150LA

Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEILRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 54
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 150lA00
1SX2A 1L04A 172LA 3C7YA 3OE0A 1L72A 3F8VA 1L57A 4DJHA 1L16A 212LA 3SB5A 1QT8A 222LA 2IGCA 258LA 2RBPA 1L60A 6LZMA 233LA 1T6HA 249LA 3JR6A 3G3XA 1L65A 1QTZA 3HWLA 2RAYX 1L90A 231LA 4I7TA 155LA 2B73A 3PBLA 1P56A 2RB0X 1JQUA 1OVHA 1L17A 1L47A 1P46A 2LZMA 1DYGA 1QTDA 3UONA 1C65A 160LA 2B6WA 107LA 186LA 3OE8A 1DYFA 3PDSA 3DN4A 161LA 2QB0B 1T97A 2B72A 1L32A 1C6TA 4W51A 1ZURA 129LA 3DN0A 4I7PA 3OE6A 1L49A 4W57A 1L25A 1L91A 255LA 166LA 1QTCA 228LA 1L62A 247LA 1CV6A 1L36A 239LA 4PK0A 1L10A 1KW7A 3DN8A 4EPFA 2B6TA 1L11A 1B6IA 3GUKA 1OVJA 1SSWA 3HTDA 4ARMB 1SWZA 1SWYA 1LLHA 1C62A 262LA 2OEAX 1C6AA 2B6YA 1OWYA 1CX6A 4I7NA 229LA 1D3JA 3HTBA 1C66A 3C8SA 3G3WA 4I7RA 110LA 1L46A 2RBSA 4I7SA 4W58A 1LI2A 191LA 1G06A 4IAPA 1L73A 1CV4A 3SB7A 1LGUA 2RB1X 1KY1A 1D3FA 4OO9A 1C6GA 3DN2A 1KY0A 1QT4A 174LA 1L85A 1L43A 148LE 4EXMA 1L59A 215LA 1C61A 3EMLA 180LA 1LYJA 4I7QA 4I7KA 237LA 248LA 260LA 3C83A 2OTZX 1G0MA 3C8RA 140LA 1P36A 3FA0A 201LA 1TLAA 1CV0A 4YXCA 1QTVA 1CU6A 1L27A 235LA 1QUGA 1L35A 219LA 1L96A 1L68A 1QTHA 181LA 2OU9A 3DNAA 4LDOA 1JTMA 1PQDA 1NHBA 1L81A 2B6XA 3HH6A 4I7JA 3C80A 1L92A 3V2YA 3DN6A 1L37A 1CTWA 3HDEA 104LA 184LA 227LA 4W52A 4EKSA 2RAZX 245LA 1QT7A 3HU8A 1OV7A 3SB9A 171LA 3GUIA 126LA 1L61A 2O7AA 4ARQB 252LA 4DKLA 1LW9A 2B75A 1C6DA 1LYEA 2Q9DA 1PQOA 1DYDA 2CUUA 2LC9A 4LDEA 4AQNA 2OU8A 1PQJA 1L52A 196LA 1DYAA 1L87A 3V2WA 1LWKA 2ANVA 1G0GA 162LA 1L42A 156LA 2F2QA 1C69A 4ZPUA 1T8AA 1L08A 1QT5A 1CVKA 2RBNA 224LA 1CV5A 1LYHA 234LA 2RBQA 1L80A 4K5YA 1QT6A 2B7XA 192LA 1L76A 1L0KA 119LA 142LA 1C6JA 1JTNA 1L18A 3HUKA 4W54A 1L53A 1L74A 109LA 1SSYA 1P5CA 3C8QA 4I7MA 4EPIA 1LYGA 178LA 3HH5A 144LA 2L78A 256LA 3L64A 2LCBA 1C63A 149LA 1CV1A 2NTHA 1XJTA 165LA 1L01A 131LA 1LYIA 168LA 1L48A 123LA 1L40A 3LZMA 1G07A 1L29A 3CDVA 108LA 199LA 4ARLA 200LA 1CV3A 3GUJA 1L69A 163LA 1QT3A 4I7LA 130LA 1C6HA 1L83A 1L89A 1L93A 206LA 1C64A 1C6LA 