165LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNALRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 56
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 165lA00
2NTHA 1L12A 4EKSA 1C60A 1PQIA 1C67A 159LA 3OE0A 262LA 4GBRB 1KNIA 128LA 1JTMA 3HU8A 1L06A 1OVJA 2B70A 1L41A 223LA 1CV1A 3HT9A 4W54A 1L88A 1L50A 151LA 235LA 4IAPA 3JR6A 3C8SA 1L98A 1LYGA 4DKLA 3HTFA 4ARQB 125LA 1D3NA 1B6IA 1L51A 258LA 2OU0X 1L96A 2B6TA 1LPYA 1C6FA 182LA 115LA 3DN4A 4I7SA 185LA 1G0MA 1L20A 2RBPA 3DN2A 1L46A 4EXMA 3SB8A 113LA 131LA 1T97A 1OVHA 155LA 189LA 1WTHA 239LA 3CDQA 3RUNA 3SB6A 1DYBA 3NY8A 1L61A 1XJTA 3DNAA 1KY0A 3HTDA 1KW5A 1L33A 1L63A 1LWKA 1C6GA 218LA 2B75A 3DMXA 5LZMA 1L24A 1L59A 3GUMA 3SBBC 1L30A 230LA 221LA 247LA 1L37A 4I7PA 1CTWA 3V2WA 1G0LA 1SSWA 1L17A 3RZEA 164LA 1L53A 1QS9A 1PQMA 1QT8A 191LA 251LA 3GUPA 3HDFA 4ARPA 190LA 1C6HA 1C6PA 2A4TA 1L44A 1L86A 1L09A 4EKPA 233LA 4S0WA 1L94A 1QTHA 1D9WA 186LA 2RBQA 1G06A 138LA 2F47A 3HUAA 1QTCA 118LA 1QTBA 3HH4A 127LA 3SB5A 3C82A 1L87A 1L62A 104LA 3CDOA 232LA 165LA 2RBSA 119LA 4ZPUA 1QT5A 227LA 144LA 231LA 2Q9EA 176LA 2QB0B 224LA 4EKQA 4YXCA 1L60A 1L75A 1QUHA 145LA 1D3MA 1CU5A 1L55A 248LA 195LA 2RB2X 3OE6A 1LWGA 242LA 3C7YA 172LA 4ARQA 1PQKA 2B7XA 1L04A 4ARLA 3HTGA 3OE9A 1CV4A 3QAKA 1LYEA 1L84A 1D2YA 2CUUA 4I7KA 1L15A 1P46A 156LA 212LA 215LA 1L01A 1LGUA 3C7WA 2LCBA 234LA 1L16A 3HDEA 3D4SA 4W58A 141LA 229LA 3DMZA 2B6YA 3DN3A 1L77A 1C66A 3OE8A 209LA 167LA 1C62A 184LA 3HTBA 199LA 1L43A 3CDRA 1L21A 174LA 1L47A 1CV6A 243LA 1JTNA 142LA 3C80A 108LA 4I7QA 1SWYA 237LA 1DYDA 1P3NA 1L81A 4W56A 126LA 213LA 3L64A 1L58A 1SX2A 140LA 1QT7A 1L68A 2ANXA 122LA 2B74A 3HH3A 3EMLA 3C8QA 3PDSA 1LI3A 1DYEA 200LA 3C7ZA 1LYHA 2NTGA 2B73A 1C6BA 1CU3A 1C6KA 1SWZA 1L31A 3HT6A 4LDLA 1P64A 120LA 3G3WA 3HWLA 196LA 1CX7A 3G3VA 1ZYTA 1L72A 1L23A 1DYAA 214LA 1D3FA 1OWYA 3VW7A 1L76A 4PK0A 4W59A 161LA 1LGWA 4LDOA 1L26A 3G3XA 1L71A 1L56A 1OYUA 1C6TA 1T8FA 102LA 1SX7A 1CV3A 183LA 1C65A 2F2QA 1G0PA 1L65A 216LA 143LA 1L39A 1L80A 2IGCA 162LA 2ANVA 157LA 1L03A 1L13A 4DJHA 1L52A 1C6MA 