148LE

A covalent enzyme-substrate intermediate with saccharide distortion in a mutant t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYEIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase substrate
source organism Enterobacteria phage t4
publication title A covalent enzyme-substrate intermediate with saccharide distortion in a mutant T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 148lE00
1L58A 1L64A 1CUPA 4I7RA 1CV3A 120LA 234LA 3RZEA 3G3WA 111LA 1C6BA 257LA 2B7XA 2B6TA 1PQIA 3HH4A 1L94A 1DYDA 1D3MA 216LA 2OTYX 1L51A 209LA 3HUQA 1L88A 138LA 1OVHA 3L2XA 1K28A 1P3NA 118LA 7LZMA 1NHBA 4LDOA 3OE8A 1QUOA 4I7TA 126LA 1L95A 3HT6A 2O79A 262LA 3G3VA 191LA 1G0GA 1L81A 3HTGA 4DJHA 151LA 2OE7X 222LA 2RBOA 230LA 2RB1X 2O4WA 1QT5A 1DYEA 115LA 210LA 1L70A 1L39A 199LA 1L18A 2IGCA 142LA 1C6PA 1LYDA 1QT6A 2OU8A 3HTBA 4I7PA 211LA 2HUMA 2QB0B 195LA 2HULA 4W59A 107LA 1OWYA 3OE0A 103LA 4GRVA 104LA 1B6IA 1C69A 1L13A 244LA 1L54A 237LA 125LA 2B75A 3PBLA 4LDLA 1L11A 1C67A 102LA 1CUQA 1CV6A 2RBQA 1P37A 3DN4A 3DKEX 3SN6R 1LI3A 1C6KA 3V2WA 3EMLA 255LA 190LA 254LA 5LZMA 1QS5A 1QTHA 128LA 1L29A 1C6GA 1G0LA 1QUGA 3DMVA 1L49A 2RB0X 162LA 3HUKA 1L56A 1L36A 1LGXA 1L83A 1JTMA 2LCBA 220LA 4PJZA 1L92A 2NTGA 1P56A 1L50A 1L47A 3HH5A 196LA 1C6JA 1D3FA 1LYEA 146LA 3D4SA 166LA 1C6EA 1L24A 3SB7A 186LA 1QT8A 3K2RA 3GUPA 1C6TA 1L76A 246LA 221LA 169LA 1KW5A 1P5CA 1KY1A 1L04A 3DNAA 178LA 1L46A 1CVKA 2HUKA 253LA 1SSWA 1OV5A 4ARMB 2Q9EA 1L38A 110LA 3HUAA 4YXCA 109LA 236LA 1G0JA 1L05A 3GUJA 1C6MA 113LA 228LA 119LA 1DYAA 4PK0A 1P36A 3OE9A 1L03A 1L21A 1CU2A 1L44A 1SX7A 3HU8A 238LA 1C64A 174LA 4I7LA 1L61A 1QSQA 4I7QA 2RBSA 3RUNA 4EKQA 1L82A 4EKSA 2OU0X 1LYGA 1OVJA 1OV7A 189LA 1TLAA 1L14A 1CV0A 1PQOA 1CV4A 1C6HA 1L99A 1C68A 1G06A 1L12A 4ARMA 218LA 5I14A 1CX7A 4ARLA 3CDQA 108LA 130LA 1L40A 1C6QA 1L30A 3SB8A 141LA 4I7JA 1CV5A 250LA 129LA 1QTBA 3G3XA 2B6WA 176LA 1C65A 112LA 2B73A 1QUDA 1P7SA 2RAZX 4EKPA 1L65A 1G0KA 231LA 1SWYA 2RH1A 1CU6A 4I7KA 3C7YA 3CDVA 1L57A 3C7ZA 155LA 227LA 3GUNA 4ARJA 180LA 1L01A 261LA 3L64A 1L74A 168LA 1OYUA 127LA 114LA 1C6AA 3HT7A 4EPFA 139LA 1LWGA 2OE4X 