1CX7A 4GBRB 1P37A 1L0JA 1C6KA 3DMZA 3GUNA 102LA 1QUDA 4EKQA 3RZEA 1OYUA 1G0LA 2RBRA 3C81A 2F47A 1KS3A 1XJUA 1CU5A 3RUNA 2RBOA 1L00A 244LA 3NY8A 2O79A 170LA 1KW5A 1D3NA 213LA 164LA 1DYBA 251LA 1ZYTA 1D9WA 195LA 3C82A 1L58A 1G0PA 1L79A 3F9LA 226LA 214LA 1CU3A 112LA 254LA 1LI3A 1QSQA 261LA 1SX7A 1PQMA 230LA 1G0QA 1K28A 1LI6A 1L44A 243LA 122LA 2ANXA 1C6PA 1C6EA 1L30A 1QS5A 182LA 1L54A 1L21A 118LA 1L66A 232LA 1L31A 4PJZA 1L38A 3DMXA 1G0KA 3NYAA 173LA 4EJ4A 3CDTA 210LA 1L24A 1T8GA 216LA 2RH1A 7LZMA 1PQIA 1L14A 2A4TA 188LA 1G1VA 183LA 1G0JA 3HUQA 220LA 1XEPA 1P2LA 1PQKA 1L88A 3L2XA 1OVKA 103LA 1P7SA 3G3VA 1KNIA 4S0WA 4ARQA 1P3NA 2OE7X 138LA 3HTGA 223LA 125LA 4W59A 209LA 3DKEX 189LA 1L51A 1LGXA 1L64A 3HU9A 1L67A 2OE4X 5I14A 3C7WA 1L82A 3GUMA 1L34A 3D4SA 3SB8A 2HULA 3HTFA 1L28A 250LA 141LA 139LA 167LA 3GULA 111LA 221LA 4EKPA 1L86A 4LDLA 1L07A 1L50A 1EPYA 4I7OA 1L06A 4W53A 158LA 1L41A 205LA 1QUOA 1C60A 2NTGA 1L09A 113LA 3OE9A 211LA 3C7ZA 240LA 3SBAA 3SN6R 151LA 1L19A 1LPYA 1OWZA 3DN1A 1CU0A 3VW7A 2B70A 1C6QA 1CUQA 1D2YA 120LA 257LA 4GRVA 1L75A 1L56A 1QS9A 217LA 1L23A 1G1WA 1P64A 128LA 169LA 4EKRA 4ARMA 1LYFA 114LA 1L45A 1L70A 3HT7A 1CU2A 1QTBA 1D2WA 3HT8A 127LA 3SB6A 4ARPA 1L84A 1DYEA 3GUOA 246LA 4ARJA 1L71A 2OTYX 2HUMA 241LA 3QAKA 2F32A 1C68A 185LA 1C6IA 190LA 1LGWA 1L03A 3FI5A 1L98A 1L05A 157LA 143LA 1L26A 2HUKA 4W56A 1L33A 1L15A 1C6FA 1L63A 4W55A 145LA 137LA 1L22A 1C6CA 147LA 2RB2X 3DN3A 1P6YA 5LZMA 177LA 3SBBC 115LA 4YX7C 3DMVA 1L99A 187LA 3HT9A 2QARC 3GUPA 3HT6A 4LZMA 1OV5A 3CDOA 1WTHA 1I6SA 2B74A 1L55A 2OU0X 2Z6BA 3NY9A 1C6NA 1C67A 1P2RA 152LA 2B6ZA 1LYDA 1DYCA 198LA 1L13A 150LA 159LA 3HUAA 2OE9X 1L39A 1L20A 1QUHA 1ZWNA 242LA 3K2RA 4YXAC 1L94A 238LA 146LA 4DAJA 197LA 1C6MA 218LA 1D3MA 253LA 1L95A 236LA 1CUPA 1L97A 225LA 3HDFA 3CDRA 3HH4A 259LA 2Q9EA 4E97A 2O4WA 3ODUA 1T8FA 176LA 1QSBA 1L77A 3FADA 1LWGA 3HH3A 175LA 3CDQA 1C6BA 1L12A 1L02A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IX0A 3WYHA 153LA 1TEWA 1P2CC 1REZA 3F8VA 1OQMA 1LMAA 1L57A 1XFPL 4DJHA 1UIFA 212LA 2F4AA 1QT8A 1GAZA 