158LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNALAMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 56
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 158lA00
142LA 199LA 166LA 185LA 1XJTA 1LLHA 2QARC 249LA 205LA 3G3XA 1KW5A 243LA 1L0JA 1L65A 188LA 1L32A 1CV1A 4ARJA 1L53A 1C66A 4EJ4A 1L73A 1L19A 1G1WA 242LA 3GUIA 232LA 1LWGA 3C8QA 151LA 1L34A 3UONA 1P37A 1L09A 234LA 147LA 198LA 222LA 219LA 3DKEX 4W53A 4ZPUA 1CV3A 173LA 2B73A 172LA 238LA 1XJUA 4W58A 3SB6A 1L44A 228LA 1ZYTA 2OE9X 1QT3A 2F47A 261LA 1L56A 1L07A 3C7ZA 1C6KA 1L49A 118LA 245LA 2O4WA 3SN6R 1G0KA 4YXCA 200LA 148LE 2L78A 216LA 2RAZX 1C6AA 1QT4A 1OVKA 1T6HA 1KY1A 1L51A 2RBNA 144LA 2NTHA 150LA 1G0GA 2LZMA 3HTDA 1D3MA 3DN1A 174LA 3DN6A 3SB9A 3GULA 3HUAA 1C62A 107LA 122LA 1C6CA 1QS5A 3DMZA 1EPYA 226LA 1C6PA 4W57A 3LZMA 1KNIA 1OVHA 5LZMA 2LC9A 2B72A 4I7NA 1L16A 3JR6A 1L38A 230LA 3VW7A 3L2XA 4DJHA 251LA 4I7MA 158LA 4YX7C 189LA 1L06A 1L42A 4I7TA 1LYEA 1D3NA 2RB2X 240LA 3FADA 1CV6A 1L59A 1L63A 1LPYA 2OU8A 1L74A 1LWKA 1L72A 256LA 1DYDA 130LA 1L69A 3HT8A 3HUQA 3DMVA 1L12A 4OO9A 212LA 3C83A 1L50A 1ZURA 146LA 4W56A 3HT6A 3HWLA 1L76A 1C6GA 4E97A 1CTWA 1CV0A 1D3FA 4EPFA 4W55A 1L27A 1SWYA 1C67A 259LA 1L0KA 2HUMA 3HDEA 2OU0X 187LA 3HTBA 4I7PA 6LZMA 2Q9DA 4DAJA 196LA 3EMLA 195LA 1OVJA 1L62A 1L41A 2RBOA 1CUPA 1LW9A 138LA 233LA 1NHBA 201LA 1L46A 4PK0A 3NYAA 169LA 149LA 1PQDA 1L36A 114LA 236LA 2OTZX 1L91A 4EPIA 3G3VA 161LA 4W59A 1L84A 1L88A 3SB5A 1L39A 1L61A 1P2LA 1L04A 1C6EA 1LI2A 2OE4X 4I7JA 1CX6A 206LA 2OU9A 1C6LA 160LA 1G0PA 1L45A 2B7XA 3NY8A 4AQNA 1L66A 155LA 4K5YA 1L68A 244LA 1L01A 209LA 1C6MA 1C6DA 2IGCA 1G0MA 1L54A 1WTHA 3HT9A 1CUQA 128LA 186LA 221LA 4GRVA 4LDEA 1SX2A 4LDOA 1L79A 215LA 1D9WA 1QSBA 1C6FA 1L23A 1QS9A 1QUGA 1LYIA 225LA 4IAPA 1C6NA 1KY0A 1L08A 2F2QA 3DN8A 1C6HA 1T8GA 170LA 3HT7A 1SSWA 184LA 2OTYX 1OYUA 4YXAC 1P36A 253LA 3QAKA 1G0QA 1DYGA 1KW7A 1C63A 1SWZA 157LA 115LA 183LA 2O7AA 1ZWNA 2A4TA 168LA 3F8VA 1L25A 250LA 3V2YA 129LA 1C6BA 1OWYA 1L90A 120LA 1L33A 110LA 3HTFA 1C65A 156LA 1LI3A 3SB8A 4DKLA 2HUKA 1L77A 