167LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNCFEMLRCDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 167lA00
4I7PA 4W54A 103LA 172LA 1L41A 1L16A 4YX7C 1SWYA 3PBLA 112LA 3GULA 3SBBC 1C6LA 1KW7A 1CU3A 260LA 1L93A 1QT3A 113LA 4W57A 1L21A 238LA 2IGCA 3C81A 1L98A 1L80A 4YXAC 4AQNA 1C6GA 3HH4A 159LA 3OE6A 1OVKA 1G0LA 1C66A 170LA 1L61A 1L97A 181LA 195LA 3HH3A 3RUNA 3HTBA 1LYHA 1C6HA 1L84A 251LA 1C69A 4LDEA 1L18A 1SX2A 1SSYA 178LA 4I7MA 115LA 3DN2A 1L39A 2LCBA 1PQIA 1OWYA 2RBSA 1G0QA 247LA 1L76A 1LI2A 1LW9A 242LA 226LA 189LA 1T8AA 1LYEA 1LYIA 1L13A 1QTZA 177LA 1L53A 156LA 107LA 1B6IA 2OTZX 1L29A 1L85A 2Q9DA 1I6SA 1L90A 1JTNA 2NTGA 3C83A 1C6CA 1G0KA 1L54A 3DN3A 1DYGA 1D2WA 236LA 131LA 137LA 4E97A 1L01A 3DN8A 6LZMA 1L0JA 1L57A 167LA 1L14A 1P46A 2QARC 3HUQA 152LA 4W55A 126LA 1L27A 1CU2A 3HTFA 168LA 1SSWA 1DYCA 1L37A 111LA 118LA 1C6EA 1QT5A 1C6IA 1L71A 4DKLA 1CV6A 3SB9A 1L63A 4IAPA 1QUDA 175LA 2OTYX 1LLHA 2B70A 1L12A 2O7AA 3C7YA 1D2YA 3UONA 1L28A 3GUIA 120LA 3HH5A 2F2QA 3V2WA 3SBAA 4ARMB 1LYDA 169LA 224LA 2B73A 1QTBA 205LA 2RBOA 3CDRA 3SB6A 3GUJA 130LA 1G0PA 201LA 148LE 1P2RA 1CU5A 1ZWNA 243LA 3HTGA 192LA 1L95A 2RAZX 128LA 4ARQB 1L89A 1L62A 2B75A 2ANXA 160LA 220LA 1L43A 1SX7A 3GUKA 211LA 3G3XA 2OU8A 1L79A 1L10A 1C6MA 1CX6A 244LA 3NY8A 1LGUA 1QT6A 3HT8A 4ARMA 3K2RA 4GRVA 250LA 1KW5A 1L22A 4GBRB 4ARPA 3HH6A 1L32A 1OVHA 144LA 146LA 1QS9A 1L77A 1ZURA 3DN0A 217LA 2B6XA 4ARQA 1D3NA 229LA 2B7XA 1DYFA 1LYGA 5I14A 4LDLA 1C67A 1L17A 1XEPA 1DYBA 150LA 2NTHA 1K28A 1QT4A 259LA 234LA 119LA 239LA 1C61A 227LA 3FADA 3C80A 1C6BA 1L66A 1T8FA 2RAYX 1D3JA 1P6YA 1L74A 3GUOA 1ZYTA 171LA 1L50A 1G0GA 255LA 3CDOA 1CUQA 1QSBA 231LA 3HT6A 4ZPUA 1KS3A 4EKSA 122LA 1LYFA 3ODUA 241LA 3FI5A 3L2XA 2O79A 4LDOA 1L33A 1L75A 2B74A 3SB7A 1L81A 1P36A 1L60A 1L34A 1KNIA 1QT8A 157LA 3C7ZA 191LA 3SB5A 139LA 210LA 4S0WA 1QTDA 2ANVA 1L94A 1L20A 1L45A 3C8RA 2B72A 3EMLA 1L70A 200LA 246LA 1CV0A 1JTMA 1L02A 4DJHA 173LA 2RBQA 102LA 232LA 1LWKA 235LA 4YXCA 2OE9X 1L05A 212LA 216LA 185LA 1T8GA 1PQOA 3HU8A 