170LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNSNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRSALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRCKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 56
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 170lA00
1L02A 2IGCA 3UONA 200LA 1C69A 2RBOA 233LA 4ARPA 1L01A 184LA 220LA 4IAPA 3C8SA 1QT7A 187LA 239LA 4W55A 222LA 1OYUA 1KW5A 248LA 1P36A 3HUQA 201LA 3CDVA 142LA 1L38A 2RB0X 4LZMA 1L04A 1LYEA 1L47A 3HTDA 1QT3A 3OE0A 236LA 3GUJA 1L35A 1L66A 254LA 146LA 1L80A 2RB1X 1QUGA 1DYDA 2Z6BA 211LA 1C61A 5I14A 145LA 3NYAA 2OE9X 3G3XA 4EPFA 1L67A 3C8RA 1C6KA 2O79A 2B73A 1QS9A 3SN6R 1L81A 2OTYX 113LA 219LA 3HH4A 158LA 1L59A 1L96A 258LA 4ARQB 3LZMA 2RBNA 1CVKA 155LA 3HTGA 1L60A 1OV5A 165LA 3HTFA 1L41A 1L62A 212LA 139LA 1P5CA 2OTZX 1P37A 4ARQA 120LA 229LA 1NHBA 1G0GA 4I7OA 3EMLA 1LYFA 2F32A 2LCBA 1L82A 247LA 1QUDA 234LA 1C6GA 1L10A 3DN6A 1L20A 2Q9EA 1L90A 137LA 4S0WA 2NTGA 1L21A 1L64A 157LA 1D3FA 1P6YA 160LA 1ZYTA 167LA 4W52A 3GUMA 125LA 171LA 1C63A 230LA 1C6BA 4I7PA 2B7XA 1D2YA 1L92A 1C62A 3NY9A 103LA 1L07A 4W58A 3DN4A 3HT9A 1L34A 3HDFA 149LA 1LWGA 1LGWA 1L11A 1C6AA 1OWYA 1L09A 3RUNA 3F9LA 1L52A 140LA 1G1WA 1C6QA 183LA 1L22A 1L54A 190LA 1LGXA 1OVHA 4I7KA 2HUMA 1JQUA 118LA 4DJHA 2OE4X 4EKSA 224LA 4W57A 4I7MA 2B6ZA 2B70A 3G3VA 4GRVA 3FI5A 3SB9A 1L14A 169LA 1L16A 4GBRB 1C6HA 3OE6A 4EKQA 1L40A 1B6IA 1OWZA 196LA 215LA 3CDQA 1QTCA 3L64A 2B74A 4I7LA 150LA 3CDOA 3DN8A 4W54A 1KS3A 1ZWNA 109LA 2F2QA 4ARLA 1KY1A 3OE9A 1OVKA 2B6TA 4I7TA 4W53A 1L94A 2HULA 2B6WA 1L73A 1L98A 1PQDA 130LA 1C6JA 1LLHA 214LA 3C82A 3DN0A 1LYHA 1PQMA 1C65A 2LZMA 1L86A 1C6NA 156LA 1L89A 1LYGA 3CDRA 3GUOA 237LA 244LA 3GUNA 1QT6A 131LA 141LA 2ANXA 2RB2X 242LA 3SBAA 180LA 238LA 3C83A 1L33A 4W51A 257LA 4YXCA 143LA 162LA 243LA 168LA 1LWKA 256LA 1L75A 1C6LA 1L37A 1L45A 3VW7A 228LA 1CUQA 2ANVA 2F47A 1G06A 2QB0B 172LA 1L06A 3HU8A 173LA 2OE7X 1C6MA 246LA 1P64A 3HT8A 1D3NA 1LI3A 3DN2A 3SB6A 6LZMA 3C7WA 1P7SA 1CV6A 1CV4A 1C6PA 3FADA 3HU9A 1L85A 1CUPA 1DYAA 2O4WA 1G07A 1LI6A 3C8QA 2OU9A 4YXAC 1LYDA 