157LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFAAALAALAAKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 157lA00
3UONA 2F2QA 1ZYTA 1L08A 2RH1A 1CV6A 7LZMA 2RB0X 1QTHA 1KY0A 3SB6A 1C6QA 1L27A 242LA 3LZMA 1P37A 3F9LA 1QT4A 2RBSA 4GRVA 220LA 1QT5A 1OV7A 244LA 2L78A 1L87A 3L2XA 1CTWA 4EKPA 219LA 239LA 1OVJA 257LA 111LA 1SX7A 2F47A 1D3FA 248LA 1L07A 2B6ZA 1L50A 1XJUA 1L05A 4S0WA 1L83A 1G0PA 1L37A 1L65A 1L36A 166LA 1CUQA 214LA 4I7LA 222LA 2OU8A 2B72A 1P7SA 1XJTA 152LA 170LA 1L14A 149LA 3QAKA 109LA 2B6WA 1L52A 243LA 3C80A 241LA 4YXAC 1L48A 3HTBA 3HTGA 2Q9EA 1L99A 127LA 2LZMA 1C68A 2B6XA 1OWZA 1P64A 3JR6A 229LA 3DN8A 1OV5A 1QT6A 4EPFA 1SSYA 2RBNA 4LDOA 196LA 3C83A 1L74A 1L61A 3FA0A 3DN1A 3SN6R 2LC9A 1P3NA 1G0MA 2B73A 3DKEX 1C6FA 1L64A 1L89A 3C7YA 3C8QA 4AQNA 1C6JA 4W54A 3NYAA 1G0JA 1C64A 250LA 3HT8A 4EPIA 1P36A 1L19A 160LA 1L72A 1DYBA 1L53A 1G0GA 2Q9DA 1QS9A 3FI5A 3PDSA 1C6TA 1LGWA 125LA 171LA 1C63A 2RAYX 1L38A 3CDQA 159LA 2IGCA 1QUGA 3HDFA 3RUNA 1L10A 228LA 3HTFA 4I7RA 167LA 235LA 1NHBA 3DN0A 225LA 4EKSA 1KNIA 199LA 1D3JA 1LYFA 2O7AA 3GUNA 1P5CA 1L39A 2B6YA 185LA 1CV0A 247LA 173LA 2HUKA 2LCBA 262LA 226LA 238LA 1P46A 1CU3A 2OTYX 3GUMA 1LI6A 3G3WA 131LA 141LA 1G0KA 1L13A 3HH4A 142LA 1C62A 2B7XA 3K2RA 1L76A 1DYAA 145LA 1L70A 261LA 176LA 1P2LA 1SSWA 3NY8A 1WTHA 1D9WA 4DKLA 3C7ZA 217LA 1L43A 4DAJA 4I7SA 1L85A 4I7KA 1ZURA 1L58A 1QUOA 1C6IA 1LYHA 110LA 1QUDA 150LA 260LA 104LA 251LA 2HUMA 3V2WA 2RBOA 1C69A 3GUOA 1L32A 1LI3A 1CU0A 1T8AA 114LA 1L73A 232LA 1L21A 3SB5A 1L79A 2CUUA 2OTZX 192LA 4PJZA 165LA 126LA 1L56A 168LA 3PBLA 175LA 1PQMA 1TLAA 3CDOA 1JTMA 1L59A 221LA 130LA 1I6SA 1G07A 4ARLA 3HU8A 1L96A 1T97A 1KW7A 1LWGA 1OYUA 1QSBA 236LA 1L49A 258LA 162LA 2QARC 4I7NA 1C6HA 1OVHA 2RBQA 4W59A 2RBPA 1C6BA 1DYDA 212LA 3GUJA 3NY9A 218LA 1L41A 1T6HA 1CUPA 1XEPA 1K28A 205LA 3HT9A 3HWLA 148LE 249LA 3D4SA 1KS3A 223LA 3HUKA 1L71A 2OU0X 2B6TA 4W53A 240LA 2NTHA 1L88A 1QTBA 1CV5A 2B70A 3FADA 138LA 3OE0A 6LZMA 3C8RA 102LA 230LA 4I7PA 198LA 255LA 1L30A 1L60A 1L91A 1QTCA 2F32A 1CU5A 3HT7A 