170LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNSNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRSALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRCKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 56
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 170lA00
258LA 3GUJA 183LA 3RZEA 1CV1A 192LA 247LA 1L67A 1SX2A 1KY0A 4I7KA 3HDFA 1L34A 1DYGA 1P2RA 1L06A 1L87A 176LA 1L32A 1L65A 1L29A 3HUAA 1L58A 212LA 3LZMA 3HTGA 6LZMA 162LA 3C80A 3SB7A 2Q9DA 3HH4A 108LA 3GUIA 120LA 1L08A 1QTHA 1L39A 1C6PA 3GUKA 1QT8A 3DN8A 2F47A 214LA 1LPYA 2HULA 4W54A 4YXAC 165LA 191LA 3C7ZA 3CDRA 1CTWA 3QAKA 3FI5A 1L22A 147LA 1LWKA 185LA 260LA 2OTZX 2B6YA 2O7AA 3D4SA 2RBOA 231LA 4I7SA 152LA 1PQKA 1L85A 180LA 1L21A 1LYDA 2B6WA 1CU2A 1P36A 251LA 2LC9A 1CU3A 2B73A 1L81A 4W55A 2QB0B 1QUGA 168LA 1L09A 1KW7A 1QT4A 2RH1A 2O4WA 4ARPA 1L45A 1CUQA 1DYCA 1QSBA 1L57A 229LA 233LA 1G0PA 1L71A 1L31A 1C6AA 2F32A 4I7LA 1QUHA 1L73A 3DN1A 1L99A 1KY1A 234LA 1LLHA 3UONA 1L43A 1QS5A 1L61A 1QT6A 3OE8A 4ARJA 164LA 1PQJA 2IGCA 1D3MA 1I6SA 250LA 1ZWNA 4EKPA 2B74A 1OV7A 4EKSA 110LA 4W59A 1P7SA 170LA 4YX7C 4EXMA 3GULA 2L78A 1L01A 213LA 259LA 245LA 112LA 1T8AA 111LA 4ARMB 1OYUA 4EJ4A 4W51A 182LA 1L40A 115LA 113LA 1C60A 1L88A 223LA 127LA 3PBLA 215LA 2B7XA 103LA 252LA 3CDVA 1L92A 1LGWA 4LDLA 2RBPA 1L74A 219LA 3G3VA 253LA 3C81A 128LA 1LWGA 2B72A 4I7NA 150LA 1CV0A 3PDSA 3F9LA 1L93A 5I14A 1L48A 4W52A 1ZYTA 2OTYX 1L10A 1DYDA 1CV3A 1T6HA 1LGXA 1L86A 2RAYX 3GUNA 3JR6A 4DAJA 3SN6R 199LA 146LA 3L2XA 1C6HA 3VW7A 1LI6A 1C66A 1D3FA 2RB1X 4IAPA 1C6BA 161LA 236LA 1CVKA 1L18A 174LA 1G0QA 3DNAA 2OU8A 1WTHA 4ARMA 1SSYA 1QSQA 139LA 109LA 189LA 3FA0A 4W56A 3SB9A 1C6CA 3NYAA 225LA 3OE6A 2LZMA 1L42A 200LA 155LA 1L05A 1DYBA 220LA 4LDEA 4W53A 148LE 1L60A 167LA 1G06A 210LA 1SWYA 4GBRB 3HUQA 1CV6A 1L50A 1L37A 1OVKA 1LYHA 1L33A 1TLAA 209LA 1C6IA 175LA 1T8GA 1ZURA 2HUMA 1T8FA 1L80A 1L51A 3HH3A 4AQNA 4EKQA 2B6ZA 2B6TA 4LZMA 3GUMA 4DJHA 2ANXA 1L97A 122LA 1C67A 1QUDA 159LA 1LW9A 243LA 2RB0X 1G0LA 1L12A 1L75A 1OWZA 181LA 1P6YA 239LA 201LA 129LA 1XJTA 1P37A 1L94A 