166LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFANSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 166lA00
220LA 1I6SA 1LWGA 1DYGA 3HUKA 1L49A 257LA 2A4TA 1L27A 1L69A 1L45A 4LDOA 1OWZA 1D2WA 2B6WA 191LA 1CV3A 1CV5A 170LA 1CU5A 1L05A 1CUQA 1L19A 2F32A 187LA 1OV7A 185LA 2OEAX 4EPFA 1L10A 1G06A 1P36A 4EKQA 4I7TA 3HTFA 3SB8A 3DN0A 1L73A 156LA 1P5CA 2RH1A 1C6GA 180LA 4I7JA 112LA 3DNAA 1P56A 1ZYTA 237LA 1P2LA 226LA 3DN3A 127LA 1C6LA 3C83A 214LA 2B7XA 206LA 210LA 1JTNA 3SB6A 1C6PA 4IAPA 183LA 3HH4A 1CV6A 4K5YA 2RBOA 1G0LA 1XJUA 3HTDA 161LA 1L13A 1L03A 1P7SA 110LA 4EPIA 103LA 1C6CA 3K2RA 4W52A 1L36A 3HDEA 2B70A 1QSQA 3DMVA 3C82A 1QTDA 3QAKA 4ARLA 1LYEA 1CU0A 1P6YA 108LA 1LLHA 1OVJA 4I7PA 4ARQB 1L20A 1QT6A 181LA 3V2YA 3C81A 1L37A 225LA 1OYUA 2OU9A 230LA 3DN4A 150LA 186LA 1QUGA 1L93A 1L80A 1ZURA 3HUAA 1L96A 1L91A 1QUOA 1SSWA 3CDRA 142LA 219LA 1OWYA 1G0KA 2O7AA 3NY8A 1JQUA 1LYJA 1L16A 1DYBA 198LA 3OE9A 3SB7A 118LA 164LA 4EXMA 1L81A 2RB0X 1CU3A 1JTMA 4I7NA 1T8FA 111LA 189LA 149LA 114LA 1L65A 253LA 4W57A 1OV5A 3HU9A 1LWKA 2F2QA 3DN1A 1LI3A 1LYGA 2B74A 4ARJA 3RZEA 125LA 1DYFA 2HUMA 3UONA 1L06A 3SBBC 1PQMA 3HDFA 1C6EA 1KS3A 158LA 2L78A 4I7KA 131LA 2RAYX 4LDLA 3G3VA 140LA 200LA 1L64A 3V2WA 1KW5A 176LA 1L70A 171LA 1L32A 4EKPA 1OVKA 1L46A 1L34A 1C69A 1CUPA 218LA 1C61A 3RUNA 1SSYA 1C6DA 1KNIA 246LA 2OU8A 1L29A 1SX7A 259LA 4YX7C 2QARC 169LA 128LA 2HUKA 4I7SA 6LZMA 4GBRB 228LA 1D3JA 1CV0A 1QTCA 2B6XA 3GUKA 1KW7A 163LA 2RBPA 3HTBA 3GULA 148LE 3C8QA 4I7RA 3SBAA 212LA 3C8RA 3C80A 1L97A 1T8GA 3C7YA 165LA 1C68A 3GUIA 1TLAA 1DYDA 3SN6R 1L25A 172LA 168LA 3SB5A 1CV4A 1QS9A 4DAJA 2LC9A 221LA 1LI2A 216LA 3NY9A 1L08A 3HT6A 143LA 4W51A 1L22A 1LPYA 1G0GA 2NTGA 3HT9A 1G0JA 2OU0X 1L67A 1L60A 1LYHA 1C6FA 4W54A 3GUMA 2B6YA 1L99A 1P2RA 4ARMA 1L88A 4EKSA 1WTHA 4EKRA 4PJZA 2IGCA 1L00A 3VW7A 245LA 107LA 215LA 