1XEPA 191LA 1L15A 1SX7A 1L12A 2RBQA 2OEAX 1PQOA 1XJUA 4W59A 1L42A 259LA 1C6IA 1G0LA 2RH1A 1CV1A 1QTZA 2RAYX 1L56A 210LA 7LZMA 4LDEA 1QT5A 5LZMA 107LA 163LA 1L36A 111LA 1JTMA 4LDOA 2NTHA 192LA 1P2LA 178LA 1G0QA 1D3JA 170LA 1D9WA 186LA 225LA 115LA 1QSBA 206LA 1L72A 4DKLA 1CV3A 1L76A 3K2RA 1T8GA 1L77A 1I6SA 3DMXA 1CX6A 1CTWA 1L83A 1L50A 1L03A 255LA 3PDSA 1L32A 3ODUA 1OVJA 3DKEX 104LA 1L24A 2RBSA 185LA 1K28A 1PQIA 1L99A 3HT6A 3DN1A 1P56A 2OU0X 3HH3A 1SSWA 1C66A 249LA 1G1VA 250LA 1CU2A 2RAZX 1L19A 1EPYA 3GUKA 3L2XA 1L31A 4I7JA 1C6TA 205LA 1LW9A 1L27A 2QARC 1L43A 1PQJA 1LYIA 1DYFA 1L57A 1WTHA 2LC9A 2Q9DA 3V2WA 1P2RA 1QUHA 112LA 1P46A 1QS5A 2O7AA 4ARMB 4EKPA 1T6HA 1L46A 129LA 1JTNA 1L00A 1QTDA 3JR6A 1DYCA 3DMVA 1KNIA 174LA 199LA 114LA 1L88A 3RZEA 3GUIA 4ARMA 3V2YA 1QSQA 2A4TA 3HUKA 1L53A 241LA 1L91A 4EPIA 1L13A 1CX7A 119LA 3G3WA 1D2WA 252LA 4W56A 138LA 223LA 216LA 1DYGA 2CUUA 1KY0A 1L84A 4EJ4A 1C64A 1L65A 240LA 1L61A 1G0PA 217LA 1PQKA 1OV7A 3HH5A 2B75A 126LA 3C7YA 108LA 261LA 3HT7A 1LI2A 1G0KA 1L71A 1T8AA 3HDEA 4PK0A 3SB7A 161LA 262LA 152LA 1C67A 3CDTA 1L17A 4LDLA 1XJTA 4I7QA 213LA 218LA 151LA 144LA 123LA 4EKRA 1SSYA 1L26A 235LA 2OU8A 1C6DA 1L97A 1L69A 226LA 4E97A 188LA 1LYJA 122LA 2HUKA 102LA 4ZPUA 1L74A 1D3MA 1L0KA 3FA0A 128LA 1L25A 3C81A 1C6EA 1SX2A 3OE8A 4I7RA 1CV5A 1L48A 232LA 3SB8A 1L87A 2B6XA 3C7ZA 3HWLA 1C6CA 4ARJA 251LA 1DYBA 189LA 3SBBC 1T8FA 1L08A 3DN3A 3GULA 198LA 1ZURA 4DAJA 1CV0A 1L49A 1LPYA 127LA 2L78A 1C6FA 4PJZA 1T97A 227LA 1L18A 164LA 253LA 1L55A 1L29A 1DYEA 175LA 1L68A 2B6YA 1L79A 1KW7A 1CU3A 1C60A 260LA 1L70A 1LGUA 3F8VA 1G0MA 1L95A 3GUPA 3PBLA 4YX7C 1TLAA 209LA 245LA 1SWZA 110LA 2B72A 1SWYA 1C68A 1CU5A 4K5YA 3NY8A 1P3NA 3C80A 177LA 1QTBA 3HH6A 182LA 1L93A 4I7NA 1CU0A 1L44A 181LA 1L30A 2RBPA 1L28A 1L58A 1QUOA 4I7SA 3DNAA 197LA 1QTVA 3D4SA 1QT4A 176LA 1QT8A 3HTBA 4EXMA 4OO9A 1QTHA 148LE 166LA 1G0JA 1L51A 2RBRA 1CU6A 3HUAA 3DMZA 4AQNA 3QAKA 231LA 1L23A 159LA 1L0JA 3SB5A 195LA 221LA 147LA 1L05A 1L39A 1L63A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XJHA 1L02A 1C69A 4DD0A 1YAOA 4ARPA 184LA 5APFA 