR 335.A O ALA 339.A H 2.913 2.088 LYS 340.A N ALA 336.A O LYS 340.A H 2.900 2.095 ILE 341.A N LEU 337.A O ILE 341.A H 2.931 2.083 ALA 342.A N ALA 338.A O ALA 342.A H 2.921 2.079 GLU 343.A N ALA 339.A O GLU 343.A H 2.890 2.067 GLU 344.A N LYS 340.A O GLU 344.A H 2.895 2.061 SER 345.A N ILE 341.A O SER 345.A H 2.994 2.392 SER 345.A N ALA 342.A O SER 345.A H 3.070 2.342 SER 345.A OG ALA 342.A O SER 345.A HG 2.570 1.809 ASN 346.A N GLU 343.A O ASN 346.A H 3.269 2.441 ASN 346.A ND2 GLU 344.A OE2 ASN 346.A HD22 3.271 2.653 PHE 347.A N SER 345.A OG PHE 347.A H 3.394 2.549 LYS 351.A N CYS 384.A O LYS 351.A H 2.929 2.120 LYS 351.A NZ ILE 352.A O LYS 351.A HZ2 3.333 2.770 CYS 353.A N VAL 386.A O CYS 353.A H 2.893 2.094 MET 358.A N PRO 355.A O MET 358.A H 3.175 2.319 PHE 361.A N MET 358.A O PHE 361.A H 3.226 2.377 LYS 366.A N SER 362.A O LYS 366.A H 3.132 2.332 CYS 367.A N GLU 363.A O CYS 367.A H 2.940 2.115 GLN 368.A N THR 364.A O GLN 368.A H 2.899 2.079 ALA 369.A N ALA 365.A O ALA 369.A H 2.919 2.099 MET 370.A N LYS 366.A O MET 370.A H 2.939 2.096 LYS 371.A N CYS 367.A O LYS 371.A H 2.931 2.076 LYS 372.A N.A GLN 368.A O no hydrogen 2.868 N/A LYS 372.A N.B GLN 368.A O no hydrogen 2.867 N/A ILE 373.A N ALA 369.A O ILE 373.A H.A 2.939 2.113 PHE 374.A N MET 370.A O PHE 374.A H 3.003 2.160 ASP 375.A N LYS 371.A O ASP 375.A H 2.848 1.995 ASP 376.A N LYS 372.A O.A ASP 376.A H 2.892 2.045 ASP 376.A N LYS 372.A O.B ASP 376.A H 2.894 2.048 ALA 377.A N ILE 373.A O ALA 377.A H 2.936 2.126 TYR 378.A N PHE 374.A O TYR 378.A H 2.911 2.159 LYS 379.A N ASP 376.A O LYS 379.A H 3.255 2.401 SER 380.A OG LEU 382.A O SER 380.A HG 3.053 2.539 CYS 384.A N PHE 349.A O CYS 384.A H 2.885 2.261 VAL 385.A N LEU 426.A O VAL 385.A H 3.268 2.414 VAL 386.A N LYS 351.A O VAL 386.A H 2.909 2.145 VAL 387.A N ILE 428.A O VAL 387.A H 3.052 2.199 ASP 388.A N CYS 353.A O ASP 388.A H 3.009 2.190 ILE 390.A N THR 430.A O ILE 390.A H 3.181 2.324 LEU 393.A N ASP 389.A O LEU 393.A H 3.157 2.328 LEU 394.A N ILE 390.A O LEU 394.A H 3.275 2.577 LEU 394.A N GLU 391.A O LEU 394.A H 3.146 2.442 ASP 395.A N ARG 392.A O ASP 395.A H 3.034 2.220 SER 404.A N LEU 394.A O SER 404.A H 3.379 2.604 GLN 409.A N ASN 405.A O GLN 409.A H 2.917 2.100 ALA 410.A N LEU 406.A O ALA 410.A H 2.926 2.100 LEU 411.A N VAL 407.A O LEU 411.A H 2.938 2.093 LEU 412.A N LEU 408.A O LEU 412.A H 2.918 2.077 VAL 413.A N GLN 409.A O VAL 413.A H 2.896 2.036 LEU 414.A N ALA 410.A O LEU 414.A H 2.919 2.075 LEU 415.A N LEU 411.A O LEU 415.A H 2.932 2.186 LYS 416.A N VAL 413.A O LYS 416.A H 3.180 2.325 ARG 423.A NH1 TYR 378.A O ARG 423.A HH11 3.441 2.871 LYS 424.A N GLN 381.A O LYS 424.A H 3.414 2.566 LYS 424.A NZ SER 316.A O LYS 424.A HZ3 3.389 2.832 LEU 425.A N PRO 320.A O LEU 425.A H 3.133 2.432 ILE 427.A N VAL 322.A O ILE 427.A H 3.303 2.575 ILE 428.A N VAL 385.A O ILE 428.A H 3.232 2.464 GLY 429.A N VAL 324.A O GLY 429.A H 3.070 2.248 ARG 433.A N THR 431.A OG1 ARG 433.A H 3.375 2.528 LYS 434.A NZ GLU 327.A OE2 LYS 434.A HZ1 3.131 2.265 GLN 