135LA

X-ray structure of monoclinic turkey egg lysozyme at 1.3 angstroms resolution
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Meleagris gallopavo
publication title X-ray structure of monoclinic turkey egg lysozyme at 1.3 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TURKEY EGG WHITE LYSOZYME
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 135lA00
3A96A 4WG1A 5KXXA 1DPWA 1TDYA 1LPIA 1D6PA 5KXKA 4GCEA 5I53A 1LKRA 1OUFA 1T6VL 5E4PA 2C8OA 5KXSA 3HBHA 3A90A 1UC0A 4HJVA 2G4PA 4DD1A 1LSFA 2C8PA 1TEWA 1HMKA 1UBZA 3K3TA 4AGAA 1IIZA 1IOCA 1B5XA 2D4IA 4WG7A 1GB6A 3LYMA 1IP6A 1LJJA 4NGYA 2MEIA 1LJNA 5LAGA 1GE4A 3AB6A 1GAYA 1GBWA 5FSTA 5LA5A 2CJLA 3W3EA 4DYGA 3EO5A 4ETBA 1BB5A 3HBEX 3IJUA 1WTMA 1B5VA 5LYMA 2XBSA 2YBNA 1OUGA 1GWDA 1JSFA 1PS5A 5FCPA 1LZ4A 4NSHA 3ATOA 194LA 1YL1X 2BQHA 4OOTA 1V7SA 3TXFA 1GFTA 1IC4Y 4XADA 1JWRA 2CGIA 3WPKA 1JISA 1GAZA 1QUSA 1VAUA 3WH1A 3FI7A 3WXTA 4DD7A 1KXXA 4YOPA 1XGUC 3N9EA 1B7OA 2MEAA 2BLXA 4BADA 1UIAA 4PHIA 3RNXA 1JPOA 1P2CC 5KKIA 2Q0MX 2Z19A 1C43A 4N5RA 1EQEA 3WU9A 4E3UA 1BGIA 1JIYA 1J1OY 2BQAA 1YKXX 1LYYA 1EQ5A 3RZ4A 5FDJA 4AXTA 4OW1A 2BLYA 5F9UA 1Z55A 4DDAA 1RCMA 1NBZC 134LA 1W6ZA 3TXDA 1YAQA 2BQBA 4TX7A 1YL0X 2EQLA 1LZEA 3EBAB 5HQ1A 3WULA 4Z41A 4NGWA 1GBZA 1G7IC 2IHLA 1J1XY 1GE0A 1QDTA 2DQJY 1GFUA 1OUEA 5ILCA 4OWHA 1LZNA 1YANA 3B6LA 1JITA 5D5CA 4HTKA 1IWXA 2MEDA 3TMWA 1JJ1A 3A3QA 1CNSA 1LYSA 4H8ZA 4RLMA 4XJGA 4H9FA 5ILFA 3G3AB 1LJ3A 1LHIA 5KKJA 4FDYA 2XBRA 4XJHA 3N9CA 1B7NA 1YAMA 3A94A 1VDTA 2YVBA 3AW7A 3SP3A 1GF3A 5J7CA 4HTQA 4WM5A 1FN5A 3RU5A 1G7HC 5II3A 4LYMA 3B0KA 2W1LA 3P65A 3W6DA 3WW6A 4HV2A 2MEHA 1IP7A 4LYCA 1AT5A 2Z39A 1LJEA 1H6MA 2W1YA 2YBMA 3CB7A 4WM3A 1UACY 1FLQA 1NF5A 4GN3A 1B5ZA 5I4XA 5LYTA 1DI5A 2MEFA 2HEFA 5AMYA 2Z37A 2DQCY 3WW5A 5KXYA 4B0DA 1B7PA 4NHSA 3W6EA 1IO5A 1LMOA 1V7TA 2VB1A 2A7FA 3MGWA 3T6UA 1LZ5A 2FBBA 3A91A 1YQVY 1HSWA 4TSCA 2CDSA 2EIZC 1VATA 5FEKA 5JENB 1OUIA 1BWJA 1GB8A 1GFVA 1LSMA 1RJCB 1HEOA 1F0WA 1YIKA 1GFHA 5EBHA 5E9RA 5KXRA 1MLCE 4ML7A 4KL7A 4LYBA 2YBIA 4XJIA 1LSYA 