1L42A 103LA 1CUPA 1QSQA 152LA 146LA 112LA 1QSBA 246LA 4EPFA 1C68A 1L0JA 1L18A 1XEPA 2OE7X 1C69A 3CDVA 1CU2A 1KY1A 4I7OA 1L48A 1L34A 2RBNA 148LE 114LA 1C6NA 1L70A 1C6LA 1L00A 3FADA 1K28A 1LW9A 171LA 249LA 2Q9DA 1QT6A 240LA 1L40A 3HU9A 2OE9X 3GUJA 4W52A 2B6ZA 1L67A 175LA 3FA0A 1CV0A 1T8GA 2RB0X 181LA 1L07A 173LA 3F8VA 1G0GA 139LA 1L29A 123LA 107LA 4ARJA 1C61A 1D3JA 241LA 1C6DA 160LA 1L05A 3C8RA 4LDEA 1L08A 1G0QA 1CUQA 3PBLA 2OTYX 1C6CA 4AQNA 5I14A 1L11A 1QUOA 4YX7C 4W55A 147LA 1L83A 1LYDA 3FI5A 1I6SA 4EJ4A 2O79A 1L14A 1DYCA 1L82A 1C6IA 1PQOA 1LYIA 245LA 1L69A 228LA 1L99A 1L25A 222LA 1L49A 1DYGA 3HT7A 3CDTA 1OV5A 1L91A 2O7AA 4PJZA 3UONA 3ODUA 201LA 1L28A 3SBAA 1L36A 1T8AA 1G0KA 1P37A 260LA 2OU8A 1C6EA 2RB1X 3GUKA 1C6AA 1L54A 1L57A 2B72A 137LA 1NHBA 166LA 1PQJA 3LZMA 4W53A 3V2YA 1P5CA 1EPYA 1CU6A 1QTVA 1G0JA 3NY9A 192LA 1TLAA 238LA 3SB7A 1L38A 3HH6A 1L90A 197LA 253LA 188LA 1JQUA 1P2RA 1OVKA 250LA 205LA 3HUKA 4W51A 169LA 3GUNA 1L0KA 236LA 1L02A 3GULA 4I7NA 4EPIA 1ZURA 1QUGA 3L2XA 254LA 2B6WA 177LA 257LA 3GUOA 2OEAX 3DKEX 4E97A 220LA 1T6HA 1L19A 3GUIA 1P6YA 2RH1A 2LC9A 1L22A 1L66A 4ARMA 1PQDA 1OWZA 217LA 158LA 2HUMA 1G07A 2OTZX 2LZMA 4I7JA 1L92A 219LA 1C64A 1P56A 4GRVA 1L73A 198LA 180LA 1QS5A 1SSYA 3C83A 109LA 187LA 255LA 4I7TA 3SB9A 2F32A 252LA 1P7SA 244LA 1L10A 3HH5A 1P36A 3K2RA 1L97A 1QTDA 111LA 1L45A 1QTZA 4DAJA 3HUQA 3NYAA 1P2LA 1L32A 1L35A 4LZMA 3F9LA 1CU0A 1LI2A 1L64A 256LA 1QT3A 2O4WA 170LA 1L74A 1LI6A 1LYJA 3C81A 1LGXA 1KW7A 2OE4X 1L79A 4I7LA 2RAZX 1G1VA 1L95A 2RBRA 1D2WA 1L93A 2Z6BA 1ZWNA 4YXAC 2HULA 1CVKA 1C63A 4ARMB 1CX6A 210LA 130LA 1G1WA 110LA 4I7RA 3DN6A 3DMVA 1XJUA 2RBOA 225LA 1L85A 4I7MA 2OU9A 4OO9A 3DN1A 211LA 1QUDA 1LYFA 1QT4A 261LA 178LA 6LZMA 1KS3A 150LA 1C6JA 1CV5A 3SN6R 163LA 2RAYX 1L89A 1LLHA 3DN8A 206LA 226LA 168LA 3HT8A 1C6QA 7LZMA 129LA 2QARC 4W57A 4EKRA 4K5YA 259LA 149LA 2B6XA 3DN0A 1DYFA 1L27A 2L78A 1OV7A 2HUKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LYMA 1ALCA 3AB6A 1C67A 4GN3A 2BQDA 128LA 1YAPA 5FDJA 2B70A 1L41A 1YROA 1JTTL 1G7HC 2LHMA 151LA 1LMOA 