438.A N LYS 434.A O GLN 438.A H 2.890 2.039 GLU 439.A N ASP 435.A O GLU 439.A H 2.928 2.115 MET 440.A N VAL 436.A O MET 440.A H 2.913 2.185 GLU 441.A N GLN 438.A O GLU 441.A H 3.032 2.241 MET 442.A N LEU 437.A O MET 442.A H 3.118 2.348 ALA 445.A N MET 442.A O ALA 445.A H 2.859 2.044 ILE 450.A N LEU 325.A O ILE 450.A H 3.120 2.429 VAL 452.A N GLU 327.A O VAL 452.A H 3.083 2.382 ILE 455.A N ILE 490.A O ILE 455.A H 3.448 2.622 ALA 456.A N GLN 460.A OE1 ALA 456.A H 3.308 2.450 GLN 460.A N THR 457.A OG1 GLN 460.A H 3.321 2.526 LEU 461.A N THR 457.A O LEU 461.A H 3.158 2.369 LEU 462.A N GLY 458.A O LEU 462.A H 2.897 2.089 GLU 463.A N GLU 459.A O GLU 463.A H 2.897 2.066 ALA 464.A N GLN 460.A O ALA 464.A H 2.919 2.095 LEU 465.A N LEU 461.A O LEU 465.A H 2.896 2.054 GLU 466.A N LEU 462.A O GLU 466.A H 2.889 2.043 LEU 467.A N GLU 463.A O LEU 467.A H 2.892 2.066 LEU 468.A N ALA 464.A O LEU 468.A H 2.913 2.117 GLY 469.A N LEU 465.A O GLY 469.A H 2.682 1.858 LYS 472.A N GLU 475.A OE1 LYS 472.A H 2.800 1.978 ARG 476.A N LYS 472.A O ARG 476.A H 2.638 1.855 ARG 476.A NH2 PHE 471.A O ARG 476.A HH22 2.370 1.737 THR 477.A N ASP 473.A O THR 477.A H 2.887 2.077 THR 478.A N LYS 474.A O THR 478.A H 2.918 2.075 THR 478.A OG1 LYS 474.A O THR 478.A HG1 2.781 1.944 ILE 479.A N GLU 475.A O ILE 479.A H 2.912 2.075 ALA 480.A N ARG 476.A O ALA 480.A H 2.893 2.040 GLN 481.A N THR 477.A O GLN 481.A H 2.900 2.048 GLN 482.A N THR 478.A O GLN 482.A H 2.927 2.240 GLN 482.A N ILE 479.A O GLN 482.A H 2.997 2.349 VAL 483.A N ILE 479.A O VAL 483.A H 2.878 2.214 VAL 483.A N ALA 480.A O VAL 483.A H 3.237 2.545 LYS 484.A N ALA 480.A O LYS 484.A H 2.969 2.287 LYS 484.A NZ GLN 481.A OE1 LYS 484.A HZ3 3.117 2.284 LYS 486.A N VAL 483.A O LYS 486.A H 3.005 2.145 LYS 487.A NZ ALA 523.A O LYS 487.A HZ3 3.294 2.404 VAL 488.A N LYS 486.A O VAL 488.A H 2.720 2.046 LEU 495.A N GLY 491.A O LEU 495.A H 2.972 2.161 LEU 496.A N ILE 492.A O LEU 496.A H 2.919 2.112 MET 497.A N LYS 493.A O MET 497.A H 2.960 2.127 LEU 498.A N LYS 494.A O LEU 498.A H 2.864 2.026 ILE 499.A N LEU 495.A O ILE 499.A H 2.898 2.073 GLU 500.A N LEU 496.A O GLU 500.A H 2.915 2.068 MET 501.A N MET 497.A O MET 501.A H 2.959 2.109 SER 502.A N LEU 498.A O SER 502.A H 2.858 2.031 LEU 503.A N ILE 499.A O LEU 503.A H 2.980 2.201 GLN 504.A N MET 501.A O GLN 504.A H 3.214 2.459 TYR 509.A N ASP 506.A O TYR 509.A H 3.230 2.479 TYR 509.A N ASP 506.A OD1 TYR 509.A H 3.284 2.510 ARG 510.A NE MET 505.A O ARG 510.A HE 2.434 1.750 ARG 510.A NH2 MET 505.A O ARG 510.A HH21 2.851 2.277 LYS 513.A N TYR 509.A O LYS 513.A H 3.319 2.472 PHE 514.A N ARG 510.A O PHE 514.A H 2.918 2.069 LEU 515.A N VAL 511.A O LEU 515.A H 2.886 2.069 ALA 516.A N ARG 512.A O ALA 516.A H 2.883 2.034 LEU 517.A N LYS 513.A O LEU 517.A H 2.897 2.058 LEU 518.A N PHE 514.A O LEU 518.A H 2.939 2.105 ARG 519.A N LEU 515.A O ARG 519.A H 2.895 2.061 GLU 520.A N ALA 516.A O GLU 520.A H 2.896 2.065 GLU 521.A N LEU 517.A O GLU 521.A H 3.267 2.512 GLU 521.A N LEU 518.A O GLU 521.A H 3.058 2.453