1L25A 1D3NA 233LA 1PQKA 237LA 1B6IA 3HTDA 1L12A 103LA 4EXMA 1G06A 1LLHA 3HDEA 3L64A 2QB0B 144LA 3DNAA 120LA 3DMVA 191LA 5LZMA 1C6LA 2RB2X 190LA 1L26A 1L24A 195LA 4IAPA 245LA 4ARQB 147LA 4OO9A 1CX6A 1L22A 197LA 115LA 112LA 1P6YA 3HT6A 1DYGA 1QTVA 122LA 3GULA 1L06A 158LA 3SB8A 4I7MA 231LA 1D2WA 2ANXA 1CU6A 3DMXA 253LA 139LA 1QT3A 4W55A 1LPYA 1DYCA 3RZEA 1C65A 1C6AA 1L82A 146LA 2Z6BA 200LA 206LA 1L57A 3C7WA 1L92A 1C60A 1L45A 3G3XA 2RAZX 1CVKA 4GBRB 3HH3A 1C61A 3CDVA 1G0LA 4ARMB 3HUAA 1L34A 224LA 4ARQA 216LA 1L84A 4DJHA 1L90A 1JQUA 1L16A 1DYFA 4W58A 1T8FA 3OE6A 1PQOA 1DYEA 2OU9A 1L31A 1L68A 1L75A 3HUQA 1ZWNA 1L54A 4W51A 4YXCA 1D3MA 2OE9X 1L97A 209LA 2B74A 1L15A 1OWYA 3HH6A 1C66A 3G3VA 4I7TA 1EPYA 1P2RA 113LA 1L80A 2OEAX 2HULA 188LA 4ARMA 118LA 1L67A 1L55A 1CV3A 1L33A 1CU2A 1QT8A 4K5YA 1QTDA 186LA 1C6PA 1LI2A 210LA 155LA 3ODUA 4I7JA 1G1WA 2B75A 4ARJA 1L62A 1G0QA 163LA 1LYIA 1L51A 215LA 3SBAA 1L94A 3GUPA 4I7OA 1L77A 182LA 3HH5A 1SWYA 137LA 1LYGA 1PQIA 151LA 1C6NA 1LGUA 3C8SA 1QSQA 1L17A 140LA 107LA 1CX7A 3DN2A 1L47A 211LA 1T8GA 1C6GA 3V2YA 157LA 4ARPA 4PK0A 4EJ4A 1C6MA 2A4TA 1L29A 3CDRA 1LYDA 3HU9A 1C6EA 169LA 1L18A 1L63A 3EMLA 123LA 1L81A 1L44A 234LA 1L02A 1LWKA 156LA 252LA 184LA 1L95A 1LW9A 3CDTA 201LA 2O79A 1L23A 129LA 1L00A 1L86A 3SB7A 1CV4A 1L03A 178LA 213LA 1OVKA 2ANVA 1L0KA 189LA 1L98A 2NTGA 1L35A 5I14A 1SWZA 177LA 1L04A 4E97A 1L46A 172LA 1L01A 4W56A 1JTNA 2OE4X 2O4WA 1LYEA 3C82A 4W52A 1L93A 164LA 4W57A 259LA 1SX2A 4LDEA 1QUHA 1L66A 3GUIA 143LA 4LZMA 1QTZA 3DN6A 1QS5A 181LA 1LGXA 256LA 187LA 128LA 1LYJA 4EKRA 1L09A 4EKQA 183LA 1PQJA 3DN3A 1C6CA 1L11A 1PQDA 1C6KA 4I7QA 1P56A 3C81A 3SBBC 254LA 119LA 174LA 1D2YA 2OE7X 4LDLA 3GUKA 1L40A 4ZPUA 227LA 3F8VA 1L20A 1KY1A 3VW7A 4YX7C 2RB1X 1C6DA 161LA 3SB9A 1G1VA 1KW5A 246LA 3DMZA 1L28A 3OE9A 1C67A 1L42A 1L0JA 1QT7A 1CV1A 1L69A 108LA 3DN4A 180LA 2RBRA 3OE8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W6FA 1ZYTA 3AW7A 3ZVQB 4XJHA 2GV0A 2LZTA 1LTMA 1GB5A 1L27A 2A7DA 3TXEA 3TXIA 2Y8PA 3LZMA 1P37A 4GRVA 3BKHA 2I6ZA 1B7RA 1XGRC 1UC0A 