160LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRALQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 160lA00
1L61A 1C6DA 1C6HA 1PQIA 6LZMA 3K2RA 3HH3A 1G0LA 257LA 4ARLA 104LA 1C68A 1P64A 170LA 1XJTA 1ZYTA 4EKPA 1L09A 3OE6A 4YXCA 1L04A 1OWZA 2B6XA 4DAJA 3C8QA 231LA 1LW9A 4DKLA 1QT5A 1L44A 3C8RA 1L25A 2O7AA 1L27A 1L16A 3GUPA 1L75A 1SSWA 4W59A 4AQNA 3HH6A 1CU0A 1SWZA 1CX6A 3HU9A 1JQUA 110LA 1G06A 1L87A 1L76A 1L97A 1DYGA 1JTMA 1C6KA 1L07A 4YXAC 1QT7A 1T6HA 1CVKA 3HUKA 1L36A 260LA 1C61A 3V2YA 252LA 3OE9A 1L72A 2Z6BA 1D3FA 1LLHA 1CU5A 2O4WA 1CU3A 2Q9EA 3GUKA 1KW7A 1T97A 1P6YA 3RZEA 2RBNA 1L71A 1G0PA 1C6CA 3HH4A 108LA 1T8FA 1CV1A 175LA 1C65A 1SX7A 3GULA 220LA 1L19A 2RB0X 3FI5A 4I7NA 3C7WA 5LZMA 182LA 195LA 201LA 2RAZX 3G3WA 174LA 1L77A 1C6LA 1L28A 1T8AA 1L40A 3CDRA 1L56A 240LA 1KY1A 165LA 185LA 2IGCA 215LA 1L88A 1CV4A 1P56A 4ARQA 3HT7A 1DYFA 200LA 1OVJA 1I6SA 1L58A 1LYHA 1L91A 3G3VA 2OTYX 4LDLA 102LA 1JTNA 1QTVA 1SWYA 1PQOA 223LA 213LA 3GUIA 1L74A 1L43A 2B74A 1D9WA 4K5YA 2LC9A 4YX7C 4EKRA 188LA 2OU8A 1L32A 259LA 2RBRA 224LA 1P7SA 230LA 4W52A 3SB7A 3C82A 2QARC 3HDEA 2RBPA 4ARQB 147LA 3HUQA 245LA 3SB6A 3G3XA 1D2WA 2LZMA 2B7XA 197LA 1L80A 1C6GA 258LA 3C7ZA 3RUNA 246LA 3DN2A 113LA 4ARMA 3DN8A 1CX7A 1PQDA 1QTBA 4I7JA 1G1VA 198LA 1PQKA 2NTGA 1L63A 3CDTA 1ZURA 1QUOA 1CU2A 253LA 3VW7A 3PDSA 1L03A 1LYFA 3F8VA 1LYEA 1KNIA 1QUHA 7LZMA 1LWGA 3HTBA 4LZMA 2HULA 249LA 4ARJA 1L50A 199LA 160LA 3SBBC 4ARMB 1G1WA 1L08A 4W51A 1LI6A 1L60A 3V2WA 141LA 219LA 1L30A 2B75A 1QTDA 2QB0B 2RH1A 3OE8A 1LPYA 243LA 159LA 1P37A 1L02A 114LA 1DYBA 3LZMA 144LA 155LA 4I7TA 181LA 1TLAA 1D3MA 128LA 1OV7A 1C62A 1C6MA 1OV5A 1CU6A 1OVHA 209LA 2B6TA 1OWYA 186LA 4EPFA 148LE 2Q9DA 3L2XA 129LA 2HUMA 1G0KA 1C6PA 1P2RA 1C63A 1L85A 191LA 1P36A 206LA 3C7YA 140LA 1L20A 1L62A 142LA 3SBAA 4EKQA 1C6FA 1C6EA 1C6IA 1QT4A 210LA 1CV5A 161LA 3HT6A 1C69A 1L69A 4S0WA 1L79A 1L11A 1G07A 3CDVA 1P46A 2OE4X 217LA 1L81A 1G0JA 1PQJA 3DN3A 3HWLA 1LYJA 1L52A 4EXMA 1L82A 4I7QA 1LI3A 123LA 145LA 1L31A 3GUMA 122LA 3DMZA 3HUAA 