148LE

A covalent enzyme-substrate intermediate with saccharide distortion in a mutant t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYEIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase substrate
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title A covalent enzyme-substrate intermediate with saccharide distortion in a mutant T4 lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 148lE00
1L42A 4LDOA 4YX7C 1L07A 3GUNA 3HH4A 1L06A 148LE 1C6JA 4AQNA 200LA 1CU3A 232LA 3DN2A 1L41A 1L90A 257LA 1L73A 1QT3A 2ANXA 184LA 254LA 3GUPA 174LA 3LZMA 261LA 1L87A 1T8AA 2OU0X 3G3VA 1D3JA 4W55A 196LA 1L18A 1L13A 1L69A 215LA 216LA 4I7JA 4I7OA 3GUIA 6LZMA 170LA 4ARQB 1L31A 2LCBA 3CDOA 188LA 4YXAC 1C6LA 1L71A 2RBQA 3HH3A 4I7QA 2B75A 4EPIA 3HDFA 1L60A 1L89A 249LA 3CDRA 1L98A 4DKLA 209LA 2RBSA 1L17A 2OU9A 3RUNA 1QUOA 245LA 131LA 1CV0A 1T8GA 167LA 1L39A 2QB0B 1LGWA 246LA 3GUOA 3HTFA 1DYFA 1L16A 4IAPA 1G1WA 1L19A 2RAYX 2OTZX 3FI5A 1C63A 3FADA 1L83A 1L48A 1P3NA 1C65A 2RAZX 4W58A 2B7XA 1C6EA 126LA 2B6TA 2B6YA 1SSWA 1D3NA 3HT9A 1P46A 1L61A 226LA 4I7MA 4EJ4A 3DN1A 2OE4X 2B73A 1L70A 128LA 233LA 1C6PA 1L99A 3RZEA 1CUPA 1L59A 4E97A 1OVJA 3UONA 205LA 1P36A 238LA 1SX7A 1L05A 3GUKA 1L15A 1L24A 3HT8A 173LA 1C6QA 201LA 119LA 1QT8A 2RB1X 3SB6A 217LA 3D4SA 1L76A 1C6BA 3NY8A 172LA 149LA 1G0PA 4I7RA 4I7NA 1EPYA 1L47A 1PQIA 234LA 4DAJA 1PQKA 1L84A 3V2YA 1P37A 1DYGA 1L30A 3HU8A 3JR6A 127LA 1QSBA 2OE7X 2RBRA 1LYGA 1L64A 1KY1A 2RB2X 1L03A 141LA 4W56A 1QTDA 1D3MA 3ODUA 1KW7A 4PK0A 247LA 1I6SA 1QT6A 210LA 4OO9A 3DKEX 1QT7A 195LA 2B6XA 4EPFA 3DN3A 3QAKA 1C69A 112LA 1L74A 143LA 1D2YA 1P2LA 3HDEA 1T97A 1D9WA 1OWYA 1CV4A 3HH5A 2HUMA 3C7ZA 4S0WA 4ARLA 1C6CA 192LA 1L33A 1XJUA 1PQOA 1ZWNA 1OV7A 159LA 212LA 1L32A 229LA 1D3FA 1DYAA 1L72A 2B72A 2LC9A 1C66A 1CX6A 1L38A 186LA 1L20A 3GUMA 3HTDA 129LA 2HULA 189LA 3HTGA 3SBBC 259LA 2RBNA 1LYEA 2F2QA 2F47A 1CUQA 1C6HA 1L50A 123LA 4EKSA 1L37A 156LA 3PBLA 1L45A 2NTGA 1C6FA 1G0QA 1LYHA 1L02A 4I7LA 3HT7A 1L26A 250LA 1CV5A 1L58A 1LYIA 1L52A 1L92A 1L54A 2OE9X 2B74A 3DMXA 181LA 258LA 243LA 1OWZA 1JQUA 3G3XA 1L00A 4PJZA 2O4WA 256LA 1L25A 