Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 9pdd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 8.A N GLU 8.A OE1 GLU 8.A H 2.589 1.780 MET 10.A N PHE 7.A O MET 10.A H 3.147 2.353 GLU 18.A N GLU 18.A OE1 GLU 18.A H 2.565 1.751 ASP 21.A N LYS 17.A O ASP 21.A H 2.973 2.132 ILE 22.A N GLU 18.A O ILE 22.A H 2.894 2.046 PHE 23.A N PHE 19.A O PHE 23.A H 2.878 2.049 ARG 24.A N SER 20.A O ARG 24.A H 2.937 2.091 ARG 25.A N ASP 21.A O ARG 25.A H 2.942 2.155 ALA 26.A N ILE 22.A O ALA 26.A H 2.876 2.106 GLU 35.A N GLU 35.A OE1 GLU 35.A H 2.706 1.913 GLU 38.A N PRO 34.A O GLU 38.A H 2.920 2.066 GLN 39.A N GLU 35.A O GLN 39.A H 2.943 2.137 MET 40.A N ILE 36.A O MET 40.A H 2.905 2.112 GLY 41.A N VAL 37.A O GLY 41.A H 2.891 2.061 HIS 44.A ND1 SER 29.A OG no hydrogen 2.412 N/A LYS 46.A NZ ILE 150.A O LYS 46.A HZ3 2.386 1.670 ILE 48.A N VAL 161.A O ILE 48.A H 2.905 2.209 LEU 49.A N VAL 183.A O LEU 49.A H 3.133 2.335 LEU 50.A N GLY 163.A O LEU 50.A H 2.885 2.166 CYS 56.A SG ILE 187.A O CYS 56.A HG 3.732 2.655 ALA 62.A N LYS 58.A O ALA 62.A H 3.424 2.626 ARG 63.A N THR 59.A O ARG 63.A H 2.938 2.108 GLN 64.A N LEU 60.A O GLN 64.A H 2.913 2.063 ILE 65.A N LEU 61.A O ILE 65.A H 2.934 2.085 GLY 66.A N ALA 62.A O GLY 66.A H 2.910 2.063 LYS 67.A N ARG 63.A O LYS 67.A H 2.904 2.108 MET 68.A N GLN 64.A O MET 68.A H 2.951 2.132 LEU 69.A N ILE 65.A O LEU 69.A H 3.416 2.579 ASN 70.A N LYS 67.A O ASN 70.A H 3.200 2.354 ARG 72.A N LEU 114.A O ARG 72.A H 3.445 2.614 LYS 75.A N ILE 116.A O LYS 75.A H 3.432 2.599 GLY 79.A N ASN 78.A OD1 GLY 79.A H 2.814 2.200 ILE 82.A N GLY 79.A O ILE 82.A H 3.086 2.347 LEU 83.A N GLU 81.A O LEU 83.A H 2.949 2.345 TYR 86.A N ASN 84.A OD1 TYR 86.A H 3.140 2.359 ILE 94.A N SER 90.A O ILE 94.A H 2.936 2.118 ARG 95.A N GLU 91.A O ARG 95.A H 2.879 2.061 LYS 96.A N ALA 92.A O LYS 96.A H 2.930 2.163 LEU 97.A N ILE 94.A O LEU 97.A H 3.398 2.550 PHE 98.A N ARG 95.A O PHE 98.A H 3.415 2.617 GLU 102.A N PHE 98.A O GLU 102.A H 2.960 2.148 GLU 103.A N ALA 99.A O GLU 103.A H 2.921 2.091 GLU 104.A N ASP 100.A O GLU 104.A H 2.928 2.083 GLN 105.A N ALA 101.A O GLN 105.A H 2.907 2.062 GLN 105.A NE2 ASN 158.A OD1 GLN 105.A HE21 3.451 2.769 ARG 106.A N GLU 102.A O ARG 106.A H 2.893 2.060 ARG 107.A N GLU 103.A O ARG 107.A H 2.943 2.141 LEU 108.A N GLU 104.A O LEU 108.A H 2.904 2.139 GLY 