2F47A 1QTCA 1C6AA 2ANVA 1L39A 1C64A 4W53A 173LA 1L26A 1OYUA 4I7LA 221LA 3DN6A 3HU8A 4LDOA 211LA 2O79A 3GUNA 1DYAA 4W56A 164LA 1QT8A 2F2QA 1G0GA 2RBSA 1C6QA 118LA 3SB9A 1L96A 237LA 1C6TA 187LA 2B73A 4W58A 3NY9A 2OTZX 3OE0A 2NTHA 4I7PA 1T8GA 126LA 1L92A 1CTWA 1P3NA 1QSQA 4ARPA 3C80A 1NHBA 120LA 149LA 1QTZA 236LA 1CUQA 1C6BA 4PK0A 2L78A 1QUDA 2F32A 180LA 1KW5A 229LA 192LA 139LA 1L84A 4EKSA 178LA 4I7RA 1LGWA 1L64A 2RBQA 1L59A 119LA 2OE9X 226LA 107LA 1L29A 3D4SA 1LGXA 150LA 4EPIA 1L0JA 234LA 4DJHA 1L73A 225LA 2B70A 1L18A 3HDFA 1OVKA 1QS5A 112LA 1D3JA 3QAKA 1QT3A 1L24A 4E97A 3FA0A 3JR6A 1L89A 130LA 168LA 1P5CA 109LA 2B72A 4I7SA 4PJZA 2RBOA 3GUOA 1L46A 1LYDA 1C6NA 1CV3A 4I7KA 1D3NA 244LA 3EMLA 251LA 3F9LA 1L05A 5I14A 1LYIA 1DYEA 1L70A 255LA 176LA 1L35A 183LA 1KS3A 184LA 4W55A 1L49A 3PBLA 1L98A 2A4TA 4I7MA 239LA 1LYGA 4EJ4A 1L21A 1LI2A 157LA 1G0MA 212LA 131LA 1P2LA 1L17A 3UONA 3DN4A 238LA 3GUJA 1L00A 1L22A 1L51A 4I7OA 138LA 3DKEX 1LWKA 218LA 196LA 4GBRB 247LA 163LA 3HTFA 3HTGA 3SN6R 1KY0A 1C60A 1L99A 3SB5A 3DMXA 1C67A 1L37A 216LA 3C81A 1G0QA 1L23A 156LA 115LA 1L45A 2OU0X 1L34A 3ODUA 250LA 1L13A 1L68A 3C8SA 2CUUA 1L95A 2LCBA 2OEAX 242LA 189LA 1L15A 1L41A 103LA 3FADA 3DMVA 111LA 1B6IA 162LA 1L94A 169LA 2RAYX 3SB8A 2B6WA 248LA 3DN1A 2RB1X 152LA 1QSBA 1XJUA 2HUKA 2RB2X 1CV6A 1L42A 262LA 1CV0A 2B6ZA 3L64A 171LA 1L14A 1C66A 151LA 4ZPUA 1L67A 1C6JA 2OU9A 190LA 1L54A 1L93A 166LA 1PQMA 1L83A 1WTHA 254LA 3HT9A 1L38A 4W57A 143LA 1LGUA 241LA 4IAPA 1QT6A 1L33A 125LA 1CUPA 1L06A 4LDEA 1QS9A 3DN0A 3HTDA 227LA 256LA 167LA 4GRVA 1L55A 1QUGA 2ANXA 3HH5A 177LA 228LA 1L48A 2OE7X 127LA 158LA 137LA 1L10A 172LA 1L66A 1L86A 3C83A 1DYCA 2B6YA 1SSYA 205LA 3CDQA 1L0KA 1L47A 146LA 1QTHA 222LA 233LA 1L57A 1EPYA 1ZWNA 1SX2A 1XEPA 1K28A 1L12A 4OO9A 1L90A 4W54A 1D2YA 214LA 261LA 235LA 1L65A 3CDOA 1DYDA 3DNAA 3HT8A 3NYAA 1L53A 232LA 3NY8A 1L01A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HERA 1C6HA 3RW8A 3K2RA 1IWXA 9LYZA 4J1AA 4LT0A 3HH3A 2Z2FA 170LA 1ZYTA 5APDA 4I0CA 1REYA 1ZVYB 4YXCA 3RU5A 