164LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLAMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 164lA00
157LA 118LA 1L51A 4W55A 1C60A 4YXAC 1C6MA 160LA 1JQUA 4OO9A 2IGCA 129LA 1QT3A 1LI3A 2Z6BA 1L27A 1LI6A 158LA 3HTGA 3SB6A 225LA 1L45A 1C6NA 1PQJA 260LA 1L12A 1QT8A 210LA 1KY0A 1LYDA 227LA 2RAYX 1L21A 2OU0X 1L33A 4EJ4A 1PQOA 3FADA 1L98A 3HT8A 175LA 1C6FA 1L70A 2B70A 4EKQA 1QTBA 241LA 1L48A 1L95A 1L93A 3DN6A 1D3NA 3HT6A 3HTBA 1L63A 156LA 2B72A 4ARJA 2NTHA 1C6BA 3VW7A 3DMVA 1L94A 187LA 1C6EA 183LA 1DYCA 3SB9A 198LA 1QUDA 139LA 1C62A 1CU6A 1D9WA 4W52A 1LGWA 1C6PA 1L14A 1L13A 1L89A 3HU8A 2B74A 1L44A 1DYGA 1L71A 2RH1A 4YXCA 2LC9A 1KW7A 1L25A 151LA 1L61A 1L76A 1WTHA 2HULA 1CV6A 3C8SA 2B6TA 127LA 1L15A 1L83A 1G1WA 173LA 243LA 1CX7A 1KNIA 1LYFA 177LA 188LA 4I7LA 2F47A 146LA 3CDQA 1ZYTA 1L53A 1CU5A 1QSQA 1I6SA 2CUUA 167LA 1C63A 1L09A 239LA 3HT9A 1G0JA 1SSWA 3G3VA 4W53A 1L60A 137LA 3C7YA 196LA 242LA 3HWLA 3HT7A 1C61A 2ANXA 1L81A 3EMLA 212LA 1KY1A 232LA 213LA 3DN0A 3HU9A 107LA 2B75A 1QUGA 174LA 1L54A 2RBNA 2Q9DA 2RBRA 3C80A 4I7JA 166LA 244LA 3GUNA 197LA 1L64A 5LZMA 224LA 3D4SA 161LA 2QARC 4EKRA 3SN6R 165LA 170LA 1LI2A 2OU9A 1JTMA 3L2XA 1L34A 2HUMA 1OV5A 2RB2X 3SB7A 1L03A 1L37A 1SSYA 1P64A 3PBLA 4I7TA 1PQIA 4S0WA 1ZWNA 1LYJA 168LA 1P3NA 2NTGA 1QTHA 4LDEA 1T97A 1TLAA 2OEAX 258LA 4W59A 3SB8A 186LA 1L17A 4EKPA 1L66A 4EPIA 1L87A 214LA 230LA 1D3MA 3C81A 2B6ZA 182LA 1L84A 122LA 2RBPA 3GUIA 2RBQA 4I7RA 1L72A 1PQDA 7LZMA 2LZMA 123LA 1L69A 3FA0A 4YX7C 152LA 3C7WA 4I7NA 1OWYA 3OE0A 1CU2A 4ARPA 3OE9A 1QS9A 1L85A 256LA 3F9LA 4EKSA 108LA 192LA 1OYUA 2RB1X 120LA 1CV3A 1L16A 1QTDA 1SX7A 1B6IA 1C6LA 2B73A 215LA 1L10A 1L08A 1L46A 1L80A 191LA 1OVJA 3SBBC 4W51A 1L58A 1L39A 2OU8A 255LA 2F2QA 3NY9A 1C6AA 142LA 2F32A 2OTZX 1T6HA 2RBSA 1L02A 180LA 3L64A 1QTCA 1C64A 1QT4A 1P2LA 4GRVA 2OE7X 1L65A 1G0QA 3SBAA 181LA 1PQMA 4I7PA 1L86A 220LA 1QT6A 222LA 3GUPA 2OE9X 2Q9EA 110LA 1L73A 3DN4A 223LA 4ARQA 162LA 1L00A 1L75A 2RB0X 102LA 103LA 159LA 4DJHA 2RBOA 1P37A 4ARMB 3G3XA 1L91A 185LA 