109.A N GLN 105.A O GLY 109.A H 3.241 2.557 ILE 117.A N LEU 160.A O ILE 117.A H 3.312 2.532 ILE 122.A N MET 164.A O ILE 122.A H 3.257 2.439 ALA 124.A N GLU 121.A O ALA 124.A H 2.751 1.894 ILE 125.A N ILE 122.A O ILE 125.A H 3.306 2.569 CYS 126.A SG LEU 170.A O CYS 126.A HG 3.601 2.556 SER 131.A N GLN 128.A O SER 131.A H 2.916 2.125 SER 131.A OG GLN 128.A OE1 SER 131.A HG 3.152 2.514 MET 132.A N ARG 129.A O MET 132.A H 3.210 2.601 VAL 142.A N HIS 139.A O VAL 142.A H 2.821 1.987 VAL 143.A N ASP 140.A O VAL 143.A H 2.920 2.292 GLN 145.A N THR 141.A O GLN 145.A H 3.199 2.400 LEU 146.A N VAL 142.A O LEU 146.A H 3.412 2.626 LEU 147.A N VAL 143.A O LEU 147.A H 3.266 2.467 SER 148.A N ASN 144.A O SER 148.A H 3.119 2.324 SER 148.A OG ASN 144.A O SER 148.A HG 3.485 2.669 LYS 149.A N LEU 146.A O LYS 149.A H 2.927 2.147 ILE 150.A N LEU 146.A O ILE 150.A H 3.281 2.494 ASP 151.A N LEU 147.A O ASP 151.A H 2.876 1.988 GLU 154.A N GLU 154.A OE1 GLU 154.A H 2.400 1.606 ASN 158.A ND2 ALA 101.A O ASN 158.A HD21 3.665 2.830 LEU 160.A N HIS 115.A O LEU 160.A H 3.195 2.586 ILE 162.A N ILE 117.A O ILE 162.A H 3.359 2.525 GLY 163.A N ILE 48.A O GLY 163.A H 2.925 2.091 THR 165.A N LEU 50.A O THR 165.A H 2.914 2.243 LEU 170.A N ARG 167.A O LEU 170.A H 3.062 2.209 GLU 173.A N GLU 173.A OE1 GLU 173.A H 2.310 1.688 ALA 174.A N ASP 172.A OD1 ALA 174.A H 2.396 1.623 LEU 175.A N ASP 172.A O LEU 175.A H 3.149 2.309 ARG 177.A NH1 ALA 174.A O ARG 177.A HH11 2.848 2.088 ARG 180.A N ARG 177.A O ARG 180.A H 3.167 2.387 GLU 186.A N GLU 186.A OE1 GLU 186.A H 2.296 1.619 ILE 187.A N TYR 51.A O ILE 187.A H 3.317 2.569 GLY 194.A N ASP 191.A OD1 GLY 194.A H 2.861 2.036 ARG 195.A N ASP 191.A O ARG 195.A H 2.754 1.915 ARG 195.A NE ALA 222.A O ARG 195.A HE 3.327 2.469 ARG 195.A NH2 GLU 192.A OE1 ARG 195.A HH21 2.634 1.962 LEU 196.A N GLU 192.A O LEU 196.A H 2.917 2.082 GLN 197.A N LYS 193.A O GLN 197.A H 2.904 2.067 ILE 198.A N GLY 194.A O ILE 198.A H 2.908 2.076 LEU 199.A N ARG 195.A O LEU 199.A H 2.929 2.074 HIS 200.A N LEU 196.A O HIS 200.A H 2.893 2.068 ILE 201.A N GLN 197.A O ILE 201.A H 2.915 2.104 HIS 202.A N ILE 198.A O HIS 202.A H 2.945 2.095 HIS 202.A ND1 ILE 198.A O no hydrogen 2.888 N/A THR 203.A N HIS 200.A O THR 203.A H 3.224 2.422 HIS 209.A N MET 206.A O HIS 209.A H 3.044 2.371 GLN 210.A N ARG 207.A O GLN 210.A H 