1SQ2L 5I4YA 4WM1A 125LA 4Z3MA 1L51A 1LZCA 1L96A 1XFPL 1LKRA 1G7LC 5I4XA 3TXFA 1L20A 4YOPA 113LA 4EOFA 1B7PA 1HNLA 3CDQA 4ZIXA 4WG7A 5II3A 1EQ4A 5LZMA 3N9EA 1L37A 2HU3A 1G0LA 4OW1A 2I6ZA 3EXDA 3LN2A 4NSGA 1L17A 5HNCA 1QT8A 191LA 1DI3A 1CNSA 190LA 1C6HA 2A4TA 233LA 1OQMA 1AT6A 4S0WA 1QTHA 1GDXA 5AMYA 186LA 2RBQA 4DD2A 1JJ0A 1LSCA 1LSGA 138LA 2F47A 4XJFA 1F0WA 118LA 1GHLA 3HH4A 2FYDA 3CSZA 3C82A 3SB5A 165LA 119LA 5KXOA 3WH1A 176LA 2QB0B 2LZ2A 1LZYA 1G7JC 4WO6A 2RB2X 3OE6A 1LWGA 4HTQA 4OWEA 242LA 1JPOA 172LA 1C10A 5APDA 1L04A 4TWSA 3HTGA 2DQFC 1GF4A 4ET9A 1CJ8A 1LYEA 1L84A 1GEVA 2BQIA 3J6KA 5KXMA 1G7MC 5LAGA 1B7NA 3D4SA 4YENA 4IASA 3GXKA 4TSCA 167LA 1LSZA 184LA 3RW8A 1FKQA 8LYZA 2BQEA 3CDRA 174LA 1L47A 243LA 2MEHA 5KXTA 3C80A 1QTKA 1DYDA 1P3NA 5KXNA 1B0DA 1SX2A 140LA 122LA 1QDRA 2B74A 1LCNA 3HH3A 2FBBA 4NGVA 4GCFA 2D91A 3HBEX 2H9KA 2NTGA 2XBSA 1CKFA 1IWXA 1C6KA 1SWZA 2HTXA 4WLTA 4LDLA 4P2EA 120LA 1WQRA 3HWLA 5DLAA 196LA 1CX7A 4KL7A 3P66A 4NGZA 1WQQA 5LVHA 1GB8A 1DYAA 1GD6A 1LZ8A 161LA 1IVMA 4M4OA 4LDOA 1L26A 1L71A 1L56A 4DDAA 4Z98A 3RNXA 1SX7A 1CV3A 183LA 4GLAA 4B4IA 2D4IA 4G4HA 143LA 1L80A 4WO9A 157LA 1C6MA 1L52A 4WM6A 4J1BA 1B5WA 1CJ7A 1KY1A 1L34A 1L00A 5K7OA 3FADA 4LYTA 1LW9A 3A3RX 1L40A 1B5ZA 3HU9A 1HMKA 1HSXA 3A3QA 1LKSA 3E3DA 5F9UA 3A94A 1FLYA 3FA0A 2AUBA 1GFVA 2RB0X 173LA 1D0LA 1BWHA 5B06A 4HP0A 241LA 1C6DA 160LA 4HTNA 1YANA 3C8RA 4MR1A 4C5FA 4AQNA 2BQHA 4W94A 5I14A 1QUOA 147LA 4C3WA 2O79A 1L14A 1PQOA 1LYIA 4GCDA 3WL2A 1IWTA 1IP6A 3CT1A 3WU8A 1L91A 4PJZA 1OUJA 4NHPA 2LZTA 1C6EA 2RB1X 1IWWA 1C6AA 2XBRA 1L57A 1GF3A 1LYYA 1PQJA 1IP4A 2YBIA 1P5CA 1IR9A 3EBAB 1LYZA 3A8ZA 1QTVA 3G3AB 4H9EA 5DL9A 3CT0A 5E9RA 4WOAA 1DKJA 1UICA 1OVKA 1LAAA 2BAAA 4LYMA 1LSNA 3GULA 4OWBA 1ZURA 4RDSA 1QUGA 254LA 4HV2A 3DKEX 3BKHA 1RE2A 4WM5A 3GUIA 3N9CA 2RH1A 2LC9A 1L66A 2NWDX 2MEDA 4QEQA 1GF7A 2OTZX 1L92A 2DQAA 1IORA 1IWZA 5LAFA 5F9XA 1SSYA 4YM8A 2BQMA 3LZ2A 1LZRA 3B0KA 1GFHA 252LA 244LA 1LYOA 1OUIA 1QTDA 111LA 1L45A 1NF5A 3HUQA 1LHLA 1NBYC 4NHIA 1L35A 1OUFA 5ILCA 1LJJA 4LZMA 3F9LA 1QT3A 170LA 1QSWA 1JIYA 3C81A 