3DMVA 3CDQA 217LA 1OV5A 1C69A 142LA 1L35A 1L15A 1L28A 1L19A 1L0KA 1L11A 222LA 1L07A 1L62A 1OVJA 3DN3A 1QTZA 160LA 3SBAA 3HT9A 1LGUA 3HH5A 1L89A 224LA 3C82A 114LA 1C64A 1C62A 232LA 1JTNA 1CX7A 226LA 1QTCA 1LYJA 230LA 1L20A 4OO9A 4I7OA 3SB6A 1L0JA 3DN2A 2ANVA 2QARC 1NHBA 3HU8A 1CV5A 195LA 1C65A 4EPIA 3SB5A 1G0KA 156LA 238LA 1LYGA 1L63A 1LYEA 2A4TA 3DMZA 169LA 4I7PA 4YXCA 1QTBA 1QUOA 3L64A 2Q9EA 3GUPA 3HTFA 3C8SA 3SBBC 1P3NA 2RAZX 1G1WA 1D2WA 3G3WA 1L66A 1C6QA 240LA 3C8QA 3DMXA 1L69A 3G3XA 1P2LA 2HUKA 1EPYA 1L68A 138LA 2RBNA 4E97A 4I7TA 1P46A 1JTMA 4K5YA 3CDOA 3V2WA 118LA 1G0GA 163LA 1L41A 261LA 1L02A 137LA 1PQDA 178LA 2RBRA 1C6GA 1B6IA 107LA 3F8VA 1KW5A 1LI3A 1C6LA 1CX6A 3C83A 141LA 3HT6A 1G1VA 1C6MA 1L96A 221LA 151LA 1JQUA 143LA 1L77A 2OE4X 126LA 227LA 4S0WA 4I7QA 3CDTA 1QT3A 1L91A 131LA 4DKLA 1L49A 3V2YA 4ARLA 177LA 4I7JA 1P56A 1L82A 1C6EA 3EMLA 123LA 1C6TA 1L25A 1XEPA 218LA 257LA 2CUUA 1DYFA 1L52A 1C68A 249LA 5LZMA 1D9WA 187LA 3HTDA 104LA 1L23A 158LA 1G0MA 1L95A 172LA 3K2RA 184LA 1PQIA 1DYEA 1L14A 246LA 7LZMA 1L56A 197LA 1L90A 119LA 256LA 1L04A 1QT5A 3DN4A 1L36A 255LA 3NY9A 2OEAX 2NTHA 4ARQB 1G0JA 1L84A 1SSWA 171LA 4I7MA 1C6DA 4PJZA 190LA 1D3NA 145LA 248LA 1SX7A 2RBSA 157LA 2OE9X 2Z6BA 3HWLA 4PK0A 2RBQA 1C6KA 3FADA 1L55A 1L54A 1QS9A 140LA 1DYAA 2B75A 2OU0X 1L83A 2F2QA 3RUNA 1CV4A 1OWYA 1L17A 1L46A 216LA 3C8RA 1L27A 1G07A 102LA 3SB8A 3HT8A 1D3JA 1C63A 1C6JA 205LA 3GUOA 228LA 1C6NA 3NY8A 3OE0A 3DN6A 1T97A 1L47A 3DN0A 1LYIA 1C61A 4W57A 3HDEA 4ZPUA 4EPFA 1LI2A 1L44A 3HH6A 1CUPA 1L00A 4GRVA 1XJUA 1KS3A 1L03A 235LA 3HU9A 3OE9A 4LDOA 1QT7A 166LA 1CU6A 244LA 237LA 206LA 4ARQA 1KNIA 3C7YA 1L72A 2RB2X 254LA 3HTBA 3DKEX 149LA 1L26A 1L53A 211LA 198LA 1L13A 1CU5A 1LYFA 2OU9A 1L59A 1OVHA 3ODUA 2OE7X 188LA 241LA 125LA 1L76A 1L98A 1L64A 1L70A 2B70A 242LA 1QTDA 1PQMA 173LA 1C6FA 3HUKA 130LA 186LA 1L16A 262LA 1CU0A 1K28A 3C7WA 196LA 2B6XA 1L24A 1P5CA 1D2YA 1SWZA 4EKRA 2LCBA 144LA 1L79A 1L38A 4I7RA 1P64A 1QTVA 3HT7A 1L30A 2NTGA 1PQOA 2O79A 4W58A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RZEA 5IELA 1GBOA 3W6AA 