1LGUA 2F47A 4I7QA 1L42A 1L44A 2CUUA 3DMZA 1C66A 1L40A 190LA 1L23A 1L68A 1QT7A 1C63A 1L89A 2OE7X 4W56A 3OE0A 7LZMA 260LA 2RAZX 1C6AA 1C62A 1L87A 1L47A 192LA 1L48A 2B6ZA 4EJ4A 1XEPA 123LA 1L51A 262LA 2NTHA 3HH3A 3FADA 113LA 1G1WA 213LA 1LI6A 1QT8A 232LA 1L41A 4DJHA 1CVKA 1SWYA 1QT4A 4GRVA 3OE8A 2QB0B 1C6NA 1C6KA 1L38A 1L90A 4DKLA 3C8SA 1DYCA 145LA 1C67A 3DMXA 1CU2A 3ODUA 157LA 2LZMA 1C60A 1G1VA 1L84A 2OE9X 1L35A 252LA 1C6IA 1C6TA 241LA 146LA 166LA 1L57A 1L92A 1L26A 1DYEA 1L50A 1OVHA 1L04A 173LA 1L39A 1L95A 4W59A 3C7ZA 2Q9DA 231LA 1LGWA 3GUPA 1LYFA 1PQKA 4ARPA 175LA 4PK0A 1L53A 250LA 3GUOA 3FA0A 1K28A 2RBNA 1L01A 236LA 3PBLA 1QT5A 1CU6A 115LA 141LA 1L86A 3DN8A 1P64A 2B73A 2OTYX 4LDEA 1QTZA 151LA 4OO9A 2B6TA 195LA 5LZMA 1L30A 2OE4X 3PDSA 1L02A 1CTWA 3NYAA 1L15A 3DKEX 2ANXA 3JR6A 2Q9EA 224LA 4S0WA 4ARQA 3L64A 4I7OA 3G3WA 2RB2X 1QTBA 1G07A 174LA 1DYAA 1L43A 2RBRA 3HTGA 201LA 188LA 1QT3A 120LA 4W53A 1L58A 102LA 1L55A 1L76A 1D3MA 160LA 1EPYA 258LA 1L74A 137LA 3HT7A 1NHBA 1L33A 2HULA 1KY0A 1G0PA 254LA 1LGXA 2O4WA 1P46A 247LA 1D3FA 1L72A 248LA 2ANVA 129LA 3C7WA 1SWZA 4YXAC 4W58A 3OE6A 1L94A 3SB9A 209LA 3HH5A 211LA 182LA 1L98A 2LCBA 1C64A 1L62A 1T97A 229LA 238LA 2B72A 130LA 1L12A 3HU8A 197LA 1C6HA 233LA 1L75A 3CDQA 1L61A 1L21A 1LYDA 1C6JA 1QTVA 1T8AA 3CDVA 227LA 1L14A 1QS5A 119LA 1LYIA 1SX2A 1L56A 5I14A 1CX7A 1KY1A 1L85A 1B6IA 139LA 1L24A 1L79A 223LA 1L71A 109LA 2OTZX 3G3XA 126LA 4I7LA 3HT8A 1L0JA 144LA 2RB1X 1QUDA 3GUNA 3HWLA 1L63A 1XJTA 1T6HA 1CV1A 1L18A 1LW9A 138LA 1G0MA 1QUHA 3F8VA 256LA 4LZMA 239LA 1P3NA 243LA 1L66A 4I7MA 4E97A 104LA 184LA 1L07A 1L17A 1CX6A 1QTHA 199LA 1P37A 3D4SA 162LA 251LA 1L11A 1PQDA 1C6BA 1L09A 4ZPUA 1L77A 1L28A 3CDTA 1G0QA 1L52A 1PQIA 1PQOA 3HH6A 1PQJA 147LA 4AQNA 167LA 1L31A 1D9WA 1L54A 196LA 1D3NA 3DN6A 1L59A 222LA 235LA 3DN2A 3CDOA 1L0KA 242LA 178LA 159LA 3HUQA 4ARMB 