149LA

Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNLFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 149lA00
1DYAA 1L27A 256LA 2OE9X 214LA 1L76A 4W57A 4EKSA 1CVKA 1SWYA 219LA 3FI5A 7LZMA 1C6BA 1SSWA 127LA 183LA 1P2LA 1ZURA 2RBOA 3DN3A 3HT6A 1D3JA 1QUHA 1L19A 2B7XA 3HUQA 1G1WA 227LA 1T8AA 1P2RA 2OU8A 1ZYTA 4EPIA 2HUMA 1L58A 1L95A 243LA 1L43A 1L53A 1KY0A 223LA 119LA 196LA 1OVKA 1L66A 1P6YA 3HT9A 210LA 2B6WA 1C65A 3CDRA 4ARMA 198LA 1L90A 1QUDA 1L16A 3C83A 3HTFA 205LA 3GUNA 1SX7A 2Q9DA 175LA 3HT7A 1L26A 1C63A 1L92A 104LA 1G0QA 1L67A 1L41A 155LA 1L62A 211LA 3G3VA 1C6MA 2O4WA 236LA 1EPYA 226LA 2F32A 3SB7A 143LA 171LA 1P46A 217LA 1L54A 3V2YA 258LA 4W51A 1D2WA 2NTHA 4I7SA 1L77A 3CDTA 1L87A 1L23A 1L34A 1LI6A 209LA 1C6FA 3HWLA 2OTYX 3UONA 1DYCA 1CUPA 4I7PA 1DYGA 1QT3A 200LA 1L47A 3DN8A 3HTDA 1LLHA 1L55A 3C81A 1D3NA 4LDEA 3GUIA 1CV6A 4DJHA 245LA 2RAYX 115LA 3F8VA 4K5YA 1C6EA 149LA 255LA 201LA 2OTZX 241LA 1C6NA 1L64A 130LA 1L44A 3PBLA 172LA 147LA 3DNAA 1C6LA 3FA0A 107LA 1C6HA 1TLAA 1C6PA 188LA 1CV1A 259LA 2LCBA 3HH6A 1ZWNA 3L2XA 1KW5A 1QTBA 3GULA 1L80A 148LE 1C6JA 1L97A 2QB0B 1L85A 3D4SA 137LA 231LA 1SX2A 1L89A 3GUOA 1L84A 4W55A 3HTBA 140LA 3C80A 222LA 2B6TA 3HU9A 4I7QA 1OYUA 3HUKA 235LA 1T6HA 3PDSA 4S0WA 1QTZA 2CUUA 2Z6BA 1T97A 191LA 1LYJA 1L22A 2OE7X 1C66A 1C64A 1L70A 206LA 3DMVA 3GUMA 1C6IA 120LA 4GBRB 1L91A 3OE8A 1P37A 2HUKA 1L35A 1QS5A 261LA 4LDOA 1LI3A 1PQKA 4W59A 1L04A 3OE9A 4AQNA 1PQMA 252LA 109LA 185LA 1JTMA 1L17A 3SB5A 1L00A 1L29A 2RAZX 2B73A 5I14A 1L48A 1CX7A 1OWZA 158LA 1L88A 216LA 1P7SA 2OU0X 2ANVA 1T8FA 3C7YA 3HDFA 3G3XA 2O7AA 3LZMA 1C69A 1G0GA 1L86A 2F47A 1L0JA 1CU0A 1PQOA 1L28A 1L98A 4I7KA 4EKPA 3DN0A 1D2YA 156LA 1CX6A 1LYIA 1QUOA 2IGCA 165LA 1LGUA 1CV3A 4OO9A 1CV4A 3HU8A 1L37A 3V2WA 1XEPA 2HULA 1L59A 3DMZA 1KS3A 3C8SA 1LYHA 1QT5A 237LA 1OV7A 224LA 1DYDA 233LA 3SBAA 1D9WA 2RBSA 180LA 1C68A 2RBPA 3VW7A 1P5CA 1LYDA 150LA 2B75A 161LA 1L0KA 1LI2A 1L46A 232LA 1CTWA 4YX7C 1C6AA 1L74A 1B6IA 2OE4X 2RBNA 1L11A 1L73A 1L08A 1QT8A 1G0KA 2OEAX 103LA 4I7LA 176LA 1L40A 