145LA 228LA 4W53A 4EKRA 1L03A 4I7RA 1L73A 125LA 1QUGA 2HUMA 3DMXA 221LA 1L86A 4LZMA 183LA 206LA 3HT7A 127LA 1T6HA 2OEAX 3C8QA 2B6ZA 1EPYA 1L51A 3F8VA 1L38A 262LA 1LYJA 3D4SA 3C82A 1QSQA 1JQUA 1C6PA 4ARLA 1L00A 1PQJA 1P7SA 1T97A 1D3MA 3OE0A 3QAKA 199LA 1L06A 4I7LA 174LA 1G1WA 2RBPA 1QTVA 4EPFA 223LA 151LA 3GUPA 1DYDA 161LA 1L99A 1L36A 1LWGA 4EKPA 1C6AA 1QUHA 1L56A 222LA 1PQDA 261LA 256LA 1C65A 1P37A 1L48A 1L35A 2B6YA 3DMZA 1QS5A 1CUPA 1C6JA 3DN6A 4ARJA 143LA 4I7TA 4W56A 1L44A 123LA 2B6WA 230LA 2HUKA 209LA 1G0JA 3FA0A 3DN1A 1L91A 1C6FA 2F47A 3SN6R 1PQMA 1C6NA 4W59A 3G3WA 188LA 1D3FA 1L59A 3HWLA 142LA 2LZMA 3DMVA 110LA 1C68A 1L04A 233LA 1L31A 1PQKA 2RBNA 1OV7A 3DKEX 2OE7X 180LA 245LA 1OV5A 1CX7A 1C6QA 1CV3A 1LI6A 1L23A 164LA 1KY1A 198LA 218LA 3OE8A 1LI3A 4I7NA 2RB0X 1LPYA 1L68A 4I7QA 1L87A 1QTCA 196LA 3LZMA 4I7SA 3C8SA 1CV1A 1L09A 1G06A 1OYUA 4I7KA 3VW7A 3DN4A 1QUOA 3SB8A 1L88A 214LA 4W51A 1L58A 1DYEA 1L69A 138LA 1P3NA 2CUUA 155LA 1L0KA 213LA 3CDTA 3HUAA 3HT9A 1G1VA 4W58A 1OVJA 162LA 187LA 166LA 1P56A 114LA 4DAJA 1OWZA 3PDSA 2OE4X 4EPIA 3OE9A 1LGWA 237LA 248LA 149LA 1P64A 2O4WA 1XJTA 1DYAA 108LA 3CDQA 1D9WA 190LA 1CU6A 1L49A 1C62A 2Q9EA 1L25A 2QB0B 165LA 4W52A 141LA 1CV4A 4PK0A 1WTHA 3NY9A 2RB1X 182LA 1L83A 2OU0X 2L78A 129LA 1G0MA 1L52A 1L30A 254LA 1L07A 1L96A 1L92A 4PJZA 3RZEA 3GUNA 4I7JA 3L64A 1G07A 1L64A 4OO9A 1SWZA 3DNAA 3GUMA 1L55A 184LA 1C6KA 1C63A 1L42A 257LA 258LA 1L72A 2LC9A 3HDFA 1L82A 2HULA 3JR6A 1P2LA 2OU9A 1C6DA 1L24A 1C60A 1NHBA 240LA 2F32A 7LZMA 1L15A 219LA 3HDEA 225LA 1L67A 252LA 1KY0A 3HUKA 1L11A 3F9LA 2RH1A 2B6TA 3G3VA 3V2YA 1L08A 3HU9A 109LA 163LA 1QT7A 1QTHA 3HTDA 249LA 176LA 2A4TA 104LA 215LA 1CV5A 253LA 147LA 1LGXA 1CVKA 3NYAA 4I7OA 1CTWA 1P5CA 1CU0A 1L19A 1L26A 4EXMA 1L65A 1L47A 197LA 2Z6BA 1TLAA 140LA 186LA 2RBRA 2RB2X 1XJUA 1C64A 1L40A 158LA 4K5YA 1L46A 4EJ4A 3C7WA 5LZMA 4EKQA 3CDVA 1C6TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5K7OA 1JISA 1REXA 1XEKA 2LZ2A 3SBBC 1CU3A 1L93A 1GE1A 113LA 1IOSA 1IWTA 2FBBA 1L80A 4YXAC 3OE6A 2Z37A 3WPKA 