1L86A 3NYAA 1L53A 4LDLA 2NTHA 1L28A 190LA 1L51A 191LA 1CTWA 1L0JA 3OE8A 1C61A 3K2RA 3F8VA 1C6NA 1KW5A 1L88A 3SN6R 213LA 1LW9A 4I7KA 1L66A 2A4TA 1L77A 3HUQA 3C8QA 1L11A 1L35A 1G1VA 260LA 164LA 2Z6BA 2L78A 1L0KA 3VW7A 3C7YA 4W52A 182LA 4ZPUA 1K28A 1ZYTA 4ARQA 162LA 1L29A 1L75A 1QUGA 1LGUA 1LPYA 1LI6A 1P2RA 158LA 4LDEA 3DMVA 4GBRB 3OE0A 3C80A 1G0JA 2IGCA 3L64A 1PQMA 109LA 2O7AA 3GULA 1SSYA 3SB8A 161LA 2B70A 1L55A 1C6IA 4K5YA 228LA 206LA 3V2WA 221LA 1D2WA 1JTNA 227LA 3EMLA 1SWZA 1L27A 3C8SA 104LA 1L23A 3C83A 2HUKA 4GRVA 1L82A 222LA 2OTYX 3GUJA 1PQJA 3HTBA 1PQDA 1G06A 1LGXA 1QS9A 187LA 1L22A 1L49A 125LA 1L10A 1L40A 1G0GA 1JTMA 1L14A 1CVKA 122LA 1L91A 252LA 4ARPA 1SWYA 1LI3A 1L97A 4EKRA 3DN4A 2RBPA 1QT5A 1QT4A 118LA 185LA 1QSQA 2Q9DA 1CU5A 1CV1A 1C6MA 175LA 1P64A 1L79A 2F32A 2B6ZA 2OU8A 4ARMB 151LA 255LA 1L81A 1L36A 4YXCA 1CX7A 1T8FA 4DJHA 3DNAA 3F9LA 1KY0A 3CDQA 115LA 178LA 1G0KA 169LA 1DYBA 165LA 1QS5A 240LA 1QTVA 137LA 140LA 1QTCA 1C64A 4I7TA 1C6KA 3PDSA 139LA 1DYDA 253LA 2ANVA 236LA 1C60A 163LA 110LA 155LA 145LA 1L08A 1CV3A 4I7PA 4W53A 1QTBA 114LA 1L67A 1L09A 1SX2A 3DN6A 3HWLA 4W57A 1G07A 1WTHA 1TLAA 1LI2A 3HH6A 1LYJA 1L93A 1L04A 1L43A 2RB0X 1C68A 230LA 1DYEA 4ARJA 1L68A 2B6WA 1C6AA 3C82A 2O79A 1L12A 1L94A 4W59A 1CU6A 1C6TA 1C6DA 1XEPA 2RH1A 1L96A 4ARMA 177LA 5I14A 171LA 5LZMA 1L01A 1LYDA 3L2XA 1L85A 1OVHA 1QUHA 2LZMA 218LA 1LLHA 1L57A 4EKPA 2QARC 3C7WA 3HUAA 3CDTA 1P7SA 1OYUA 1P5CA 2RBOA 231LA 1ZURA 1CU2A 108LA 3CDVA 219LA 244LA 1P56A 113LA 1L62A 3C8RA 1L65A 3OE6A 1L56A 2Q9EA 223LA 4I7SA 4LZMA 198LA 4W54A 3C81A 183LA 224LA 1KS3A 1L34A 1L21A 1CV6A 146LA 3SB9A 1LWGA 225LA 3HU9A 3NY9A 242LA 1LWKA 4EKQA 1LYFA 1QTZA 1T6HA 1L80A 248LA 262LA 241LA 1L44A 1L95A 142LA 197LA 111LA 251LA 1DYCA 3HUKA 120LA 1OV5A 199LA 1B6IA 1L63A 166LA 3FA0A 1OVKA 152LA 3SBAA 239LA 147LA 3HT6A 4W51A 1G0LA 3G3WA 168LA 235LA 144LA 102LA 1XJTA 1NHBA 1C67A 1QUDA 157LA 1QTHA 150LA 214LA 138LA 1G0MA 1KNIA 3SB7A 160LA 4EXMA 1CU0A 3DN0A 1C62A 107LA 237LA 3DN8A 2OEAX 130LA 1C6GA 2CUUA 7LZMA 220LA 180LA 3OE9A 103LA 176LA 1L46A 211LA 3SB5A 3DMZA 1P6YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NWGA 