3LYTA 3C8QA 1LW9A 4H9FA 3AJNA 2O7AA 1L27A 2ZIKA 1NDGC 4ZEEA 3P66A 3HH6A 1GFKA 3ATNA 3HU9A 2H9KA 1D9UA 3D3DA 1B7PA 1JTMA 1C6KA 1T6HA 1CVKA 5IELA 1C61A 4WG7A 5HNCA 252LA 3OE9A 4FDYA 1GAZA 2BQDA 4N1CC 1LLHA 1CU3A 1MELL 1OUJA 1IP6A 1IC5Y 2HEAA 5DLAA 4H91A 4Z3MA 2BQNA 1HFYA 2HECA 1LZ6A 175LA 3GULA 220LA 2RB0X 4NGYA 201LA 5KKJA 1T8AA 3CDRA 1L56A 3EO5A 4LT2A 1G7JC 165LA 4UWNA 4M6DA 1UCOA 4J0LA 4QEQA 1GF6A 1DYFA 1JHLA 1OVJA 1VEDA 1L91A 3G3VA 4NHQA 4OWAA 2D4JA 4ETAA 3A95A 2BQJA 1PQOA 3GUIA 2ZNWY 1D9WA 2YBHA 1WQRA 4FJRA 5LVKA 4WM5A 3QNGA 188LA 1GFUA 259LA 4TSBA 4LYZA 1UIGA 3SB7A 1BB4A 3HDEA 1GF3A 4H93A 1LHIA 3VWOA 1UIHA 1D2WA 5FEKA 2YSSC 1L80A 4WMGA 197LA 1C6GA 3A3QA 3C7ZA 1QQYA 1HEWA 3DN2A 113LA 4UWVA 3CSQA 4Z41A 1UACY 1QUOA 2Z37A 1L03A 1LWGA 3HTBA 2HULA 5C6IA 1L50A 1IOCA 1G1WA 3V2WA 219LA 2B75A 1LZSA 1EQ4A 2XBSA 1LTMA 1GFEA 1LPYA 4R0FA 243LA 1B7SA 2HTXA 4WM4A 3FE0A 1LSPA 3LYOA 4WLTA 5L3HA 1C62A 1QTKA 1TCYA 4EPFA 3WVXA 1CNSA 4GCCA 1LJIA 1LHHA 1GB2A 1UICA 4NGZA 1P2RA 1L85A 3C7YA 1LJFA 4GLAA 1L20A 2C8OA 2F30A 1IC7Y 1LAAA 1LSBA 2YBMA 210LA 2W1YA 1L11A 1G07A 3AGGG 3CDVA 1P46A 1GAYA 5K7OA 1L81A 1G0JA 2HU1A 1GB9A 3AGHA 1L82A 4N0JA 1GXV2 4I7QA 2I26L 1EQ5A 2DQJY 145LA 1L31A 3RT5X 4B0DA 1JPOA 1B7OA 122LA 3DMZA 1FLYA 1H87A 1C6AA 1HHLA 2ANVA 5LINA 1LZNA 1VAUA 3TXKA 2MECA 5HNLA 2FBBA 1TAYA 1YAQA 3GXRA 1IWWA 3HU8A 3GUNA 1B7NA 4RW1A 5LVIA 4LT3A 2RBSA 1C6QA 3CSRA 1L96A 3A6BY 4LYOA 3NY9A 1IOSA 3N9CA 1LMCA 2NTHA 4ETCA 1T8GA 2G4NA 3SP3A 1HMKA 1C6BA 1PZYA 2XJWA 2DQHY 1TDYA 139LA 4EKSA 2RBQA 2OE9X 1LJNA 3D4SA 150LA 4EPIA 234LA 1CJ7A 1LMOA 1LHLA 1IOTA 1OVKA 4XJBA 112LA 1D3JA 4R6CA 1L24A 3A93A 3FA0A 4PRUA 3JR6A 130LA 168LA 4YEOA 1VDPA 1IP3A 5I53A 1IP5A 1A2YC 2B72A 1J1XY 1LJ4A 6LYZA 4B1AA 3LZ2A 3F9LA 3M18B 4YOPA 1L05A 5LA8A 255LA 1B5VA 1KIRC 4ET8A 5KXZA 1KS3A 4I7MA 239LA 1LYGA 4XJGA 1GF5A 5E9RA 131LA 1FKQA 138LA 4WL7A 4WM2A 1LWKA 247LA 5FDJA 3HTGA 3SN6R 1C60A 1L99A 3SB5A 4LT1A 1GEVA 1QUSA 2W1MA 1L34A 4HPIA 3FI7A 3AZ7A 4NSHA 1YAPA 189LA 1B6IA 169LA 1OUCA 2RAYX 2B6WA 248LA 4U3XB 4H9CA 5LYMA 1DI4A 