1OVKA 4WO6A 1F6SA 1G0LA 1B5YA 1C66A 4HPEA 5KXXA 1HEPA 3WVXA 4TX7A 1L84A 2DQAA 1L18A 1SX2A 1SSYA 3HBHA 5KY1A 1XGQC 1L39A 2FYCA 1LZDA 2D4KA 3TXKA 1GBYA 1XGRC 1LW9A 1H87A 1LYEA 1UICA 2D4JA 2I26L 156LA 2G4PA 1E8LA 2OTZX 1NWGA 1JTNA 5DLAA 4NSHA 5I4WA 1L54A 1CKDA 1DYGA 4KXIA 236LA 1GB3A 4QGZA 4WLDA 1LYZA 1VFBC 1P46A 3D9AC 1GPQC 168LA 2H9JA 1GFHA 1LHJA 118LA 1C6IA 1L71A 4LGKA 1CV6A 4NGVA 1IY3A 175LA 4H1PA 1LLHA 2O7AA 4ETDA 3C7YA 1AZFA 4RDSA 3UONA 1L28A 2DQEY 3V2WA 4DWXA 5KXNA 169LA 224LA 1W08A 205LA 1TCYA 2DBTA 1IWUA 3SB6A 1LZRA 201LA 1GXXA 1P2RA 1CU5A 192LA 4YENA 2RSCA 4ARQB 2BQLA 1XGUC 1L89A 1L62A 1SX7A 4BADA 2W1LA 2Z38A 1IC5Y 4R0FA 5LVJA 4GRVA 2IHLA 4H9CA 4TTDA 2MEEA 1OVHA 5B1FA 146LA 134LA 1QS9A 1CKCA 3DN0A 4CFPA 4DDAA 1D3NA 2XTHA 2BPUA 229LA 5II3A 4HV2A 5KXRA 1LYGA 4LDLA 4H91A 1XEPA 1DYBA 1KXXA 2Z2EA 132LA 1BB5A 2Z2FA 4XADA 3FADA 4TSBA 4B4IA 1T8FA 2RAYX 1D3JA 1CNSA 3WH1A 2C8PA 4NHPA 1IC4Y 3CDOA 1CUQA 1J1XY 1QSBA 1XEIA 1LZ1A 3ODUA 3N9CA 4LDOA 3SB7A 1KNIA 1YL0X 4W94A 2ANVA 1L45A 1DPXA 1YQVY 200LA 4BAPA 1CV0A 1HERA 1L02A 1PZYA 1YL1X 235LA 2H5ZA 1LMPA 2BQOA 1YKZX 2BQNA 212LA 3GXKA 1T8GA 1PQOA 3HU8A 1LJEA 228LA 4W53A 4GN4A 1LSEA 1UC0A 4I7RA 1DZBX 1L73A 1LJKA 2EIZC 3W6FA 183LA 206LA 1LZEA 4HPIA 3C8QA 2OEAX 2B6ZA 4XJDA 1HMLA 1JQUA 4WL7A 1UIHA 1PQJA 1D3MA 3QAKA 1L06A 4DC4A 4BAFA 4DD0A 4EPFA 151LA 1DYDA 3WW5A 5T3FA 1B7OA 1QSWA 1OUHA 4HJVA 1I20A 5ILCA 1LJGA 222LA 4WM1A 256LA 1CKHA 1GDWA 1LZCA 1L35A 3A93A 4H94A 4IJ4A 1HF4A 2YBIA 1C6JA 4YF2A 3AW7A 1YIKA 230LA 209LA 1B5ZA 2F47A 1GB2A 4W59A 1C6NA 2BQCA 2ZYCA 3G3WA 4YOPA 1W6ZA 188LA 110LA 233LA 1GFGA 1D0MA 3N9AA 1HEWA 180LA 1CX7A 5KXYA 3LYZA 1TDYA 5LYMA 198LA 3OE8A 1NBZC 1L87A 1JHLA 2ZQ3A 4I7SA 1GXV2 1WQMA 3DN4A 3SB8A 1L88A 3RZ4A 5E4PA 4I8SA 4WM6A 4W51A 1L58A 138LA 2DQFC 3TXJA 2CUUA 1G7JC 5LYZA 1L0KA 213LA 3HUAA 4W58A 4NIJA 1KXWA 1OVJA 4B0DA 166LA 4G4CA 1PS5A 2PC2A 4W96A 3WMKA 3OE9A 248LA 149LA 1QUTA 108LA 2Q9EA 4HTNA 4NGWA 1L25A 2YBHA 2QB0B 2BLXA 3ATOA 4PRUA 2Z18A 4TSCA 1IC7Y 4H92A 4GCCA 1LAAA 1LMTA 1G7LC 4ETAA 4LYCA 2OU0X 