1L15A 4W51A 1L11A 104LA 2RH1A 126LA 1DYBA 1LGXA 2O79A 111LA 1PQKA 3HH3A 4LDLA 1G0JA 1PQIA 3V2WA 1L80A 141LA 2OEAX 1L55A 4LZMA 139LA 1L86A 3SBAA 257LA 4EKPA 180LA 4EXMA 4ARQB 182LA 2RB0X 1L22A 1G06A 1QT5A 3GUOA 1PQOA 237LA 3HU8A 241LA 125LA 255LA 3CDQA 1G1VA 3SB7A 3GUMA 1P7SA 159LA 3SBBC 3GUJA 4EKQA 1LGWA 4I7SA 2RBSA 165LA 1T8AA 197LA 3C82A 1CU2A 3DNAA 217LA 1L17A 3CDVA 2OE7X 1L13A 1T97A 3K2RA 1C60A 2B6ZA 231LA 2B75A 1L29A 1L85A 3RUNA 235LA 1LYJA 109LA 1CU5A 1PQMA 2B6TA 3HUKA 4ARLA 1L92A 2B70A 1QTDA 1DYEA 1L31A 1PQJA 3C7YA 3F9LA 3PBLA 2B6WA 3HU9A 1QTZA 1L98A 2B6YA 1L05A 3RZEA 3OE9A 2B6XA 1L81A 1L02A 1QUHA 1CU3A 1I6SA 3DMXA 220LA 1L30A 1C64A 2Q9EA 1KS3A 3HDFA 119LA 3ODUA 1QT7A 167LA 1L26A 108LA 4ARPA 1L87A 3DN2A 113LA 1L14A 3G3WA 3CDOA 1L58A 1L21A 1JTNA 246LA 247LA 163LA 1G07A 1L82A 1QTBA 140LA 1CV5A 190LA 1CX7A 152LA 137LA 1L47A 3C8SA 3GUKA 260LA 1L24A 1L94A 213LA 210LA 1C6QA 131LA 1P3NA 191LA 3DN0A 1L93A 2F32A 3HTGA 4W54A 177LA 229LA 1OV7A 1QSQA 1C6TA 1P56A 3HH6A 2ANXA 1LYHA 3C8RA 1LI6A 4ARMB 4I7LA 1L70A 1QTHA 3OE0A 248LA 1CU0A 1CU6A 1CV4A 2RB1X 3PDSA 1L35A 1P5CA 1C69A 1QUOA 4W52A 4ARMA 1QT6A 3DN4A 223LA 2QB0B 3C81A 2RBRA 1B6IA 3CDTA 252LA 1L52A 1L95A 1DYAA 1C6IA 1T8FA 262LA 2LCBA 4I7KA 1L10A 4GBRB 1L03A 1LYFA 2NTGA 103LA 1L28A 1L89A 1L96A 3GUNA 2B74A 162LA 3FA0A 1D2YA 127LA 239LA 3C7WA 1JQUA 3GUPA 1DYFA 3HH5A 1OV5A 2RAYX 1G0LA 1LGUA 1TLAA 143LA 1L48A 3HH4A 4ARQA 1C68A 123LA 1SX7A 1K28A 1QTCA 214LA 1JTMA 1P64A 258LA 1XEPA 2RBQA 171LA 227LA 1L71A 178LA 1QTVA 2Z6BA 4I7OA 1L40A 1L20A 4PJZA 211LA 1C6JA 1L00A 1L37A 218LA 3C80A 3OE8A 175LA 1DYCA 1P2RA 1D3JA 145LA 4I7QA 164LA 3CDRA 3OE6A 1OWZA 3NY9A 4EKRA 4I7RA 1P46A 2HULA 5I14A 4S0WA 176LA 192LA 1QT8A 1L43A 1L75A 4EKSA 254LA 112LA 1L97A 3FI5A 1L18A 224LA 1CVKA 3L64A 181LA 1L99A 1LYDA 2CUUA 1L83A 1P6YA 1L64A 1L60A 1SSYA 102LA 3DN3A 1D2WA 1QUDA 3D4SA 7LZMA 2RBPA 2ANVA 1C61A 1L67A 1LYGA 1L57A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EBHA 1VDSA 249LA 1GXV2 3EBAB 243LA 4H9FA 3A6CY 188LA 4ARJA 1L53A 4GLAA 1C66A 1L73A 1VDPA 3D9AC 1REZA 