1T8FA 122LA 6LZMA 1L00A 1L89A 1P64A 1CU5A 4W57A 3CDRA 167LA 1LYFA 4GBRB 140LA 1KY0A 1QTDA 143LA 1L93A 3NY8A 1KW7A 1T6HA 1L41A 1G0PA 2LC9A 147LA 4YX7C 1QUHA 1G0QA 131LA 3F8VA 1D3JA 2OTZX 163LA 3HH6A 226LA 1QT4A 164LA 259LA 3HH3A 3DN2A 3GUIA 1XJTA 4W56A 188LA 1L60A 1C66A 3OE6A 1XJUA 215LA 1L0JA 2OE9X 1L96A 2B6YA 1L0KA 1LI6A 1P6YA 123LA 243LA 3DMZA 170LA 1L86A 4I7MA 1CTWA 3NY9A 1PQJA 1T8GA 4ARQB 3JR6A 1LI2A 4I7SA 1L66A 212LA 1D2YA 1L26A 1DYBA 1C62A 201LA 3C8SA 3DMXA 4I7OA 1P46A 1QSBA 1DYGA 4EKRA 3SBAA 3HT8A 1L42A 1L06A 1L20A 171LA 185LA 1L85A 165LA 1LYJA 4YXAC 1PQDA 240LA 4W54A 1L75A 1L25A 2B6XA 183LA 2F2QA 1XEPA 1KS3A 3FA0A 3C7WA 214LA 4AQNA 2QARC 1I6SA 1LWKA 1PQKA 2RBRA 1L59A 233LA 1OWZA 3CDTA 3GUKA 1L73A 182LA 245LA 1L97A 3HTFA 2O7AA 3SB5A 198LA 4EXMA 3FADA 1SX2A 1LLHA 157LA 4I7NA 1L02A 4ARQA 137LA 1ZURA 3QAKA 1QT7A 1L32A 3FI5A 4OO9A 3GUMA 1L67A 4IAPA 1LYHA 3GULA 187LA 200LA 1SSYA 3C83A 1L87A 3C80A 2B72A 1CV1A 149LA 232LA 229LA 150LA 1L08A 1OVKA 213LA 3C8QA 1LPYA 4E97A 3GUOA 1G07A 1L53A 1L23A 1L79A 1L34A 4ZPUA 1L27A 1C6LA 2OU9A 3LZMA 3UONA 4W52A 2F47A 1LW9A 1P2LA 1C6FA 205LA 239LA 184LA 1LGWA 3NYAA 3C81A 4LDEA 224LA 1L48A 2RBNA 1L90A 1G1VA 1P2RA 1QT3A 159LA 3PDSA 2F32A 156LA 1QTVA 1ZWNA 248LA 3HU9A 192LA 217LA 3DN6A 1L72A 1L22A 3SB6A 2B6ZA 2Z6BA 1DYFA 3HTDA 3SBBC 4W53A 2RBPA 3HDEA 177LA 1QS9A 206LA 242LA 1CX6A 1L07A 145LA 252LA 1L80A 4EJ4A 173LA 1CU0A 1QTCA 1ZYTA 3DN8A 1L77A 1DYCA 247LA 4S0WA 2Q9DA 2CUUA 219LA 1D9WA 1L35A 1L33A 1G1WA 2RAYX 2OEAX 3F9LA 1WTHA 251LA 2L78A 3HWLA 148LE 1L19A 1L15A 197LA 158LA 1L31A 1L62A 1T8AA 3ODUA 4W51A 1L45A 3V2YA 256LA 161LA 1JQUA 223LA 3VW7A 1C63A 3CDOA 4LZMA 1L43A 152LA 175LA 1CU3A 3SB9A 4W58A 1L17A 1C6DA 4K5YA 2RB2X 1C60A 4W55A 2ANVA 4DKLA 1L10A 235LA 3HDFA 1C6CA 1C6IA 1D3NA 4ARPA 1QTZA 1T97A 3DN3A 1L16A 1L52A 3DN1A 160LA 1D2WA 3C82A 1L55A 2B70A 1C61A 249LA 1L84A 1L28A 1L69A 260LA 1KNIA 241LA 258LA 2A4TA 1L98A 172LA 3DN0A 4DAJA 181LA 144LA 1LGUA 1L91A 1L09A 2LZMA 2NTHA 1L63A 1PQMA 1SWZA 2ANXA 2B74A 4EPIA 225LA 1G0MA 1C6NA 1JTNA 1LYIA 1L71A 1L68A 3HT9A 3C8RA 1EPYA 1L37A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L58A 