160LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRALQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 160lA00
192LA 1LYEA 4LDOA 1C6KA 1CTWA 2LZMA 1L41A 1L42A 4I7TA 130LA 1G0PA 1P2LA 1LWGA 209LA 1L55A 1L64A 1QTBA 4EPFA 126LA 1L13A 2OE4X 1ZURA 3OE9A 5LZMA 128LA 1C63A 220LA 1L76A 1LYHA 4DKLA 1L04A 213LA 1LGXA 2OTYX 1D3FA 3D4SA 144LA 1LYIA 1OWYA 2OE9X 1C6HA 1C68A 2B6WA 2B72A 2CUUA 3G3XA 1DYGA 1G0MA 2NTHA 4LDEA 1WTHA 1C64A 242LA 2NTGA 4GBRB 151LA 1CU5A 2RB0X 4W53A 2OE7X 1D3NA 234LA 1QUDA 114LA 3DN1A 1L01A 1SSYA 1LPYA 4ARQA 1QTZA 1L84A 1OYUA 1L10A 2RAZX 1C6NA 1L91A 1QSBA 248LA 4I7KA 4W55A 1P64A 206LA 1L12A 1L75A 1QS9A 123LA 1L07A 4DAJA 3OE0A 1LYGA 1L50A 1L30A 1K28A 1KY1A 3EMLA 107LA 1C6JA 3V2WA 2LCBA 2RBRA 3C83A 4OO9A 1D9WA 2OU0X 1C65A 1OWZA 3JR6A 1OVHA 1L57A 188LA 1L85A 4EXMA 2ANXA 189LA 1LI2A 1G0LA 1L56A 1P36A 2O7AA 237LA 2B75A 1L88A 1KW5A 2F32A 118LA 1C62A 160LA 4S0WA 1DYBA 1D3JA 216LA 230LA 2B6XA 155LA 1L23A 2RAYX 2ANVA 1DYFA 1L26A 252LA 1L40A 3FI5A 1L81A 3C8QA 210LA 3K2RA 1CVKA 1L65A 1C6EA 4EKQA 1D2YA 1C6LA 4W56A 3NY9A 1L43A 3C8SA 1SX7A 127LA 122LA 1LGWA 1OV5A 3DMVA 182LA 3LZMA 4YXAC 215LA 1CV1A 1L20A 2RBNA 1LYFA 4EPIA 240LA 2Q9EA 3HH4A 6LZMA 3NY8A 4ARJA 3OE6A 1L92A 1L87A 1P37A 1L19A 1L90A 2OTZX 1PQIA 4EKRA 244LA 1G1VA 1L16A 2RBOA 1L99A 2Q9DA 3DMZA 1G06A 3GUNA 1L02A 1L44A 1L15A 1L09A 2RB2X 3CDVA 198LA 1C6GA 3HU9A 140LA 3SBBC 1L39A 181LA 249LA 1KY0A 225LA 2HUKA 222LA 1QUHA 119LA 232LA 200LA 1L60A 2OU9A 167LA 1C6QA 1CV4A 1G0JA 224LA 165LA 3V2YA 1G0GA 4I7RA 211LA 3CDOA 4I7MA 196LA 3SBAA 1CV0A 109LA 1G1WA 2A4TA 4LDLA 150LA 3HTDA 1QSQA 3HT8A 1QTHA 1L47A 1L89A 110LA 1L77A 1T97A 3GUKA 3HUQA 1T8AA 1L67A 231LA 1QT4A 175LA 3DN0A 1L49A 227LA 1I6SA 4W52A 3UONA 3HT6A 4I7PA 164LA 1L61A 1L94A 1L33A 104LA 2RB1X 3FADA 2HUMA 3L2XA 1L53A 3C8RA 1P6YA 2B7XA 3HTGA 1CX7A 2B6YA 169LA 212LA 2L78A 4I7OA 145LA 1G0KA 4IAPA 138LA 1SWZA 3FA0A 1L03A 4W58A 1OVKA 1T8FA 4YXCA 4I7JA 195LA 3HUAA 131LA 2QB0B 1TLAA 226LA 1L97A 246LA 1PQJA 3HDEA 170LA 152LA 1L70A 3HT7A 245LA 4EKSA 3F9LA 137LA 159LA 