1JSEA 5LVIA 1L06A 4D9ZA 5E9RA 1L32A 6LZMA 3C80A 1B7QA 4B4EA 1LMPA 3HH4A 1FN5A 3SP3A 1HERA 1QT8A 1JJ3A 4H9AA 5T3FA 1P2CC 4DD1A 1DKJA 1VEDA 191LA 1DQJC 1GFVA 1GB5A 3FI5A 5LVJA 1L22A 3AB6A 260LA 4U3XB 4DYGA 2X0AA 4NIJA 1KIRC 1UC0A 2YBJA 2B5ZA 1PQKA 1IP7A 1CJ7A 2XQOA 3P4ZA 3WYHA 2B73A 1L81A 1JJ1A 2QB0B 1L09A 1I20A 1JHLA 1QT4A 5AMYA 5FHWA 3M18B 2RH1A 4ARPA 2I25L 4H91A 3LYTA 4DDBA 4ETEA 233LA 1L71A 1GFEA 1L31A 4I7LA 5D5CA 3DN1A 3WVYA 234LA 4OWAA 1L61A 3OE8A 2IGCA 3HBDA 250LA 5KXOA 5B07A 4ZEEA 4LYTA 1WVVA 4RW2A 2BQOA 5D5FA 1WQRA 2H9JA 170LA 1XGUC 245LA 2ZQ3A 2D6BA 112LA 1T8AA 4ARMB 2DQGY 1OUCA 2H9KA 1GBWA 1QTKA 3ZEKA 127LA 3WPJA 3PBLA 4WM4A 4LT0A 4WM5A 1L74A 2BQNA 2DQAA 5KXKA 3WH1A 2EPEA 4ETAA 3AW6A 1GFHA 150LA 2ZILA 5ILCA 5I14A 4NGLA 4OWBA 1L48A 2OTYX 1LJKA 4GN4A 2RAYX 5FSTA 4DAJA 1F6RA 5KXLA 1G7HC 4H9FA 4BADA 1IC5Y 1D3FA 2RB1X 3WW5A 5I5QA 3LYOA 1IOSA 4HJVA 1CVKA 1L18A 3TXKA 3A8ZA 3HBEX 1WTHA 1SSYA 139LA 3NYAA 4WLYA 1L42A 155LA 4W53A 1JKCA 4N8ZA 1GEZA 1L60A 1LYOA 5KKIA 3CSZA 1D6QA 2GV0A 1JIYA 4GBRB 2BLXA 4NGWA 4NFVA 5F16A 4GCFA 2FYDA 5C6JA 209LA 1T8GA 1LJIA 1ZURA 1T8FA 4XJIA 3AGIA 133LA 2Z39A 4EKQA 2B6ZA 5B1FA 4GCEA 2Z18A 1CKDA 1IWXA 1IVMA 122LA 243LA 1G0LA 1L75A 1NKHA 1TBYA 3CT0A 1OWZA 2BQKA 4AXTA 4LYOA 1P6YA 4UWVA 1L94A 1OP9B 153LA 1XGQC 2XBRA 1UIAA 1VAUA 3TXDA 2HEDA 4P2EA 1C43A 3SBAA 4NGVA 3HT9A 1XGPC 5F9UA 1B5ZA 4X3BA 1C64A 1CNSA 4CJ2A 4RLNA 1LYJA 230LA 1L20A 1B0DA 3QNGA 3SB6A 4NSHA 3DN2A 2QARC 1TAYA 4HPIA 195LA 1C65A 5LVGA 2HEAA 3CT1A 238LA 1LYGA 3DMZA 5C6IA 1GBXA 4B4IA 132LA 1LMQA 1QTBA 3L64A 3SBBC 3C8SA 2BQHA 1G1WA 3N9EA 1C6QA 3DMXA 5KXWA 4R0FA 1P2LA 5B1GA 1QUTA 2IHLA 4OW1A 4I7TA 4GLVA 1FDLY 4PGJB 4K5YA 137LA 1C6GA 1CJ9A 1GB3A 141LA 3HT6A 1FKQA 1LZ6A 2XJWA 1ALCA 4ANRA 2OE4X 4NGIA 2C8OA 3ZVQA 1L91A 4DKLA 177LA 4ARLA 4I7JA 1C6EA 2BQBA 1C6TA 218LA 4WM2A 1C68A 249LA 3W6BA 3LZ2A 4OOTA 187LA 3HTDA 4YM8A 104LA 3TXJA 2A7DA 194LA 1LSAA 2MEEA 5LVKA 1PQIA 1DYEA 1IR7A 246LA 197LA 119LA 1EQ4A 1BVKC 1VDPA 2OEAX 2NTHA 4ARQB 1SSWA 1C6DA 4H8XA 2BQCA 1D3NA 1HEQA 2RBSA 1UUZC 1JTPL 2RBQA 4NGZA 4TTDA 1L54A 1GFGA 1KIPC 