1L56A 3HUQA 112LA 2B7XA 1C6GA 1T8FA 1LGXA 1L67A 115LA 169LA 4ZPUA 1XJTA 2LCBA 2O4WA 104LA 1L20A 5I14A 4DKLA 1D2WA 2O7AA 259LA 1LWGA 3CDVA 1KS3A 3GUMA 217LA 176LA 1CU0A 119LA 1SWZA 3FI5A 4I7MA 3G3WA 231LA 1OV7A 1L96A 1DYAA 1QTZA 1T8GA 1K28A 2RAZX 1JTNA 150LA 184LA 189LA 1DYFA 1L36A 1D3FA 3V2WA 1QUHA 2L78A 3DKEX 4I7SA 3DN1A 4IAPA 195LA 1C6TA 3C82A 1CU3A 234LA 4EXMA 253LA 3CDOA 3JR6A 130LA 3CDRA 205LA 257LA 3GUOA 1OWZA 1ZURA 3HTFA 1L62A 3HH5A 1OVKA 236LA 4GBRB 1L59A 4I7QA 2A4TA 190LA 111LA 1C66A 1LGUA 1P36A 1LLHA 3DN8A 1G0MA 1C67A 141LA 1L01A 1C6KA 1L40A 1L22A 1P5CA 4AQNA 131LA 125LA 1P7SA 4ARLA 3DN2A 1L05A 144LA 1G06A 1QT7A 1LPYA 3RZEA 1L88A 1SX2A 216LA 201LA 3ODUA 2B6WA 143LA 178LA 128LA 1LYIA 245LA 1CUQA 1QSBA 4I7OA 252LA 1L38A 3PDSA 147LA 1LW9A 1L18A 3DNAA 1L49A 4PJZA 3K2RA 1L06A 1L31A 1QTVA 1KW5A 1C69A 4PK0A 1C6HA 1T8AA 1SWYA 3V2YA 1LYGA 1L19A 1DYEA 1CTWA 200LA 1L35A 1L97A 3HTDA 3GUJA 235LA 1C6CA 148LE 251LA 3DN3A 3HDFA 1L29A 1L57A 3HH3A 1L42A 211LA 3C7ZA 4LDOA 1LYHA 238LA 164LA 1QT5A 3F8VA 2B6XA 1L99A 3GULA 171LA 3DMZA 1L0JA 1QS5A 3HUKA 3NYAA 237LA 3C8RA 1D3JA 1L04A 1L30A 1G0LA 1G1VA 3LZMA 3HH4A 172LA 1L79A 4EPFA 126LA 1L52A 221LA 4W56A 1L50A 1L43A 1XJUA 4ARQB 1L77A 3UONA 4ARMA 4K5YA 1P46A 1C6IA 254LA 3GUKA 199LA 1L41A 1L23A 1C6QA 1PQKA 206LA 1C6JA 1L92A 3RUNA 226LA 4E97A 1L55A 1OVHA 4W54A 1CV5A 114LA 149LA 1L26A 1G0KA 145LA 1L11A 1G0GA 246LA 3OE6A 1L24A 4W57A 1CVKA 240LA 2HUKA 1CV0A 1L0KA 1G0PA 228LA 4W58A 1P56A 1CV4A 3QAKA 1P2RA 1L68A 1CX6A 219LA 3SB5A 229LA 4LDLA 261LA 6LZMA 247LA 233LA 3OE8A 1L74A 1NHBA 1L28A 1L90A 3HDEA 249LA 3HUAA 250LA 1QUOA 4LZMA 138LA 1C65A 3C83A 3DMXA 1C6DA 248LA 218LA 1L47A 1CUPA 2ANVA 140LA 155LA 1CV1A 209LA 3HH6A 1C68A 1L07A 2OE4X 1DYBA 3C8QA 1L32A 2OTYX 3NY8A 2B6YA 1D2YA 2O79A 4DAJA 1DYDA 1XEPA 1EPYA 1L82A 262LA 3CDTA 2QB0B 113LA 1LWKA 4I7KA 163LA 1P6YA 1G07A 1LYEA 109LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