4W55A 1QSBA 3FI5A 4YXCA 3GUJA 1L82A 244LA 249LA 122LA 1C6QA 152LA 2Z6BA 1ZWNA 3F9LA 3L2XA 177LA 1C6MA 255LA 2RBSA 3LZMA 261LA 2O79A 1C65A 240LA 205LA 155LA 1L83A 234LA 1D2YA 217LA 2B75A 3EMLA 2RBQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1I6SA 2XBRA 1OUJA 257LA 1GFJA 2BQJA 4LDOA 4H94A 1JISA 1CV3A 1CV5A 1HFYA 1DKJA 1HEMA 1HENA 1L19A 4TX7A 187LA 4CGEA 2CWIA 1GB5A 1DI3A 4EKQA 4YEOA 1NHEA 1VDQA 5J7CA 4XJGA 1IP1A 1P5CA 1IP2A 5KXSA 2RH1A 5DM9A 2MEGA 127LA 1IO5A 4NGJA 5IHGA 3CT0A 4GCCA 1LSPA 1IOTA 4LT0A 3SB6A 2F2NA 1G0LA 3HTDA 161LA 1L13A 110LA 4L41A 3ZVQB 3QAKA 2XJWA 2XBSA 1WTMA 3G3BB 4ARQB 1QT6A 5T3FA 1MLCE 3TXFA 1L37A 3MGWA 150LA 2BQBA 5A3ZA 1JEFA 1VDPA 5B07A 2LYMA 1JHLA 4WLXA 1RJCB 3CDRA 4GCDA 1TDYA 3WXTA 1GAZA 3TMUA 1WQRA 4B4EA 1LSDA 4IATA 1JQUA 1INUA 1XSFA 1LJGA 3SB7A 1B5UA 1LHKA 1YKYX 189LA 3VWOA 2ZIJA 4BS7A 1LYSA 253LA 3AGGG 3HU9A 2FYCA 1LI3A 4NSJA 1LJKA 2HUMA 1L06A 1GF5A 4H91A 1GE0A 1KS3A 1JJ0A 1YL1X 3AGIA 1LKRA 200LA 4NEBA 4GN5C 1KW5A 176LA 1IY3A 1O23A 171LA 4NGWA 1LZ4A 4MR1A 4EKPA 1XGQC 1C45A 5KJ9A 1C69A 218LA 1C6DA 246LA 1SX7A 1G7JC 2QARC 4GBRB 1UCOA 1D3JA 2B6XA 4DQJA 2BPUA 1OUBA 1FLUA 5LA5A 148LE 3SBAA 5LINA 1DI5A 2LYZA 3C8RA 3C7YA 1IWXA 1B5ZA 168LA 1CV4A 216LA 3NY9A 1L08A 5KXLA 1L22A 1G0GA 4U3XB 2OU0X 4PGJB 1LZCA 1ZVYB 1EQEA 1LYHA 3AZ5A 4ARMA 1L88A 4XN6A 1FDLY 2Z2EA 1L00A 4XYYA 1LGUA 3TXGA 1GF0A 1L44A 4DD9A 4H9FA 1B2KA 2YBHA 190LA 2DQDY 1L89A 2OE7X 1HFXA 3OE0A 3G3AB 5HNLA 1YILA 2RAZX 5FEKA 1C62A 1L87A 4TSCA 3HBDA 5KXOA 4OWHA 4AXTA 4GCFA 113LA 2BQLA 5I5QA 1LZ6A 1MELL 5L3HA 4DJHA 1BVKC 4ET9A 4NHSA 2QB0B 1GB0A 1EQ5A 3C8SA 1JKBA 3A67Y 1C67A 1UIAA 4PPOA 3WU9A 1XEKA 3ODUA 4DD2A 2LZMA 1D6PA 1C6IA 1WTNA 3WU7A 4GLVA 1GB8A 5F16A 3QE8A 1L39A 1DZBX 231LA 1LYFA 1GF7A 4PK0A 3FA0A 4Z3MA 2RBNA 1GF4A 1DQJC 4NGYA 3D3DA 1ZVHL 1LHIA 1QTZA 151LA 4OO9A 4TWSA 1L02A 1W6ZA 4OOTA 2ANXA 4LYZA 