4N0JA 2D91A 2OU0X 1LZDA 4G4HA 3LHMA 1L46A 1L27A 2ZWBA 1DPWA 3SB8A 3HT8A 3A96A 1GE2A 205LA 5KXTA 228LA 3AZ5A 3NY8A 1DI3A 2WARA 3KAMA 4W57A 3HDEA 2Z19A 4B1AA 4EPFA 5FELA 3B0IA 4YF2A 4ETDA 2BQGA 1G7IC 1QT7A 1LZNA 3P65A 4G49A 9LYZA 1L72A 4WG7A 1GB2A 3DKEX 1L53A 1BQLY 1L13A 1CU5A 1LYFA 1OUDA 4H1PA 1LZEA 1LSEA 1LZ5A 3ODUA 3ATOA 2B70A 242LA 5ILFA 1GFKA 173LA 4XN6A 2HECA 262LA 5DN4A 2BQLA 1D2YA 5HQ1A 1VDSA 144LA 1UBZA 5B59A 4ZIXA 2FYCA 1LSZA 1QTVA 1L30A 5EBHA 1FLUA 2O79A 4W58A 4CHXA 3GUJA 183LA 1T3PA 5B05A 1DPXA 4I7KA 3HDFA 4DD2A 5FCPA 1REZA 1DYGA 1J1PY 3T6UA 1HC0A 3LZTA 1L65A 1IO5A 3WULA 1IEEA 3HTGA 1IWYA 1OUFA 162LA 4FDYA 2Q9DA 2HTXA 120LA 1QTHA 3OJPA 1LHIA 3B6LA 2YBLA 1IOTA 2HU1A 5APCA 5KXSA 2F47A 2HULA 4W54A 1GB8A 1HF4A 3P66A 1B2KA 3CDRA 1JTOL 2LYOA 5APEA 3QAKA 3E3DA 3TMUA 2OTZX 5K7OA 152LA 3F6ZA 1L85A 1ZV5L 1L21A 1LYDA 1TCYA 1CU3A 4LYBA 3WMKA 4W55A 168LA 2F30A 1D6PA 2RSCA 1LKSA 5F9XA 4TSCA 2I6ZA 1LSBA 4OWHA 2EKSC 1QUHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RZE A;  5IEL A;  1GBO A;  3W6A A;  1JSE A;  5LVI A;  1L06 A;  4D9Z A;  5E9R A;  1L32 A;  6LZM A;  3C80 A;  1B7Q A;  4B4E A;  1LMP A;  3HH4 A;  1FN5 A;  3SP3 A;  1HER A;  1QT8 A;  1JJ3 A;  4H9A A;  5T3F A;  1P2C C;  4DD1 A;  1DKJ A;  1VED A;  191L A;  1DQJ C;  1GFV A;  1GB5 A;  3FI5 A;  5LVJ A;  1L22 A;  3AB6 A;  260L A;  4U3X B;  4DYG A;  2X0A A;  4NIJ A;  1KIR C;  1UC0 A;  2YBJ A;  2B5Z A;  1PQK A;  1IP7 A;  1CJ7 A;  2XQO A;  3P4Z A;  3WYH A;  2B73 A;  1L81 A;  1JJ1 A;  2QB0 B;  1L09 A;  1I20 A;  1JHL A;  1QT4 A;  5AMY A;  5FHW A;  3M18 B;  2RH1 A;  4ARP A;  2I25 L;  4H91 A;  3LYT A;  4DDB A;  4ETE A;  233L A;  1L71 A;  1GFE A;  1L31 A;  4I7L A;  5D5C A;  3DN1 A;  3WVY A;  234L A;  4OWA A;  1L61 A;  3OE8 A;  2IGC A;  3HBD A;  250L A;  5KXO A;  5B07 A;  4ZEE A;  4LYT A;  1WVV A;  4RW2 A;  2BQO A;  5D5F A;  1WQR A;  2H9J A;  170L A;  1XGU C;  245L A;  2ZQ3 A;  2D6B A;  112L A;  1T8A A;  4ARM B;  2DQG Y;  1OUC A;  2H9K A;  1GBW A;  1QTK A;  3ZEK A;  127L A;  3WPJ A;  3PBL A;  4WM4 A;  4LT0 A; 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