3.258 2.409 LEU 211.A N MET 206.A O LEU 211.A H 3.267 2.602 ASP 215.A N SER 213.A OG ASP 215.A H 3.216 2.367 ALA 222.A N ILE 218.A O ALA 222.A H 2.955 2.143 VAL 223.A N LYS 219.A O VAL 223.A H 2.908 2.081 GLU 224.A N GLU 220.A O GLU 224.A H 2.905 2.089 THR 225.A N LEU 221.A O THR 225.A H 3.215 2.372 THR 225.A OG1 LEU 221.A O THR 225.A HG1 3.081 2.271 THR 225.A OG1 ALA 222.A O THR 225.A HG1 3.100 2.673 ASN 227.A ND2 PHE 284.A O ASN 227.A HD21 2.409 1.712 LEU 233.A N GLY 230.A O LEU 233.A H 3.154 2.463 GLY 235.A N ALA 231.A O GLY 235.A H 2.939 2.101 LEU 236.A N GLU 232.A O LEU 236.A H 2.859 2.038 VAL 237.A N LEU 233.A O VAL 237.A H 2.949 2.143 ARG 238.A N GLU 234.A O ARG 238.A H 2.921 2.084 ALA 239.A N GLY 235.A O ALA 239.A H 2.897 2.052 ALA 240.A N LEU 236.A O ALA 240.A H 2.877 2.038 GLN 241.A N VAL 237.A O GLN 241.A H 2.950 2.111 SER 242.A N ARG 238.A O SER 242.A H 2.933 2.100 THR 243.A N ALA 239.A O THR 243.A H 2.896 2.050 ALA 244.A N ALA 240.A O ALA 244.A H 2.897 2.051 MET 245.A N GLN 241.A O MET 245.A H 2.944 2.097 ASN 246.A N SER 242.A O ASN 246.A H 2.922 2.091 ARG 247.A N THR 243.A O ARG 247.A H 2.885 2.041 HIS 248.A N ALA 244.A O HIS 248.A H 2.921 2.081 ILE 249.A N MET 245.A O ILE 249.A H 2.925 2.082 LYS 250.A N ASN 246.A O LYS 250.A H 2.930 2.086 ALA 251.A N ARG 247.A O ALA 251.A H 2.902 2.058 SER 252.A N HIS 248.A O SER 252.A H 2.903 2.071 THR 253.A N ILE 249.A O THR 253.A H 2.901 2.080 LYS 254.A N LYS 250.A O LYS 254.A H 2.910 2.100 VAL 255.A N ALA 251.A O VAL 255.A H 2.913 2.089 GLU 263.A N MET 259.A O GLU 263.A H 2.919 2.152 GLU 263.A N GLU 263.A OE1 GLU 263.A H 3.053 2.309 SER 264.A OG GLU 260.A O SER 264.A HG 3.186 2.389 LEU 273.A N ARG 269.A O LEU 273.A H 3.260 2.433 ALA 274.A N GLY 270.A O ALA 274.A H 2.917 2.066 SER 275.A N ASP 271.A O SER 275.A H 2.901 2.051 LEU 276.A N PHE 272.A O LEU 276.A H 2.893 2.051 GLU 277.A N LEU 273.A O GLU 277.A H 2.927 2.121 ASN 278.A N SER 275.A O ASN 278.A H 3.362 2.584 ASN 278.A ND2 ASP 279.A OD1 ASN 278.A HD22 2.611 1.816 ASP 279.A N SER 275.A O ASP 279.A H 2.892 2.058 LYS 281.A NZ ASN 278.A O LYS 281.A HZ2 2.735 1.865 ASP 290.A N ASN 287.A OD1 ASP 290.A H 2.854 2.075 TYR 291.A N GLN 288.A O TYR 291.A H 3.320 2.586 ALA 292.A N GLU 289.A O ALA 292.A H 3.240 2.583 SER 293.A N ASP 290.A O SER 293.A H 2.993 2.243 TYR 294.A N TYR 291.A