165LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNALRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 56
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 165lA00
3OE0A 4I7LA 3JR6A 2B7XA 220LA 3HUAA 1L19A 256LA 210LA 1L99A 1LYEA 1C6JA 162LA 3EMLA 1KY1A 142LA 1L10A 240LA 3V2YA 2RBPA 156LA 1L82A 122LA 1PQMA 4ARQA 3HTFA 1L75A 4I7MA 1L33A 1P6YA 1C6TA 2O79A 1ZURA 1QT7A 1G07A 2RBQA 3HTDA 161LA 1C6IA 237LA 1QUHA 2QARC 3GUPA 252LA 4ARMB 2ANXA 168LA 1LYJA 1D3FA 1QTVA 1T8GA 4LDLA 1P64A 4DKLA 3DMZA 1L60A 4EPIA 2RAZX 2Z6BA 139LA 1L40A 1NHBA 4EJ4A 199LA 2OU9A 1L0KA 1L95A 1CV1A 233LA 2RAYX 1QTBA 1C6QA 4EXMA 1KNIA 3DNAA 163LA 1LI3A 1OVKA 2OE7X 223LA 109LA 1L24A 103LA 2B6XA 1ZYTA 184LA 1L46A 214LA 3HU9A 120LA 239LA 1P2RA 2LCBA 1LW9A 1D3NA 3GUKA 1LI2A 1PQOA 174LA 1L72A 4ARPA 1L54A 190LA 1L07A 1L64A 2B75A 3G3WA 2HUKA 1QT8A 3HUKA 185LA 225LA 1PQIA 253LA 1L45A 1T97A 1L76A 4I7PA 191LA 1L06A 3HTGA 1SWZA 234LA 4EKQA 1L15A 3GUIA 1T6HA 1C67A 1C60A 125LA 1P37A 3NY9A 169LA 4W56A 1L03A 183LA 1L86A 3HH5A 1QUGA 165LA 1CU5A 2B70A 2CUUA 1QSQA 1L27A 4LDEA 170LA 1CX7A 1G0PA 1L97A 198LA 4YX7C 177LA 1L14A 1WTHA 4W53A 1SWYA 155LA 1QTCA 4LZMA 4GBRB 157LA 1CVKA 1OVHA 4ARQB 166LA 1C6NA 3F8VA 3HT6A 126LA 231LA 1G06A 3FADA 2OU0X 160LA 1OWZA 3GUMA 2RBNA 128LA 1XJTA 205LA 195LA 2B6TA 1L94A 4E97A 1L26A 3G3XA 2NTGA 3GUJA 1L41A 3GULA 1L83A 242LA 4EKPA 1L37A 1P56A 1SSWA 3C7WA 4I7SA 1C68A 4K5YA 137LA 3L64A 1L34A 1L42A 1CV5A 2RB1X 1L61A 1PQDA 3OE8A 3QAKA 1CUPA 1LGUA 1DYDA 187LA 1LWGA 3HDEA 4PJZA 1L20A 182LA 4I7KA 2B72A 1EPYA 1QTZA 3LZMA 4DAJA 4ZPUA 1L02A 114LA 3G3VA 1OV7A 2OTYX 1G0LA 147LA 1XEPA 1DYEA 1QTHA 215LA 2RBSA 171LA 1C6KA 3V2WA 167LA 1CV0A 144LA 3GUNA 2HULA 1C6AA 178LA 259LA 1L93A 1L57A 1L55A 1QT6A 4YXAC 1DYGA 3C80A 172LA 3L2XA 129LA 1C6BA 1L23A 181LA 226LA 1QT5A 3FI5A 227LA 236LA 2OEAX 2IGCA 1L38A 1CV4A 3PDSA 1L89A 2NTHA 3DN6A 1LYIA 2RBRA 2F2QA 1PQKA 104LA 3SB6A 209LA 1CU0A 1L74A 138LA 1LYFA 235LA 196LA 1L44A 2ANVA 1L53A 3F9LA 1L73A 1C69A 1LLHA 222LA 110LA 2HUMA 3HT9A 1L28A 1C62A 2B6WA 2B73A 3C81A 141LA 1L49A 