1L69A 253LA 4LDLA 1L09A 1L65A 4ARQA 131LA 186LA 160LA 3CDQA 229LA 2B70A 3DN4A 1L63A 138LA 1C6DA 1QUGA 225LA 4YXCA 1QT4A 240LA 254LA 151LA 164LA 3C8RA 1L15A 162LA 1L57A 1JTNA 1JQUA 1G0MA 1PQDA 128LA 145LA 1XJUA 3CDVA 129LA 1L05A 2OU9A 246LA 3HH5A 159LA 112LA 1PQIA 4EKRA 248LA 3CDOA 2L78A 1QS9A 3L64A 1KW7A 4I7OA 2Q9EA 139LA 1L94A 1L39A 1OWYA 144LA 4ARJA 114LA 1G0JA 1LPYA 1QT6A 1L13A 3OE6A 3NYAA 1L10A 142LA 1D3FA 1L68A 3EMLA 126LA 1DYBA 1KY1A 212LA 3GUKA 3GUPA 1G07A 1L45A 1L83A 1L25A 215LA 238LA 3DKEX 1QSBA 1L18A 3FADA 3ODUA 197LA 1L14A 187LA 1L33A 2LC9A 1L61A 1P64A 1LGXA 4I7NA 4W56A 1QTVA 4ARLA 3SB8A 2F2QA 1D3MA 1KNIA 1C6TA 2NTGA 1LYEA 1P3NA 125LA 4E97A 218LA 4W58A 3C7WA 1L72A 1L21A 1L96A 1L60A 1L99A 4I7TA 4I7JA 220LA 182LA 1QT7A 2O79A 260LA 1L49A 228LA 3HUAA 1L50A 2B6YA 3SB6A 2RBQA 166LA 2QARC 4I7RA 152LA 1L81A 1L38A 4PK0A 195LA 1L75A 1WTHA 244LA 102LA 1C62A 1CU6A 4ARPA 4GRVA 173LA 1C6GA 1CV5A 1L32A 2RB2X 3RZEA 1NHBA 4DKLA 2B74A 1L03A 3JR6A 1L93A 3GUJA 2B6XA 4EJ4A 1L31A 178LA 242LA 122LA 108LA 2A4TA 157LA 169LA 1P36A 1C60A 1LGWA 1L01A 1G06A 1OVHA 3HTGA 4W54A 3RUNA 1L07A 174LA 1K28A 189LA 262LA 3HDEA 3HT8A 5LZMA 4DAJA 2RBRA 1L30A 1CV0A 1XJTA 1LYGA 1QTHA 251LA 1G0LA 2RB0X 4ARMB 1OVJA 170LA 4EPFA 230LA 1LW9A 1LYFA 247LA 1DYFA 1L36A 4YXAC 110LA 181LA 1I6SA 2ANXA 1C6QA 1G0PA 3DN2A 4EKQA 1T8GA 4EXMA 1C67A 2RB1X 1OV5A 1C6CA 3NY9A 3SN6R 192LA 1L56A 1L71A 1P56A 4I7MA 184LA 1L06A 146LA 1L82A 3DN1A 1L42A 123LA 3F9LA 1L12A 2RH1A 2LZMA 167LA 3DN6A 3C8QA 4ZPUA 4W52A 118LA 3HH4A 1QTCA 1DYEA 249LA 4PJZA 190LA 257LA 3C7ZA 3K2RA 3SBBC 1QTDA 1G1VA 1L79A 113LA 1SSYA 3SB9A 2B72A 3G3WA 1C61A 1CUQA 1SWZA 1CU2A 234LA 3HH3A 3NY8A 6LZMA 1C6KA 3QAKA 3C82A 199LA 1PQJA 213LA 1L02A 1CU3A 3DMXA 163LA 250LA 4IAPA 4W53A 1CU5A 1LWKA 1QSQA 168LA 1L24A 4ARQB 1L52A 3OE0A 111LA 4LZMA 2B6ZA 221LA 239LA 1L51A 1L20A 1LWGA 177LA 141LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A4VA 5F14A 4CFOA 1BQLY 1BVKC 1CVKA 1LMTA 3FI5A 1LSFA 1ZMYL 7LZMA 2BLYA 1SSWA 5FELA 4IATA 183LA 1P2LA 1VATA 1B7QA 3HT6A 1L19A 3HUQA 