1QTKA 5I5QA 1LZSA 1LZGA 1GFKA 1IP5A 3OJPA 5APEA 4RW2A 1LSCA 3WUNA 1OUHA 1G7MC 1GF7A 1UIEA 4CHXA 4M4OA 1B5WA 1HNLA 4QY9A 4NHTA 1D0LA 3D3DA 3TXHA 4DD2A 2DQDY 1LMQA 1FKVA 2I6ZA 3AGGG 1YKZX 5A3ZA 2I26L 1HEMA 3A92A 1LJHA 2ZILA 3ZVQA 4P2EA 1BVKC 1NKHA 1NDGC 1IP3A 5KJ9A 5LXWA 1QSAA 2YBLA 4WM2A 5DN5A 4NG8A 1LHLA 1LSPA 1WQOA 2ZQ3A 4WL7A 4CFPA 5L9JA 1JKDA 1HF4A 1I20A 1LYOA 3M18B 3TXGA 1JTTL 4DWXA 3WMKA 4J1BA 5LIOA 1N4FA 1XGPC 1AZFA 4LFPA 4GN5C 1DQJC 5HMJA 1QUTA 6LYTA 2ZYPA 4B4IA 1NHEA 4ETCA 1NQIA 4LT1A 5HNCA 3P68A 2Z2FA 1QDRA 1CKDA 1GFRA 5F14A 1C10A 1LSZA 4ZIXA 1FLWA 1UUZC 135LA 1VFBC 4H9BA 4TSBA 1WQRA 4GCDA 1MELL 2YBHA 5IELA 1ZV5L 1IWUA 3WVXA 1CJ6A 1OUBA 4DT3A 2BPUA 1GB2A 1CKCA 4IJ4A 2EKSC 2Z38A 3CSZA 4G4CA 3T36A 1BB7A 3CT5A 5HLLA 1HFYA 5LVKA 4LFXA 9LYZA 1AM7A 2HEBA 4R6CA 5KXZA 1A4VA 4OWAA 4HJYA 1HC0A 4ET9A 1B2KA 154LA 1WQMA 4WO6A 1JUGA 1W08A 1HERA 1D9UA 4Z3MA 1JTPL 2Z2EA 1KIPC 1XSFA 3M3UA 5KXWA 5DN4A 5KXTA 4ZEEA 2XTHA 1REZA 2EPEA 1RFPA 3ATNA 1IWZA 1FLUA 4H8YA 4H9EA 1A2YC 4MSTA 1LZCA 2ZYCA 3RW8A 1GF5A 4H9AA 3GXRA 1XFPL 4DD3A 1IOQA 4NGIA 1LKSA 2MECA 3A6BY 153LA 1G7LC 4RW1A 1LSEA 5LYZA 4ZFPA 1IEEA 1LMPA 1NMMA 1UIHA 5APDA 3W6BA 4U3XB 3WU8A 1HELA 2DQGY 3LZTA 4H8XA 1J1PY 4BAFA 3IWRA 1OUAA 2LYZA 3CSQA 1IP2A 3WU7A 1IY3A 1LZRA 4HSFA 1FDLY 4GCBA 4WL6A 4WLYA 2AUBA 1I56A 1GFEA 2H9JA 1B7MA 1BWHA 4LYZA 4NHIA 4WO9A 4XJFA 2FBDA 3CT1A 1GDWA 1EQ4A 3D9AC 1TAYA 3AYQA 4XJBA 3OK0A 3KAMA 1GBSA 1PZYA 3AW6A 3WUMA 4DC4A 1F6RA 4LYTA 5KXPA 3ZVQB 1HMLA 1GBXA 2DQIY 1LZ8A 1SQ2L 2W1XA 3ZEKA 1GEVA 1OUJA 3FE0A 5T3FA 5LVGA 4YENA 4H94A 2G4QA 5C6JA 4GCFA 1IWVA 1UIDA 2DKVA 1LSBA 4QGZA 1LHJA 4G9SA 3QNGA 3HFMY 1B9OA 2LYMA 3WPJA 8LYZA 4BAPA 193LA 4DD9A 1B5UA 5B1GA 1LSNA 1B7SA 2LHMA 2BQFA 2YSSC 1ZVYB 1HEWA 5APFA 1SLYA 1XGQC 3EXDA 3P4ZA 4IATA 4TTDA 3AZ4A 1OUDA 3TXBA 2LYOA 4WOAA 1CKFA 1LSGA 2D91A 1GFGA 1GFAA 1WVVA 1WQNA 5DLAA 3AZ5A 1DKJA 1JHLA 1F10A 1TBYA 1JJ3A 4NIJA 133LA 3ULRA 5FELA 4H9IA 4NWEA 5HNLA 3BKHA 2F4GA 1HFXA 3AGHA 2HU3A 3B72A 4BS7A 3E3DA 2ZQ4A 3TXEA 1LSAA 2BQJA 5KXMA 4H9HA 1BHZA 1LHMA 