167LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNCFEMLRCDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 167lA00
245LA 1SSYA 144LA 3DN8A 195LA 1L13A 119LA 1L43A 162LA 4GBRB 1PQIA 2OU0X 182LA 1C6IA 1L54A 4I7MA 226LA 213LA 260LA 205LA 4DKLA 235LA 1L56A 1OV7A 1L59A 2F2QA 2RB2X 113LA 166LA 1L11A 1L39A 2A4TA 2RH1A 3V2WA 219LA 236LA 4PJZA 126LA 3FADA 1KY0A 3CDVA 1DYDA 1JTMA 1C6EA 3HT9A 180LA 176LA 1P7SA 1TLAA 186LA 159LA 1LGWA 145LA 1SX7A 200LA 3GUKA 2ANVA 115LA 1L14A 1PQJA 160LA 3SBAA 1NHBA 1I6SA 1C66A 2OU9A 4ZPUA 1LI3A 1K28A 127LA 7LZMA 3CDTA 1L08A 1CV0A 1DYBA 1T8AA 2Q9DA 1LYIA 156LA 4OO9A 3DKEX 1CU5A 1L48A 2B6WA 1D3MA 2RBOA 1C6DA 1G0MA 2CUUA 3PDSA 2LZMA 141LA 1LYGA 3C8SA 1QT4A 3F9LA 1LGXA 1CV1A 4LDLA 1OYUA 1QTBA 1LYFA 3C7ZA 1CV5A 1DYAA 1SX2A 1C6HA 1L17A 1L05A 3C7WA 3HH6A 3NYAA 3DN0A 1XJUA 1LWKA 2OEAX 1L69A 249LA 214LA 3OE9A 4I7KA 4PK0A 3GUIA 2RB0X 4I7TA 1L95A 3DNAA 4I7RA 1QUOA 1C6BA 1LW9A 108LA 1L20A 142LA 3HDEA 112LA 1L93A 169LA 3NY8A 1G06A 3DMVA 1CU2A 4EPIA 198LA 147LA 1L71A 4EKQA 4W55A 3HTGA 1L89A 1CTWA 4ARMA 1L97A 3LZMA 4K5YA 3GUNA 3CDRA 1L03A 1L06A 3C7YA 118LA 1L36A 1G0QA 151LA 3SN6R 259LA 122LA 1QT8A 178LA 1PQMA 3DN2A 250LA 1G1VA 1L0JA 2B7XA 1CX7A 2OTYX 1L32A 3C80A 215LA 155LA 4E97A 125LA 1P6YA 102LA 4ARLA 3G3WA 1QSQA 3C83A 3DN3A 1D9WA 1L25A 4LZMA 4AQNA 1L84A 242LA 3GUJA 128LA 1L61A 3SB6A 3SBBC 146LA 165LA 4W51A 1G1WA 1T6HA 1LYEA 1L38A 148LE 164LA 2RB1X 1L29A 1C6GA 1QTDA 1B6IA 3UONA 2OE9X 1C6QA 1CX6A 227LA 1OVKA 1L51A 1CUPA 2B6YA 1CUQA 1KY1A 107LA 3HT6A 3FA0A 217LA 1L70A 114LA 4EKPA 1LPYA 1DYFA 229LA 143LA 247LA 1P64A 262LA 4IAPA 2RBPA 1QTVA 2NTHA 3F8VA 223LA 3HH3A 138LA 248LA 225LA 2B70A 3C82A 2RBRA 1L46A 3HDFA 3DMZA 3OE0A 3HTDA 1LGUA 241LA 4I7SA 4W54A 1L62A 1L94A 216LA 1SWYA 189LA 130LA 2B72A 1L87A 4I7LA 1JQUA 1C69A 3PBLA 1L00A 1D3JA 172LA 4W57A 1L77A 1L79A 1OWYA 1EPYA 3FI5A 1QS5A 149LA 1C6JA 4I7OA 3EMLA 196LA 2B6XA 1QT5A 1L88A 2O79A 158LA 3D4SA 1L96A 1T97A 1QUHA 1L75A 1T8GA 2OU8A 220LA 4W53A 3HH4A 2O4WA 252LA 1L45A 199LA 1C6TA 1L09A 3G3XA 4I7JA 1CV6A 