2HECA 1LWGA 3UONA 1L34A 3AGIA 2FYDA 3A67Y 4GCCA 4RW2A 4ANRA 1YKXX 147LA 222LA 4NG1A 1F6SA 4LGKA 2B73A 1FBIX 238LA 5T3FA 1L44A 2LHMA 2XTHA 4LFXA 4L41A 5L9JA 3N9AA 1XSFA 2LYMA 1C6KA 245LA 2Z19A 1G0KA 1YKZX 4LT3A 1JHLA 2LYZA 5HMJA 1LSFA 4WOAA 1DI4A 2RAZX 3AZ7A 1QT4A 1LJEA 1T6HA 2H9KA 2GV0A 1FLYA 1H87A 4DD9A 2NTHA 1J1XY 1G0GA 2LZMA 174LA 3ATOA 1GDXA 1C6CA 2HEEA 1CKFA 3DMZA 4NGJA 1YAOA 226LA 4Z3MA 1JSEA 1HEQA 2B72A 4NGZA 3ZEKA 230LA 2D91A 5AMYA 3J4GA 251LA 158LA 1L42A 1A4VA 4DC4A 1REXA 4H8ZA 1UC0A 3FADA 1L59A 2DQJY 2BQDA 2YDGA 3P64A 1UBZA 5C6JA 1IY3A 4LT1A 1BHZA 1GFGA 3A91A 130LA 3HT8A 1L12A 1YAMA 4II8A 146LA 1C6GA 2I25L 1CTWA 1D3FA 5LYTA 1L27A 2BQOA 1VDTA 259LA 2HUMA 187LA 1IX0A 4ET8A 196LA 3EMLA 1LSNA 1L62A 1CUPA 1HEMA 233LA 1CKHA 3OJPA 1L46A 169LA 1PQDA 5C6IA 5KXTA 3CSZA 4CHXA 4W59A 3SB5A 4NG8A 1HFXA 2D4JA 4DT3A 2OE4X 2ZILA 3P65A 160LA 2DQCY 1G0PA 1IY4A 5LAGA 1B5UA 1LYOA 155LA 2DQEY 4K5YA 2CDSA 3BKHA 2F2NA 5KXPA 1CUQA 4HSFA 186LA 4LDEA 1IWXA 215LA 1D9WA 1XEIA 1C6FA 1LYIA 1KXWA 225LA 4DDAA 1CKGA 1KY0A 1L08A 4C5FA 1GB0A 1IP3A 1LSGA 3B0OA 2ZNXY 1GE0A 2BQHA 3AZ6A 2I6ZA 4HTKA 1P36A 1G0QA 1KW7A 1C63A 4ET9A 5KKJA 3IJUA 2F4GA 3RT5X 2Z38A 1GFKA 1GF5A 1TBYA 4WLDA 4IATA 1L33A 3HTFA 3LYTA 156LA 1LMQA 1L15A 2YBIA 4UWVA 1B5VA 1DYBA 1GF8A 2O79A 111LA 4LDLA 1C46A 3W6DA 1G0JA 1PQIA 1C45A 3V2WA 1J1OY 4MR1A 2OEAX 1QDRA 1QIOA 4BS7A 4LZMA 4FJRA 1L86A 1LYZA 2YBNA 1IWWA 3AGHA 2IFFY 1PQOA 3HU8A 125LA 4NGOA 255LA 2PC2A 3SB7A 1HENA 3J6KA 4HTQA 1P7SA 159LA 3GUJA 2FYCA 1LMAA 1B7OA 5F81A 3TMUA 1GBOA 1NHEA 3AW7A 4G49A 4YM8A 1NDMC 197LA 2OE7X 3WXTA 2FBBA 4AGAA 3K2RA 1UACY 1C60A 1G7LC 1L29A 2BQGA 3RUNA 1LYJA 1LSPA 1CU5A 1PQMA 3CT0A 2B6TA 1QTDA 1TAYA 3PBLA 1IR7A 1B5XA 2B6WA 3QNGA 3A3RX 1OUHA 2BQIA 1D6PA 154LA 1XFPL 1I6SA 4NGYA 1YROA 2Q9EA 1RJCB 3ULRA 3HDFA 1LSDA 167LA 4H8XA 108LA 2ZNWY 7LYZA 2W1LA 1GE2A 4I0CA 3BKVA 246LA 247LA 1HMKA 190LA 5KXKA 137LA 3C8SA 3GUKA 4H93A 4MSTA 1GFEA 3GXRA 1OUGA 4I8SA 4HJVA 4QGZA 1GB6A 2F32A 4W54A 3AYQA 1OV7A 4LYCA 1HF4A 1C6TA 1P56A 5L3HA 1CJ8A 1DZBX 3C8RA 4ARMB 3LZTA 1L70A 1G7MC 2W1MA 1L35A 