5F9XA 1GF7A 134LA 2RB2X 1CV6A 3LZTA 4RDSA 1C66A 5DN4A 151LA 1GE0A 1B5XA 3HT9A 1HFZA 143LA 1GF8A 1CUPA 1WVUA 1LSYA 4ML7A 1QS9A 1PS5A 4EOFA 4GCDA 4XYYA 4DD1A 194LA 1DXJA 1YKYX 4BADA 1QUGA 4W94A 1JKCA 1L48A 2OE7X 5DN5A 158LA 2LZ2A 1L86A 3AZ5A 2B6YA 1OUAA 1N4FA 1L57A 3IJVA 3A6CY 1F10A 1XSFA 2W1XA 1L12A 4HV2A 4DQ7A 2LYOA 1LMNA 1D2YA 4W54A 214LA 1BB5A 3HT8A 5I5QA 2A7FA 5F81A 3RZ4A 5KXRA 1C6DA 1PQIA 4TX7A 3LYMA 1LJGA 1NHEA 1C46A 1IO5A 2N5ZA 3OE6A 1KIPC 1JKAA 1D6PA 4OWHA 3T36A 4LFXA 1L44A 5DL9A 3B0KA 1L25A 1LYYA 1L16A 1GFJA 4RLNA 1RJCB 4NGKA 1LMPA 1CU0A 1HC0A 1CX6A 1OUFA 2BQBA 4DWXA 1JQUA 110LA 1J1PY 1LSGA 1G06A 1L76A 1IR8A 5FHWA 1GE1A 1F0WA 1QT7A 3HUKA 1L36A 4WM3A 260LA 1REMA 2IFFY 3P65A 1UA6Y 2FBDA 1V7TA 2Q9EA 1P6YA 2HEDA 3W3EA 2RBNA 1G0PA 3TMXA 2G4QA 108LA 4N8ZA 1G7MC 1CV1A 1C65A 4HSFA 3FI5A 5HLLA 1LZTA 3C7WA 1LSNA 3WH1A 3ULRA 2RAZX 174LA 1ZV5L 1L77A 1L28A 2XTHA 2YBNA 1ZVHL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HER A;  1C6H A;  3RW8 A;  3K2R A;  1IWX A;  9LYZ A;  4J1A A;  4LT0 A;  3HH3 A;  2Z2F A;  170L A;  1ZYT A;  5APD A;  4I0C A;  1REY A;  1ZVY B;  4YXC A;  3RU5 A;  3LYT A;  3C8Q A;  1LW9 A;  4H9F A;  3AJN A;  2O7A A;  1L27 A;  2ZIK A;  1NDG C;  4ZEE A;  3P66 A;  3HH6 A;  1GFK A;  3ATN A;  3HU9 A;  2H9K A;  1D9U A;  3D3D A;  1B7P A;  1JTM A;  1C6K A;  1T6H A;  1CVK A;  5IEL A;  1C61 A;  4WG7 A;  5HNC A;  252L A;  3OE9 A;  4FDY A;  1GAZ A;  2BQD A;  4N1C C;  1LLH A;  1CU3 A;  1MEL L;  1OUJ A;  1IP6 A;  1IC5 Y;  2HEA A;  5DLA A;  4H91 A;  4Z3M A;  2BQN A;  1HFY A;  2HEC A;  1LZ6 A;  175L A;  3GUL A;  220L A;  2RB0 X;  4NGY A;  201L A;  5KKJ A;  1T8A A;  3CDR A;  1L56 A;  3EO5 A;  4LT2 A;  1G7J C;  165L A;  4UWN A;  4M6D A;  1UCO A;  4J0L A;  4QEQ A;  1GF6 A;  1DYF A;  1JHL A;  1OVJ A;  1VED A;  1L91 A;  3G3V A;  4NHQ A;  4OWA A;  2D4J A;  4ETA A;  3A95 A;  2BQJ A;  1PQO A;  3GUI A;  2ZNW Y;  1D9W A;  2YBH A;  1WQR A;  4FJR A;  5LVK A;  4WM5 A;  3QNG A;  188L A;  1GFU A;  259L A;  4TSB A;  4LYZ A; 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