1GF8A 2MEHA 224LA 4I7OA 5LYZA 5B1GA 8LYZA 7LYZA 1LZRA 3P64A 4G4CA 5HMJA 120LA 4W53A 102LA 4WM4A 4J1BA 2DQCY 4PHIA 5LVIA 3HT7A 5KXXA 1QSAA 1JPOA 254LA 1LMNA 1YANA 247LA 4B4JA 1GF6A 1UUZC 1CKDA 4ETDA 1HEQA 1YAQA 1GFRA 1HEPA 5FSTA 2LCBA 1L62A 1T97A 2B72A 2BQIA 130LA 4OWAA 1LPIA 3P65A 1L21A 1LYDA 2HU1A 1T8AA 1XGUC 1IWVA 4WG7A 119LA 1LYIA 1JJ1A 1L56A 1KY1A 223LA 1OUEA 126LA 1JITA 2RB1X 3GUNA 1LMAA 1LMQA 4XJHA 3W6BA 4CFPA 1C08C 4NHQA 1D6QA 1L66A 1UIDA 4I7MA 1A4VA 1L17A 1VDSA 3WVYA 2XTHA 1GAYA 1HF4A 1QDRA 162LA 1C6BA 1L09A 3LYZA 1LZ9A 1VAUA 2BQCA 1G0QA 4WLTA 1L52A 4D9ZA 1HC0A 3ZEKA 3HH6A 1LZYA 1PQJA 147LA 3TXIA 4HJYA 4CHXA 4XADA 3DN6A 222LA 3T36A 4CFOA 4H9AA 3WMKA 1GD6A 4XJDA 4HV1A 159LA 2ZIKA 4W55A 1YAMA 3GUJA 1L82A 4B0DA 249LA 1KXXA 4DD0A 1C6QA 1GFGA 2HEDA 1C6MA 3CSRA 1F0WA 5APDA 2RBSA 3EO5A 3QY4A 4NGIA 5HNCA 1HSWA 155LA 2H5ZA 3EMLA 2BQMA 220LA 1HEOA 1L49A 132LA 1G7HC 5B59A 1L45A 1YAPA 3TXBA 2Q0MX 2YBIA 2I26L 1BWIA 1L05A 185LA 5EBHA 4ETBA 2OEAX 1BGIA 2YSSC 1J1XY 4I7TA 1LKSA 1LZAA 4H9HA 2DQFC 5AMYA 1C6GA 180LA 4DDCA 1LHLA 1LZEA 3DNAA 1I1ZA 3C83A 2BLYA 3WL2A 206LA 210LA 1JTNA 3CSZA 4H8XA 5LA8A 4IAPA 2I6ZA 1CV6A 1NMMA 1XJUA 1GFVA 5F9UA 1L03A 2BQDA 135LA 4WOAA 4WLYA 4AGAA 1QTDA 1CU0A 108LA 1CJ6A 4OW1A 1FLWA 1L20A 4GN3A 3ATOA 3C81A 4WLDA 2WARA 2OU9A 2FBDA 2X0AA 1QSWA 1QDTA 186LA 1QUGA 3HUAA 2MEAA 1LSYA 1UICA 4RDSA 1JSEA 2O7AA 1GF9A 3A3RX 1LYJA 4GLAA 5F81A 1NBZC 4YENA 198LA 118LA 4EXMA 1RFPA 1L81A 4I7NA 111LA 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1NF5A 1SLYA 1KXWA 3NYAA 1L15A 2Q9EA 4C3WA 5F9XA 3ULRA 1LJNA 2IHLA 3G3WA 1QTBA 1L43A 2MECA 2RBRA 201LA 4WL6A 2YVBA 1G7IC 1GEVA 2HEAA 1L76A 1TAYA 1JTTL 4HPEA 2EPEA 4WG1A 4KXIA 1FKQA 1EPYA 258LA 1OUIA 1L74A 3M3UA 1L33A 5E9RA 2HULA 1AT5A 1KY0A 5FELA 1P46A 4GCEA 2ANVA 3C7WA 1SWZA 5D5CA 1GB6A 1YKXX 3OE6A 4LYCA 1L94A 1I20A 1BQLY 3J6KA 2BQNA 4R6CA 