O TYR 294.A H 3.162 2.324 ILE 295.A N TYR 291.A O ILE 295.A H 3.185 2.343 ARG 308.A N ASP 304.A O ARG 308.A H 3.308 2.507 VAL 309.A N PRO 305.A O VAL 309.A H 2.908 2.078 LEU 310.A N VAL 306.A O LEU 310.A H 2.942 2.097 ASP 311.A N THR 307.A O ASP 311.A H 2.889 2.050 ASP 312.A N ARG 308.A O ASP 312.A H 2.924 2.089 GLY 313.A N VAL 309.A O GLY 313.A H 2.916 2.075 GLU 314.A N LEU 310.A O GLU 314.A H 2.932 2.106 LEU 315.A N ASP 311.A O LEU 315.A H 2.899 2.081 LEU 316.A N ASP 312.A O LEU 316.A H 2.934 2.109 VAL 317.A N GLY 313.A O VAL 317.A H 2.907 2.080 GLN 318.A N.A GLU 314.A O GLN 318.A H.A 2.909 2.069 GLN 318.A N.B GLU 314.A O GLN 318.A H.B 2.910 2.071 GLN 318.A NE2.A GLU 314.A OE1 GLN 318.A HE21.A 3.538 2.917 GLN 319.A N LEU 315.A O GLN 319.A H 2.905 2.080 THR 320.A N LEU 316.A O THR 320.A H 2.934 2.118 THR 320.A OG1 LEU 432.A O THR 320.A HG1 3.552 2.939 LYS 321.A N VAL 317.A O LYS 321.A H 2.932 2.184 LEU 332.A N THR 455.A O LEU 332.A H 3.090 2.403 GLU 334.A N ILE 457.A O GLU 334.A H 3.092 2.336 SER 339.A N PRO 336.A O SER 339.A H 3.330 2.628 SER 339.A OG PRO 336.A O SER 339.A HG 2.242 1.647 LYS 341.A NZ GLY 335.A O LYS 341.A HZ3 2.591 1.923 LYS 341.A NZ THR 438.A O LYS 341.A HZ2 2.595 1.948 LYS 341.A NZ SER 439.A OG LYS 341.A HZ1 2.961 2.186 ALA 345.A N LYS 341.A O ALA 345.A H 3.165 2.335 ALA 346.A N THR 342.A O ALA 346.A H 2.905 2.064 LYS 347.A N ALA 343.A O LYS 347.A H 2.898 2.087 ILE 348.A N LEU 344.A O ILE 348.A H 2.933 2.095 ALA 349.A N ALA 345.A O ALA 349.A H 2.933 2.093 GLU 350.A N ALA 346.A O GLU 350.A H 2.864 2.053 GLU 351.A N LYS 347.A O GLU 351.A H 2.947 2.159 SER 352.A N ALA 349.A O SER 352.A H 3.308 2.473 ASN 353.A N GLU 350.A O ASN 353.A H 3.356 2.501 PHE 354.A N SER 352.A OG PHE 354.A H 3.088 2.303 LYS 358.A N CYS 391.A O LYS 358.A H 2.920 2.103 CYS 360.A N VAL 393.A O CYS 360.A H 2.869 2.010 ASP 363.A N SER 361.A OG ASP 363.A H 3.188 2.405 MET 365.A N PRO 362.A O MET 365.A H 2.942 2.192 GLU 370.A N GLU 370.A OE1 GLU 370.A H 2.282 1.455 LYS 373.A N SER 369.A O LYS 373.A H 3.096 2.310 CYS 374.A N GLU 370.A O CYS 374.A H 2.951 2.136 GLN 375.A N THR 371.A O GLN 375.A H 2.955 2.118 ALA 376.A N ALA 372.A O ALA 376.A H 2.893 2.061 MET 377.A N LYS 373.A O MET 377.A H 2.956 2.110 LYS 378.A N CYS 374.A O LYS 378.A H 2.921 2.073 LYS 379.A N.A GLN 375.A O LYS 379.A H.A 2.900 