161LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTASLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 161lA00
164LA 1QT5A 1DYCA 1L49A 1L91A 1L38A 1D3NA 3HUAA 1P7SA 1L23A 1LYIA 1L01A 1L09A 4I7TA 1LPYA 126LA 213LA 175LA 130LA 233LA 4IAPA 1XEPA 1CU0A 1CU3A 1L45A 1L56A 1L42A 1C6MA 1L64A 1L27A 1T8AA 1C62A 1L53A 1SX7A 4ARQB 1L68A 1L80A 183LA 172LA 1L17A 1L40A 109LA 111LA 2RH1A 1OWYA 104LA 1QUOA 2B72A 1L28A 190LA 3RUNA 1C6CA 1G0LA 1L08A 1C6GA 1XJUA 2ANVA 1LWGA 1T97A 1C66A 2O79A 186LA 1T8FA 1L25A 1LW9A 1L19A 3FA0A 222LA 1CV3A 1ZWNA 113LA 248LA 4YXAC 1C65A 1QUDA 145LA 2B6XA 1SX2A 3L64A 3CDOA 2B73A 142LA 236LA 3OE9A 1QT7A 1L20A 4EXMA 1JQUA 3OE8A 3C7YA 3GUOA 2O7AA 257LA 1L82A 3HDFA 7LZMA 262LA 3HUKA 2B75A 3NYAA 2LZMA 1KY1A 1L21A 230LA 1KW5A 1G07A 1QTCA 3SB8A 261LA 3C80A 1L73A 1L22A 1L90A 223LA 1C61A 1QT6A 4W55A 4I7NA 235LA 1CV1A 115LA 1PQDA 3CDTA 4ZPUA 1G0KA 4W53A 137LA 3G3WA 3DNAA 1L00A 3HTGA 3HH5A 1T6HA 4W57A 227LA 1LYDA 4OO9A 2F47A 2OTZX 1L41A 3G3VA 2OTYX 4EKQA 3HTFA 1P36A 3PBLA 205LA 1L69A 1L04A 1QTVA 1G06A 4ARLA 114LA 3HT7A 3C8RA 1L72A 156LA 3HDEA 1L85A 119LA 1OYUA 217LA 4EKPA 2RBOA 1PQMA 255LA 3GULA 1L96A 1L18A 1QT4A 1C6IA 1L89A 1LI3A 215LA 1C6FA 4I7SA 1LYHA 1C6EA 2RBRA 243LA 1OWZA 3C8QA 1P46A 232LA 249LA 1L79A 1XJTA 1L14A 1L61A 1QTHA 258LA 1L67A 1NHBA 2CUUA 2RB0X 3OE0A 1L70A 2F2QA 1G0JA 206LA 147LA 209LA 1P2LA 4ARPA 131LA 1LGWA 3OE6A 1L94A 1JTMA 247LA 148LE 1QTBA 4I7QA 103LA 188LA 198LA 1DYEA 1KS3A 166LA 218LA 252LA 3SB9A 4ARJA 182LA 1C69A 1LI6A 3HT8A 254LA 1G1VA 1P3NA 231LA 2OE7X 3DN8A 161LA 2RAYX 3F8VA 110LA 1L50A 1CV4A 237LA 4AQNA 2A4TA 4I7PA 4W58A 1CV5A 1D3MA 216LA 3HU8A 1L51A 246LA 224LA 4GRVA 149LA 4EPIA 1L83A 1PQIA 2HUMA 3NY9A 241LA 112LA 1SWZA 1TLAA 2B7XA 1L36A 3GUMA 196LA 1L26A 3FI5A 1K28A 1G0QA 2Q9DA 162LA 171LA 2HUKA 1L16A 211LA 4GBRB 1D9WA 2RBSA 2OU9A 1L13A 150LA 1L81A 1L32A 4W56A 177LA 1QTDA 3DN3A 4I7KA 1WTHA 1L43A 3HH4A 2B6YA 245LA 1L57A 169LA 1LGXA 4I7MA 3LZMA 1L84A 192LA 1C6NA 1L12A 3DN6A 4YX7C 3JR6A 1LGUA 1DYAA 157LA 140LA 228LA 1CU2A 225LA 1C64A 