2RSCA 1OVJA 257LA 111LA 1B7LA 1L50A 1B5UA 1LJEA 3RZ4A 1C45A 1AZFA 4S0WA 4RW1A 1G0PA 4H9IA 4ZFPA 4Z98A 5II3A 214LA 4NFVA 5FHWA 5LVHA 4LFPA 1LSPA 3A94A 4N0JA 1RCMA 2B6WA 1EL1A 2CGIA 2Q9EA 1C68A 2DQIY 4GLVA 2B6XA 1P64A 1WTNA 1VEDA 1OV5A 4NWHA 3FA0A 1JWRA 5KXRA 1LJFA 1BGIA 3SP3A 1P3NA 1UIFA 1G0MA 3DKEX 3EBAB 3C7YA 1L89A 3WW6A 4HV1A 2MEFA 4EPIA 1LJJA 1L19A 160LA 4HV2A 4H9HA 1L53A 3FI5A 3PDSA 1IVMA 1HEOA 193LA 1DPXA 1TCYA 4WM6A 1C63A 3CDQA 1UBZA 5DN5A 1L10A 4DQJA 1RE2A 2HU3A 1NHBA 1CJ7A 2LYZA 3WVXA 4H9FA 135LA 1D3JA 2O7AA 3QE8A 1PZYA 1GFJA 1O23A 2BQKA 185LA 1OP9B 2F2NA 5APDA 1LSEA 3AW6A 1CV0A 1GBXA 173LA 5B07A 1G7LC 1XFPL 1LI6A 3G3WA 5DL9A 131LA 1G0KA 3HH4A 5I4WA 1HENA 1GBWA 1FKQA 1L76A 1LZ5A 1OUCA 217LA 1YAMA 4I7SA 5M1YA 4LT0A 2DQDY 3WPJA 1WQPA 5B1FA 2HUMA 3V2WA 2RBOA 1GB0A 1LI3A 114LA 1T6VL 4DDCA 2ZQ3A 4NGWA 4H8YA 5HLLA 1IR8A 5IELA 4X3BA 3PBLA 175LA 4DD1A 1V7TA 221LA 3ATOA 1JKBA 3TXJA 1G07A 3N9AA 1L96A 1H87A 258LA 1JSFA 2QARC 1UIAA 4NHSA 2BQJA 2RBQA 2RBPA 1JPOA 1IP5A 1NHEA 3AZ5A 212LA 1FKVA 2D4IA 1LOZA 2HEEA 3LYTA 4WM5A 4DYGA 1L41A 1BB4A 4NGKA 4H9BA 3HFMY 3HWLA 5EBHA 3HUKA 1KS3A 3W6BA 240LA 3TMUA 2FBBA 1RJCB 1Z55A 1QTBA 2B70A 4R6CA 1EQ5A 4MR1A 5HNLA 1LJIA 1B6IA 3HTDA 2D6BA 4CGEA 3B0IA 3GXKA 1G06A 1LLHA 1JJ1A 5FDJA 5KXPA 3KAMA 4BAFA 1JUGA 2BQMA 2QB0B 4H9AA 4LYOA 2RB2X 1J1OY 190LA 2HU1A 245LA 1IOTA 1HSWA 147LA 5LVGA 3WYHA 1CX6A 1FLUA 1L22A 4WLXA 2C8PA 1UACY 1HNLA 4N1CC 3LN2A 1LHHA 1D2WA 4B4EA 1LZ6A 1QT3A 4W55A 4CHXA 1LYSA 1L82A 146LA 3TXHA 1HFXA 2F4GA 4GN5C 1L57A 3C7WA 1D6PA 3G3XA 1LKSA 154LA 1CVKA 2ZIJA 1IOCA 2X0AA 1C61A 1B5WA 1G0LA 2W1MA 3A95A 224LA 216LA 3QY4A 5K7OA 1L90A 2I25L 4ETDA 4NHIA 4QDNA 3A34A 1T8FA 4WM1A 5IDDA 4IASA 1L68A 3HUQA 4N1EI 4NGZA 1L54A 5LXWA 2OE9X 2I26L 4GCDA 1GE1A 4I7TA 5LIOA 5KKJA 113LA 4ARMA 118LA 1B7SA 5KXZA 4LFXA 4K5YA 1GB9A 3IJUA 4DD2A 186LA 1NBYC 1LI2A 210LA 4I7JA 3W6DA 1L62A 1LSZA 215LA 2HEAA 1REYA 1PQIA 2CWIA 1C6NA 3C8SA 3WVYA 2Q0MX 4RLNA 140LA 1GF5A 3WU7A 1C46A 3WW5A 1T8GA 157LA 1C6MA 3ZEKA 1L29A 3HBHA 1OUIA 1L81A 1IOSA 1L44A 252LA 5FCPA 1L95A 1LW9A 