3HH5A 211LA 3P4ZA 182LA 4NSHA 3AYQA 1C64A 1C7PA 1L12A 233LA 3RT5X 1L75A 1TEWA 3CDQA 3CDVA 1D0LA 1LZSA 1NWGA 4OWBA 4H92A 3E3DA 1L71A 5LYTA 5LAFA 2DQIY 2OTZX 3G3XA 4XJIA 1LSAA 1QUDA 1XJTA 1LSCA 138LA 2FBBA 3F8VA 4QY9A 1P3NA 3WU8A 1LHMA 1GE4A 2HU3A 1CX6A 2C8PA 3D4SA 1E8LA 1C46A 251LA 1L11A 2RSCA 4G4BA 4NHPA 1L28A 5C6JA 3CDTA 1PQIA 1GXV2 3HBHA 4AQNA 4YF2A 1IY4A 1NDGC 1D9WA 1XGPC 5L3IA 196LA 235LA 2BQAA 1UIGA 3DN2A 3CDOA 242LA 1IP5A 3WYHA 4ARMB 1LSNA 4N1EI 3B72A 1XEIA 1GE2A 5ILFA 4MSTA 2H9JA 152LA 3F9LA 5KKJA 3L2XA 2I25L 1IOCA 1WVUA 2FYDA 177LA 1B7NA 4KPMA 1LHHA 261LA 1BVXA 1C65A 5KXPA 3A8ZA 217LA 2RBQA 4N9RA 4NWEA 1V7SA 3HUKA 1BWHA 1F10A 2A4TA 4DDAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1I6S A;  2XBR A;  1OUJ A;  257L A;  1GFJ A;  2BQJ A;  4LDO A;  4H94 A;  1JIS A;  1CV3 A;  1CV5 A;  1HFY A;  1DKJ A;  1HEM A;  1HEN A;  1L19 A;  4TX7 A;  187L A;  4CGE A;  2CWI A;  1GB5 A;  1DI3 A;  4EKQ A;  4YEO A;  1NHE A;  1VDQ A;  5J7C A;  4XJG A;  1IP1 A;  1P5C A;  1IP2 A;  5KXS A;  2RH1 A;  5DM9 A;  2MEG A;  127L A;  1IO5 A;  4NGJ A;  5IHG A;  3CT0 A;  4GCC A;  1LSP A;  1IOT A;  4LT0 A;  3SB6 A;  2F2N A;  1G0L A;  3HTD A;  161L A;  1L13 A;  110L A;  4L41 A;  3ZVQ B;  3QAK A;  2XJW A;  2XBS A;  1WTM A;  3G3B B;  4ARQ B;  1QT6 A;  5T3F A;  1MLC E;  3TXF A;  1L37 A;  3MGW A;  150L A;  2BQB A;  5A3Z A;  1JEF A;  1VDP A;  5B07 A;  2LYM A;  1JHL A;  4WLX A;  1RJC B;  3CDR A;  4GCD A;  1TDY A;  3WXT A;  1GAZ A;  3TMU A;  1WQR A;  4B4E A;  1LSD A;  4IAT A;  1JQU A;  1INU A;  1XSF A;  1LJG A;  3SB7 A;  1B5U A;  1LHK A;  1YKY X;  189L A;  3VWO A;  2ZIJ A;  4BS7 A;  1LYS A;  253L A;  3AGG G;  3HU9 A;  2FYC A;  1LI3 A;  4NSJ A;  1LJK A;  2HUM A;  1L06 A;  1GF5 A;  4H91 A;  1GE0 A;  1KS3 A;  1JJ0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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