1D2WA 4EKSA 1L06A 3HUQA 4EKRA 1D3FA 1QSQA 199LA 1CVKA 2O4WA 2RAZX 174LA 1G1WA 2RB2X 180LA 178LA 1QT3A 1C6LA 1L35A 229LA 1CU6A 4LDLA 200LA 3GUKA 1L39A 4DKLA 1QSBA 118LA 1L71A 1CV6A 1QT8A 3V2YA 3C83A 2LCBA 4I7LA 1G0PA 1PQKA 2RBQA 1L34A 1L95A 4LDOA 122LA 1C68A 3SBBC 1L98A 2LC9A 3GUJA 152LA 1DYBA 256LA 165LA 221LA 1L31A 155LA 1L46A 1SSWA 128LA 1L58A 1L0JA 210LA 3HTDA 1QUGA 3SBAA 120LA 1L60A 3D4SA 3DMXA 151LA 1EPYA 3HT9A 1G0MA 1L10A 3HT6A 3HWLA 4S0WA 1L55A 1C6TA 2L78A 197LA 3FADA 1C6DA 1C6PA 1L77A 1P6YA 1LLHA 168LA 1L11A 191LA 1PQOA 4DJHA 3C8SA 3CDRA 4K5YA 163LA 240LA 2B6WA 4I7OA 4ARMA 1L47A 238LA 3DN1A 1DYDA 2RBPA 1L0KA 1L05A 1QS9A 1C6QA 1L62A 1C67A 1L88A 3QAKA 2RB1X 1L15A 3GUIA 4W54A 234LA 1L76A 251LA 2HULA 4LZMA 3HH3A 1DYFA 1P56A 189LA 146LA 129LA 3F9LA 2NTHA 1CUQA 1L48A 2OU8A 5LZMA 3RZEA 3HU9A 167LA 2Z6BA 3SB6A 1LYEA 1KY0A 3HTBA 3CDQA 1LYJA 1LYFA 4ARQA 4W59A 4EJ4A 4PJZA 138LA 125LA 3GUPA 1L97A 3C7ZA 1L29A 3HH6A 3CDVA 3V2WA 220LA 1C6BA 2Q9EA 1OVHA 3PDSA 3DKEX 195LA 1L86A 107LA 5I14A 160LA 1L03A 1C6HA 1L07A 4EPFA 1L87A 4E97A 244LA 3C7WA 187LA 1SWYA 2B6ZA 1CUPA 159LA 1D3JA 4DAJA 3UONA 1P2RA 2B6TA 1L24A 212LA 2IGCA 3C82A 3VW7A 1L74A 2QARC 1P37A 1OVJA 173LA 2QB0B 108LA 1I6SA 1L52A 259LA 3SN6R 1CX6A 102LA 1QUHA 1ZYTA 1CU5A 1L44A 1G0GA 260LA 1KNIA 1L54A 2B70A 3G3XA 143LA 1CTWA 3DN4A 253LA 2F32A 1C6AA 1LWKA 1SSYA 6LZMA 3L2XA 1C6KA 1B6IA 1C63A 1QS5A 242LA 1P64A 239LA 184LA 2OE4X 1L92A 127LA 1OV7A 3GUNA 4PK0A 1L33A 3ODUA 139LA 2OEAX 3DN2A 1DYGA 1L75A 3C81A 158LA 1D2YA 1L65A 1C6JA 3EMLA 1CX7A 1L37A 2OE9X 3K2RA 3NY8A 144LA 185LA 214LA 226LA 181LA 1ZURA 2B74A 3SB7A 1OV5A 1JTNA 4I7RA 1KW7A 1L66A 2OU0X 1L30A 219LA 1L63A 170LA 1PQJA 1LYGA 4W52A 4ARMB 1CV0A 1OVKA 250LA 3DMZA 4W51A 176LA 1P5CA 2RBNA 1L93A 1LI2A 123LA 4YXCA 2NTGA 2ANXA 201LA 1QTZA 1L99A 4I7JA 1L59A 1C60A 141LA 3DMVA 4LDEA 3SB5A 1T8GA 3DN0A 1L02A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DQ7A 1OQMA 3HUAA 1YL0X 1LYIA 1L01A 1EQEA 1IWWA 4CHXA 4I7TA 1HMLA 1GE4A 1LZ4A 1LPYA 126LA 2Y8PA 175LA 1VDQA 3AGIA 1YAPA 1J1PY 1CU3A 