1IP7A 1V7SA 258LA 5ILCA 3CSZA 4RDSA 1LKRA 2D91A 1JPOA 4ANRA 1WQRA 4QDNA 2FBBA 1IVMA 3W6FA 1QIOA 3JR6A 1L65A 1QTZA 2RAYX 231LA 5KXYA 4WM1A 1IR8A 5HMVA 3UONA 1C65A 1GFAA 4B4JA 160LA 4H8YA 186LA 1G7JC 3DN4A 2QB0B 5IHGA 2MEEA 3WVXA 1ZURA 4B1AA 2XBSA 3DN0A 2XTHA 1HSWA 1GEVA 4I7PA 4R0FA 4DWXA 4WLTA 1YIKA 1QUTA 2LYMA 4WG1A 1CV6A 1L36A 1LJNA 1KW7A 3A94A 1KXYA 1L11A 1DI5A 2ZNWY 1D6PA 4ARMB 3LZTA 1NBYC 1SWZA 5LIOA 2YDGA 4LFXA 2H9JA 2HEAA 3F6ZA 5FDJA 4I7RA 2HU3A 135LA 2RBSA 2YBMA 3P64A 5KXNA 3WUMA 1LI2A 2G4QA 1L73A 1LGUA 3LZ2A 1IWTA 2VB1A 1D3FA 1KY0A 1QT4A 1L85A 3TMXA 1JIYA 2ZQ4A 1FLUA 1IR9A 1IO5A 140LA 1GFKA 1P36A 1OUGA 3FA0A 4A7DA 1B5XA 1BB6A 5HLLA 1YAQA 2HEBA 4J7VA 1L96A 2BQLA 4LDOA 1XGTC 1B9OA 1LSFA 2EKSC 1PQDA 3V2YA 1KXWA 1L92A 1GF6A 2W1YA 1CTWA 4NFVA 5E4PA 3B0OA 3HU8A 3TXHA 126LA 252LA 1OUHA 3WUAA 4G4CA 2CUUA 2LC9A 5F9XA 2Z12A 2WARA 1B5UA 1LMTA 2ANVA 3A6CY 5HNLA 4DDBA 1L08A 2CWIA 3ZVQA 2HTXA 1CV5A 1B7NA 234LA 1GEZA 1IP2A 2B7XA 1DZBX 1YAMA 1LZ5A 1L18A 109LA 3G3AB 3HH5A 1LZ1A 1IC4Y 4NWEA 256LA 3L64A 1GBXA 165LA 1VDTA 1LYIA 1L48A 3TMUA 1OUJA 1XEKA 1G07A 1KIRC 108LA 5A3ZA 4ARLA 200LA 1HNLA 1QT3A 163LA 2BQBA 4EMNA 1C6HA 1L93A 1YKYX 1IWWA 1C6LA 1FBIX 3GUNA 1LZTA 4B0DA 3RZEA 4FJRA 3C81A 4PRQA 2F47A 1KS3A 3P66A 1BB7A 244LA 5D5FA 2DQFC 170LA 1D3NA 164LA 7LYZA 1DYBA 4NGVA 3SP3A 195LA 1LMCA 1G0PA 2ZYPA 214LA 1F6RA 3AGGG 1LHLA 1DKJA 261LA 1PQMA 5T3FA 230LA 4LYZA 243LA 122LA 1W6ZA 1LCNA 1DPXA 1T6VL 154LA 1AT6A 4PJZA 5LAGA 5KXTA 1CJ8A 5LAFA 1T8GA 1PQIA 1L14A 1LZAA 188LA 2I26L 4KPMA 183LA 1G0JA 1GF0A 3E3DA 1RJCB 220LA 4HTKA 1L88A 1KNIA 1QSWA 4NSGA 1P3NA 1HELA 1KXXA 1REMA 4NSIA 4UWNA 4XJDA 1JKDA 3QY4A 1LZ6A 4NSHA 2Z2EA 1IWUA 2MECA 2Z38A 1LHKA 4NHIA 1L67A 5I14A 3C7WA 1EL1A 3EO5A 1LJGA 4Z41A 3HTFA 4HJZA 1IY3A 141LA 167LA 1LJ3A 3WPJA 5JENB 1L50A 2YBJA 1EPYA 2CJLA 158LA 4NGYA 3OE9A 3CB7A 2HEDA 2C8PA 3SBAA 1OUBA 151LA 1LPYA 4IJ4A 3WL2A 1UIGA 1C6QA 3TMWA 4TSCA 3A90A 1G7MC 3ATOA 3A3RX 4LT3A 1VATA 1L23A 4G4HA 128LA 169LA 4QGZA 4EKRA 114LA 1L70A 3HT7A 3HT8A 2BAAA 4NGKA 1C7PA 1L71A 2OTYX 3HFMY 1PZYA 1LSAA 241LA 4I0CA 