1PQMA 177LA 1L17A 3HWLA 1P46A 1C6FA 1L52A 3GUIA 1P7SA 1L82A 1QT6A 1XEPA 217LA 1G07A 236LA 141LA 1L36A 253LA 2O4WA 4PJZA 3HDFA 1L28A 2B73A 1L45A 1QT7A 1CV6A 1PQDA 4YX7C 3C81A 113LA 1L29A 1LW9A 1PQOA 157LA 1DYEA 262LA 156LA 1QTVA 3CDRA 180LA 1CU6A 4I7SA 1L68A 1QTDA 1B6IA 1CUPA 218LA 1L66A 223LA 2OEAX 1DYAA 1LLHA 1L37A 3DN3A 3ODUA 4I7QA 2B70A 233LA 3SN6R 1C66A 228LA 148LE 1CU3A 1L98A 1C6AA 254LA 1D2WA 3HH6A 1JTMA 2B74A 3G3VA 1CUQA 259LA 1L73A 1L18A 147LA 1L51A 1C6CA 3GUPA 1SSWA 2F2QA 3SB8A 176LA 3HT9A 1ZWNA 1LGUA 1L80A 241LA 3OE8A 1L69A 214LA 3NYAA 120LA 4ZPUA 2OU8A 197LA 1L0JA 1L11A 3GUOA 2RBSA 4PK0A 1C6MA 1L95A 1P5CA 3SB5A 1L34A 235LA 162LA 1P2RA 1XJUA 1EPYA 4W59A 1C60A 183LA 1SWYA 7LZMA 1DYCA 4K5YA 1LYDA 3HUKA 3QAKA 1L08A 1L71A 1L48A 1NHBA 3GULA 4EKPA 3SB7A 3L64A 219LA 3SB6A 1L22A 2LC9A 1QS5A 1SX2A 168LA 4W54A 1L96A 1P3NA 3C7ZA 1L74A 4ARPA 205LA 3DN4A 112LA 260LA 1ZYTA 1LWKA 3DN6A 1C61A 3PBLA 163LA 1L25A 1L46A 3DN8A 2IGCA 4W51A 250LA 2RH1A 1LI6A 1C6TA 1OVJA 3DKEX 3HH3A 4I7NA 3GUJA 143LA 1L14A 1CV3A 255LA 1C6PA 3DMXA 186LA 185LA 1C6DA 1P56A 2HULA 1L59A 174LA 3GUMA 3HTFA 171LA 3HH5A 1QT3A 3DN2A 4ARLA 166LA 1KNIA 1L0KA 3C7WA 3DNAA 5I14A 1L27A 1L05A 2RBPA 3G3WA 4ARMB 199LA 1L31A 3SB9A 4DJHA 3RUNA 1XJTA 111LA 4AQNA 2RBQA 1T6HA 108LA 1QT8A 201LA 125LA 4GRVA 2O79A 3RZEA 184LA 238LA 1L32A 139LA 1KS3A 1QUGA 4EJ4A 1L72A 178LA 187LA 158LA 1T8GA 173LA 3PDSA 1QTCA 1L35A 4E97A 103LA 3HTBA 3F8VA 115LA 2Z6BA 4W57A 239LA 1L63A 221LA 3C80A 4I7LA 149LA 243LA 102LA 1KW7A 172LA 1L79A 3HU8A 191LA 1QT5A 3CDQA 1C6IA 1QUOA 1L21A 146LA 1CU2A 247LA 3CDTA 1PQKA 3C7YA 251LA 1L54A 1C6BA 1DYDA 1L83A 1L58A 161LA 1JTNA 1L38A 2B6ZA 2QARC 1LI3A 190LA 1OV7A 1CV5A 1L86A 1G0QA 1L06A 4ARQB 229LA 4LZMA 142LA 3VW7A 1L93A 1C67A 1LYJA 1D3MA 257LA 2F47A 1C69A 1L62A 1JQUA 1CX6A 261LA 1L24A 3C82A 129LA 256LA 1L00A 2B6TA 4ARMA 258LA 1CU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LDOA 1JUGA 1L42A 3MGWA 4I7TA 4H9BA 209LA 5F16A 1YILA 3AGHA 1DI3A 2OE4X 3OE9A 4DKLA 1L04A 2G4NA 1LYIA 3N9CA 3B0KA 2XJWA 2CUUA 1LSZA 