1L56A 5A3EA 1T8AA 1L27A 1SX7A 4ARQB 1L68A 1C45A 1BWIA 1GBYA 4NGLA 3AB6A 4XJFA 3P64A 1LYYA 1WQQA 1UIGA 2ZIKA 3J6KA 186LA 3TMXA 3WU8A 1C7PA 1HSWA 2I25L 4WO6A 4YXAC 4GN4A 1QUDA 3AZ5A 2Z37A 3W6BA 2B73A 142LA 1GDXA 4Z46A 1LMOA 1UIFA 1NF5A 3C7YA 3GUOA 4GLAA 4XADA 257LA 262LA 3NYAA 1INUA 4R0FA 1L21A 230LA 1GPQC 1G07A 1QTCA 1VATA 1IP5A 3SB8A 1L73A 1L22A 1TAYA 5FSTA 2DQEY 1JUGA 1QT6A 1IO5A 4W55A 3G3AB 235LA 1CV1A 4BADA 2ZYCA 4QGZA 4ZPUA 1G0KA 4NG8A 4WLTA 1D9UA 3DNAA 4W57A 3ATNA 1L41A 4H94A 1LJGA 1LSGA 2W1XA 4EKQA 1UC0A 5B1FA 3PBLA 1H6MA 4RW2A 1QTVA 2MEGA 2A7DA 3WUAA 4ZEEA 1LSCA 156LA 2XTHA 2BQGA 2F4GA 1OYUA 4N9RA 1HEOA 4HV1A 2Q0MX 1IX0A 7LYZA 1LMQA 3WW6A 1LHMA 1C6IA 1L89A 1QDTA 4I7SA 3C8QA 4WOAA 249LA 2BQNA 1L79A 1L14A 1L61A 1QTHA 1GF4A 3OE0A 1LJ3A 1B5YA 5L3IA 1LGWA 1LZCA 2YBIA 247LA 1QTBA 4HTKA 4UWUA 1KS3A 218LA 3SB9A 4ARJA 4LT1A 4DD2A 254LA 1P3NA 1VFBC 1DXJA 4NHQA 5APFA 161LA 4N0JA 4II8A 5KXSA 5KXTA 1LJIA 3QY4A 1OUCA 112LA 1TLAA 4NGYA 1ZVHL 1L36A 1JTPL 4LYBA 4H91A 5APCA 196LA 1GFUA 3FI5A 2HU3A 4WLXA 5HNLA 1G0QA 1XEIA 1HC0A 1L16A 194LA 134LA 4H9BA 4NG1A 4W56A 1QTDA 1WTHA 3HH4A 5B06A 4I7MA 3AGHA 2BQDA 1Z55A 4FJRA 1WQRA 4H9FA 1NMMA 140LA 4U3XB 2BLYA 4MSTA 1C64A 5L3HA 4EKRA 199LA 2RAZX 174LA 4LZTA 1QT3A 3VWOA 5E9RA 1IP2A 1WQOA 4XN6A 2BAAA 1IR7A 1LHJA 200LA 1AT6A 1GBSA 1L39A 2YSSC 118LA 5I4XA 1GB8A 2MEAA 5T3FA 4LFPA 1QT8A 3IWRA 3AW7A 2LCBA 4NSJA 1F10A 2LC9A 3GUJA 4NSIA 4XYYA 1DI5A 1L58A 1QUGA 1W08A 120LA 3D4SA 3D9AC 1YKZX 1MLCE 3HT9A 4S0WA 1L55A 3FADA 2BQHA 1L77A 1VDSA 191LA 1PQOA 4DDCA 4DJHA 4K5YA 5FCPA 4TX7A 1LMNA 1L47A 238LA 4OOTA 1LSDA 2W1MA 4W54A 2RB1X 1L15A 6LYZA 1L76A 1IR9A 251LA 1HSXA 1LSEA 5LAFA 4LZMA 1GWDA 1B7RA 5KXLA 3EXDA 1CUQA 4NSHA 4RDSA 1LCNA 1UICA 1OUHA 3HU9A 3CT0A 4IJ4A 1XGTC 3SB6A 1LYEA 5KKIA 3HTBA 2HU1A 4N1CC 1BB5A 4ARQA 5B05A 4WG1A 1LZDA 3TXJA 1WTNA 3RU5A 1L29A 3CDVA 1CJ9A 1GFVA 195LA 160LA 1ALCA 1L03A 1FLWA 1LYSA 2D91A 4L41A 4EPFA 5IHGA 2DQIY 4PPOA 5II3A 1REYA 2LYZA 1JPOA 3C7WA 1D3JA 4DAJA 2BLXA 1L24A 173LA 1GD6A 1CU5A 1AT5A 3B0IA 1L54A 1JISA 2B70A 1GB2A 1YKYX 1GAYA 