1CV3A 3DN3A 1D3MA 151LA 1L43A 3SB5A 6LZMA 3HDFA 159LA 255LA 1L84A 3CDTA 150LA 3DN4A 257LA 230LA 1C63A 3C83A 1L25A 180LA 143LA 1D3JA 1P5CA 4I7NA 1L31A 1P3NA 1SSYA 176LA 3C8SA 249LA 1L39A 1KS3A 3CDOA 1L17A 1JQUA 1KW5A 1P7SA 251LA 175LA 3SB9A 246LA 1L12A 2O4WA 1L50A 3HUQA 1L21A 250LA 2QB0B 4I7RA 3C7YA 1K28A 1ZWNA 4EKRA 1CU2A 1C6DA 1OV5A 4W54A 2B6ZA 1L98A 3HH4A 1C6LA 3CDVA 4W55A 4EPFA 1C6HA 245LA 1QS9A 228LA 3HT8A 1L65A 1L36A 3DN8A 3PBLA 1OYUA 2O7AA 241LA 1C6GA 3CDRA 1P2LA 2Q9DA 3DMXA 3OE9A 1L63A 1CV6A 3SBBC 4W58A 145LA 3FA0A 3HH3A 2B6YA 232LA 1L13A 4W51A 4DJHA 1L08A 1QSBA 3C8RA 1C64A 188LA 1L81A 1DYCA 1L90A 1CTWA 115LA 4OO9A 1G0KA 3C8QA 4GRVA 146LA 1L11A 2F47A 2Q9EA 1C66A 260LA 2LZMA 1L56A 3HH6A 164LA 173LA 1L88A 244LA 1KY0A 3GUOA 2A4TA 118LA 4YXCA 1D9WA 1L32A 1L00A 1D2YA 1SX2A 2OU8A 1G0QA 1L0JA 1L87A 3DKEX 2OE9X 1SX7A 4EKSA 4I7TA 1L91A 3SB7A 1T8AA 221LA 218LA 1CX6A 1I6SA 149LA 3RZEA 1L79A 4S0WA 1C61A 192LA 2LC9A 3RUNA 1P36A 1L52A 131LA 3HT7A 1L05A 1L70A 1G0GA 2RH1A 1L22A 4I7OA 5I14A 1C6CA 1L58A 1L59A 206LA 1C65A 2OTZX 158LA 247LA 1DYAA 211LA 3ODUA 2L78A 1L80A 1QUDA 4W52A 3CDQA 1QS5A 1L92A 1L67A 1LGXA 107LA 113LA 1G0MA 3NY8A 2F32A 1LPYA 261LA 152LA 3VW7A 1L68A 1QTDA 238LA 3SB8A 1L30A 4W57A 4IAPA 1LGWA 4ARMA 1G1VA 1L96A 1L47A 1L01A 102LA 1QUOA 127LA 3HWLA 254LA 3HU8A 4I7QA 3DN1A 4PK0A 123LA 3SBAA 3DMVA 148LE 1L16A 1QT4A 1CU3A 4ARLA 2RB2X 1L04A 3C7ZA 1LYDA 1D2WA 2OE4X 4W59A 5LZMA 112LA 219LA 213LA 201LA 1OWYA 1G1WA 1L85A 1TLAA 1CUQA 1L62A 1LYHA 212LA 111LA 217LA 1C6PA 1L66A 1L69A 1CU6A 108LA 1OVJA 186LA 1C6MA 258LA 243LA 200LA 119LA 4I7JA 1L29A 1XJUA 7LZMA 1L48A 1LYGA 1L51A 1C6EA 1L77A 1JTMA 1JTNA 1DYBA 1T8FA 1P46A 1KW7A 1L18A 140LA 1L71A 1C6FA 1DYFA 1LI6A 2RB0X 3DN2A 3DN0A 3NYAA 224LA 248LA 4ARJA 1PQJA 229LA 3K2RA 3UONA 1L09A 216LA 3D4SA 4AQNA 2B74A 3C82A 197LA 262LA 1G0JA 3OE6A 3SN6R 4LDOA 1L35A 2RBOA 1QT3A 3HTBA 130LA 189LA 1LWKA 1B6IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OE0A 220LA 4LZTA 1L19A 5L9JA 1GPQC 1L99A 4GCDA 1KY1A 2X0AA 122LA 5LAGA 4XYYA 3HTFA 1P6YA 2BLXA 2MEAA 