4YEMA 2BQIA 4PGJB 2BAAA 1HFZA 207LA 2Y8PA 1LZ1A 3AGIA 4NGJA 4WM1A 1C08C 1NBYC 1LTMA 7LYZA 1DKKA 4OWEA 1VEDA 1I1ZA 4LT3A 4I0CA 1HENA 3RT5X 3LYOA 4W94A 5KXNA 4J7VA 1IWWA 2XJWA 4KPMA 1BB3A 6LYZA 4WM6A 1FLYA 2ZIKA 1IC7Y 1LYZA 4MCKA 1GF8A 4RLNA 2Z12A 2GV0A 1JJ0A 1B7LA 1REMA 3B0OA 5D5FA 4UWUA 4YM8A 4CJ2A 1CKHA 1FKQA 2ZIJA 4HJZA 4TUNA 1LZYA 2F2NA 1JKCA 4HTNA 1REXA 2BQLA 2D6BA 2BQDA 2H5ZA 3A6CY 1GE2A 1IX0A 2HEAA 4L41A 4LZTA 4NGLA 3TMXA 1E8LA 4QDNA 1YILA 3GXKA 3EMSA 4B4EA 2D4KA 2HEEA 1OP9B 3QY4A 2BQMA 2BQKA 1TCYA 4G49A 1JTOL 3F6ZA 4H92A 4TWSA 1C7PA 3CSRA 4C5FA 4WLTA 4EMNA 5B05A 4RDSA 2W1MA 4PRQA 3B0IA 3A67Y 2HEDA 4ETEA 1DI3A 1YKYX 1KXWA 2HUBA 4G4BA 4O34A 4A7DA 4LT2A 1KIRC 1LZBA 4NGOA 4II8A 1EL1A 5K7OA 2RSCA 1UIBA 2LZTA 1IOTA 4GN4A 4NEBA 1B5YA 2LZ2A 1GXXA 4WM4A 5B07A 1GF0A 3W6FA 1BB6A 4NFVA 5APCA 1XEKA 4G4HA 1D0KA 1ZVHL 1GE1A 4N0JA 2MEGA 1LJGA 4B4JA 1CJ8A 1JSEA 4NG1A 4Z98A 2DQFC 1GB7A 3LHMA 4NWHA 3P66A 1YAPA 1RE2A 1VDPA 2ZWBA 3WUAA 5KXLA 2MEEA 3WL2A 1BVXA 1IWYA 2HECA 1VDSA 1B0DA 1JKAA 2A7DA 3W6CA 1JKBA 1IY4A 1HEQA 1LMNA 2DQEY 3LYZA 3A3RX 1XGRC 3LZ2A 5B59A 1IP1A 5F16A 1GF4A 1H87A 2IFFY 1GBOA 2NWDX 4NSJA 5B1FA 2DQAA 4DDCA 3A8ZA 4ETDA 5A3EA 5L3HA 5M1YA 3WVYA 1LMTA 3LN2A 1RI8B 1WQQA 1XEJA 1LJIA 5C6LA 3BKVA 1D6QA 2BQCA 1XGTC 4H91A 1BWIA 1LOZA 4N1EI 5I4WA 4FJRA 3N9AA 4X3BA 4UWNA 3AZ6A 1LZAA 3AZ7A 4DD0A 5LINA 1DPXA 4XYYA 1YROA 4EOFA 1DXJA 1OUCA 2YBJA 1IWTA 1LHHA 5HMVA 4NGKA 1FBIX 2BQOA 3A34A 4PJ2C 3J4GA 1IR8A 1GB5A 4OWCA 1UA6Y 1GXV2 4YEOA 5FHWA 5LVIA 3WXUA 1GB9A 1GB3A 4N9RA 4MR1A 132LA 4R0FA 1IP4A 1O23A 5C6IA 1IORA 2BQNA 1LHKA 5KY1A 1DZBX 1QQYA 1B7QA 4H90A 1YAOA 1HSXA 5L3IA 1GFJA 3A95A 2YDGA 4QEQA 1GE3A 4B49A 4XENA 2DBTA 4HPIA 4J0LA 1LMAA 4GLAA 2G4NA 5IDDA 4OWBA 3TXIA 1LMCA 2FYCA 4DDBA 2BQGA 3QE8A 1GBYA 1UICA 1IOSA 5I4YA 1C45A 2HTXA 5B06A 3J6KA 5LVHA 1IC5Y 2F4AA 5LAFA 1UIGA 2F30A 4NHPA 4I8SA 4C3WA 5LA8A 4HV1A 1OQMA 1GDXA 3G3BB 1QIOA 1G7JC 2I25L 1CKGA 1DI4A 4GCCA 4WLXA 4CGEA 1B7RA 1KXYA 1LJKA 5IHGA 2B5ZA 1BQLY 1ZMYL 1IR9A 3W6AA 4NGZA 1HHLA 4B1AA 4D9ZA 1WTNA 1QSWA 