118LA 1C60A 4YXAC 4H9FA 1UIEA 2BPUA 4GCEA 1JQUA 1DXJA 1QT3A 2F4GA 1L45A 3ZEKA 1PQJA 2CWIA 260LA 5HLLA 2RAYX 3RW8A 4L41A 1LSDA 4EJ4A 1FLUA 1PQOA 3HT8A 5L3HA 1C6FA 3N9EA 1GXXA 1N4FA 1GDWA 1L48A 2ZILA 5DLAA 4II8A 3VW7A 3SB9A 1B5VA 2HU1A 1C62A 1CU6A 1D9WA 5LVGA 4TWSA 1L14A 1L13A 1L89A 1VATA 2DQEY 3HU8A 1DYGA 3WH1A 4DQ5A 151LA 2BLXA 2BQGA 2BQKA 3CT0A 1CV6A 4RW2A 2BQFA 2B6TA 1L83A 173LA 1GB9A 188LA 3CDQA 1BB4A 2Z19A 1LSMA 239LA 1GFAA 2DQAA 4DQ7A 4NGZA 5LYMA 1IC4Y 4W53A 1D9UA 5I5QA 1GAYA 1EQ5A 4H94A 5LVKA 196LA 5APDA 1C61A 3EMLA 4LT3A 232LA 3HU9A 107LA 2B75A 4XJBA 5T3FA 4WL6A 2XBSA 1B5XA 1IWUA 3GUNA 1LSAA 1LMQA 5KXPA 5LZMA 5KKJA 4WM2A 4EKRA 5HNLA 2OU9A 4N5RA 1YAQA 4GLVA 4LT1A 3L2XA 4LYOA 4LZTA 1L34A 3QNGA 1H6MA 2RB2X 2H9KA 1QDRA 3SB7A 1L37A 1YL1X 4UWUA 1AM7A 135LA 1IORA 4W94A 4LDEA 1QTHA 4NWEA 1BVKC 1G7LC 5HQ1A 230LA 4H9CA 122LA 3W6FA 2RBQA 3EMSA 1PQDA 5KXMA 1JKAA 1LJEA 1JPOA 3OE9A 1L16A 1B6IA 4C3WA 1L10A 1LTMA 191LA 4NG1A 3OJPA 1LZ1A 1GDXA 3WXUA 5LA5A 4HP0A 2F32A 2FYCA 1LHIA 2HUBA 4MSTA 3L64A 1CJ9A 1C64A 1XGRC 1L65A 1LSYA 2ZQ3A 3SBAA 1PQMA 2EQLA 3RZ4A 4OOTA 222LA 5KXRA 223LA 162LA 1L75A 1UBZA 103LA 1IOQA 4ARMB 4NHSA 1I1ZA 1GBYA 185LA 4ETBA 1L56A 112LA 2G4QA 1C6GA 1LGXA 3J6KA 4H93A 4ZPUA 2LCBA 104LA 1FDLY 1CKGA 2RSCA 3WVYA 1ZV5L 3TMVA 1UCOA 4E3UA 4XJGA 3TXBA 1VDSA 259LA 1LWGA 1CU0A 4I7MA 4TSCA 4X3BA 3G3WA 1DYAA 3B6LA 3WXTA 1RCMA 1LZAA 1HELA 1NF5A 1QUHA 2A7FA 2VB1A 1OUAA 1CKHA 4G4CA 2DKVA 1XEJA 4RDSA 253LA 5KXKA 3JR6A 130LA 1ZURA 5KXXA 3HTFA 4HJZA 4NHTA 3WU9A 194LA 4NY5A 1OVKA 236LA 1L59A 1UACY 1GF5A 1WQPA 111LA 4DDAA 2I26L 1LGUA 1FLQA 4N8ZA 2YSSC 141LA 1L22A 5B1FA 1NDGC 4ARLA 1XGTC 1L05A 2BQLA 1HFYA 1G06A 1QT7A 3RZEA 1IP5A 1LSFA 1L88A 201LA 3ODUA 1INUA 143LA 1QSWA 245LA 3IJVA 4PJZA 1C69A 1GFJA 2FYDA 1C6HA 1SWYA 3V2YA 1LJFA 1V7SA 1DYEA 4WLYA 2ZWBA 1VDTA 4B1AA 3CSRA 2BQBA 1L29A 1LMAA 1L57A 1IR8A 1LYHA 1E8LA 2D4IA 1IWZA 2AUBA 171LA 1L0JA 5FHWA 1BWHA 2XTHA 3P66A 4XYYA 3C8RA 3CB7A 3F6ZA 1GE4A 4EPFA 2CJLA 4AGAA 126LA 3ZVQA 221LA 4GN4A 4W56A 1L50A 1WQRA 1B2KA 5LAFA 3UONA 1P46A 3WUNA 3GUKA 4WM5A 4BS7A 3A91A 2ZIJA 4WG7A 4NHQA 5KXYA 3RUNA 5I54A 1CV5A 114LA 4A7DA 1L11A 1L24A 240LA 1IP6A 