4LDOA 4ETAA 3TXKA 4DD9A 3W6AA 2FYCA 2D6BA 3AW6A 1GB2A 200LA 3EXDA 3DN2A 257LA 1L73A 1LJJA 2F30A 174LA 1SQ2L 261LA 1GFRA 1JUGA 1L87A 2OU0X 3WVXA 1L13A 2BQAA 4I7JA 5DLAA 3GUIA 5DM9A 1LKRA 5L9JA 1T3PA 3A96A 5HNLA 188LA 4YXAC 4I7QA 1YAMA 1RI8B 3CDRA 4DKLA 193LA 2OU9A 1JKAA 2DQJY 1LMNA 2DQAA 1T8GA 1L39A 1RFPA 1LZBA 3TXDA 4WO6A 4TSCA 1DYFA 3RZ4A 5HNCA 4DDBA 3RU5A 1XGRC 1LZ5A 4OWBA 126LA 1LZ6A 3T6UA 3HT9A 1UC0A 226LA 5KY1A 4EJ4A 2OE4X 4YM8A 128LA 1C6PA 1HEWA 1OVJA 1GB6A 205LA 1GXV2 3HT8A 2RSCA 1FKVA 1C6QA 4GCEA 1LZ8A 1QT8A 1QSAA 1IWUA 1GB9A 3SB6A 5LVIA 4OOTA 4OWEA 3B0KA 4ETCA 3HBEX 2CWIA 4DAJA 5APDA 1KXXA 1PQKA 2NWDX 1IP5A 1DYGA 1CKGA 1IORA 1QSBA 3B6LA 1IWZA 1GBXA 2RB2X 1L03A 1VDTA 1GHLA 1D3MA 3WU9A 4U3XB 4OO9A 4HPIA 4UWNA 5I53A 2B6XA 1L74A 143LA 1HERA 1P2LA 4GCDA 1GF0A 1OWYA 3HH5A 192LA 1YL0X 1OV7A 159LA 212LA 1DYAA 2LC9A 1CX6A 5I4XA 186LA 1L20A 5F16A 1GXXA 4OWAA 4IJ4A 4NGWA 5KXWA 1V7TA 3M3UA 1CUQA 1L37A 3TXEA 4H91A 1L02A 1LCNA 4I7LA 3HBHA 3HT7A 1LZTA 1AZFA 1CV5A 1L58A 1LYIA 3SP3A 1CKCA 1L92A 4NFVA 4FDYA 1ZVYB 4NHTA 258LA 4TUNA 3G3XA 4PJZA 1WQNA 1T6VL 1BVKC 4DC4A 3ULRA 2BAAA 4DQJA 3AB6A 4BAFA 3A6BY 1B7NA 190LA 1CTWA 1L0JA 3T36A 1UIBA 1IC7Y 4QY9A 4M4OA 213LA 1LW9A 4WLYA 1BWHA 5HLLA 3C7YA 4ZPUA 2LZ2A 3CSZA 1JITA 4ZEEA 3TXFA 162LA 4RLMA 1L29A 4Z98A 3D9AC 1LPYA 5KXOA 1G7LC 4LDEA 4GBRB 1G0JA 5KJ9A 1IP3A 2O7AA 1SSYA 3AYQA 3RW8A 4K5YA 4GLAA 1D0KA 3EMLA 4NHSA 3C8SA 104LA 2HUKA 1LSDA 222LA 3GUJA 1IEEA 1D0LA 1LGXA 1F0WA 1L22A 125LA 1L10A 3WVYA 4GCBA 4N5RA 1G0GA 1JTMA 5B59A 1CVKA 1LSPA 1L91A 1IP6A 1SWYA 3CQLA 2MEEA 3DN4A 4C5FA 1DXJA 2DBTA 1P64A 4EMNA 2N5ZA 4J1AA 3WU8A 169LA 4WG7A 240LA 2IFFY 1QTVA 2I6ZA 7LYZA 1C6KA 1MLCE 3LN2A 1IR7A 1BB3A 3J4GA 3TMWA 5F14A 110LA 145LA 3AGGG 4WL7A 4W53A 1QTBA 1GBOA 4ETBA 4LFXA 1QIOA 208LA 4W57A 1G07A 1GBZA 1WTHA 2C8OA 1L93A 1IWXA 2ZQ3A 1YAPA 1C68A 2GV0A 4ARJA 1LMTA 1C6AA 3C82A 1L12A 1L94A 4W59A 1XEPA 1BB6A 4ARMA 1UCOA 1GAYA 4B49A 3B0IA 1N4FA 1OUCA 4YOPA 3IJUA 2QARC 3HUAA 1OYUA 1P5CA 2Z19A 1GF3A 4NIJA 2BQBA 3C8RA 1L65A 223LA 1I20A 2XBRA 1I1ZA 5LVGA 4W54A 3K3TA 224LA 4PHIA 1L34A 1L21A 3SB9A 1NHEA 1NMMA 2EQLA 4XJDA 