1L23A 3HUAA 1LYHA 109LA 1G0GA 3HU9A 1L16A 1L57A 3OE6A 1L66A 4LDEA 1C6KA 1L02A 1L67A 1CU6A 1L15A 1OVHA 4EKSA 1L10A 1C6FA 4DJHA 1P3NA 1C64A 1C65A 137LA 1C68A 1L65A 1G0KA 4EXMA 261LA 2NTGA 1QTZA 1L26A 3DN6A 3GULA 6LZMA 1C6AA 103LA 1CVKA 2OE7X 3DN4A 4YXAC 1PQOA 4DAJA 163LA 4YX7C 231LA 1QUDA 1T8FA 1ZWNA 3GUPA 1L33A 2LC9A 2B75A 1P37A 1L85A 1LI6A 191LA 1G07A 1JTNA 1PQDA 1L72A 1D3NA 1OVJA 1L21A 2RBSA 1SWZA 3HT8A 190LA 209LA 1L04A 2LCBA 1C62A 185LA 224LA 4ARJA 1QUGA 3HU8A 1L98A 3OE8A 257LA 3JR6A 1C61A 246LA 1C6CA 2IGCA 1L82A 1C60A 1LLHA 1L44A 3C8RA 1L86A 152LA 1CU0A 210LA 3CDOA 4ARPA 1DYEA 1L34A 1QSBA 150LA 2Q9EA 2RAZX 1C63A 4EPFA 1L90A 3V2YA 1QT7A 1L01A 3QAKA 1CU3A 1L41A 1ZURA 1L92A 3HH5A 1L07A 3L64A 1L52A 3CDQA 2HUMA 2F47A 234LA 3HTBA 1OV5A 123LA 2HUKA 1G0LA 232LA 2QB0B 4W56A 4YXCA 1CV4A 174LA 1L22A 1L60A 4EJ4A 157LA 243LA 206LA 4LDOA 1L64A 2OTZX 1L49A 258LA 239LA 1L80A 1L73A 1L50A 1L19A 3RZEA 253LA 1L53A 3GUOA 1D2WA 181LA 1C6NA 1KW7A 3NY9A 197LA 129LA 187LA 1P2LA 1P56A 1D3FA 2RBQA 161LA 5LZMA 1C6LA 1LWGA 1XEPA 4EKRA 1P36A 1L68A 4W59A 2O7AA 131LA 3K2RA 4W58A 1L58A 170LA 139LA 192LA 3HWLA 1L12A 4ARQB 5I14A 1L63A 1L31A 244LA 3HT7A 237LA 1C6MA 1L18A 1QTCA 3SB9A 233LA 1LI2A 1L24A 1SSWA 1L55A 4I7QA 1L28A 1QS9A 1L81A 1L30A 1P2RA 4I7PA 228LA 1L40A 4ARQA 177LA 1CV3A 256LA 1L99A 3G3VA 3HUKA 1L27A 168LA 110LA 1DYGA 221LA 2B74A 4GRVA 1C6PA 2B73A 2RAYX 1C67A 230LA 1L76A 1ZYTA 3SB5A 1XJTA 4I7NA 183LA 1LYDA 3SB8A 1LYJA 3VW7A 212LA 1KS3A 1P5CA 2Z6BA 1L37A 2L78A 3GUMA 3DMXA 4ARMB 175LA 255LA 3L2XA 1L42A 2QARC 201LA 2F32A 188LA 1WTHA 4S0WA 1QT6A 1L74A 3HTFA 1L35A 1L83A 2B6ZA 238LA 3HUQA 222LA 2HULA 1D2YA 240LA 171LA 211LA 1KW5A 3RUNA 173LA 1KNIA 1QTHA 111LA 167LA 140LA 2RBNA 1L47A 3DN1A 120LA 1P46A 254LA 184LA 2ANXA 3C8QA 1G0PA 1L0KA 1PQKA 4W52A 3SB7A 104LA 1QT3A 3ODUA 1DYCA 1OWZA 3C81A 251LA 1G0JA 2OE4X 1L91A 2B6TA 218LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IIZA 1SSYA 1D6PA 4AXTA 195LA 1L13A 119LA 1L43A 3TXFA 1PQIA 2DBTA 3CSZA 5FHWA 4I7MA 3WU8A 4OWBA 260LA 1WVUA 4DKLA 235LA 3A67Y 1UCOA 