5LA8A 5B05A 1AT6A 3OK0A 1REYA 2NTGA 1CU5A 1YL0X 2RB0X 1JKBA 3DN1A 5I4WA 1L10A 1FDLY 2RAZX 2HEDA 4B4EA 4I7KA 1LZ4A 4W55A 4DC4A 1L12A 1QS9A 1L07A 1LYGA 2ZYCA 3SP3A 1HEQA 1L30A 107LA 2IFFY 1IWYA 3C83A 4OO9A 1GAZA 1OVHA 4TUNA 2Z19A 188LA 4QY9A 2ANXA 4P2EA 2ZILA 1FKVA 5LYMA 1G0LA 2MEBA 1P36A 1FLWA 2BQDA 1LPIA 1KW5A 2F32A 4GCBA 3A90A 3ATNA 4W96A 5KXPA 1D3JA 1LSPA 4OW1A 5I5QA 3WULA 4YENA 2RAYX 2XQOA 1L40A 5FHWA 4N1EI 3E3DA 3P64A 4R0FA 210LA 2Z12A 1C6EA 4EKQA 4M4OA 4NHIA 1DI4A 5KXWA 1IWWA 122LA 182LA 4A7DA 1GXV2 1LJHA 3LZMA 1JKDA 4ETAA 4LYCA 2CDSA 1JJ3A 1WVVA 1GFHA 1P37A 2ZNWY 2D4KA 2OTZX 1L90A 1G1VA 2RBOA 1LCNA 3DMZA 3TXDA 1UA6Y 1UC0A 4II8A 1UBZA 1L02A 1CNSA 2FBDA 3GXKA 3A8ZA 4XJDA 249LA 2F4GA 3TMWA 1NBZC 4XYYA 2OU9A 1C6QA 3V2YA 2W1XA 1ZVHL 3TXEA 211LA 196LA 4WOAA 1GBXA 1YIKA 1IP4A 2LZ2A 1QTHA 4DD1A 1GB8A 1IIZA 110LA 1T97A 1OUJA 1YKZX 1T8AA 2BQLA 3A34A 4LYMA 3M3UA 227LA 3UONA 2RB1X 194LA 1L53A 1GE1A 2B7XA 1OUAA 3AZ4A 4B1AA 5HNCA 4I7OA 3CT1A 1UACY 1L03A 4W58A 4PJ2C 1HFZA 4I7JA 1EL1A 4PHIA 4DYGA 4Z41A 4PRUA 1TLAA 3AYQA 3WUNA 3HT7A 4DD0A 1QTKA 159LA 3WW5A 1PQMA 1IOCA 3A3RX 1UUZC 1LJKA 1HFYA 1P7SA 2D4IA 4HV2A 1L82A 1F10A 2I25L 1QT6A 1XEPA 5B07A 1D9UA 4NSGA 4HPEA 2HEFA 2LHMA 1HMLA 253LA 1C43A 2B73A 4BS7A 4GCDA 1B7RA 1BGIA 1PQDA 2H9KA 3AW6A 3N9AA 1I20A 2ZQ4A 1DYEA 5LVGA 156LA 2MEFA 218LA 223LA 1REMA 2CJLA 3DN3A 1NMMA 2BQMA 1ZMYL 2XTHA 233LA 5AMYA 5LVHA 4WM5A 1C6AA 254LA 1D2WA 3HH6A 5LIOA 1JTMA 1LZDA 1B9OA 176LA 2MEGA 241LA 1B5ZA 1L69A 3CSZA 2Z39A 3TXIA 2RBSA 1LMTA 3P68A 4ZFPA 4HTKA 4W59A 1C60A 3CSRA 7LZMA 1DYCA 4K5YA 1LYDA 3ZVQA 1L71A 3GULA 3HBDA 3RZ4A 3SB6A 1PZYA 1QS5A 3WH1A 4H91A 3WL2A 168LA 4W54A 1GBOA 1CJ9A 1DQJC 205LA 3DN4A 112LA 1IWUA 5LVKA 3DN6A 1C61A 1GFEA 163LA 5D5FA 1JKAA 1L46A 1XGQC 1LI6A 1OVJA 1LZGA 4I7NA 4M6DA 186LA 1G7HC 185LA 2HULA 2W1YA 4J0LA 1BB5A 1L59A 3CB7A 1VDSA 3LHMA 4KT3A 3HH5A 2D91A 1VAUA 2YDGA 1KNIA 1G7LC 2RBPA 5KXMA 4DQ5A 134LA 3RU5A 4ANRA 1AM7A 1OUBA 1G7JC 4PGJB 1RFPA 184LA 238LA 1KS3A 4EJ4A 1L72A 4B49A 9LYZA 3ZEKA 103LA 3HTBA 5II3A 2HU3A 3VWOA 4I7LA 149LA 172LA 