1QT7A 2BQFA 4R6CA 5DN4A 1LJNA 168LA 4NSIA 1D3FA 1QTVA 4LDLA 1P64A 1CJ7A 1L60A 4EPIA 3MGWA 3WW6A 5KXWA 2RAZX 1IP4A 1OUDA 1DPWA 2RSCA 1IEEA 3BKVA 5KXMA 3G3BB 3AGHA 1CV1A 4H9BA 4NGOA 2BQAA 1C6QA 1GXXA 1B7SA 4I8SA 1KNIA 1DZBX 2OE7X 1ZYTA 184LA 1DI4A 3HU9A 1B5YA 120LA 1LW9A 4NWEA 1LI2A 4WO6A 2MEEA 190LA 1L07A 2B75A 1UIDA 1LHJA 3CSRA 1PQIA 1JKAA 1IC7Y 1LZ6A 5HNLA 4ET9A 2ZIKA 2B5ZA 4WM3A 3GUIA 4P2EA 5FELA 2BQJA 1D0MA 169LA 4W56A 4H9HA 1REZA 2B70A 1YL1X 1CKCA 198LA 177LA 5E4PA 1TDYA 1FDLY 1QTCA 1OUHA 1KIQC 2N5ZA 1GFAA 1F6SA 157LA 1CVKA 3HT6A 4HJVA 3A6BY 128LA 4DD1A 1L94A 4QEQA 1GFRA 3G3XA 3AGGG 1B0DA 3GUJA 1L41A 3GULA 1YANA 4CFPA 1YILA 1C68A 3L64A 3WL2A 1L61A 1LGUA 1DYDA 1CNSA 1IX0A 4UWUA 2DQIY 1LMAA 4WLXA 1B5XA 3LZTA 3AYQA 1QIOA 4Z46A 1IOTA 1LJHA 1QTHA 3GUNA 1CV0A 1C6AA 5LA8A 259LA 1L55A 3C80A 5I4WA 1JUGA 1QT5A 1C46A 5IELA 2MEDA 2YBIA 4KT3A 4B1AA 209LA 1LYFA 3RU5A 196LA 1IWXA 3F9LA 110LA 1L28A 1C62A 4EMNA 2B73A 1CV3A 2DQHY 3DN3A 4N8ZA 6LZMA 1V7SA 1LYYA 1WQQA 4LT0A 3CDTA 4N1EI 1UA6Y 3DN4A 257LA 1C63A 3C83A 3P66A 180LA 1DI3A 3WU8A 3A91A 3HBEX 3C8SA 3ZVQA 5KXZA 2LZ2A 1W6ZA 1QSAA 3FE0A 4H9FA 4TWSA 1JQUA 1P7SA 153LA 2G4NA 246LA 1F10A 3HUQA 250LA 4YENA 4I7RA 2DKVA 1D6QA 4H9EA 4NHTA 2B6ZA 3TMWA 1L98A 3TXIA 3HH4A 5B59A 1REYA 1AM7A 4DD9A 1WQPA 4H9IA 1OYUA 2YSSC 1C6GA 3CDRA 3FI7A 1C45A 3WUMA 2ZWBA 1CV6A 4NHIA 1HC0A 3B0KA 3LYOA 145LA 2LYOA 1YROA 4PPOA 4DJHA 5ILCA 2YBLA 1CKDA 188LA 1LJJA 4YEMA 135LA 1YKXX 4LFPA 1LZYA 2HTXA 4GRVA 146LA 2VB1A 1L11A 2F47A 5F81A 1C66A 2LZMA 3HH6A 2FYCA 3VWOA 3GUOA 1KY0A 118LA 2Z39A 1D9WA 3W6BA 1QDRA 1D2YA 1WQMA 132LA 4UWVA 2OU8A 2D91A 1G0QA 1L0JA 1BWIA 1BVXA 1LMNA 1RI8B 4WOAA 4EKSA 1ALCA 4NSJA 1J1PY 1XEKA 4PRQA 4I7TA 2G4PA 1T8AA 1XSFA 3WU7A 4ETDA 149LA 3RZEA 4S0WA 4HJYA 3RUNA 4HTNA 2RH1A 1BB7A 1WQOA 3T36A 1L59A 1JWRA 1DYAA 211LA 3AW7A 3T6UA 1L80A 2HECA 1VATA 1GFVA 1LGXA 2LYZA 113LA 3NY8A 4QY9A 261LA 4WL7A 3K3TA 3CT5A 1LHKA 3ZVQB 4W57A 2CWIA 1OUJA 4OWBA 1IY4A 127LA 1LZTA 5L3HA 2EIZC 2Q0MX 3WW5A 3DMVA 4DDCA 5B1GA 2FBDA 5I4YA 1L16A 3LN2A 4XJIA 1LSBA 4ARLA 1UIHA 1CJ8A 1GB5A 3C7ZA 