5DM9A 1P5CA 4NEBA 1D0KA 1LTMA 5F9XA 3C81A 1B5WA 4I7KA 3WU8A 1LZTA 1LJIA 1YQVY 2YSSC 1BVKC 4YEMA 1PS5A 3CT5A 3C7WA 3AB6A 1LGUA 3WYHA 1L48A 1IWYA 4N1EI 1SX7A 3TXJA 5LA5A 3AZ4A 2A7FA 1LHKA 1QTVA 2Z6BA 1WQQA 1GB7A 4AXTA 1L37A 3OE8A 2CJLA 2W1XA 4U3XB 3B0IA 4NY5A 4WM6A 4IASA 164LA 1OUJA 1OWZA 1GBSA 3NY9A 4I7RA 4NSHA 1IO5A 3A96A 3FI7A 4S0WA 4NGWA 2IHLA 1HNLA 1HMLA 254LA 112LA 4H9AA 1OUEA 1L97A 3FI5A 1MELL 1L18A 1CVKA 1GB3A 3G3AB 1LYDA 1GFHA 1IIZA 1LOZA 2XBSA 1SSYA 1QUDA 4WMGA 1L67A 9LYZA 1SLYA 142LA 199LA 1PZYA 185LA 2QARC 2W1YA 1L0JA 1L65A 4WLYA 4NHQA 4EJ4A 2XJWA 4WM5A 1YAQA 1GF3A 4XADA 1L19A 242LA 1D6QA 1LJGA 1L09A 234LA 3A95A 4WG1A 198LA 1IOTA 1B7LA 1IR9A 3DKEX 4W53A 4ZPUA 6LYTA 1GF7A 1B5ZA 2Z18A 3A8ZA 1LZ9A 1HEWA 4TX7A 3P68A 2OE9X 2F47A 1GAYA 3HBDA 1B0DA 1L56A 1L07A 3C7ZA 5KXLA 1QQYA 1L49A 118LA 2O4WA 3SN6R 4YXCA 148LE 1G7HC 2ZYCA 1DKJA 1RFPA 1GE3A 2G4PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5EBH A;  1VDS A;  249L A;  1GXV 2;  3EBA B;  243L A;  4H9F A;  3A6C Y;  188L A;  4ARJ A;  1L53 A;  4GLA A;  1C66 A;  1L73 A;  1VDP A;  3D9A C;  1REZ A;  2HEC A;  1LWG A;  3UON A;  1L34 A;  3AGI A;  2FYD A;  3A67 Y;  4GCC A;  4RW2 A;  4ANR A;  1YKX X;  147L A;  222L A;  4NG1 A;  1F6S A;  4LGK A;  2B73 A;  1FBI X;  238L A;  5T3F A;  1L44 A;  2LHM A;  2XTH A;  4LFX A;  4L41 A;  5L9J A;  3N9A A;  1XSF A;  2LYM A;  1C6K A;  245L A;  2Z19 A;  1G0K A;  1YKZ X;  4LT3 A;  1JHL A;  2LYZ A;  5HMJ A;  1LSF A;  4WOA A;  1DI4 A;  2RAZ X;  3AZ7 A;  1QT4 A;  1LJE A;  1T6H A;  2H9K A;  2GV0 A;  1FLY A;  1H87 A;  4DD9 A;  2NTH A;  1J1X Y;  1G0G A;  2LZM A;  174L A;  3ATO A;  1GDX A;  1C6C A;  2HEE A;  1CKF A;  3DMZ A;  4NGJ A;  1YAO A;  226L A;  4Z3M A;  1JSE A;  1HEQ A;  2B72 A;  4NGZ A;  3ZEK A;  230L A;  2D91 A;  5AMY A;  3J4G A;  251L A;  158L A;  1L42 A;  1A4V A;  4DC4 A;  1REX A;  4H8Z A;  1UC0 A;  3FAD A;  1L59 A;  2DQJ Y;  2BQD A;  2YDG A;  3P64 A;  1UBZ A;  5C6J A;  1IY3 A;  4LT1 A;  1BHZ A;  1GFG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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