2ZNXY 5I54A 4LGKA 1GF9A 4NSIA 1LJ4A 4LT0A 2DQHY 1REYA 3WPLA 1GB0A 4CFOA 1C46A 2CWIA 1XEIA 1IVMA 4UWVA 2X0AA 3TXJA 3WYHA 1D0MA 5KXOA 2PC2A 1GF6A 3AJNA 2BQEA 1GPQC 5LVJA 4H93A 4H1PA 4NHQA 5DM9A 4WLDA 4WMGA 1BB4A 4OOOA 2WARA 1GHLA 2H9KA 4H9CA 4KT3A 1HEPA 1IR7A 3CQLA 2N5ZA 1UIFA 3P64A 4HP0A 3LYTA 1WVUA 4ET8A 4NSGA 1GD6A 1UCOA 1CJ7A 4LYOA 2MEBA 4N8ZA 4PRUA 4M6DA 3VWOA 1WQPA 3TMUA 5F81A 4Z46A 1ALCA 2D4JA 4NY5A 1QTEA 3IJVA 4HPEA 1AKIA 1CJ9A 1LZ6A 4GLVA 4W96A 4KXIA 4XJDA 1GEZA 1KIQC 1INUA 1LZTA 4PPOA 2FYDA 3TXKA 1LJFA 4ETAA 208LA 1LAAA 4IASA 1NWGA 1JEFA 4N1CC 2Z18A 1LZ9A 4J1AA 4NGVA 1AT6A 1T3PA 3TMVA 4XN6A 1LCNA 1VDQA 3HBDA 5F9XA 4ANRA 3CT0A 4YF2A 1LZDA 1LSDA 1NDMC 2ZNWY 5DL9A 2HU1A 1F6SA 3A93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L32A 1G0JA 3C8RA 5I53A 1T6VL 2C8OA 5KXSA 1QSBA 3A90A 1G0GA 4DD1A 2C8PA 1TEWA 120LA 1GBWA 3W3EA 1B6IA 1BB5A 3IJUA 1B5VA 2B6XA 2XBSA 2YBNA 5FCPA 3G3WA 194LA 1JWRA 251LA 1P7SA 1VAUA 3WXTA 4DD7A 4YOPA 1XGUC 3DN6A 2BLXA 1UIAA 4PHIA 4W54A 2Q0MX 1C43A 143LA 3DNAA 118LA 2BLYA 4DDAA 2BQBA 4TX7A 3EBAB 3D4SA 1GFUA 1OUEA 4OWHA 3SB8A 1YANA 1JITA 1C6JA 3HH5A 1I6SA 1CNSA 4H9FA 5ILFA 1L60A 3G3AB 3A94A 1VDTA 5J7CA 5II3A 3B0KA 1L90A 3UONA 1CV5A 2Z39A 2YBMA 139LA 1UACY 3CDOA 1L79A 1B5ZA 5LYTA 2MEFA 1L73A 1D3MA 4B0DA 1IO5A 1V7TA 2VB1A 3A91A 4TSCA 1CUQA 1LSMA 1GFVA 1RJCB 1F0WA 5E9RA 1L91A 5I5QA 1LSYA 1QTKA 1L37A 206LA 1IP5A 1OUHA 3D3DA 3A92A 4I7LA 4P2EA 5LXWA 1NDGC 1IP3A 258LA 5KJ9A 5DN5A 4NG8A 1LHLA 1L74A 1C6DA 1L0JA 3WMKA 1AZFA 4B4IA 4ETCA 1GFRA 1QT5A 1FLWA 1UUZC 3HTFA 1WTHA 1C6TA 1ZV5L 1ZWNA 3WVXA 1OUBA 241LA 1GB2A 2EKSC 3CSZA 4I7PA 3RUNA 1AM7A 3HT9A 5KXZA 4HJYA 1B2KA 4Z3MA 3M3UA 3OE0A 1L16A 260LA 1PQJA 1DYFA 1L83A 1RFPA 1FLUA 1A2YC 1JQUA 1LKSA 2MECA 3A6BY 4I7QA 4RW1A 214LA 4BAFA 1CV3A 3LZMA 171LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A96 A;  4WG1 A;  5KXX A;  1DPW A;  1TDY A;  1LPI A;  1D6P A;  5KXK A;  4GCE A;  5I53 A;  1LKR A;  1OUF A;  1T6V L;  5E4P A;  2C8O A;  5KXS A;  3HBH A;  3A90 A;  1UC0 A;  4HJV A;  2G4P A;  4DD1 