1FKVA 1KW7A 2OE4X 5APEA 5LVIA 1LTMA 2RBRA 2Z6BA 4ARMB 1IOSA 210LA 1B5XA 4I7MA 2B5ZA 5A3EA 3LYOA 4ETEA 4OO9A 3DN1A 2MEIA 211LA 3WVXA 1QT4A 261LA 3FI7A 6LZMA 1YAQA 4EMNA 150LA 1QUSA 1IY4A 1CV5A 1IR7A 3SN6R 5APCA 226LA 1C6QA 1REZA 7LZMA 129LA 2Q0MX 1GBSA 4DQJA 3B0OA 259LA 2B6XA 2L78A 1OV7A 5KXLA 1Z55A 1L12A 1LYSA 1LZEA 1PQIA 1GB3A 1OUDA 3HU8A 1DPWA 4A7DA 4W54A 1CV1A 3HT9A 5C6JA 1KXWA 4DDCA 3TMWA 1L50A 1BWIA 5HMVA 4ARQB 1T6VL 1XGTC 2YBJA 2ZYPA 5KXYA 1LJEA 2CGIA 3DN4A 5HNLA 185LA 1G0MA 5J7CA 3DN2A 1L46A 1T97A 3QE8A 4HTKA 1ZVYB 5IELA 239LA 3RUNA 1HEWA 3A95A 1KY0A 1O23A 2ZYCA 3B0IA 1IP7A 1LWKA 218LA 2B75A 4I0CA 1L30A 1WTMA 1FDLY 3AJNA 1SSWA 1JKAA 4N9RA 1HEPA 3HDFA 4WL6A 5FCPA 1C6PA 4H90A 1UACY 1L86A 4UWUA 2CWIA 2H9JA 2MEAA 1HEMA 1RCMA 2YBHA 5T3FA 1IO5A 4BAPA 2BQGA 2RBSA 135LA 4II8A 1QT5A 227LA 4RW1A 144LA 1B7QA 2HEEA 3TXKA 3VWOA 1FLWA 2X0AA 224LA 4J0LA 145LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3LYM A;  1ALC A;  3AB6 A;  1C67 A;  4GN3 A;  2BQD A;  128L A;  1YAP A;  5FDJ A;  2B70 A;  1L41 A;  1YRO A;  1JTT L;  1G7H C;  2LHM A;  151L A;  1LMO A;  1SQ2 L;  5I4Y A;  4WM1 A;  125L A;  4Z3M A;  1L51 A;  1LZC A;  1L96 A;  1XFP L;  1LKR A;  1G7L C;  5I4X A;  3TXF A;  1L20 A;  4YOP A;  113L A;  4EOF A;  1B7P A;  1HNL A;  3CDQ A;  4ZIX A;  4WG7 A;  5II3 A;  1EQ4 A;  5LZM A;  3N9E A;  1L37 A;  2HU3 A;  1G0L A;  4OW1 A;  2I6Z A;  3EXD A;  3LN2 A;  4NSG A;  1L17 A;  5HNC A;  1QT8 A;  191L A;  1DI3 A;  1CNS A;  190L A;  1C6H A;  2A4T A;  233L A;  1OQM A;  1AT6 A;  4S0W A;  1QTH A;  1GDX A;  5AMY A;  186L A;  2RBQ A;  4DD2 A;  1JJ0 A;  1LSC A;  1LSG A;  138L A;  2F47 A;  4XJF A;  1F0W A;  118L A;  1GHL A;  3HH4 A;  2FYD A;  3CSZ A;  3C82 A;  3SB5 A;  165L A;  119L A;  5KXO A;  3WH1 A;  176L A;  2QB0 B;  2LZ2 A;  1LZY A;  1G7J C;  4WO6 A;  2RB2 X;  3OE6 A;  1LWG A;  4HTQ A;  4OWE A;  242L A;  1JPO A;  172L A;  1C10 A;  5APD A;  1L04 A;  4TWS A;  3HTG A;  2DQF C;  1GF4 A;  4ET9 A;  1CJ8 A;  1LYE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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