1OV7A 5KXYA 2A4TA 4FJRA 4H9CA 4WM6A 5F9XA 1KY0A 1JTMA 1FLWA 3HT9A 180LA 1KXYA 4HJVA 1P7SA 1TLAA 1CJ9A 1IO5A 4TSBA 115LA 1L14A 4J0LA 3SBAA 4OWAA 1NHBA 2OU9A 4ZPUA 1LI3A 127LA 3TMUA 4NHTA 7LZMA 1HNLA 1L08A 1CV0A 1T8AA 1GB3A 1J1OY 153LA 1B7MA 4J1AA 3P68A 1LJIA 2B6WA 1PZYA 1GF9A 1D3MA 3A6BY 1ZMYL 1GBWA 5KXTA 1QT4A 3F9LA 1B0DA 4LDLA 1QTBA 1LYFA 1DQJC 2Q0MX 1B7OA 1L05A 3C7WA 1J1PY 3NYAA 1B5VA 5AMYA 1GHLA 1LWKA 1FKVA 3AZ5A 1IY3A 1QDTA 4J7VA 1GFRA 1KIQC 3DNAA 4RLNA 1LHHA 1GF8A 108LA 4DDCA 4LT1A 112LA 1SQ2L 1G06A 3TXGA 4X3BA 1GXV2 4ARMA 3GUNA 2YBJA 1IORA 3J6KA 118LA 1G0QA 151LA 259LA 1QT8A 1PQMA 1L0JA 2EIZC 4H9FA 1CX7A 4DYGA 1IC7Y 1LMNA 1QSQA 3C83A 4AQNA 5DM9A 2BQLA 242LA 4DDAA 146LA 165LA 1LKRA 1UIAA 1GE0A 3CQLA 4GN5C 1B6IA 1GB5A 4ETAA 1C6QA 1L51A 1KY1A 107LA 3HT6A 4DD1A 1XEIA 4EKPA 229LA 262LA 1YIKA 5B07A 1LJFA 1UIDA 2NTHA 1T6VL 1QDRA 3F8VA 1LYYA 3EO5A 1L46A 2FBBA 1LGUA 1LZSA 4I7SA 4W54A 4NGJA 1SWYA 130LA 1L87A 1JQUA 1B5XA 1C69A 3PBLA 1L77A 4H8XA 4H9AA 1L88A 3CSQA 5ILFA 1L96A 1QUHA 1L75A 2OU8A 5LYZA 4WM2A 1WTNA 3EBAB 5APFA 5IELA 220LA 3N9AA 4W53A 3HH4A 1JITA 2O4WA 4PRQA 1HHLA 2F4AA 1C6TA 1L23A 3HUAA 3OE6A 4LDEA 1L66A 1OVHA 1L10A 4HTNA 4DJHA 2YDGA 2F30A 4NGZA 3B72A 1QTZA 3A94A 3M18B 4H8YA 4PJ2C 4U3XB 2I25L 4R6CA 1L26A 3DN6A 3DN4A 2I26L 4YXAC 163LA 1HFZA 5LINA 1HFXA 1DPXA 1DKJA 191LA 1UBZA 3TMVA 3QY4A 4GLVA 1GBXA 4NHQA 3WPKA 1JJ1A 4H9IA 1LOZA 1GFEA 209LA 5KKJA 5LVIA 5K7OA 2LCBA 1RI8B 2D4JA 1C62A 1HEWA 4ARJA 1QUGA 3HU8A 1L98A 257LA 5HMVA 1C60A 4DWXA 1L44A 1L86A 3SP3A 2A7DA 4ZIXA 2DKVA 2RAZX 4WLXA 1CNSA 2AUBA 3B0IA 1YKXX 1LPIA 1CU3A 1L92A 1L07A 3L64A 1L52A 1LZCA 3CDQA 5FDJA 2Z38A 1LZNA 2A7FA 2G4QA 3CB7A 1LZAA 1C10A 1IP4A 3GXKA 3P66A 1LJ3A 4W56A 174LA 4UWNA 4LDOA 1EQ5A 1FLQA 1H6MA 5A3EA 258LA 4XJGA 3HBHA 1UIHA 5JENB 5I53A 3W6EA 1F6RA 181LA 4H93A 5APEA 2HUBA 4NG1A 134LA 4OWHA 1KXXA 2YBLA 161LA 5LZMA 2DQCY 1C6LA 3W3EA 4EKRA 1BB4A 2N5ZA 3TXDA 1B7LA 1FLUA 2XBSA 170LA 1L12A 2W1YA 2D91A 4RDSA 4ARQB 1CKDA 1L63A 1IWWA 3HT7A 2HTXA 1QTCA 4TX7A 3IJUA 1D6QA 1AZFA 3WPLA 1LHKA 1CV3A 256LA 1B7SA 