2.077 LYS 379.A N.B GLN 375.A O LYS 379.A H.B 2.897 2.073 LYS 379.A NZ.A ASP 383.A OD2 LYS 379.A HZ3.A 3.382 2.665 LYS 379.A NZ.B GLN 375.A OE1 LYS 379.A HZ2.B 3.449 2.855 ILE 380.A N ALA 376.A O ILE 380.A H.A 2.933 2.101 PHE 381.A N MET 377.A O PHE 381.A H 2.994 2.154 ASP 382.A N LYS 378.A O ASP 382.A H 2.860 2.020 ASP 383.A N LYS 379.A O.A ASP 383.A H 2.910 2.069 ASP 383.A N LYS 379.A O.B ASP 383.A H 2.911 2.071 ALA 384.A N ILE 380.A O ALA 384.A H 2.929 2.104 TYR 385.A N PHE 381.A O TYR 385.A H 2.925 2.214 TYR 385.A N ASP 382.A O TYR 385.A H 3.160 2.541 LYS 386.A N ASP 383.A O LYS 386.A H 3.125 2.273 SER 387.A OG LEU 389.A O SER 387.A HG 2.957 2.442 SER 390.A OG ALA 384.A O SER 390.A HG 2.918 2.095 CYS 391.A N PHE 356.A O CYS 391.A H 2.916 2.255 VAL 392.A N LEU 433.A O VAL 392.A H 3.270 2.418 VAL 393.A N LYS 358.A O VAL 393.A H 2.902 2.162 VAL 394.A N ILE 435.A O VAL 394.A H 3.213 2.355 ASP 395.A N CYS 360.A O ASP 395.A H 3.130 2.352 ILE 397.A N THR 437.A O ILE 397.A H 3.191 2.347 LEU 400.A N ASP 396.A O LEU 400.A H 3.374 2.561 LEU 401.A N ILE 397.A O LEU 401.A H 3.287 2.507 ASP 402.A N ARG 399.A O ASP 402.A H 3.220 2.429 SER 411.A N LEU 401.A O SER 411.A H 3.406 2.595 GLN 416.A N ASN 412.A O GLN 416.A H 2.941 2.100 ALA 417.A N LEU 413.A O ALA 417.A H 2.911 2.070 LEU 418.A N VAL 414.A O LEU 418.A H 2.907 2.059 LEU 419.A N LEU 415.A O LEU 419.A H 2.930 2.090 VAL 420.A N GLN 416.A O VAL 420.A H 2.924 2.079 LEU 421.A N ALA 417.A O LEU 421.A H 2.907 2.073 LEU 422.A N LEU 418.A O LEU 422.A H 2.952 2.150 LYS 423.A N VAL 420.A O LYS 423.A H 3.187 2.350 ARG 430.A NE GLN 388.A OE1 ARG 430.A HE 3.485 2.750 LYS 431.A N GLN 388.A O LYS 431.A H 3.241 2.381 LYS 431.A NZ LYS 321.A O LYS 431.A HZ3 3.379 2.775 GLY 436.A N VAL 331.A O GLY 436.A H 3.170 2.345 ARG 440.A N THR 438.A OG1 ARG 440.A H 3.376 2.525 VAL 443.A N ASP 442.A OD1 VAL 443.A H 2.466 1.746 GLN 445.A N LYS 441.A O GLN 445.A H 2.871 2.020 GLU 446.A N ASP 442.A O GLU 446.A H 2.940 2.107 MET 447.A N VAL 443.A O MET 447.A H 2.890 2.247 MET 447.A N LEU 444.A O MET 447.A H 3.099 2.415 GLU 448.A N GLN 445.A O GLU 448.A H 2.843 2.007 ALA 452.A N MET 449.A O ALA 452.A H 2.771 1.984 ILE 457.A N LEU 332.A O ILE 457.A H 3.063 2.366 VAL 459.A N GLU 334.A O VAL 459.A H 3.075 2.295 ASN 461.A ND2 SER 339.A OG ASN 461.A HD22 2.978 2.147 ALA 463.A N