1QT7A 1CKGA 2BQNA 1D0KA 4W55A 2DQIY 5HLLA 1LYSA 201LA 3FE0A 3TXHA 142LA 1HC0A 5LIOA 1RJCB 1OQMA 236LA 3GUJA 2CDSA 4NHTA 5FCPA 1KXWA 2FBDA 211LA 5I14A 4MSTA 1IWWA 1RFPA 2OE9X 4LT1A 1D6PA 2BQEA 2O79A 1QS9A 3SN6R 5KXZA 1IOTA 219LA 158LA 1L59A 1L96A 1GFHA 4WM3A 1L60A 4H92A 3A3RX 5D5CA 1L41A 1P5CA 1P37A 1GB6A 120LA 3A34A 3AGHA 2BQDA 1L82A 1LZ1A 2ZILA 4RW2A 234LA 1YROA 1A4VA 2Q9EA 1L90A 137LA 5L9JA 4H91A 2NTGA 1L21A 1KIPC 1D3FA 4W52A 3CSQA 2BAAA 1C63A 3A94A 230LA 4WO6A 1GFAA 1C6BA 4TSCA 2H5ZA 1W6ZA 2LYOA 2HTXA 1D2YA 5KXWA 1IY3A 2BQJA 1VFBC 3DN4A 3HT9A 4LYBA 1IC4Y 149LA 7LYZA 4NGOA 1LJ3A 3G3AB 1LWGA 1YAMA 4D9ZA 1L11A 1NBYC 1OWYA 1L52A 140LA 1G1WA 1L22A 1OVHA 1JTTL 190LA 1LGXA 3LYZA 1JQUA 4DJHA 1PZYA 4EKSA 2B70A 3TXFA 3SB9A 1L14A 1L40A 1B6IA 2MEHA 196LA 4I7LA 4RLNA 150LA 4HV1A 1IVMA 3AGGG 1ZWNA 1WQMA 3TXDA 1OVKA 3AW7A 4BADA 4ZIXA 2ZNXY 130LA 214LA 2EKSC 1LYHA 4AXTA 1HHLA 1L86A 4TUNA 1LYOA 156LA 1L89A 1B7RA 1NHEA 5LYZA 244LA 3GUNA 1AM7A 5EBHA 2A7FA 4GCEA 131LA 2PC2A 1F0WA 3C83A 1UIGA 1IP6A 1L37A 1GAZA 3AW6A 3VW7A 4IASA 3AYQA 2HU1A 2ANVA 1IOSA 1GFKA 1L06A 4O34A 1SLYA 1C6MA 1DPWA 4C3WA 1HERA 3IJVA 3DN2A 4X3BA 1G7MC 2GV0A 8LYZA 2F2NA 1CV6A 1UIEA 5I4WA 1CV4A 2IHLA 4NEBA 1C6PA 4P2EA 1LZSA 4YOPA 4OWBA 3LN2A 1LHHA 3LYOA 1CJ9A 2MEBA 4Z41A 1FBIX 3A91A 1XEPA 2Z12A 3A95A 2D4JA 3AZ6A 1G7JC 2RBQA 1D6QA 2D4IA 1BHZA 1PQOA 1XJUA 3SP3A 1BB5A 1G0LA 1LSDA 4RLMA 1UACY 107LA 4J1AA 4EMNA 1LZCA 4ANRA 2YBLA 4GLVA 1REZA 1D9WA 186LA 225LA 3AB6A 5KKJA 115LA 3TMUA 1QSBA 206LA 3J4GA 4AGAA 1T8GA 3WPLA 1GB0A 1L50A 4NG8A 4UWVA 1GE4A 1B5XA 2RBSA 4QEQA 185LA 1LMNA 1K28A 3HT6A 1GB7A 1P56A 3HH3A 3A92A 1C66A 249LA 2F4GA 1XGQC 2XTHA 1L27A 1T3PA 1L43A 1GHLA 5KXYA 2BPUA 3FI7A 4DC4A 1LZ9A 4WL6A 1JITA 1N4FA 1TCYA 1OUFA 1GE0A 1L88A 1B0DA 3GUIA 3CT0A 1QSQA 3HUKA 4NY5A 3EXDA 1L13A 1CX7A 1FDLY 4N8ZA 1D2WA 2VB1A 4W56A 2LZTA 1AT6A 3WPKA 1IWVA 1YKXX 2N5ZA 4ML7A 5KXNA 1LZ5A 3AJNA 5M1YA 4ET8A 2B75A 1ZVHL 1DQJC 1FKQA 1LI2A 1IOCA 3G3BB 1T8AA 1BVXA 4PK0A 4NFVA 161LA 152LA 1C67A 193LA 1L17A 1C7PA 213LA 1QSAA 151LA 5APCA 3ZVQB 1LJIA 123LA 1I20A 1DXJA 3D3DA 4H9AA 1LZNA 2LZ2A 4FDYA 