3HU8A 191LA 1IC5Y 1CU2A 1LJJA 247LA 2BAAA 3LN2A 251LA 1KXYA 1L83A 1XEIA 1L38A 1BWHA 1LKSA 2QARC 1LI3A 4H92A 190LA 4LT0A 1OV7A 4GCEA 1L86A 2Z18A 4E3UA 1LSMA 1V7TA 3WU8A 5LAFA 1CX6A 5ILCA 1L24A 3C82A 256LA 1REXA 1LMNA 2B6TA 4ARMA 3FE0A 5C6IA 192LA 1SLYA 1LYEA 3W3EA 2F2NA 1L41A 1LZBA 2W1LA 1P2LA 1LOZA 3G3BB 4H8XA 4HPIA 126LA 4WM6A 4WLTA 5LZMA 220LA 213LA 4WLYA 3A6BY 1LZEA 1OWYA 2Z37A 1C6HA 2XBSA 1B5WA 1DYGA 1LKRA 4LDEA 1WTHA 2YBLA 4G9SA 2Q0MX 4W53A 4EOFA 5B1FA 1JTPL 4LT1A 1SSYA 1LPYA 2BLYA 1LJEA 1HMKA 4NGWA 4XADA 5LA5A 3WPLA 1L91A 1LYZA 5LVJA 123LA 2EQLA 1L50A 1K28A 3EMLA 1NBYC 1C6JA 2DQGY 1T6VL 4NGOA 2LCBA 2EIZC 2RBRA 1LSDA 2OU0X 3WMKA 1C65A 1YAQA 1WQMA 1OWZA 3JR6A 1L57A 4EXMA 1LI2A 1L56A 5LAGA 237LA 1YROA 4N5RA 2YBNA 5K7OA 4YEOA 4S0WA 3N9EA 4GCCA 4G4BA 3RW8A 3WPKA 216LA 230LA 1GF3A 155LA 1GPQC 2GV0A 1L23A 2ANVA 4LT2A 1L26A 1NWGA 4XJBA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4LDO A;  1JUG A;  1L42 A;  3MGW A;  4I7T A;  4H9B A;  209L A;  5F16 A;  1YIL A;  3AGH A;  1DI3 A;  2OE4 X;  3OE9 A;  4DKL A;  1L04 A;  2G4N A;  1LYI A;  3N9C A;  3B0K A;  2XJW A;  2CUU A;  1LSZ A;  5LA8 A;  5B05 A;  1AT6 A;  3OK0 A;  1REY A;  2NTG A;  1CU5 A;  1YL0 X;  2RB0 X;  1JKB A;  3DN1 A;  5I4W A;  1L10 A;  1FDL Y;  2RAZ X;  2HED A;  4B4E A;  4I7K A;  1LZ4 A;  4W55 A;  4DC4 A;  1L12 A;  1QS9 A;  1L07 A;  1LYG A;  2ZYC A;  3SP3 A;  1HEQ A;  1L30 A;  107L A;  2IFF Y;  1IWY A;  3C83 A;  4OO9 A;  1GAZ A;  1OVH A;  4TUN A;  2Z19 A;  188L A;  4QY9 A;  2ANX A;  4P2E A;  2ZIL A;  1FKV A;  5LYM A;  1G0L A;  2MEB A;  1P36 A;  1FLW A;  2BQD A;  1LPI A;  1KW5 A;  2F32 A;  4GCB A;  3A90 A;  3ATN A;  4W96 A;  5KXP A;  1D3J A;  1LSP A;  4OW1 A;  5I5Q A;  3WUL A;  4YEN A;  2RAY X;  2XQO A;  1L40 A;  5FHW A;  4N1E I;  3E3D A;  3P64 A;  4R0F A;  210L A;  2Z12 A;  1C6E A;  4EKQ A;  4M4O A;  4NHI A;  1DI4 A;  5KXW A;  1IWW A;  122L A;  182L A;  4A7D A;  1GXV 2;  1LJH A;  3LZM A;  1JKD A;  4ETA A;  4LYC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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