GLN 467.A OE1 ALA 463.A H 3.222 2.367 THR 464.A N GLN 467.A OE1 THR 464.A H 3.170 2.558 GLU 466.A N GLU 466.A OE1 GLU 466.A H 2.427 1.633 GLN 467.A N THR 464.A OG1 GLN 467.A H 3.286 2.480 LEU 468.A N THR 464.A O LEU 468.A H 3.280 2.479 LEU 469.A N GLY 465.A O LEU 469.A H 2.897 2.088 GLU 470.A N GLU 466.A O GLU 470.A H 2.898 2.068 ALA 471.A N GLN 467.A O ALA 471.A H 2.912 2.084 LEU 472.A N LEU 468.A O LEU 472.A H 2.911 2.069 GLU 473.A N LEU 469.A O GLU 473.A H 2.888 2.058 LEU 474.A N GLU 470.A O LEU 474.A H 2.903 2.063 LEU 475.A N ALA 471.A O LEU 475.A H 2.915 2.070 GLY 476.A N LEU 472.A O GLY 476.A H 2.592 1.754 LYS 479.A N GLU 482.A OE1 LYS 479.A H 2.993 2.170 ARG 483.A N LYS 479.A O ARG 483.A H 2.916 2.112 ARG 483.A NH2 PHE 478.A O ARG 483.A HH22 2.265 1.641 THR 484.A N ASP 480.A O THR 484.A H 2.891 2.075 THR 485.A N LYS 481.A O THR 485.A H 2.907 2.068 THR 485.A OG1 LYS 481.A O THR 485.A HG1 2.796 1.958 ILE 486.A N GLU 482.A O ILE 486.A H 2.909 2.081 ALA 487.A N ARG 483.A O ALA 487.A H 2.878 2.037 GLN 488.A N THR 484.A O GLN 488.A H 2.909 2.080 GLN 489.A N THR 485.A O GLN 489.A H 2.914 2.101 VAL 490.A N ILE 486.A O VAL 490.A H 2.893 2.250 LYS 493.A N VAL 490.A O LYS 493.A H 3.291 2.451 LYS 493.A NZ LYS 491.A O LYS 493.A HZ2 2.757 1.906 LEU 502.A N GLY 498.A O LEU 502.A H 2.915 2.118 LEU 503.A N ILE 499.A O LEU 503.A H 2.923 2.106 MET 504.A N LYS 500.A O MET 504.A H 2.957 2.111 LEU 505.A N LYS 501.A O LEU 505.A H 2.870 2.060 ILE 506.A N LEU 502.A O ILE 506.A H 2.902 2.071 GLU 507.A N LEU 503.A O GLU 507.A H 2.967 2.128 MET 508.A N MET 504.A O MET 508.A H 2.909 2.089 SER 509.A N LEU 505.A O SER 509.A H 2.862 2.059 LEU 510.A N ILE 506.A O LEU 510.A H 2.961 2.196 GLU 515.A N GLU 515.A OE1 GLU 515.A H 2.612 1.864 ARG 517.A NE MET 512.A O ARG 517.A HE 2.427 1.723 ARG 517.A NH2 MET 512.A O ARG 517.A HH21 2.506 1.811 LYS 520.A N TYR 516.A O LYS 520.A H 3.193 2.349 PHE 521.A N ARG 517.A O PHE 521.A H 2.908 2.063 LEU 522.A N VAL 518.A O LEU 522.A H 2.910 2.073 ALA 523.A N ARG 519.A O ALA 523.A H 2.893 2.050 LEU 524.A N LYS 520.A O LEU 524.A H 2.937 2.095 LEU 525.A N PHE 521.A O LEU 525.A H 2.893 2.068 ARG 526.A N LEU 522.A O ARG 526.A H 2.925 2.081 GLU 527.A N ALA 523.A O GLU 527.A H 2.926 2.137 GLU 528.A N LEU 525.A O GLU 528.A H 3.244 2.571 ALA 530.A N GLU 528.A O ALA 530.A H 2.955 2.297