1E8LA 4DD9A 1GB2A 1B5ZA 4H9AA 4QEQA 3FI5A 1LZSA 5KKIA 143LA 4WOAA 1VDPA 4W56A 4ETCA 1B7LA 4HV2A 145LA 4W55A 1GFVA 5LA5A 2RB2X 3DN3A 1P6YA 2HEEA 2DQAA 3SBBC 1FN5A 2Q0MX 3GUPA 2LYOA 3HT6A 3CDOA 1WTHA 1NDGC 1QSAA 4ET9A 1OUDA 1GAYA 4NGWA 3M18B 1B2KA 1DYCA 5HQ1A 1LPIA 150LA 3HUAA 5IDDA 1BQLY 1GPQC 5C6IA 4I8SA 4YXAC 1L94A 146LA 3AZ5A 218LA 1DKKA 2BPUA 1LZEA 4WO9A 3RW8A 253LA 4II8A 1CNSA 1CKCA 1T3PA 4RW2A 1NF5A 2BLXA 3CDRA 2Q9EA 4E97A 1LWGA 8LYZA 1LZDA 3B72A 4J0LA 1SX2A 1LHJA 3T36A 5KXOA 1HHLA 1L72A 3T6UA 4C5FA 4GCFA 222LA 2BQFA 2RBPA 1GBZA 2Z18A 6LZMA 1T6HA 2YBHA 3EXDA 3G3XA 3HWLA 1UICA 1L90A 1QTKA 1IOTA 3PBLA 3ZEKA 1P56A 2MEHA 1QTDA 1GFUA 1WTNA 107LA 1DYFA 4N5RA 161LA 1T97A 2B72A 5LVIA 4OOTA 4XJFA 5LVGA 1LHMA 2BQKA 1SLYA 1L49A 4W57A 1LAAA 1LZCA 3BKHA 166LA 2FBDA 4PK0A 239LA 2DQHY 4LYBA 4LYMA 4ZEEA 6LYTA 3DN8A 4H1PA 4EPFA 2B6TA 1IWYA 1LJIA 1B6IA 3FI7A 1OVJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IX0 A;  3WYH A;  153L A;  1TEW A;  1P2C C;  1REZ A;  3F8V A;  1OQM A;  1LMA A;  1L57 A;  1XFP L;  4DJH A;  1UIF A;  212L A;  2F4A A;  1QT8 A;  1GAZ A;  1IP7 A;  1V7S A;  258L A;  5ILC A;  3CSZ A;  4RDS A;  1LKR A;  2D91 A;  1JPO A;  4ANR A;  1WQR A;  4QDN A;  2FBB A;  1IVM A;  3W6F A;  1QIO A;  3JR6 A;  1L65 A;  1QTZ A;  2RAY X;  231L A;  5KXY A;  4WM1 A;  1IR8 A;  5HMV A;  3UON A;  1C65 A;  1GFA A;  4B4J A;  160L A;  4H8Y A;  186L A;  1G7J C;  3DN4 A;  2QB0 B;  5IHG A;  2MEE A;  3WVX A;  1ZUR A;  4B1A A;  2XBS A;  3DN0 A;  2XTH A;  1HSW A;  1GEV A;  4I7P A;  4R0F A;  4DWX A;  4WLT A;  1YIK A;  1QUT A;  2LYM A;  4WG1 A;  1CV6 A;  1L36 A;  1LJN A;  1KW7 A;  3A94 A;  1KXY A;  1L11 A;  1DI5 A;  2ZNW Y;  1D6P A;  4ARM B;  3LZT A;  1NBY C;  1SWZ A;  5LIO A;  2YDG A;  4LFX A;  2H9J A;  2HEA A;  3F6Z A;  5FDJ A;  4I7R A;  2HU3 A;  135L A;  2RBS A;  2YBM A;  3P64 A;  5KXN A;  3WUM A;  1LI2 A;  2G4Q A;  1L73 A;  1LGU A;  3LZ2 A;  1IWT A;  2VB1 A;  1D3F A;  1KY0 A;  1QT4 A;  1L85 A;  3TMX A;  1JIY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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