4NSGA 1LYFA 1L80A 1NDGC 3CT5A 111LA 1DYCA 4GCFA 4GN3A 4DD7A 1CJ9A 1AT6A 1REZA 4PGJB 1L63A 1XEJA 166LA 3J6KA 3HT6A 1XGPC 1GF9A 2MEFA 1GDWA 4LT2A 5AMYA 4DYGA 5C6JA 4LYBA 168LA 4HJZA 1QUSA 1IOCA 144LA 1KIQC 1VAUA 4ANRA 1C67A 4H9FA 1IP1A 5LIOA 1QUDA 4HTKA 2DQCY 5KXMA 1HFYA 5B1GA 3WW6A 3N9CA 176LA 2Z18A 4WM2A 4MR1A 1HENA 1LJNA 2HECA 2G4QA 2MECA 4OWHA 4YX7C 3WXTA 1NBYC 1YILA 3HH4A 1L06A 1C6JA 1CU3A 2DKVA 4N8ZA 1GFUA 1L90A 3TXBA 3A91A 3GUPA 1GFEA 1IWWA 3LZMA 1TEWA 4NGIA 196LA 5LA5A 216LA 1YQVY 3WPJA 1L31A 1LMQA 2YSSC 4B4IA 1C6LA 1L71A 2RBQA 3A3QA 2G4NA 3WXUA 1LSMA 1L89A 1LOZA 1L98A 209LA 5F9UA 1WQMA 5FEKA 1G7JC 4UWVA 2MEHA 1QUOA 4NHQA 245LA 1B5WA 2MEDA 4H9HA 1NQIA 167LA 2ZYCA 1LGWA 1IY3A 4QDNA 1L16A 4IAPA 1G1WA 1L19A 2OTZX 3LYOA 2Z39A 2W1MA 3G3AB 1LMAA 1P3NA 2C8PA 1C65A 4W58A 3P64A 4YF2A 5FSTA 2I25L 4B0DA 2B6YA 2BPUA 4H8ZA 4TX7A 1D3NA 1WQRA 1P46A 3TMXA 4ML7A 4I7MA 2B73A 1L70A 3QY4A 3RZEA 1L59A 4W94A 4E97A 1B2KA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NWG A;  4LDO A;  4ETA A;  3TXK A;  4DD9 A;  3W6A A;  2FYC A;  2D6B A;  3AW6 A;  1GB2 A;  200L A;  3EXD A;  3DN2 A;  257L A;  1L73 A;  1LJJ A;  2F30 A;  174L A;  1SQ2 L;  261L A;  1GFR A;  1JUG A;  1L87 A;  2OU0 X;  3WVX A;  1L13 A;  2BQA A;  4I7J A;  5DLA A;  3GUI A;  5DM9 A;  1LKR A;  5L9J A;  1T3P A;  3A96 A;  5HNL A;  188L A;  4YXA C;  4I7Q A;  1YAM A;  1RI8 B;  3CDR A;  4DKL A;  193L A;  2OU9 A;  1JKA A;  2DQJ Y;  1LMN A;  2DQA A;  1T8G A;  1L39 A;  1RFP A;  1LZB A;  3TXD A;  4WO6 A;  4TSC A;  1DYF A;  3RZ4 A;  5HNC A;  4DDB A;  3RU5 A;  1XGR C;  1LZ5 A;  4OWB A;  126L A;  1LZ6 A;  3T6U A;  3HT9 A;  1UC0 A;  226L A;  5KY1 A;  4EJ4 A;  2OE4 X;  4YM8 A;  128L A;  1C6P A;  1HEW A;  1OVJ A;  1GB6 A;  205L A;  1GXV 2;  3HT8 A;  2RSC A;  1FKV A;  1C6Q A;  4GCE A;  1LZ8 A;  1QT8 A;  1QSA A;  1IWU A;  1GB9 A;  3SB6 A;  5LVI A;  4OOT A;  4OWE A;  3B0K A;  4ETC A;  3HBE X;  2CWI A;  4DAJ A;  5APD A;  1KXX A;  1PQK A;  2NWD X;  1IP5 A;  1DYG A;  1CKG A;  1IOR A;  1QSB A;  3B6L A;  1IWZ A;  1GBX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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