133LA 1G0MA 254LA 2MEAA 1L96A 1IWVA 3RZEA 3GUNA 4OWAA 1UIAA 1G07A 1DKKA 3DNAA 4N1CC 3GUMA 1LYOA 1L42A 4RLNA 1L72A 1ZV5L 3WU7A 1P2LA 3ZVQB 2OU9A 1GWDA 4A7DA 1L24A 1NHBA 219LA 1GEVA 1OUGA 1EL1A 1FN5A 1UCOA 1IWWA 1KY0A 3HUKA 1LSBA 4LYZA 1LSNA 3EBAB 3A91A 3WXUA 5I5QA 1GDXA 3CT1A 1QTKA 1LZ6A 249LA 2F2NA 1CVKA 1RJCB 5AMYA 1L47A 1ZMYL 5KXWA 197LA 1TLAA 1YAPA 4WG7A 2RB2X 4K5YA 1L46A 4L41A 4EJ4A 1YKXX 4HP0A 4I7PA 1L41A 3PBLA 112LA 2H9KA 1WTNA 238LA 2BQBA 2LZTA 1BWHA 1I56A 1BB3A 1LSCA 3A3RX 4O34A 1L61A 181LA 3W6AA 3E3DA 3WW6A 4B4EA 2Q0MX 4LT2A 1C45A 2ZNWY 1GFUA 1LKSA 251LA 5KKJA 5KXZA 178LA 1HSXA 2BQKA 1LCNA 4H9EA 2RBSA 1G0QA 1OUEA 1L76A 1LI2A 1T8AA 4J1AA 2BQMA 1L13A 1DI5A 4B49A 1WVUA 1L29A 2BQHA 1GB9A 1L85A 1I6SA 1TAYA 1GAYA 2NTGA 3C83A 1GFTA 1C6CA 1C10A 3WUNA 4LT0A 1B7LA 5D5CA 5F81A 167LA 5LA8A 152LA 4W55A 126LA 1LJNA 3HTFA 4ZFPA 1L37A 111LA 5HLLA 1SQ2L 2OTYX 3B0KA 1L12A 1RE2A 4NGYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5K7O A;  1JIS A;  1REX A;  1XEK A;  2LZ2 A;  3SBB C;  1CU3 A;  1L93 A;  1GE1 A;  113L A;  1IOS A;  1IWT A;  2FBB A;  1L80 A;  4YXA C;  3OE6 A;  2Z37 A;  3WPK A;  1OVK A;  4WO6 A;  1F6S A;  1G0L A;  1B5Y A;  1C66 A;  4HPE A;  5KXX A;  1HEP A;  3WVX A;  4TX7 A;  1L84 A;  2DQA A;  1L18 A;  1SX2 A;  1SSY A;  3HBH A;  5KY1 A;  1XGQ C;  1L39 A;  2FYC A;  1LZD A;  2D4K A;  3TXK A;  1GBY A;  1XGR C;  1LW9 A;  1H87 A;  1LYE A;  1UIC A;  2D4J A;  2I26 L;  156L A;  2G4P A;  1E8L A;  2OTZ X;  1NWG A;  1JTN A;  5DLA A;  4NSH A;  5I4W A;  1L54 A;  1CKD A;  1DYG A;  4KXI A;  236L A;  1GB3 A;  4QGZ A;  4WLD A;  1LYZ A;  1VFB C;  1P46 A;  3D9A C;  1GPQ C;  168L A;  2H9J A;  1GFH A;  1LHJ A;  118L A;  1C6I A;  1L71 A;  4LGK A;  1CV6 A;  4NGV A;  1IY3 A;  175L A;  4H1P A;  1LLH A;  2O7A A;  4ETD A;  3C7Y A;  1AZF A;  4RDS A;  3UON A;  1L28 A;  2DQE Y;  3V2W A;  4DWX A;  5KXN A;  169L A;  224L A;  1W08 A;  205L A;  1TCY A;  2DBT A;  1IWU A;  3SB6 A;  1LZR A;  201L A;  1GXX A;  1P2R A;  1CU5 A;  192L A;  4YEN A; 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