1LYDA 1D2WA 5LZMA 1KXWA 201LA 1LZNA 212LA 1G1WA 2FBBA 1LZAA 2MEIA 4H9CA 4TX7A 258LA 243LA 1LMCA 1XJUA 1OP9B 5ILFA 3A94A 1XGQC 5KY1A 1DYBA 2EQLA 2YDGA 1EQ5A 1B5ZA 1C6FA 4CGEA 1LI6A 2RB0X 1UIEA 3DN2A 4B0DA 3DN0A 3NYAA 248LA 1PQJA 4MR1A 229LA 2HEBA 4NGZA 1L09A 1LJ3A 1H87A 262LA 3OE6A 1TEWA 4HTQA 2HUBA 4ML7A 4I7LA 162LA 4GCBA 3EMLA 1GXV2 1VDPA 4XJHA 1L10A 1HMLA 1GBWA 2RBPA 156LA 4FDYA 5APCA 3TXGA 1PQMA 4XENA 1LJGA 2C8PA 2DQCY 2PC2A 133LA 4NSGA 1C6TA 2O79A 1PZYA 1LZ5A 3M3UA 1GEVA 161LA 3P4ZA 3GUPA 1LMQA 252LA 3TXJA 5KKJA 1IR9A 1BB4A 1IP7A 1IWTA 4W96A 5IHGA 1LHLA 4GCFA 4NG1A 1JHLA 4I0CA 163LA 1OVKA 134LA 1LYZA 1L24A 2B6XA 103LA 3W6DA 2G4QA 4OWAA 4Z98A 2LCBA 4BADA 1TAYA 1PQOA 1IY3A 2LHMA 1L72A 1GB0A 3AZ7A 3OK0A 5L3IA 1L54A 1L64A 4PHIA 1B5WA 2MEBA 1AZFA 1B7PA 1GE2A 1LPIA 2CGIA 1LZ4A 1UIBA 4I7PA 5KXOA 234LA 1JEFA 1HEMA 1B7LA 2DQGY 1G7IC 4LYCA 1IWVA 1L03A 4N9RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OE0 A;  220L A;  4LZT A;  1L19 A;  5L9J A;  1GPQ C;  1L99 A;  4GCD A;  1KY1 A;  2X0A A;  122L A;  5LAG A;  4XYY A;  3HTF A;  1P6Y A;  2BLX A;  2MEA A;  1QT7 A;  2BQF A;  4R6C A;  5DN4 A;  1LJN A;  168L A;  4NSI A;  1D3F A;  1QTV A;  4LDL A;  1P64 A;  1CJ7 A;  1L60 A;  4EPI A;  3MGW A;  3WW6 A;  5KXW A;  2RAZ X;  1IP4 A;  1OUD A;  1DPW A;  2RSC A;  1IEE A;  3BKV A;  5KXM A;  3G3B B;  3AGH A;  1CV1 A;  4H9B A;  4NGO A;  2BQA A;  1C6Q A;  1GXX A;  1B7S A;  4I8S A;  1KNI A;  1DZB X;  2OE7 X;  1ZYT A;  184L A;  1DI4 A;  3HU9 A;  1B5Y A;  120L A;  1LW9 A;  4NWE A;  1LI2 A;  4WO6 A;  2MEE A;  190L A;  1L07 A;  2B75 A;  1UID A;  1LHJ A;  3CSR A;  1PQI A;  1JKA A;  1IC7 Y;  1LZ6 A;  5HNL A;  4ET9 A;  2ZIK A;  2B5Z A;  4WM3 A;  3GUI A;  4P2E A;  5FEL A;  2BQJ A;  1D0M A;  169L A;  4W56 A;  4H9H A;  1REZ A;  2B70 A;  1YL1 X;  1CKC A;  198L A;  177L A;  5E4P A;  1TDY A;  1FDL Y;  1QTC A;  1OUH A;  1KIQ C;  2N5Z A;  1GFA A;  1F6S A;  157L A;  1CVK A;  3HT6 A;  4HJV A;  3A6B Y;  128L A;  4DD1 A;  1L94 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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