1CUPA 1D0MA 5KKIA 2IFFY 1IY4A 1C6BA 4KL7A 5C6JA 3A95A 1BWIA 216LA 2OTYX 3L2XA 1LZ9A 7LZMA 1LZ4A 3TXFA 3OE8A 126LA 2O79A 3G3VA 4XJBA 191LA 1L81A 2Y8PA 3CSZA 1VDTA 4N1EI 1LZNA 230LA 1LZRA 115LA 1DPWA 1L18A 1ZMYL 6LYTA 1JWRA 5DL9A 1GXXA 4YENA 1LMTA 1JSFA 1HNLA 1T3PA 2QB0B 2HULA 1GFKA 1B5YA 107LA 4EOFA 1BVKC 3OE0A 103LA 3RZ4A 4GRVA 2BQAA 5IDDA 244LA 3AB6A 1L54A 3D3DA 237LA 4LDLA 4LGKA 3A6CY 1HEPA 3DN4A 2HTXA 3DKEX 1LCNA 4N9RA 4CFPA 1LI3A 1C6KA 3V2WA 3EMLA 1JTOL 1FLUA 1JKCA 1CKDA 2D91A 3D9AC 1C6GA 1G0LA 1HEQA 1QUGA 3HUKA 3WUMA 1L83A 1BB7A 5A3ZA 4XJFA 4WLYA 1LKRA 4O34A 2G4PA 4PJZA 5KXKA 2YBNA 2NTGA 4J1BA 1D3FA 3CT1A 4B1AA 1CJ7A 3M18B 1V7SA 194LA 186LA 3SB7A 169LA 1KY1A 1LZ1A 4N8ZA 3GXRA 178LA 1L46A 2LZ2A 2HUKA 5II3A 1LHMA 2Z12A 4HSFA 4ARMB 1JJ3A 4H9HA 1LJJA 3B72A 1B0DA 5IELA 109LA 1G0JA 2MEBA 7LYZA 1C6MA 1DYAA 3LHMA 1RFPA 3E3DA 4PK0A 2MEHA 3P4ZA 1CU2A 1SX7A 4NGVA 4OW1A 4UWNA 1L61A 4N0JA 2YBLA 1GF5A 4EKQA 4WM4A 2OU0X 2CJLA 1UIAA 2XBSA 3IWRA 1TLAA 1HC0A 1CV0A 2XTHA 1G06A 1L12A 1IP5A 218LA 4H90A 1L40A 141LA 5LVJA 1DKKA 1QTBA 3RW8A 4PRQA 1QUDA 3EXDA 3LZTA 1HERA 2D4IA 2FYCA 4LYZA 1B7QA 2RH1A 1GB0A 1I56A 4ARJA 1L01A 261LA 3AJNA 3L64A 3TMUA 168LA 2NWDX 1NBZC 1OYUA 114LA 1TAYA 4EPFA 1CKFA 1LSEA 2ZQ3A 3TXJA 2YBIA 1VAUA 2W1LA 1G0PA 1P2CC 1VFBC 4XN6A 1H6MA 1LPIA 3WMKA 1GB7A 1HELA 1RCMA 3DN2A 3RT5X 1L60A 3OE6A 1LJKA 3BKHA 1XJUA 215LA 3TXIA 1J1XY 1B7SA 1YKXX 4PGJB 4YF2A 4IJ4A 4KT3A 4DDCA 5KXXA 4I7SA 212LA 1UIBA 4U3XB 3DMXA 5DLAA 1L20A 3LZ2A 5B1FA 3WUAA 4MR1A 1PQDA 1L25A 2B6XA 5KKJA 1GAYA 1XEPA 1KS3A 1RJCB 5A3EA 1YAPA 233LA 3GUKA 182LA 198LA 3SB5A 4EXMA 1KXWA 1LZBA 1SQ2L 3QAKA 5LVIA 1UUZC 4OO9A 4NSJA 2EPEA 4Z98A 187LA 1QTEA 1B5ZA 2F30A 3C83A 4B4EA 1GBWA 2ZNWY 2B72A 2I25L 213LA 1LPYA 3A91A 1L53A 5KXZA 1L27A 1IR7A 2OU9A 3UONA 1C6FA 4OWEA 4GLVA 1LGWA 3NYAA 1GB2A 3C81A 1DI3A 4WOAA 1P2RA 1QT3A 4H9CA 3TXKA 1CKGA 4NEBA 248LA 2HEDA 192LA 1YKYX 3DN6A 2F4AA 1B9OA 3SB6A 2B6ZA 3SBBC 4W53A 4II8A 1B7PA 145LA 5M1YA 4EJ4A 1CU0A 1HSWA 3DN8A 1ZYTA 1DYCA 2HU1A 2D4KA 3W6FA 2Q9DA 2B5ZA 2RAYX 1LMQA 1LSZA 1GPQC 1LAAA 3FE0A 4WM2A 1F6RA 2LHMA 5FHWA 1T8AA 1L45A 1VEDA 5F9UA 