3DN4A 4H9AA 4HV2A 4H8XA 3P65A 3EO5A 1C6KA 2EIZC 4B49A 1CJ8A 1GF6A 1D0MA 1G7JC 1OV7A 135LA 4PK0A 1YAQA 1B0DA 2MEDA 1IEEA 1REMA 1CX7A 1RE2A 4H9HA 144LA 1LHLA 226LA 181LA 1YROA 1JTNA 4GCFA 1KW7A 4J0LA 2OU0X 1L30A 1L63A 3AW6A 5AMYA 1GEVA 1PQJA 4Z98A 4ARMB 5I4WA 1CKHA 1PS5A 1LMPA 4J1AA 4OWAA 2I26L 2RBNA 5DL9A 4YXCA 4PRQA 2ANXA 4HTQA 1QTZA 4LYOA 4ZFPA 3DMVA 2F4AA 1T8GA 4WLYA 1DYCA 4DD9A 1KXXA 133LA 4HJVA 2H5ZA 1SLYA 5KXZA 3A94A 1GE2A 3B0OA 4IAPA 1CU0A 1L45A 1C62A 5KY1A 183LA 1L17A 3AZ4A 3TXKA 5KXRA 1D6QA 2RH1A 1OWYA 1QUOA 2B72A 190LA 3RUNA 1CJ7A 4GCCA 1IP7A 1G0LA 1XJUA 1GF8A 4H8ZA 1LWGA 4AXTA 1HFYA 4H93A 1IC5Y 2O79A 1G7HC 222LA 1CV3A 4C5FA 248LA 4TSCA 2DQAA 3CDOA 1B7QA 1JIYA 1REZA 4YEMA 5B1GA 2ZWBA 3OE8A 1BB6A 1LSFA 1LKRA 2O7AA 3A92A 1GFJA 1GFTA 3HUKA 2LZMA 4H8YA 1KW5A 261LA 1ZV5L 2ZYPA 4I7NA 1LJEA 1LJHA 1PQDA 4NGWA 5F81A 4IASA 1OUDA 4XJHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DQ7 A;  1OQM A;  3HUA A;  1YL0 X;  1LYI A;  1L01 A;  1EQE A;  1IWW A;  4CHX A;  4I7T A;  1HML A;  1GE4 A;  1LZ4 A;  1LPY A;  126L A;  2Y8P A;  175L A;  1VDQ A;  3AGI A;  1YAP A;  1J1P Y;  1CU3 A;  1L56 A;  5A3E A;  1T8A A;  1L27 A;  1SX7 A;  4ARQ B;  1L68 A;  1C45 A;  1BWI A;  1GBY A;  4NGL A;  3AB6 A;  4XJF A;  3P64 A;  1LYY A;  1WQQ A;  1UIG A;  2ZIK A;  3J6K A;  186L A;  3TMX A;  3WU8 A;  1C7P A;  1HSW A;  2I25 L;  4WO6 A;  4YXA C;  4GN4 A;  1QUD A;  3AZ5 A;  2Z37 A;  3W6B A;  2B73 A;  142L A;  1GDX A;  4Z46 A;  1LMO A;  1UIF A;  1NF5 A;  3C7Y A;  3GUO A;  4GLA A;  4XAD A;  257L A;  262L A;  3NYA A;  1INU A;  4R0F A;  1L21 A;  230L A;  1GPQ C;  1G07 A;  1QTC A;  1VAT A;  1IP5 A;  3SB8 A;  1L73 A;  1L22 A;  1TAY A;  5FST A;  2DQE Y;  1JUG A;  1QT6 A;  1IO5 A;  4W55 A;  3G3A B;  235L A;  1CV1 A;  4BAD A;  2ZYC A;  4QGZ A;  4ZPU A;  1G0K A;  4NG8 A;  4WLT A;  1D9U A;  3DNA A;  4W57 A;  3ATN A;  1L41 A;  4H94 A;  1LJG A;  1LSG A;  2W1X A;  4EKQ A;  1UC0 A;  5B1F A;  3PBL A;  1H6M A;  4RW2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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