1G1WA 1IP6A 2F4AA 4EPIA 5J7CA 5FEKA 1C43A 1QTEA 4FJRA 4WL6A 2LZTA 1DKJA 1WQPA 1LJFA 2PC2A 1C65A 1JKCA 3CT0A 198LA 1GB3A 1LZRA 2MEBA 5KKIA 1SX7A 4Z41A 4H90A 1LMPA 4XJGA 1L67A 1N4FA 5EBHA 1L41A 4OWCA 211LA 1TCYA 3G3VA 1C6MA 4LGKA 5KY1A 4H8ZA 4L41A 1ALCA 4H9FA 4W51A 4I7SA 2B5ZA 1L77A 2D4KA 1L23A 1C6FA 1GD6A 2BQEA 3HWLA 3CSRA 4B49A 1LZEA 1YILA 5F81A 5M1YA 1FDLY 4DDBA 3DN8A 3HTDA 4LDEA 4DJHA 1LMCA 1QSAA 4H92A 4K5YA 1FLUA 5APEA 1GXXA 1LZNA 241LA 3A90A 1KXXA 3G3AB 107LA 4NSGA 4HTQA 4J7VA 1IR9A 188LA 4ZIXA 2LCBA 3P68A 1AT6A 1D9UA 1D0KA 154LA 4HJVA 1JJ3A 3D4SA 1D0MA 4NHTA 4H1PA 1L89A 1L84A 1SQ2L 4WM3A 3HTBA 1GFVA 3A95A 3HU9A 3A3QA 4EOFA 3HUKA 3TXIA 4DD1A 1T6HA 1PS5A 2Z6BA 4PHIA 2DQFC 1CJ8A 1C6IA 4XJDA 120LA 4WLDA 1DPXA 1L35A 1JTOL 1PQKA 4W59A 1GF0A 3LYOA 4WG1A 185LA 1JTMA 4GCEA 5I14A 1J1PY 4ETBA 1L48A 1CX7A 2CWIA 1OWZA 1IR7A 4OOTA 1L88A 3A96A 4DDCA 1T8FA 3G3XA 3SP3A 1LZCA 1L86A 1CU0A 4EKPA 3WPLA 3W6DA 1CX6A 1UIDA 165LA 1G7HC 1CV3A 4IASA 1YROA 1GBSA 1LHMA 2YBJA 3V2WA 4GN5C 1JTPL 2HECA 1L59A 1GB2A 5A3EA 3WUAA 4DDAA 237LA 3B6LA 3BKHA 1ZV5L 2DKVA 1IP1A 4I8SA 224LA 1GE4A 2RBSA 4NG8A 1HF4A 4CHXA 2RBPA 4N5RA 1LYDA 150LA 1LI2A 1LZ6A 1CTWA 3P65A 1C6AA 1L74A 1L11A 1L08A 1G0KA 2OEAX 1LSMA 176LA 4D9ZA 2DQEY 186LA 3LZ2A 4N0JA 229LA 2B70A 1YL1X 138LA 4YXCA 240LA 254LA 193LA 4LT0A 5I4WA 1L57A 1NMMA 2ZYCA 1QQYA 4YOPA 1PQDA 4GN3A 1XJUA 3HH5A 1JKDA 112LA 4EKRA 248LA 1IP5A 2D4IA 4MR1A 4WLXA 5KXRA 4O34A 4ZEEA 4H9CA 4U3XB 1NHEA 1G0JA 1LPYA 3OE6A 3NYAA 3RT5X 1D3FA 4ML7A 126LA 2DQGY 4M6DA 4Z98A 3LZTA 1L83A 4B4JA 1OP9B 2LC9A 177LA 1L61A 1P64A 4W56A 5KXZA 2F2QA 1C6TA 3B72A 5E9RA 1P3NA 1C7PA 2ZQ3A 1L72A 4I7TA 4I7JA 220LA 3GXRA 4LT2A 1LJKA 166LA 4NFVA 2BQCA 4HTNA 4I7RA 152LA 1L81A 195LA 1L75A 102LA 4ARPA 3JR6A 4EJ4A 1LZSA 2D4JA 5II3A 1OUFA 1GB0A 1JSFA 1G7LC 134LA 2HEDA 1G06A 3HTGA 4NG1A 4W54A 4LYTA 262LA 3HDEA 4XENA 2BQGA 3HFMY 4BS7A 2RB0X 3EO5A 5LVGA 170LA 1LW9A 247LA 4XJIA 1GFKA 110LA 181LA 2XQOA 1C6QA 4WO9A 3TMUA 4HPEA 1C67A 5APDA 2RB1X 1GB9A 1GPQC 1L71A 1P56A 1L82A 1GE0A 4NGOA 1DI4A 2RH1A 4UWNA 2BAAA 4W52A 