A;  1LSF A;  2C8P A;  1TEW A;  1HMK A;  1UBZ A;  3K3T A;  4AGA A;  1IIZ A;  1IOC A;  1B5X A;  2D4I A;  4WG7 A;  1GB6 A;  3LYM A;  1IP6 A;  1LJJ A;  4NGY A;  2MEI A;  1LJN A;  5LAG A;  1GE4 A;  3AB6 A;  1GAY A;  1GBW A;  5FST A;  5LA5 A;  2CJL A;  3W3E A;  4DYG A;  3EO5 A;  4ETB A;  1BB5 A;  3HBE X;  3IJU A;  1WTM A;  1B5V A;  5LYM A;  2XBS A;  2YBN A;  1OUG A;  1GWD A;  1JSF A;  1PS5 A;  5FCP A;  1LZ4 A;  4NSH A;  3ATO A;  194L A;  1YL1 X;  2BQH A;  4OOT A;  1V7S A;  3TXF A;  1GFT A;  1IC4 Y;  4XAD A;  1JWR A;  2CGI A;  3WPK A;  1JIS A;  1GAZ A;  1QUS A;  1VAU A;  3WH1 A;  3FI7 A;  3WXT A;  4DD7 A;  1KXX A;  4YOP A;  1XGU C;  3N9E A;  1B7O A;  2MEA A;  2BLX A;  4BAD A;  1UIA A;  4PHI A;  3RNX A;  1JPO A;  1P2C C;  5KKI A;  2Q0M X;  2Z19 A;  1C43 A;  4N5R A;  1EQE A;  3WU9 A;  4E3U A;  1BGI A;  1JIY A; 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 2F30 A;  4NHP A;  4I8S A;  4C3W A;  5LA8 A;  4HV1 A;  1OQM A;  1GDX A;  3G3B B;  1QIO A;  1G7J C;  2I25 L;  1CKG A;  1DI4 A;  4GCC A;  4WLX A;  4CGE A;  1B7R A;  1KXY A;  1LJK A;  5IHG A;  2B5Z A;  1BQL Y;  1ZMY L;  1IR9 A;  3W6A A;  4NGZ A;  1HHL A;  4B1A A;  4D9Z A;  1WTN A;  1QSW A;  2ZNX Y;  5I54 A;  4LGK A;  1GF9 A;  4NSI A;  1LJ4 A;  4LT0 A;  2DQH Y;  1REY A;  3WPL A;  1GB0 A;  4CFO A;  1C46 A;  2CWI A;  1XEI A;  1IVM A;  4UWV A;  2X0A A;  3TXJ A;  3WYH A;  1D0M A;  5KXO A;  2PC2 A;  1GF6 A;  3AJN A;  2BQE A;  1GPQ C;  5LVJ A;  4H93 A;  4H1P A;  4NHQ A;  5DM9 A;  4WLD A;  4WMG A;  1BB4 A;  4OOO A;  2WAR A;  1GHL A;  2H9K A;  4H9C A;  4KT3 A;  1HEP A;  1IR7 A;  3CQL A;  2N5Z A;  1UIF A;  3P64 A;  4HP0 A;  3LYT A;  1WVU A;  4ET8 A;  4NSG A;  1GD6 A;  1UCO A;  1CJ7 A;  4LYO A;  2MEB A;  4N8Z A;  4PRU A;  4M6D A;  3VWO A;  1WQP A;  3TMU A;  5F81 A;  4Z46 A;  1ALC A;  2D4J A;  4NY5 A;  1QTE A;  3IJV A;  4HPE A;  1AKI A;  1CJ9 A;  1LZ6 A;  4GLV A;  4W96 A;  4KXI A;  4XJD A;  1GEZ A;  1KIQ C; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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