4Z46A 4DQ5A 5B06A 161LA 1JQUA 4H92A 4PRUA 1RI8B 4W58A 4DD7A 3WU7A 2PC2A 2ANVA 5FCPA 1L10A 2DQFC 5KY1A 1C6CA 1L16A 2CWIA 3DN1A 1LSNA 1QUTA 1NBYC 1D2WA 1L55A 1LJFA 249LA 2D4JA 1IWWA 1L69A 2BQIA 3B0OA 2LYOA 241LA 1GFAA 2BQKA 3DN0A 1YAMA 144LA 5KXOA 1L09A 2NTHA 1L63A 2IHLA 1NHEA 5LXWA 2B74A 3WL2A 225LA 1G0MA 1C6NA 1L71A 2YBJA 4NHPA 3HT9A 3AZ7A 5HNCA 193LA 234LA 3RZEA 3G3WA 111LA 1DZBX 1IOSA 2W1YA 4ETCA 1JJ0A 1GF9A 1RE2A 4WLTA 1GB6A 3HUQA 4LT3A 1L88A 1K28A 4LDOA 1O23A 1T6VL 2BQGA 1DI4A 4DJHA 2OE7X 2RBOA 1DYEA 4H9BA 4NGJA 4R0FA 199LA 1LSYA 1WQPA 1LSDA 1UACY 1WVVA 5KXSA 2OU8A 3HTBA 2BQDA 2HUMA 3TXBA 1XEIA 5EBHA 2RSCA 3LYOA 1YQVY 104LA 1JISA 4W96A 125LA 2B75A 4D9ZA 1LYYA 1IP2A 5F14A 1CUQA 1CV6A 2RBQA 2BQEA 4W94A 1LHKA 5APFA 5LA5A 2HEEA 190LA 2CDSA 3M3UA 5HNLA 2H9KA 1QTHA 128LA 1L29A 3EMSA 3A93A 1ALCA 1L56A 4WL7A 4ML7A 1A2YC 1OUAA 2MECA 1L92A 1LZ6A 2LYZA 4H1PA 1KIQC 1DQJC 1C6JA 1LYEA 5FDJA 1C6EA 1YROA 3LYTA 3K2RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L58 A;  1CUP A;  1D0M A;  5KKI A;  2IFF Y;  1IY4 A;  1C6B A;  4KL7 A;  5C6J A;  3A95 A;  1BWI A;  216L A;  2OTY X;  3L2X A;  1LZ9 A;  7LZM A;  1LZ4 A;  3TXF A;  3OE8 A;  126L A;  2O79 A;  3G3V A;  4XJB A;  191L A;  1L81 A;  2Y8P A;  3CSZ A;  1VDT A;  4N1E I;  1LZN A;  230L A;  1LZR A;  115L A;  1DPW A;  1L18 A;  1ZMY L;  6LYT A;  1JWR A;  5DL9 A;  1GXX A;  4YEN A;  1LMT A;  1JSF A;  1HNL A;  1T3P A;  2QB0 B;  2HUL A;  1GFK A;  1B5Y A;  107L A;  4EOF A;  1BVK C;  3OE0 A;  103L A;  3RZ4 A;  4GRV A;  2BQA A;  5IDD A;  244L A;  3AB6 A;  1L54 A;  3D3D A;  237L A;  4LDL A;  4LGK A;  3A6C Y;  1HEP A;  3DN4 A;  2HTX A;  3DKE X;  1LCN A;  4N9R A;  4CFP A;  1LI3 A;  1C6K A;  3V2W A;  3EML A;  1JTO L;  1FLU A;  1JKC A;  1CKD A;  2D91 A;  3D9A C;  1C6G A;  1G0L A;  1HEQ A;  1QUG A;  3HUK A;  3WUM A;  1L83 A;  1BB7 A;  5A3Z A;  4XJF A;  4WLY A;  1LKR A;  4O34 A;  2G4P A;  4PJZ A;  5KXK A;  2YBN A;  2NTG A;  4J1B A;  1D3F A;  3CT1 A;  4B1A A;  1CJ7 A;  3M18 B;  1V7S A;  194L A;  186L A;  3SB7 A;  169L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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