1CV4A 1YIKA 1EL1A 3G3AB 1NBZC 2LZ2A 3EO5A 1F6RA 247LA 4LFXA 5LVIA 3WU7A 1B7RA 1JKCA 1XGUC 1OUCA 5HMJA 4Z41A 3HUAA 5A3EA 1GBOA 1LYZA 3A96A 4LZMA 4CJ2A 138LA 218LA 2MEGA 4H9AA 1UUZC 1QDTA 3EXDA 4NIJA 1G7IC 1LKRA 4N0JA 3TXIA 1C68A 2OE4X 3NY8A 2OTYX 5I4YA 2B6YA 1XEPA 5JENB 1BB5A 2QB0B 1LWKA 5L9JA 163LA 4HPEA 3P4ZA 4UWNA 1LYEA 1LZRA 1C6MA 4R6CA 1J1XY 1A2YC 3WVXA 4MCKA 5ILCA 1LI6A 225LA 1L12A 210LA 1VEDA 227LA 2D4JA 4B49A 2OU0X 1GB8A 133LA 1HFZA 4XJIA 3IWRA 2B70A 1CJ6A 241LA 1D3NA 1QUTA 156LA 1C08C 4ARJA 2NTHA 5D5CA 1LHMA 2HTXA 3A3RX 4H9BA 4ETDA 1C6EA 1DYCA 2RH1A 3M18B 1NWGA 2HULA 5KXTA 3C8SA 1L15A 243LA 1LYFA 3FE0A 2F47A 1LJKA 1CU5A 4G4HA 5I53A 5KXLA 1C63A 1L09A 3SP3A 1SSWA 4QEQA 1L60A 4WM4A 3E3DA 2HEAA 1UIAA 4DD1A 137LA 5B05A 3CT1A 3WW6A 4DT3A 4CGEA 1L81A 2YBMA 1KY1A 5FDJA 3DN0A 4NEBA 2BQOA 1BWIA 2RBNA 3RNXA 2DQHY 4WO9A 3C80A 4I7JA 166LA 1YANA 3AB6A 1LJ4A 1L64A 4U3XB 1YKZX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 118L A;  1C60 A;  4YXA C;  4H9F A;  1UIE A;  2BPU A;  4GCE A;  1JQU A;  1DXJ A;  1QT3 A;  2F4G A;  1L45 A;  3ZEK A;  1PQJ A;  2CWI A;  260L A;  5HLL A;  2RAY X;  3RW8 A;  4L41 A;  1LSD A;  4EJ4 A;  1FLU A;  1PQO A;  3HT8 A;  5L3H A;  1C6F A;  3N9E A;  1GXX A;  1N4F A;  1GDW A;  1L48 A;  2ZIL A;  5DLA A;  4II8 A;  3VW7 A;  3SB9 A;  1B5V A;  2HU1 A;  1C62 A;  1CU6 A;  1D9W A;  5LVG A;  4TWS A;  1L14 A;  1L13 A;  1L89 A;  1VAT A;  2DQE Y;  3HU8 A;  1DYG A;  3WH1 A;  4DQ5 A;  151L A;  2BLX A;  2BQG A;  2BQK A;  3CT0 A;  1CV6 A;  4RW2 A;  2BQF A;  2B6T A;  1L83 A;  173L A;  1GB9 A;  188L A;  3CDQ A;  1BB4 A;  2Z19 A;  1LSM A;  239L A;  1GFA A;  2DQA A;  4DQ7 A;  4NGZ A;  5LYM A;  1IC4 Y;  4W53 A;  1D9U A;  5I5Q A;  1GAY A;  1EQ5 A;  4H94 A;  5LVK A;  196L A;  5APD A;  1C61 A;  3EML A;  4LT3 A;  232L A;  3HU9 A;  107L A;  2B75 A;  4XJB A;  5T3F A;  4WL6 A;  2XBS A;  1B5X A;  1IWU A;  3GUN A;  1LSA A;  1LMQ A;  5KXP A;  5LZM A;  5KKJ A;  4WM2 A;  4EKR A;  5HNL A;  2OU9 A;  4N5R A;  1YAQ A;  4GLV A; 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