207LA 168LA 110LA 1EQEA 221LA 2YSSC 1DI3A 1QUTA 1C67A 3CT1A 2CJLA 2LYMA 1AM7A 1DZBX 1DPWA 212LA 3VW7A 1P5CA 2W1LA 1FBIX 2Z6BA 4XYYA 1LYZA 3AGGG 5LVJA 3DMXA 5C6IA 4ARMB 175LA 5ILCA 1LZDA 4H9EA 1C7PA 3AJNA 1BWJA 1B7NA 2F32A 4IJ4A 1E8LA 1LMCA 1JISA 2YBHA 3TXEA 4Z98A 1DI5A 3CT0A 2LHMA 2HEDA 1GBYA 211LA 4Z46A 5E4PA 173LA 1LZ8A 2ZQ3A 5F81A 2RBNA 1LSEA 3K3TA 5T3FA 254LA 4FDYA 2G4PA 3C8QA 5FELA 4W52A 3SB7A 104LA 1QTEA 1DYCA 5B1FA 3C81A 1G0JA 3D9AC 144LA 1G7MC 1GFGA 162LA 3G3BB 2OU0X 182LA 4ETDA 5LVKA 1LSFA 213LA 226LA 1LSCA 1H87A 1B9OA 4WG7A 1IP3A 3HFMY 1L39A 1YILA 2RH1A 1BWHA 4NIJA 4PJZA 1OUGA 1GDWA 4H90A 3FADA 1DYDA 4NGOA 2I6ZA 3B6LA 159LA 6LYZA 1LGWA 3ZEKA 2MEHA 1HERA 1GFVA 3A3QA 1QIOA 1GB7A 1C66A 3AGIA 3CDTA 1JHLA 3ULRA 3A91A 2NWDX 2XBRA 4LT0A 1JTOL 4ML7A 156LA 1NWGA 1V7TA 3DKEX 1CU5A 1G7JC 3AGHA 2RBOA 2CUUA 3PDSA 5HLLA 141LA 1LYGA 1OUHA 3C8SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IIZ A;  1SSY A;  1D6P A;  4AXT A;  195L A;  1L13 A;  119L A;  1L43 A;  3TXF A;  1PQI A;  2DBT A;  3CSZ A;  5FHW A;  4I7M A;  3WU8 A;  4OWB A;  260L A;  1WVU A;  4DKL A;  235L A;  3A67 Y;  1UCO A;  1OV7 A;  5KXY A;  2A4T A;  4FJR A;  4H9C A;  4WM6 A;  5F9X A;  1KY0 A;  1JTM A;  1FLW A;  3HT9 A;  180L A;  1KXY A;  4HJV A;  1P7S A;  1TLA A;  1CJ9 A;  1IO5 A;  4TSB A;  115L A;  1L14 A;  4J0L A;  3SBA A;  4OWA A;  1NHB A;  2OU9 A;  4ZPU A;  1LI3 A;  127L A;  3TMU A;  4NHT A;  7LZM A;  1HNL A;  1L08 A;  1CV0 A;  1T8A A;  1GB3 A;  1J1O Y;  153L A;  1B7M A;  4J1A A;  3P68 A;  1LJI A;  2B6W A;  1PZY A;  1GF9 A;  1D3M A;  3A6B Y;  1ZMY L;  1GBW A;  5KXT A;  1QT4 A;  3F9L A;  1B0D A;  4LDL A;  1QTB A;  1LYF A;  1DQJ C;  2Q0M X;  1B7O A;  1L05 A;  3C7W A;  1J1P Y;  3NYA A;  1B5V A;  5AMY A;  1GHL A;  1LWK A;  1FKV A;  3AZ5 A;  1IY3 A;  1QDT A;  4J7V A;  1GFR A;  1KIQ C;  3DNA A;  4RLN A;  1LHH A;  1GF8 A;  108L A;  4DDC A;  4LT1 A;  112L A;  1SQ2 L;  1G06 A;  3TXG A;  4X3B A;  1GXV 2;  4ARM A;  3GUN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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