188LA 4TSBA 3ZVQA 4YF2A 1L74A 1L0KA 4LT0A 3B0IA 2W1XA 1GF4A 1SX2A 1NQIA 5B05A 232LA 1LSEA 5L3IA 4ARJA 251LA 1DYBA 189LA 4HTQA 1XEIA 4PHIA 198LA 1ZURA 4WM5A 2FYCA 4NSHA 1LPYA 2L78A 1YQVY 1YAPA 4PJZA 1UIDA 1T97A 227LA 1YKYX 3LHMA 4H8YA 1LZYA 5IDDA 4WLTA 1GB5A 4WLXA 1TDYA 1KW7A 1CU3A 1NF5A 260LA 4N1CC 3RT5X 3VWOA 208LA 3F8VA 4NWHA 3PBLA 1C08C 209LA 1UA6Y 5B1GA 2YBHA 4LFPA 2BQOA 4YEOA 1RE2A 2MEFA 1CU5A 2DQAA 1TAYA 1V7SA 3C80A 1LZEA 4I7NA 1L58A 3DNAA 5DN4A 3WUNA 3D4SA 1QTVA 1IC7Y 2F4AA 5HMJA 5I4YA 1LMOA 4OWAA 4OO9A 148LE 5HNLA 1HELA 1FKVA 4NWEA 5FSTA 9LYZA 1FN5A 4Z3MA 1GF6A 147LA 4LGKA 1L05A 2BQHA 1L39A 5L3HA 1GB9A 200LA 3QY4A 2RSCA 1QQYA 233LA 187LA 4YENA 1OYUA 1KW5A 2I25L 2YBMA 1P36A 1IY4A 1UIBA 4NSJA 4CFOA 4WG1A 3OE0A 4H9EA 1KIRC 4DWXA 1KIQC 2RB1X 2Z6BA 1C61A 3MGWA 2DQFC 145LA 4MCKA 1LCNA 1GXV2 1VDSA 1QTEA 2B73A 113LA 4NSGA 1JHLA 4ARQB 1LSNA 1GFTA 4KL7A 2W1MA 155LA 1JPOA 3HTFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4XJH A;  1L02 A;  1C69 A;  4DD0 A;  1YAO A;  4ARP A;  184L A;  5APF A;  1QT7 A;  1CKG A;  2BQN A;  1D0K A;  4W55 A;  2DQI Y;  5HLL A;  1LYS A;  201L A;  3FE0 A;  3TXH A;  142L A;  1HC0 A;  5LIO A;  1RJC B;  1OQM A;  236L A;  3GUJ A;  2CDS A;  4NHT A;  5FCP A;  1KXW A;  2FBD A;  211L A;  5I14 A;  4MST A;  1IWW A;  1RFP A;  2OE9 X;  4LT1 A;  1D6P A;  2BQE A;  2O79 A;  1QS9 A;  3SN6 R;  5KXZ A;  1IOT A;  219L A;  158L A;  1L59 A;  1L96 A;  1GFH A;  4WM3 A;  1L60 A;  4H92 A;  3A3R X;  5D5C A;  1L41 A;  1P5C A;  1P37 A;  1GB6 A;  120L A;  3A34 A;  3AGH A;  2BQD A;  1L82 A;  1LZ1 A;  2ZIL A;  4RW2 A;  234L A;  1YRO A;  1A4V A;  2Q9E A;  1L90 A;  137L A;  5L9J A;  4H91 A;  2NTG A;  1L21 A;  1KIP C;  1D3F A;  4W52 A;  3CSQ A;  2BAA A;  1C63 A;  3A94 A;  230L A;  4WO6 A;  1GFA A;  1C6B A;  4TSC A;  2H5Z A;  1W6Z A;  2LYO A;  2HTX A;  1D2Y A;  5KXW A;  1IY3 A;  2BQJ A;  1VFB C;  3DN4 A;  3HT9 A;  4LYB A;  1IC4 Y;  149L A;  7LYZ A;  4NGO A;  1LJ3 A;  3G3A B;  1LWG A;  1YAM A;  4D9Z A;  1L11 A;  1NBY C; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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