3A94A 2BQJA 3WW5A 1WQOA 3WXTA 1YL0X 2BPUA 3K2RA 3SBBC 3QY4A 1LZ8A 4II8A 3N9EA 2XJWA 2B72A 3G3WA 1CUQA 1CU2A 2D6BA 3QAKA 1GE1A 2BQNA 2XBSA 1PQJA 213LA 1L02A 1CU3A 2W1XA 1CU5A 1YIKA 168LA 2LYMA 1L24A 1OUAA 1XFPL 4LYBA 3K3TA 239LA 4NGLA 5KXMA 1CNSA 1JWRA 1DYAA 3TXHA 5FCPA 1E8LA 3RZ4A 3CT1A 2DQJY 1KXWA 3W6AA 3EMSA 127LA 2RBOA 1D3JA 2OU8A 4NGVA 4PJ2C 2HUMA 1LPIA 4WOAA 2FBDA 1GF8A 1AT5A 1L95A 5KJ9A 243LA 1GB6A 1KY0A 194LA 5I54A 5F9UA 3N9CA 1WQRA 2BQMA 3ATNA 210LA 2B6WA 3FI7A 3CDRA 3D3DA 4ARMA 1QUDA 1L16A 3C83A 205LA 1DXJA 4QY9A 2HU3A 175LA 1AM7A 1IP2A 1WQNA 3HT7A 1IOTA 4DWXA 1B0DA 155LA 1L62A 1I1ZA 2LYOA 1JITA 2F32A 3SB7A 2BLXA 171LA 4B1AA 133LA 1L54A 258LA 1D2WA 1FKVA 1YKZX 3CDTA 1L34A 209LA 3E3DA 2OTYX 3UONA 1J1XY 1ZVYB 207LA 1G7MC 3TXFA 5LA5A 1V7SA 200LA 1L47A 2H9KA 1L55A 1CV6A 2RAYX 1NBYC 4RDSA 3F8VA 1H87A 149LA 1GEZA 1C6NA 1G7IC 3AZ6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1A4V A;  5F14 A;  4CFO A;  1BQL Y;  1BVK C;  1CVK A;  1LMT A;  3FI5 A;  1LSF A;  1ZMY L;  7LZM A;  2BLY A;  1SSW A;  5FEL A;  4IAT A;  183L A;  1P2L A;  1VAT A;  1B7Q A;  3HT6 A;  1L19 A;  3HUQ A;  1G1W A;  1IP6 A;  2F4A A;  4EPI A;  5J7C A;  5FEK A;  1C43 A;  1QTE A;  4FJR A;  4WL6 A;  2LZT A;  1DKJ A;  1WQP A;  1LJF A;  2PC2 A;  1C65 A;  1JKC A;  3CT0 A;  198L A;  1GB3 A;  1LZR A;  2MEB A;  5KKI A;  1SX7 A;  4Z41 A;  4H90 A;  1LMP A;  4XJG A;  1L67 A;  1N4F A;  5EBH A;  1L41 A;  4OWC A;  211L A;  1TCY A;  3G3V A;  1C6M A;  4LGK A;  5KY1 A;  4H8Z A;  4L41 A;  1ALC A;  4H9F A;  4W51 A;  4I7S A;  2B5Z A;  1L77 A;  2D4K A;  1L23 A;  1C6F A;  1GD6 A;  2BQE A;  3HWL A;  3CSR A;  4B49 A;  1LZE A;  1YIL A;  5F81 A;  5M1Y A;  1FDL Y;  4DDB A;  3DN8 A;  3HTD A;  4LDE A;  4DJH A;  1LMC A;  1QSA A;  4H92 A;  4K5Y A;  1FLU A;  5APE A;  1GXX A;  1LZN A;  241L A;  3A90 A;  1KXX A;  3G3A B;  107L A;  4NSG A;  4HTQ A;  4J7V A;  1IR9 A;  188L A;  4ZIX A;  2LCB A;  3P68 A;  1AT6 A;  1D9U A;  1D0K A;  154L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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