201LA 2O79A 1KXWA 4OWAA 129LA 2IHLA 3SB7A 178LA 1OVKA 4XN6A 3CB7A 1L98A 1LHMA 1L35A 3A8ZA 172LA 4W56A 2XBSA 1LZRA 1WVUA 1DXJA 4LDEA 1QUHA 1FLWA 4NSGA 1LGXA 256LA 1GXV2 1HERA 4WM2A 1HEWA 4WOAA 1YANA 1L11A 1PQDA 1JISA 1P56A 3SBBC 5KXKA 1JEFA 1GB3A 2OE7X 2Z39A 4TX7A 1BB3A 3EO5A 4NGIA 3VW7A 4YX7C 4LYZA 1FBIX 1KW5A 2ZWBA 1L28A 1XGTC 2BQNA 1DI4A 4XJFA 4QGZA 4H9EA 2RBRA 2BQIA 3OE8A 1CV6A 1QQYA 2XTHA 1QIOA 4WL6A 1UCOA 1YL1X 1JTPL 3SB6A 1RI8B 2HEBA 220LA 1QT5A 4NHTA 4EKPA 219LA 3T6UA 1JKCA 4N9RA 5I5QA 1BHZA 1OUJA 4HJYA 1XJUA 3CSZA 1L05A 4H9CA 2YVBA 1A2YC 4HSFA 5B05A 1L83A 1L65A 1LJGA 222LA 4ANRA 4NSJA 1GFRA 1LZ1A 4NIJA 1WTMA 170LA 1L14A 149LA 5HMVA 109LA 5ILFA 243LA 4YXAC 241LA 1L48A 2LYOA 2LZMA 1VFBC 1YKZX 1OWZA 4EOFA 3DN8A 4HTNA 4EPFA 1WQQA 2RBNA 4LDOA 3C83A 1GF8A 1L74A 1BWIA 4HPEA 1GF4A 3DN1A 4DQ5A 4NY5A 3M18B 2BQOA 2W1XA 4OWCA 1C6JA 1NDGC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3W6F A;  1ZYT A;  3AW7 A;  3ZVQ B;  4XJH A;  2GV0 A;  2LZT A;  1LTM A;  1GB5 A;  1L27 A;  2A7D A;  3TXE A;  3TXI A;  2Y8P A;  3LZM A;  1P37 A;  4GRV A;  3BKH A;  2I6Z A;  1B7R A;  1XGR C;  1UC0 A;  2RSC A;  1OVJ A;  257L A;  111L A;  1B7L A;  1L50 A;  1B5U A;  1LJE A;  3RZ4 A;  1C45 A;  1AZF A;  4S0W A;  4RW1 A;  1G0P A;  4H9I A;  4ZFP A;  4Z98 A;  5II3 A;  214L A;  4NFV A;  5FHW A;  5LVH A;  4LFP A;  1LSP A;  3A94 A;  4N0J A;  1RCM A;  2B6W A;  1EL1 A;  2CGI A;  2Q9E A;  1C68 A;  2DQI Y;  4GLV A;  2B6X A;  1P64 A;  1WTN A;  1VED A;  1OV5 A;  4NWH A;  3FA0 A;  1JWR A;  5KXR A;  1LJF A;  1BGI A;  3SP3 A;  1P3N A;  1UIF A;  1G0M A;  3DKE X;  3EBA B;  3C7Y A;  1L89 A;  3WW6 A;  4HV1 A;  2MEF A;  4EPI A;  1LJJ A;  1L19 A;  160L A;  4HV2 A;  4H9H A;  1L53 A;  3FI5 A;  3PDS A;  1IVM A;  1HEO A;  193L A;  1DPX A;  1TCY A;  4WM6 A;  1C63 A;  3CDQ A;  1UBZ A;  5DN5 A;  1L10 A;  4DQJ A;  1RE2 A;  2HU3 A;  1NHB A;  1CJ7 A;  2LYZ A;  3WVX A;  4H9F A;  135L A;  1D3J A;  2O7A A;  3QE8 A;  1PZY A;  1GFJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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